Agnès BOUCHEZ

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Ecologie microbienne aquatique

Publications

Article dans une revue (125)

Proficiency testing and cross-laboratory method comparison to support standardisation of diatom DNA metabarcoding for freshwater biomonitoring Valentin Vasselon,Sinziana Rivera,Éva Ács,Salomé Baja Almeida,Karl Andreeet al. Metabarcoding and Metagenomics, 2025, 9, pp.e133264. ⟨10.3897/mbmg.9.133264⟩ Article dans une revue hal-04930501v1
Environmental Matrices Need Consideration: Insights From Water and Biofilm Environmental DNA for Multi‐Taxonomic Biomonitoring Paula Gauvin,Isabelle Domaizon,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet Environmental DNA, 2025, 7 (2), pp.e70079. ⟨10.1002/edn3.70079⟩ Article dans une revue hal-05150275v1
Adding more taxa to the Cocconeis placentula group (Bacillariophyta): two new species from streams in biodiversity hotspots Demetrio Mora,Rosalina Stancheva,Nélida Abarca,Agnès Bouchez,Enrique Cantoral-Urizaet al. Nova Hedwigia, 2024, 118 (3-4), pp.277-319. ⟨10.1127/nova_hedwigia/2024/0918⟩ Article dans une revue hal-05137519v1
Diatom endemism and taxonomic turnover: Assessment in high-altitude alpine lakes covering a large geographical range Frédéric Rimet,Eveline Pinseel,Agnes Bouchez,Bella Japoshvili,Levan Mumladze Science of the Total Environment, 2023, 871, pp.161970. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.161970⟩ Article dans une revue hal-04247525v1
eDNA metabarcoding from aquatic biofilms allows studying spatial and temporal fluctuations of fish communities from Lake Geneva Sinziana F Rivera,Valentin Vasselon,Agnès Bouchez,Frédéric Rimet Environmental DNA, 2023, 5 (3), pp.570-581. ⟨10.1002/edn3.413⟩ Article dans une revue hal-04213758v1
Environmental filtering and mass effect are two important processes driving lake benthic diatoms: Results of a DNA metabarcoding study in a large lake Frédéric Rimet,Alexis Canino,Teofana Chonova,Julie Guéguen,Agnes Bouchez Molecular Ecology, 2023, 32 (1), pp.124-137. ⟨10.1111/mec.16737⟩ Article dans une revue hal-03881952v1
Evidence of Bacterial Community Coalescence between Freshwater and Discharged tpm-Harboring Bacterial Taxa from Hospital and Domestic Wastewater Treatment Plants among Epilithic Biofilms Rayan Bouchali,Laurence Marjolet,Leslie Mondamert,Teofana Chonova,Sébastien Ribunet al. Microorganisms, 2023, 11 (4), pp.922. ⟨10.3390/microorganisms11040922⟩ Article dans une revue hal-04154873v1
Which barcode to decipher freshwater microalgal assemblages? Tests on mock communities Alexis Canino,Clarisse Lemonnier,Benjamin Alric,Agnes Bouchez,Isabelle Domaizonet al. International Journal of Limnology, 2023, 59, pp.8. ⟨10.1051/limn/2023008⟩ Article dans une revue hal-04210529v1
Environmental DNA metabarcoding for benthic monitoring: A review of sediment sampling and DNA extraction methods J. Pawlowski,K. Bruce,K. Panksep,F.I. Aguirre,S. Amalfitanoet al. Science of the Total Environment, 2022, 818, pp.151783. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.151783⟩ Article dans une revue hal-03977006v1
Recommendations for the preservation of environmental samples in diatom metabarcoding studies Ana Baricevic,Cécile Chardon,Maria Kahlert,Satu Maaria Karjalainen,Daniela Maric Pfannkuchenet al. Metabarcoding and Metagenomics, 2022, 6 (e85844), ⟨10.3897/mbmg.6.85844⟩ Article dans une revue hal-03976810v1
A strategy for successful integration of DNA-based methods in aquatic monitoring Philippe Blancher,Estelle Lefrançois,Frédéric Rimet,Valentin Vasselon,Christine Argillieret al. Metabarcoding and Metagenomics, 2022, 6 (e85652), ⟨10.3897/mbmg.6.85652⟩ Article dans une revue hal-03976834v1
Passive sampling of environmental DNA in aquatic environments using 3D‐printed hydroxyapatite samplers Héloïse Verdier,Lara Konecny‐dupre,Christophe Marquette,Helen Reveron,Solène Tadieret al. Molecular Ecology Resources, 2022, 22, pp.2158-2170. ⟨10.1111/1755-0998.13604⟩ Article dans une revue hal-03601922v1
SIPIBEL observatory: Data on usual pollutants (solids, organic matter, nutrients, ions) and micropollutants (pharmaceuticals, surfactants, metals), biological and ecotoxicity indicators in hospital and urban wastewater, in treated effluent and sludge from wastewater treatment plant, and in surface and groundwater Jean-Luc Bertrand-Krajewski,Rémy Bournique,Vivien Lecomte,Noémie Pernin,Laure Wiestet al. Data in Brief, 2022, 40, pp.107726. ⟨10.1016/j.dib.2021.107726⟩ Article dans une revue (data paper) hal-03511662v1
Metadata standards and practical guidelines for specimen and DNA curation when building barcode reference libraries for aquatic life Frédéric Rimet,Eva Aylagas,Ángel Borja,Agnes Bouchez,Alexis Caninoet al. Metabarcoding and Metagenomics, 2021, 5, pp.e58056. ⟨10.3897/mbmg.5.58056⟩ Article dans une revue pasteur-03159791v1
Fish eDNA metabarcoding from aquatic biofilm samples: Methodological aspects Sinziana Rivera,Frédéric Rimet,Valentin Vasselon,Marine Vautier,Isabelle Domaizonet al. Molecular Ecology Resources, 2021, ⟨10.1111/1755-0998.13568⟩ Article dans une revue hal-03510613v1
Expanding ecological assessment by integrating microorganisms into routine freshwater biomonitoring M. Sagova-Mareckova,J. Boenigk,Agnes Bouchez,K. Cermakova,T. Chonovaet al. Water Research, 2021, 191, pp.116767. ⟨10.1016/j.watres.2020.116767⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-03487093v1
How can integrated morphotaxonomy- and metabarcoding-based diatom assemblage analyses best contribute to the ecological assessment of streams? Panayiota Pissaridou,Marco Cantonati,Agnes Bouchez,Iakovos Tziortzis,Gerald Dörflingeret al. Metabarcoding and Metagenomics, 2021, 5, pp.111-120. ⟨10.3897/MBMG.5.68438⟩ Article dans une revue hal-03528828v1
Herbicide-Induced Shifts in the Periphyton Community Composition Indirectly Affect Feeding Activity and Physiology of the Gastropod Grazer Physella acuta Marco Konschak,Jochen Zubrod,Tomás Duque Acosta,Agnes Bouchez,Alexandra Krollet al. Environmental Science and Technology, 2021, 55 (21), pp.14699-14709. ⟨10.1021/acs.est.1c01819⟩ Article dans une revue hal-03510646v1
Phytool, a ShinyApp to homogenise taxonomy of freshwater microalgae from DNA barcodes and microscopic observations Alexis Canino,Agnes Bouchez,Christophe Laplace-Treyture,Isabelle Domaizon,Frédéric Rimet Metabarcoding and Metagenomics, 2021, 5, pp.199-205. ⟨10.3897/mbmg.5.74096⟩ Article dans une revue hal-03484541v1
Monitoring the ecological status of rivers with diatom eDNA metabarcoding: a comparison of taxonomic markers and analytical approaches for the inference of a molecular diatom index Laure Apothéloz‐perret‐gentil,Agnes Bouchez,Tristan Cordier,Arielle Cordonier,Julie Guéguenet al. Molecular Ecology, 2021, 30 (13), pp.2959-2968. ⟨10.1111/mec.15646⟩ Article dans une revue hal-02955898v1
Cyprus’ diatom diversity and the association of environmental and anthropogenic influences for ecological assessment of rivers using DNA metabarcoding Panayiota Pissaridou,Valentin Vasselon,Andreas Christou,Teofana Chonova,Athina Papatheodoulouet al. Chemosphere, 2021, 272, pp.129814. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.129814⟩ Article dans une revue hal-03303887v1
Exploring the capacity of aquatic biofilms to act as environmental DNA samplers: Test on macroinvertebrate communities in rivers Sinziana Rivera,Valentin Vasselon,Nathalie Mary,Olivier Monnier,Fréderic Rimetet al. Science of the Total Environment, 2021, 763, pp.144208. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.144208⟩ Article dans une revue hal-03103971v1
The potential of exact sequence variants (ESVs) to interpret and assess the impact of agricultural pressure on stream diatom assemblages revealed by DNA metabarcoding Kálmán Tapolczai,Géza Selmeczy,Beáta Szabó,Viktória B-Béres,François Kecket al. Ecological Indicators, 2021, 122, pp.107322. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.107322⟩ Article dans une revue hal-03238653v1
A pilot experiment to assess the efficiency of pharmaceutical plant wastewater treatment and the decreasing effluent toxicity to periphytic biofilms Vincent Tardy,Chloé Bonnineau,Agnes Bouchez,Cécile Miège,Matthieu Massonet al. Journal of Hazardous Materials, 2021, 411, pp.125121. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.125121⟩ Article dans une revue hal-03238813v1
Unlocking our understanding of intermittent rivers and ephemeral streams with genomic tools Rosetta C Blackman,Florian Altermatt,Arnaud Foulquier,Tristan Lefébure,Maïlys Gauthieret al. Frontiers in Ecology and the Environment, 2021, 19 (10), pp.574-583. ⟨10.1002/fee.2404⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-03369170v1
Ecosystems monitoring powered by environmental genomics: a review of current strategies with an implementation roadmap Tristan Cordier,Laura Alonso‐sáez,Laure Apothéloz‐perret‐gentil,Eva Aylagas,David Bohanet al. Molecular Ecology, 2021, 30 (13), pp.2937-2958. ⟨10.1111/mec.15472⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02860583v1
Benthic diatom community dynamics in Mediterranean intermittent streams: Effects of water availability and their potential as indicators of dry-phase ecological status Maria Helena Novais,Eduardo F Morales,Alexandra Marchã Penha,Miguel Potes,Agnes Bouchezet al. Science of the Total Environment, 2020, 719, pp.137462. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137462⟩ Article dans une revue hal-02520259v1
The vertical distribution of tetA and intI1 in a deep lake is rather due to sedimentation than to resuspension Andrea Di cesare,Ester Eckert,Camille Cottin,Agnes Bouchez,Cristiana Callieriet al. FEMS Microbiology Ecology, 2020, 96 (2), ⟨10.1093/femsec/fiaa002⟩ Article dans une revue hal-02569099v1
A taxonomy-free approach based on machine learning to assess the quality of rivers with diatoms Maria João Feio,Sonia R.Q. Serra,Andreia Mortágua,Agnes Bouchez,Frédéric Rimetet al. Science of the Total Environment, 2020, 722, ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137900⟩ Article dans une revue hal-02520169v1
