Aurelien Brionne Ingénieur en ingénierie logicielle (E2C45)

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aurelien-brionne

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0009-0009-3301-3813

Publications

Article dans une revue (36)

Characterization of interindividual DNA methylation variability in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Gaëlle Lefort,Aurélien Brionne,Benoît Piégu,Frédéric Terrier,Antoine Pigeonet al. Genomics, 2026, 118, ⟨10.1016/j.ygeno.2026.111211⟩ Article dans une revue hal-05528110v1
Identification of miR-187 as a modulator of early oogenesis and female fecundity in medaka Marlène Davilma,Stéphanie Gay,Manon Thomas,Sully Mak,Fabrice Mahéet al. BioRxiv, In press Article dans une revue hal-05458486v1
High temperature induces motility of zebrafish sperm after short-term storage Songpei Zhang,Swapnil Gorakh Waghmare,Sayyed Mohammad Hadi Alavi,Nururshopa Eskander Shazada,Yu Chenget al. Aquaculture, 2025, 595 (2), pp.741623. ⟨10.1016/j.aquaculture.2024.741623⟩ Article dans une revue hal-04744104v1
Cryopreservation did not affect spermatogonia global methylation profile in Senegalese sole (Solea senegalensis) M. Mafalda Almeida,Elsa Cabrita,Vincent Laizé,Aurélien Brionne,Catherine Labbéet al. Cryobiology, 2025, 118, pp.105162. ⟨10.1016/j.cryobiol.2024.105162⟩ Article dans une revue hal-04835965v1
Parent-of-origin regulation by maternal auts2 shapes neurodevelopment and behavior in fish Antoine Clement,Constance Merdrignac,Sergi Roig Puiggros,Dorine Sévère,Aurélien Brionneet al. Genome Biology, 2025, 26 (1), pp.125. ⟨10.1186/s13059-025-03600-y⟩ Article dans une revue hal-05079847v1
Strengths and limitations of reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) in the perspective of DNA methylation analysis in fish: a case-study on rainbow trout spermatozoa Marina El Kamouh,Aurélien Brionne,Amin Sayyari,Delphine Lallias,Catherine Labbéet al. Fish Physiology and Biochemistry, 2024, ⟨10.1007/s10695-024-01326-5⟩ Article dans une revue hal-04548356v1
Cryopreservation effect on DNA methylation profile in rainbow trout spermatozoa Marina El Kamouh,Aurélien Brionne,Amin Sayyari,Audrey Laurent,Catherine Labbé Scientific Reports, 2023, 13, pp.19029. ⟨10.1038/s41598-023-44803-2⟩ Article dans une revue hal-04501436v1
Spermatozoa methylome and its sensitivity to water temperature in a teleost fish Aurélien Brionne,Anne-Sophie Goupil,Stéphanie Kica,Jean-Jacques Lareyre,Catherine Labbéet al. Science of the Total Environment, 2023, 892, pp.164077. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.164077⟩ Article dans une revue hal-04172467v1
Avian primordial germ cells as key players for the conservation of genetic ressources and genome Amélie Juanchich,S. Alves,J. Ezagal,M. Bernard,Christoph Kloppet al. Animal. Science proceedings, 2022, 13 (5), pp.630-631. ⟨10.1016/j.anscip.2022.05.033⟩ Article dans une revue hal-03853554v1
Chronic dietary exposure to a glyphosate-based herbicide results in reversible increase early embryo mortality in chicken Anthony Estienne,Mathias Fréville,Guillaume Bourdon,Christelle Ramé,Joël Delaveauet al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2022, 241, pp.1-14. ⟨10.1016/j.ecoenv.2022.113741⟩ Article dans une revue hal-03744971v1
Protein expression reveals a molecular sexual identity of avian primordial germ cells at pre-gonadal stages Laura Soler-Vasco,Sabine Alves,Aurélien Brionne,Aurore Jacques,Vanessa Guérinet al. Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-98454-2⟩ Article dans une revue hal-03367022v1
Embryonic thermal manipulation impacts the postnatal transcriptome response of heat-challenged Japanese quails Anaïs Vitorino Carvalho,Christelle Hennequet-Antier,Aurélien Brionne,Sabine Crochet,Justine Jimenezet al. BMC Genomics, 2021, 22 (488), ⟨10.1186/s12864-021-07832-7⟩ Article dans une revue hal-03321946v1
Avian uterine fluid proteome: exosomes and biological processes potentially involved in sperm survival Cindy Riou,Aurélien Brionne,Luiz-Augusto Cordeiro,Grégoire Harichaux,Audrey Gargaros-Ratajczaket al. Molecular Reproduction and Development, 2020, acceptée (4), Acceptée. ⟨10.1002/mrd.23333⟩ Article dans une revue hal-01605894v1
A grape seed extract maternal dietary supplementation improves egg quality and reduces ovarian steroidogenesis without affecting fertility parameters in reproductive hens Alix Barbe,Namya Mellouk,Christelle Ramé,Jérémy Grandhaye,Karine Angeret al. PLoS ONE, 2020, 15 (5), pp.1-22. ⟨10.1371/journal.pone.0233169⟩ Article dans une revue hal-03151806v1
Eimeria tenella ROP kinase EtROP1 induces G0/G1 cell cycle arrest and inhibits host cell apoptosis Mamadou Amadou Diallo,Alix Sausset,Audrey Gnahoui-David,Adeline Ribeiro E Silva,Aurélien Brionneet al. Cellular Microbiology, 2019, 21 (7), 14 p. ⟨10.1111/cmi.13027⟩ Article dans une revue hal-02629406v1
Proteomic analysis of uterine fluid of fertile and subfertile hens before and after insemination Cindy Riou,Aurélien Brionne,Luiz Cordeiro,Grégoire Harichaux,Audrey Gargaroset al. Reproduction [Cambridge]. Supplement, 2019, 158 (4), pp.335-356. ⟨10.1530/REP-19-0079⟩ Article dans une revue hal-02622969v1
Differential expression and co-expression gene network analyses reveal molecular mechanisms and candidate biomarkers involved in breast muscle myopathies in chicken Eva Pampouille,Christelle Hennequet-Antier,Christophe Praud,Amélie Juanchich,Aurélien Brionneet al. Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-51521-1⟩ Article dans une revue hal-02966590v1
Thermal Manipulation During Embryogenesis Impacts H3K4me3 and H3K27me3 Histone Marks in Chicken Hypothalamus Sarah-Anne David,Anais Vitorino Carvalho,Coralie Gimonnet,Aurélien Brionne,Christelle Hennequet-Antieret al. Frontiers in Genetics, 2019, 10, pp.1207. ⟨10.3389/fgene.2019.01207⟩ Article dans une revue hal-02385835v1
