Ali Hamraoui

Identifiants chercheurs

IdHAL :

ali-hamraoui

ORCID :

0009-0008-7001-4252

Publications

Article dans une revue (1)

AsaruSim: a single-cell and spatial RNA-Seq Nanopore long-reads simulation workflow Ali Hamraoui,Laurent Jourdren,Morgane Thomas-Chollier Bioinformatics, 2025, Volume 41 (Issue 3), pp.March 2025, btaf087. ⟨10.1093/bioinformatics/btaf087⟩ Article dans une revue hal-04708885v2

Poster de conférence (2)

ToulligQC: What’s new in 2024? Ali Hamraoui,Brunon Salomé,Morgane Thomas-Chollier,Laurent Jourdren jobim 2024, Jun 2024, Toulouse, France. Poster de conférence hal-05142761v1
Wf-ToulligQC : A User-Friendly Solution for Quality Control of Nanopore sequencing data on EPI2ME Labs Ali Hamraoui,Karine Dias,Sophie Lemoine,Morgane Thomas-Chollier,Stéphane Le Cromet al. Assemblée générale France Génomique, Jun 2023, Paris, France. Poster de conférence hal-05142806v1

Pré-publication, Document de travail (1)

A systematic benchmark of bioinformatics methods for single-cell and spatial RNA-seq Nanopore long-read data Ali Hamraoui,Audrey Onfroy,Catherine Sénamaud-Beaufort,Fanny Coulpier,Sophie Lemoineet al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-05190995v1

Thèse (1)

Bioinformatics approaches for the study of isoforms in single-cell transcriptomics coupled with long-read sequencing Ali Hamraoui Bioinformatics [q-bio.QM]. École Normale Supérieure (Paris), 2025. English. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-05492857v1