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Cédric Midoux

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Affiliations actuelles
  • 1002496
  • 1002434
  • 1169987
Identifiants chercheurs
  • IdHAL cedric-midoux
  • ORCID 0000-0002-7964-0929
  • Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=lAzGLCIAAAAJ&hl=fr
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Publications

olivier-rue
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Mining the equine gut metagenome: poorly-characterized taxa associated with cardiovascular fitness in endurance athletes

Núria Mach , Cédric Midoux , Sébastien Leclercq , Samuel Pennarun , Laurence Le Moyec
Communications Biology, 2022, 5, pp.1032. ⟨10.1038/s42003-022-03977-7⟩
Article dans une revue hal-03794437v2
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Virulent Phages Isolated from a Smear-Ripened Cheese Are Also Detected in Reservoirs of the Cheese Factory

Thomas Paillet , Julien Lossouarn , Clarisse Figueroa , Cédric Midoux , Olivier Rué
Viruses, 2022, 14 (8), pp.1620. ⟨10.3390/v14081620⟩
Article dans une revue hal-03738602v1
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Investigation of the Phageome and Prophages in French Cider, a Fermented Beverage

Pierre Ledormand , Nathalie Desmasures , Cédric Midoux , Olivier Rué , Marion Dalmasso
Microorganisms, 2022, 10 (6), pp.1203. ⟨10.3390/microorganisms10061203⟩
Article dans une revue hal-03693766v1
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Taxon appearance from extraction and amplification steps demonstrates the value of multiple controls in tick microbiome analysis

Emilie Lejal , Agustin Estrada-Peña , Maud Marsot , Jean-Francois J.-F. Cosson , Olivier Rué
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.01093⟩
Article dans une revue hal-02790980v1
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Assessing the quality of fresh Whitemouth croaker (Micropogonias furnieri) meat based on micro‐organism and histamine analysis using NGS, qPCR and HPLC‐DAD

Alessandra Danile de Lira , Caroline Isabel Kothe , Olivier Rué , Cédric Midoux , Michele Bertoni Mann
Journal of Applied Microbiology, 2020, 128 (5), pp.1448-1459. ⟨10.1111/jam.14566⟩
Article dans une revue hal-02903118v1

Comparative metatranscriptomic analysis of anaerobic digesters treating anionic surfactant contaminated wastewater

Tiago P. Delforno , Thais Z. Macedo , Cedric Midoux , Gileno V. Lacerda , Olivier Rué
Science of the Total Environment, 2019, 2019 (649), pp.482-494. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.08.328⟩
Article dans une revue hal-01888286v1
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Bacteriophages infecting surface bacteria from a smear-ripened cheese are persistent and contaminate the dairy plant

Thomas Paillet , Julien Lossouarn , Clarisse Figueroa , Inès Pedros , Cédric Midoux
Viruses of Microbes (VoM) 2022, Jul 2022, Guimarães, Portugal
Poster de conférence hal-04416527v1
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Plateforme bioinformatique MIGALE

Mouhamadou Ba , Hélène Chiapello , Christelle Hennequet-Antier , Valentin Loux , Mahendra Mariadassou
Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. 2022
Poster de conférence hal-04176761v1

Le cidre est une matrice délicate pour l’étude des bactériophages et des phageomes.

Pierre Ledormand , Nathalie Desmasures , Céline Caillard , Erwan Renard , Didier Goux
Société Française de Microbiologie 2022, 2022, Nantes, France
Poster de conférence hal-03896438v1

Bacteriophage ecology of cider, an alcoholic fermented beverage: phages, are you there?

Pierre Ledormand , Nathalie Desmasures , Didier Goux , Cédric Midoux , Olivier Rué
LAB symposium, 2021, Egmond aan Zee, Netherlands
Poster de conférence hal-03896414v1
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Plateforme bioinformatique MIGALE

Mouhamadou Ba , Hélène Chiapello , Christelle Hennequet-Antier , Valentin Loux , Mahendra Mariadassou
Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jul 2021, Paris, France. 2021
Poster de conférence hal-04176768v1
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New virulent bacteriophages isolated from the surface of Epoisses cheese infect ripening bacteria

Thomas Paillet , Julien Lossouarn , Inès Pedros , Cédric Midoux , Olivier Rué
Sixth symposium of the French PHAGE Network, Oct 2021, Roscoff, France
Poster de conférence hal-03441698v1
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A shotgun metagenomics analysis applied to the ecological engineering of anaerobic microbial communities for the production of hydrogen from Citrus Peel Waste

Cedric Midoux , Franciele Camargo , Olivier Rué , Mahendra Mariadassou , Valentin Loux
JOBIM, Jun 2020, Montpellier, France
Poster de conférence hal-02902758v1
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Plateforme bioinformatique MIGALE

Mouhamadou Ba , Damien Berry , David Christiany , Hélène Chiapello , Olivier Inizan
Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jun 2020, Montpellier, France. 2020
Poster de conférence hal-04176782v1
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Plateforme bioinformatique MIGALE

Hélène Chiapello , Sandra Dérozier , Olivier Inizan , Mahendra Mariadassou , Véronique Martin
Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jul 2019, Nantes, France. 2019
Poster de conférence hal-04176805v1
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Detection of an archaeal-specific viral family, previously thought to infect exclusively hyperthermophiles, in human gut metaviromes

Vuong Quoc Hoang Ngo , Cédric Midoux , Olivier Rué , Mahendra Mariadassou , Violette Da Cunha
Phages in Grenoble, Oct 2019, Grenoble, France.
Poster de conférence hal-04360160v1
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Mining anaerobic digestion data with Deep-omics, a new digital environmental engineering platform for omics data

Cédric Midoux , Guillaume Perréal , Marion Predhumeau , Olivier Rué , Yannick Fayolle
AD16 (16th IWA World Conference on Anaerobic Digestion), Jun 2019, Delft, Netherlands
Poster de conférence hal-04361137v1
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Feedback on a c omparative metatranscriptomic analysis

Cedric Midoux , Tiago P. Delforno , Thais Z. Macedo , Gileno V. Lacerda , Olivier Rué
JOBIM 2019 : Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France. , 2019, JOBIM 2019
Poster de conférence hal-02735859v1
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Easy16S : a user-friendly Shiny interface for analysis and visualization of metagenomic data

Cedric Midoux , Olivier Rué , Olivier Chapleur , Mahendra Mariadassou , Théodore Bouchez
JOBIM 2018 : Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2018, Marseille, France. , 2018, JOBIM 2018
Poster de conférence hal-02737257v1