Cécile Guichard

Publications

Article dans une revue (10)

A comprehensive map of preferentially located motifs reveals distinct proximal cis -regulatory elements in plants Julien Rozière,Cécile Guichard,Véronique Brunaud,Marie-Laure Martin,Sylvie Coursol Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.976371. ⟨10.3389/fpls.2022.976371⟩ Article dans une revue hal-04400803v1
Extensive nuclear reprogramming and endoreduplication in mature leaf during floral induction Stefania del Prete,Anne Molitor,Delphine Charif,Nadia Bessoltane-Bentahar,Ludivine Soubigou-Taconnatet al. BMC Plant Biology, 2019, 19, pp.135. ⟨10.1186/s12870-019-1738-6⟩ Article dans une revue hal-02618994v1
A systems biology approach uncovers a gene co-expression network associated with cell wall degradability in maize Clément Cuello,Aurélie Baldy,Véronique Brunaud,Johann Joets,Etienne Delannoyet al. PLoS ONE, 2019, 14 (12), pp.e0227011. ⟨10.1371/journal.pone.0227011⟩ Article dans une revue hal-02429157v1
A new version of the grapevine reference genome assembly (12X.v2) and of its annotation (VCost.v3) Aurelie Canaguier,Jérome Grimplet,Gabriele Di Gaspero,Simone Scalabrin,Eric Duchêneet al. Genomics Data, 2017, 14, pp.56-62. ⟨10.1016/j.gdata.2017.09.002⟩ Article dans une revue (data paper) hal-01619926v1
Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies. Christophe Plomion,Jean-Marc Aury,Joëlle Amselem,Tina Alaeitabar,Valérie Barbeet al. Molecular Ecology Resources, 2015, 16 (1), pp.254-265. ⟨10.1111/1755-0998.12425⟩ Article dans une revue istex hal-01579667v1
GEM2Net: from gene expression modeling to -omics networks, a new CATdb module to investigate Arabidopsis thaliana genes involved in stress response Rim Zaag,Jean-Philippe Tamby,Cecile Guichard,Zakia Tariq,Guillem Rigaillet al. Nucleic Acids Research, 2015, 43 (Database issue), pp.D1010-D1017. ⟨10.1093/nar/gku1155⟩ Article dans une revue hal-01137554v1
Exploration of plant genomes in the FLAGdb++ environment Sandra S. Derozier,Franck F. Samson,Jean-Philippe Tamby,Cecile C. Guichard,Veronique V. Brunaudet al. Plant Methods, 2011, 7 (8), 10 p. ⟨10.1186/1746-4811-7-8⟩ Article dans une revue hal-02652189v1
Patterns of sequence polymorphism in the fleshless berry locus in cultivated and wild Vitis vinifera accessions Cléa Houel,Rémi Bounon,Jamila Chaïb,Cecile C. Guichard,Jean-Pierre Peroset al. BMC Plant Biology, 2010, 10 (284), pp.1-15. ⟨10.1186/1471-2229-10-284⟩ Article dans une revue hal-02657182v1
A physical map of the heterozygous grapevine 'Cabernet Sauvignon' allows mapping candidate genes for disease resistance Marco Moroldo,Sophie Paillard,Raffaella Marconi,Fabrice Legeai,Aurélie Canaguieret al. BMC Plant Biology, 2008, 8 (66), pp.1-14. ⟨10.1186/1471-2229-8-66⟩ Article dans une revue inria-00329169v1
UTILLdb, a Pisum sativum in silico forward and reverse genetics tool Marion M. Dalmais,Julien Schmidt,Christine Le Signor,Francoise Moussy,Judith Burstinet al. Genome Biology, 2008, 9 (2), R43, 12p. ⟨10.1186/gb-2008-9-2-r43⟩ Article dans une revue hal-02666957v1

Communication dans un congrès (12)

