Aurélie Allais-Bonnet

Publications

Article dans une revue (21)

Genetic regulation of sperm DNA methylation in cattle through meQTL mapping Corentin Fouéré,Valentin Costes,Chris Hozé,Amrita Raja Ravi Shankar,Florian Besnardet al. BMC Genomics, 2025, 26 (1), pp.771. ⟨10.1186/s12864-025-11934-x⟩ Article dans une revue hal-05220883v1
CRISPR-Cas9 gene-editing to assess the role of RF-amide−related peptide 3 in ovine seasonal breeding Christophe Richard,Aurélie Allais-Bonnet,Marjolaine André,Valerie Gelin,Marie-Christine Delocheet al. Animal, 2025, 19 (5), pp.101508. ⟨10.1016/j.animal.2025.101508⟩ Article dans une revue hal-05058912v1
CRISPR/Cas9-editing of PRNP in Alpine goats Aurélie Allais-Bonnet,Christophe Richard,Marjolaine André,Valerie Gelin,Marie-Christine Delocheet al. Veterinary Research, 2025, 56, ⟨10.1186/s13567-024-01444-1⟩ Article dans une revue hal-04885356v1
Multi-omics data integration for the identification of biomarkers for bull fertility Valentin Costes,Eli Sellem,Sylvain Marthey,Chris Hoze,Aurélie Allais-Bonnetet al. PLoS ONE, 2024, 19, ⟨10.1371/journal.pone.0298623⟩ Article dans une revue hal-04489600v1
Massive detection of cryptic recessive genetic defects in dairy cattle mining millions of life histories Florian Besnard,Ana Guintard,Cécile Grohs,Laurence Guzylack-Piriou,Margarita Canoet al. Genome Biology, 2024, 25 (1), pp.248. ⟨10.1186/s13059-024-03384-7⟩ Article dans une revue hal-04714371v1
Uterine defects and estradiol-dependent development of oviductal diverticula in mice lacking the SMAD4 C-terminal Mad homology 2 domain Fabrice G. Petit,Christine Kervarrec,Aurélie Allais-Bonnet,Bertrand Evrard,Frédéric Chalmelet al. FASEB Journal, 2023, 37 (8), pp.e23073. ⟨10.1096/fj.202300737R⟩ Article dans une revue hal-04165713v1
Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 for Horn Patterning in Bovidae Aurélie Allais-Bonnet,Aurélie Hintermann,Marie-Christine Deloche,Raphael Cornette,Philippe Bardouet al. Molecular Biology and Evolution, 2021, ⟨10.1093/molbev/msab021⟩ Article dans une revue hal-03164832v1
Dynamics of cattle sperm sncRNAs during maturation, from testis to ejaculated sperm Eli Sellem,Sylvain Marthey,Andrea Rau,Luc Jouneau,Aurélie Allais-Bonnetet al. Epigenetics & Chromatin, 2021, 14, pp.2-18. ⟨10.1186/s13072-021-00397-5⟩ Article dans une revue hal-03233594v1
A comprehensive overview of bull sperm-borne small non-coding RNAs and their diversity across breeds Eli Sellem,Sylvain Marthey,Andrea Rau,Luc Jouneau,Aurélie Allais-Bonnetet al. Epigenetics & Chromatin, 2020, 13 (1), ⟨10.1186/s13072-020-00340-0⟩ Article dans une revue hal-03176141v1
Dual role of DMXL2 in olfactory information transmission and the first wave of spermatogenesis Clara Gobe,Maeva M. El Zaiat,Nicolas Meunier,Marjolaine André,Eli Sellemet al. PLoS Genetics, 2019, 15 (2), pp.1-28. ⟨10.1371/journal.pgen.1007909⟩ Article dans une revue hal-02622530v1
An initiator codon mutation in SDE2 causes recessive embryonic lethality in Holstein cattle Sebastien Fritz,Chris Hoze,Emmanuelle Rebours,Anne Barbat,Méline Bizardet al. Journal of Dairy Science, 2018, 101 (7), pp.6220-6231. ⟨10.3168/jds.2017-14119⟩ Article dans une revue hal-02623515v1