Evaluation and sensitivity analysis of diatom DNA metabarcoding for WFD bioassessment of Mediterranean rivers Javier Pérez-Burillo,Rosa Trobajo,Valentin Vasselon,Frédéric Rimet,Agnes Bouchezet al. Science of the Total Environment, 2020, 727, ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.138445⟩ Article dans une revue hal-02557859v1
Diatom metabarcoding applied to large scale monitoring networks: Optimization of bioinformatics strategies using Mothur software Sinziana Rivera,Valentin Vasselon,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet Ecological Indicators, 2020, 109, ⟨10.1016/j.ecolind.2019.105775⟩ Article dans une revue hal-02518194v1
Environmental filtering and limiting similarity as main forces driving diatom community structure in Mediterranean and continental temporary and perennial streams Gábor Várbíró,Gabor Borics,Maria Helena Novais,Maria Manuela Morais,Frédéric Rimetet al. Science of the Total Environment, 2020, 741, pp.140459. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.140459⟩ Article dans une revue hal-02901285v1
Key questions for next-generation biomonitoring Andreas Makiola,Zacchaeus G. Compson,Donald J Baird,Matthew A. Barnes,Sam Philip Boerlijstet al. Frontiers in Environmental Science, 2020, 7, pp.197. ⟨10.3389/fenvs.2019.00197⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02402296v1
Recommandations d'un collectif franco-suisse d'experts pour une meilleure évaluation de la qualité écotoxicologique des sédiments par l'étude des communautés benthiques Stéphane Pesce,J.D. Ferrari,C. Bonnineau,C. Casado,L. Apotheloz Perret Gentilet al. Sciences Eaux & Territoires, 2019, HS, pp.9. ⟨10.14758/SET-REVUE.2019.hs.04⟩ Article dans une revue hal-02609267v1
Applicability of DNA metabarcoding approach in the bioassessment of Portuguese rivers using diatoms Andreia Mortágua,Valentin Vasselon,Ricardo Oliveira,Carmen Elias,Cécile Chardonet al. Ecological Indicators, 2019, 106, pp.105470. ⟨10.1016/j.ecolind.2019.105470⟩ Article dans une revue hal-02623986v1
Diatom DNA metabarcoding for biomonitoring: strategies to avoid major taxonomical and bioinformatical biases Llmiting molecular indices capacities Kálmán Tapolczai,François Keck,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Maria Kahlertet al. Frontiers in Ecology and Evolution, 2019, 7, ⟨10.3389/fevo.2019.00409⟩ Article dans une revue hal-02624302v1
Diat.barcode, an open-access curated barcode library for diatoms Frédéric Rimet,Evgenuy Gusev,Maria Kahlert,Martyn G. Kelly,Maxim Kulikovskiyet al. Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-51500-6⟩ Article dans une revue hal-02619171v1
Benthic Diatom Communities in an Alpine River Impacted by Waste Water Treatment Effluents as Revealed Using DNA Metabarcoding Teofana Chonova,Rainer Kurmayer,Frédéric Rimet,Jérôme Labanowski,Valentin Vasselonet al. Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00653⟩ Article dans une revue hal-02381793v1
A comparison of biotic groups as dry-phase indicators of ecological quality in intermittent rivers and ephemeral streams R. Stubbington,A. Paillex,J. England,A. Barthes,Agnes Bouchezet al. Ecological Indicators, 2019, 97, pp.165-174. ⟨10.1016/j.ecolind.2018.09.061⟩ Article dans une revue hal-02608198v1
Autumn drought drives functional diversity of benthic diatom assemblages of continental intermittent streams Viktória B-Béres,Béla Tóthmérész,István Bácsi,Gabor Borics,András Abonyiet al. Advances in Water Resources, 2019, 126, pp.129-136. ⟨10.1016/j.advwatres.2019.02.010⟩ Article dans une revue hal-02619814v1
Molecular versus morphological data for benthic diatoms biomonitoring in Northern Europe freshwater and consequences for ecological status Bonnie Bailet,Agnes Bouchez,Alain Franc,Jean-Marc Frigerio,François Kecket al. Metabarcoding and Metagenomics, 2019, 3, ⟨10.3897/mbmg.3.34002⟩ Article dans une revue hal-02432989v1
DNA barcode reference libraries for the monitoring of aquatic biota in Europe: Gap-analysis and recommendations for future work Hannah Weigand,Arne J. Beermann,Filipe O. Costa,Zoltán Csabai,Sofia Duarteet al. Science of the Total Environment, 2019, 678, pp.499-524. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.04.247⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02626077v1
Connecting the morphological and molecular species concepts to facilitate species identification within the genus Fragilaria (Bacillariophyta) Maria Kahlert,Martyn G. Kelly,David G. Mann,Frédéric Rimet,Shinya Satoet al. Journal of Phycology, 2019, 55 (4), pp.948-970. ⟨10.1111/jpy.12886⟩ Article dans une revue hal-02628803v1
Factors influencing the heterogeneity of benthic diatom communities along the shoreline of natural alpine lakes Frédéric Rimet,Léa Féret,Agnes Bouchez,Jean Marcel Dorioz,Etienne Dambrine Hydrobiologia, 2019, 839 (1), pp.103-118. ⟨10.1007/s10750-019-03999-z⟩ Article dans une revue hal-02618767v1
The impact of OTU sequence similarity threshold on diatom-based bioassessment: A case study of the rivers of Mayotte (France, Indian Ocean) Kalman Tapolczai,Valentin Vasselon,Agnes Bouchez,Csilla Stenger-Kovács,Judit Padisáket al. Ecology and Evolution, 2019, 9 (1), pp.166-179. ⟨10.1002/ece3.4701⟩ Article dans une revue hal-02619428v1
Assessing pollution of aquatic environments with diatoms' DNA metabarcoding: experience and developments from France Water Framework Directive networks Valentin Vasselon,Frédéric Rimet,Isabelle Domaizon,Olivier Monnier,Yorick Reyjolet al. Metabarcoding and Metagenomics, 2019, 3, ⟨10.3897/mbmg.3.39646⟩ Article dans une revue hal-03148548v1
Sensitivities of seven algal species to triclosan, fluoxetine and their mixtures Ran Bi,Xiangfeng Zeng,Lei Mu,Liping Hou,Wenhua Liuet al. Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-33785-1⟩ Article dans une revue hal-02621712v1
Do we similarly assess diversity with microscopy and high-throughput sequencing? Case of microalgae in lakes Frédéric Rimet,Valentin Vasselon,Barbara A.-Keszte,Agnes Bouchez Organisms Diversity and Evolution, 2018, 18 (1), pp.51-62. ⟨10.1007/s13127-018-0359-5⟩ Article dans une revue hal-02625205v1
Boosting DNA metabarcoding for biomonitoring with phylogenetic estimation of OTUs' ecological profiles F Keck,Valentin Vasselon,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez,M Kahlert Molecular Ecology Resources, 2018, 18 (6), pp.1299-1309. ⟨10.1111/1755-0998.12919⟩ Article dans une revue hal-02625977v1
Metabarcoding of lake benthic diatoms: from structure assemblages to ecological assessment S. F. Rivera,Valentin Vasselon,Stéphan Jacquet,Agnes Bouchez,D. Arizteguiet al. Hydrobiologia, 2018, 807 (1), pp.37-51. ⟨10.1007/s10750-017-3381-2⟩ Article dans une revue hal-02621047v1
DNA metabarcoding and microscopic analyses of sea turtles biofilms: Complementary to understand turtle behavior Sinziana Rivera,Valentin Vasselon,Katia Ballorain,Alice Carpentier,Carlos E. Wetzelet al. PLoS ONE, 2018, 13 (4), pp.e0195770. ⟨10.1371/journal.pone.0195770⟩ Article dans une revue hal-02624564v1
Development and implementation of eco-genomic tools for aquatic ecosystem biomonitoring: the SYNAQUA French-Swiss program Estelle Lefrancois,Laure Apothéloz-Perret-Gentil,Philippe Blancher,Samuel Botreau,Cécile Chardonet al. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (34), pp.33858-33866. ⟨10.1007/s11356-018-2172-2⟩ Article dans une revue hal-02916342v1
Implementation options for DNA-based identification into ecological status assessment under the european water framework directive Daniel Hering,Angel Borja,J.Iwan Jones,Didier Pont,Pieter Boetset al. Water Research, 2018, 138, pp.192-205. ⟨10.1016/j.watres.2018.03.003⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02626478v1
SIPIBEL : un site pilote pour l’étude des effluents hospitaliers et urbains. Les grands enseignements après cinq ans de suivi et de recherche Vivien Lecomte,Jean-Luc Bertrand-Krajewski,Agnes Bouchez,Benoit Cournoyer,Christophe Dagotet al. Environnement, Risques & Santé, 2018, 17 (S1), pp.59-74. ⟨10.1684/ers.2017.1074⟩ Article dans une revue hal-01825316v1
Sensitive vs. tolerant Nitzschia palea (Kützing) W. Smith strains to atrazine: a biochemical perspective S M Esteves,S F P Almeida,S Gonçalves,Frédéric Rimet,Agnes Bouchezet al. Ecotoxicology, 2018, 27 (7), pp.860-870. ⟨10.1007/s10646-018-1953-1⟩ Article dans une revue hal-02623950v1
The SIPIBEL project: treatment of hospital and urban wastewater in a conventional urban wastewater treatment plant. Teofana Chonova,Vivien Lecomte,Jean-Luc Bertrand-Krajewski,Agnes Bouchez,Jérôme Labanowskiet al. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (10), pp.9197-9206. ⟨10.1007/s11356-017-9302-0⟩ Article dans une revue hal-01606931v1
The potential of High-Throughput Sequencing (HTS) of natural samples as a source of primary taxonomic information for reference libraries of diatom barcodes Frédéric Rimet,Nelida Abarca,Agnes Bouchez,Wolf-Henning Kusber,Regine Jahnet al. Fottea (Praha), 2018, 18 (1), pp.37-54. ⟨10.5507/fot.2017.013⟩ Article dans une revue hal-02624468v1
ECOTOX, new questions for terrestrial and aquatic ecotoxicology Christian Mougin,Agnes Bouchez,Laurence Denaix,Jeanne Garric,Fabrice Martin-Laurent Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (34), ⟨10.1007/s11356-018-3179-4⟩ Article dans une revue hal-01878281v1
The future of biotic indices in the ecogenomic era: Integrating (e)DNA metabarcoding in biological assessment of aquatic ecosystems Jan Pawlowski,Mary Kelly-Quinn,Florian Altermatt,Laure Apothéloz-Perret-Gentil,Pedro Bejaet al. Science of the Total Environment, 2018, 637-638, pp.1295-1310. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.05.002⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02629210v1
River biofilm community changes related to pharmaceutical loads emitted by a wastewater treatment plant Teofana Chonova,Jérôme Labanowski,Benoit Cournoyer,Cècile Chardon,François Kecket al. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (10), pp.9254-9264. ⟨10.1007/s11356-017-0024-0⟩ Article dans une revue hal-01859406v1