Integrative analysis of transcriptomic data related to the liver of laying hens: from physiological basics to newly identified functions Audrey Gloux,Michel Jacques M.J. Duclos,Aurélien Brionne,Marie Bourin,Yves Nyset al. BMC Genomics, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s12864-019-6185-0⟩ Article dans une revue hal-02622659v1
The unique features of proteins depicting the chicken amniotic fluid Mylène da Silva,Clara Dombre,Aurélien Brionne,Philippe Monget,Magali Chesséet al. Molecular and Cellular Proteomics, 2019, 18 (3), pp.S174-S190. ⟨10.1074/mcp.RA117.000459⟩ Article dans une revue hal-02626106v1
Guinea fowl eggshell quantitative proteomics yield new findings related to its unique structural characteristics and superior mechanical properties Nathalie Le Roy,Lucie Combes-Soia,Aurélien Brionne,Valérie Labas,Alejandro B. Rodriguez-Navarroet al. Journal of Proteomics, 2019, 209, ⟨10.1016/j.jprot.2019.103511⟩ Article dans une revue hal-02623244v1
ViSEAGO: a bioconductor package for clustering biological functions using gene ontology and semantic similarity Aurélien Brionne,Amélie Juanchich,Christelle Hennequet-Antier BioData Mining, 2019, 12, 13 p. ⟨10.1186/s13040-019-0204-1⟩ Article dans une revue hal-02618212v1
Candidate genes of the transcellular and paracellular calcium absorption pathways in the small intestine of laying hens Audrey Gloux,Nathalie Le Roy,Aurélien Brionne,Emilie Bonin,Amélie Juanchichet al. Poultry Science, 2019, 98 (11), pp.6005-6018. ⟨10.3382/ps/pez407⟩ Article dans une revue hal-02622782v1
Food restriction but not fish oil increases fertility in hens: role of RARRES2? Namya Mellouk,Christelle Ramé,Joël Delaveau,Christophe Rat,Maxime Marchandet al. Reproduction [Cambridge]. Supplement, 2018, 155 (4), pp.321-331. ⟨10.1530/REP-17-0678⟩ Article dans une revue hal-02627259v1
An assessment of fixed and native chromatin preparation methods to study histone post-translational modifications at a whole genome scale in skeletal muscle tissue Sarah-Anne David,Benoit Piegu,Christelle Hennequet-Antier,Maëlle Pannetier,Tiphaine Aguirre-Lavinet al. Biological Procedures Online, 2017, 19, pp.1-11. ⟨10.1186/s12575-017-0059-0⟩ Article dans une revue hal-01608235v1
Thermal manipulation of the chicken embryo triggers differential gene expression in response to a later heat challenge Thomas Loyau,Christelle Hennequet-Antier,Vincent Coustham,Cécile Berri,Marie Leducet al. BMC Genomics, 2016, 17 (1), 15 p. ⟨10.1186/s12864-016-2661-y⟩ Article dans une revue hal-02636990v1
Quantitative proteomics provides new insights into chicken eggshell matrix protein functions during the primary events of mineralisation and the active calcification phase Pauline Marie,Valérie Labas,Aurélien Brionne,Grégoire Harichaux,Christelle Hennequet-Antieret al. Journal of Proteomics, 2015, 126, pp.140-154. ⟨10.1016/j.jprot.2015.05.034⟩ Article dans une revue hal-02638649v1
Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken eggshell matrix proteins during the primary events of eggshell mineralization and the active growth phase of calcification Pauline Marie,Valérie Labas,Aurélien Brionne,Grégoire Harichaux,Christelle Hennequet-Antieret al. Data in Brief, 2015, 4, pp.430-436. ⟨10.1016/j.dib.2015.06.019⟩ Article dans une revue (data paper) hal-01601560v1
Identifying specific proteins involved in eggshell membrane formation using gene expression analysis and bioinformatics Jingwen Du,Maxwell T. Hincke,Megan Rose-Martel,Christelle Hennequet-Antier,Aurélien Brionneet al. BMC Genomics, 2015, 16, ⟨10.1186/s12864-015-2013-3⟩ Article dans une revue hal-02633268v1
Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken eggshell matrix proteins during the primary events of eggshell mineralization and the active growth phase of shell calcification Pauline Marie,Valérie Labas,Aurélien Brionne,Grégoire Harichaux,Christelle Hennequet-Antieret al. Data in Brief, 2015, 4, pp.430-436. ⟨10.1016/j.dib.2015.06.019⟩ Article dans une revue (data paper) hal-02629430v1
Quantitative proteomics and bioinformatic analysis provide new insight into protein function during avian eggshell biomineralization Pauline Marie,Valérie Labas,Aurélien Brionne,Grégoire Harichaux,Christelle Hennequet-Antieret al. Journal of Proteomics, 2015, 113, pp.178-193. ⟨10.1016/j.jprot.2014.09.024⟩ Article dans une revue hal-01129881v1
Effect of embryonic development on the chicken egg yolk plasma proteome after 12 days of incubation Sophie Réhault-Godbert,Karlheinz Mann,Marie-Christine Bourin,Aurélien Brionne,Yves Y. Nys Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2014, 62 (12), pp.2531-2540. ⟨10.1021/jf404512x⟩ Article dans une revue hal-02631379v1
Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken uterine fluid during eggshell biomineralization Pauline Marie,Valérie Labas,Aurélien Brionne,Grégoire Harichaux,Christelle Hennequet-Antieret al. Data in Brief, 2014, 1, pp.65-69. ⟨10.1016/j.dib.2014.09.006⟩ Article dans une revue (data paper) hal-02630052v1
Hen uterine gene expression profiling during eggshell formation reveals putative proteins involved in the supply of minerals or in the shell mineralization process Aurélien Brionne,Yves Y. Nys,Christelle Hennequet-Antier,Joël Gautron BMC Genomics, 2014, 15, 17 p. ⟨10.1186/1471-2164-15-220⟩ Article dans une revue hal-02640144v1
Ovalbumin-related Protein X Is a Heparin-binding Ov-Serpin Exhibiting Antimicrobial Activities. Sophie Réhault-Godbert,Valérie Labas,Emmanuelle Helloin,Virginie Hervé-Grépinet,Cindy Slugockiet al. Journal of Biological Chemistry, 2013, 288 (24), pp.17285-95. ⟨10.1074/jbc.M113.469759⟩ Article dans une revue hal-00845174v1
Identification of uterine ion transporters for mineralisation precursors of the avian eggshell Vincent Jonchère,Aurélien Brionne,Joël Gautron,Yves Y. Nys BMC Physiology, 2012, 12, 17 p. ⟨10.1186/1472-6793-12-10⟩ Article dans une revue hal-02642183v1

