Agnès BOUCHEZ

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Présentation

Ecologie microbienne aquatique

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Proficiency testing and cross-laboratory method comparison to support standardisation of diatom DNA metabarcoding for freshwater biomonitoring

Valentin Vasselon , Sinziana Rivera , Éva Ács , Salomé Baja Almeida , Karl Andree et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2025, 9, pp.e133264. ⟨10.3897/mbmg.9.133264⟩

Article dans une revue hal-04930501v1
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Environmental Matrices Need Consideration: Insights From Water and Biofilm Environmental DNA for Multi‐Taxonomic Biomonitoring

Paula Gauvin , Isabelle Domaizon , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet

Environmental DNA, 2025, 7 (2), pp.e70079. ⟨10.1002/edn3.70079⟩

Article dans une revue hal-05150275v1

Adding more taxa to the Cocconeis placentula group (Bacillariophyta): two new species from streams in biodiversity hotspots

Demetrio Mora , Rosalina Stancheva , Nélida Abarca , Agnès Bouchez , Enrique Cantoral-Uriza et al.

Nova Hedwigia, 2024, 118 (3-4), pp.277-319. ⟨10.1127/nova_hedwigia/2024/0918⟩

Article dans une revue hal-05137519v1
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Which barcode to decipher freshwater microalgal assemblages? Tests on mock communities

Alexis Canino , Clarisse Lemonnier , Benjamin Alric , Agnes Bouchez , Isabelle Domaizon et al.

International Journal of Limnology, 2023, 59, pp.8. ⟨10.1051/limn/2023008⟩

Article dans une revue hal-04210529v1
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Diatom endemism and taxonomic turnover: Assessment in high-altitude alpine lakes covering a large geographical range

Frédéric Rimet , Eveline Pinseel , Agnes Bouchez , Bella Japoshvili , Levan Mumladze

Science of the Total Environment, 2023, 871, pp.161970. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.161970⟩

Article dans une revue hal-04247525v1
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eDNA metabarcoding from aquatic biofilms allows studying spatial and temporal fluctuations of fish communities from Lake Geneva

Sinziana F Rivera , Valentin Vasselon , Agnès Bouchez , Frédéric Rimet

Environmental DNA, 2023, 5 (3), pp.570-581. ⟨10.1002/edn3.413⟩

Article dans une revue hal-04213758v1

Environmental filtering and mass effect are two important processes driving lake benthic diatoms: Results of a DNA metabarcoding study in a large lake

Frédéric Rimet , Alexis Canino , Teofana Chonova , Julie Guéguen , Agnes Bouchez

Molecular Ecology, 2023, 32 (1), pp.124-137. ⟨10.1111/mec.16737⟩

Article dans une revue hal-03881952v1
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Evidence of Bacterial Community Coalescence between Freshwater and Discharged tpm-Harboring Bacterial Taxa from Hospital and Domestic Wastewater Treatment Plants among Epilithic Biofilms

Rayan Bouchali , Laurence Marjolet , Leslie Mondamert , Teofana Chonova , Sébastien Ribun et al.

Microorganisms, 2023, 11 (4), pp.922. ⟨10.3390/microorganisms11040922⟩

Article dans une revue hal-04154873v1
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A strategy for successful integration of DNA-based methods in aquatic monitoring

Philippe Blancher , Estelle Lefrançois , Frédéric Rimet , Valentin Vasselon , Christine Argillier et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2022, 6 (e85652), ⟨10.3897/mbmg.6.85652⟩

Article dans une revue hal-03976834v1
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Recommendations for the preservation of environmental samples in diatom metabarcoding studies

Ana Baricevic , Cécile Chardon , Maria Kahlert , Satu Maaria Karjalainen , Daniela Maric Pfannkuchen et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2022, 6 (e85844), ⟨10.3897/mbmg.6.85844⟩

Article dans une revue hal-03976810v1

Environmental DNA metabarcoding for benthic monitoring: A review of sediment sampling and DNA extraction methods

J. Pawlowski , K. Bruce , K. Panksep , F.I. Aguirre , S. Amalfitano et al.

Science of the Total Environment, 2022, 818, pp.151783. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.151783⟩

Article dans une revue hal-03977006v1
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Passive sampling of environmental DNA in aquatic environments using 3D‐printed hydroxyapatite samplers

Héloïse Verdier , Lara Konecny‐dupre , Christophe Marquette , Helen Reveron , Solène Tadier et al.

Molecular Ecology Resources, 2022, 22, pp.2158-2170. ⟨10.1111/1755-0998.13604⟩

Article dans une revue hal-03601922v1
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SIPIBEL observatory: Data on usual pollutants (solids, organic matter, nutrients, ions) and micropollutants (pharmaceuticals, surfactants, metals), biological and ecotoxicity indicators in hospital and urban wastewater, in treated effluent and sludge from wastewater treatment plant, and in surface and groundwater

Jean-Luc Bertrand-Krajewski , Rémy Bournique , Vivien Lecomte , Noémie Pernin , Laure Wiest et al.

Data in Brief, 2022, 40, pp.107726. ⟨10.1016/j.dib.2021.107726⟩

Article dans une revue (data paper) hal-03511662v1
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Ecosystems monitoring powered by environmental genomics: a review of current strategies with an implementation roadmap

Tristan Cordier , Laura Alonso‐sáez , Laure Apothéloz‐perret‐gentil , Eva Aylagas , David Bohan et al.

Molecular Ecology, 2021, 30 (13), pp.2937-2958. ⟨10.1111/mec.15472⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02860583v1

Monitoring the ecological status of rivers with diatom eDNA metabarcoding: a comparison of taxonomic markers and analytical approaches for the inference of a molecular diatom index

Laure Apothéloz‐perret‐gentil , Agnes Bouchez , Tristan Cordier , Arielle Cordonier , Julie Guéguen et al.

Molecular Ecology, 2021, 30 (13), pp.2959-2968. ⟨10.1111/mec.15646⟩

Article dans une revue hal-02955898v1

Fish eDNA metabarcoding from aquatic biofilm samples: Methodological aspects

Sinziana Rivera , Frédéric Rimet , Valentin Vasselon , Marine Vautier , Isabelle Domaizon et al.

Molecular Ecology Resources, 2021, ⟨10.1111/1755-0998.13568⟩

Article dans une revue hal-03510613v1
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Metadata standards and practical guidelines for specimen and DNA curation when building barcode reference libraries for aquatic life

Frédéric Rimet , Eva Aylagas , Ángel Borja , Agnes Bouchez , Alexis Canino et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2021, 5, pp.e58056. ⟨10.3897/mbmg.5.58056⟩

Article dans une revue pasteur-03159791v1
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Phytool, a ShinyApp to homogenise taxonomy of freshwater microalgae from DNA barcodes and microscopic observations

Alexis Canino , Agnes Bouchez , Christophe Laplace-Treyture , Isabelle Domaizon , Frédéric Rimet

Metabarcoding and Metagenomics, 2021, 5, pp.199-205. ⟨10.3897/mbmg.5.74096⟩

Article dans une revue hal-03484541v1

Herbicide-Induced Shifts in the Periphyton Community Composition Indirectly Affect Feeding Activity and Physiology of the Gastropod Grazer Physella acuta

Marco Konschak , Jochen Zubrod , Tomás Duque Acosta , Agnes Bouchez , Alexandra Kroll et al.

Environmental Science and Technology, 2021, 55 (21), pp.14699-14709. ⟨10.1021/acs.est.1c01819⟩

Article dans une revue hal-03510646v1

Expanding ecological assessment by integrating microorganisms into routine freshwater biomonitoring

M. Sagova-Mareckova , J. Boenigk , Agnes Bouchez , K. Cermakova , T. Chonova et al.

Water Research, 2021, 191, pp.116767. ⟨10.1016/j.watres.2020.116767⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-03487093v1
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How can integrated morphotaxonomy- and metabarcoding-based diatom assemblage analyses best contribute to the ecological assessment of streams?

Panayiota Pissaridou , Marco Cantonati , Agnes Bouchez , Iakovos Tziortzis , Gerald Dörflinger et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2021, 5, pp.111-120. ⟨10.3897/MBMG.5.68438⟩

Article dans une revue hal-03528828v1

Cyprus’ diatom diversity and the association of environmental and anthropogenic influences for ecological assessment of rivers using DNA metabarcoding

Panayiota Pissaridou , Valentin Vasselon , Andreas Christou , Teofana Chonova , Athina Papatheodoulou et al.

Chemosphere, 2021, 272, pp.129814. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.129814⟩

Article dans une revue hal-03303887v1

The potential of exact sequence variants (ESVs) to interpret and assess the impact of agricultural pressure on stream diatom assemblages revealed by DNA metabarcoding

Kálmán Tapolczai , Géza Selmeczy , Beáta Szabó , Viktória B-Béres , François Keck et al.

Ecological Indicators, 2021, 122, pp.107322. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.107322⟩

Article dans une revue hal-03238653v1
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Exploring the capacity of aquatic biofilms to act as environmental DNA samplers: Test on macroinvertebrate communities in rivers

Sinziana Rivera , Valentin Vasselon , Nathalie Mary , Olivier Monnier , Fréderic Rimet et al.

