Cédric Midoux Bioinfo

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cedric-midoux

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0000-0002-7964-0929

Publications

Article dans une revue (34)

Easy16S: a user-friendly Shiny web-service for exploration and visualization of microbiome data. Cédric Midoux,Olivier Rué,Olivier Chapleur,Ariane Bize,Valentin Louxet al. Journal of Open Source Software, 2024, 9 (103), pp.6704. ⟨10.21105/joss.06704⟩ Article dans une revue hal-04785149v1
The electrochemical microbial tree: A new concept for wastewater treatment Morgane Hoareau,Luc Etcheverry,Olivier Chapleur,Chrystelle Bureau,Cédric Midouxet al. Chemical Engineering Journal, 2023, 454 (3), pp.140295. ⟨10.1016/j.cej.2022.140295⟩ Article dans une revue hal-03851691v1
Study of a Pilot Scale Microbial Electrosynthesis Reactor for Organic Waste Biorefinery Jiang-Hao Tian,Rémy Lacroix,Asim Ali Yaqoob,Chrystelle Bureau,Cédric Midouxet al. Energies, 2023, 16 (2), pp.591. ⟨10.3390/en16020591⟩ Article dans une revue hal-03922462v1
Methane production and microbial community acclimation of five manure inocula during psychrophilic anaerobic digestion of swine manure Thomas Lendormi,Kaïs Jaziri,Fabrice Béline,Sophie Leroux,Chrystelle Bureauet al. Journal of Cleaner Production, 2022, 340, 11 p. ⟨10.1016/j.jclepro.2022.130772⟩ Article dans une revue hal-03574579v1
Molecular approaches to uncover phage-lactic acid bacteria interactions in a model community simulating fermented beverages Pierre Ledormand,Nathalie Desmasures,Benoit Bernay,Didier Goux,Oliver Ruéet al. Food Microbiology, 2022, 107, pp.104069. ⟨10.1016/j.fm.2022.104069⟩ Article dans une revue hal-03696589v1
A longitudinal study of the effect of temperature modification in full-scale anaerobic digesters – dataset combining 16S rDNA gene sequencing, metagenomics, and metabolomics data Francesc Puig-Castellví,Cédric Midoux,Angéline Guenne,Delphine Conteau,Oscar Franchiet al. Data in Brief, 2022, 41, pp.107960. ⟨10.1016/j.dib.2022.107960⟩ Article dans une revue (data paper) hal-03585428v1
Impacts of disinfected wastewater irrigation on soil characteristics, microbial community composition, and crop yield Lays Paulino Leonel,Ariane Bize,Mahendra Mariadassou,Cédric Midoux,Jerusa Schneideret al. Blue-Green Systems, 2022, 4 (2), pp.247-271. ⟨10.2166/bgs.2022.126⟩ Article dans une revue hal-03894086v1
Diversity of novel archaeal viruses infecting methanogens discovered through coupling of stable isotope probing and metagenomics Vuong Quoc Hoang Ngo,François Enault,Cédric Midoux,Mahendra Mariadassou,Olivier Chapleuret al. Environmental Microbiology, 2022, ⟨10.1111/1462-2920.16120⟩ Article dans une revue hal-03727436v1
Investigation of the Phageome and Prophages in French Cider, a Fermented Beverage Pierre Ledormand,Nathalie Desmasures,Cédric Midoux,Olivier Rué,Marion Dalmasso Microorganisms, 2022, 10 (6), pp.1203. ⟨10.3390/microorganisms10061203⟩ Article dans une revue hal-03693766v1
Virulent Phages Isolated from a Smear-Ripened Cheese Are Also Detected in Reservoirs of the Cheese Factory Thomas Paillet,Julien Lossouarn,Clarisse Figueroa,Cédric Midoux,Olivier Ruéet al. Viruses, 2022, 14 (8), pp.1620. ⟨10.3390/v14081620⟩ Article dans une revue hal-03738602v1
Mining the equine gut metagenome: poorly-characterized taxa associated with cardiovascular fitness in endurance athletes Núria Mach,Cédric Midoux,Sébastien Leclercq,Samuel Pennarun,Laurence Le Moyecet al. Communications Biology, 2022, 5, pp.1032. ⟨10.1038/s42003-022-03977-7⟩ Article dans une revue hal-03794437v2