Communication dans un congrès (49)

Unveiling the role of mir-187 in promoting adult ovarian follicle growth and female fecundity in medaka (Oryzias latipes) Stéphanie Gay,Marlène Davilma,Sully Heng,Fabrice Mahé,Manon Thomaset al. Différenciation et fonctions des gonades, Mar 2025, Paris, France Communication dans un congrès hal-05107315v1
Tridimensional interactive plots improve the visualization of global data structure in complex scRNA-seq datasets Amanda de Oliveira Ribeiro,Aurélien Brionne,Adriana Carvalho Natal de Moraes,Maira Da Silva Rodrigues,Beatriz Marques de Souzaet al. Journée Régionale GenoToul Bioinfo/Biostat, Escudié Frédéric; Gaspin Christine; Hoede Claire; Maugis-Rabusseau Cathy; Neuvial Pierre; Quentin Yves; Savy Nicolas; Vialaneix Nathalie; Zytnicki Matthias, Nov 2025, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-05363704v1
La spécificité de la matrice extracellulaire du testicule pourrait être nécessaire à la production d’organoïdes testiculaires chez les poissons Nathalie Chenais,Aurélien Brionne,Blandine Guével,Regis Lavigne,Agnès Burelet al. Organoïdes et recherche agronomique, INRAE (département PHASE), Nov 2024, Rennes, France Communication dans un congrès hal-04805813v1
Sex Determination in Medaka (Oryzias latipes): When Epigenetics Overrides Genetic Determinants Alexandra Depince,Florent Murat,Violette Thermes,Aurélien Brionne,Manfred Schartlet al. 3. European Symposium on Sex Determination in Vertebrates, Nov 2024, La colle sur Loup, France Communication dans un congrès hal-04780055v1
Transgenerational inheritance of DNA methylation alterations after gdf6b+/- -induced sex reversal in the medaka (Oryzias latipes) Alexandra Depince,Florent Murat,Violette Thermes,Aurélien Brionne,Manfred Schartlet al. IX. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Jul 2024, Leon, Spain Communication dans un congrès hal-04657868v1
L'imagerie 3D à haute résolution et la reconstruction du testicule entier du poisson zèbre constituent une approche prometteuse pour étudier le nombre et l'organisation spatiale des cellules souches spermatogoniales adultes. Maira Da Silva Rodrigues,Nathalie Chenais,Quentin Rapilly,Amanda de Oliveira Ribeiro,Aurélien Brionneet al. StemPhase 2024, INRAE département PHASE, Nov 2024, Rennes, France Communication dans un congrès hal-04805854v1
Certain paracrine factors implicated in germ stem cell fate could also exhibit additional endocrine functions throughout the reproductive cycle of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Charline Danthu,Aurélien Brionne,Blandine Guével,Regis Lavigne,Emmanuelle Comet al. 31. Conference of European Comparative Endocrinologists, Sep 2024, Ancona, Italy Communication dans un congrès hal-04690566v1
Identification par une approche innovante de protéomique à haut débit (diaPASEF) de protéines plasmatiques différentiellement exprimées au cours de la maturation sexuelle des truites Arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) Regis Lavigne,Aurélien Brionne,Charline Danthu,Emmanuelle Com,Charles Pineauet al. Bio-informatique et Intelligence Artificielle appliquées à la Protéomique, Biogenouest, Mar 2023, Nantes, France Communication dans un congrès hal-04680077v1
Integrating TGF-β signalling pathways and epigenetic modulations for controlling sex determination in medaka Amaury Herpin,Alexandra Depince,Florent Murat,Mateus Adolfi,Jérôme Montfortet al. 9. International Symposium on the Biology of Vertebrate Sex Determination, Apr 2023, Kona, Big Island, Hawaii, United States Communication dans un congrès hal-04089746v1
Parallel accumulation - serial fragmentation combined with data-independent acquisition for Identification of plasma proteins correlated with entry into sexual maturation: towards the development of an innovative biotechnology to control the sexual precocity and fertility of rainbow trout Régis Lavigne,Aurélien Brionne,Emmanuelle Com,Charline Danthu,Guével Blandineet al. ProteoAix 2023, Jun 2023, Aix-en-Provence, France Communication dans un congrès hal-04158595v1
Parallel accumulation - serial fragmentation combined with data-independent acquisition for Identification of plasma proteins correlated with entry into sexual maturation: towards the development of an innovative biotechnology to control the sexual precocity and fertility of rainbow trout Regis Lavigne,Charline Danthu,Blandine Guével,Emmanuelle Com,Aurélien Brionneet al. Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France Communication dans un congrès hal-03911904v1
Variation in muscle energy stores: impact on reproduction and egg characteristics in meat-type chicken strains Sonia Metayer-Coustard,Alessandro Franzoni,Sophie Réhault-Godbert,Anne Collin,Angélique Travelet al. 26. World Poultry Congress, WPSA, May 2022, Paris, France Communication dans un congrès hal-04152751v1
Cellules germinales primordiales aviaires au cœur des avancées de la conservation des ressources génétiques et de l’édition des génomes. L’exemple français Amélie Juanchich,Sabine Alves,Jacky Ezagal,Maria Bernard,Christophe Kloppet al. 14. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2022, Tours, France. pp.115-123 Communication dans un congrès hal-04275281v1
Sperm DNA methylation and sensitivity to environmenatl variations in rainbow trout Audrey Laurent,Aurélien Brionne,Anne-Sophie Goupil,Catherine Labbé,Jean-Jacques Lareyre International Congress on the Biology of Fish, Jun 2022, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04692707v1
French avian cryobank: development of reproductive biotechnologies based on primordial germ cells (PGCs) and investigation of the impact of in vitro steps on PGCs integrity and reproductive capacity Marina Govoroun,Sabine Alves,Laura Soler-Vasco,Sophie Fouchécourt,Nadine Gérardet al. 26è World's Poultry Congress,, May 2022, Webinar, France Communication dans un congrès hal-04276115v1
