Accéder directement au contenu

Christophe KLOPP

21
Documents
Affiliations actuelles
  • 577435

Publications

"frederic-lecerf"
Image document

Watch out for a second SNP: focus on multi-nucleotide variants in coding regions and rescued stop-gained

Fabien Degalez , Frédéric Jehl , Kévin Muret , Maria Bernard , Frédéric Lecerf
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.659287. ⟨10.3389/fgene.2021.659287⟩
Article dans une revue hal-03280040v1
Image document

RNA-Seq Data for Reliable SNP Detection and Genotype Calling

Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Frédéric Lecerf , Maria Bernard , Laetitia Lagoutte
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.655707. ⟨10.3389/fgene.2021.655707⟩
Article dans une revue hal-03276149v1
Image document

Le projet « Mille Génomes Gallus » : partager les données de séquences pour mieux les utiliser

Michèle Tixier-Boichard , Frédéric Lecerf , Frédéric Herault , Philippe Bardou , Christophe C. Klopp
INRAE Productions Animales, 2020, 33 (3), pp.189-202. ⟨10.20870/productions-animales.2020.33.3.4564⟩
Article dans une revue hal-03103324v1
Image document

Long noncoding RNA repertoire in chicken liver and adipose tissue

Kévin Muret , Christophe C. Klopp , Valentin Wucher , Diane Esquerré , Fabrice Legeai
Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.6. ⟨10.1186/s12711-016-0275-0⟩
Article dans une revue hal-01431420v1
Image document

Combined QTL and selective sweep mappings with coding SNP annotation and cis-eQTL analysis revealed PARK2 and JAG2 as new candidate genes for adiposity regulation.

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anne Blum , Brian Parks , Alexandra Montagner
G3, 2015, 5, pp.517-529. ⟨10.1534/g3.115.016865⟩
Article dans une revue hal-01194040v1
Image document

Transcriptome profiling of the feeding-to-fasting transition in chicken liver.

Colette Désert , Michel Jacques M.J. Duclos , Pierre Blavy , Frédéric Lecerf , François Moreews
BMC Genomics, 2008, 9 (611), pp.611. ⟨10.1186/1471-2164-9-611⟩
Article dans une revue hal-00729919v1

A lncRNA gene-enriched atlas for GRCg7b chicken genome and its functional annotation across 47 tissues

Fabien Degalez , Mathieu Charles , Sylvain Foissac , Haijuan Zhou , Dailu Guan
39. Congress of the international society for animal genetics (ISAG), Jul 2023, Cape Town, South Africa. pp.47
Communication dans un congrès hal-04217589v1

RNA-seq data for detecting reliable SNPs & genotypes in livestock species: interest for coding variant characterization and cis-regulation analysis by allele-specific expression !

Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Maria Bernard , Frédéric Lecerf , Laetitia Lagoutte
World Poultry Congress (WPC) 2022, Aug 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04258396v1

RNA-SEQ data for reliable SNP detection and genotype calling in livestock species: interest for coding variant characterization and cis-regulation analysis by allele-specific expression

Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Maria Bernard , Frédéric Lecerf , Laetitia Lagoutte
26. World's Poultry Congress (WPC), Aug 2022, Paris, France. pp.405
Communication dans un congrès hal-04132375v1

Le projet mille génomes gallus : comment partager les données de séquences pour mieux les utiliser

Michèle Tixier-Boichard , Frédéric Lecerf , Philippe Bardou , Christophe C. Klopp
13.Journées de la recherche avicole et des palmipèdes à foie gras, Mar 2019, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02737429v1
Image document

Combining Genetics Mapping, Selective Sweeps, Genome Re-Requencing and Allele Specific Expression Reveals Several Serious Causative Genes for QTL Regions

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anis Djari , Diane Esquerre , Colette Désert
International Plant & Animal Genome XXII (PAG), Jan 2014, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01193794v1
Image document

Identification of candidate polymorphism in a QTL region by combining eQTL mapping with NGS data

Pierre-François Roux , Yuna Blum , Colette Désert , Anis Djari , Diane Esquerre
64th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. pp.300
Communication dans un congrès hal-01019609v1
Image document

Using NGS data to characterize genetics of meet-type and egg-type chicken lines

Pierre-François Roux , Frédéric Lecerf , Anis Djari , Diane Esquerre , Sylvain Marthey
64th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. pp.296
Communication dans un congrès hal-01019218v1

Utilisation des NGS pour la caractérisation génétique de lignées de poulet de chair et poules de ponte

Pierre-François Roux Roux , Frédéric Lecerf , Anis Djari , Diane D. Esquerre , Sylvain S. Marthey
10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2013, La Rochelle, France. pp.556-561
Communication dans un congrès hal-01000659v1
Image document

Pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP aviaires

Frederique Pitel , Alain Vignal , Sophie Leroux , Katia Feve , Florence Vignoles
8èmes Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Paris (FR), France. pp.594-598
Communication dans un congrès hal-00730058v1
Image document

A lncRNA gene-enriched atlas for GRCg7b chicken genome and its functional annotation across 47 tissues

Fabien Degalez , Mathieu Charles , Sylvain Foissac , Haijuan Zhou , Dailu Guan
39. Congress of the international society for animal genetics (ISAG), Jul 2023, Cape Town, South Africa. , pp.78, 2023, Abstracts
Poster de conférence hal-04217582v1

A lncRNA gene-enriched atlas for GRCg7b chicken genome using Ensembl, RefSeq and two FAANG databases

Fabien Degalez , Mathieu Charles , Sylvain Foissac , Zhou Haijuan , Guan Dailu
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), Aug 2023, Lyon, France. Wageningen Academic Publishers, Book of abstracts, 29, pp.932, 2023, Book of abstracts of the 74st annual meeting of the european federation of animal science
Poster de conférence hal-04217567v1

Une nouvelle facette du génome de poule : les genes “longs non-codants"

Kévin Muret , Christophe C. Klopp , Valentin Wucher , Diane Esquerre , Fabrice Legeai
12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2017, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01605848v1

Long-non coding RNAs repertoire in liver and adipose tissue in chicken

Kévin Muret , Christophe C. Klopp , Valentin Wucher , Diane D. Esquerre , Fabrice Legeai
XXIV International Plant & Animal Genome (Pag), Jan 2016, San Diego, United States. 2016
Poster de conférence hal-02799305v1

La combinaison de cartographie de signatures de sélection, de re-séquençage de génomes et d'analyses d'expression révèle PARK2 et JAG2 comme nouveaux genes candidats régulant l'adiposité

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anne Blum , Brian Parks , Alexandra Montagner
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2015, Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01194116v1

Selective sweeps using hapFLK combined with genome re-sequencing data reveals strong candidate mutations in QTL regions in divergent chicken lines

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anis Djari , Diane Esquerre , Sylvain Marthey
8th European Symposium on Poultry Genetics (ESPG), Sep 2013, Venise, Italy. 2013, Proceedings of the 8th European Symposium on Poultry Genetics
Poster de conférence hal-01193795v1