Benjamin Misson
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Presentation
**Maître de Conférences - HDR - 67ème section CNU**
***Activités de recherche***
Thématiques de recherche actuelles principales :
- Dynamique, structure et diversité des communautés microbiennes marines planctoniques et benthiques
- Contribution des pressions anthropiques (contaminations chimiques, perturbations physiques) à l'écologie des communautés microbiennes marines
- Contributions microbiennes au devenir des contaminants dans l’environnement marin côtier : spéciation, partition dissous/particulaire, transfert trophique, transferts eau/sédiment
Mots clés :
- Ecologie microbienne
- Biodiversité
- Biogéochimie
- Environnement côtier
- Biologie moléculaire
- Cytométrie en flux
Modèles biologiques d’intérêt : bactéries, eucaryotes unicellulaires, archées
Production scientifique :
- 32 articles parus dont 8 en tant que 1er auteur et 7 en tant que co-auteur de doctorants co-encadrés
- 4 communcations invitées en congrés et workshops internationaux, > 60 communications orales ou affichées en congrés internationaux et nationaux.
Coordination de projets de recherche :
- COMICS (2020-2021, Couplage d'approches méta-OMICS pour l'étude approfondie de réponses microbiennes aux perturbations d'origine anthropique en milieu marin côtier, UTLN/TPM : 30.7 k€)
- SE.D.RI.PORT. (2017-2020, SEdimenti, Dragaggi, RIschi PORTuali, Interreg Marittimo, 1854.6k€, part UTLN : 220k€, PI : Région Autonome de Sardaigne, coordination UTLN : B. Misson depuis début 2018)
- IMPRECI-M² (2016-2017, IMPacts RECIproques entre Microorganismes et Métaux traces en milieu marin côtier : qui contrôle qui ? EC2CO ECODYN+MICROBIEN : 37.8k€)
- METOPHYTO (2015-2016, Influence de pollutions MEtalliques multiples représentatives de l’environnement marin côtier TOulonnais sur le picoPHYTOplancton, FR ECCOREV : 7k€)
- COMMET (2014, Caractérisation des COMmunautés Microbiennes participant à la biogéochimie du MErcure dans les sédiments de la rade de Toulon : diversité, distribution et réponse aux contaminations métalliques multiples, UTLN/TPM: 15.5k€)
Partenaire de projets de recherche :
- BLACK MATTERS (2021, Black Carbon dissous en milieu marin : biodisponibilité potentielle pour les procaryotes hétérotrophes et pouvoir de complexation avec les contaminants chimiques, MIO, 12.2k€)
- CARAMBOLE (2020-2021, Caractérisation des apports de COD et de leurs effets sur les communautés biologiques en lacs de haute altitude, EC2CO HYBIGE, 45 k€)
- GEREMIA (2018-2021, GEstione dei REflui per il MIglioramento delle Acque portuali, Interreg Marittimo, 1783k€, part UTLN : 383.8k€)
- COMMET (2018, MIO, 5k€)
- EPIBIOINDIC (2017-2018, Epibiontes des herbiers marins : indicateur de qualité des écosystèmes côtiers? FR ECCOREV, 7k€, part MIO : 2k€ )
- MERITE-Hippocampe (2017-2020, MISTRALS, AT pollutions et contaminants, 200k€)
- FOS SEA (2017-2020, Environmental risk assessment of biological fouling control along the Mediterranean coast, ANR, 635k€, part MIO : 134.5k€)