Science of the Total Environment, 2021, 763, pp.144208. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.144208⟩

Article dans une revue hal-03103971v1
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Unlocking our understanding of intermittent rivers and ephemeral streams with genomic tools

Rosetta C Blackman , Florian Altermatt , Arnaud Foulquier , Tristan Lefébure , Maïlys Gauthier et al.

Frontiers in Ecology and the Environment, 2021, 19 (10), pp.574-583. ⟨10.1002/fee.2404⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-03369170v1

A pilot experiment to assess the efficiency of pharmaceutical plant wastewater treatment and the decreasing effluent toxicity to periphytic biofilms

Vincent Tardy , Chloé Bonnineau , Agnes Bouchez , Cécile Miège , Matthieu Masson et al.

Journal of Hazardous Materials, 2021, 411, pp.125121. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.125121⟩

Article dans une revue hal-03238813v1
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Environmental filtering and limiting similarity as main forces driving diatom community structure in Mediterranean and continental temporary and perennial streams

Gábor Várbíró , Gabor Borics , Maria Helena Novais , Maria Manuela Morais , Frédéric Rimet et al.

Science of the Total Environment, 2020, 741, pp.140459. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.140459⟩

Article dans une revue hal-02901285v1
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Key questions for next-generation biomonitoring

Andreas Makiola , Zacchaeus G. Compson , Donald J Baird , Matthew A. Barnes , Sam Philip Boerlijst et al.

Frontiers in Environmental Science, 2020, 7, pp.197. ⟨10.3389/fenvs.2019.00197⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02402296v1

The vertical distribution of tetA and intI1 in a deep lake is rather due to sedimentation than to resuspension

Andrea Di cesare , Ester Eckert , Camille Cottin , Agnes Bouchez , Cristiana Callieri et al.

FEMS Microbiology Ecology, 2020, 96 (2), ⟨10.1093/femsec/fiaa002⟩

Article dans une revue hal-02569099v1

Benthic diatom community dynamics in Mediterranean intermittent streams: Effects of water availability and their potential as indicators of dry-phase ecological status

Maria Helena Novais , Eduardo F Morales , Alexandra Marchã Penha , Miguel Potes , Agnes Bouchez et al.

Science of the Total Environment, 2020, 719, pp.137462. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137462⟩

Article dans une revue hal-02520259v1

A taxonomy-free approach based on machine learning to assess the quality of rivers with diatoms

Maria João Feio , Sonia R.Q. Serra , Andreia Mortágua , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet et al.

Science of the Total Environment, 2020, 722, ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137900⟩

Article dans une revue hal-02520169v1
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Diatom metabarcoding applied to large scale monitoring networks: Optimization of bioinformatics strategies using Mothur software

Sinziana Rivera , Valentin Vasselon , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet

Ecological Indicators, 2020, 109, ⟨10.1016/j.ecolind.2019.105775⟩

Article dans une revue hal-02518194v1

Evaluation and sensitivity analysis of diatom DNA metabarcoding for WFD bioassessment of Mediterranean rivers

Javier Pérez-Burillo , Rosa Trobajo , Valentin Vasselon , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez et al.

Science of the Total Environment, 2020, 727, ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.138445⟩

Article dans une revue hal-02557859v1

The impact of OTU sequence similarity threshold on diatom-based bioassessment: A case study of the rivers of Mayotte (France, Indian Ocean)

Kalman Tapolczai , Valentin Vasselon , Agnes Bouchez , Csilla Stenger-Kovács , Judit Padisák et al.

Ecology and Evolution, 2019, 9 (1), pp.166-179. ⟨10.1002/ece3.4701⟩

Article dans une revue hal-02619428v1

Factors influencing the heterogeneity of benthic diatom communities along the shoreline of natural alpine lakes

Frédéric Rimet , Léa Féret , Agnes Bouchez , Jean Marcel Dorioz , Etienne Dambrine

Hydrobiologia, 2019, 839 (1), pp.103-118. ⟨10.1007/s10750-019-03999-z⟩

Article dans une revue hal-02618767v1
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Assessing pollution of aquatic environments with diatoms' DNA metabarcoding: experience and developments from France Water Framework Directive networks

Valentin Vasselon , Frédéric Rimet , Isabelle Domaizon , Olivier Monnier , Yorick Reyjol et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2019, 3, ⟨10.3897/mbmg.3.39646⟩

Article dans une revue hal-03148548v1

Diat.barcode, an open-access curated barcode library for diatoms

Frédéric Rimet , Evgenuy Gusev , Maria Kahlert , Martyn G. Kelly , Maxim Kulikovskiy et al.

Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-51500-6⟩

Article dans une revue hal-02619171v1
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Benthic Diatom Communities in an Alpine River Impacted by Waste Water Treatment Effluents as Revealed Using DNA Metabarcoding

Teofana Chonova , Rainer Kurmayer , Frédéric Rimet , Jérôme Labanowski , Valentin Vasselon et al.

Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00653⟩

Article dans une revue hal-02381793v1
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Recommandations d'un collectif franco-suisse d'experts pour une meilleure évaluation de la qualité écotoxicologique des sédiments par l'étude des communautés benthiques

Stéphane Pesce , J.D. Ferrari , C. Bonnineau , C. Casado , L. Apotheloz Perret Gentil et al.

Sciences Eaux & Territoires, 2019, HS, pp.9. ⟨10.14758/SET-REVUE.2019.hs.04⟩

Article dans une revue hal-02609267v1

Applicability of DNA metabarcoding approach in the bioassessment of Portuguese rivers using diatoms

Andreia Mortágua , Valentin Vasselon , Ricardo Oliveira , Carmen Elias , Cécile Chardon et al.

Ecological Indicators, 2019, 106, pp.105470. ⟨10.1016/j.ecolind.2019.105470⟩

Article dans une revue hal-02623986v1
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Diatom DNA metabarcoding for biomonitoring: strategies to avoid major taxonomical and bioinformatical biases Llmiting molecular indices capacities

Kálmán Tapolczai , François Keck , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet , Maria Kahlert et al.

Frontiers in Ecology and Evolution, 2019, 7, ⟨10.3389/fevo.2019.00409⟩

Article dans une revue hal-02624302v1
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A comparison of biotic groups as dry-phase indicators of ecological quality in intermittent rivers and ephemeral streams

R. Stubbington , A. Paillex , J. England , A. Barthes , Agnes Bouchez et al.

Ecological Indicators, 2019, 97, pp.165-174. ⟨10.1016/j.ecolind.2018.09.061⟩

Article dans une revue hal-02608198v1

Autumn drought drives functional diversity of benthic diatom assemblages of continental intermittent streams

Viktória B-Béres , Béla Tóthmérész , István Bácsi , Gabor Borics , András Abonyi et al.

Advances in Water Resources, 2019, 126, pp.129-136. ⟨10.1016/j.advwatres.2019.02.010⟩

Article dans une revue hal-02619814v1

Molecular versus morphological data for benthic diatoms biomonitoring in Northern Europe freshwater and consequences for ecological status

Bonnie Bailet , Agnes Bouchez , Alain Franc , Jean-Marc Frigerio , François Keck et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2019, 3, ⟨10.3897/mbmg.3.34002⟩

Article dans une revue hal-02432989v1

DNA barcode reference libraries for the monitoring of aquatic biota in Europe: Gap-analysis and recommendations for future work

Hannah Weigand , Arne J. Beermann , Filipe O. Costa , Zoltán Csabai , Sofia Duarte et al.

Science of the Total Environment, 2019, 678, pp.499-524. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.04.247⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02626077v1

Connecting the morphological and molecular species concepts to facilitate species identification within the genus Fragilaria (Bacillariophyta)

Maria Kahlert , Martyn G. Kelly , David G. Mann , Frédéric Rimet , Shinya Sato et al.

Journal of Phycology, 2019, 55 (4), pp.948-970. ⟨10.1111/jpy.12886⟩

Article dans une revue hal-02628803v1

The future of biotic indices in the ecogenomic era: Integrating (e)DNA metabarcoding in biological assessment of aquatic ecosystems

Jan Pawlowski , Mary Kelly-Quinn , Florian Altermatt , Laure Apothéloz-Perret-Gentil , Pedro Beja et al.

Science of the Total Environment, 2018, 637-638, pp.1295-1310. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.05.002⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02629210v1

River biofilm community changes related to pharmaceutical loads emitted by a wastewater treatment plant

Teofana Chonova , Jérôme Labanowski , Benoit Cournoyer , Cècile Chardon , François Keck et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (10), pp.9254-9264. ⟨10.1007/s11356-017-0024-0⟩

Article dans une revue hal-01859406v1
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Development and implementation of eco-genomic tools for aquatic ecosystem biomonitoring: the SYNAQUA French-Swiss program

Estelle Lefrancois , Laure Apothéloz-Perret-Gentil , Philippe Blancher , Samuel Botreau , Cécile Chardon et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (34), pp.33858-33866. ⟨10.1007/s11356-018-2172-2⟩

Article dans une revue hal-02916342v1

SIPIBEL : un site pilote pour l’étude des effluents hospitaliers et urbains. Les grands enseignements après cinq ans de suivi et de recherche

Vivien Lecomte , Jean-Luc Bertrand-Krajewski , Agnes Bouchez , Benoit Cournoyer , Christophe Dagot et al.

