Cécile GROHS Molecular biology ingenieer in cattle genomicsIn charge of The French National Observatory for Bovine Abnormalities

Publications

Article dans une revue (69)

Assembly of a pangenome uncovers novel non-reference unique insertion sequences in cattle highlighting their genetic diversity Valentin Sorin,Florian Besnard,Aurélien Capitan,Cécile Grohs,Maulana Mughitz Najiet al. Journal of Animal Science and Biotechnology , 2026, 17 (1), pp.47. ⟨10.1186/s40104-026-01373-3⟩ Article dans une revue hal-05543227v1
Comprehensive detection of structural variations in long and short reads dataset of French cattle Maulana Mughitz Naji,Christophe Klopp,Camille Eché,Arnaud Di Franco,Clément Birbeset al. Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.40758. ⟨10.1038/s41598-025-24477-8⟩ Article dans une revue hal-05391915v1
Application of a French cattle pangenome, from structural variant discovery to association studies on key phenotypes Valentin Sorin,Maulana Mughitz Naji,Clément Birbes,Cécile Grohs,Clémentine Escouflaireet al. Genetics Selection Evolution, 2025, 57, pp.61. ⟨10.1186/s12711-025-01012-x⟩ Article dans une revue hal-05330359v1
Whole genome short read data from 567 bulls of 14 breeds provides insight into genetic diversity of French cattle Mekki Boussaha,Camille Eché,Christophe Klopp,Cécile Grohs,Marine Milheset al. Data in Brief, 2025, 62, pp.112049. ⟨10.1016/j.dib.2025.112049⟩ Article dans une revue (data paper) hal-05268512v1
NOA1 deficiency observed in a subset of Montbéliarde calves with bilateral anophthalmia Cécile Grohs,Aurélien Capitan Animal Genetics, 2025, 56 (6), ⟨10.1111/age.70058⟩ Article dans une revue hal-05392506v1
A bovine model of rhizomelic chondrodysplasia punctata caused by a deep intronic splicing variant in the GNPAT gene Arnaud Boulling,Julien Corbeau,Cécile Grohs,Anne Barbat,Jérémy Mortieret al. Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.23. ⟨10.1186/s12711-025-00969-z⟩ Article dans une revue hal-05075769v1
A recessive deleterious missense variant in PEX7 causes a lethal form of chondrodysplasia in Bazadaise cattle Cécile Grohs,Stéphanie Minéry,Sébastien Fritz,Mekki Boussaha,Aurélien Capitan Animal Genetics, 2025, 56 (4), ⟨10.1111/age.70035⟩ Article dans une revue hal-05261352v1
Validated DNA isolation method ensuring successful long-read sequencing of cattle semen genome Erwan Denis,Cécile Grohs,Cécile Donnadieu,Carole Iampietro PLoS ONE, 2024, 19 (8), pp.e0308011. ⟨10.1371/journal.pone.0308011⟩ Article dans une revue hal-04675198v1
Massive detection of cryptic recessive genetic defects in dairy cattle mining millions of life histories Florian Besnard,Ana Guintard,Cécile Grohs,Laurence Guzylack-Piriou,Margarita Canoet al. Genome Biology, 2024, 25 (1), pp.248. ⟨10.1186/s13059-024-03384-7⟩ Article dans une revue hal-04714371v1
A recurrent de novo missense mutation in COL1A1 causes osteogenesis imperfecta type II and preterm delivery in Normande cattle Julien Corbeau,Cécile Grohs,Jeanlin Jourdain,Mekki Boussaha,Florian Besnardet al. Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.39. ⟨10.1186/s12711-024-00909-3⟩ Article dans une revue hal-04581779v1
Large-scale detection and characterization of interchromosomal rearrangements in normozoospermic bulls using massive genotype and phenotype data sets Jeanlin Jourdain,Harmonie Barasc,Thomas Faraut,Anne Calgaro,Nathalie Bonnetet al. Genome Research, 2023, 33 (6), pp.957-971. ⟨10.1101/gr.277787.123⟩ Article dans une revue hal-04170739v1
Detailed analysis of mortality rates in the female progeny of 1,001 Holstein bulls allows the discovery of new dominant genetic defects Florian Besnard,H Leclerc,Mekki Boussaha,Cécile Grohs,N Jewellet al. Journal of Dairy Science, 2023, 106 (1), pp.439-451. ⟨10.3168/jds.2022-22365⟩ Article dans une revue hal-03844760v1
Integrin alpha 6 homozygous splice-site mutation causes a new form of junctional epidermolysis bullosa in Charolais cattle Mekki Boussaha,Arnaud Boulling,Valérie Wolgust,Lorraine Bourgeois-Brunel,Pauline Michotet al. Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.40. ⟨10.1186/s12711-023-00814-1⟩ Article dans une revue hal-04125597v1
A Bos taurus sequencing methods benchmark for assembly, haplotyping, and variant calling Camille Eché,Carole Iampietro,Clément Birbes,Andreea Dréau,Claire Kuchlyet al. Scientific Data , 2023, 10 (1), pp.369. ⟨10.1038/s41597-023-02249-1⟩ Article dans une revue (data paper) hal-04122201v1
Mutation of the MYH3 gene causes recessive cleft palate in Limousine cattle Anne Vaiman,Sébastien Fritz,Christian Beauvallet,Mekki Boussaha,Cécile Grohset al. Genetics Selection Evolution, 2022, 54 (1), pp.71. ⟨10.1186/s12711-022-00762-2⟩ Article dans une revue hal-03839198v1