- Development of a Quantitative Lab and Field-Based Microbial Tool to Determine Arsenic (2016, MITACS/Campus France, 10k€)
- PREVENT (2015-2017, PRotection du littoral méditerranéen: EValuation, surveillancE, conséqueNces, impacT économique et sociétal – Application à la Rade de Toulon, UTLN/TPM/CD83/Région PACA, 188,6k€)
- MERMEX (2013-2016, MISTRALS, WP3, action C3A)
- DYNAMICS (2012-2015, « Dynamique des communautés microbiennes actuelles et passées dans les sédiments ligériens », Agence de l’eau Loire-Bretagne. (Postdoctorat)
- Actions Intégrées Volubilis France-Maroc de 2010 à 2014 sur l’impact des fluctuations climatiques sur le potentiel toxique des proliférations cyanobactériennes dans des écosystèmes aquatiques marocains et français (Doctorat)
Financement de ressources humaines :
- Contrat Postdoctoral ANR FOSSEA Julie Foulon (12 mois)
- Contrat Doctoral région PACA 2015-2018 Clément Coclet (33%)
- Contrat Doctoral région PACA 2016-2019 Marie Mayer (33%)
- Contrat Doctoral région PACA 2017-2020 Nicolas Layglon (33%)
- CDD IgE UTLN 2018-2019 Emilie Paséro (10 mois)
- CDD IgE UTLN + projet 2019 Nicolas Gallois (9 mois)
Encadrement :
- 1 chercheuse post-doctorale (Julie Foulon, ANR FOSSEA, 10/2018 – 09/2019)
- 2 ATER (Lyria Berdjeb 2017-2018; Elyne Dugény 2021-2022)
- 4 doctorants (Clément Coclet, co-encadrant, 11/2015 – 06/2019 ; Marie Mayer, co-encadrant, 11/2016 – 08/2017 démission ; Nicolas Layglon, co-encadrant, 10/2017 - 09/2020; Clara Dignan, co-directeur, 10/2020 - 09/2023)
- 7 stagiaires de M2 (Benjamin Legrand, UBP, 2013 ; Clément Coclet, AMU, 2015 ; Aurélie Portas, AMU, 2018 ; Alexis Canino, AMU, 2019 ; Roxane Dhommée, UTLN, 2019 ; Emma Lavaut, UPVD, 2019 ; Clara Dignan, UPPA, 2020)
- 4 stagiaires de M1 (Delphine Boulouis, UTLN, 2010, Perrine Delompré, UTLN, 2015 ; Thibaut Cossart, UTLN, 2016 ; Carolane Giraud, UPMC, 2017)
- 1 stagiaire ingénieure (Jade Céfaï, Polytech Marseille, 2021)
- 4 stagiaires de DUT (Claire Dumortier, UTLN, 2015 ; Mathilde Goidin, UTLN, 2017, Léa Rodrigues, UTLN, 2018 ; Marvin Hilger, UTLN, 2018)
- 2 stagiaires de Licence (Léa Germain, L Physique-Chimie renforcée, UTLN, 2016-2017 ; Philip Poupin, L Biologie, AMU, 2018)
***Responsabilités administratives***
- Co-responsable de l’Axe Transverse CONTAM (Dynamique des contaminants dans le milieu marin) du laboratoire MIO depuis le 1er janvier 2018.
- Co-responsable de l'action Contaminants de l'équipe MEB du MIO
- Membre élu représentant des enseignants chercheurs au bureau du pôle MEDD de l’UTLN depuis juillet 2018.
- Correspondant UTLN auprès du Réseau des Universités Marines depuis 2019
- Animation scientifique à l’EA PROTEE : responsable du cycle de séminaires bi-mensuels « Anim’mardi » entre septembre 2014 et décembre 2017 (49 séminaires organisés).
- Représentant suppléant de l’EA PROTEE au conseil de l’axe stratégique (devenu pôle) MEDD de l’UTLN de 2016 à 2017.
- Membre élu du conseil de laboratoire de l’EA PROTEE de janvier 2014 à décembre 2017.