Plant-PLMview: a web-tool and in silico method for identifying cis-regulatory elements in gene-proximal regions of plants Julien Rozière,Franck Samson,Cécile Guichard,Margot Correa,Sylvie Coursolet al. Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques (JOBIM), SFBI, Jul 2025, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-05163963v1
Detection of preferentially located DNA motifs reveals distinct cis-regulatory sequences in gene-proximal regions of Arabidopsis thaliana and maize Julien Rozière,Franck Samson,Cécile Guichard,Margot Correa,Véronique Brunaudet al. 65th Annual Maize Genetics Meeting, Maize Genetics Cooperation, Inc, Mar 2023, Saint-Louis (M0), United States Communication dans un congrès hal-05161597v1
A MAP OF GENE-PROXIMAL CIS-REGULATORY SEQUENCES IN THE ARABIDOPSIS AND MAIZE GENOMES Julien Rozière,Cécile Guichard,Véronique Brunaud,Marie-Laure Martin,Sylvie Coursol 13th International Conference of the French Society of Plant Biology, Christian Dubos, Aug 2022, Montpellier (Centre Agropolis), France Communication dans un congrès hal-05161601v1
PLMdetect: a bioinformatic approach to identify cis-regulatory motifs in promoters of Plant genomes. Julien Rozière,Cecile C. Guichard,Margot Correa,Sylvie Coursol,Marie-Laure Martin-Magnietteet al. 2nd International Conference on Plant & Molecular Biology, Oct 2019, Amsterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-02955246v1
From gene expression modeling to gene network to investigate Arabidopsis thaliana genes involved in stress response Rim Zaag,Jean-Philippe Tamby,Cécile Guichard,Zakia Tariq,Sébastien Aubourget al. The 26th international conference on Arabidopsis research (ICAR2015), Jul 2015, Paris, France Communication dans un congrès hal-04671451v1
Toward the deciphering of chromosome structure in Vitis vinifera Aurelie A. Canaguier,Isabelle I. Le Clainche,Aurélie A. Berard,Aurelie A. Chauveau,Marie-Stéphanie Vernereyet al. 10. International Conference on Grapevine Breeding and Genetics, Aug 2010, Geneva, New York, United States Communication dans un congrès hal-02739605v1
Sequencing allelic BACs for exploring the level of genome heterozygosity in oak Patricia P. Faivre-Rampant,Nathalie N. Pavy,Isabelle I. Le Clainche,Aurelie A. Canaguier,Cecile C. Guichardet al. IUFRO working group "Genetics of Quercus and Nothofagus", Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p Communication dans un congrès hal-00964429v1
Physical mapping and re-sequencing of a set of resistance related genes in grapevine Marco Moroldo,Sophie Paillard,R. Marconi,Fabrice Legeai,Aurelie Canaguieret al. 17. Conference Plant and Animal Genomes, Labo/service de l'auteur, Ville service, Pays service., Jan 2009, San Diego, United States. 1 p Communication dans un congrès hal-01462667v1
Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers Patricia P. Faivre-Rampant,Alois Bresson,Véronique Jorge,Arnaud Dowkiw,Redouane R. El-Malkiet al. Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. 84 p Communication dans un congrès hal-02750107v1
Allele mining in grape for the analysis of complex traits Roberto Bacilieri,Stephane Nicolas,Richard Bounon,Alexis Dereeper,Marie-Christine Le Paslieret al. 18. Conference, Jan 2010, San Diego, United States Communication dans un congrès hal-02754346v1
Structural and functional genomics in grapevine through FLAGdb++ Sandra S. Derozier,Cecile C. Guichard,Franck F. Samson Jobim2010, Sep 2010, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02757685v1
Genomic ressources for pea Marion M. Dalmais,Julien Schmidt,Christine Le Signor,Francoise Moussy,Judith Burstinet al. 6. European Conference on Grain Legumes "Integrating legume biology for sustainable agriculture", Nov 2007, Lisbon, Portugal. 199 p Communication dans un congrès hal-02754438v1

Poster de conférence (2)

A comprehensive map of preferentially located motifs reveals novel proximal cis-regulatory elements in plants Julien Rozière,Cécile Guichard,Véronique Brunaud,Marie-Laure Martin,Sylvie Coursol Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. , 2022 Poster de conférence hal-05161617v1
Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers Alois Bresson,Véronique Jorge,Arnaud Dowkiw,Redouane R. El-Malki,Vincent Seguraet al. Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité, 84 p., 2011, Les ressources génétiques face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociaux Poster de conférence hal-02749127v1

Proceedings/Recueil des communications (1)

Pea TILLING platform Marion M. Dalmais,Julien Schmidt,Christine Le Signor,Francoise Moussy,Judith Burstinet al. 6. European Conference on Grain Legumes "Integrating legume biology for sustainable agriculture", Nov 2007, Lisbon, Portugal. European Conference on Grain Legumes, 199 p., 2007 Proceedings/Recueil des communications hal-02822350v1