Anouk ZANCARINI

Identifiants chercheurs

IdHAL :

anouk-zancarini

ORCID :

0000-0002-8209-5255

Publications

Article dans une revue (13)

Carbon substrates utilization determine antagonistic fungal-fungal interactions among root-associated fungi Rosa Kemmerling,Louise-Elisabeth Dintilhac,Anouk Zancarini,Alice Mataigne,Christophe Mougelet al. Frontiers in Microbiology, 2025, 16, pp.1645107. ⟨10.3389/fmicb.2025.1645107⟩ Article dans une revue hal-05227488v1
Medicago truncatula genotype drives the plant nutritional strategy and its associated rhizosphere bacterial communities Anouk Zancarini,Christine Le Signor,Sébastien Terrat,Julie Aubert,Christophe Salonet al. New Phytologist, 2025, 245 (2), pp.767-784. ⟨10.1111/nph.20272⟩ Article dans une revue hal-04835437v1
A strategy for differential abundance analysis of sparse microbiome data with group-wise structured zeros Fentaw Abegaz,Davar Abedini,Fred White,Alessandra Guerrieri,Anouk Zancariniet al. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.12433. ⟨10.1038/s41598-024-62437-w⟩ Article dans une revue hal-04615173v1
Effect of strigolactones on recruitment of the rice root-associated microbiome Bora Kim,Johan Westerhuis,Age K. Smilde,Kristýna Floková,Afnan K. A. Suleimanet al. FEMS Microbiology Ecology, 2022, 98 (2), pp.fiac010. ⟨10.1093/femsec/fiac010⟩ Article dans une revue hal-03963464v1
Integration of omics data to unravel root microbiome recruitment Anouk Zancarini,Johan Westerhuis,Age Smilde,Harro Bouwmeester Current Opinion in Biotechnology, 2021, 70, pp.255-261. ⟨10.1016/j.copbio.2021.06.016⟩ Article dans une revue hal-03965707v1
Fast computation of genome-metagenome interaction effects Florent Guinot,Marie Szafranski,Julien Chiquet,Anouk Zancarini,Christine Le Signoret al. Algorithms for Molecular Biology, 2020, 15 (1), art.13 (21p.). ⟨10.1186/s13015-020-00173-2⟩ Article dans une revue hal-01906069v3
Multiple processes acting from local to large geographical scales shape bacterial communities associated with Phormidium (cyanobacteria) biofilms in French and New Zealand rivers Isidora Echenique-Subiabre,Anouk Zancarini,Mark W Heath,Susanna A Wood,Catherine Quiblieret al. Scientific Reports, 2018, 8, pp.14416. ⟨10.1038/s41598-018-32772-w⟩ Article dans une revue hal-01883819v1
Deciphering biodiversity and interactions between bacteria and microeukaryotes within epilithic biofilms from the Loue River, France Anouk Zancarini,Isidora Echenique-Subiabre,Didier Debroas,Najwa Taïb,Catherine Quiblieret al. Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.4344. ⟨10.1038/s41598-017-04016-w⟩ Article dans une revue hal-01599307v2
Bacterial communities associated with four cyanobacterial genera display structural and functional differences: evidence from an experimental approach Lin Zhu,Anouk Zancarini,Imen Louati,Silvia de Cesare,Charlotte Duvalet al. Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1-11. ⟨10.3389/fmicb.2016.01662⟩ Article dans une revue hal-01602443v1
Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to study the relationship between Medicago truncatula genotypes and their associated rhizosphere bacterial communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Sébastien Terrat,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain Plant and Soil, 2013, 365 (1-2), pp.183 - 199. ⟨10.1007/s11104-012-1364-7⟩ Article dans une revue istex hal-02646573v1
Soil Nitrogen Availability and Plant Genotype Modify the Nutrition Strategies of M. truncatula and the Associated Rhizosphere Microbial Communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Anne-Sophie Voisin,Marion Prudent,Christophe Salonet al. PLoS ONE, 2012, 7 (10), ⟨10.1371/journal.pone.0047096⟩ Article dans une revue hal-02646215v1
The auxin-signaling pathway is required for the lateral root response of Arabidopsis to the rhizobacterium Phyllobacterium brassicacearum Céline Contesto,Sandrine Milesi,Sophie Mantelin,Anouk Zancarini,Guilhem Desbrosseset al. Planta, 2010, 232 (6), pp.1455-1470. ⟨10.1007/s00425-010-1264-0⟩ Article dans une revue istex hal-01203931v1
Aphid transmission of Cauliflower mosaic virus: the role of the host plant Alexandre Martiniere,Anouk Zancarini,Martin Drucker Plant Signaling and Behavior, 2009, 4 (6), pp.548-550. ⟨10.4161/psb.4.6.8712⟩ Article dans une revue hal-00986097v1

Communication dans un congrès (8)

