Anthony Boureux

Publications

Article dans une revue (21)

Why and how to set up a Bioinformatics Learning Lab (BILL) Anna-Sophie Fiston-Lavier,Emira Cherif,Marie-Ka Tilak,Arnaud Soulier,Catherine Bretonet al. PLoS Computational Biology, 2025, 21 (8), pp.e1013236. ⟨10.1371/journal.pcbi.1013236⟩ Article dans une revue hal-05279437v1
Acute myeloid leukemia risk stratification in younger and older patients through transcriptomic machine learning models Raíssa Silva,Cédric Riedel,Maïlis Amico,Jerome Reboul,Benoit Guibertet al. Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.39821. ⟨10.1038/s41598-025-23468-z⟩ Article dans une revue hal-05551437v1
Kmerator Suite: design of specific k -mer signatures and automatic metadata discovery in large RNA-seq datasets Sébastien Riquier,Chloé Bessiere,Benoit Guibert,Anne-Laure Bouge,Anthony Boureuxet al. NAR Genomics and Bioinformatics, 2021, 3 (3), pp.lqab058. ⟨10.1093/nargab/lqab058⟩ Article dans une revue hal-04147535v1
Long non-coding RNA exploration for mesenchymal stem cell characterisation Sébastien Riquier,Marc Mathieu,Chloé Bessiere,Anthony Boureux,Florence Ruffléet al. BMC Genomics, 2021, 22 (1), pp.412. ⟨10.1186/s12864-020-07289-0⟩ Article dans une revue inserm-03251471v1
Recurrent Genetic Abnormalities in Human Pluripotent Stem Cells: Definition and Routine Detection in Culture Supernatant by Targeted Droplet Digital PCR Said Assou,Nicolas Girault,Mathilde Plinet,Julien Bouckenheimer,Caroline Sansacet al. Stem Cell Reports, 2020, 14 (1), pp.1-8. ⟨10.1016/j.stemcr.2019.12.004⟩ Article dans une revue hal-03396129v1
New chimeric RNAs in acute myeloid leukemia Florence Ruffle,Jérôme Audoux,Anthony Boureux,Sacha Beaumeunier,Jean-Baptiste Gaillardet al. F1000Research, 2017, 6, ⟨10.12688/f1000research.11352.2⟩ Article dans une revue hal-01840091v1
Long non-coding RNAs in human early embryonic development and their potential in ART Julien Bouckenheimer,Said Assou,Sébastien Riquier,Cyrielle Hou,Nicolas Philippeet al. Human Reproduction Update, 2016, 23 (1), pp.19 - 40. ⟨10.1093/humupd/dmw035⟩ Article dans une revue hal-01819458v1
On the evaluation of the fidelity of supervised classifiers in the prediction of chimeric RNAs Sacha Beaumeunier,Jérôme Audoux,Anthony Boureux,Florence Ruffle,Thérèse Commeset al. BioData Mining, 2016, 9 (1), pp.34. ⟨10.1186/s13040-016-0112-6⟩ Article dans une revue inserm-01390470v1
Combining DGE and RNA-sequencing data to identify new polyA+ non-coding transcripts in the human genome Nicolas Philippe,Elias Bou Samra,Anthony Boureux,Alban Mancheron,Florence Ruffléet al. Nucleic Acids Research, 2014, 42 (5), pp.2820-2832. ⟨10.1093/nar/gkt1300⟩ Article dans une revue lirmm-01233107v1
New prognostic markers, determined using gene expression analyses, reveal two distinct subtypes of chronic myelomonocytic leukaemia patients. Elias Bou Samra,Jérôme Moreaux,Fabienne Vacheret,Ken Mills,Florence Ruffléet al. British Journal of Haematology, 2012, 157 (3), pp.347-56. ⟨10.1111/j.1365-2141.2012.09069.x⟩ Article dans une revue inserm-00681007v1
Digital gene expression data, cross-species conservation and noncoding RNA Nicolas Philippe,Florence Ruffle,Elias Bou Samra,Anthony Boureux,Thérèse Commeset al. EMBnet.journal, 2011, 17 (Supplement B), pp.1. ⟨10.14806/ej.17.B.288⟩ Article dans une revue lirmm-00757989v1
Maternal mRNA deadenylation and decay by thepiRNA pathway in the early Drosophila embryo R. Rouget,C. Papin,A. Boureux,Ac Meunier,B. Francoet al. Nature, 2010, 467 (7319), pp.1128-1132. ⟨10.1038/nature09465⟩ Article dans une revue hal-00533320v1
Using reads to annotate the genome: influence of length, background distribution, and sequence errors on prediction capacity Nicolas Philippe,Anthony Boureux,Laurent Brehelin,Jorma Tarhio,Thérèse Commeset al. Nucleic Acids Research, 2009, 37 (15 e104), pp.11. ⟨10.1093/nar/gkp492⟩ Article dans une revue lirmm-00415899v1
Estimation of sequence errors and capacity of genomic annotation in transcriptomic and DNA-protein interaction assays based on next generation sequencers Nicolas Philippe,Anthony Boureux,Laurent Brehelin,Jorma Tarhio,Thérèse Commeset al. Cellular Oncology, 2009, 31 (2), pp.145-146 Article dans une revue lirmm-00416012v1
The Src-like adaptor protein regulates PDGF-induced actin dorsal ruffles in a c-Cbl-dependent manner. Audrey Sirvent,C. Leroy,A. Boureux,V. Simon,Serge Roche Oncogene, 2008, 27 (24), pp.3494-500. ⟨10.1038/sj.onc.1211011⟩ Article dans une revue hal-00211547v1
The tyrosine kinase Abl is required for Src-transforming activity in mouse fibroblasts and human breast cancer cells. Audrey Sirvent,A. Boureux,V. Simon,C. Leroy,Serge Roche Oncogene, 2007, 26 (52), pp.7313-7323. ⟨10.1038/sj.onc.1210543⟩ Article dans une revue hal-00189107v1
Evolution of the Rho Family of Ras-Like GTPases in Eukaryotes Anthony Boureux,Emmanuel Vignal,Sandrine Faure,Philippe Fort Molecular Biology and Evolution, 2007, 24 (1), pp.203-216. ⟨10.1093/molbev/msl145⟩ Article dans une revue hal-02267395v2
Variability and Expression of Ankyrin Domain Genes in Wolbachia Variants Infecting the Mosquito Culex pipiens Olivier Duron,Anthony Boureux,Pierre Echaubard,Arnaud Berthomieu,Claire Berticatet al. Journal of Bacteriology, 2007, 189 (12), pp.4442-4448. ⟨10.1128/JB.00142-07⟩ Article dans une revue halsde-00424353v1
Transcriptome Annotation using Tandem SAGE Tags Eric Rivals,Anthony Boureux,Mireille Lejeune,Florence Ottones,Oscar Pecharromàn Pérezet al. Nucleic Acids Research, 2007, 35 (17), pp.e108. ⟨10.1093/nar/gkm495⟩ Article dans une revue lirmm-00193291v1
Transforming properties of chimeric TEL-JAK proteins in Ba/F3 cells. V Lacronique,A. Boureux,R Monni,S Dumon,M Mauchaufféet al. Blood, 2000, 95 (6), pp.2076-2083. ⟨10.1182/blood.V95.6.2076⟩ Article dans une revue hal-02427379v1
A domain of TEL conserved in a subset of ETS proteins defines a specific oligomerization interface essential to the mitogenic properties of the TEL-PDGFR-beta oncoprotein Christina Jousset,C. Carron,A. Boureux,C. Tran Quang,Celine Ouryet al. EMBO Journal, 1997, 16 (1), pp.69-82. ⟨10.1093/emboj/16.1.69⟩ Article dans une revue hal-02698586v1