Rare cases of hernia of the linea alba among TWIST1 haploinsufficient Charolais cattle Cécile Grohs,Mekki Boussaha,Chris Hozé,Aurélien Capitan Animal Genetics, In press, ⟨10.1111/age.13179⟩ Article dans une revue hal-03582504v1
A missense mutation in the FZD7 gene is associated with dilution of the red areas of the coat in Montbéliarde cattle S. Floriot,A. Duchesne,C. Grohs,C. Hozé,M.C. Delocheet al. Animal Genetics, 2021, 52 (3), pp.351-355. ⟨10.1111/age.13055⟩ Article dans une revue hal-04478130v1
Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 for Horn Patterning in Bovidae Aurélie Allais-Bonnet,Aurélie Hintermann,Marie-Christine Deloche,Raphael Cornette,Philippe Bardouet al. Molecular Biology and Evolution, 2021, ⟨10.1093/molbev/msab021⟩ Article dans une revue hal-03164832v1
Determination of immunoglobulin concentrations and genetic parameters for colostrum and calf serum in Charolais animals Pauline Martin,Aurélie Vinet,C. Denis,Cécile Grohs,L. Chanteloupet al. Journal of Dairy Science, 2021, 104 (3), pp.3240-3249. ⟨10.3168/jds.2020-19423⟩ Article dans une revue hal-03182575v1
Identification of the ABCC4, IER3, and CBFA2T2 candidate genes for resistance to paratuberculosis from sequence-based GWAS in Holstein and Normande dairy cattle Marie-Pierre Sanchez,Raphaël Guatteo,Aurore Davergne,Judikael Saout,Cécile Grohset al. Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), pp.14. ⟨10.1186/s12711-020-00535-9⟩ Article dans une revue hal-02514814v1
Α de novo 3.8-Mb inversion affecting the EDA and XIST genes in a heterozygous female calf with generalized hypohidrotic ectodermal dysplasia Clémentine Escouflaire,Emmanuelle Rebours,Mathieu Charles,Sébastien Orellana,Margarita Canoet al. BMC Genomics, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s12864-019-6087-1⟩ Article dans une revue hal-02611162v1
An initiator codon mutation in SDE2 causes recessive embryonic lethality in Holstein cattle Sebastien Fritz,Chris Hoze,Emmanuelle Rebours,Anne Barbat,Méline Bizardet al. Journal of Dairy Science, 2018, 101 (7), pp.6220-6231. ⟨10.3168/jds.2017-14119⟩ Article dans une revue hal-02623515v1
Whole-genome analysis of introgressive hybridization and characterization of the bovine legacy of Mongolian yaks Ivica Medugorac,Alexander Graf,Cécile Grohs,Sophie Rothammer,Yondon Zagdsurenet al. Nature Genetics, 2017, 49 (3), pp.470-475. ⟨10.1038/ng.3775⟩ Article dans une revue hal-01605099v1
Identification of copy number variation in French dairy and beef breeds using next-generation sequencing Rabia Letaief,Emmanuelle Rebours,Cécile Grohs,Cédric Meersseman,Sébastien Fritzet al. Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.77. ⟨10.1186/s12711-017-0352-z⟩ Article dans une revue hal-01622967v1
A missense mutation in PFAS (phosphoribosylformylglycinamidine synthase) is likely causal for embryonic lethality associated with the MH1 haplotype in Montbéliarde dairy cattle Pauline Michot,Sebastien Fritz,Anne Barbat,Mekki Boussaha,Marie-Christine Delocheet al. Journal of Dairy Science, 2017, 100 (10), pp.8176-8187. ⟨10.3168/jds.2017-12579⟩ Article dans une revue hal-02619062v1
Rapid discovery of de novo deleterious mutations in cattle enhances the value of livestock as model species Emmanuelle Bourneuf,P. Otz,H. Pausch,V. Jagannathan,Pauline Michotet al. Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.11466. ⟨10.1038/s41598-017-11523-3⟩ Article dans une revue hal-01608270v1
Deciphering the Wisent Demographic and Adaptive Histories from Individual Whole-Genome Sequences Mathieu Gautier,Katayoun Moazami-Goudarzi,Hubert H. Levéziel,Hugues Parrinello,Cécile Grohset al. Molecular Biology and Evolution, 2016, 33 (11), pp.2801-2814. ⟨10.1093/molbev/msw144⟩ Article dans une revue hal-02506852v1
Construction of a large collection of small genome variations in French dairy and beef breeds using whole-genome sequences Mekki Boussaha,Pauline Michot,Rabia Letaief,Chris Hozé,Sébastien Fritzet al. Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.87. ⟨10.1186/s12711-016-0268-z⟩ Article dans une revue hal-01479216v1
Du phénotype à la mutation causale : le cas des anomalies récessives bovines Amandine Duchesne,Cécile Grohs,Pauline Michot,Maud Bertaud,Didier Boichardet al. INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.319-328 Article dans une revue (article de synthèse) hal-01608800v1
Identification and characterization of copy number variations in cattle Rabia Letaief,Diane Esquerre,Johanna Barbieri,Cécile Grohs,Sebastien Fritzet al. Journal of Animal Science, 2016, 94, pp.183-183. ⟨10.2527/jas2016.94supplement4183a⟩ Article dans une revue hal-01605684v1