Comparative analysis of root exudates and bacterial diversity in aeroponics and soil Bora Kim,Marco Bentlage,Benjamin Thiombiano,Harro Bouwmeester,Anouk Zancarini Rhizosphere 5, Jul 2019, Saskatoon, Canada Communication dans un congrès hal-04081034v1
The effects of strigolactones on the microbiome of rice Bora Kim,Anouk Zancarini,Harro Bouwmeester Rhizosphere 5, Jul 2019, Saskatoon, Canada Communication dans un congrès hal-04081042v1
Plant genotype: a lever in the interactions between plant and its associated rhizosphere microbiome Anouk Zancarini,Christine Le Signor,Julie J. Aubert,Sébastien Terrat,Joëlle Ronfortet al. 2nd Plant Microbiome Symposium, Feb 2018, Amsterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-04081016v1
Biofilms à cyanobactéries dans les rivières : une diversité et une écologie encore méconnues Isidora Echenique-Subiabre,Anouk Zancarini,Didier Debroas,Catherine Quiblier,Jean-François Humbert Réseau National des Biofilms, Nov 2013, Pau, France Communication dans un congrès hal-04080867v1
Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to assess interaction between genotypes of Medicago truncatula and the soil bacterial communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain Rhizosphere 3 International Conference, Sep 2011, Perth, Australia Communication dans un congrès hal-02744462v1
Crosstalks between soil microbial communities and a nitrogen fixing legume species (medicago truncatula) during its Vegetative Stage Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain 5. International Food Legumes Research Conference (IFLRC V) and 7. European Conference on Grain Legumes (AEPVII) ; Legumes for Global Health Legume Crops and Products for Food, Feed and Environmental Benefits, Apr 2010, Antalya, Turkey Communication dans un congrès hal-02753416v1
Etude de l’interaction « Plante x Communauté microbienne du sol » chez l’espèce modèle &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain 16eme Forum des Jeunes Chercheurs, Jun 2010, Besançon, France. 16 p Communication dans un congrès hal-02822520v1
Tubulin and transmission of Cauliflower mosaic virus Alexandre Martinière,Anouk Zancarini,Daniel Gargani,Marilyne Uzest-Bonhomme,Nicole Lautredouet al. Congrès RESISTVIR, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR UMR INRA / ENSAM / CIRAD : Biologie et Génétique des Interactions Plantes / Parasite pour la Protection Intégrée (0385)., Nov 2008, Cadiz, Spain. pp.inc Communication dans un congrès hal-02817848v1

Poster de conférence (5)

A new conceptual framework shows that plant genotype and soil nitrogen availability modify both plant nutritional strategies and diversity of their associated rhizosphere microbiome Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Anne-Sophie Voisin,Marion Prudent,Christophe Salonet al. Rhizosphere 4, Jun 2015, Maastricht, Netherlands Poster de conférence hal-04080970v1
Spatial and temporal variation of microbial diversity in river biofilms Anouk Zancarini,Isidora Echenique-Subiabre,Didier Debroas,Catherine Quiblier,Jean-François Humbert ISME15, Aug 2014, Seoul, South Korea Poster de conférence hal-04080951v1
Une diversité encore méconnue au sein des biofilms à Cyanobactéries benthiques dans les rivières Anouk Zancarini,Isidora Echenique-Subiabre,Didier Debroas,Catherine Quiblier,Jean-François Humbert Génomique Environnementale, Nov 2013, Rennes, France Poster de conférence hal-04080932v1
Une diversité encore méconnue au sein des biofilms à Cyanobactéries benthiques dans les rivières Anouk Zancarini,Isidora Echenique-Subiabre,Didier Debroas,Catherine Quiblier,Jean-François Humbert Réseau National des Biofilms, Nov 2013, Pau, France Poster de conférence hal-04080839v1
Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to assess interaction between genotypes of &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; and the soil bacterial communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain 17eme Forum des Jeunes Chercheurs "Jeunes chercheurs, explorons la bulle professionnelle", Jun 2011, Dijon, France. 155 p., 2011 Poster de conférence hal-02749671v1

Chapitre d'ouvrage (1)

Combining molecular microbial ecology with ecophysiology and plant genetics for a better understanding of plant-microbial communities' interactions in the rhizosphere. Anouk Zancarini,Clémentine Lepinay,Judith Burstin,Gérard Duc,Philippe P. Lemanceauet al. F.J. de Bruijn. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere, 1, Wiley-Blackwell, pp.69-86, 2013, 978-1-118-29617-2. ⟨10.1002/9781118297674.ch7⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01119954v1

Pré-publication, Document de travail (3)

Unlocking research on rhizodeposition: a step-by-step guide for producing, sampling and analyzing Frédéric Rees,Virginie Lauvergeat,Gabin Piton,Aude Tixier,Sylvain Chéreauet al. 2026 Pré-publication, Document de travail hal-05530854v1
Quantitative trait locus mapping of root exudate metabolome in a Solanum lycopersicum Moneymaker x S. pimpinellifolium RIL population and their putative links to rhizosphere microbiome Bora Kim,Gertjan Kramer,Márcio Fernandes Alves Leite,Basten Snoek,Anouk Zancariniet al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-05426400v1
A Strategy for Differential Abundance Analysis of Sparse Microbiome Data with Group-wise Structured Zeros Fentaw Abegaz,Davar Abedini,Fred White,Alessandra Guerrieri,Anouk Zancariniet al. 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04276508v1

Thèse (1)

Etude de l’interaction plante-communautés microbiennes de la rhizosphère chez l’espèce modèle &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; par une approche multidisciplinaire : contribution à la réflexion sur le pilotage des interactions par la plante Anouk Zancarini Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Bourgogne, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-02807895v1

Cours (1)

Microbiome data analysis - Lecture Anouk Zancarini Master. Tools in molecular data analysis - module Microbiome, Netherlands. 2021 Cours hal-04286457v1