Assessing ecological status with diatoms DNA metabarcoding: Scaling-up on a WFD monitoring network (Mayotte island, France) Valentin Vasselon,Frédéric Rimet,Kalman Tapolczai,Agnes Bouchez Ecological Indicators, 2017, 82, pp.1-12. ⟨10.1016/j.ecolind.2017.06.024⟩ Article dans une revue hal-02622658v1
Spatio-Temporal Variations of Marine Biofilm Communities Colonizing Artificial Substrata Including Antifouling Coatings in Contrasted French Coastal Environments Jean-François Briand,Aude Barani,Cédric Garnier,Karine Rehel,Félix Urvoiset al. Microbial ecology, 2017, 74 (3), pp.585 - 598. ⟨10.1007/s00248-017-0966-2⟩ Article dans une revue hal-01599314v1
Taxonomy- or trait-based ecological assessment for tropical rivers? Case study on benthic diatoms in Mayotte island (France, Indian Ocean) Kalman Tapolczai,Agnes Bouchez,Csilla Stenger-Kovács,Judit Padisák,Frédéric Rimet Science of the Total Environment, 2017, 607-608, pp.1293-1303. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.07.093⟩ Article dans une revue hal-01604595v1
Application of high-throughput sequencing (HTS) metabarcoding to diatom biomonitoring: Do DNA extraction methods matter? Valentin Vasselon,Isabelle Domaizon,Frédéric Rimet,Maria Kahlert,Agnes Bouchez Freshwater Science, 2017, 36 (1), pp.162-177. ⟨10.1086/690649⟩ Article dans une revue hal-01606868v1
Can we predict diatoms herbicide sensitivities with phylogeny? Influence of intraspecific and interspecific variability Sara Esteves,Francois Keck,Salome Almeida,Etelvina Lourenço Figueira,Agnes Bouchezet al. Ecotoxicology, 2017, 26 (8), ⟨10.1007/s10646-017-1834-z⟩ Article dans une revue hal-01604474v1
Avoiding quantification bias in metabarcoding: Application of a cell biovolume correction factor in diatom molecular biomonitoring Valentin Vasselon,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Stéphan Jacquet,Rosa Trobajoet al. Methods in Ecology and Evolution, 2017, 9 (4), pp.1060-1069. ⟨10.1111/2041-210X.12960⟩ Article dans une revue hal-02916343v1
Freshwater biomonitoring in the Information age Francois Keck,Valentin Vasselon,Kalman Tapolczai,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Frontiers in Ecology and the Environment, 2017, 15 (5), pp.266-274. ⟨10.1002/fee.1490⟩ Article dans une revue hal-01604509v1
Benthic diatom communities in high altitude lakes: a large scale study in the French Alps Léa Féret,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet Annales de Limnologie - International Journal of Limnology, 2017, 53, pp.411-423. ⟨10.1051/limn/2017025⟩ Article dans une revue hal-02619291v1
Trait-based ecological classifications for benthic algae: review and perspectives Kálmán Tapolczai,Agnes Bouchez,Csilla Stenger-Kovács,Judit Padisák,Frédéric Rimet Hydrobiologia, 2016, 776 (1), pp.1-17. ⟨10.1007/s10750-016-2736-4⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02631412v1
Comparison of specific versus literature species sensitivity distributions for herbicides risk assessment Floriane Larras,Vincent Gregorio,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle,Nathalie Chèvre Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (4), pp.3042-3052. ⟨10.1007/s11356-015-5430-6⟩ Article dans une revue hal-02637650v1
Linking phylogenetic similarity and pollution sensitivity to develop ecological assessment methods: a test with river diatoms François Keck,Agnes Bouchez,Alain Franc,Frédéric Rimet Journal of Applied Ecology, 2016, 53 (3), pp.856-864. ⟨10.1111/1365-2664.12624⟩ Article dans une revue hal-01426853v1
Pollution-induced community tolerance (PICT) as a tool for monitoring Lake Geneva long-term in situ ecotoxic restoration from herbicide contamination Floriane Larras,Frédéric Rimet,V. Gregorio,Annette A. Berard,C. Leboulangeret al. Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (5), pp.4301-4311. ⟨10.1007/s11356-015-5302-0⟩ Article dans une revue hal-01293534v1
Phylogenetic signal in diatom ecology: perspectives for aquatic ecosystems biomonitoring François Keck,Frédéric Rimet,Alain Franc,Agnes Bouchez Ecological Applications, 2016, 26 (3), pp.861 - 872. ⟨10.1890/14-1966⟩ Article dans une revue hal-01426854v1
Pollution-induced community tolerance (PICT): towards an ecologically relevant risk assessment of chemicals in aquatic systems Ahmed Tlili,Annette Berard,Hans Blanck,Agnes Bouchez,Fernanda Cassioet al. Freshwater Biology, 2016, 61 (12, SI), pp.2141-2151. ⟨10.1111/fwb.12558⟩ Article dans une revue hal-01473127v1
R-Syst::diatom: an open-access and curated barcode database for diatoms and freshwater monitoring Frédéric Rimet,Philippe Chaumeil,François Keck,Lenaïg Kermarrec,Valentin Vasselonet al. Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2016, 2016, pp.baw016. ⟨10.1093/database/baw016⟩ Article dans une revue hal-01426772v1
Rejets d'effluents hospitaliers : évaluation de la persistance environnementale des médicaments et des bactéries pathogènes: La démarche du projet Persist-Env J. Labanowski,E. Laurent,T. Chonova,Agnes Bouchez,B. Cournoyeret al. TSM. Techniques Sciences Méthodes – Génie urbain, génie rural, 2016, 6, pp.22-30. ⟨10.1051/tsm/201606022⟩ Article dans une revue hal-02466014v1
Spatial heterogeneity of littoral benthic diatoms in a large lake: monitoring implications Frédéric Rimet,Agnes Bouchez,Kálmán Tapolczai Hydrobiologia, 2016, 771 (1), pp.179-193. ⟨10.1007/s10750-015-2629-y⟩ Article dans une revue hal-02634391v1
phylosignal: an R package to measure, test, and explore the phylogenetic signal François Keck,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez,Alain Franc Ecology and Evolution, 2016, 6 (9), pp.2774 - 2780. ⟨10.1002/ece3.2051⟩ Article dans une revue hal-01426773v1
Report on the fifth meeting of INRA’s national network of ecotoxicologists, ECOTOX Christian Mougin,Agnes Bouchez,Laurence Denaix,Isabelle Lamy,Francois Laurentet al. Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (4), pp.2974-2976. ⟨10.1007/s11356-015-4279-z⟩ Article dans une revue hal-01512225v1
ECOTOX, the INRA’s network of ecotoxicologists, a major structure involved for the coordination and structuring of the French research in ecotoxicology Christian Mougin,Agnes Bouchez,Laurence Denaix,Francois Laurent,Fabrice Martin-Laurent Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (4), pp.2969-2973. ⟨10.1007/s11356-015-5948-7⟩ Article dans une revue hal-02634692v1
Separate treatment of hospital and urban wastewaters: A real scale comparison of effluents and their effect on microbial communities Teofana Chonova,François Keck,Jérôme Labanowski,Bernard Montuelle,Frédéric Rimetet al. Science of the Total Environment, 2016, 542, pp.965-975. ⟨10.1016/j.scitotenv.2015.10.161⟩ Article dans une revue istex hal-01445038v1
Benthic diatoms and phytoplankton to assess nutrients in a large lake: Complementarity of their use in Lake Geneva (France–Switzerland) Frédéric Rimet,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle Ecological Indicators, 2015, 53, pp.231-239. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.02.008⟩ Article dans une revue istex hal-02636810v1
Comparative sensitivity to the fungicide tebuconazole of biofilm and plankton microbial communities in freshwater ecosystems Joan Artigas,N. Pascault,Agnes Bouchez,J. Chastaine,D. Debroaset al. Science of the Total Environment, 2014, 468-469, pp.326-336. ⟨10.1016/j.scitotenv.2013.08.074⟩ Article dans une revue istex hal-00995683v2
Antifouling Coatings Influence both Abundance and Community Structure of Colonizing Biofilms: a Case Study in the Northwestern Mediterranean Sea Mercedes Camps,Aude Barani,Gérald Grégori,Agnes Bouchez,Brigitte Le Berreet al. Applied and Environmental Microbiology, 2014, 80 (16), pp.4821-4831. ⟨10.1128/AEM.00948-14⟩ Article dans une revue hal-03183971v1
Seasonal shift in the sensitivity of a natural benthic microalgal community to a herbicide mixture: impact on the protective level of thresholds derived from species sensitivity distributions Floriane Larras,Bernard Montuelle,Frédéric Rimet,Nathalie Chèvre,Agnes Bouchez Ecotoxicology, 2014, 23 (6), pp.1109-1123. ⟨10.1007/s10646-014-1254-2⟩ Article dans une revue hal-02636768v1
A next-generation sequencing approach to river biomonitoring using benthic diatoms Lenaïg Kermarrec,Alain Franc,Frédéric Rimet,Philippe Chaumeil,Jean-Marc Frigerioet al. Freshwater Science, 2014, 33 (1), pp.349-363. ⟨10.1086/675079⟩ Article dans une revue hal-02632667v1
When is sampling complete? The effects of geographical range and marker choice on perceived diversity in Nitzschia palea (Bacillariophyta) Frédéric Rimet,Rosa Trobajo,David.G. Mann,Lenaïg Kermarrec,Alain Francet al. Protist, 2014, 165 (3), pp.245-259. ⟨10.1016/j.protis.2014.03.005⟩ Article dans une revue istex hal-02640347v1
Linking diatom sensitivity to herbicides to phylogeny: a step forward for biomonitoring? Floriane Larras,Francois Keck,Bernard Montuelle,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Environmental Science and Technology, 2014, 48 (3), pp.1921-1930. ⟨10.1021/es4045105⟩ Article dans une revue hal-02636747v1
A high-throughput sequencing ecotoxicology study of freshwater bacterial communities and their responses to tebuconazole Noémie Pascault,Simon Roux,Joan Artigas,Stéphane Pesce,Julie Leloupet al. FEMS Microbiology Ecology, 2014, 90 (3), pp.25135322. ⟨10.1111/1574-6941.12416⟩ Article dans une revue hal-01110178v1
Next-generation sequencing to inventory taxonomic diversity in eukaryotic communities: a test for freshwater diatoms Lenaïg Kermarrec,Alain Franc,Frédéric Rimet,Philippe Chaumeil,Jean-François Humbertet al. Molecular Ecology Resources, 2013, 13, pp.607-619 Article dans une revue bioemco-00840234v1
Assessment of toxicity thresholds in aquatic environments: Does benthic growth of diatoms affect their exposure and sensitivity to herbicides? Floriane Larras,Bernard Montuelle,Agnes Bouchez Science of the Total Environment, 2013, 463, pp.469 - 477. ⟨10.1016/j.scitotenv.2013.06.063⟩ Article dans une revue istex hal-02652453v1
