Arnaud Mounier Informaticien en Humanités Numériques

Identifiants chercheurs

IdHAL :

arnaud-mounier

ORCID :

0000-0002-4595-0857

Présentation

Informaticien de formation, j'ai pris mes fonctions à ARTEHIS le lundi 13 janvier 2025. À l'origine développeur logiciel dans un laboratoire de biologie, j'ai réorienté mes activités vers le métier d'administrateur des systèmes d'information début 2023. Dans le cadre de mes précédentes fonctions, j'ai écrit des « workflows » informatiques, pensés en terme comme de la programmation littéraire, à l'aide de carnet Jupyter (langage Python) et Quarto (langage R). J'ai aussi développé une approche centrée sur la visualisation interactive toujours à l'aide de carnet Jupyter et de l'interface Shiny.Pour le traitement de données à grande échelle, j'ai acquis une maîtrise de l'outil Pandas (Python) et de l'écosystème en programmation fonctionnelle « Tidyverse » (R). J'ai aussi administré un serveur de calcul. Ces expériences ont été réinvesties ensuite à la MSH de Dijon, où j'ai réorganisé le pôle informatique et je me suis formé à l'administration d'un système d'information du point de vue de la gestion de parc, de la sécurité et de la maintenance de serveurs notamment de serveur de bases de données en géomatique.

Publications

Article dans une revue (15)

Size exclusion experiment in a grassland field unravels top-down control of the soil fauna on microbial community assembly Mathilde Jeanbille,Sana Romdhane,Marie-Christine Breuil,David Bru,Stefan Geisenet al. Ecology Letters, 2024, 27 (6), pp.e14442. ⟨10.1111/ele.14442⟩ Article dans une revue hal-04674236v1
Idiosyncratic invasion trajectories of human bacterial pathogens facing temperature disturbances in soil microbial communities Eliette Ascensio,Elodie Barbier,Arnaud Mounier,Tiffany Raynaud,Aymé Sporet al. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.12375. ⟨10.1038/s41598-024-63284-5⟩ Article dans une revue hal-04639981v1
Evidence that a common arbuscular mycorrhizal network alleviates phosphate shortage in interconnected walnut sapling and maize plants Emma Mortier,Arnaud Mounier,Jonathan Kreplak,Fabrice Martin-Laurent,Ghislaine G. Recorbetet al. Frontiers in Plant Science, 2023, 14, pp.art. 1206047. ⟨10.3389/fpls.2023.1206047⟩ Article dans une revue hal-04198972v1
Experimental community coalescence sheds light on microbial interactions in soil and restores impaired functions Sarah Huet,Sana Romdhane,Marie-Christine Breuil,David Bru,Arnaud Mounieret al. Microbiome, 2023, 11, pp.art. 42. ⟨10.1186/s40168-023-01480-7⟩ Article dans une revue hal-04019313v1
Impact of repeated irrigation of lettuce cultures with municipal wastewater on the diversity and composition of root-associated arbuscular mycorrhizal fungi Sara Gallego,Yvonne Bigott,Arnaud Mounier,Aymé Spor,Peter Schröderet al. Biology and Fertility of Soils, 2022, 58 (5), pp.607-611. ⟨10.1007/s00374-022-01641-0⟩ Article dans une revue hal-03843285v1
A core microbiota of the plant-earthworm interaction conserved across soils Samuel Jacquiod,Ruben Puga-Freitas,Aymé Spor,Arnaud Mounier,Cécile Monardet al. Soil Biology and Biochemistry, 2020, 144, pp.107754. ⟨10.1016/j.soilbio.2020.107754⟩ Article dans une revue hal-02535174v1
Toward the understanding of the role of CDC48, a major component of the protein quality control, in plant immunity Hervé Begue,Arnaud Mounier,Claire Rosnoblet,David Wendehenne Plant Science, 2019, 279, pp.34-44. ⟨10.1016/j.plantsci.2018.10.029⟩ Article dans une revue hal-02626427v1
The evolution of nitric oxide signalling diverges between the animal and the green lineages Jérémy Astier,Arnaud Mounier,Jerome Santolini,Sylvain Jeandroz,David Wendehenne Journal of Experimental Botany, 2019, ⟨10.1093/jxb/erz088⟩ Article dans une revue hal-02065043v1
The genus &lt;em&gt;Rhizophagus&lt;/em&gt; dominates arbuscular mycorrhizal fungi communities in contrasted cassava field soils in Côte d’Ivoire Drolet Jean-Marc Sery,Diederik van Tuinen,Alice Drain,Arnaud Mounier,Adolphe Zézé Rhizosphere, 2018, 7, pp.8-17. ⟨10.1016/j.rhisph.2018.06.007⟩ Article dans une revue hal-02628307v1
The plasma membrane proteome of &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; roots as modified by arbuscular mycorrhizal symbiosis Achref A. Aloui,Ghislaine Recorbet,Christelle Lemaitre-Guillier,Arnaud Mounier,Thierry Balliauet al. Mycorrhiza, 2018, 28 (1), pp.1-16. ⟨10.1007/s00572-017-0789-5⟩ Article dans une revue hal-02626498v1
Changes in plastid proteome and structure in arbuscular mycorrhizal roots display a nutrient starvation signature Zeina Daher,Ghislaine Recorbet,Katalin Solymosi,Stefanie Wienkoop,Arnaud Mounieret al. Physiologia Plantarum, 2017, 159 (1), pp.13-29. ⟨10.1111/ppl.12505⟩ Article dans une revue hal-01606574v1
Draft genome sequence of [i]Pseudomonas[/i] sp. strain ADP, a bacterial model for studying the degradation of the herbicide atrazine Marion Devers,Aymé Spor,Arnaud Mounier,Fabrice Martin-Laurent Genome Announcements, 2016, 4 (1), 2p. ⟨10.1128/genomeA.01733-15⟩ Article dans une revue hal-01297022v1
Fusarium diversity in soil using a specific molecular approach and a cultural approach Véronique Edel-Hermann,Nadine Gautheron,Arnaud Mounier,Christian Steinberg Journal of Microbiological Methods, 2015, 111, pp.64 - 71. ⟨10.1016/j.mimet.2015.01.026⟩ Article dans une revue hal-02631755v1
Direct purification of detergent-insoluble membranes from &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; root microsomes : comparison between floatation and sedimentation Christelle Guillier,Jean-Luc Cacas,Ghislaine Recorbet,Nicolas Depretre,Arnaud Mounieret al. BMC Plant Biology, 2014, 14, ⟨10.1186/s12870-014-0255-x⟩ Article dans une revue hal-02633982v1
The membrane proteome of &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; roots displays qualitative and quantitative changes in response to arbuscular mycorrhizal symbiosis Cosette C. Abdallah,Benoît Valot,Christelle Guillier,Arnaud Mounier,Thierry Balliauet al. Journal of Proteomics, 2014, 108, pp.354-368. ⟨10.1016/j.jprot.2014.05.028⟩ Article dans une revue hal-02633346v1