Environnement, Risques & Santé, 2018, 17 (S1), pp.59-74. ⟨10.1684/ers.2017.1074⟩

Article dans une revue hal-01825316v1

Implementation options for DNA-based identification into ecological status assessment under the european water framework directive

Daniel Hering , Angel Borja , J.Iwan Jones , Didier Pont , Pieter Boets et al.

Water Research, 2018, 138, pp.192-205. ⟨10.1016/j.watres.2018.03.003⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02626478v1

Metabarcoding of lake benthic diatoms: from structure assemblages to ecological assessment

S. F. Rivera , Valentin Vasselon , Stéphan Jacquet , Agnes Bouchez , D. Ariztegui et al.

Hydrobiologia, 2018, 807 (1), pp.37-51. ⟨10.1007/s10750-017-3381-2⟩

Article dans une revue hal-02621047v1

Boosting DNA metabarcoding for biomonitoring with phylogenetic estimation of OTUs' ecological profiles

F Keck , Valentin Vasselon , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez , M Kahlert

Molecular Ecology Resources, 2018, 18 (6), pp.1299-1309. ⟨10.1111/1755-0998.12919⟩

Article dans une revue hal-02625977v1
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DNA metabarcoding and microscopic analyses of sea turtles biofilms: Complementary to understand turtle behavior

Sinziana Rivera , Valentin Vasselon , Katia Ballorain , Alice Carpentier , Carlos E. Wetzel et al.

PLoS ONE, 2018, 13 (4), pp.e0195770. ⟨10.1371/journal.pone.0195770⟩

Article dans une revue hal-02624564v1
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Sensitivities of seven algal species to triclosan, fluoxetine and their mixtures

Ran Bi , Xiangfeng Zeng , Lei Mu , Liping Hou , Wenhua Liu et al.

Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-33785-1⟩

Article dans une revue hal-02621712v1

Do we similarly assess diversity with microscopy and high-throughput sequencing? Case of microalgae in lakes

Frédéric Rimet , Valentin Vasselon , Barbara A.-Keszte , Agnes Bouchez

Organisms Diversity and Evolution, 2018, 18 (1), pp.51-62. ⟨10.1007/s13127-018-0359-5⟩

Article dans une revue hal-02625205v1

Sensitive vs. tolerant Nitzschia palea (Kützing) W. Smith strains to atrazine: a biochemical perspective

S M Esteves , S F P Almeida , S Gonçalves , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez et al.

Ecotoxicology, 2018, 27 (7), pp.860-870. ⟨10.1007/s10646-018-1953-1⟩

Article dans une revue hal-02623950v1

The SIPIBEL project: treatment of hospital and urban wastewater in a conventional urban wastewater treatment plant.

Teofana Chonova , Vivien Lecomte , Jean-Luc Bertrand-Krajewski , Agnes Bouchez , Jérôme Labanowski et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (10), pp.9197-9206. ⟨10.1007/s11356-017-9302-0⟩

Article dans une revue hal-01606931v1

The potential of High-Throughput Sequencing (HTS) of natural samples as a source of primary taxonomic information for reference libraries of diatom barcodes

Frédéric Rimet , Nelida Abarca , Agnes Bouchez , Wolf-Henning Kusber , Regine Jahn et al.

Fottea (Praha), 2018, 18 (1), pp.37-54. ⟨10.5507/fot.2017.013⟩

Article dans une revue hal-02624468v1
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ECOTOX, new questions for terrestrial and aquatic ecotoxicology

Christian Mougin , Agnes Bouchez , Laurence Denaix , Jeanne Garric , Fabrice Martin-Laurent

Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (34), ⟨10.1007/s11356-018-3179-4⟩

Article dans une revue hal-01878281v1
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Benthic diatom communities in high altitude lakes: a large scale study in the French Alps

Léa Féret , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet

Annales de Limnologie - International Journal of Limnology, 2017, 53, pp.411-423. ⟨10.1051/limn/2017025⟩

Article dans une revue hal-02619291v1
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Freshwater biomonitoring in the Information age

Francois Keck , Valentin Vasselon , Kalman Tapolczai , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Frontiers in Ecology and the Environment, 2017, 15 (5), pp.266-274. ⟨10.1002/fee.1490⟩

Article dans une revue hal-01604509v1

Taxonomy- or trait-based ecological assessment for tropical rivers? Case study on benthic diatoms in Mayotte island (France, Indian Ocean)

Kalman Tapolczai , Agnes Bouchez , Csilla Stenger-Kovács , Judit Padisák , Frédéric Rimet

Science of the Total Environment, 2017, 607-608, pp.1293-1303. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.07.093⟩

Article dans une revue hal-01604595v1

Assessing ecological status with diatoms DNA metabarcoding: Scaling-up on a WFD monitoring network (Mayotte island, France)

Valentin Vasselon , Frédéric Rimet , Kalman Tapolczai , Agnes Bouchez

Ecological Indicators, 2017, 82, pp.1-12. ⟨10.1016/j.ecolind.2017.06.024⟩

Article dans une revue hal-02622658v1

Spatio-Temporal Variations of Marine Biofilm Communities Colonizing Artificial Substrata Including Antifouling Coatings in Contrasted French Coastal Environments

Jean-François Briand , Aude Barani , Cédric Garnier , Karine Rehel , Félix Urvois et al.

Microbial ecology, 2017, 74 (3), pp.585 - 598. ⟨10.1007/s00248-017-0966-2⟩

Article dans une revue hal-01599314v1
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Application of high-throughput sequencing (HTS) metabarcoding to diatom biomonitoring: Do DNA extraction methods matter?

Valentin Vasselon , Isabelle Domaizon , Frédéric Rimet , Maria Kahlert , Agnes Bouchez

Freshwater Science, 2017, 36 (1), pp.162-177. ⟨10.1086/690649⟩

Article dans une revue hal-01606868v1

Can we predict diatoms herbicide sensitivities with phylogeny? Influence of intraspecific and interspecific variability

Sara Esteves , Francois Keck , Salome Almeida , Etelvina Lourenço Figueira , Agnes Bouchez et al.

Ecotoxicology, 2017, 26 (8), ⟨10.1007/s10646-017-1834-z⟩

Article dans une revue hal-01604474v1
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Avoiding quantification bias in metabarcoding: Application of a cell biovolume correction factor in diatom molecular biomonitoring

Valentin Vasselon , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet , Stéphan Jacquet , Rosa Trobajo et al.

Methods in Ecology and Evolution, 2017, 9 (4), pp.1060-1069. ⟨10.1111/2041-210X.12960⟩

Article dans une revue hal-02916343v1

Separate treatment of hospital and urban wastewaters: A real scale comparison of effluents and their effect on microbial communities

Teofana Chonova , François Keck , Jérôme Labanowski , Bernard Montuelle , Frédéric Rimet et al.

Science of the Total Environment, 2016, 542, pp.965-975. ⟨10.1016/j.scitotenv.2015.10.161⟩

Article dans une revue istex hal-01445038v1
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ECOTOX, the INRA’s network of ecotoxicologists, a major structure involved for the coordination and structuring of the French research in ecotoxicology

Christian Mougin , Agnes Bouchez , Laurence Denaix , Francois Laurent , Fabrice Martin-Laurent

Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (4), pp.2969-2973. ⟨10.1007/s11356-015-5948-7⟩

Article dans une revue hal-02634692v1
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Report on the fifth meeting of INRA’s national network of ecotoxicologists, ECOTOX

Christian Mougin , Agnes Bouchez , Laurence Denaix , Isabelle Lamy , Francois Laurent et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (4), pp.2974-2976. ⟨10.1007/s11356-015-4279-z⟩

Article dans une revue hal-01512225v1
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Linking phylogenetic similarity and pollution sensitivity to develop ecological assessment methods: a test with river diatoms

François Keck , Agnes Bouchez , Alain Franc , Frédéric Rimet

Journal of Applied Ecology, 2016, 53 (3), pp.856-864. ⟨10.1111/1365-2664.12624⟩

Article dans une revue hal-01426853v1

Pollution-induced community tolerance (PICT) as a tool for monitoring Lake Geneva long-term in situ ecotoxic restoration from herbicide contamination

Floriane Larras , Frédéric Rimet , V. Gregorio , Annette A. Berard , C. Leboulanger et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (5), pp.4301-4311. ⟨10.1007/s11356-015-5302-0⟩

Article dans une revue hal-01293534v1

Comparison of specific versus literature species sensitivity distributions for herbicides risk assessment

Floriane Larras , Vincent Gregorio , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle , Nathalie Chèvre

Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (4), pp.3042-3052. ⟨10.1007/s11356-015-5430-6⟩

Article dans une revue hal-02637650v1

Trait-based ecological classifications for benthic algae: review and perspectives

Kálmán Tapolczai , Agnes Bouchez , Csilla Stenger-Kovács , Judit Padisák , Frédéric Rimet

Hydrobiologia, 2016, 776 (1), pp.1-17. ⟨10.1007/s10750-016-2736-4⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02631412v1

Phylogenetic signal in diatom ecology: perspectives for aquatic ecosystems biomonitoring

François Keck , Frédéric Rimet , Alain Franc , Agnes Bouchez

Ecological Applications, 2016, 26 (3), pp.861 - 872. ⟨10.1890/14-1966⟩

Article dans une revue hal-01426854v1

Pollution-induced community tolerance (PICT): towards an ecologically relevant risk assessment of chemicals in aquatic systems

Ahmed Tlili , Annette Berard , Hans Blanck , Agnes Bouchez , Fernanda Cassio et al.