A reverse genetic approach identifies an ancestral frameshift mutation in RP1 causing recessive progressive retinal degeneration in European cattle breeds Pauline Michot,Sabine Chahory,Andrew Marete,Cécile Grohs,Dimitri Dagioset al. Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.56. ⟨10.1186/s12711-016-0232-y⟩ Article dans une revue hal-01479315v1
Les anomalies génétiques chez les espèces d’élevage - Avant-propos Didier Boichard,Aurélien Capitan,Coralie Danchin-Burge,Cécile Grohs INRAE Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.293-296. ⟨10.20870/productions-animales.2016.29.5.2995⟩ Article dans une revue hal-04045143v1
Les anomalies génétiques : définition, origine, transmission et évolution, mode d’action Didier Boichard,Cécile Grohs,Coralie Danchin-Burge,Aurelien Capitan INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.297-306 Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602233v1
Anticiper l'émergence d'anomalies génétiques grâce aux données génomiques Sebastien Fritz,Pauline Michot,Chris Hoze,Cécile Grohs,Anne Barbatet al. INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.339-350 Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602234v1
Dossier : Anomalies génétiques - Avant-propos Didier Boichard,Aurelien Capitan,Coralie Danchin-Burge,Cécile Grohs INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.293-295 Article dans une revue hal-01533956v1
Prise en compte des anomalies génétiques en sélection : le cas des bovins Didier Boichard,Cécile Grohs,Pauline Michot,Coralie Danchin-Burge,Aurelien Capitanet al. INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.351-358 Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602349v1
L’Observatoire National des Anomalies Bovines, son action et ses résultats pour une aide efficace à la gestion des anomalies génétiques Cécile Grohs,Amandine Duchesne,Sandrine Floriot,Marie-Christine Deloche,Didier Boichardet al. INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.307-318 Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602238v1
Genome-wide study of structural variants in bovine Holstein, Montbéliarde and Normande dairy breeds Mekki Boussaha,Diane Esquerre,Johanna Barbieri,Anis Djari,Alain Pintonet al. PLoS ONE, 2015, 10 (8), pp.1-21. ⟨10.1371/journal.pone.0135931⟩ Article dans une revue hal-01194172v1
Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 23 of the [i]integrin beta 4[/i] gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa Pauline Michot,Oscar Fantini,Régis Braque,Aurélie Allais-Bonnet,Romain Saintilanet al. Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.1-7. ⟨10.1186/s12711-015-0110-z⟩ Article dans une revue hal-01194111v1
Whole-genome sequencing of 234 bulls facilitates mapping of monogenic and complex traits in cattle Hans D Daetwyler,Aurelien Capitan,Hubert Pausch,Paul Stothard,Rianne van Binsbergenet al. Nature Genetics, 2014, 46 (8), pp.858-865. ⟨10.1038/ng.3034⟩ Article dans une revue hal-01193853v1
Novel insights into the bovine polled phenotype and horn ontogenesis in Bovidae Aurélie Allais-Bonnet,Cécile Grohs,Ivica I. Medugorac,Stefan S. Krebs,Anis Djariet al. PLoS ONE, 2013, 8, online (5), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0063512⟩ Article dans une revue hal-01000794v1
Detection of haplotypes associated with prenatal death in dairy cattle and identification of deleterious mutations in GART, SHBG and SLC37A2 Sebastien S. Fritz,Aurelien A. Capitan,Anis Djari,Sabrina S. Rodriguez,Anne Barbatet al. PLoS ONE, 2013, 8, online (6), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0065550⟩ Article dans une revue hal-01000118v1
Characterization of bovine FUT7 furthers understanding of FUT7 evolution in mammals Benoît B. Laporte,Daniel Petit,Dominique Rocha,Mekki Boussaha,Cécile Grohset al. BMC Genetics, 2012, 13 (august), Non paginé. ⟨10.1186/1471-2156-13-74⟩ Article dans une revue hal-01001227v1
A 3.7 Mb deletion encompassing ZEB2 causes a novel polled and multisystemic syndrome in the progeny of a somatic mosaic bull Aurelien Capitan,Aurélie Allais-Bonnet,Alain Pinton,Brigitte Marquant-Le Guienne,Daniel Le Bourhiset al. PLoS ONE, 2012, 7, online (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0049084⟩ Article dans une revue hal-01019835v1
A newly described bovine type 2 scurs syndrome segregates with a frame-shift mutation in TWIST1 Aurelien A. Capitan,Cécile Grohs,Bernard B. Weiss,Marie-Noëlle M.-N. Rossignol,Patrick P. Reverseet al. PLoS ONE, 2011, 6 (7), pp.1 - 8. ⟨10.1371/journal.pone.0022242⟩ Article dans une revue hal-01000725v1
The scurs inheritance: new insights from the French Charolais breed Aurelien Capitan,Cécile Grohs,Mathieu Gautier,Andre Eggen BMC Genetics, 2009, 10, online (july), Non paginé. ⟨10.1186/1471-2156-10-33⟩ Article dans une revue hal-01193369v1
