Andaine Seguin-Orlando Maîtresse de conférences en paléogénomique

Publications

Article dans une revue (41)

An ancient DNA perspective on the Russian conquest of Yakutia Éric Crubézy,Perle Guarino-Vignon,Andaine Seguin-Orlando,Clio Der Sarkissian,Kristian Hanghøjet al. Nature, 2026, 650, pp.389-398. ⟨10.1038/s41586-025-09856-5⟩ Article dans une revue hal-05465734v1
Sustainability insights from Late Pleistocene climate change and horse migration patterns Yvette Running Horse Collin,Clément Bataille,Samantha Hershauer,Mila Hunska Tašunke Icu,Akil Nujipiet al. Science, 2025, 388 (6748), pp.748-755. ⟨10.1126/science.adr2355⟩ Article dans une revue hal-05216355v1
Sustainability insights from Late Pleistocene climate change and horse migration patterns Yvette Running Horse Collin,Clément Bataille,Samantha Hershauer,Mila Hunska Tašunke Icu,Akil Nujipiet al. Science, 2025, 388 (6748), pp.748-755. ⟨10.1126/science.adr2355⟩ Article dans une revue hal-05343796v1
The genomic history of Iberian horses since the last Ice Age Jaime Lira Garrido,Gaétan Tressières,Lorelei Chauvey,Stéphanie Schiavinato,Laure Calvière-Tonassoet al. Nature Communications, 2025, 16 (1), pp.7098. ⟨10.1038/s41467-025-62266-z⟩ Article dans une revue hal-05220396v1
Validating a Target-Enrichment Design for Capturing Uniparental Haplotypes in Ancient Domesticated Animals Kuldeep D More,Ophélie Lebrasseur,Jaime Lira Garrido,Andaine Seguin-Orlando,Emmanuel Discampset al. Molecular Ecology Resources, 2025, 25 (7), ⟨10.1111/1755-0998.14112⟩ Article dans une revue hal-05027853v1
Tracking population structure and phenology through time using ancient genomes from waterlogged white oak wood Stefanie Wagner,Andaine Seguin-Orlando,Jean-Charles Leplé,Thibault Leroy,Céline Lalanneet al. Molecular Ecology, 2024, 33 (3), ⟨10.1111/mec.16859⟩ Article dans une revue hal-04717422v1
Long genetic and social isolation in Neanderthals before their extinction Ludovic Slimak,Tharsika Vimala,Andaine Seguin-Orlando,Clément Zanolli,Laure Metzet al. Cell Genomics, 2024, 4 (9), pp.100593. ⟨10.1016/j.xgen.2024.100593⟩ Article dans une revue hal-04709009v1
Widespread horse-based mobility arose around 2,200 BCE in Eurasia Pablo Librado,Gaetan Tressières,Lorelei Chauvey,Antoine Fages,Naveed Khanet al. Nature, 2024, 631 (8022), ⟨10.1038/s41586-024-07597-5⟩ Article dans une revue hal-04607980v1
DNA methylation-based profiling of horse archaeological remains for age-at-death and castration Xuexue Liu,Andaine Seguin- Orlando,Lorelei Chauvey,Gaëtan Tressières,Laure Tonasso-Calvieet al. iScience, 2023, 26 (3), pp.106144. ⟨10.1016/j.isci.2023.106144⟩ Article dans une revue cea-04286440v1
Improving the extraction of ancient Yersinia pestis genomes from the dental pulp Pierre Clavel,Lexane Louis,Clio Der Sarkissian,Catherine Thèves,Claudia Gilletet al. iScience, 2023, 26 (5), pp.106787. ⟨10.1016/j.isci.2023.106787⟩ Article dans une revue hal-04510941v1
Interdisciplinary evidence for early domestic horse exploitation in southern Patagonia William Timothy Treal Taylor,Juan Bautista Belardi,Ramiro Barberena,Joan Brenner Coltrain,Flavia Carballo Marinaet al. Science Advances , 2023, 9 (49), ⟨10.1126/sciadv.adk5201⟩ Article dans une revue hal-04729939v1
Early dispersal of domestic horses into the Great Plains and northern Rockies William Timothy Treal Taylor,Pablo Librado,Mila Hunska Tašunke Icu,Carlton Shield Chief Gover,Jimmy Arterberryet al. Science, 2023, 379 (6639), pp.1316-1323. ⟨10.1126/science.adc9691⟩ Article dans une revue hal-04065852v1
Modern human incursion into Neanderthal territories 54,000 years ago at Mandrin, France Ludovic Slimak,Clément Zanolli,Tom Higham,Marine Frouin,Jean-Luc Schwenningeret al. Science Advances , 2022, 8 (6), ⟨10.1126/sciadv.abj9496⟩ Article dans une revue hal-03604105v1