First Evidence of the Existence of Semi-Cryptic Species and of a Phylogeographic Structure in the Gomphonema parvulum (Kutzing) Kutzing Complex (Bacillariophyta) Lenaïg Kermarrec,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Jean Francois Humbert Protist, 2013, 164 (5), pp.686 - 705. ⟨10.1016/j.protis.2013.07.005⟩ Article dans une revue istex hal-02645491v1
Next-generation sequencing to inventory taxonomic diversity in eukaryotic communities: a test for freshwater diatoms Lenaïg Kermarrec,Alain Franc,Frédéric Rimet,Philippe Chaumeil,Jean Francois Humbertet al. Molecular Ecology Resources, 2013, 13 (4), pp.607-619. ⟨10.1111/1755-0998.12105⟩ Article dans une revue istex hal-02644189v1
The effect of temperature and a herbicide mixture on freshwater periphytic algae Floriane Larras,A.S. Lambert,Stéphane Pesce,Frédéric Rimet,Agnes Bouchezet al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2013, 98, pp.162-170. ⟨10.1016/j.ecoenv.2013.09.007⟩ Article dans une revue hal-02599031v1
Mangrove microbial diversity and the impact of trophic contamination Agnes Bouchez,Noémie Pascault,Cècile Chardon,Marc Bouvy,Philippe Cecchiet al. Marine Pollution Bulletin, 2013, vol. 66 (1-2), pp. 39-46. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.11.015⟩ Article dans une revue hal-00956925v1
Influence of herbicide contamination on diversity and ecological guilds of river diatoms Rémy Marcel,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet Cryptogamie Algologie, 2013, 34 (2), pp.169 - 183. ⟨10.7872/crya.v34.iss2.2013.169⟩ Article dans une revue hal-02644367v1
Using bioassays and species sensitivity distributions to assess herbicide toxicity towards benthic diatoms Floriane Larras,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Bernard Montuelle PLoS ONE, 2012, 7 (8), ⟨10.1371/journal.pone.0044458⟩ Article dans une revue hal-02643239v1
Risk of herbicide mixtures as a key parameter to explain phytoplankton fluctuation in a great lake: the case of Lake Geneva, Switzerland Vincent Gregorio,Lucie Buechi,Orlane Anneville,Frédéric Rimet,Agnes Bouchezet al. Ecotoxicology, 2012, 21 (8), pp.2306 - 2318. ⟨10.1007/s10646-012-0987-z⟩ Article dans une revue hal-02644910v1
Pioneer marine biofilms on artificial surfaces including antifouling coatings immersed in two contrasting French Mediterranean coast sites Jean-François Briand,Ikram Djeridi,Dominique Jamet,Stéphane Coupé,Christine Bressyet al. Biofouling, 2012, 28 (5), pp.453--463. ⟨10.1080/08927014.2012.688957⟩ Article dans une revue hal-01362664v1
The submillimeter spectrum of deuterated glycolaldehydes Agnes Bouchez,L. Margulès,R. A. Motiyenko,Jean-Claude Guillemin,A. Walterset al. Astronomy & Astrophysics - A&A, 2012, 540, pp.51. ⟨10.1051/0004-6361/201118701⟩ Article dans une revue hal-00904702v1
Biomonitoring river diatoms : implications of taxonomic resolution Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Ecological Indicators, 2012, 15 (1), pp.92-99. ⟨10.1016/j.ecolind.2011.09.014⟩ Article dans une revue istex hal-02651506v1
Life-forms, cell-sizes and ecological guilds of diatoms in European rivers Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2012, 406, ⟨10.1051/kmae/2012018⟩ Article dans une revue hal-02650771v1
Molecular phylogeny of the family Bacillariaceae based on 18S rDNA sequences: focus on freshwater Nitzschia of the section Lanceolatae Frédéric Rimet Rimet,Lenaïg L. Kermarrec,Agnes Bouchez,Lucien L. Hoffmann,Luc L. Ectoret al. Diatom Research, 2011, 26, pp.273-291. ⟨10.1080/0269249X.2011.597988⟩ Article dans une revue hal-00956037v1
Effects of organic herbicides on phototrophic microbial communities in freshwater ecosystems S. Pesce,Agnes Bouchez,B. Montuelle Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 2011, 214, p. 87 - p. 124. ⟨10.1007/978-1-4614-0668-6_5⟩ Article dans une revue hal-00655976v1
A preliminary phylogenetic analysis of the Cymbellales based on 18S rDNA gene sequencing Lenaïg Kermarrec,Luc Ector,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Lucien Hoffmann Diatom Research, 2011, 26 (3), pp.305 - 315. ⟨10.1080/0269249X.2011.633255⟩ Article dans une revue hal-02648431v1
Comparison of the Effects of Two Herbicides and an Insecticide on Tropical Freshwater Plankton in Microcosms C. Leboulanger,M. Bouvy,Philippe Cecchi,Laurence Amalric,Agnes Bouchezet al. Archives of Environmental Contamination and Toxicology, 2011, 61 (4), pp.599-613. ⟨10.1007/s00244-011-9653-3⟩ Article dans une revue istex hal-00681317v1
Use of diatom life-forms and ecological guilds to assess pesticide contamination in rivers : lotic mesocosm approaches Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Ecological Indicators, 2011, 11, pp.489-499. ⟨10.1016/j.ecolind.2010.07.004⟩ Article dans une revue hal-02648538v1
Impact of chronic and acute pesticide exposures on periphyton communities Ahmed Tlili,Bernard Montuelle,Annette A. Berard,Agnes Bouchez Science of the Total Environment, 2011, 409 (11), pp.2102-2113. ⟨10.1016/j.scitotenv.2011.01.056⟩ Article dans une revue istex hal-01319985v1
In-situ interactions between the effects of season, current velocity and pollution on a river biofilm A. Villeneuve,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle Freshwater Biology, 2011, 56 (11), pp.2245-2259. ⟨10.1111/j.1365-2427.2011.02649.x⟩ Article dans une revue istex hal-02595328v1
Effects of flow regime and pesticides on periphytic communities : evolution and role of biodiversity Aurélie Villeneuve,Bernard Montuelle,Agnes Bouchez Aquatic Toxicology, 2011, 102 (1), pp.123-133. ⟨10.1016/j.aquatox.2011.01.004⟩ Article dans une revue istex hal-02646239v1
Using diatom life-forms and ecological guilds to assess organic pollution and trophic level in rivers : a case study of rivers in south-eastern France Vincent Berthon,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet Hydrobiologia, 2011, 673, pp.259-271. ⟨10.1007/s10750-011-0786-1⟩ Article dans une revue istex hal-02650841v1
Transplantation of Microbenthic Algal assemblages to Assess Structural and Functional Recovery After Diuron Exposure Ursula Dorigo,A. Berard,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Bernard Montuelle Archives of Environmental Contamination and Toxicology, 2010, 59 (4), pp.555-563. ⟨10.1007/s00244-010-9511-8⟩ Article dans une revue istex hal-02593840v1
Influence of slight differences in environmental conditions (light, hydrodynamics) on the structure and function of periphyton A. Villeneuve,Bernard Montuelle,Agnes Bouchez Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, 2010, 72 (1), pp.33-44. ⟨10.1007/s00027-009-0108-0⟩ Article dans une revue istex hal-02594603v1
In situ assessment of periphyton recovery in a river contaminated by pesticides Ursula Dorigo,A. Berard,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle Aquatic Toxicology, 2010, 98 (4), pp.396-406. ⟨10.1016/j.aquatox.2010.03.011⟩ Article dans une revue hal-02593841v1
The periphyton as a multimetric bioindicator for assessing the impact of land use on rivers: an overview of the Ardières-Morcille experimental watershed (France) Bernard Montuelle,Ursula Dorigo,A. Berard,B. Volat,Agnes Bouchezet al. Hydrobiologia, 2010, 657 (1), pp.123-141. ⟨10.1007/s10750-010-0105-2⟩ Article dans une revue istex hal-02593726v1
Genotoxic pressure of vineyard pesticides in fish : field and mesocosm surveys Sylvie Bony,Christian C. Gillet,Agnes Bouchez,Christelle Margoum,Alain Devaux Aquatic Toxicology, 2008, 89 (3), pp.197-203. ⟨10.1016/j.aquatox.2008.06.017⟩ Article dans une revue istex hal-02657801v1
Response of chronically contaminated biofilms to short pluses of diuron: an experimental study simulating flooding events in a small river Amani Tlili,Ursula Dorigo,Bernard Montuelle,C. Margoum,Nadia Carlueret al. Aquatic Toxicology, 2008, 87 (4), pp.252-263. ⟨10.1016/j.aquatox.2008.02.004⟩ Article dans une revue istex hal-02590778v1
Genotoxic pressure of vineyard pesticides in fish: field and mesocosm surveys Sylvie Bony,C. Gillet,Agnes Bouchez,C. Margoum,Alain Devaux Aquatic Toxicology, 2008, 89, pp.197-203 Article dans une revue hal-02590841v1
The use of MapPop1.0 for choosing a QTL mapping sample from an advanced backcross population. Christelle Birolleau-Touchard,Eric Hanocq,Agnes Bouchez,Cyril Bauland,Isabelle Dourienet al. TAG Theoretical and Applied Genetics, 2007, 114 (6), pp.1019-1028. ⟨10.1007/s00122-006-0495-8⟩ Article dans une revue istex hal-02655103v1
Lotic biofilm community structure and pesticide tolerance along a contamination gradient in a vineyard area Ursula Dorigo,Christophe Leboulanger,Annette Bérard,Agnes Bouchez,Jean-François Humbertet al. Aquatic Microbial Ecology, 2007, 50 (1), pp.91-102. ⟨10.3354/ame01133⟩ Article dans une revue hal-02590216v1
Marker-assisted introgression of favorable alleles at quantitative trait loci between maize elite lines Agnes Bouchez,Frederic F. Hospital,Mathilde M. Causse,A. Gallais,Alain A. Charcosset Genetics, 2002, 162, pp.1945-1959 Article dans une revue hal-02670246v1
Efficiency of the use of doubled-haploids in recurrent selection for combining ability Agnes Bouchez,A. Gallais Crop Science, 2000, 40 (1), pp.23-29 Article dans une revue hal-02698581v1
Sampling problems with nested mating designs for estimating epistatic variance components in testcrosses of maize Christine Epinat,Agnes Bouchez,Alain A. Charcosset,A. Gallais Maydica, 1996, 41, pp.287-293 Article dans une revue hal-02686996v1
Evaluation of selection index : application to the choice of an indirect multitrait selection index for soybean breeding Agnes Bouchez,Bruno Goffinet TAG Theoretical and Applied Genetics, 1990, 79, pp.261-267 Article dans une revue hal-02714729v1
Evaluation of selection index: application to the choice of an indirect multitrait selection index for soybean breeding Agnes Bouchez,Bruno Goffinet,. Station de Biometrie Et Intelligence Artificielle TAG Theoretical and Applied Genetics, 1989, 701, pp.1-7 Article dans une revue hal-02719138v1

