Anne Tireau

Publications

Communication dans un congrès (14)

Méthode d'adaptation d'une ontologie d'application : cas des expérimentations agronomiques Catherine Roussey,Anne Tireau,Pascal Neveu 36. Journées francophones d’Ingénierie des Connaissances (IC), AFIA- Association Française d’Intelligence Artificielle, Jul 2025, Dijon, France. pp.73-79 Communication dans un congrès hal-05142985v1
Usages d'AgroPortal dans des systèmes d'information à INRAE Clément Jonquet,Guillaume Alviset,Syphax Bouazzouni,Llorenç Cabrera-Bosquet,Arnaud Charleroyet al. 8. Atelier INtégration de sources/masses de données hétérogènes et Ontologies, dans le domaine des sciences du VIVant et de l’Environnement (IN-OVIVE), adossé à la conférence Ingénierie des Connaissances @PFIA, AFIA- Association Française d’Intelligence Artificielle, Jul 2025, Dijon, France. 5p Communication dans un congrès hal-05077024v1
Alignement et enrichissement d’ontologies utilisées par deux systèmes d’informations gérant des données expérimentales sur les procédés de transformation : OpenSILEX-EnviBIS et PO2 BaGaTel Emilie Fernandez,Magalie Weber,Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervauxet al. Atelier IN-OVIVE, organisé dans le cadre de la conférence Ingénierie des connaissances IC-2022, PFIA., Jun 2022, Saint Etienne, France Communication dans un congrès hal-03768264v1
PHIS et OpenSILEX : système d'information pour des données FAIR Isabelle Alic,Anne Tireau,Pascal Neveu,Valentin Rigolle,Gabriel Besombes Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Fabrice LEGEAI; Olivier DAMERON; Frédéric DE LAMOTTE, Jul 2022, Rennes, France Communication dans un congrès hal-05060889v1
Sixtine, PHIS des Systèmes d'Information pilotés par des ontologies Anne Tireau,Pascal Neveu Semantic Linked Data, INRAE CATIs CODEX-DIISCICO; INRAE réseau MathNum IN-OVIVE, Oct 2021, Sète, France Communication dans un congrès hal-05060943v1
Déploiement de la plateforme de traitement des données de phénotypage haut débit 4P sur l'infrastructure France Grilles Vincent Negre,Eric David,Marie Weiss,Philippe Burger,Romain Chapuiset al. Journées Calcul et Données (JCAD 2019), Oct 2019, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-03085756v1
Semantics and plant phenotyping data structuration for data analytics Pierre-Etienne Alary,Pascal Neveu,Anne Tireau,Nadine Hilgert,Llorenç Cabrera Bosquetet al. 7. International Food Legumes Research Conference (IFLRC VII), May 2018, Marrakech, Morocco Communication dans un congrès hal-02791501v1
Development of a knowledge system for Big Data: Case study to plant phenotyping data Luyen Le Ngoc,Anne Tireau,Aravind Venkatesan,Pascal Neveu,Pierre Larmande WIMS: Web Intelligence, Mining and Semantics, Mines Ales, Jun 2016, Nîmes, France. pp.1-9, ⟨10.1145/2912845.2912869⟩ Communication dans un congrès hal-01411565v1
Software for data and knowledge management in winemaking fermentations Pascal Neveu,Virginie Rossard,Anne Tireau,Evelyne E. Aguera,Marc M. Perezet al. KEOD 2012, Oct 2012, Barcelone, Spain Communication dans un congrès hal-02749951v1
Using ontologies for R functions management Olilvier Corby,Caroline Domerg,Juliette Fabre,Catherine Faron Zucker,Alexandre Granieret al. The R User Conference, UseR! 2010, Jul 2010, Gaithersburg, United States. 18 p Communication dans un congrès hal-02820851v1
Using annotations for R function management, MOQA : Méta-données et Ontologies pour la Qualité des Annotations Anne Tireau,Caroline Domerg,Olilvier Corby,Juliette Fabre,Catherine Faron Zuckeret al. JOBIM : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Sep 2010, Montpellier, France. 36 p Communication dans un congrès hal-02824208v1
Using ontologies of software : example of R functions management Emilie Gennari,Pascal Neveu,Caroline Domerg,Juliette Fabre,Vincent Negreet al. Third International Workshop on Resource Discovery, RED 2010, Nov 2010, Paris, France Communication dans un congrès hal-02754347v2
Développement d’un système d'information de phénotypage d’Arabidopsis thaliana Juliette Fabre,Anne Tireau,Pascal Neveu,Myriam Dauzat,Christine C. Granier 11. J2M INRA, journées de la métrologie et de la mesure, Oct 2008, Biarritz, France Communication dans un congrès hal-02821454v1
Développement d'un système d'information de phénotypage d'Arabidopsis thaliana Juliette Fabre,Anne Tireau,Pascal Neveu,Myriam Dauzat,Christine Granier J2M INRA, journées de la métrologie et de la mesure, Oct 2008, Biarritz, France Communication dans un congrès hal-00858086v1