Historical management of equine resources in France from the Iron Age to the Modern Period: a cross disciplinary approach Pierre Clavel,Jean Dumoncel,Clio Der Sarkissian,Andaine Seguin-Orlando,Laure Calvière-Tonassoet al. Bulletins et Mémoires de la Société d'anthropologie de Paris, 2022, 34 ((S)), pp.4627-4647. ⟨10.4000/bmsap.8460⟩ Article dans une revue hal-05023241v1
The genomic history and global expansion of domestic donkeys Evelyn Todd,Laure Tonasso-Calvière,Loreleï Chauvey,Stéphanie Schiavinato,Antoine Fageset al. Science, 2022, 377 (6611), pp.1172-1180. ⟨10.1126/science.abo3503⟩ Article dans une revue hal-03827857v1
Sex in the city: Uncovering sex-specific management of equine resources from prehistoric times to the Modern Period in France Benoît Clavel,Sébastien Lepetz,Loreleï Chauvey,Stéphanie Schiavinato,Laure Tonasso-Calvièreet al. Journal of Archaeological Science: Reports, 2022, 41, pp.103341. ⟨10.1016/j.jasrep.2022.103341⟩ Article dans une revue halshs-03755076v1
Assessing the impact of USER‐treatment on hyRAD capture applied to ancient DNA Tomasz Suchan,Lorelei Chauvey,Marine Poullet,Laure Tonasso-Calvière,Stéphanie Schiavinatoet al. Molecular Ecology Resources, 2022, 22 (6), pp.2262-2274. ⟨10.1111/1755-0998.13619⟩ Article dans une revue hal-03827861v1
Grey wolf genomic history reveals a dual ancestry of dogs Anders Bergström,David W. G. Stanton,Ulrike H. Taron,Laurent Frantz,Mikkel-Holger S. Sindinget al. Nature, 2022, 607, pp.313-320. ⟨10.1038/s41586-022-04824-9⟩ Article dans une revue hal-03717833v1
Heterogeneous Hunter-Gatherer and Steppe-Related Ancestries in Late Neolithic and Bell Beaker Genomes from Present-Day France Andaine Seguin-Orlando,Richard Donat,Clio Der Sarkissian,John Southon,Catherine Thèveset al. Current Biology, 2021, 31 (5), pp.1072-1083.e10. ⟨10.1016/j.cub.2020.12.015⟩ Article dans une revue hal-03150872v1
Historical management of equine resources in France from the Iron Age to the Modern Period Sébastien Lepetz,Benoît Clavel,Duha Alioğlu,Lorelei Chauvey,Stéphanie Schiavinatoet al. Journal of Archaeological Science: Reports, 2021, 40 (B), pp.103250. ⟨10.1016/j.jasrep.2021.103250⟩ Article dans une revue hal-03431948v1
Assessing the predictive taxonomic power of the bony labyrinth 3D shape in horses, donkeys and their F1-hybrids Pierre Clavel,Jean Dumoncel,Clio Der Sarkissian,Andaine Seguin-Orlando,Laure Calvière-Tonassoet al. Journal of Archaeological Science, 2021, 131, pp.105383. ⟨10.1016/j.jas.2021.105383⟩ Article dans une revue hal-03413040v1
Identifying a living great-grandson of the Lakota Sioux leader Tatanka Iyotake (Sitting Bull) Ida Moltke,Thorfinn Sand Korneliussen,Andaine Seguin-Orlando,J. Víctor Moreno-Mayar,Ernie Lapointeet al. Science Advances , 2021, 7 (44), ⟨10.1126/sciadv.abh2013⟩ Article dans une revue hal-04780842v1
Ancient horse genomes reveal the timing and extent of dispersals across the Bering Land Bridge Alisa Vershinina,Peter Heintzman,Duane Froese,Grant Zazula,Molly Cassatt‐johnstoneet al. Molecular Ecology, 2021, ⟨10.1111/mec.15977⟩ Article dans une revue hal-03431968v1
The origins and spread of domestic horses from the Western Eurasian steppes Pablo Librado,Naveed Khan,Antoine Fages,Mariya A Kusliy,Tomasz Suchanet al. Nature, 2021, 598 (7882), pp.634-640. ⟨10.1038/s41586-021-04018-9⟩ Article dans une revue hal-03425363v1
No particular genomic features underpin the dramatic economic consequences of 17th century plague epidemics in Italy Andaine Seguin-Orlando,Caroline Costedoat,Clio Der Sarkissian,Stéfan Tzortzis,Célia Kamelet al. iScience, 2021, 24 (4), pp.102383. ⟨10.1016/j.isci.2021.102383⟩ Article dans une revue hal-03356277v1
CASCADE: A Custom-Made Archiving System for the Conservation of Ancient DNA Experimental Data Dirk Dolle,Antoine Fages,Xavier Mata,Stéphanie Schiavinato,Laure Tonasso-Calvièreet al. Frontiers in Ecology and Evolution, 2020, 8, pp.185. ⟨10.3389/fevo.2020.00185⟩ Article dans une revue hal-02910989v1