Phenotypic and molecular transgenerational analysis of embryonic thermal manipulation in Japanese quail Anais Vitorino Carvalho,Christelle Hennequet-Antier,Romuald Rouger,Benoit Piegu,Aurélien Brionneet al. Incubation and Fertility Research Group (IFRG) Meeting 2021, Oct 2021, Online, Netherlands Communication dans un congrès hal-03617443v1
Guinea fowl eggshell structural organization and particular organic matrix protein patterns to decipher its exceptional biomechanical properties Nathalie Le Roy,Lucie Combes-Soia,Aurélien Brionne,Valérie Labas,Alejandro Rodriguez-Navarroet al. XVIII European on the quality of eggs and egg products and XXIV European symposium on the quality of poultry meat symposium, Jun 2019, Cezme, Turkey Communication dans un congrès hal-02734825v1
Modifications moléculaires et histologiques associées à des myopathies du muscle du filet chez le poulet de chair Eva Pampouille,Christelle Hennequet-Antier,Amélie Juanchich,Aurélien Brionne,Thierry Bordeauet al. 13. Journée de la Recherche Avicole et Palmipèdes à foie Gras, Mar 2019, Tours, France Communication dans un congrès hal-03658366v1
Eimeria tenella ROP kinase EtROP1 induces G0/G1 cell cycle arrest and inhibits host cell apoptosis Mamadou Diallo,Alix Sausset,Audrey Gnahoui-David,Adeline Ribeiro E Silva,Aurélien Brionneet al. ApiCOWplexa 2019. 5. International Meeting on Apicomplexan Parasites in Farm Animals, Oct 2019, Berlin, Germany Communication dans un congrès hal-03306867v1
La thermo-manipulation embryonnaire chez la caille japonaise : de la physiologie à la régulation de l'épigénome Anais Vitorino Carvalho,Christelle Hennequet-Antier,Nathalie Couroussé,Coralie Gimmonet,Sabine Crochetet al. 5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p Communication dans un congrès hal-02736783v1
Guinea fowl eggshell structural organization and particular organice matrix protein patterns to decipher its exceptional biomechanical properties Joël Gautron,Nathalie Le Roy,Aurélien Brionne,Valérie Labas,Lucie Combes Soiaet al. Journées françaises de la biologie des tissus minéralisés, SFBTM, Jun 2019, Boulogne sur mer, France Communication dans un congrès hal-03254659v1
Variation des réserves énergétiques : impact sur la reproduction et les caractéristiques des oeufs à couver en lignées chair Sonia Metayer-Coustard,Alessandro Franzoni,Sophie Réhault-Godbert,Anne Collin,Angélique Travelet al. 13. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2019, Tours, France Communication dans un congrès hal-02737893v1
&lt;em&gt;Eimeria tenella&lt;/em&gt; induit l’arrêt du cycle en G0/G1 et inhibe l’apoptose de la cellule hôte : rôle de la kinase EtROP1 Mamadou Diallo,Alix Sausset,Audrey Gnahoui-David,Adeline Ribeiro E Silva,Aurélien Brionneet al. Congrès SFP-SFMM 2019, Société Française de Parasitologie (SFP). FRA., May 2019, Tours, France Communication dans un congrès hal-02738443v1
ViSEAGO: Easier data mining of biological functions organized into clusters using Gene Ontology and semantic similarity Aurélien Brionne,Amélie Juanchich,Christelle Hennequet-Antier Journées PEPI IBIS, Jun 2019, Paris, France. pp.11 Communication dans un congrès hal-02786704v1
Epigenome-wide analysis of the impact of a thermal manipulation treatment on avian embryo Sarah-Anne David,Anais Vitorino Carvalho,Coralie Gimonnet,Sabine Crochet,Thierry Bordeauet al. Avian Model Systems 10, Jun 2018, Paris, France Communication dans un congrès hal-02737539v1
Embryonic thermal manipulation of the Japanese quail: impacts on physiology and hypothalamic methylome and transcriptome Anais Vitorino Carvalho,Nathalie Couroussé,Flora Gataud,Coralie Gimonnet,Sabine Crochetet al. 15. European Poultry Conference, European federation of WPSA (WPSA). INT., Sep 2018, Dubrovnik, Croatia Communication dans un congrès hal-02735147v1
Temporal expression of hen uterine transcripts at key steps of shell mineralization Joël Gautron,Aurélien Brionne,Olivier Bouchez,Cédric Cabau,Christelle Hennequet-Antieret al. XVII European Symposium on the Quality of Eggs and Egg Products and XXIII European Symposium on the Quality of Poultry Meat ‘EggMeat 2017, Sep 2017, Edinburgh, United Kingdom Communication dans un congrès hal-02733489v1
Temporal Expression of Hen Uterine transcripts at key step of shell mineralization Joël Gautron,Aurélien Brionne,Olivier Bouchez,Cédric Cabau,Christelle Hennequet-Antieret al. 14th International Symposium on Biomineralization, Oct 2017, Tsukuba, Japan Communication dans un congrès hal-02733493v1
Change in calcium carbonate mineralogy and in organic matrix proteins quantified by proteomic analysis during the early stages of egg shell mineralization in hens Joël Gautron,Alejandro Rodriguez-Navarro,Pauline Marie,Valérie Labas,Nazaret Dominguez-Gascaet al. 25. World's Poultry Congress 2016, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Sep 2016, Beijing, China Communication dans un congrès hal-02742876v1
About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction Cindy Riou,Aurélien Brionne,Luiz Cordeiro,Grégoire Harichaux,Audrey Gargaroset al. 25. World's Poultry Congress 2016, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Sep 2016, Beijing, China Communication dans un congrès hal-02739212v1
Identification of uterine ionic transport proteins involved in providing the minerals for eggshell formation in hens. Aurélien Brionne,Joël Gautron,Yves Y. Nys 13. International Symposium on Biomineralization, Sep 2015, Granada, Spain Communication dans un congrès hal-02738481v1
Avian eggshell formation: Presence of amorphous calcium carbonate associated with changes in some organic matrix proteins during initiation of mineralisation Pauline Marie,Valérie Labas,Aurélien Brionne,Grégoire Harichaux,Christelle Hennequet-Antieret al. 22. European Symposium on the Quality of Poultry Meat - 16. European Symposium on the Quality of Eggs and Egg Products, May 2015, Nantes, France Communication dans un congrès hal-02738484v1
Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved Cindy Riou,Audrey Gargaros,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Joël Gautronet al. 41. Annual Conference of the International Embryo Transfer Society, International Embryo Transfer Society (IETS). USA., Jan 2015, Versailles, France Communication dans un congrès hal-02741083v1
Identification of uterine ionic transport proteins involved in providing the mineral materiel for eggshell formation in hens Aurélien Brionne,Joël Gautron,Yves Y. Nys Biomin 13th international symposium on biomineralization, Sep 2015, Granada, Spain Communication dans un congrès hal-02740084v1
Quantitative proteomics provides new insights into chicken eggshell matrix protein functions during pivotal stages of shell mineralization Joël Gautron,Pauline Marie,Valérie Labas,Aurélien Brionne,Grégoire Harichauxet al. 13. International Symposium on Biomineralization, Sep 2015, Granada, Spain. résumé 2 p Communication dans un congrès hal-02738852v1
Formation de la coquille de l'oeuf de poule : présence d'une phase de carbonate de calcium amorphe et variation associées de protéines de la matrice organique lors de l'initiation de la minéralisation Pauline Marie,Valérie Labas,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Christelle Hennequet-Antieret al. 11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA. Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), FRA. World's Poultry Science Association (WPSA). Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse (INPT - ENSAT)., Mar 2015, Tours, France Communication dans un congrès hal-02740279v1
Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved Cindy Riou,Audrey Gargaros,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Joël Gautronet al. 12. International Symposium on Spermatology, Association for Animal Andrology. AUS., Aug 2014, Newcastle, Australia Communication dans un congrès hal-02738618v1
Identification of uterine ionic transport proteins involved in providing the mineral precursors for eggshell formation in hens Aurélien Brionne,Yves Y. Nys,Christelle Hennequet-Antier,Joël Gautron 16. Journées françaises de biologie des tissus minéralisés, May 2014, Limoges, France Communication dans un congrès hal-02738600v1
New insights on egg proteins and their biological activities Joël Gautron,Aurélien Brionne,Sophie Réhault-Godbert,Yves Y. Nys Foodomics, Apr 2014, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02792816v1
Hen uterine gene expression profiling during eggshell formation reveals putative proteins involved in the shell mineralization process Aurélien Brionne,Yves Y. Nys,Christelle Hennequet-Antier,Joël Gautron 14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway Communication dans un congrès hal-02739248v1
Analyse du fluide utérin de Gallus gallus par spectrométrie de masse ''bottom up'' : comparaison de deux lignées de poules et effet de l'insémination artificielle Cindy Riou,Grégoire Harichaux,Kathy Soutonie,Aurélien Brionne,Joël Gautronet al. 26. Colloque Biotechnocentre, Association pour le Développement des Biotechnologies en Région Centre (Biotechnocentre). FRA., Oct 2013, Seillac, France Communication dans un congrès hal-02749802v1
Characterization and quantification of proteins secreted by uterus during initiation, growth and arrest of eggshell biomineralisation Pauline Marie,Valérie Labas,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Yves Y. Nyset al. 12. International Symposium of Biomineralization, Institute of Experimental Physics. DEU., Aug 2013, Frieberg, Germany Communication dans un congrès hal-02744748v1
Quantification and characterization of proteins secreted by uterus during initiation, growth and arrest of eggshell biomineralisation Pauline Marie,Valérie Labas,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Yves Y. Nyset al. 15. European Symposium on the Qaulity og Eggs and Egg Products. 21. European Symposium on the Quality of Poultry Meat, Sep 2013, Bergamo, Italy. 124 p Communication dans un congrès hal-02747442v1
New insights on egg proteins and their biological activities related to its physical and chemical protection Joël Gautron,Aurélien Brionne,Sophie Réhault-Godbert,Nicolas Guyot,Yves Y. Nys 15. European Symposium on the Quality og Eggs and Egg Products. 21. European Symposium on the Quality of Poultry Meat, Sep 2013, Bergamo, Italy. 124 p Communication dans un congrès hal-02747444v1
New advances on egg proteins and their potential for food and non food uses Joël Gautron,Sophie Réhault-Godbert,Aurélien Brionne,Cédric Cabau,Nicolas Guyotet al. 104th AOCS Annual Meeting and Expo, Apr 2013, Montreal, Canada Communication dans un congrès hal-02808179v1
The effect of embryonic development on the egg yolk plasma proteome during the first 12 days of incubation Yves Y. Nys,Sophie Réhault-Godbert,Karlheimz Mann,Marie-Christine Bourin,Aurélien Brionne 51th Meeting of the Incubation and Fertility Research Group, WPSA European Federation, Sep 2013, Göttingen, Germany Communication dans un congrès hal-02746453v1
New insights in egg proteins applying cDNA microarrays to hen oviduct and liver and extensive proteomic data mining Joël Gautron,Aurélien Brionne,Marie-Christine Bourin,Christelle Hennequet-Antier,Cédric Cabauet al. 5. Combined Workshop on Fundamental Physiology and Perinatal Development in Poultry, Aug 2011, Wageningen, Netherlands Communication dans un congrès hal-02802514v1
New insights in egg white proteins using cDNA microarrays and extensive proteomic data mining Joël Gautron,Aurélien Brionne,Christelle Hennequet-Antier,Cédric Cabau,Nicolas Guyotet al. 14. European Symposium on the Quality of Eggs and Egg Products, Sep 2011, Leipzig, Germany Communication dans un congrès hal-02747495v1
Gene identification coding uterine proteins supplying the minerals for eggshell formation Vincent Jonchère,Joël Gautron,Agnès Narcy,Aurélien Brionne,Yves Y. Nys 13. European Poultry Conference (EPC 2010), Aug 2010, Tours, France Communication dans un congrès hal-02752419v1