Microbial and functional characterization of granulated sludge from full-scale UASB thermophilic reactor applied to sugarcane vinasse treatment Franciele Pereira Camargo,Isabel Kimiko Sakamoto,Tiago Palladino Delforno,Cédric Midoux,Iolanda Cristina Silveira Duarteet al. Environmental Technology, 2022, pp.1-42. ⟨10.1080/09593330.2022.2052361⟩ Article dans une revue hal-03634517v1
Metataxonomics, metagenomics, metabolomics analysis of the influence of temperature modification in full-scale anaerobic digesters Francesc Puig-Castellví,Cédric Midoux,Angéline Guenne,Delphine Conteau,Oscar Franchiet al. Bioresource Technology, 2022, 346, pp.126612. ⟨10.1016/j.biortech.2021.126612⟩ Article dans une revue hal-03507080v1
Denitrifying bio-cathodes developed from constructed wetland sediments exhibit electroactive nitrate reducing biofilms dominated by the genera Azoarcus and Pontibacter Timothé Philippon,Jiang-Hao Tian,Chrystelle Bureau,Cédric Chaumont,Cédric Midouxet al. Bioelectrochemistry, 2021, 140, pp.107819. ⟨10.1016/j.bioelechem.2021.107819⟩ Article dans une revue hal-03196902v1
Microbial and functional characterization of an allochthonous consortium applied to hydrogen production from Citrus Peel Waste in batch reactor in optimized conditions Franciele Pereira Camargo,Isabel Kimiko Sakamoto,Tiago Palladino Delforno,Mahendra Mariadassou,Valentin Louxet al. Journal of Environmental Management, 2021, 291, pp.112631. ⟨10.1016/j.jenvman.2021.112631⟩ Article dans une revue hal-03211333v1
Oxygen-reducing bidirectional microbial electrodes designed in real domestic wastewater Morgane Hoareau,Benjamin Erable,Olivier Chapleur,Cédric Midoux,Chrystelle Bureauet al. Bioresource Technology, 2021, 326, pp.0. ⟨10.1016/j.biortech.2021.124663⟩ Article dans une revue hal-03129147v1
Temporal patterns in Ixodes ricinus microbial communities: an insight into tick-borne microbe interactions E. Lejal,J. Chiquet,J. Aubert,S. Robin,A. Estrada-Peñaet al. Microbiome, 2021, 9 (1), pp.153. ⟨10.1186/s40168-021-01051-8⟩ Article dans une revue hal-03287263v1
Exploring short k-mer profiles in cells and mobile elements from Archaea highlights the major influence of both the ecological niche and evolutionary history Ariane Bize,Cédric Midoux,Mahendra Mariadassou,Sophie Schbath,Patrick Forterreet al. BMC Genomics, 2021, 22, ⟨10.1186/s12864-021-07471-y⟩ Article dans une revue hal-03176011v1
Electrochemical analysis of a microbial electrochemical snorkel in laboratory and constructed wetlands Joanna Rogińska,Michel Perdicakis,Cédric Midoux,Théodore Bouchez,Christelle Despaset al. Bioelectrochemistry, 2021, 142, pp.107895. ⟨10.1016/j.bioelechem.2021.107895⟩ Article dans une revue hal-03318075v1
Integrating independent microbial studies to build predictive models of anaerobic digestion inhibition by ammonia and phenol Simon Poirier,Sébastien Dejean,Cédric Midoux,Kim-Anh Lê Cao,Olivier Chapleur Bioresource Technology, 2020, 316, pp.123952. ⟨10.1016/j.biortech.2020.123952⟩ Article dans une revue hal-02907466v1
Taxon appearance from extraction and amplification steps demonstrates the value of multiple controls in tick microbiome analysis Emilie Lejal,Agustin Estrada-Peña,Maud Marsot,Jean-Francois J.-F. Cosson,Olivier Ruéet al. Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.01093⟩ Article dans une revue hal-02790980v1
The Basis for Natural Multiresistance to Phage in Pseudomonas aeruginosa Christine Pourcel,Cédric Midoux,Gilles Vergnaud,Libera Latino Antibiotics, 2020, 9 (6), pp.339. ⟨10.3390/antibiotics9060339⟩ Article dans une revue hal-02890481v1