Communication dans un congrès (58)

eDNA outperforms traditional methods for detecting organic pollution in a non- perennial river Héloïse Verdier,Thibault Datry,Lara Konecny-Dupré,Maïlys Gauthier,Maxence Forcelliniet al. AquaEcOmic, Mar 2025, Evian les Bains, France Communication dans un congrès hal-05009809v1
Comprendre le métabarcoding des diatomées pour appréhender les enjeux de la bioindication du futur Valentin Vasselon,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez,Olivier Monnier 41ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France Communication dans un congrès hal-05481130v1
Exposure of benthic microbial communities to pharmaceuticals and resulting adaptation including tolerance, biodegradation and antibiotic resistance: advances and challenges Chloé Bonnineau,Joan Artigas,Agnes Bouchez,Christophe Dagot,Marion Devers-Lamraniet al. EcotoxicoMic 2022, 3rd international conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2022, Montpelier, France Communication dans un congrès hal-03982093v1
The impact of urban contamination on antibioresistance in microbial communities from periphyton and sediments Chloe Bonnineau,Agnes Bouchez,Anais Charton,Christophe Dagot,Marion Deverset al. EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier (virtual), France Communication dans un congrès hal-03145351v1
Importance de la variabilité intraspécifique de la polluosensibilité pour l’évaluation du risque ecotoxicologique basée sur l’approche SSD (Species Sensitivity Distribution) Vincent Baillard,Laurine Malardier,Marie Laure Delignette-Muller,Eva Roubeau Dumont,Arnaud Elgeret al. 38ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03172724v1
Effluents hospitaliers et stations d'épuration urbaines : sept années de suivi, d'études et de recherche sur SIPIBEL Jean-Luc Bertrand-Krajewski,Rayan Bouchali,Agnes Bouchez,Elodie Brelot,Claire Brivetet al. 23èmes JIE – Journées Information Eaux, Oct 2018, Poitiers, France. pp.03-1 - 03-18 Communication dans un congrès hal-01948652v1
Évaluation in situ de l'efficacité d'une station de traitement de l'industrie pharmaceutique et de la toxicité des effluents qui en résultent sur la diversité et l'activité des biofilms microbiens aquatiques Vincent Tardy,C. Bonnineau,Agnes Bouchez,C. Rosy,B. Motteet al. 4ème Journées d'Ecotoxicologie Microbienne - Forum Santé Environnement & Molécules, Oct 2018, Valence, France. pp.1 Communication dans un congrès hal-02608050v1
Flux Polluants, Ecotoxicologie, Ecosystèmes du bassin du Rhône E. Naffrechoux,Agnes Bouchez ZABR, Feb 2018, Lyon, France Communication dans un congrès hal-01995510v1
Effects of water intermittency on diatom (Bacillariophyta) and invertebrate (aquatic and terrestrial) communities in streams of southern Portugal Maria Helena Novais,Maria Alexandra Penha,Eduardo Morales,Amalia Oliveira,Agnes Bouchezet al. Iberian Limnological Society meeting, Jun 2018, Coimbra, Portugal Communication dans un congrès hal-03138079v1
ANTIBIO-TOOLS : Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatiques C. Bonnineau,Agnes Bouchez,J. Labanowski,Christophe Dagot,F. Martin Laurent Séminaire PNREST : Séminaire de présentation des projets APR2017 (ANSES), Mar 2018, Maisons-Alfort, France. pp.39 Communication dans un congrès hal-02608136v1
La tolérance et l'adaptation des communautés microbiennes aux micropolluants comme indicateur de l'état des milieux Amani Tlili,Stéphane Pesce,E. Lyautey,F. Martin-Laurent,Agnes Bouchez Séminaire SediCommuTOX, Apr 2017, Villié-Morgon, France. pp.27 Communication dans un congrès hal-02606718v1
ECOTOX, le Réseau des écotoxicologues de l'INRA et de ses partenaires Christian Mougin,Agnes Bouchez,Laurence Denaix,Fabrice Martin-Laurent Forum ECO-TOX, Ecoparc Rovaltain, Oct 2016, Alixan, France Communication dans un congrès hal-01604659v1
Gaps to fill when analyzing freshwater diatom diversity with DNA barcoding – notes from a boreal region Maria Kahlert,Agnes Bouchez,Philippe Chaumeil,Alain Franc,Jean-Marc Frigerioet al. 6. European Phycological Congress, Aug 2015, Londres, United Kingdom. ⟨10.1080/09670262.2015.1069489⟩ Communication dans un congrès hal-02743082v1
Lien entre la phylogénie des diatomées et leur sensibilité aux herbicides Francois Keck,Floriane Larras,Frédéric Rimet,Bernard Montuelle,Agnes Bouchez 5. Séminaire d'Ecotoxicologie de l'INRA, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., Nov 2014, Biarritz, France. 66 p Communication dans un congrès hal-02743084v1
R-SYST network : a French consortium for barcoding and species identification Agnes Bouchez,Marc Buée,Philippe Chaumeil,Valerie Laval,Marion Le Sauxet al. Journées annuelles de la Société Française de Systématique : "Systématique et sciences participatives", Oct 2013, Paris, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01209971v1
metaMatch: un algorithme pour l'assignation taxonomique en métagénomique Jean-Marc Frigerio,Philippe Chaumeil,Pierre Gay,Lenaïg Kermarrec,Frédéric Rimetet al. journées scientifiques mésocentres et France Grilles 2012, Oct 2012, Paris, France Communication dans un congrès hal-00766072v1
Marine biofilm communities colonizing antifouling paints in the Mediterranean Sea Mercedes Camps,Gérald Grégori,Agnes Bouchez,Aude Barani,Brigitte Le Berreet al. 14th International Congress : The power of the small, International Society for Microbial Ecology (ISME). Copenhagen, INT., Aug 2012, Copenhagen, Denmark Communication dans un congrès hal-02807526v1
New Biomonitoring Approaches based on Next Generation Sequencing : a Test for Freshwater Diatom Communities Lenaïg Kermarrec,Frédéric Rimet,Alain Franc,Philippe Chaumeil,Jean Francois Humbertet al. 22nd International Diatom Symposium, Ghent University [Belgium] (UGENT). National Botanic Garden of Belgium, Ghent, BEL., Aug 2012, Ghent, Belgium. 1p Communication dans un congrès hal-02807004v1
Antifouling coatings : in vitro bioassay vs marine biofilm communities Mercedes Camps,Gérald Grégori,Agnes Bouchez,Aude Barani,Brigitte Le Berreet al. 16th International Congress on Marine Corrosion and Fouling, Comité International Permanent pour la Recherche sur la Préservation des Matériaux en Milieu Marin ((COIPM).). Seattle, INT., Jun 2012, Seattle, United States Communication dans un congrès hal-02805263v1
Assessment of the impact of tebuconazol (fungicide) on lake and stream bacterial communities using a 16S rRNA pyrosequencing method Noémie Pascault,Joan Artigas,Simon Roux,Remy Tadonleke Dzatchou,Alexandra ter Halleet al. 12. Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Labo/service de l'auteur, Ville service., Aug 2011, Rostock, Germany. 121 p Communication dans un congrès hal-02749915v1
Des bioindicateurs pour évaluer l’impact ou la restauration vis-à-vis des pesticides - Diatomées Frédéric Rimet,Rémy Marcel,Thierry Caquet,Agnes Bouchez Colloque ONEMA Les méthodes d'évaluation de l'état des eaux: situation et perspectives dans le contexte de la DCE, Jan 2011, Paris, France. 20 p Communication dans un congrès hal-01453828v1
A pipeline for automatic taxonomic community inventories on data from NGS : an example with freshwater diatoms Lenaïg L. Kermarrec,Philippe P. Chaumeil,Frédéric F. Rimet,Jean-Marc Frigerio,Valerie Lavalet al. 4th International Barcode of Life Conference, University of Adelaide. Adélaide, AUS., Nov 2011, Adélaide, Australia. 1p Communication dans un congrès hal-00999998v1
Sensibility of aquatic bacterial communities to contaminants in wine-producing watersheds: Approach in rivers and lakes Joan Artigas,N. Pascault,J. Chastain,G. Voyard,Alexandra ter Halleet al. 7th Symposium for European Freshwater Sciences, Jun 2011, Girona, Spain. pp.1 Communication dans un congrès hal-02595337v1
Linking changes in microbial communities to trophic variations in a tropical mangrove Agnes Bouchez,Noémie Pascault,Cècile Chardon,Marc Bouvy,Philippe Cecchiet al. 12. Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Aug 2011, Rostock, Germany Communication dans un congrès hal-02748180v1
Benthic Microbial community responses to pesticides in lake littoral zones Floriane Larras,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle 12. ﻿Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Aug 2011, Rostock, Germany Communication dans un congrès hal-02745822v1
Impacts of chronic and pulse pesticide exposures on periphyton communities Agnes Bouchez,Ahmed Tlili,Annette A. Berard,Bernard Montuelle SEFS7 Symposium for European Freshwater Sciences, Jun 2011, Girona, Spain. 17 p Communication dans un congrès hal-02809233v1
Des bioindicateurs pour évaluer l’impact ou la restauration vis-à-vis des pesticides – Invertébrés Thierry Caquet,Marc Roucaute,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Colloque ONEMA Les méthodes d'évaluation de l'état des eaux : situation et perspectives dans le contexte de la DCE, Apr 2011, Paris, France. 20 p Communication dans un congrès hal-01453818v1
Prédire l’impact des herbicides en mélange et à faible concentration sur les communautés algales planctoniques et benthiques lacustres Agnes Bouchez Pesticides & Environnement : entre science et décision, Mar 2011, Tours, France. 1 p Communication dans un congrès hal-02804368v1