Poster de conférence (33)

Characterization of the spermatogonial dynamics and molecular mechanisms underlying spermatogenesis resumption using single cell-RNA seq Amanda de Oliveira Ribeiro,Aurélien Brionne,Adriana Carvalho Natal de Moraes,Maira da Silva Rodrigues,Beatriz Marques de Souzaet al. Single Cell Conference Nantes 2025 :Deciphering single cell interactions in health and disease, Oct 2025, Nantes, France Poster de conférence hal-05320615v1
Composition of the rainbow trout testicular extracellular matrix and progress towards the development of testicular organoids Nathalie Chenais,Rafael Henrique Nobrega,Régis Lavigne,Aurélien Brionne,Manon Thomaset al. 12. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, May 2023, Heraklion, Greece. Poster de conférence hal-04102161v1
Composition of the Rainbow trout testicular extracellular matrix using diaPASEF Blandine Guével,Nathalie Chenais,Régis Lavigne,Aurélien Brionne,Emmanuelle Comet al. ProteoAix 2023, Jun 2023, Aix-en-Provence, France Poster de conférence hal-04158632v1
Effets transgénérationnels d'une exposition embryonnaire à la chaleur sur le transcriptome et l'épigénome de la caille japonaise Anais Vitorino Carvalho,Benoît Piégu,Christelle Hennequet-Antier,Nathalie Couroussé,Sabine Crochetet al. épiPhase - 7. Journées d'Animation Scientifique autour de l'Epigénétique, Jun 2022, Rennes, France Poster de conférence hal-03726346v1
Effets a court et long termes de la manipulation thermique embryonnaire sur la physiologie de la caille japonaise Anais Vitorino Carvalho,Nathalie Couroussé,Coralie Gimonnet,Sabine Crochet,Thierry Bordeauet al. 13. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2019, Tours, France. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2019, 13. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras Poster de conférence hal-02735184v1
Transgenerational analysis of embryonic heat exposure in Japanese quail Anais Vitorino Carvalho,Coralie Gimonnet,Christelle Hennequet-Antier,Benoit Piegu,Aurélien Brionneet al. Epigenetic Inheritance Symposium 2019, Aug 2019, Zurich, Switzerland. 2019 Poster de conférence hal-02736953v1
Impact of variation in energy stores on reproduction and egg characteristics of meat-type chickens Sonia Metayer-Coustard,Alessandro Franzoni,Sophie Réhault-Godbert,Anne Collin,Angélique Travelet al. XI European Symposium on Poultry Genetics, Oct 2019, Prague, Czech Republic. 2019 Poster de conférence hal-02737377v1
Manipulation thermique embryonnaire chez la caille japonaise : étude de l'impact sur le phénotype et l'épigénome sur plusieurs générations Anais Vitorino Carvalho,Christelle Hennequet-Antier,Coralie Gimonnet,Benoit Piegu,Aurélien Brionneet al. Séminaire Défis Scientifiques du département Phase 2019, Nov 2019, Rennes, France Poster de conférence hal-02909456v1
Analyse bioinformatique des marques d'histone chez le poulet exposé à la chaleur pendant l'incubation Coralie Gimonnet,Sarah-Anne David,Anais Vitorino Carvalho,Benoit Piegu,Christelle Hennequet-Antieret al. 13.Journées de la recherche avicole et des palmipèdes à foie gras, Mar 2019, Tours, France. Journées de la Recherche sur les Palmipèdes à Foie Gras, 2019, 13. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras Poster de conférence hal-02734830v1
Guinea fowl eggshell quantitative proteomics yield new findings related to its unique structural characteristics and superior mechanical properties Nathalie Le Roy,Aurélien Brionne,Valérie Labas,Lucie Combes-Soia,Joël Gautronet al. XVth Symposium on biomineralization, Sep 2019, Munich, Germany. 2019 Poster de conférence hal-02737797v1
ViSEAGO: Easier data mining of biological functions organized into clusters using Gene Ontology and semantic similarity Christelle Hennequet-Antier,Aurélien Brionne,Amélie Juanchich useR! 2019, Jul 2019, Toulouse, France. 2019 Poster de conférence hal-02789400v1
Impact de la manipulation thermique embryonnaire sur le méthylome de caille japonaise Coralie Gimonnet,Anais Vitorino Carvalho,Nathalie Couroussé,Sabine Crochet,Thierry Bordeauet al. JOBIM 2019 : Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France. 2019 Poster de conférence hal-02737671v1
ViSEAGO: Easier data mining of biological functions organized into clusters using Gene Ontology and semantic similarity Christelle Hennequet-Antier,Aurélien Brionne,Amélie Juanchich Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques JOBIM 2019, Jul 2019, Nantes, France. 1 p, 2019 Poster de conférence hal-02786990v1
Projet PPILOW : des innovations pour améliorer le bien-être des porcs et volailles en élevage et expérimentation en systèmes de production plein air et biologiques à bas intrants (2019-2024) Anne Collin,Claire Bonnefous,Elisabeth Le Bihan-Duval,Sandrine Mignon-Grasteau,Elodie Guettieret al. Défis scientifiques Phase, Nov 2019, Rennes, France. pp.83, Recueil des résumés Poster de conférence hal-03502878v1
Impact de la thermo-manipulation embryonnaire sur l'aposition de H3K27ME3 et H3K4ME3 dans l'hypothalamus de poulet agé de 35 jours Sarah-Anne David,Anais Vitorino Carvalho,Coralie Gimonnet,Nathalie Couroussé,Sabine Crochetet al. 4. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2018, Nouzilly, France. 1 p., 2018 Poster de conférence hal-02735511v1
Analyse bioinformatique des modifications post-traductionnelles des histones chez le poulet thermomanipulé durant l'embryogenèse Coralie Gimonnet,Sarah-Anne David,Anais Vitorino Carvalho,Benoit Piegu,Christelle Hennequet-Antieret al. 4. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2018, Nouzilly, France. 1 p., 2018 Poster de conférence hal-02734816v1