Freshwater Biology, 2016, 61 (12, SI), pp.2141-2151. ⟨10.1111/fwb.12558⟩

Article dans une revue hal-01473127v1
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R-Syst::diatom: an open-access and curated barcode database for diatoms and freshwater monitoring

Frédéric Rimet , Philippe Chaumeil , François Keck , Lenaïg Kermarrec , Valentin Vasselon et al.

Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2016, 2016, pp.baw016. ⟨10.1093/database/baw016⟩

Article dans une revue hal-01426772v1

Spatial heterogeneity of littoral benthic diatoms in a large lake: monitoring implications

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez , Kálmán Tapolczai

Hydrobiologia, 2016, 771 (1), pp.179-193. ⟨10.1007/s10750-015-2629-y⟩

Article dans une revue hal-02634391v1

Rejets d'effluents hospitaliers : évaluation de la persistance environnementale des médicaments et des bactéries pathogènes: La démarche du projet Persist-Env

J. Labanowski , E. Laurent , T. Chonova , Agnes Bouchez , B. Cournoyer et al.

TSM. Techniques Sciences Méthodes – Génie urbain, génie rural, 2016, 6, pp.22-30. ⟨10.1051/tsm/201606022⟩

Article dans une revue hal-02466014v1
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phylosignal: an R package to measure, test, and explore the phylogenetic signal

François Keck , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez , Alain Franc

Ecology and Evolution, 2016, 6 (9), pp.2774 - 2780. ⟨10.1002/ece3.2051⟩

Article dans une revue hal-01426773v1

Benthic diatoms and phytoplankton to assess nutrients in a large lake: Complementarity of their use in Lake Geneva (France–Switzerland)

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle

Ecological Indicators, 2015, 53, pp.231-239. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.02.008⟩

Article dans une revue istex hal-02636810v1

A next-generation sequencing approach to river biomonitoring using benthic diatoms

Lenaïg Kermarrec , Alain Franc , Frédéric Rimet , Philippe Chaumeil , Jean-Marc Frigerio et al.

Freshwater Science, 2014, 33 (1), pp.349-363. ⟨10.1086/675079⟩

Article dans une revue hal-02632667v1
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Comparative sensitivity to the fungicide tebuconazole of biofilm and plankton microbial communities in freshwater ecosystems

Joan Artigas , N. Pascault , Agnes Bouchez , J. Chastaine , D. Debroas et al.

Science of the Total Environment, 2014, 468-469, pp.326-336. ⟨10.1016/j.scitotenv.2013.08.074⟩

Article dans une revue istex hal-00995683v2

Antifouling Coatings Influence both Abundance and Community Structure of Colonizing Biofilms: a Case Study in the Northwestern Mediterranean Sea

Mercedes Camps , Aude Barani , Gérald Grégori , Agnes Bouchez , Brigitte Le Berre et al.

Applied and Environmental Microbiology, 2014, 80 (16), pp.4821-4831. ⟨10.1128/AEM.00948-14⟩

Article dans une revue hal-03183971v1

Seasonal shift in the sensitivity of a natural benthic microalgal community to a herbicide mixture: impact on the protective level of thresholds derived from species sensitivity distributions

Floriane Larras , Bernard Montuelle , Frédéric Rimet , Nathalie Chèvre , Agnes Bouchez

Ecotoxicology, 2014, 23 (6), pp.1109-1123. ⟨10.1007/s10646-014-1254-2⟩

Article dans une revue hal-02636768v1

When is sampling complete? The effects of geographical range and marker choice on perceived diversity in Nitzschia palea (Bacillariophyta)

Frédéric Rimet , Rosa Trobajo , David.G. Mann , Lenaïg Kermarrec , Alain Franc et al.

Protist, 2014, 165 (3), pp.245-259. ⟨10.1016/j.protis.2014.03.005⟩

Article dans une revue istex hal-02640347v1

Linking diatom sensitivity to herbicides to phylogeny: a step forward for biomonitoring?

Floriane Larras , Francois Keck , Bernard Montuelle , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Environmental Science and Technology, 2014, 48 (3), pp.1921-1930. ⟨10.1021/es4045105⟩

Article dans une revue hal-02636747v1

A high-throughput sequencing ecotoxicology study of freshwater bacterial communities and their responses to tebuconazole

Noémie Pascault , Simon Roux , Joan Artigas , Stéphane Pesce , Julie Leloup et al.

FEMS Microbiology Ecology, 2014, 90 (3), pp.25135322. ⟨10.1111/1574-6941.12416⟩

Article dans une revue hal-01110178v1

Influence of herbicide contamination on diversity and ecological guilds of river diatoms

Rémy Marcel , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet

Cryptogamie Algologie, 2013, 34 (2), pp.169 - 183. ⟨10.7872/crya.v34.iss2.2013.169⟩

Article dans une revue hal-02644367v1

Next-generation sequencing to inventory taxonomic diversity in eukaryotic communities: a test for freshwater diatoms

Lenaïg Kermarrec , Alain Franc , Frédéric Rimet , Philippe Chaumeil , Jean-François Humbert et al.

Molecular Ecology Resources, 2013, 13, pp.607-619

Article dans une revue bioemco-00840234v1

First Evidence of the Existence of Semi-Cryptic Species and of a Phylogeographic Structure in the Gomphonema parvulum (Kutzing) Kutzing Complex (Bacillariophyta)

Lenaïg Kermarrec , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet , Jean Francois Humbert

Protist, 2013, 164 (5), pp.686 - 705. ⟨10.1016/j.protis.2013.07.005⟩

Article dans une revue istex hal-02645491v1

Assessment of toxicity thresholds in aquatic environments: Does benthic growth of diatoms affect their exposure and sensitivity to herbicides?

Floriane Larras , Bernard Montuelle , Agnes Bouchez

Science of the Total Environment, 2013, 463, pp.469 - 477. ⟨10.1016/j.scitotenv.2013.06.063⟩

Article dans une revue istex hal-02652453v1

Next-generation sequencing to inventory taxonomic diversity in eukaryotic communities: a test for freshwater diatoms

Lenaïg Kermarrec , Alain Franc , Frédéric Rimet , Philippe Chaumeil , Jean Francois Humbert et al.

Molecular Ecology Resources, 2013, 13 (4), pp.607-619. ⟨10.1111/1755-0998.12105⟩

Article dans une revue istex hal-02644189v1

The effect of temperature and a herbicide mixture on freshwater periphytic algae

Floriane Larras , A.S. Lambert , Stéphane Pesce , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez et al.

Ecotoxicology and Environmental Safety, 2013, 98, pp.162-170. ⟨10.1016/j.ecoenv.2013.09.007⟩

Article dans une revue hal-02599031v1
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Mangrove microbial diversity and the impact of trophic contamination

Agnes Bouchez , Noémie Pascault , Cècile Chardon , Marc Bouvy , Philippe Cecchi et al.

Marine Pollution Bulletin, 2013, vol. 66 (1-2), pp. 39-46. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.11.015⟩

Article dans une revue hal-00956925v1
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Life-forms, cell-sizes and ecological guilds of diatoms in European rivers

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2012, 406, ⟨10.1051/kmae/2012018⟩

Article dans une revue hal-02650771v1

The submillimeter spectrum of deuterated glycolaldehydes

Agnes Bouchez , L. Margulès , R. A. Motiyenko , Jean-Claude Guillemin , A. Walters et al.

Astronomy & Astrophysics - A&A, 2012, 540, pp.51. ⟨10.1051/0004-6361/201118701⟩

Article dans une revue hal-00904702v1

Pioneer marine biofilms on artificial surfaces including antifouling coatings immersed in two contrasting French Mediterranean coast sites

Jean-François Briand , Ikram Djeridi , Dominique Jamet , Stéphane Coupé , Christine Bressy et al.

Biofouling, 2012, 28 (5), pp.453--463. ⟨10.1080/08927014.2012.688957⟩

Article dans une revue hal-01362664v1
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Using bioassays and species sensitivity distributions to assess herbicide toxicity towards benthic diatoms

Floriane Larras , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet , Bernard Montuelle

PLoS ONE, 2012, 7 (8), ⟨10.1371/journal.pone.0044458⟩

Article dans une revue hal-02643239v1

Risk of herbicide mixtures as a key parameter to explain phytoplankton fluctuation in a great lake: the case of Lake Geneva, Switzerland

Vincent Gregorio , Lucie Buechi , Orlane Anneville , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez et al.