***Activités d’enseignement***
Enseignements dispensés actuellement :
- biologie et physiologie végétale
- biologie moléculaire
- inventaires de diversité
- fonctionnement de l'environnement marin
- développement durable
- pollutions et bio-remédiation
- conservation des espaces naturels
- SIG
- écologie microbienne
- outils moléculaires pour l'étude des communautés
- écotoxicologie microbienne
Formations universitaires concernées :
- BUT Génie Biologique 1ère année (tronc commun et parcours SEE), DUT Génie Biologique 2ème année option GE
- Master Sciences De la Mer 1ère année et 2ème année
Responsabilités de modules :
- BUT1 GB : UE 1.3 Gérer les milieux naturels anthropisés
- DUT GB GE2 : Complément de formation technologique pour l’analyse des milieux
- DUT GB GE2 : Développement durable
- DUT GB GE2 : Complément de formation en gestion de l’environnement
- M1 SDM IPA : Ecotoxicologie microbienne
***Expérience professionnele en Recherche et Enseignement***
- Depuis le 1er janvier 2018 : maître de conférences, UTLN, IUT département de génie biologique, MIO (UM110, CNRS, IRD, AMU, UTLN) équipe Microbiologie Environnementale et Biotechnologies (MEB).
- Septembre 2013 – décembre 2017 : maître de conférences, UTLN, IUT département génie biologique, PROTEE (EA 3819), équipe Ecologie et Biologie MArines.
- Octobre 2012 – août 2013 : post-doctorant, LMGE (UMR CNRS 6023, UBP, Clermont-Ferrand), équipes « Communautés microbiennes : écotoxicologie, santé » (CMES) et « Interactions dans les réseaux trophiques aquatiques » (IRTA).
- Octobre 2011 – août 2012 : Attaché temporaire d’enseignement et de recherche (temps plein) –Université Blaise Pascal (UBP), UFR Sciences et Technologies, département de Biologie, LMGE, équipe CMES.
- Octobre 2008 – juin 2011 : enseignant vacataire, UBP et Université d’Auvergne. (205,5h eq. TD).
***Formation Universitaire***
- Novembre 2019 : Habilitation à diriger des recherches - UTLN. Titre : Ecologie de populations et communautés microbiennes dans l’eau et les sédiments d’environnements aquatiques sous forte pression anthropique.
- octobre 2008 – octobre 2011 : Thèse de doctorat d’écologie - UBP (soutenue le 19 octobre 2011) - Sujet : « Potentiel toxique et structure génétique de populations de Microcystis en relation avec les différentes phases de son cycle de vie » - Directeurs de thèse : Christian Amblard (DR, UMR CNRS 6023, LMGE) et Delphine Latour (MCF, UBP, LMGE) - Financement : Allocation de recherche du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche, obtenue par voie de concours, classé 2/26 par l’école doctorale.
- 2007-2008 : Master 2 recherche spécialité « Biologie et Fonctionnement des Ecosystèmes », UBP. Mention Bien, classé 1er/11. Obtention d’une bourse de mérite, sur la base des résultats universitaires. Stage de recherche (6 mois) réalisé au LMGE sur le sujet : « Impact des microcystines sur le recrutement benthique de la cyanobactérie Microcystis ».
- 2006-2007 : Master 1 « Biologie des Peuplements et des Ecosystèmes », UBP. Mention Bien, classé 1er/26 - Stage de recherche (3 mois) réalisé au LMGE sur le sujet : « Influence de la compétition alimentaire interspécifique entre espèces piscicoles du Haut-Allier sur la croissance des juvéniles du Saumon Atlantique Salmo salar ».
- 2005-2006 : Licence Biologie parcours Environnement, UBP. Mention Assez-Bien, classé 16ème/234
- 2003-2005 : DEUG Biologie, parcours Sciences de la Vie, UBP. Mention Assez-Bien.
Publications
Role of microorganisms in marine mercury cycling: current knowledge and future directionsMISTRALS Contamination & Pollution workshop, Nov 2018, Marseille, France
Conference papers
hal-02173548v1
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Soil photosynthetic microbial communities as bioindicators for pesticide stress assessment1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), Dec 2014, Dijon, France. 702 p., 2014, The First Global Soil Biodiversity Conference, december 2-5, 2014, Dijon, France : book of abstracts
Conference poster
hal-02738907v1
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Potentiel toxique et structure génétique de populations de Microcystis en lien avec les différentes phases de son cycle de vieSciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. Français. ⟨NNT : 2011CLF22168⟩
Theses
tel-00678587v1
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