The Basis for Natural Multiresistance to Phage in Pseudomonas aeruginosa Christine Pourcel,Cédric Midoux,Gilles Vergnaud,Libera Latino Antibiotics, 2020, 9 (6), pp.339. ⟨10.3390/antibiotics9060339⟩ Article dans une revue hal-05271041v1
Assessing the quality of fresh Whitemouth croaker (Micropogonias furnieri) meat based on micro‐organism and histamine analysis using NGS, qPCR and HPLC‐DAD Alessandra Danile de Lira,Caroline Isabel Kothe,Olivier Rué,Cédric Midoux,Michele Bertoni Mannet al. Journal of Applied Microbiology, 2020, 128 (5), pp.1448-1459. ⟨10.1111/jam.14566⟩ Article dans une revue hal-02903118v1
Investigation of $Pseudomonas\ aeruginosa$ strain PcyII-10 variants resisting infection by N4-like phage Ab09 in search for genes involved in phage adsorption Libera Latino,Cédric Midoux,Gilles Vergnaud,Christine Pourcel PLoS ONE, 2019, 14 (4), pp.e0215456. ⟨10.1371/journal.pone.0215456⟩ Article dans une revue hal-02173138v1
Comparative metatranscriptomic analysis of anaerobic digesters treating anionic surfactant contaminated wastewater Tiago P. Delforno,Thais Z. Macedo,Cedric Midoux,Gileno V. Lacerda,Olivier Ruéet al. Science of the Total Environment, 2019, 2019 (649), pp.482-494. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.08.328⟩ Article dans une revue hal-01888286v1
Transposition behavior revealed by high-resolution description of $Pseudomonas\ Aeruginosa$ saltovirus integration sites Gilles Vergnaud,Cédric Midoux,Yann Blouin,Maria Bourkaltseva,Victor Krylovet al. Viruses, 2018, 10 (5), pp.245. ⟨10.3390/v10050245⟩ Article dans une revue hal-02184815v1
Large Preferred Region for Packaging of Bacterial DNA by phiC725A, a Novel Pseudomonas aeruginosa F116-Like Bacteriophage Christine Pourcel,Cédric Midoux,Yolande Hauck,Gilles Vergnaud,Libera Latino PLoS ONE, 2017, 12 (1), pp.e0169684. ⟨10.1371/journal.pone.0169684⟩ Article dans une revue hal-01879155v1
A carrier state is established in Pseudomonas aeruginosa by phage LeviOr01, a newly isolated ssRNA levivirus Christine Pourcel,Cédric Midoux,Gilles Vergnaud,Libera Latino Journal of General Virology, 2017, 98 (8), pp.2181 - 2189. ⟨10.1099/jgv.0.000883⟩ Article dans une revue hal-01879191v1
Complete Genome Sequence of PM105, a New Pseudomonas aeruginosa B3-Like Transposable Phage. Christine Pourcel,Cédric Midoux,Maria Bourkaltseva,Elena Pleteneva,Victor Krylov Genome Announcements, 2016, 4 (2), pp.e01543-15. ⟨10.1128/genomeA.01543-15⟩ Article dans une revue hal-01443828v1
Complete Genome Sequences of Pseudomonas aeruginosa Phages vB_PaeP_PcyII-10_P3P1 and vB_PaeM_PcyII-10_PII10A. Christine Pourcel,Cédric Midoux,Libera Latino,Marie-Agnès Petit,Gilles Vergnaud Genome Announcements, 2016, 4 (6), pp.e00916-16. ⟨10.1128/genomeA.00916-16⟩ Article dans une revue hal-01439325v1
Pseudolysogeny and sequential mutations build multiresistance to virulent bacteriophages in Pseudomonas aeruginosa Libera Latino,Cédric Midoux,Yolande Hauck,Gilles Vergnaud,Christine Pourcel Microbiology, 2016, ⟨10.1099/mic.0.000263⟩ Article dans une revue hal-01280758v1
Investigation of a Large Collection of Pseudomonas aeruginosa Bacteriophages Collected from a Single Environmental Source in Abidjan, Côte d'Ivoire. Christiane Essoh,Libera Latino,Cédric Midoux,Yann Blouin,Guillaume Loukouet al. PLoS ONE, 2015, 10 (6), pp.e0130548. ⟨10.1371/journal.pone.0130548⟩ Article dans une revue hal-01188392v1
Interpretation and approximation tools for big, dense Markov chain transition matrices in population genetics. Katja Reichel,Valentin Bahier,Cédric Midoux,Nicolas Parisey,Jean-Pierre Massonet al. Algorithms for Molecular Biology, 2015, 10 (1), pp.31. ⟨10.1186/s13015-015-0061-5⟩ Article dans une revue hal-01286505v1