Ecotoxicology, 2012, 21 (8), pp.2306 - 2318. ⟨10.1007/s10646-012-0987-z⟩

Article dans une revue hal-02644910v1

Biomonitoring river diatoms : implications of taxonomic resolution

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Ecological Indicators, 2012, 15 (1), pp.92-99. ⟨10.1016/j.ecolind.2011.09.014⟩

Article dans une revue istex hal-02651506v1

Using diatom life-forms and ecological guilds to assess organic pollution and trophic level in rivers : a case study of rivers in south-eastern France

Vincent Berthon , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet

Hydrobiologia, 2011, 673, pp.259-271. ⟨10.1007/s10750-011-0786-1⟩

Article dans une revue istex hal-02650841v1

Use of diatom life-forms and ecological guilds to assess pesticide contamination in rivers : lotic mesocosm approaches

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Ecological Indicators, 2011, 11, pp.489-499. ⟨10.1016/j.ecolind.2010.07.004⟩

Article dans une revue hal-02648538v1

Molecular phylogeny of the family Bacillariaceae based on 18S rDNA sequences: focus on freshwater Nitzschia of the section Lanceolatae

Frédéric Rimet Rimet , Lenaïg L. Kermarrec , Agnes Bouchez , Lucien L. Hoffmann , Luc L. Ector et al.

Diatom Research, 2011, 26, pp.273-291. ⟨10.1080/0269249X.2011.597988⟩

Article dans une revue hal-00956037v1

Comparison of the Effects of Two Herbicides and an Insecticide on Tropical Freshwater Plankton in Microcosms

C. Leboulanger , M. Bouvy , Philippe Cecchi , Laurence Amalric , Agnes Bouchez et al.

Archives of Environmental Contamination and Toxicology, 2011, 61 (4), pp.599-613. ⟨10.1007/s00244-011-9653-3⟩

Article dans une revue istex hal-00681317v1
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Effects of organic herbicides on phototrophic microbial communities in freshwater ecosystems

S. Pesce , Agnes Bouchez , B. Montuelle

Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 2011, 214, p. 87 - p. 124. ⟨10.1007/978-1-4614-0668-6_5⟩

Article dans une revue hal-00655976v1

A preliminary phylogenetic analysis of the Cymbellales based on 18S rDNA gene sequencing

Lenaïg Kermarrec , Luc Ector , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet , Lucien Hoffmann

Diatom Research, 2011, 26 (3), pp.305 - 315. ⟨10.1080/0269249X.2011.633255⟩

Article dans une revue hal-02648431v1

Impact of chronic and acute pesticide exposures on periphyton communities

Ahmed Tlili , Bernard Montuelle , Annette A. Berard , Agnes Bouchez

Science of the Total Environment, 2011, 409 (11), pp.2102-2113. ⟨10.1016/j.scitotenv.2011.01.056⟩

Article dans une revue istex hal-01319985v1

In-situ interactions between the effects of season, current velocity and pollution on a river biofilm

A. Villeneuve , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle

Freshwater Biology, 2011, 56 (11), pp.2245-2259. ⟨10.1111/j.1365-2427.2011.02649.x⟩

Article dans une revue istex hal-02595328v1

Effects of flow regime and pesticides on periphytic communities : evolution and role of biodiversity

Aurélie Villeneuve , Bernard Montuelle , Agnes Bouchez

Aquatic Toxicology, 2011, 102 (1), pp.123-133. ⟨10.1016/j.aquatox.2011.01.004⟩

Article dans une revue istex hal-02646239v1

Influence of slight differences in environmental conditions (light, hydrodynamics) on the structure and function of periphyton

A. Villeneuve , Bernard Montuelle , Agnes Bouchez

Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, 2010, 72 (1), pp.33-44. ⟨10.1007/s00027-009-0108-0⟩

Article dans une revue istex hal-02594603v1

Transplantation of Microbenthic Algal assemblages to Assess Structural and Functional Recovery After Diuron Exposure

Ursula Dorigo , A. Berard , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet , Bernard Montuelle

Archives of Environmental Contamination and Toxicology, 2010, 59 (4), pp.555-563. ⟨10.1007/s00244-010-9511-8⟩

Article dans une revue istex hal-02593840v1

In situ assessment of periphyton recovery in a river contaminated by pesticides

Ursula Dorigo , A. Berard , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle

Aquatic Toxicology, 2010, 98 (4), pp.396-406. ⟨10.1016/j.aquatox.2010.03.011⟩

Article dans une revue hal-02593841v1

The periphyton as a multimetric bioindicator for assessing the impact of land use on rivers: an overview of the Ardières-Morcille experimental watershed (France)

Bernard Montuelle , Ursula Dorigo , A. Berard , B. Volat , Agnes Bouchez et al.

Hydrobiologia, 2010, 657 (1), pp.123-141. ⟨10.1007/s10750-010-0105-2⟩

Article dans une revue istex hal-02593726v1

Genotoxic pressure of vineyard pesticides in fish : field and mesocosm surveys

Sylvie Bony , Christian C. Gillet , Agnes Bouchez , Christelle Margoum , Alain Devaux

Aquatic Toxicology, 2008, 89 (3), pp.197-203. ⟨10.1016/j.aquatox.2008.06.017⟩

Article dans une revue istex hal-02657801v1

Response of chronically contaminated biofilms to short pluses of diuron: an experimental study simulating flooding events in a small river

Amani Tlili , Ursula Dorigo , Bernard Montuelle , C. Margoum , Nadia Carluer et al.

Aquatic Toxicology, 2008, 87 (4), pp.252-263. ⟨10.1016/j.aquatox.2008.02.004⟩

Article dans une revue istex hal-02590778v1

Genotoxic pressure of vineyard pesticides in fish: field and mesocosm surveys

Sylvie Bony , C. Gillet , Agnes Bouchez , C. Margoum , Alain Devaux

Aquatic Toxicology, 2008, 89, pp.197-203

Article dans une revue hal-02590841v1

The use of MapPop1.0 for choosing a QTL mapping sample from an advanced backcross population.

Christelle Birolleau-Touchard , Eric Hanocq , Agnes Bouchez , Cyril Bauland , Isabelle Dourien et al.

TAG Theoretical and Applied Genetics, 2007, 114 (6), pp.1019-1028. ⟨10.1007/s00122-006-0495-8⟩

Article dans une revue istex hal-02655103v1

Lotic biofilm community structure and pesticide tolerance along a contamination gradient in a vineyard area

Ursula Dorigo , Christophe Leboulanger , Annette Bérard , Agnes Bouchez , Jean-François Humbert et al.

Aquatic Microbial Ecology, 2007, 50 (1), pp.91-102. ⟨10.3354/ame01133⟩

Article dans une revue hal-02590216v1

Marker-assisted introgression of favorable alleles at quantitative trait loci between maize elite lines

Agnes Bouchez , Frederic F. Hospital , Mathilde M. Causse , A. Gallais , Alain A. Charcosset

Genetics, 2002, 162, pp.1945-1959

Article dans une revue hal-02670246v1

Efficiency of the use of doubled-haploids in recurrent selection for combining ability

Agnes Bouchez , A. Gallais

Crop Science, 2000, 40 (1), pp.23-29

Article dans une revue hal-02698581v1

Sampling problems with nested mating designs for estimating epistatic variance components in testcrosses of maize

Christine Epinat , Agnes Bouchez , Alain A. Charcosset , A. Gallais

Maydica, 1996, 41, pp.287-293

Article dans une revue hal-02686996v1

Evaluation of selection index : application to the choice of an indirect multitrait selection index for soybean breeding

Agnes Bouchez , Bruno Goffinet

TAG Theoretical and Applied Genetics, 1990, 79, pp.261-267

Article dans une revue hal-02714729v1

Evaluation of selection index: application to the choice of an indirect multitrait selection index for soybean breeding

Agnes Bouchez , Bruno Goffinet , . Station de Biometrie Et Intelligence Artificielle

TAG Theoretical and Applied Genetics, 1989, 701, pp.1-7

Article dans une revue hal-02719138v1

eDNA outperforms traditional methods for detecting organic pollution in a non- perennial river

Héloïse Verdier , Thibault Datry , Lara Konecny-Dupré , Maïlys Gauthier , Maxence Forcellini et al.

AquaEcOmic, Mar 2025, Evian les Bains, France

Communication dans un congrès hal-05009809v1

Comprendre le métabarcoding des diatomées pour appréhender les enjeux de la bioindication du futur

Valentin Vasselon , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez , Olivier Monnier

41ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France

Communication dans un congrès hal-05481130v1

Exposure of benthic microbial communities to pharmaceuticals and resulting adaptation including tolerance, biodegradation and antibiotic resistance: advances and challenges

Chloé Bonnineau , Joan Artigas , Agnes Bouchez , Christophe Dagot , Marion Devers-Lamrani et al.

EcotoxicoMic 2022, 3rd international conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2022, Montpelier, France

Communication dans un congrès hal-03982093v1

The impact of urban contamination on antibioresistance in microbial communities from periphyton and sediments

Chloe Bonnineau , Agnes Bouchez , Anais Charton , Christophe Dagot , Marion Devers et al.

EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier (virtual), France

Communication dans un congrès hal-03145351v1

Importance de la variabilité intraspécifique de la polluosensibilité pour l’évaluation du risque ecotoxicologique basée sur l’approche SSD (Species Sensitivity Distribution)

Vincent Baillard , Laurine Malardier , Marie Laure Delignette-Muller , Eva Roubeau Dumont , Arnaud Elger et al.

38ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03172724v1

ANTIBIO-TOOLS : Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatiques

C. Bonnineau , Agnes Bouchez , J. Labanowski , Christophe Dagot , F. Martin Laurent

Séminaire PNREST : Séminaire de présentation des projets APR2017 (ANSES), Mar 2018, Maisons-Alfort, France. pp.39

Communication dans un congrès hal-02608136v1
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Effluents hospitaliers et stations d'épuration urbaines : sept années de suivi, d'études et de recherche sur SIPIBEL

Jean-Luc Bertrand-Krajewski , Rayan Bouchali , Agnes Bouchez , Elodie Brelot , Claire Brivet et al.

23èmes JIE – Journées Information Eaux, Oct 2018, Poitiers, France. pp.03-1 - 03-18

Communication dans un congrès hal-01948652v1

Évaluation in situ de l'efficacité d'une station de traitement de l'industrie pharmaceutique et de la toxicité des effluents qui en résultent sur la diversité et l'activité des biofilms microbiens aquatiques

Vincent Tardy , C. Bonnineau , Agnes Bouchez , C. Rosy , B. Motte et al.

4ème Journées d'Ecotoxicologie Microbienne - Forum Santé Environnement & Molécules, Oct 2018, Valence, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-02608050v1

Effects of water intermittency on diatom (Bacillariophyta) and invertebrate (aquatic and terrestrial) communities in streams of southern Portugal

Maria Helena Novais , Maria Alexandra Penha , Eduardo Morales , Amalia Oliveira , Agnes Bouchez et al.

Iberian Limnological Society meeting, Jun 2018, Coimbra, Portugal

Communication dans un congrès hal-03138079v1

Flux Polluants, Ecotoxicologie, Ecosystèmes du bassin du Rhône

E. Naffrechoux , Agnes Bouchez

ZABR, Feb 2018, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-01995510v1

La tolérance et l'adaptation des communautés microbiennes aux micropolluants comme indicateur de l'état des milieux

Amani Tlili , Stéphane Pesce , E. Lyautey , F. Martin-Laurent , Agnes Bouchez

Séminaire SediCommuTOX, Apr 2017, Villié-Morgon, France. pp.27

Communication dans un congrès hal-02606718v1
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ECOTOX, le Réseau des écotoxicologues de l'INRA et de ses partenaires

Christian Mougin , Agnes Bouchez , Laurence Denaix , Fabrice Martin-Laurent

Forum ECO-TOX, Ecoparc Rovaltain, Oct 2016, Alixan, France

Communication dans un congrès hal-01604659v1

Gaps to fill when analyzing freshwater diatom diversity with DNA barcoding – notes from a boreal region

Maria Kahlert , Agnes Bouchez , Philippe Chaumeil , Alain Franc , Jean-Marc Frigerio et al.

6. European Phycological Congress, Aug 2015, Londres, United Kingdom. ⟨10.1080/09670262.2015.1069489⟩

Communication dans un congrès hal-02743082v1
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Lien entre la phylogénie des diatomées et leur sensibilité aux herbicides

Francois Keck , Floriane Larras , Frédéric Rimet , Bernard Montuelle , Agnes Bouchez

5. Séminaire d'Ecotoxicologie de l'INRA, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., Nov 2014, Biarritz, France. 66 p

Communication dans un congrès hal-02743084v1
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R-SYST network : a French consortium for barcoding and species identification

Agnes Bouchez , Marc Buée , Philippe Chaumeil , Valerie Laval , Marion Le Saux et al.

Journées annuelles de la Société Française de Systématique : "Systématique et sciences participatives", Oct 2013, Paris, France. 1 p

Communication dans un congrès hal-01209971v1
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Marine biofilm communities colonizing antifouling paints in the Mediterranean Sea

Mercedes Camps , Gérald Grégori , Agnes Bouchez , Aude Barani , Brigitte Le Berre et al.

14th International Congress : The power of the small, International Society for Microbial Ecology (ISME). Copenhagen, INT., Aug 2012, Copenhagen, Denmark

Communication dans un congrès hal-02807526v1
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metaMatch: un algorithme pour l'assignation taxonomique en métagénomique

Jean-Marc Frigerio , Philippe Chaumeil , Pierre Gay , Lenaïg Kermarrec , Frédéric Rimet et al.

journées scientifiques mésocentres et France Grilles 2012, Oct 2012, Paris, France

Communication dans un congrès hal-00766072v1
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New Biomonitoring Approaches based on Next Generation Sequencing : a Test for Freshwater Diatom Communities

Lenaïg Kermarrec , Frédéric Rimet , Alain Franc , Philippe Chaumeil , Jean Francois Humbert et al.

22nd International Diatom Symposium, Ghent University [Belgium] (UGENT). National Botanic Garden of Belgium, Ghent, BEL., Aug 2012, Ghent, Belgium. 1p

Communication dans un congrès hal-02807004v1

Antifouling coatings : in vitro bioassay vs marine biofilm communities

Mercedes Camps , Gérald Grégori , Agnes Bouchez , Aude Barani , Brigitte Le Berre et al.

16th International Congress on Marine Corrosion and Fouling, Comité International Permanent pour la Recherche sur la Préservation des Matériaux en Milieu Marin ((COIPM).). Seattle, INT., Jun 2012, Seattle, United States

Communication dans un congrès hal-02805263v1
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Taxonomic resolution of river diatoms: structuring impact of environmental parameters and implications for biomonitoring

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

7th Symposium for European Freshwater Sciences, Catalan Institute for Water Research (ICRA). Girona, ESP., Jun 2011, Girona, Spain. pp.2

Communication dans un congrès hal-02806457v1
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Efficiency of 3 genetic markers to determine the composition of a diatom assemblage using next generation sequencing

Lenaïg Kermarrec , Frédéric Rimet , Alain Franc , Philippe Chaumeil , Jean Francois Humbert et al.

4thInternational Barcode of Life Conference, University of Adelaide. Adélaide, AUS., Nov 2011, Adélaide, Australia. 1p

Communication dans un congrès hal-02805342v1
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Benthic Microbial community responses to pesticides in lake littoral zones

Floriane Larras , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle

12. Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Aug 2011, Rostock, Germany

Communication dans un congrès hal-02745822v1
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Assessment of the impact of tebuconazol (fungicide) on lake and stream bacterial communities using a 16S rRNA pyrosequencing method

Noémie Pascault , Joan Artigas , Simon Roux , Remy Tadonleke Dzatchou , Alexandra ter Halle et al.

12. Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Labo/service de l'auteur, Ville service., Aug 2011, Rostock, Germany. 121 p

Communication dans un congrès hal-02749915v1
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Des bioindicateurs pour évaluer l’impact ou la restauration vis-à-vis des pesticides - Diatomées

Frédéric Rimet , Rémy Marcel , Thierry Caquet , Agnes Bouchez

Colloque ONEMA Les méthodes d'évaluation de l'état des eaux: situation et perspectives dans le contexte de la DCE, Jan 2011, Paris, France. 20 p

Communication dans un congrès hal-01453828v1
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Linking changes in microbial communities to trophic variations in a tropical mangrove

Agnes Bouchez , Noémie Pascault , Cècile Chardon , Marc Bouvy , Philippe Cecchi et al.

12. Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Aug 2011, Rostock, Germany

Communication dans un congrès hal-02748180v1

Sensibility of aquatic bacterial communities to contaminants in wine-producing watersheds: Approach in rivers and lakes

Joan Artigas , N. Pascault , J. Chastain , G. Voyard , Alexandra ter Halle et al.

7th Symposium for European Freshwater Sciences, Jun 2011, Girona, Spain. pp.1

Communication dans un congrès hal-02595337v1
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A pipeline for automatic taxonomic community inventories on data from NGS : an example with freshwater diatoms

Lenaïg L. Kermarrec , Philippe P. Chaumeil , Frédéric F. Rimet , Jean-Marc Frigerio , Valerie Laval et al.

4th International Barcode of Life Conference, University of Adelaide. Adélaide, AUS., Nov 2011, Adélaide, Australia. 1p

Communication dans un congrès hal-00999998v1
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Des bioindicateurs pour évaluer l’impact ou la restauration vis-à-vis des pesticides – Invertébrés

Thierry Caquet , Marc Roucaute , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Colloque ONEMA Les méthodes d'évaluation de l'état des eaux : situation et perspectives dans le contexte de la DCE, Apr 2011, Paris, France. 20 p

Communication dans un congrès hal-01453818v1
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Impacts of chronic and pulse pesticide exposures on periphyton communities

Agnes Bouchez , Ahmed Tlili , Annette A. Berard , Bernard Montuelle

SEFS7 Symposium for European Freshwater Sciences, Jun 2011, Girona, Spain. 17 p

Communication dans un congrès hal-02809233v1
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Prédire l’impact des herbicides en mélange et à faible concentration sur les communautés algales planctoniques et benthiques lacustres

Agnes Bouchez

Pesticides & Environnement : entre science et décision, Mar 2011, Tours, France. 1 p

Communication dans un congrès hal-02804368v1
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Evaluation des effets de trois pesticides sur des communautés planctoniques tropicales : une approche en microcosmes

Agnes Bouchez , Christophe Leboulanger , Marc Bouvy , Claire Carré , Philippe Cecchi et al.

Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France

Communication dans un congrès hal-02753912v1
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Using diatom life-forms and ecological guilds to assess organic and nutrient concentrations in rivers : a case study in rivers in south-eastern France)

Vincent Berthon , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

4th CE-Diatom Meeting, Mar 2010, Reichenau, Germany. 1 p

Communication dans un congrès hal-02818242v1
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Taxonomic resolution of river diatoms : structuring impact of environmental parameters and implications for biomonitoring

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France

Communication dans un congrès hal-02755745v1
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Evaluation des effets de trois pesticides sur des communautés planctoniques tropicales : une approche en microcosmes

Christophe Leboulanger , Marc Bouvy , Claire Carré , Philippe Cecchi , Marc Pagano et al.

40ème congrès scientifique du Groupe Français des Pesticides., May 2010, Banyuls, France. 2 p

Communication dans un congrès hal-02818396v1
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Evaluation du risque des mélanges de substances chimiques : application au cas du phytoplancton du Léman

Valéry Grégorio , Agnes Bouchez , Orlane Anneville , Nathalie Chèvre

Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France

Communication dans un congrès hal-02751329v1
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Intérêt de différents traits biologiques des diatomées pour l'évaluation des niveaux de saprobie et de trophie en rivières

Vincent Berthon , Bernard Rimet , Agnes Bouchez

Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France

Communication dans un congrès hal-02758478v1

Genotypic and morphometric characterization of temperate and tropical Gomphonema parvulum isolates (Bacillariophyta)

Lenaïg Kermarrec , Bernard Rimet , Jean Francois Humbert , Agnes Bouchez

Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bain, France

Communication dans un congrès hal-02751055v1
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Genetic diversity within the Gomphonema Parvulum complex.

Lenaïg Kermarrec , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

21th International Diatom Symposium, Mineapolis, usa., 2010

Communication dans un congrès hal-02814475v1
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Diatomées et bioindication : perspectives pour les milieux tropicaux

Lenaïg Kermarrec , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

Colloque sur la Bioindication et la biodiversité des écosystèmes d’eau douce en milieu tropical, Martinique (France), Oct 2010, Fort de France, France. 1 p

Communication dans un congrès hal-02816150v1
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What is the influence of the nature of submerged artificial surfaces on the structure of microbial biofilms communities

Jean-François Briand , Ikram Djeridi , Dominique Jamet , Stéphane Coupé , Christine Bressy et al.

15th International Congress on Marine Corrosion and Fouling, Comité International Permanent pour la Recherche sur la Préservation des Matériaux en Milieu Marin ((COIPM).). Newcastle, INT., Jun 2010, Newcastle, United Kingdom. 1 p

Communication dans un congrès hal-02816267v1

Biofilms et évaluation d'impact chimique en milieux aquatiques

Bernard Montuelle , Vincent Berthon , Agnes Bouchez , François Delmas , Soizic Morin et al.

Ecologie 2010, Sep 2010, Montpellier, France. pp.125-125

Communication dans un congrès hal-02593811v1
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Use of diatom life-forms and ecological guilds to assess pesticide contamination in rivers: lotic mesocosm approaches

Frédéric Rimet , Agnes Bouchez

4th CE-Diatom Meeting, Mar 2010, Reichenau, Germany. 2 p

Communication dans un congrès hal-02817780v1

Use of pollution-induced community tolerance (PICT) approach based on river biofilms for assessing environmental toxicant impact and remediation

Bernard Montuelle , Ursula Dorigo , Agnes Bouchez , Stéphane Pesce , Amani Tlili et al.

36th Aquatic Toxicity Workshop, Sep 2009, La Malbaie, Canada. pp.13

Communication dans un congrès hal-02592823v1

Ergokit : une nouvelle méthode d’évaluation des capacités fonctionnelles appliquées au monde du travail

L Bontoux , A Mollé , Agnes Bouchez , G Roche , V Dubus et al.

23ème congrès de la Société française de médecine physique et de réadaptation, Oct 2008, Mulhouse, France

Communication dans un congrès hal-02937999v1

Responses of pesticide impacted biofilms in a translocation experiments in river

Ursula Dorigo , Annette Berard , Bernard Motte , Bernadette Vollat , Agnes Bouchez et al.

5. symposium for european freshwater sciences, Jul 2007, Palerme, Italy

Communication dans un congrès hal-02754801v1

Impact of pesticides (Diuron and Azoxystrobin) on microbial aquatic biodiversity and functions. An experimental study

Aurélie Villeneuve , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle

5. symposium for european freshwater sciences, Jul 2007, Palerme, Italy

Communication dans un congrès hal-02751956v1

Responses of pesticide impacted biofilms in a translocation experiment in river

Ursula Dorigo , A. Berard , B. Motte , B. Volat , Agnes Bouchez et al.

5th SEFS, Palermo, ITA, 8-13 July 2007, 2007, pp.1

Communication dans un congrès hal-02590243v1

Treatment of herbicides by Advanced Oxidation Processes

Marion Carrier , M. Besson , E. Gonze , C. Petrier , Agnes Bouchez et al.

4th European Meeting on Solar Chemistry and Photocatalysis: Environmental Applications, 2006, Las Palmas de Gran Canaria, Spain

Communication dans un congrès hal-00174715v1

Comparison of advanced oxidation processes (AOPs) for decontamination of water containing Diuron

Marion Carrier , M. Besson , C. Guillard , E. Gonze , C. Pétrier et al.

First European Conference on Environmental Applications of Advanced Oxidation Processes, EAAOP-1, 2006, Chania, Greece. 7-9 septembre

Communication dans un congrès hal-00018215v1

Impact d'un herbicide sur la diversité microbienne aquatique. Une approche expérimentale

Agnes Bouchez , Aurélie Villeneuve , Christophe Leboulanger , Jean Francois Humbert , Bernard Montuelle

3. Séminaire d'Ecotoxicologie de l'INRA, Sep 2006, Dinard, France

Communication dans un congrès hal-02754142v1

Toxic effects of degradated Diuron by advanced oxidation processes (AOPs) on microalgae and rotifere

Marion Carrier , Anne Ponticelli , Agnes Bouchez , B. Vollat , M. Besson et al.

Analytical Chemistry and Ecotoxicology, Feb 2006, Geneve, Switzerland

Communication dans un congrès hal-02757222v1

The PICT method, application on various systems and with various microalgae communities. Implication in ecotoxicological assessment

Agnes Bouchez , Christophe Leboulanger , Ursula Dorigo , F. Seguin , Annette Berard

Analytical Chemistry and Ecotoxicology, Feb 2006, Geneve, France

Communication dans un congrès hal-02754023v1

Toxic effect of degradated Diuron by Advanced Oxidation Processes (AOPs) on microalgae and rotifere

Marion Carrier , A. Ponticelli , Agnes Bouchez , B. Vollat , M. Besson et al.

Workshop Analytical Chemistry and Ecotoxicology, 2006, Genève, Switzerland

Communication dans un congrès hal-00013593v1

Impact des facteurs physiques sur la biodiversité bactérienne et phytobenthique et le fonctionnement des communautés en "rivières" expérimentales

A. Villeneuve , Bernard Montuelle , J.F. Humbert , Agnes Bouchez

Conférence Internationale des Limnologues d'Expression Française CILEF, Hammamet, TUN, 17-21 mars 2006, 2006, pp.13

Communication dans un congrès hal-02588942v1

Apparition de clones de microalgues résistants sous l'effet d'un herbicide. Caractérisation et coût de la résistance

Agnes Bouchez , Aurélie Villeneuve , Christophe Leboulanger

2. Colloque d'écologie microbienne, May 2005, Obernai, France

Communication dans un congrès hal-02760691v1

Introgression de gènes ou de QTL

L. Moreau , Bertrand Servin , Agnes Bouchez , Frederic F. Hospital

Séminaire du Département de Génétique Animale INRA, Sep 2001, Batz-sur-Mer, France

Communication dans un congrès hal-02759533v1

Au delà des QTLs : deux approches d'utilisation des marqueurs en sélection

Alain A. Charcosset , Frederic F. Hospital , L. Moreau , Agnes Bouchez , Aurélie Maurice et al.

Séminaire du groupe de travail "Génomes végétaux", Apr 1997, Méribel-les-Allues, France

Communication dans un congrès hal-02765840v1

Construction de génotypes assistée par marqueurs chez le maïs. Poster

A. Gallais , Aurélie Maurice , Agnes Bouchez , Alain A. Charcosset , Mathilde M. Causse et al.

Séminaire, Oct 1996, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02765460v1
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Multiple tools for antibiotics and AMR characterisation in aquatic ecosystems a 2-years monitoring study

Chloé Bonnineau , Agnes Bouchez , Anaïs Charton , Teofana Chonova , Christophe Dagot et al.

SETAC Europe 32nd annual meeting, May 2022, Copenhague, Denmark.

Poster de conférence hal-03788502v1
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Influence de la radioactivité naturellement renforcée (NOR) sur les peuplements de diatomées actuelles et passées des sources minérales.

Lory-Anne Baker , Beauger Aude , Sofia Kolovi , Olivier Voldoire , Alain Elisabeth et al.