A Generalized Caprine-like Hypoplasia Syndrome is localized within a 6-cM interval on bovine chromosome 13 in the Montbeliarde breed Amandine Duchesne,L Manciaux,M Gautier,Sandrine Floriot,Cécile Grohset al. Animal Genetics, 2008, 39 (2), pp.112-120. ⟨10.1111/j.1365-2052.2007.01688.x⟩ Article dans une revue hal-02659723v1
Genetic and haplotypic structure in 14 European and African cattle breeds Mathieu M. Gautier,Thomas Faraut,Katayoun Moazami-Goudarzi,Vincent Navratil,Mario Foglioet al. Genetics, 2007, 177, pp.1059-1070 Article dans une revue hal-02660515v1
Identification of a doublet missense substitution in the bovine LRP4 gene as a candidate causal mutation for syndactyly in Holstein cattle. Amandine Duchesne,Mathieu M. Gautier,Sead Chadi,Cécile Grohs,Sandrine Floriotet al. Genomics, 2006, 88, pp.610-621 Article dans une revue hal-02657118v1
A first-generation microsatellite-based integrated genetic and cytogenetic map for the European rabbit ( Oryctolagus cuniculus) and localization of angora and albino Céline Chantry-Darmon,Celine C. Urien,Hubert de Rochambeau,Daniel D. Allain,Bérengère Pena-Arnaudet al. Animal Genetics, 2006, 37, pp.335-341 Article dans une revue hal-02659000v1
Identification of a doublet missense substitution in the bovine LRP4 gene as a candidate causal mutation for syndactyly in Holstein cattle Amandine Duchesne,Mathieu Gautier,Sead Chadi,Cécile Grohs,Sandrine Floriotet al. Genomics, 2006, 88 (5), pp.610-621. ⟨10.1016/j.ygeno.2006.05.007⟩ Article dans une revue hal-02657088v1
Fine mapping and physical characterization of two linked Quantitative Trait Loci affecting milk fat yield in dairy cattle on BTA26. Mathieu M. Gautier,R. Roy Barcelona,Sebastien S. Fritz,Cécile Grohs,Tom T. Druetet al. Genetics, 2006, 172, pp.425-436 Article dans une revue hal-02653456v1
Detection of genes influencing economic traits in three French dairy cattle breeds Didier Boichard,Cécile Grohs,Florence Bourgeois,Frédérique Cerqueira,Rémi Faugeraset al. Genetics Selection Evolution, 2003, 35 (1), pp.77-101. ⟨10.1051/gse:2002037⟩ Article dans une revue hal-00894436v1
Combined analysis of data from two granddaughter designs: a simple strategy for QTL confirmation and increasing experimental power in dairy cattle. J. Bennewitz,N. Reinsch,Cécile Grohs,Hubert H. Levéziel,A. Malafosseet al. Genetics Selection Evolution, 2003, 35, pp.319-338 Article dans une revue hal-01211860v1
Combined analysis of data from two granddaughter designs: A simple strategy for QTL confirmation and increasing experimental power in dairy cattle Jörn Bennewitz,Norbert Reinsch,Cécile Grohs,Hubert Levéziel,Alain Malafosseet al. Genetics Selection Evolution, 2003, 35 (3), pp.319-338. ⟨10.1051/gse:2003011⟩ Article dans une revue hal-00894449v1
La recherche de QTL à l'aide de marqueurs : résultats chez les bovins laitiers Didier Boichard,Cécile Grohs,F. Cerqueira,Remy Faugeras,André Neauet al. Productions Animales, 2000, HS 2000, pp.217-222 Article dans une revue hal-02685086v1
Genomic identification of the breed of an individual or its tissue. R. Ciampolini,Hubert H. Levéziel,E. Mazzanti,Cécile Grohs,D. Cianci Meat Science, 2000, 54, pp.35-40 Article dans une revue hal-01211832v1
Refined mapping of the bovine C blood-group system (EAC) on BTA18 K. Saunier,Hubert Levéziel,E. Petit,Cécile Grohs,Guy Noéet al. Animal Genetics, 1996, 27 (Suppl-2), pp.63 Article dans une revue hal-02685244v1
Analysis of genetic variability within the Piemontese cattle breed using microsatellite polymorphisms and research of association between individual multilocus genotypes and quantitative traits. R. Ciampolini,E. Mazzanti,Hubert H. Levéziel,Cécile Grohs,D. Cianci Animal Genetics, 1996, suppl. 2, pp.101-102 Article dans une revue hal-02685679v1
Refined mapping of the bovine C blood group system (EAC) on BTA18. K. Saunier,Hubert H. Levéziel,Elisabeth Petit,Cécile Grohs,Guy Noéet al. Animal Genetics, 1996, suppl. 2, pp.63 Article dans une revue hal-02691329v1
A genetic and physical map of bovine chromosome 3 Daniel Vaiman,Andre A. Eggen,D. Mercier,I. Bahri-Darwich,Cécile Grohset al. Animal Genetics, 1995, 26, pp.21-25 Article dans une revue hal-02707094v1
A microsatellite within the bovine kappa-casein gene reveals a polymorphism correlating strongly with polymorphisms previously described at the protein as well as the DNA level Hubert Levéziel,C. Rodellar,Christine Leroux,L. Pépin,Cécile Grohset al. Animal Genetics, 1994, 25 (4), pp.223-228 Article dans une revue hal-02708503v1
Emploi de microsatellites pour l'analyse de la diversité génétique des races bovines françaises : premiers résultats Katayoun Moazami-Goudarzi,Daniel Vaiman,D. Mercier,Cécile Grohs,J-Pierre J.-P. Furetet al. Genetics Selection Evolution, 1994, 26 (suppl1), pp.155s-165s Article dans une revue hal-02714932v1