Logiciel (1)

Easy16S: a user-friendly Shiny web-service for exploration and visualization of microbiome data Cédric Midoux,Olivier Rué,Olivier Chapleur,Ariane Bize,Valentin Louxet al. 2024, ⟨swh:1:rel:35d2caacc87474efa1f1e277f5eb13352962793d⟩ Logiciel hal-04304559v2

Communication dans un congrès (15)

Easy16S: a user-friendly Shiny web-service for exploration and visualization of microbiome data. Cédric Midoux Symposium FROGSdays, INRAE, Dec 2025, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-05393313v1
Analyse croisée de données métabarcoding et métagénomiques sur des microbiotes d'hôtes animaux Núria Mach,Maverick Monié--Ibanes,Cédric Midoux,Olivier Rué,Eric Barreyet al. FROGSdays 2025, équipe FROGS INRAe, Dec 2025, Auzeville Tolosan, France Communication dans un congrès hal-05397464v1
Inhibition de la digestion anaérobie des boues d'épuration urbaines par le propionate de sodium : production de biogaz et évolution de la communauté microbienne dans des réacteurs semi-continus Joel Awinzure Agumah,Xiaojun Liu,Chloé Soulard,Laura André,André Pausset al. 19e Congrès de la Société Française du Génie des Procédés (SFGP 2024), Société Française du Génie des Procédés, Oct 2024, Deauville, France Communication dans un congrès hal-05306554v1
Role of the glycome-microbiome axis on susceptibility to bovine viral infections and on animal welfare Núria Mach,Alice de Boyer Des Roches,Dorothee Ledoux,Maverick Monie-Ibanes,Nao Yamakawaet al. Séminaire du métaprogramme SANBA, Oct 2024, Paris, France Communication dans un congrès hal-04888568v1
Easy16S : a user-friendly Shiny web-service for exploration and visualization of microbiome data. Cédric Midoux Journées NEM, INRAE, Apr 2024, Paris, France Communication dans un congrès hal-04549290v1
Easy16S: a user-friendly Shiny web-service for exploration and visualization of microbiome data Cédric Midoux,Mahendra Mariadassou Rencontres R, Société Française de Statistique, Jun 2024, Vannes, France Communication dans un congrès hal-04611225v1
Packages R pour contrôler son travail et ainsi mieux optimiser, réutiliser et communiquer autour de ses analyses Cédric Midoux,Philippe Ruiz Journées du PEPI IBIS, PEPI IBIS, Sep 2023, Paris, France Communication dans un congrès hal-04229825v1
Co-digestion anaérobie de boues urbaines : effets du fumier et de la fraction organique des déchets ménagers employés comme cosubstrats, sur la composition des communautés microbienne Ariane Bize,Sabrina Guérin-Rechdaoui,Franciele Pereira Camargo,Vincent Rocher,Elise Alibertet al. 25ème édition des Journées Information Eaux (JIE), Oct 2022, Poitiera, France Communication dans un congrès hal-04493115v1
Développer ses applications et partager ses résultats avec R et GitLab Cédric Midoux Café des sciences, BioSP - INRAE, Feb 2022, Avignon (FR), France Communication dans un congrès hal-04249221v1
Implementation of a Nanopore metagenomic workflow for time-series of complex microbial communities: MAG catalog and functional annotation Cédric Midoux,Chrystelle Bureau,Baptiste Quentin,Olivier Chapleur Journée thématique du PEPI IBIS - Métagénomique, PEPI IBIS, Nov 2022, Dijon, France Communication dans un congrès hal-04229643v1
Characterization of virus-host dynamics in anaerobic digesters under abiotic stress Marion Coves,Laurent Mazéas,Olivier Chapleur,Cédric Midoux,Ludwig E Jardillieret al. 17e Congrès National de la Société Française de Microbiologie, Société Française de Microbiologie, Oct 2022, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04356630v1
Diversity of novel viruses infecting methanogenic archaea, discovered through coupling of stable isotope probing and metagenomics Hoang Ngo,François Enault,Cédric Midoux,Mahendra Mariadassou,Olivier Chapleuret al. Phages in Paris, Phages.fr, Oct 2022, Paris, France Communication dans un congrès hal-04357012v1
Transcriptomic and proteomic response of a Liquorilactobacillus mali strain from cider to a lytic phage infection Pierre Ledormand,Nathalie Desmasures,Benoit Bernay,Olivier Rué,Cédric Midouxet al. Société Francaise Microbiologie, 2021, Nantes, France Communication dans un congrès hal-03896401v1
K-mer approaches provide valuable insight into mobilome evolution in the domain Archaea Ariane Bize,Violette Da Cunha,Cédric Midoux,Sophie Schbath,Patrick Forterre Viruses of Microbes 2018, Jul 2018, Wroclaw, Poland Communication dans un congrès hal-04360247v1
K-mer approaches provide valuable insight into mobilome evolution in the domain Archaea Ariane Bize,Violette Da Cunha,Cédric Midoux,Sophie Schbath,Patrick Forterre Phages in Bordeaux, Phages.fr, Sep 2018, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04360213v1