Rapid discovery of de novo deleterious mutations in cattle enhances the value of livestock as model species Emmanuelle Bourneuf,P. Otz,H. Pausch,V. Jagannathan,Pauline Michotet al. Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.11466. ⟨10.1038/s41598-017-11523-3⟩ Article dans une revue hal-01608270v1
A specific role for &lt;em&gt;PRND&lt;/em&gt; in goat fetal Leydig cells is suggested by prion family gene expression during gonad development in goats and mice Aurélie Allais-Bonnet,Johan J. Castille,Maëlle Pannetier,Bruno B. Passet,Maeva Elzaiatet al. FEBS Open Bio, 2016, 6, pp.4-15. ⟨10.1002/2211-5463.12002⟩ Article dans une revue hal-02636701v1
A reverse genetic approach identifies an ancestral frameshift mutation in RP1 causing recessive progressive retinal degeneration in European cattle breeds Pauline Michot,Sabine Chahory,Andrew Marete,Cécile Grohs,Dimitri Dagioset al. Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.56. ⟨10.1186/s12711-016-0232-y⟩ Article dans une revue hal-01479315v1
Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 23 of the [i]integrin beta 4[/i] gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa Pauline Michot,Oscar Fantini,Régis Braque,Aurélie Allais-Bonnet,Romain Saintilanet al. Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.1-7. ⟨10.1186/s12711-015-0110-z⟩ Article dans une revue hal-01194111v1
FOXL2 is a female sex-determining gene in the goat Laurent Boulanger,Maëlle Pannetier,Laurence Gall Pouget Gall,Aurélie Allais-Bonnet,Maeva M. El Zaiatet al. Current Biology, 2014, 24 (4), pp.404-408. ⟨10.1016/j.cub.2013.12.039⟩ Article dans une revue hal-02638689v1
High-throughput sequencing analyses of XX genital ridges lacking [i]FOXL2[/i] reveal [i]DMRT1[/i] up-regulation before [i]SOX9[/i] expression during the sex-reversal process in goats Maeva El Zaiat,Luc Jouneau,Dominique Thepot Thépot,Christophe Klopp,Aurélie Allais-Bonnetet al. Biology of Reproduction, 2014, 91 (6), pp.1-14. ⟨10.1095/biolreprod.114.122796⟩ Article dans une revue hal-01194038v1
Role of the prion protein family in the gonads Aurélie Allais-Bonnet,Eric Pailhoux Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2014, 2, ⟨10.3389/fcell.2014.00056⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02632043v1
Novel insights into the bovine polled phenotype and horn ontogenesis in Bovidae Aurélie Allais-Bonnet,Cécile Grohs,Ivica I. Medugorac,Stefan S. Krebs,Anis Djariet al. PLoS ONE, 2013, 8, online (5), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0063512⟩ Article dans une revue hal-01000794v1
A 3.7 Mb deletion encompassing ZEB2 causes a novel polled and multisystemic syndrome in the progeny of a somatic mosaic bull Aurelien Capitan,Aurélie Allais-Bonnet,Alain Pinton,Brigitte Marquant-Le Guienne,Daniel Le Bourhiset al. PLoS ONE, 2012, 7, online (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0049084⟩ Article dans une revue hal-01019835v1
Balanced effect of PACAP and FasL on granule cell death during cerebellar development: a morphological, functional and behavioural characterization. Aurélie Allais,Delphine Burel,Vincent Roy,Sébastien Arthaud,Ludovic Galaset al. Journal of Neurochemistry, 2010, 113 (2), pp.329-40. ⟨10.1111/j.1471-4159.2009.06555.x⟩ Article dans une revue pasteur-00819614v1