Logiciel (12)

PHENOME-EMPHASIS shared resource center Isabelle Alic,Farzaneh Kazemipour-Ricci,François Tardieu,Pascal Neveu,Anne Tireauet al. 2025, ⟨swh:1:dir:c4ca30be04f2f6c370f7aefb49b423026ab6f29a;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-05054243;visit=swh:1:snp:3cd9c2f02f29ebac8a399a81832fd24a05ce4acb;anchor=swh:1:rel:1943d0e271dec66c0f4511844478aa235c473a72;path=/⟩ Logiciel hal-05054243v2
PHIS (Phenotyping Hybrid Information System) Neveu Pascal,Anne Tireau,Isabelle Alic,Arnaud Charleroy,Llorenç Cabrera-Bosquet 2024 Logiciel hal-04784056v1
Vitioeno resource center Arnaud Charleroy,X. Delpuech,Eric Duchêne,Anne Tireau,Pascal Neveu 2022, ⟨swh:1:dir:016df6b408f4bc7d05f803bd0834337139650ff3;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04986210;visit=swh:1:snp:bffc3bb5f36e78593ad11367178a0916281bf136;anchor=swh:1:rel:87d3adb5d7ed0a43e52d32a7805b221667190360;path=/⟩ Logiciel hal-04986210v2
OpenSILEX Anne Tireau,Pascal Neveu,Isabelle Alic,Arnaud Charleroy 2020, ⟨swh:1:dir:ed72e0386747aaf51a0358396832b973a2f446cf;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04784053;visit=swh:1:snp:6562a4c1d65901e3f719083476f98eb9d1646015;anchor=swh:1:rel:6481341553a6bcdcd9b766a6cb4f08d72f8dd789;path=/⟩ Logiciel hal-04784053v1
Benchmarcking Application main portal Luyen Le Ngoc,Anne Tireau,Aravind Venkatesen,Pascal Neveu,Pierre Larmande 2016 Logiciel hal-02795939v1
SILEX Anne Tireau,Pascal Neveu,Virginie Rossard,Vincent Negre,Jonathan Mineauet al. 2013 Logiciel hal-02811205v1
SILEX-VitiOeno Alexandre Mairin,Emilie Gennari,Mathias Chouet,Lydie Dufour,Pascal Neveuet al. 2013 Logiciel hal-02811265v1
SILEX-LBE Virginie Rossard,Eric Latrille,Laurent Lardon,Pascal Neveu,Anne Tireau 2012 Logiciel hal-02811190v1
SG4T Anne Tireau,Emilie Gennari,Pascal Neveu 2011 Logiciel hal-02810906v1
PHENODYNDB : le système d'information associé à la plateforme de phénotypage à haut débit PHENODYN Vincent Negre,Francois F. Tardieu,Claude Welcker,Anne Tireau,Philippe Naudinet al. 2011 Logiciel hal-02811439v1
DESIRR Pascal Neveu,Juliette Fabre,Caroline Domerg,Emilie Gennari,Vincent Negreet al. 2010 Logiciel hal-02819995v1
PHENOPSIS DB: an information system for Arabidopsis thaliana phenotypic data in an environmental context. Vincent Negre,Juliette Fabre,Christine C. Granier,Myriam Dauzat,Nathalie Wuytset al. 2010 Logiciel hal-02824587v1

Article dans une revue (6)

BrAPI v2: real-world applications for data integration and collaboration in the breeding and genetics community Peter Selby,Rafael Abbeloos,Anne-Francoise Adam-Blondon,Francisco J. Agosto-Pérez,Michael Alauxet al. Database - The journal of Biological Databases and Curation, In press, 2025, pp.baaf048. ⟨10.1093/database/baaf048⟩ Article dans une revue hal-05290990v1
Dealing with multi-source and multi-scale information in plant phenomics: the ontology-driven Phenotyping Hybrid Information System Pascal Neveu,Anne Tireau,Nadine Hilgert,Vincent Negre,Jonathan Mineau-Cesariet al. New Phytologist, 2019, 221 (1), pp.588-601. ⟨10.1111/nph.15385⟩ Article dans une revue hal-02627721v1
A generic ontological network for Agri-food experiment integration – Application to viticulture and winemaking Aunur Rofiq Muljarto,Jean-Michel Salmon,Brigitte Charnomordic,Patrice Buche,Anne Tireauet al. Computers and Electronics in Agriculture, 2017, 140, pp.433-442. ⟨10.1016/j.compag.2017.06.020⟩ Article dans une revue hal-01552148v1
PHENOPSIS DB: an Information System for Arabidopsis thaliana phenotypic data in an environmental context Juliette Fabre,Myriam Dauzat,Vincent Negre,Nathalie Wuyts,Anne Tireauet al. BMC Plant Biology, 2011, 11 (77), pp.1-7. ⟨10.1186/1471-2229-11-77⟩ Article dans une revue hal-01018993v1
Het gebruik van de verzamelde data: de smartphone Eating Advisor N.J.J.P. Koenderink,,Anne Tireau Agro Informatica, 2010, 3 (23), pp.16-20 Article dans une revue hal-02656686v1
Développement d’un système d'information de phénotypage d’Arabidopsis thaliana Juliette Fabre,Anne Tireau,Pascal Neveu,Myriam Dauzat,Christine Granier Cahier des Techniques de l'INRA, 2008, 65, pp.31-46 Article dans une revue hal-02662730v1