Taxonomic resolution of river diatoms: structuring impact of environmental parameters and implications for biomonitoring Frédéric Rimet,Agnes Bouchez 7th Symposium for European Freshwater Sciences, Catalan Institute for Water Research (ICRA). Girona, ESP., Jun 2011, Girona, Spain. pp.2 Communication dans un congrès hal-02806457v1
Efficiency of 3 genetic markers to determine the composition of a diatom assemblage using next generation sequencing Lenaïg Kermarrec,Frédéric Rimet,Alain Franc,Philippe Chaumeil,Jean Francois Humbertet al. 4thInternational Barcode of Life Conference, University of Adelaide. Adélaide, AUS., Nov 2011, Adélaide, Australia. 1p Communication dans un congrès hal-02805342v1
Intérêt de différents traits biologiques des diatomées pour l'évaluation des niveaux de saprobie et de trophie en rivières Vincent Berthon,Bernard Rimet,Agnes Bouchez Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France Communication dans un congrès hal-02758478v1
Evaluation du risque des mélanges de substances chimiques : application au cas du phytoplancton du Léman Valéry Grégorio,Agnes Bouchez,Orlane Anneville,Nathalie Chèvre Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France Communication dans un congrès hal-02751329v1
Taxonomic resolution of river diatoms : structuring impact of environmental parameters and implications for biomonitoring Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France Communication dans un congrès hal-02755745v1
Evaluation des effets de trois pesticides sur des communautés planctoniques tropicales : une approche en microcosmes Christophe Leboulanger,Marc Bouvy,Claire Carré,Philippe Cecchi,Marc Paganoet al. 40ème congrès scientifique du Groupe Français des Pesticides., May 2010, Banyuls, France. 2 p Communication dans un congrès hal-02818396v1
Diatomées et bioindication : perspectives pour les milieux tropicaux Lenaïg Kermarrec,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez Colloque sur la Bioindication et la biodiversité des écosystèmes d’eau douce en milieu tropical, Martinique (France), Oct 2010, Fort de France, France. 1 p Communication dans un congrès hal-02816150v1
Genetic diversity within the Gomphonema Parvulum complex. Lenaïg Kermarrec,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez 21th International Diatom Symposium, Mineapolis, usa., 2010 Communication dans un congrès hal-02814475v1
Genotypic and morphometric characterization of temperate and tropical Gomphonema parvulum isolates (Bacillariophyta) Lenaïg Kermarrec,Bernard Rimet,Jean Francois Humbert,Agnes Bouchez Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bain, France Communication dans un congrès hal-02751055v1
What is the influence of the nature of submerged artificial surfaces on the structure of microbial biofilms communities Jean-François Briand,Ikram Djeridi,Dominique Jamet,Stéphane Coupé,Christine Bressyet al. 15th International Congress on Marine Corrosion and Fouling, Comité International Permanent pour la Recherche sur la Préservation des Matériaux en Milieu Marin ((COIPM).). Newcastle, INT., Jun 2010, Newcastle, United Kingdom. 1 p Communication dans un congrès hal-02816267v1
Biofilms et évaluation d'impact chimique en milieux aquatiques Bernard Montuelle,Vincent Berthon,Agnes Bouchez,François Delmas,Soizic Morinet al. Ecologie 2010, Sep 2010, Montpellier, France. pp.125-125 Communication dans un congrès hal-02593811v1
Use of diatom life-forms and ecological guilds to assess pesticide contamination in rivers: lotic mesocosm approaches Frédéric Rimet,Agnes Bouchez 4th CE-Diatom Meeting, Mar 2010, Reichenau, Germany. 2 p Communication dans un congrès hal-02817780v1
Using diatom life-forms and ecological guilds to assess organic and nutrient concentrations in rivers : a case study in rivers in south-eastern France) Vincent Berthon,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez 4th CE-Diatom Meeting, Mar 2010, Reichenau, Germany. 1 p Communication dans un congrès hal-02818242v1
Evaluation des effets de trois pesticides sur des communautés planctoniques tropicales : une approche en microcosmes Agnes Bouchez,Christophe Leboulanger,Marc Bouvy,Claire Carré,Philippe Cecchiet al. Journées Internationales de Limnologie, Oct 2010, Thonon-les-Bains, France Communication dans un congrès hal-02753912v1
Use of pollution-induced community tolerance (PICT) approach based on river biofilms for assessing environmental toxicant impact and remediation Bernard Montuelle,Ursula Dorigo,Agnes Bouchez,Stéphane Pesce,Amani Tliliet al. 36th Aquatic Toxicity Workshop, Sep 2009, La Malbaie, Canada. pp.13 Communication dans un congrès hal-02592823v1
Ergokit : une nouvelle méthode d’évaluation des capacités fonctionnelles appliquées au monde du travail L Bontoux,A Mollé,Agnes Bouchez,G Roche,V Dubuset al. 23ème congrès de la Société française de médecine physique et de réadaptation, Oct 2008, Mulhouse, France Communication dans un congrès hal-02937999v1
Responses of pesticide impacted biofilms in a translocation experiments in river Ursula Dorigo,Annette Berard,Bernard Motte,Bernadette Vollat,Agnes Bouchezet al. 5. symposium for european freshwater sciences, Jul 2007, Palerme, Italy Communication dans un congrès hal-02754801v1
Impact of pesticides (Diuron and Azoxystrobin) on microbial aquatic biodiversity and functions. An experimental study Aurélie Villeneuve,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle 5. symposium for european freshwater sciences, Jul 2007, Palerme, Italy Communication dans un congrès hal-02751956v1
Responses of pesticide impacted biofilms in a translocation experiment in river Ursula Dorigo,A. Berard,B. Motte,B. Volat,Agnes Bouchezet al. 5th SEFS, Palermo, ITA, 8-13 July 2007, 2007, pp.1 Communication dans un congrès hal-02590243v1
Comparison of advanced oxidation processes (AOPs) for decontamination of water containing Diuron Marion Carrier,M. Besson,C. Guillard,E. Gonze,C. Pétrieret al. First European Conference on Environmental Applications of Advanced Oxidation Processes, EAAOP-1, 2006, Chania, Greece. 7-9 septembre Communication dans un congrès hal-00018215v1
Toxic effects of degradated Diuron by advanced oxidation processes (AOPs) on microalgae and rotifere Marion Carrier,Anne Ponticelli,Agnes Bouchez,B. Vollat,M. Bessonet al. Analytical Chemistry and Ecotoxicology, Feb 2006, Geneve, Switzerland Communication dans un congrès hal-02757222v1
The PICT method, application on various systems and with various microalgae communities. Implication in ecotoxicological assessment Agnes Bouchez,Christophe Leboulanger,Ursula Dorigo,F. Seguin,Annette Berard Analytical Chemistry and Ecotoxicology, Feb 2006, Geneve, France Communication dans un congrès hal-02754023v1
Toxic effect of degradated Diuron by Advanced Oxidation Processes (AOPs) on microalgae and rotifere Marion Carrier,A. Ponticelli,Agnes Bouchez,B. Vollat,M. Bessonet al. Workshop Analytical Chemistry and Ecotoxicology, 2006, Genève, Switzerland Communication dans un congrès hal-00013593v1
Impact d'un herbicide sur la diversité microbienne aquatique. Une approche expérimentale Agnes Bouchez,Aurélie Villeneuve,Christophe Leboulanger,Jean Francois Humbert,Bernard Montuelle 3. Séminaire d'Ecotoxicologie de l'INRA, Sep 2006, Dinard, France Communication dans un congrès hal-02754142v1
Impact des facteurs physiques sur la biodiversité bactérienne et phytobenthique et le fonctionnement des communautés en &quot;rivières&quot; expérimentales A. Villeneuve,Bernard Montuelle,J.F. Humbert,Agnes Bouchez Conférence Internationale des Limnologues d'Expression Française CILEF, Hammamet, TUN, 17-21 mars 2006, 2006, pp.13 Communication dans un congrès hal-02588942v1
Treatment of herbicides by Advanced Oxidation Processes Marion Carrier,M. Besson,E. Gonze,C. Petrier,Agnes Bouchezet al. 4th European Meeting on Solar Chemistry and Photocatalysis: Environmental Applications, 2006, Las Palmas de Gran Canaria, Spain Communication dans un congrès hal-00174715v1
Apparition de clones de microalgues résistants sous l'effet d'un herbicide. Caractérisation et coût de la résistance Agnes Bouchez,Aurélie Villeneuve,Christophe Leboulanger 2. Colloque d'écologie microbienne, May 2005, Obernai, France Communication dans un congrès hal-02760691v1
Introgression de gènes ou de QTL L. Moreau,Bertrand Servin,Agnes Bouchez,Frederic F. Hospital Séminaire du Département de Génétique Animale INRA, Sep 2001, Batz-sur-Mer, France Communication dans un congrès hal-02759533v1
Au delà des QTLs : deux approches d'utilisation des marqueurs en sélection Alain A. Charcosset,Frederic F. Hospital,L. Moreau,Agnes Bouchez,Aurélie Mauriceet al. Séminaire du groupe de travail "Génomes végétaux", Apr 1997, Méribel-les-Allues, France Communication dans un congrès hal-02765840v1
Construction de génotypes assistée par marqueurs chez le maïs. Poster A. Gallais,Aurélie Maurice,Agnes Bouchez,Alain A. Charcosset,Mathilde M. Causseet al. Séminaire, Oct 1996, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02765460v1