Impact of embryonic thermal manipulation on quail transcriptome and methylome Anais Carvalho,Nathalie Couroussé,Sabine Crochet,Sarah-Anne David,Thierry Bordeauet al. Incubation and Fertility Research Group (IFRG), Aug 2017, Wageningen, Netherlands. 2017, Combined meeting of the Incubation and Fertility Research Group (WP6) and of the Fundamental Physiology and Perinatal Development Group (WP12). Abstracts Poster de conférence hal-01607553v1
About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction Cindy Riou,Aurélien Brionne,Luiz-Augusto Cordeiro,Grégoire Harichaux,Audrey Gargaros-Ratajczaket al. 2. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2017, Tours, France. 75 p., 2017, 2èmes Journées Scientifiques du GdR Repro Poster de conférence hal-01605263v1
Environmental epigenetics in birds: when the embryo feels the heat Anais Vitorino Carvalho,Sabine Crochet,Nathalie Couroussé,Thierry Bordeau,Benoit Pieguet al. France Japan Epigenetic Workshop, Nov 2017, Paris, France. , 2017 Poster de conférence hal-02790274v1
Projet OVISPERM : conservation des gamètes mâles dans l'oviducte de poule Nadine Gérard,Cindy Riou,Aurélien Brionne,Luiz-Augusto Cordeiro,Joël Delaveauet al. 29e Colloque Biotechnocentre, Oct 2016, Seillac, France. , 97 p., 2016, 29e Colloque Biotechnocentre Poster de conférence hal-01602196v1
Exploring the role of the chicken amniotic fluid during embryonic development Mylène da Silva,Aurélien Brionne,Valérie Labas,Lucie Combes Soia,Maryse Millset al. 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group" Poster de conférence hal-02742157v1
Sperm storage in hens: comprehensive proteomic analysis of uterine fluid and SST in relation to fertility lenght Cindy Riou,Aurélien Brionne,Audrey Gargaros-Ratajczak,Luiz-Augusto Cordeiro,Grégoire Harichauxet al. 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group" Poster de conférence hal-01608737v1
About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction Cindy Riou,Aurélien Brionne,Luiz-Augusto Cordeiro,Grégoire Harichaux,Audrey Gargaros-Ratajczaket al. 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group" Poster de conférence hal-01602972v1
Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved Cindy Riou,Audrey Gargaros,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Joël Gautronet al. 1 Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro Poster de conférence hal-02739803v1
Proteomic and bioinformatic analysis of avian uterine fluid Cindy Riou,Aurélien Brionne,Audrey Gargaros,Luiz-Augusto Cordeiro,Grégoire Harichauxet al. Congrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2015), Sep 2015, Ajaccio, France. , 2015, SMAP 2015 Poster de conférence hal-02738695v1
Comprehensive proteomic analysis of Gallus gallus uterine fluid Cindy Riou,Aurélien Brionne,Audrey Gargaros,Luiz-Augusto Cordeiro,Grégoire Harichauxet al. 31. Scientific Meeting of the AETE, Sep 2015, Ghent, Belgium. Brazilian College of Animal Reproduction, Animal Reproduction, 12 (3), 2015, 31st Scientific Meeting of the AETE Poster de conférence hal-02740039v1
Identification of uterine ionic transport proteins involved in providing the mineral materiel for eggshell formation in hens Aurélien Brionne,C. Sun,Joël Gautron,N. Yang,Yves Y. Nys 14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway. WPSA, Branche Norvégienne, 2014, XIVTH EUROPEAN POULTRY CONFERENCE Poster de conférence hal-02741984v1
Eggshell mineralisation: relationship between in situ observations and organic matrix composition Pauline Marie,Alejandro Rodriguez Navarro,Valérie Labas,Grégoire Harichaux,Christelle Hennequet-Antieret al. 14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway. WPSA, Branche Norvégienne, 2014, XIVth European Poultry Conference Poster de conférence hal-02738844v1
Bottom-up analysis of Gallus gallus uterine fluid: comparison of two lines of hens and effect of artificial insemination Grégoire Harichaux,Cindy Riou,Kathy Soutonie,Aurélien Brionne,Joël Gautronet al. 7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA 2013. Scientific Meeting Poster de conférence hal-02745845v1
Quantification et caractérisation des protéines sécrétées par l'utérus lors de l'initiation, de la croissance et de l'arrêt de la minéralisation de la coquille d'oeuf de poule Pauline Marie,Valérie Labas,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Yves Y. Nyset al. 10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2013, La Rochelle, France. Journées de la Recherche Avicole, 2013, 10èmes Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras Poster de conférence hal-02749889v1
Quantification et caractérisation des protéines sécrétées par l'utérus lors de l'initiation, de la croissance et de l'arrêt de la minéralisation de la coquille d'oeuf de poule Pauline Marie,Valérie Labas,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Yves Y. Nyset al. 15. Journées de la Société Française de Biologie des Tissus Minéralisés, May 2013, Poitiers, France. 2013 Poster de conférence hal-02805515v1
A transcriptomic approach of the hen's uterus to identify new genes involved in biomineralization of the eggshell Aurélien Brionne,Yves Y. Nys,Joël Gautron 14. Congrès SFBTM, Mar 2012, Bordeaux, France. 2012 Poster de conférence hal-02804011v1
Utilization of label free spectral counting to quantify the proteins involved in the various phases of chicken eggshell mineralisation Pauline Marie,Valérie Labas,Grégoire Harichaux,Aurélien Brionne,Yves Y. Nyset al. 29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Sep 2012, Orléans (FRA), France. , 256 p., 2012, JFSM Orléans 2012 Poster de conférence hal-02745304v1