Communication dans un congrès (6)

TranSipedia.org : Une plateforme web pour l'analyse à grande échelle de données de séquençage haut débit du Transcriptome Humain Therese Commes-Maerten,Chloé Bessiere,Benoit Guibert,Florence Rufflé,Camelia Sennaouiet al. CNRIUT 2025 Bayonne - Pays Basque, IUT de Bayonne Pays Basque, Mar 2025, Bayonne, France Communication dans un congrès hal-05093390v1
Identification of LINE-1 specific transcripts using k-mers Nicolas Gilbert,Anthony Boureux,Thérèse Commes 24ème Congrès National sur le Elements Transposables - CNET 2023, GDR 3546, Jul 2023, Perpignan, France Communication dans un congrès hal-04941348v1
Estimation of Sequence Errors and Prediction Capacity in Transcriptomic and DNA-Protein Interaction Assays Nicolas Philippe,Anthony Boureux,Laurent Brehelin,Jorma Tarhio,Thérèse Commeset al. SMPGD'09: Statistical Methods for Post-genomic Data Workshop, Jan 2009, Paris, France. pp.3 Communication dans un congrès lirmm-00375005v1
Combining SAGE Tags to Predict Genomic Transcribed Regions Eric Rivals,Anthony Boureux,Mireille Lejeune,Florence Ottones,Oscar Pecharromàn Pérezet al. JOBIM 2008 - 9es Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2008, Lille, France. pp.141-146 Communication dans un congrès lirmm-00343895v1
Transcriptome annotation using tandem SAGE tags Eric Rivals,Anthony Boureux,Mireille Lejeune,Florence Ottones,Oscar Pecharromàn Pérezet al. Réunion satellite "Transcriptome et bioinformatique", Jul 2007, Marseille, France. pp.8 Communication dans un congrès lirmm-00203923v1
Human Transcriptome Annotation using Tandem SAGE Tags Eric Rivals,Anthony Boureux,Mireille Lejeune,Florence Ottones,Oscar Pecharromàn Pérezet al. Integrative Post-Genomics, Nov 2006, Lyon, France. pp.39 Communication dans un congrès lirmm-00120164v1

Poster de conférence (2)

Analyse comparative de l'expression des éléments transposables L1HS par le biais des kmers Camelia Sennaoui,Anthony Boureux,Nicolas Gilbert 24ème Congrès National sur le Elements Transposables - CNET 2023, Jul 2023, Perpignan, France Poster de conférence hal-04941380v1
Annotation of Human Transcriptome Using Tandem SAGE Tags Eric Rivals,Anthony Boureux,Mireille Lejeune,Florence Ottones,Oscar Pecharromàn Pérezet al. Canceropôle Rhones-Alpes Côte d'Azur. 14th CHO Meeting "Stem Cells & Cancer", Oct 2007, Presqu'île de Giens, France. , 2007 Poster de conférence lirmm-00203895v1