Poster de conférence (14)

Multiple tools for antibiotics and AMR characterisation in aquatic ecosystems a 2-years monitoring study Chloé Bonnineau,Agnes Bouchez,Anaïs Charton,Teofana Chonova,Christophe Dagotet al. SETAC Europe 32nd annual meeting, May 2022, Copenhague, Denmark. Poster de conférence hal-03788502v1
Influence de la radioactivité naturellement renforcée (NOR) sur les peuplements de diatomées actuelles et passées des sources minérales. Lory-Anne Baker,Beauger Aude,Sofia Kolovi,Olivier Voldoire,Alain Elisabethet al. 5e colloque des Zones Ateliers – CNRS 2000-2020, 20 ans de recherche du Réseau des Zones Ateliers, Nov 2020, Tours, France Poster de conférence hal-03018019v1
Résistance aux antibiotiques et impact écologique chez les communautés microbiennes benthiques exposées a la contamination urbaine. Chloé Bonnineau,Agnes Bouchez,Anaïs Charton,Christophe Dagot,Marion Deverset al. Colloque 2019 de la Société Française d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA), 2019, Lyon, France, 24-25 juin 2019, France. 2019 Poster de conférence hal-02790470v1
Résistance aux antibiotiques et impact écologique chez les communautés microbiennes benthiques exposées à la contamination urbaine C. Bonnineau,Agnes Bouchez,A. Charton,Christophe Dagot,M. Deverset al. SEFA, Jun 2019, Lyon, France. pp.1, 2019 Poster de conférence hal-02609884v1
AntibiotoolS : Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatiques C. Bonnineau,Agnes Bouchez,A. Charton,Christophe Dagot,M. Deverset al. 7ème conférence Eau et Santé, Nov 2019, Villeurbanne, France. pp.1, 2019 Poster de conférence hal-02609885v1
Limiting similarity and environmental filtering under drought stress in streams, a case study on diatoms Gábor Várbíró,Agnes Bouchez,Fréderic Rimet,Kálmán Tapolczai,Maria Helena Novaiset al. 25th International Diatom Symposium, Jun 2018, Berlin, Germany Poster de conférence hal-03138084v1
A pilot experimental installation to evaluate the efficiency of a pharmaceutical industry treatment plant and the resulting decrease in effluents toxicity to aquatic microbial biofilms Vincent Tardy,C. Bonnineau,Agnes Bouchez,C. Rosy,B. Motteet al. 1st International Conference on Microbial Ecotoxicology (EcotoxicoMic 2017), Nov 2017, Lyon, France. pp.1, 2017 Poster de conférence hal-02606934v1
ECOTOX, le réseau des écotoxicologues de l’INRA Christian Mougin,Laurence Denaix,Fabrice Martin-Laurent,Agnes Bouchez 2ème colloque scientifique de la Fondation Rovaltain, Oct 2015, Alixan, France. 2015 Poster de conférence hal-01601569v1
Using diatom taxonomic diversity to assess herbicide contamination in rivers Rémy Marcel,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet SEFS7 - Ecological assessment of lakes, rivers and reservoirs : water quality management ; ; Girona (ESP), Jun 2011, Girona, Spain. 1 p., 2011 Poster de conférence hal-02804487v1
Déterminisme de l’impact des pesticides en cours d’eau : influence de la dynamique de l’exposition sur les effets biologiques Véronique Gouy,A. Berard,Agnes Bouchez,Nadia Carluer,S. Charleset al. Colloque de restitution du programme EC2CO, Nov 2010, Toulouse, France. pp.1, 2010 Poster de conférence hal-02606344v1
Environmental physical factors impacts on biofilm in small experimental streams Agnes Bouchez,Aurélie Villeneuve,Jean Francois Humbert,Bernard Montuelle 10. Symposium on Aquatic Microbial Ecology SAME 10, Sep 2007, Faro, Portugal. 1 p., 2007 Poster de conférence hal-02821927v1
Hydraulic versus pesticides effects on periphyton in experimental stream Aurélie Villeneuve,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle 10.Symposium on Aquatic Microbial Ecology ; SAME 10, Sep 2007, Faro, Portugal. 1 p., 2007 Poster de conférence hal-02812653v1
Treatment of agricultural wastewater containing herbicides by advanced oxidation processes Marion Carrier,Michelle Besson,Chantale Guillard,Evelyne Gonze,Christian Petrieret al. 1. European Conference on Environmental Applications of Oxydation Processes, Sep 2006, Chania, Greece. 1 p., 2006 Poster de conférence hal-02818281v1
Treatment of agricultural wastewater containing herbicides by Advanced Oxidation Processes Marion Carrier,Michelle Besson,Chantale Guillard,Evelyne Gonze,Christian Petrieret al. Solar Chemistry and Photocatalysis Environmental Applications 4th european meeting' SPEA Las Palmas (Canaria), 8-10 november 2006, Nov 2006, Las Palmas (Canaria), Spain. 1 p, 2006 Poster de conférence hal-02818341v1