Poster de conférence (24)

When bacteriophages enter the cheese ripening process: An overview of the PHAGOFROM project Marion Dalmasso,Eric Dugat-Bony,Alicia Bertry,Camille Leneveu,Margareth Renaultet al. Microbes 2025, Sep 2025, Bordeaux, France Poster de conférence hal-05162180v1
DeepOmics, a Digital Environnemental Engineering Platform for Omics data Véronique Jamilloux,Ariane Bize,Cédric Midoux,Aurélie Gramusset,Cédric Gilet al. JOBIM 2024 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2024, Toulouse, France. Poster de conférence hal-04619395v1
Plateforme bioinformatique MIGALE Mouhamadou Ba,Hélène Chiapello,Christelle Hennequet-Antier,Valentin Loux,Mahendra Mariadassouet al. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématique (JOBIM), Jun 2024, Toulouse, France Poster de conférence hal-04843798v1
Deciphering the effect of propionic acid on anaerobic digestion of sludge: gas production and microbial community structure Chloé Soulard,Xiaojun Liu,André Pauss,Laura André,Thierry Ribeiroet al. 18th IWA World Conference On Anaerobic Digestion, Jun 2024, Istanbul, Turkey. , 18th IWA World Conference on Anaerobic Digestion CONFERENCE PROCEEDINGS, 2024 Poster de conférence hal-04647849v1
SK8 : Un service institutionnel de gestion et d'hébergement d'applications Shiny Élise Maigné,Isabelle Sanchez,David Carayon,Joseph Tran,Jean-François Reyet al. Rencontres R 2023 et 2024, Jun 2023, Avignon (FR), France. Poster de conférence hal-04141247v2
Characterization of virus-host dynamics in anaerobic digesters under abiotic stress Marion Coves,Laurent Mazéas,Olivier Chapleur,Cédric Midoux,Ludwig E Jardillieret al. Viruses of Microbes, Jul 2022, Braga, Portugal. Poster de conférence hal-04356367v1
Plateforme bioinformatique MIGALE Mouhamadou Ba,Hélène Chiapello,Christelle Hennequet-Antier,Valentin Loux,Mahendra Mariadassouet al. Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. 2022 Poster de conférence hal-04176761v1
Bacteriophages infecting surface bacteria from a smear-ripened cheese are persistent and contaminate the dairy plant Thomas Paillet,Julien Lossouarn,Clarisse Figueroa,Inès Pedros,Cédric Midouxet al. Viruses of Microbes (VoM) 2022, Jul 2022, Guimarães, Portugal Poster de conférence hal-04416527v1
Implementation of a Nanopore metagenomic workflow for time-series of complex microbial communities: MAG catalog and functional annotation. Cédric Midoux,Chrystelle Bureau,Baptiste Quentin,Olivier Chapleur MICROBES symposium, Sep 2022, Orsay, France. Poster de conférence hal-03765009v1
Le cidre est une matrice délicate pour l’étude des bactériophages et des phageomes. Pierre Ledormand,Nathalie Desmasures,Céline Caillard,Erwan Renard,Didier Gouxet al. Société Française de Microbiologie 2022, 2022, Nantes, France Poster de conférence hal-03896438v1
Diversity of novel archaeal viruses infecting methanogens discovered through coupling of stable isotope probing and metagenomics Vuong Quoc Hoang Ngo,François Enault,Cédric Midoux,Mahendra Mariadassou,Olivier Chapleuret al. ISME18, 18th International Symposium on Microbial Ecology, Aug 2022, Lausanne, Switzerland. Poster de conférence hal-04359643v1
Plateforme bioinformatique MIGALE Mouhamadou Ba,Hélène Chiapello,Christelle Hennequet-Antier,Valentin Loux,Mahendra Mariadassouet al. Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jul 2021, Paris, France. 2021 Poster de conférence hal-04176768v1
Bacteriophage ecology of cider, an alcoholic fermented beverage: phages, are you there? Pierre Ledormand,Nathalie Desmasures,Didier Goux,Cédric Midoux,Olivier Ruéet al. LAB symposium, 2021, Egmond aan Zee, Netherlands Poster de conférence hal-03896414v1