A genetic and physical map of bovine Chromosome 11. Daniel Vaiman,D. Mercier,Andre A. Eggen,I. Bahri-Darwich,Cécile Grohset al. Mammalian Genome, 1994, 5, pp.553-556 Article dans une revue hal-02705857v1
Conservation of a syntenic group of microsatellite loci between cattle and sheep. Daniel Vaiman,M. Imam Ghali,Katayoun Moazami-Goudarzi,Gérard Guérin,Cécile Grohset al. Mammalian Genome, 1994, 5, pp.310-314 Article dans une revue hal-02709369v1
Genotyping of the bovine beta-casein C allele by amplification created restriction site. R. Velmala,Cécile Grohs,M Francois Mahe,S. Lien,Hubert H. Levéziel Animal Genetics, 1994, 25, pp.429 Article dans une revue hal-02709638v1
Emploi de microsatellites pour l'analyse de la diversité génétique des races bovines françaises : premiers résultats Katayoun Moazami-Goudarzi,D Vaiman,D Mercier,Cécile Grohs,Jp Furetet al. Genetics Selection Evolution, 1994, 26 (Suppl1), pp.155s-165s Article dans une revue hal-00894061v1
Characterization of five new bovine dinucleotide repeats. Daniel Vaiman,R. Osta,D. Mercier,Cécile Grohs,Hubert H. Levéziel Animal Genetics, 1992, 23, pp.537-541 Article dans une revue hal-02700207v1
Characterization of a set of bovine (TG)n microsatellites : allelic frequencies in french and italian cattle breeds Daniel Vaiman,Katayoun Moazami-Goudarzi,R. Osta,Cécile Grohs,R. Ciampoliniet al. Animal Genetics, 1992, 23 (1s), pp.64 Article dans une revue hal-02700535v1

Communication dans un congrès (41)

A Cattle Pangenome Approach Reveals Novel Non-Reference Unique Insertions and Their Impact on Economic Traits Valentin Sorin,Florian Besnard,Cécile Grohs,Clémentine Escouflaire,Sébastien Fritzet al. Plant and Animal Genome Conference, Jan 2026, San Diego (CA), United States Communication dans un congrès hal-05537087v1
Integrating Structural Variants into Sequence-Based GWAS Using a Pangenome and Imputation Framework in Dairy Cattle Maulana Mughitz,Valentin Sorin,Cecile Grohs,Sébastien Fritz,Christophe Kloppet al. Plant and Animal Genome Conference, Jan 2026, San Diego (CA), United States Communication dans un congrès hal-05537063v1
Detection and characterization of cytogenetic defects in cattle using large genotypic and phenotypic data sets generated for genomic evaluation Jeanlin Jourdain,Harmonie Barasc,Sébastien Fritz,Clémentine Escouflaire,Anne Barbatet al. 25th International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jun 2024, Naples, Italy Communication dans un congrès hal-04726165v1
Search for new mutations in cattle by systematic whole genome resequencing Mekki Boussaha,C Eché,C Iampietro,C Grohs,A Capitanet al. 74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, INRAE, Aug 2023, Lyon, France. ⟨10.3920/978-90-8686-936-7⟩ Communication dans un congrès hal-04195854v1
Detection of interchromosomal rearrangements in bulls using large genotype and phenotype datasets J Jourdain,H Barasc,T Faraut,C Grohs,C Donnadieuet al. 74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, INRAE, Aug 2023, Lyon, France. ⟨10.3920/978-90-8686-936-7⟩ Communication dans un congrès hal-04195876v1
ITGA6 homozygous splice-site mutation causes junctional epidermolysis bullosa in Charolais cattle Cécile Grohs,Mekki Boussaha,Arnaud Boulling,Valérie Wolgust,Lorraine Bourgeois-Brunelet al. Book of Abstracts of the 74. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, INRAE, Aug 2023, Lyon, France. pp.524 Communication dans un congrès hal-04200626v1
Improvement of the Bos taurus Genome Assembly using New Sequencing Technologies Camille Eché,Carole Iampietro,Clement Birbes,Andreea Dreau,Claire Kuchlyet al. Discoveries Roadshow 2023 - PacBio, PacBio, May 2023, Paris, France Communication dans un congrès hal-04096124v1
Massive detection of cryptic recessive genetic defects in livestock mining millions of life trajectories Ana Guintard,Florian Besnard,Margarita Cano,Chris Hoze,Hélène Leclercet al. 12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-03731359v1
Detailed analysis of mortality rates in the female progeny of Holstein bulls allows the discovery of new dominant genetic defects Florian Besnard,Hélène Leclerc,Nora Cesbron,Mekki Boussaha,Cécile Grohset al. 12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-03731355v1
A de novo missense mutation of COL1A1 causes Osteogenesis Imperfecta type 2 and premature delivery in Normande Cattle Cécile Grohs,Julien Corbeau,Jeanlin Jourdain,Mekki Boussaha,Vincent Plassardet al. 12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands. ⟨10.15454/BRKOV3⟩ Communication dans un congrès hal-03731343v1