Horse males became over-represented in archaeological assemblages during the Bronze Age Antoine Fages,Andaine Seguin-Orlando,Mietje Germonpré,Ludovic Orlando Journal of Archaeological Science: Reports, 2020, 31, pp.102364. ⟨10.1016/j.jasrep.2020.102364⟩ Article dans une revue hal-03030301v1
Tracking Five Millennia of Horse Management with Extensive Ancient Genome Time Series Antoine Fages,Kristian Hanghøj,Naveed Khan,Charleen Gaunitz,Andaine Seguin-Orlandoet al. Cell, 2019, 177 (6), pp.1419-1435.e31. ⟨10.1016/j.cell.2019.03.049⟩ Article dans une revue hal-02166928v1
High-Throughput DNA sequencing of ancient wood Stefanie Wagner,Frédéric Lagane,Andaine Seguin-Orlando,Mikkel Schubert,Thibault Leroyet al. Molecular Ecology, 2018, 27 (5), pp.1138-1154. ⟨10.1111/mec.14514⟩ Article dans une revue hal-01783724v1
Ancient genomes revisit the ancestry of domestic and Przewalski’s horses Charleen Gaunitz,Antoine Fages,Kristian Hanghøj,Anders Albrechtsen,Naveed Khanet al. Science, 2018, 360 (6384), pp.111-114. ⟨10.1126/science.aao3297⟩ Article dans une revue hal-02406833v1
The prehistoric peopling of Southeast Asia Hugh Mccoll,Fernando Racimo,Lasse Vinner,Fabrice Demeter,Takashi Gakuhariet al. Science, 2018, 361 (6397), pp.88-92. ⟨10.1126/science.aat3628⟩ Article dans une revue halshs-02185511v1
Improved de novo genomic assembly for the domestic donkey Gabriel Renaud,Bent Petersen,Andaine Seguin-Orlando,Mads Frost Bertelsen,Andrew Walleret al. Science Advances , 2018, 4 (4), pp.eaaq0392. ⟨10.1126/sciadv.aaq0392⟩ Article dans une revue hal-02170860v1
Ancient genomes show social and reproductive behavior of early Upper Paleolithic foragers Martin Sikora,Andaine Seguin-Orlando,Vitor C. Sousa,Anders Albrechtsen,Thorfinn Korneliussenet al. Science, 2017, 358 (6363), pp.659-662. ⟨10.1126/science.aao1807⟩ Article dans une revue hal-03207795v1
Less effective selection leads to larger genomes Tristan Lefébure,Claire Morvan,Florian Malard,Clémentine François,Lara Konecny-Dupréet al. Genome Research, 2017, 27, pp.1016-1028. ⟨10.1101/gr.212589.116⟩ Article dans une revue hal-01544879v2
Evaluating the impact of domestication and captivity on the horse gut microbiome Jessica L Metcalf,Se Jin Song,James T Morton,Sophie Weiss,Andaine Seguin-Orlandoet al. Scientific Reports, 2017, 7 (1), ⟨10.1038/s41598-017-15375-9⟩ Article dans une revue hal-04781445v1
Zonkey : a simple, accurate and sensitive pipeline to genetically identify equine F1-hybrids in archaeological assemblages Mikkel Schubert,Marjan Mashkour,Charleen Gaunitz,Antoine Fages,Andaine Seguin-Orlandoet al. Journal of Archaeological Science, 2017, 78, pp.147-157. ⟨10.1016/j.jas.2016.12.005⟩ Article dans une revue hal-04036146v1
Evolutionary Genomics and Conservation of the Endangered Przewalski’s Horse Clio Der Sarkissian,Luca Ermini,Mikkel Schubert,Melinda A Yang,Pablo Libradoet al. Current Biology, 2015, 25 (19), ⟨10.1016/j.cub.2015.08.032⟩ Article dans une revue hal-04781443v1
Mitochondrial genomes reveal the extinct Hippidion as an outgroup to all living equids Clio Der Sarkissian,Julia Vilstrup,Mikkel Schubert,Andaine Seguin-Orlando,David Emeet al. Biology Letters, 2015, 11 (20141058), pp.1-5. ⟨10.1098/rsbl.2014.1058⟩ Article dans une revue hal-01323150v1
Pros and cons of methylation-based enrichment methods for ancient DNA Andaine Seguin-Orlando,Cristina Gamba,Clio Der Sarkissian,Luca Ermini,Guillaume Louvelet al. Scientific Reports, 2015, 5 (1), ⟨10.1038/srep11826⟩ Article dans une revue hal-04781448v1
Tracking the origins of Yakutian horses and the genetic basis for their fast adaptation to subarctic environments Pablo Librado,Clio Der Sarkissian,Luca Ermini,Mikkel Schubert,Hákon Jónssonet al. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, ⟨10.1073/pnas.1513696112⟩ Article dans une revue hal-01256914v1
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans Maanasa Raghavan,Matthias Steinrücken,Kelley Harris,Stephan Schiffels,Simon Rasmussenet al. Science, 2015, 349 (6250), pp.aab3884-aab3884. ⟨10.1126/science.aab3884⟩ Article dans une revue hal-02112773v1