5e colloque des Zones Ateliers – CNRS 2000-2020, 20 ans de recherche du Réseau des Zones Ateliers, Nov 2020, Tours, France

Poster de conférence hal-03018019v1
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AntibiotoolS : Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatiques

C. Bonnineau , Agnes Bouchez , A. Charton , Christophe Dagot , M. Devers et al.

7ème conférence Eau et Santé, Nov 2019, Villeurbanne, France. pp.1, 2019

Poster de conférence hal-02609885v1

Résistance aux antibiotiques et impact écologique chez les communautés microbiennes benthiques exposées a la contamination urbaine.

Chloé Bonnineau , Agnes Bouchez , Anaïs Charton , Christophe Dagot , Marion Devers et al.

Colloque 2019 de la Société Française d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA), 2019, Lyon, France, 24-25 juin 2019, France. 2019

Poster de conférence hal-02790470v1
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Résistance aux antibiotiques et impact écologique chez les communautés microbiennes benthiques exposées à la contamination urbaine

C. Bonnineau , Agnes Bouchez , A. Charton , Christophe Dagot , M. Devers et al.

SEFA, Jun 2019, Lyon, France. pp.1, 2019

Poster de conférence hal-02609884v1

Limiting similarity and environmental filtering under drought stress in streams, a case study on diatoms

Gábor Várbíró , Agnes Bouchez , Fréderic Rimet , Kálmán Tapolczai , Maria Helena Novais et al.

25th International Diatom Symposium, Jun 2018, Berlin, Germany

Poster de conférence hal-03138084v1
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A pilot experimental installation to evaluate the efficiency of a pharmaceutical industry treatment plant and the resulting decrease in effluents toxicity to aquatic microbial biofilms

Vincent Tardy , C. Bonnineau , Agnes Bouchez , C. Rosy , B. Motte et al.

1st International Conference on Microbial Ecotoxicology (EcotoxicoMic 2017), Nov 2017, Lyon, France. pp.1, 2017

Poster de conférence hal-02606934v1
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ECOTOX, le réseau des écotoxicologues de l’INRA

Christian Mougin , Laurence Denaix , Fabrice Martin-Laurent , Agnes Bouchez

2ème colloque scientifique de la Fondation Rovaltain, Oct 2015, Alixan, France. 2015

Poster de conférence hal-01601569v1
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Using diatom taxonomic diversity to assess herbicide contamination in rivers

Rémy Marcel , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet

SEFS7 - Ecological assessment of lakes, rivers and reservoirs : water quality management ; ; Girona (ESP), Jun 2011, Girona, Spain. 1 p., 2011

Poster de conférence hal-02804487v1
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Déterminisme de l’impact des pesticides en cours d’eau : influence de la dynamique de l’exposition sur les effets biologiques

Véronique Gouy , A. Berard , Agnes Bouchez , Nadia Carluer , S. Charles et al.

Colloque de restitution du programme EC2CO, Nov 2010, Toulouse, France. pp.1, 2010

Poster de conférence hal-02606344v1
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Hydraulic versus pesticides effects on periphyton in experimental stream

Aurélie Villeneuve , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle

10.Symposium on Aquatic Microbial Ecology ; SAME 10, Sep 2007, Faro, Portugal. 1 p., 2007

Poster de conférence hal-02812653v1

Environmental physical factors impacts on biofilm in small experimental streams

Agnes Bouchez , Aurélie Villeneuve , Jean Francois Humbert , Bernard Montuelle

10. Symposium on Aquatic Microbial Ecology SAME 10, Sep 2007, Faro, Portugal. 1 p., 2007

Poster de conférence hal-02821927v1

Treatment of agricultural wastewater containing herbicides by Advanced Oxidation Processes

Marion Carrier , Michelle Besson , Chantale Guillard , Evelyne Gonze , Christian Petrier et al.

Solar Chemistry and Photocatalysis Environmental Applications 4th european meeting' SPEA Las Palmas (Canaria), 8-10 november 2006, Nov 2006, Las Palmas (Canaria), Spain. 1 p, 2006

Poster de conférence hal-02818341v1

Treatment of agricultural wastewater containing herbicides by advanced oxidation processes

Marion Carrier , Michelle Besson , Chantale Guillard , Evelyne Gonze , Christian Petrier et al.

1. European Conference on Environmental Applications of Oxydation Processes, Sep 2006, Chania, Greece. 1 p., 2006

Poster de conférence hal-02818281v1

Why We Need Sustainable Networks Bridging Countries, Disciplines, Cultures and Generations for Aquatic Biomonitoring 2.0: A Perspective Derived From the DNAqua-Net COST Action

Florian Leese , Agnes Bouchez , Kessy Abarenkov , Florian Altermatt , Angel Borja et al.

Next Generation Biomonitoring: Part 1, 58, Elsevier, pp.63-99, 2018, Advances In Ecological Research, 978-0-12-813949-3

Chapitre d'ouvrage hal-01984996v1
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EFFLUENTS HOSPITALIERS ET STATIONS D'EPURATION URBAINES : SEPT ANNEES DE SUIVI, D'ETUDES ET DE RECHERCHE SUR SIPIBEL

Jean-Luc Bertrand-Krajewski , Rayan Bouchali , Agnes Bouchez , Elodie Brelot , Claire Brivet et al.

Actes des 23e Journées Information Eaux, 2018

Chapitre d'ouvrage hal-02386470v1

Environmental River Biofilms as Biological Indicators of the Impact of Chemical Contaminants

A. Villeneuve , Bernard Montuelle , Stéphane Pesce , Agnes Bouchez

Encyclopedia of aquatic ecotoxicology, Férard, J.F. & Blaise, C., pp.443-455, 2013

Chapitre d'ouvrage hal-02599032v1

Les microorganismes travaillent pour nous

Bernard Montuelle , Agnes Bouchez , Aurelie Villeneuve , Stéphane Pesce

Rhône-Alpes et l'environnement : 100 questions pour la recherche, Cluster de recherche Rhône-Alpes Environnement CNRS Rhône Alpes Auvergne, 296 p., 2011, 978-2-7446-2968-4

Chapitre d'ouvrage hal-02810296v1

Effects of organic herbicides on phototrophic microbial communities in freshwater ecosystems

Stéphane Pesce , Agnes Bouchez , Bernard Montuelle

Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 214, Springer, 2011, Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 978-1-4614-0667-9. ⟨10.1007/978-1-4614-0668-6_5⟩

Chapitre d'ouvrage hal-02811179v1
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Diatoms of Mayotte. The benthic flora of watercourses

Gilles Gassiole , Agnes Bouchez , Frédéric Rimet , Olivier Monnier

MicPhyc; Office Francais de la Biodiversité; Inrae. 2024

Rapport hal-04935349v1
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Phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer: développement d'outils de monitoring basés sur l'ADN Livrable 3 : « Application de l'approche ADNe pour recenser le phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer: méthodes et premiers résultats »

Alexis Canino , Benjamin Alric , Maria-Mercedes Nicolosi-Gelis , Christophe Laplace-Treyture , Agnes Bouchez et al.

INRAE UMR CARRTEL; INRAE UR EABX. 2023

Rapport hal-04116746v1
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Diatomées des cours d'eau de Mayotte. Guide iconographique pour la mise en œuvre des indices diatomées IDMsp et IDMtrait. Comparaison pour certains taxons avec La Réunion, la Nouvelle-Calédonie et la Polynésie française

Gilles Gassiole , Frédéric Rimet , Agnes Bouchez , Olivier Monnier

MicPhyc; INRAE; OFB. 2023

Rapport hal-04418123v1
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Rapport final du projet Antibiotools - Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatique (PNREST Anses, 2017/3 ABR/22)

Chloé Bonnineau , Agnes Bouchez , Christophe Dagot , Marion Devers-Lamrani , J. Labanowski et al.

[Rapport de recherche] INRAE RiverLy. 2022

Rapport (rapport de recherche) hal-03797468v1
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Phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer : développement d'outils de monitoring basés sur l'ADN - Livrable 2 : «Phytoplancton DOM : première application du protocole de terrain et comparaisons entre microscopie/ADNe »

Alexis Canino , Christophe Laplace-Treyture , Agnes Bouchez , Domaizon Isabelle , Frédéric Rimet

Livrable 2, Pole R&D ECLA. 2021

Rapport hal-05306176v1

Synthèse du séminaire « Quo vadis, la biosurveillance basée sur l’ADNe ? »

Philippe Blancher , Agnes Bouchez , Teofana Chonova , Estelle Lefrancois , Frédéric Rimet et al.

INRAE, UMR Carrtel. 2021, 21 p

Rapport hal-04904384v1
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Phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer : développement d'outils de monitoring basés sur l'ADN

Alexis Canino , Christophe Laplace-Treyture , Agnes Bouchez , Isabelle Domaizon , Frédéric Rimet

Livrable 1, Pole R&D ECLA. 2020

Rapport hal-05305968v1

Formes de vie, guildes écologiques et classes de tailles des diatomées d’eau douce

Frédéric Rimet , Vincent Berthon , Agnes Bouchez

[Rapport Technique] 2010

Rapport (rapport technique) hal-02824514v1