New insights into resistance to paratuberculosis from sequence-based GWAS in Holstein cattle Marie-Pierre Sanchez,Raphaël Guatteo,Arnaud Delafosse,Aurore Davergne,Cécile Grohset al. 72nd Annual Meeting EAAP, Aug 2021, Davos, Switzerland Communication dans un congrès hal-03336111v1
Sequence-based association study of resistance to paratuberculosis in Holstein and Normande cattle Marie-Pierre Sanchez,Raphaël R. Guatteo,A. Davergne,Cécile Grohs,Sébastien Taussatet al. 69. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2018, Dubrovnik, Croatia Communication dans un congrès hal-02736321v1
Genome-wide study of structural variants in French dairy and beef breeds Didier Boichard,Mekki Boussaha,Cécile Grohs,Rabia Letaief,Sebastien Fritzet al. 69. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2018, Dubrovnik, Croatia Communication dans un congrès hal-02736390v1
Experience from large scale use of the EuroGenomics custom SNP chip in cattle Didier Boichard,Mekki Boussaha,Aurelien Capitan,Dominique Rocha,Chris Hozeet al. 11. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, New Zealand Communication dans un congrès hal-02737523v1
Prise en compte des gènes d’intérêt dans les objectifs de sélection en bovins laitiers Chris Hoze,Sebastien Fritz,Aurélia Baur,Cécile Grohs,Coralie Danchin-Burgeet al. 24. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants (3R), Dec 2018, Paris, France Communication dans un congrès hal-02735939v1
Whole genome association analysis of resistance / susceptibility to paratuberculosis in French Holstein and Normande cattle Marie-Pierre Sanchez,Raphaël R. Guatteo,A. Davergne,Cécile Grohs,Aurelien A. Capitanet al. 13. International Colloquium on Paratuberculosis, Jun 2016, Nantes, France Communication dans un congrès hal-02742839v1
GWAS of resistance to paratuberculosis in French Holstein and Normande cattle breeds Marie-Pierre Sanchez,Raphaël R. Guatteo,A. Davergne,Cécile Grohs,Aurelien Capitanet al. 67. Annual meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP 2016), Aug 2016, Belfast, United Kingdom. 684 p Communication dans un congrès hal-02742788v1
The French observatory on genetic defect: an assessment after 15 years of operation Coralie Danchin-Burge,Cécile Grohs 67. Annual meeting of the European Federation of Animal Science EAAP 2016, Aug 2016, Belfast, Ireland. 1 p Communication dans un congrès hal-01532630v1
Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 22 of the integrin beta 4 gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa Pauline Michot,Oscar Fantini,Régis Braques,Aurélie Allais-Bonnet,Romain Saintilanet al. 23. Plant and Animal Genome, Jan 2015, San Diego, United States. 1 p Communication dans un congrès hal-01194035v1
Intérêt du séquençage de génome complet pour la détection précoce des anomalies génétiques Pauline Michot,S Chahory,M. Chambrial,Sarah Barbey,Cécile Grohset al. 22. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2015, Paris, France. 409 p Communication dans un congrès hal-02742342v1
Rapid discovery of mutations responsible for sporadic dominant genetic defects in livestock using genome sequence data: enhancing the value of farm animals as model species Aurelien Capitan,Pauline Michot,François Guillaume,Cécile Grohs,Anis Djariet al. 10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada Communication dans un congrès hal-01193912v1
Identification de QTL associés à de la mortalité embryonnaire chez les bovins laitiers Sébastien Fritz,Aurelien Capitan,Anis Djari,Cécile Grohs,Mekki Boussahaet al. 20. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2013, Paris, France. pp.145-148 Communication dans un congrès hal-01189868v1
Identification of five novel mutations responsible for prenatal mortality in dairy cattle Sebastien Fritz,Aurelien Capitan,Anis Djari,Sabrina Rodriguez,Anne Barbatet al. International Plant & Animal Genome XXI, Jan 2013, San Diego, CA, United States Communication dans un congrès hal-01019848v1
Identification of six mutations responsible for prenatal mortality in dairy cattle Didier Boichard,Aurelien Capitan,Anis Djari,S.C. Rodriguez,Anne Barbatet al. 64th Annual Meeting European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. pp.231 Communication dans un congrès hal-01190515v1
Détection de QTL influençant l'aptitude à la transformation fromagère des laits dans un croisement Holstein Normande. Helene H. Larroque,Yves Y. Gallard,Agnès Delacroix-Buchet,Cyrille Bach,J.C. Ogieret al. 14e Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2007, Paris, France Communication dans un congrès hal-02754003v1