Communication dans un congrès (16)

Integration of multi-tissues data. An example from bovine embryos. Denis Laloë,Aurélie Allais-Bonnet,Béatrice Mandon-Pepin,Luc Jouneau,Anne Frambourget al. 25eme congress of Animal Production Science. ASPA 2023, ASPA, Jun 2023, Bari, Italy Communication dans un congrès hal-04329926v1
La production in vitro des embryons bovins modifie les dimorphismes sexuels des methylomes foetaux Véronique Duranthon,Aurélie Chaulot-Talmon,Sebukhan Derya,Anne Frambourg,Francesca Aliet al. Epiphase 2023, Epiphase, Oct 2023, Jouy en Josas, France Communication dans un congrès hal-04331159v1
Différenciation et reprogrammation épigénétique des cellules germinales mâles dans le testicule fœtal bovin Marjolaine André,Béatrice Mandon-Pepin,Aurélie Allais-Bonnet,Hélène Jammes,Amélie Bonnet-Garnieret al. EpiPHASE 6ème journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique, Jun 2021, Lyon, France Communication dans un congrès hal-03284625v1
Bull sperm sncRNAs: A new source for potential fertility biomarkers? Eli Sellem,Sylvain Marthey,Hélène Kiefer,Chrystelle Le Danvic,Aurélie Allais-Bonnetet al. International Bull Fertility Conference, British Society of Animal Science (BSAS). GBR., May 2018, Westport, Ireland Communication dans un congrès hal-02734297v1
Les petits ARN non codants du spermatozoïde bovin, de potentiels biomarqueurs de la fertilité mâle ? Eli Sellem,Sylvain Marthey,Hélène Kiefer,Chrystelle Le Danvic,Aurélie Allais-Bonnetet al. 3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1p Communication dans un congrès hal-01608764v1
Epigenetic reprogramming in the male germ line of ruminants Béatrice Mandon-Pepin,Aurélie Allais-Bonnet,Marjolaine André,Pierre Calvel,Eli Sellemet al. France-Japan Epigenetics Workshop 2017, ATouT. Com. FRA., Nov 2017, Paris, France Communication dans un congrès hal-02791776v1
Reprogrammation de la méthylation de l’ADN des cellules germinales au cours du développement testiculaire chez Capra Hircus Aurélie Allais-Bonnet,Béatrice Mandon-Pepin,Marjolaine André,Eric Pailhoux,Audrey Prézelinet al. 3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01607860v1
Small non coding RNA from Frozen bull sperm cells Eli Sellem,Sylvain S. Marthey,Hélène Kiefer,Chrystelle Le Danvic,Aurélie Allais-Bonnetet al. 18. International Congress on Animal Reproduction (ICAR), International Organisation on Animal Reproduction. FRA., Jun 2016, Tours, France. 676 p Communication dans un congrès hal-02743053v1
Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 22 of the integrin beta 4 gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa Pauline Michot,Oscar Fantini,Régis Braques,Aurélie Allais-Bonnet,Romain Saintilanet al. 23. Plant and Animal Genome, Jan 2015, San Diego, United States. 1 p Communication dans un congrès hal-01194035v1
FOXL2, a critical regumator of steroid synthesis, acts as a female sex-determining gene in goats Maëlle Pannetier,Maeva Elzaiat,Laurent Boulanger,Aurélie Allais-Bonnet,Laurence Gall Pouget Gallet al. 27. Conference of European Comparative Endocrinologists, European Society of Endocrinology (ESE). GBR., Aug 2014, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02741073v1
DMRT1 turns on testicular differentiation during XX sex-reversal in the goat Maeva El Zaiat,Luc Jouneau,Dominique Thepot Thépot,Christophe Klopp,Aurélie Allais-Bonnetet al. 18. European Testis Workshop, May 2014, Elsinore, Denmark. 1 p Communication dans un congrès hal-01193822v1
&lt;em&gt;FOXL2&lt;/em&gt; is a female sex-determining gene in the goat Laurent Boulanger,Maëlle Pannetier,Laurence Gall Pouget Gall,Aurélie Allais-Bonnet,Maeva M. El Zaiatet al. Opening Conference "COST Action BM1308. Sharing Advances on Large Animal Models", European Cooperation in Science and Technology (COST). BEL., Dec 2014, Munich, Germany Communication dans un congrès hal-02741098v1
Effects of Dmxl2 invalidation on murine ovaries Maeva El Zaiat,Aurélie Allais-Bonnet,Marjolaine André,Clara Gobe,Eric Pailhouxet al. 5. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2013), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Oct 2013, Paris, France Communication dans un congrès hal-01189842v1
Invalidation du gène FOXL2 chez la chèvre; démonstration de son rôle de déterminant ovarien chez les bovidés Laurent Boulanger,Maëlle Pannetier,Laurence Gall,Aurélie Allais-Bonnet,Maeva Elzaiatet al. Journées d'Animation Scientifique Phase 2013, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Oct 2013, Paris, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01019184v1
Involvment of [i]DMRT1[/i] in XX sex-reversed polled goats Maeva Elzaiat,Dominique Thepot Thépot,Luc Jouneau,Aurélie Allais-Bonnet,Christophe Kloppet al. 6. International Symposium on the Biology of Vertebrate Sex Determination, Vertebrate-biosex. USA., Apr 2012, Kona, Hawai, United States. 1 p Communication dans un congrès hal-01019618v1
GENIDOV: Gene network involved in ovarian development in goat and mouse Eric Pailhoux,Maëlle Pannetier,Dominique Thepot Thépot,Geneviève Jolivet,Ikrame Naciriet al. 9. Colloque Agenae / ANR, Colloque Génomique Animale et Microbienne, AGENAE - Analyse du Génome des Animaux d'Elevage (AGENAE). FRA., Mar 2012, La Rochelle, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01193796v1