Communication dans un congrès (8)

Sexualités préhistoriques: les apports de l’ADN ancien Andaine Seguin-Orlando Sexualités : l’intimité entre normes et singularités, Université de Pau et des Pays de l’Adour, Apr 2024, Pau, France Communication dans un congrès hal-04785404v1
anthropYXX, a molecular proxy for gender contrasts at the Neolithic to Bronze Age transition Andaine Seguin-Orlando Beyond Genetics: Exploring Non-Biological Kinship in Prehistoric Times, Austrian Academy of Science, Oct 2024, Vienna, Austria Communication dans un congrès hal-04781542v1
La peste: Quels impacts sur les populations humaines ? Raphaëlle Coton,Laëtitia Bouniol,Emeline Verna,Andaine Seguin-Orlando,Caroline Costedoat 9èmes Journées des Doctorant.e.s, Laboratoire Population Environnement Développement, Nov 2022, Marseille, France Communication dans un congrès hal-04036394v1
Improving wet-laboratory procedures toward ancient epigenome characterization and ancient pathogens detection Andaine Seguin-Orlando,Pierre Clavel,Ludovic Orlando Journées de la Société d'anthropologie de Paris, Société d'anthropologie de Paris, Jan 2022, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-04781526v1
La Maladrerie Saint-Lazare de Beauvais (Oise, France): Etude anthropo-biologique d'un charnier de pestiférés du XVIIème siècle Raphaëlle Coton,Laëtitia Bouniol,Emeline Verna,Andaine Seguin-Orlando,Caroline Costedoat 29ème Congrès de l'ED Sciences de l'Environnement, May 2022, Marseille, France Communication dans un congrès hal-03894383v1
Hétérogénéité des ascendances mésolithiques et steppiques dans des génomes d’individus du Néolithique et du Campaniforme du territoire français Andaine Seguin-Orlando,Richard Donat,Clio Der Sarkissian,John Southon,Catherine Thèveset al. Journées de la Société d'Anthropologie de Paris, Jan 2021, Paris, France. https://journals.openedition.org/bmsap/7187 Communication dans un congrès hal-03677512v1
Approches archéogénomiques de sépultures collectives néolithiques en hypogée Andaine Seguin-Orlando,Clio Der Sarkissian,Richard Donat,Catherine Thèves,Eric Crubézyet al. Journées de la Société d'anthropologie de Paris 2020, Société d'anthropologie de Paris, Jan 2020, Aix-en-Provence, France Communication dans un congrès hal-04781474v1
Les apports de la paléogénomique à la caractérisation de l'impact de la colonisation russe sur les liens sociaux et biologiques en Yakutie Andaine Seguin-Orlando,Kristian Hanghøj,Clio Der Sarkissian,Sylvie Duchesnes,Patrice Gérardet al. Journées de la Société d'anthropologie de Paris 2019, Société d'anthropologie de Paris, Jan 2019, Paris, France Communication dans un congrès hal-04781156v1