Carte génétique du lapin : Etat des lieux et perspectives Céline Chantry-Darmon,Celine C. Urien,Hubert de Rochambeau,Daniel D. Allain,Bérengère Pena-Arnaudet al. 11. journées de la Recherche Cunicole, Nov 2005, Paris, France Communication dans un congrès hal-02762965v1
Controlling genetic disorders in the french dairy cattle population Andre A. Eggen,Amandine Duchesne,Pascal Laurent,Cécile Grohs,Catherine C. Deniset al. 29. International Conference on International Society of Animal Genetics, International Society for Animal Genetics (ISAG). INT., Sep 2004, Tokyo, Japan Communication dans un congrès hal-02762175v1
Establishment of a first generation microsatellite-based genetic map in the rabbit Céline Chantry-Darmon,Hélène Hayes,Maud Bertaud,Celine C. Urien,J-Claude Saveet al. 29. International Conference on International Society of Animal Genetics, Sep 2004, Tokyo, Japan Communication dans un congrès hal-02761910v1
Cartographie fine d'un QTL intervenant sur la fertilité femelle chez les bovins laitiers. Mathieu M. Gautier,Sebastien S. Fritz,Cécile Grohs,Didier Boichard,Andre A. Eggen 10èmes Rencontres Recherches Ruminants, 34 décembre 2003, Dec 2003, Paris, France Communication dans un congrès hal-02760103v1
La syndactylie en race Holstein : identification de marqueurs génétiques et caractérisation de gènes candidats. Vers une éradication de l'anomalie de nos cheptels Amandine Duchesne,Mathieu M. Gautier,Cécile Grohs,Fabienne Le Provost,Isabelle Hueet al. 10. Rencontres autour de Recherches sur les Ruminants, Dec 2003, Paris, France Communication dans un congrès hal-02762850v1
Détection de gènes influençant les caractères d'importance économique en races bovines Prim'Holstein, Normande et Montbéliarde Didier Boichard,Cécile Grohs,S. Bourgeois,F. Cerqueira,Remy Faugeraset al. 6. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, 1999 Communication dans un congrès hal-02770127v1
La recherche de QTL à l'aide de marqueurs : résultats chez les bovins laitiers. Didier Boichard,Cécile Grohs,F. Bourgeois,F. Cerqueira,Remy Faugeraset al. Séminaire, La génétique moléculaire et ses applications, Sep 1999, Cap d Agde, France Communication dans un congrès hal-02771694v1
Approche du gène &quot;sans corne&quot; en race bovine Charolaise française et perspective pour la sélection Andre A. Eggen,P Sibille,L Chopard,Hubert Levéziel,E. Petitet al. 4. Rencontres autour des recherches sur les ruminants, Dec 1997, Paris, France Communication dans un congrès hal-02841950v1
Analysis of genetic variability within the Piemontese cattle breed using microsatellite polymorphisms and research of association between individual multilocus genotypes and quantitative traits. R. Ciampolini,E. Mazzanti,Hubert H. Levéziel,Cécile Grohs,D. Cianci XXV International Conference on Animal Genetics, Jul 1996, Tours Communication dans un congrès hal-02765068v1
Refined mapping of the bovine C blood group system (EAC) on BTA18. K. Saunier,Hubert H. Levéziel,Elisabeth Petit,Cécile Grohs,Guy Noéet al. XXV International Conference on Animal Genetics, Jul 1996, Tours Communication dans un congrès hal-02764648v1
Refined mapping of the bovine C blood-group system (EAC) on BTA18 K. Saunier,Hubert Levéziel,E. Petit,Cécile Grohs,Guy Noéet al. 25. Conference of the International Society for Animal Genetics, Jul 1996, Tours, France Communication dans un congrès hal-02834529v1
Analyse des relations génétiques entre des races bovines françaises à l'aide de marqueurs moléculaires Katayoun Moazami-Goudarzi,J.P. Furet,Cécile Grohs,Hubert Levéziel,Patrice Martin 2. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, 1995, Paris, France Communication dans un congrès hal-02772088v1
Emploi de microsatellites pour l'analyse de la diversité génétique des races bovines françaises : premiers résultats Katayoun Moazami-Goudarzi,Daniel Vaiman,D. Mercier,Cécile Grohs,J-Pierre J.-P. Furetet al. Colloque BRG/INRA. Ressources génétiques animales et végétales. Méthodologies d'étude et de gestion, Sep 1993, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02846604v1
Use of microsatellites to investigate genetic diversity in four Italian beef cattle breeds. R. Ciampolini,Cécile Grohs,Daniel Vaiman,R. Leotta,Hubert H. Levézielet al. XXIV International Conference on Animal Genetics, Jul 1994, Prague Communication dans un congrès hal-02772247v1
Emploi de microsatellites pour l'analyse de la diversité génétique des races bovines françaises : premiers résultats. Katayoun Moazami-Goudarzi,Daniel Vaiman,D. Mercier,Cécile Grohs,J-Pierre J.-P. Furetet al. Colloque BRG/INRA, Ressources génétiques animales et végétales. Méthodologies d'étude et de gestion, 1993, Montpellier Communication dans un congrès hal-02778105v1