Cours (1)

OpenSILEX : Des systèmes d’information pour des données FAIR Isabelle Alic,Pascal Neveu,Anne Tireau,Arnaud Charleroy Doctorat. OpenSILEX : Des systèmes d’information pour des données FAIR, INRAE (Clermont-Ferrand / Aubière - Campus des Cézeaux), France. 2024, pp.44 Cours hal-05054181v1

Autre publication scientifique (2)

Enabling interoperability between AgroPortal and PHIS information system data repository for enhanced phenomics data annotation and exchange Anne Tireau,Arnaud Charleroy,Llorenç Cabrera-Bosquet,Clement Jonquet 2024, 2p. ⟨10.5281/zenodo.14192644⟩ Autre publication scientifique hal-04914922v1
ALFIs Anne Tireau,Pascal Neveu,Emilie Gennari,Virginie Rossard,Christian Picou 2013 Autre publication scientifique hal-01837676v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Identification of objects with Uniform Resource Identifier (URI): recommendations for application in plant phenotyping Jean-Eudes Hollebecq,Llorenç Cabrera Bosquet,Romain David,Marie-Claude Quidoz,Francois Tardieuet al. 2019 Pré-publication, Document de travail hal-02390920v1

Poster de conférence (7)

Déploiement de la plateforme de traitement des données phénotypage haut débit 4P sur l’infrastructure France Grilles. Vincent Nègre,Eric David,Philippe Burger,Romain Chapuis,Boris Adamet al. JRES (Journées réseaux de l'enseignement et de la recherche ) 2019, Dec 2019, Dijon, France. 2019 Poster de conférence hal-04807042v1
PHIS, a plant science ontology-driven Phenotyping Hybrid Information System Pascal Neveu,Anne Tireau,Nadine Hilgert,Vincent Negre,Jonathan Mineau-Cesariet al. NETTAB 2018: Building a FAIR Bioinformatics environment, Oct 2018, Genova, Italy. , 1 p., 2018 Poster de conférence hal-02788853v1
PHENOARCH, a multiscale phenotyping platform for plant architecture, growth rate, water use efficiency and radiation use efficiency Llorenç Cabrera Bosquet,Nicolas Brichet,Christian Fournier,Antonin Grau,Jonathan Mineauet al. Recent progress in drought tolerance from genetics to modelling, Jun 2015, Montpellier, France. 2015 Poster de conférence hal-01595406v1
PHENODYN: A high throughput platform for measurement of organ elongation rate and plant transpiration with high temporal resolution Stephane Berthezene,Nicolas Brichet,Vincent Negre,Boris Parent,Benoit Suardet al. EPPN Plant Phenotyping Symposium, Nov 2015, Barcelona, Spain. 2015 Poster de conférence hal-01229558v1
PHENOARCH, a multiscale phenotyping platform for plant architecture, growth rate, water use efficiency and radiation use efficiency Llorenç Cabrera Bosquet,Nicolas Brichet,Christian Fournier,Antonin Grau,Jonathan Mineauet al. EPPN Plant Phenotyping Symposium, Nov 2015, Barcelona, Spain. 2015 Poster de conférence hal-01229559v1
PHENODYN: a high throughput platform for measurement of organ elongation rate and plant transpiration with high temporal resolution Stephane Berthezene,Nicolas Brichet,Vincent Negre,Boris Parent,Benoit Suardet al. Recent progress in drought tolerance from genetics to modelling, Jun 2015, Montpellier, France. 2015 Poster de conférence hal-01270223v1
Phenodyn: a phenotyping plateform and an information system to dissect the genetic variability for growth and transpiration rates in response to water deficit Claude Welcker,Benoit Boussuge,Anne Tireau,Philippe Naudin,Pascal Neveuet al. The Genomics of Drought, Oct 2007, Adelaïde, Australia. 2007 Poster de conférence hal-02757651v1

Rapport (2)

CAFE Deliverable 2.2 Pascal Neveu,Alexandre Granier,Nicole Koenderink,Eric Latrille,Bruno Perretet al. [Research Report] auto-saisine. 2010 Rapport (rapport de recherche) hal-01195450v1
CAFE Deliverable 2.1 Pascal Neveu,Alexandre Granier,John Charron,Anne Tireau,Nicole Koenderinket al. [Research Report] Lirmm. 2009 Rapport (rapport de recherche) hal-00858567v1