Poster de conférence (3)

Archaeogenetic Insights into a Megalithic Burial Monument in Southern France Anna-Lena Titze,Bruno Bizot,Aurore Schmitt,Manon Armengaud,Klervia Jaouenet al. ISBA11 – International Symposium on Biomolecular Archaeology, Aug 2025, Turin (Italie), Italy Poster de conférence hal-05285348v1
La Maladrerie Saint-Lazare de Beauvais (Oise, France) : Étude anthropo-biologique d’un charnier de pestiférés du XVIIe siècle Raphaëlle Coton,Laëtitia Bouniol,Emeline Verna,Jean-Marc Fémolant,Michel Signoliet al. 1847èmes Journées de la Société d'Anthropologie de Paris, Jan 2022, Toulouse, France. 34 ((S)), 2021, ⟨10.4000/bmsap.8714⟩ Poster de conférence hal-03831391v1
No particular genomic features underpin the dramatic economic consequences of 17th century plague epidemics in Italy Andaine Seguin-Orlando,Caroline Costedoat,Clio Der Sarkissian,Stéfan Tzortzis,Célia Kamelet al. ISBA9, Jun 2021, Toulouse, France Poster de conférence hal-04781509v1

Pré-publication, Document de travail (1)

A late Neanderthal reveals genetic isolation in their populations before extinction Ludovic Slimak,Tharsika Vimala,Andaine Seguin-Orlando,Laure Metz,Clément Zanolliet al. 2023 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) halshs-04267849v1

Rapport (1)

Installations de la fin du Paléolithique moyen de la Grotte Mandrin, Malataverne, (Drôme). Fouille programmée triennale 2015-2017. Rapport de synthèse Ludovic Slimak,D. Belkacem,Fabienne Belles,Adelphine Bonneau,Jacques Élie Brochieret al. [Rapport de recherche] Service Régional de l’Archéologie Auvergne Rhône-Alpes. 2017, pp.800 Rapport (rapport de recherche) halshs-01817196v1