Ouvrages (3)

Guide pour la mise en œuvre d'indices biologiques en Outre-mer. Les indices diatomées Mayotte IDMsp et IDMtrait Valentin Vasselon,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Gilles Gassiole,Olivier Monnier OFB. 2019, Guides et protocoles, 978-2-37785-016-7 Ouvrages hal-05024540v1
Special Issue « ECOTOX, the INRA's network of ecotoxicologists » Christian Mougin,Agnes Bouchez,Laurence Denaix,Francois Laurent,Fabrice Martin-Laurent , 23, pp.2969-3194, 2016, Environmental Science and Pollution Research Ouvrages hal-01630631v1
Bioindication : des outils pour évaluer l'état écologique des milieux aquatiques - Perspectives en vue du 2e cycle DCE - Eaux de surface continentales Yorick Reyjol,Vassilis Spyratos,Laurent Basilico,Virginie Archaimbault,Christine Argillieret al. Onema, pp.56, 2013 Ouvrages hal-02598686v1

Chapitre d'ouvrage (5)

Why We Need Sustainable Networks Bridging Countries, Disciplines, Cultures and Generations for Aquatic Biomonitoring 2.0: A Perspective Derived From the DNAqua-Net COST Action Florian Leese,Agnes Bouchez,Kessy Abarenkov,Florian Altermatt,Angel Borjaet al. Next Generation Biomonitoring: Part 1, 58, Elsevier, pp.63-99, 2018, Advances In Ecological Research, 978-0-12-813949-3 Chapitre d'ouvrage hal-01984996v1
EFFLUENTS HOSPITALIERS ET STATIONS D'EPURATION URBAINES : SEPT ANNEES DE SUIVI, D'ETUDES ET DE RECHERCHE SUR SIPIBEL Jean-Luc Bertrand-Krajewski,Rayan Bouchali,Agnes Bouchez,Elodie Brelot,Claire Brivetet al. Actes des 23e Journées Information Eaux, 2018 Chapitre d'ouvrage hal-02386470v1
Environmental River Biofilms as Biological Indicators of the Impact of Chemical Contaminants A. Villeneuve,Bernard Montuelle,Stéphane Pesce,Agnes Bouchez Encyclopedia of aquatic ecotoxicology, Férard, J.F. & Blaise, C., pp.443-455, 2013 Chapitre d'ouvrage hal-02599032v1
Les microorganismes travaillent pour nous Bernard Montuelle,Agnes Bouchez,Aurelie Villeneuve,Stéphane Pesce Rhône-Alpes et l'environnement : 100 questions pour la recherche, Cluster de recherche Rhône-Alpes Environnement CNRS Rhône Alpes Auvergne, 296 p., 2011, 978-2-7446-2968-4 Chapitre d'ouvrage hal-02810296v1
Effects of organic herbicides on phototrophic microbial communities in freshwater ecosystems Stéphane Pesce,Agnes Bouchez,Bernard Montuelle Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 214, Springer, 2011, Reviews of Environmental Contamination and Toxicology, 978-1-4614-0667-9. ⟨10.1007/978-1-4614-0668-6_5⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02811179v1

Autre publication scientifique (5)

SIPIBEL data set Jean-Luc Bertrand-Krajewski,Rémy Bournique,Vivien Lecomte,Noémie Pernin,Laure Wiestet al. 2021 Autre publication scientifique hal-03318893v1
Bilan 2019 des activités du réseau ECOTOX Agnes Bouchez,Laurence Denaix,Jeanne Garric,Fabrice Martin-Laurent,Christian Mougin 2020, pp.1-4 Autre publication scientifique hal-03144237v1
Présentation du projet ANTIBIO-TOOLS Chloé Bonnineau,Agnes Bouchez,J. Labanowski,Christophe Dagot,Fabrice Martin-Laurent 2018 Autre publication scientifique hal-03788451v1
Évaluation des risques liés aux pesticides pour les écosystèmes aquatiques : recommandations issues du programme de recherche « Pesticides » E. Barriuso,A.S. Carpentier,Edwige Charbonnier,Hélène Soubelet,F. de Alencastroet al. 2015, pp.6 Autre publication scientifique hal-02602219v1
R-Syst Pierre Abad,Marie-Anne Auger-Rozenberg,Agnes Bouchez,Marc Buée,Thierry Candresseet al. 2013 Autre publication scientifique hal-01204276v1

Rapport (8)

Diatoms of Mayotte. The benthic flora of watercourses Gilles Gassiole,Agnes Bouchez,Frédéric Rimet,Olivier Monnier MicPhyc; Office Francais de la Biodiversité; Inrae. 2024 Rapport hal-04935349v1
Phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer: développement d'outils de monitoring basés sur l'ADN Livrable 3 : « Application de l'approche ADNe pour recenser le phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer: méthodes et premiers résultats » Alexis Canino,Benjamin Alric,Maria-Mercedes Nicolosi-Gelis,Christophe Laplace-Treyture,Agnes Bouchezet al. INRAE UMR CARRTEL; INRAE UR EABX. 2023 Rapport hal-04116746v1
Diatomées des cours d'eau de Mayotte. Guide iconographique pour la mise en œuvre des indices diatomées IDMsp et IDMtrait. Comparaison pour certains taxons avec La Réunion, la Nouvelle-Calédonie et la Polynésie française Gilles Gassiole,Frédéric Rimet,Agnes Bouchez,Olivier Monnier MicPhyc; INRAE; OFB. 2023 Rapport hal-04418123v1
Rapport final du projet Antibiotools - Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatique (PNREST Anses, 2017/3 ABR/22) Chloé Bonnineau,Agnes Bouchez,Christophe Dagot,Marion Devers-Lamrani,J. Labanowskiet al. [Rapport de recherche] INRAE RiverLy. 2022 Rapport (rapport de recherche) hal-03797468v1
Phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer : développement d'outils de monitoring basés sur l'ADN - Livrable 2 : «Phytoplancton DOM : première application du protocole de terrain et comparaisons entre microscopie/ADNe » Alexis Canino,Christophe Laplace-Treyture,Agnes Bouchez,Domaizon Isabelle,Frédéric Rimet Livrable 2, Pole R&D ECLA. 2021 Rapport hal-05306176v1
Synthèse du séminaire « Quo vadis, la biosurveillance basée sur l’ADNe ? » Philippe Blancher,Agnes Bouchez,Teofana Chonova,Estelle Lefrancois,Frédéric Rimetet al. INRAE, UMR Carrtel. 2021, 21 p Rapport hal-04904384v1
Phytoplancton des plans d'eau d'Outre-Mer : développement d'outils de monitoring basés sur l'ADN Alexis Canino,Christophe Laplace-Treyture,Agnes Bouchez,Isabelle Domaizon,Frédéric Rimet Livrable 1, Pole R&D ECLA. 2020 Rapport hal-05305968v1
Formes de vie, guildes écologiques et classes de tailles des diatomées d’eau douce Frédéric Rimet,Vincent Berthon,Agnes Bouchez [Rapport Technique] 2010 Rapport (rapport technique) hal-02824514v1

Thèse (1)

Contribution à la construction et a la validation des index de sélection. Application a la sélection du Soja Agnes Bouchez Environnement et Société. Institut National Polytechnique (Toulouse), 1988. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-02857494v1