Poster de conférence (9)

In vitro production of bovine embryos modified sex-dimorphims in fetal liver methylome Véronique Duranthon,Aurélie Chaulot-Talmon,Francesca Ali,Ludivine Laffont,Anne Frambourget al. AETE 39th annual meeting, Sep 2023, Heraklion - Crète, Greece. AETE proceedings 2023, pp.146 Poster de conférence hal-04355532v1
ETUDE DES REMANIEMENTS ÉPIGÉNÉTIQUES AU MOMENT DE L'EGA CHEZ LE BOVIN À L'AIDE D'APPROCHES CORRÉLATIVES EN MICROSCOPIE OPTIQUE Martine Letheule,Aurélie Allais-Bonnet,Marie-Christine Deloche,Ludivine Laffont,Hélène Jammeset al. 10emes Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes INRAE, Nov 2021, TOURS, France Poster de conférence hal-03517503v1
Différenciation et reprogrammation épigénétique de la lignée germinale – Analyses transcriptomiques à l’échelle de la cellule. Geneviève Jolivet,Hérault Eloïse,Aurélie Allais-Bonnet,Marjolaine André,Béatrice Mandon-Pepinet al. Séminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, 2019, Rennes, France Poster de conférence hal-02949117v1
DNA methylation dynamics during spermatogenesis in ruminants Aurélie Allais-Bonnet,Sébastien Messiaen,Marjolaine André,Béatrice Mandon-Pepin,Gabriel Liveraet al. Mammalian Reproductive Gordon Research, Jul 2018, Lucca, Italy. , 2018 Poster de conférence hal-02790316v1
Small non coding RNA from frozen bull sperm cells: biomarkers of male fertility? Eli Sellem,Sylvain Marthey,Hélène Kiefer,Chrystelle Le Danvic,Aurélie Allais-Bonnetet al. 36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. , pp.222, 2017, ISAG 2017 36th International Society for Animal Genetics Conference Poster de conférence hal-02735698v1
Small non coding RNA from frozen bull sperm cells: biomarkers of male fertility? Eli Sellem,Sylvain Marthey,Hélène Kiefer,Chrystelle Le Danvic,Aurélie Allais-Bonnetet al. PAG XXVI Plant and Animal Genome Conference, Jan 2017, San Diego, United States. , 2017 Poster de conférence hal-02738420v1
Small non coding RNA from frozen bull sperm cells: A Biomarkers panel of male fertility Eli Sellem,Sylvain Marthey,Hélène Kiefer,Chrystelle Le Danvic,Aurélie Allais-Bonnetet al. PAG XXV - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2017, Qan Diego, United States. , 2017 Poster de conférence hal-02738179v1
Invalidation of &lt;em&gt;Dmxl2&lt;/em&gt; in female germ cells and fertility trouble Clara Gobe,Maeva M. El Zaiat,Marjolaine André,Aurélie Allais-Bonnet,Eric Pailhouxet al. 1. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. , 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro Poster de conférence hal-02741048v1
[i]Dmxl2[/i] is involved in follicle formation in the mouse Maëva El Zaiat,Clara Gobe,Bruno Passet,Nicolas Meunier,Marjolaine Andréet al. 1. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. , 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro Poster de conférence hal-01194103v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 to Determine the Number and Topology of Horns in Bovidae Aurélie Allais-Bonnet,Aurélie Hintermann,Marie-Christine Deloche,Raphaël Cornette,Philippe Bardouet al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-04426679v1