Communication dans un congrès (5)

Selection for species interaction patterns revealed by experimental evolution of rhizosphere microbiota Milena Gonzalo,Samuel Jacquiod,Arnaud Mounier,Manuel Blouin Société Française d’Ecologie et d’Evolution. SFE2 2024, Oct 2024, Lyon/Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-04991148v1
Field exclusion experiment unravel the role of soil fauna in microbial community assembly Mathilde Jeanbille,Sana Romdhane,Marie-Christine Breuil,David Bru,Stefan Geisenet al. Talk, 3rd Global Soil Biodiversity Conference (GSB), Mar 2023, Dublin, Ireland Communication dans un congrès hal-04896556v1
Experimental community coalescence sheds light on microbial interactions in soil and restores impaired functions Sarah Huet,Sana Romdhane,Marie-Christine Breuil,David Bru,Arnaud Mounieret al. Forum des Jeunes Chercheurs Université de Bourgogne, Jun 2022, Dijon, France Communication dans un congrès hal-03714331v1
Nitric oxide production and signalling in algae Jérémy Astier,Arnaud Mounier,Jordan Rossi,Pauline Chatelain,Agnès Klingueret al. 8th Plant Nitric Oxide International Meeting, Jul 2021, Virtuel, France Communication dans un congrès hal-03534506v1
Production et signalisation dépendante du monoxyde d'azote dans la lignée verte la surprise des microalgues Jérémy Astier,Arnaud Mounier,Jerome Santolini,Sylvain Jeandroz,David Wendehenne 4ème e-meeting du Groupe de Recherche NOX-ROS GDR 2039, Dec 2020, Virtuel, France Communication dans un congrès hal-03534549v1

Poster de conférence (5)

A field exclusion experiment to assess the role of the soil fauna in microbial community assembly Mathilde Jeanbille,Sana Romdhane,Marie-Christine Breuil,David Bru,Stefan Geisenet al. 18th International Symposium on Microbial Ecology, Aug 2022, Lausanne, Switzerland. , 2022 Poster de conférence hal-04904265v1
Identification of putative interactors of arabidopsis sugar transporters Sportes Antoine,Raphaël Boussageon,Pierre-Antoine Noceto,Carole Pfister,Arnaud Mounieret al. Workshop Sugar allocation in plant, Oct 2021, Versailles, France Poster de conférence hal-03610422v1
Identification of putative interactors of arabidopsis sugar transporters Sportes Antoine,Raphael Boussageon,Pierre-Antoine Noceto,Carole Pfister,Arnaud Mounieret al. Workshop Sugar allocation in plant, Oct 2021, Versailles, France Poster de conférence hal-03671273v1
The evolution of nitric oxide signalling diverges between the animal and the green lineages Jérémy Astier,Arnaud Mounier,Jérôme Santolini,Sylvain Jeandroz,David Wendehenne EMBO symposium 2019 : Sensing and signalling in plant stress response, Apr 2019, New Delhi, India Poster de conférence hal-03470698v1
Evidence of a core microbiota shaped by plant and earthworm interactions across soils Samuel Jacquiod,Ruben Puga Freitas,Aymé Spor,Arnaud Mounier,Cécile Monardet al. 17. International Society of Microbial Ecology (ISME17), Aug 2018, Leipzig, Germany. , 2018 Poster de conférence hal-02785624v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Evidence that common arbuscular mycorrhizal network alleviates phosphate shortage in interconnected walnut sapling and maize plants Emma Mortier,Arnaud Mounier,Jonathan Kreplak,Fabrice Martin-Laurent,Ghislaine Recorbetet al. 2023 Pré-publication, Document de travail hal-05069989v1