A bioinformatic pipeline to elucidate the links between viruses and their hosts in microbial communities, applied to viruses in anaerobic digestion processes Vuong Quoc Hoang Ngo,Cédric Midoux,Mahendra Mariadassou,Valentin Loux,François Enaultet al. JOBIM 2021 (JOBIM (Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques), Jul 2021, Paris, France. Poster de conférence hal-04359920v1
New virulent bacteriophages isolated from the surface of Epoisses cheese infect ripening bacteria Thomas Paillet,Julien Lossouarn,Inès Pedros,Cédric Midoux,Olivier Ruéet al. Sixth symposium of the French PHAGE Network, Oct 2021, Roscoff, France Poster de conférence hal-03441698v1
DeepOmics, a Digital Environmental Engineering Platform for meta-omics data Ariane Bize,Guillaume Perréal,Aurélie Gramusset,Marion Predhumeau,Cédric Midouxet al. Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM2020), Jun 2020, Montpellier, France. Poster de conférence hal-04493150v1
Plateforme bioinformatique MIGALE Mouhamadou Ba,Damien Berry,David Christiany,Hélène Chiapello,Olivier Inizanet al. Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jun 2020, Montpellier, France. 2020 Poster de conférence hal-04176782v1
Chemometric analysis of a metagenomic dataset to decipher the functional role of the micrpbiota from anaerobic digesters Francesc Puig-Castellví,Cédric Midoux,Laëtitia Cardona,Olivier Chapleur,Delphine Conteauet al. Chimiométrie 2020, Jan 2020, Liège, Belgium Poster de conférence hal-04231788v1
A shotgun metagenomics analysis applied to the ecological engineering of anaerobic microbial communities for the production of hydrogen from Citrus Peel Waste Cedric Midoux,Franciele Camargo,Olivier Rué,Mahendra Mariadassou,Valentin Louxet al. JOBIM, Jun 2020, Montpellier, France Poster de conférence hal-02902758v1
Detection of an archaeal-specific viral family, previously thought to infect exclusively hyperthermophiles, in human gut metaviromes Vuong Quoc Hoang Ngo,Cédric Midoux,Olivier Rué,Mahendra Mariadassou,Violette Da Cunhaet al. Phages in Grenoble, Oct 2019, Grenoble, France. Poster de conférence hal-04360160v1
Plateforme bioinformatique MIGALE Hélène Chiapello,Sandra Dérozier,Olivier Inizan,Mahendra Mariadassou,Véronique Martinet al. Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jul 2019, Nantes, France. 2019 Poster de conférence hal-04176805v1
Feedback on a c omparative metatranscriptomic analysis Cedric Midoux,Tiago P. Delforno,Thais Z. Macedo,Gileno V. Lacerda,Olivier Ruéet al. JOBIM 2019 : Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France. , 2019, JOBIM 2019 Poster de conférence hal-02735859v1
Mining anaerobic digestion data with Deep-omics, a new digital environmental engineering platform for omics data Cédric Midoux,Guillaume Perréal,Manon Prédhumeau,Olivier Rué,Yannick Fayolleet al. AD16 (16th IWA World Conference on Anaerobic Digestion), Jun 2019, Delft, Netherlands Poster de conférence hal-04361137v1
Easy16S : a user-friendly Shiny interface for analysis and visualization of metagenomic data Cedric Midoux,Olivier Rué,Olivier Chapleur,Mahendra Mariadassou,Théodore Bouchezet al. JOBIM 2018 : Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2018, Marseille, France. , 2018, JOBIM 2018 Poster de conférence hal-02737257v1

Rapport (1)

Plan de gestion des données de l’unité de recherche PROSE (UR1461 INRAE) Cédric Midoux INRAE - UR PROSE. 2026, 34 p Rapport (plan de gestion de données/data management plan) hal-05442197v1