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Clémence BONNOT
Chargée de recherche, Équipe ‘Écogénomique des interactions’, UMR 1136 IAM, INRAE-Université de Lorraine, France.
• Compréhension des mécanismes moléculaires d’intégration des besoins nutritifs, signaux de stress et associations ectomycorhiziennes chez les arbres forestiers.
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Documents
Affiliations actuelles
- 1002417
Identifiants chercheurs
- clemence-bonnot
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- 0000-0002-5669-0982
Domaines de recherche
Sciences du Vivant [q-bio]
Compétences
Physiologie: Marquages (P,N,C) ; Analyses de flux (nutriments, drogues etc.) ; Dosages de nutriments (Pi, NO3-, NH4+) dans les tissus et sol ; Dosages d’amidon et anthocyanes ; Préparation d’échantillons pour ICP-OES; Greffes.
Biotechnologie: Cultures axéniques de plantes, algues, champignons et bactéries modèles ou non; Transformations stables (A. thaliana, M. polymorpha, P X canescens, L. bicolor, S. cerevisiae) et transitoire (N. benthamiana) ; Tests de complémentation sur levure ; Isolation et inoculation fongiques.
Génétique: Génétique classique, réverse et chimique ; Mutagenèse (UV, EMS, T-DNA) et cribles haut-débits de mutants, drogues et peptides.
Biologie moléculaire et biochimie: Transcriptomique ; Clonages ; PCRs (nichée, dégénérée, TAIL, RACE, RT-PCR, qPCR) ; Extraction de protéines (membranaire, soluble, acides) ; Western blot ; Test d’activités enzymatiques ; Extraction/quantification de métabolites/drogues (HPLC-MS, HPLC-UV) ; Extraction de sève brute pour sécrétomique et métabolomique.
Histologie: Sections en agarose, cire et plastique ; Hybridation In situ ; Colorations tissulaires (marqueurs tissulaires, GUS, ROS, amidon, phosphatase…) ; Immunocytolocalisation ; Microscopie (Confocale, Luminescence…).
Bioinformatique: Langage R ; Cartographie et analyse de transcriptomes (CLC, FastQc, WGCNA, DiSeq, Mapman, Morpheus) ; Phylogénies (Bayésienne, Maximum-likelihood) ; CLANS.
Publications
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A Viable New Strategy for the Discovery of Peptide Proteolytic Cleavage Products in Plant-Microbe InteractionsMolecular Plant-Microbe Interactions, 2020, 33 (10), pp.1177-1188. ⟨10.1094/mpmi-04-20-0082-ta⟩
Article dans une revue
hal-02990389v1
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Facing global changeNew Phytologist, 2018, 220 (1), pp.25-29. ⟨10.1111/nph.15376⟩
Article dans une revue
hal-01890694v1
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Do SSPs regulate ectomycorrhizal symbiosis in response to biotic and abiotic nutrient signals in trees?INUPRAG Symposium on Integrative Plant Biology 2023, Feb 2023, Umeå, Sweden
Communication dans un congrès
hal-04186836v1
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What are the roles of SSPs in regulating ECM symbiosis in response to biotic and abiotic nutritional signals in trees?JOURNÉES 2022 SYMBIPHYT, Nov 2022, Dijon, France
Communication dans un congrès
hal-04186873v1
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Investigation of the regulation of ectomycorrhizal symbiosis by nutrient signalling in Poplar4th international Molecular Mycorrhiza Meeting, Feb 2019, Turin, Italy
Communication dans un congrès
hal-04186913v1
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Investigation of the regulation of ECM symbiosis by nutrient signalling in plantsVI WORKSHOP PLANT PEPTIDES AND RECEPTORS, Sep 2018, Antequera, Spain
Communication dans un congrès
hal-04186927v1
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Regulation of ectomycorrhizal symbiosis by nutrient signalling in poplar3rd MPIterMic - ARBRE workshop on Molecular Plant Fungal Interactions, Nov 2018, Cologne, Germany
Poster de conférence
hal-04187772v1
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