Chapitre d'ouvrage (1)

CHAPTER 14. Bioactive Minor Egg Components Joël Gautron,Nicolas Guyot,Aurélien Brionne,Sophie Réhault-Godbert Wu J. Eggs as Functional Foods and Nutraceuticals for Human Health, Royal Society of Chemistry, pp.406, 2019, Food Chemistry, Function and Analysis, 978-1-78801-213-3. ⟨10.1039/9781788013833-00259⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02788830v1

Pré-publication, Document de travail (3)

Characterization of interindividual DNA methylation variability in rainbow trout ( Oncorhynchus mykiss ) Gaëlle Lefort,Aurélien Brionne,Benoît Piégu,Frédéric Terrier,Antoine Pigeonet al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-05232256v1
Autism-related gene intergenerationally regulates neurodevelopment and behavior in fish through non-genetic mechanisms Antoine Clement,Constance Merdrignac,Sergi Ruig Puiggros,Aurélien Brionne,Thuy Thao Vi Nguyenet al. 2024 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-04693265v1
Epigenetic landscape of heat stress intergenerational inheritance in a teleost fish Aurélien Brionne,Anne-Sophie Goupil,Stéphanie Kica,Jean-Jacques Lareyre,Catherine Labbéet al. 2024 Pré-publication, Document de travail hal-04645932v1

Rapport (1)

SEXTIMING: Identification de protéines plasmatiques corrélées à l’entrée en maturation sexuelle : vers un développement d’une biotechnologie innovante pour maîtriser la précocité sexuelle et la fertilité de la truite arc-en-ciel Jean-Jacques Lareyre,Charline Danthu,Aurélien Brionne,Emmanuelle Com,Charles Pineau INRAE Bretagne Normandie. 2023, pp.45 Rapport hal-04411012v1

Logiciel (1)

ViSEAGO: a Bioconductor package for clustering biological functions using GeneOntology and semantic similarity Christelle Hennequet-Antier,Aurélien Brionne,Amélie Juanchich 2019 Logiciel hal-02789561v1