Characterization of a set of bovine (TG)n microsatellites : allelic frequencies in french and italian cattle breeds Daniel Vaiman,Katayoun Moazami-Goudarzi,R. Osta,Cécile Grohs,R. Ciampoliniet al. 23. Conference of the International Society for Animal Genetics, Aug 1992, Interlaken, Switzerland Communication dans un congrès hal-02844237v1

Poster de conférence (13)

Major contribution to the bovine pangenome: whole genome sequences, SNPs, and structural variants of 154 bulls from 14 breeds Amandine Suin,Camille Marcuzzo,Camille Eché,Andreea Dréau,Clément Birbeset al. Plant and Genome San Diego 2024, Jan 2024, San Diego, United States Poster de conférence hal-04432840v1
A Bos taurus sequencing methods benchmark for assembly, haplotyping, and variant calling Camille Eché,Carole Iampietro,Clément Birbes,Andreea Dréau,Claire Kuchlyet al. Plant and Genome San Diego 2024, Jan 2024, San Diego, United States. 10, 2024 Poster de conférence hal-04432803v1
Search for new mutations in cattle by systemac whole genome resequencing Mekki Boussaha,Camille Eché,Clémentine Escouflaire,Cécile Grohs,Carole Iampietroet al. 39th International Society of Animal Genetics Conference, Jul 2023, Cape Town, South Africa Poster de conférence hal-04170956v1
ITGA6 homozygous splice-site mutation causes junctional epidermolysis bullosa in Charolais cattle Cécile Grohs,Mekki Boussaha,Arnaud Boulling,Valérie Wolgust,Lorraine Bourgeois-Brunelet al. Joint International congress on animal science 2023, Aug 2023, Lyon (Centre des Congrès), France. , 2023 Poster de conférence hal-04728107v1
De novo assembly of 90 bovines genomes using PacBio CLR application comparison and optimization Camille Marcuzzo,Amandine Suin,Camille Eché,Andreea Dreau,Clément Birbeset al. Assemblée générale France Génomique, Jun 2022, Paris, France Poster de conférence hal-04590746v1
De novo assembly of bovine genome using PacBio applications Camille Eché,Clément Birbes,Carole Iampietro,Andreea Dréau,Claire Kuchlyet al. SMRT Leiden 2021 – Young Investigator Virtual Conference, May 2021, virtuel, Netherlands Poster de conférence hal-03541224v1
A Long Read project to find optimal technologic combinations for genome assembly and variability, epigenetic marks detection and metagenomic analysis Carole Iampietro,Camille Eché,Adrien Castinel,Rémy-Félix Serre,Christophe Kloppet al. PAG XXVIII, Plant and Animal Genome, Jan 2020, San Diego, United States. 2020 Poster de conférence hal-02947690v1
Phénotypage de l’épilepsie en race Parthenaise : étude rétrospective Anne A. Relun,Aurelien Capitan,Cécile Grohs,Pauline Michot,Vincent Loiseauet al. 24. Rencontres Recherches Ruminants (3R), Dec 2018, Paris, France. , 24 (24ème ed.), 2018, Rencontres Recherches Ruminants (3R) Poster de conférence hal-02734061v1
Reverse genetics to describe a recessive defect in different breeds Didier Boichard,Cécile Grohs 68. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2017, Tallinn, Estonia. , 2017, Book of Abstracts of the 68th annual meeting of the Federation of Animal Science (EAAP) Poster de conférence hal-01604566v1
Causes de la mortalité embryonnaire ou fœtale de 2 mutants bovins Aurelien Capitan,Daniel Le Bourhis,Brigitte Le Guienne,Christophe Richard,Cécile Grohset al. Journées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase 2016), Apr 2016, Tours, France. , 115 p., 2016, Crédits Incitatifs financés entre 2011 et 2014 Poster de conférence hal-01533874v1
Large-scale identification of the causative genetic variants influencing traits of economic interest in French dairy breeds Didier Boichard,Olivier Bouchez,Aurelien Capitan,Anis Djari,Diane Esquerreet al. Plant and Animal Genome, Jan 2012, San Diego, United States. 2012 Poster de conférence hal-01190277v1
Novel models and strategies to unravel the genetic pathways involved in horn ontogenesis Aurelien Capitan,Cécile Grohs,Agnès Bonnet,Alain Pinton,Brigitte Leguienneet al. Plant and Animal Genome, Jan 2012, San Diego, United States. 2012 Poster de conférence hal-01190273v1
Hybridization-based targeted enrichment and second generation sequencing applied to domestic animals Per Wahlberg,Aurelien A. Capitan,Marie-Thérèse Bihoreau,Sabrina Rodriguez,Cécile Grohset al. 32nd Conference of the International Society of Animal Genetics (ISAG), Jul 2010, Edinburgh, United Kingdom. 2010 Poster de conférence hal-02823465v1

Rapport (1)

DNA isolation from cattle semen for long read sequencing v1 Erwan Denis,Cécile Grohs,Carole Iampietro 2024 Rapport (typdoc.RESPROT) hal-04414012v1

Pré-publication, Document de travail (1)

A bovine model of rhizomelic chondrodysplasia punctata caused by a deep intronic splicing mutation in the GNPAT gene Arnaud Boulling,Julien Corbeau,Cécile Grohs,Anne Barbat,Jérémy Mortieret al. 2024 Pré-publication, Document de travail hal-04702979v1