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Cédric Pionneau

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Presentation

**COMPETENCES PROFESSIONNELLES** *Protéomique* Biochimie des protéines (extraction, fractionnement, chromatographie) Electrophorèse bidimensionnelle 2D-DIGE Spectrométrie de masse MALDI-TOF/TOF et LC-MS/MS *Bioinformatique* Analyse des données MS (identification, quantification label-free) Analyse d’images de gels 2D (DeCyder, SameSpots) *Biologie moléculaire* Extraction d’ADN, PCR Techniques de marquage moléculaire (microsatellites, RAPD, RFLP, SSCP) *Informatique* Bases de données relationnelles Langages PHP, HTML, Visual Basic **FORMATIONS** 2019 Annotation fonctionnelle et interprétation de données protéomiques (PROFI/IFB) 2018 Analyses statistiques : ANOVA pour les « omiques » (INSERM) 2016 Utilisation des outils bioinformatiques de la plateforme PAPPSO pour l’analyse de données protéomiques (INRA) 2015 Sensibilisation aux enjeux ISO 9001 et NFX 50-900 (société LRQA) 2014 Gestion et Management du temps (UPMC) **EXPERIENCE PROFESSIONNELLE – STAGES** *Depuis 2006* Ingénieur d’études Sorbonne Université sur la Plateforme Post-génomique de la Pitié-Salpêtrière (P3S) : réalisation des projets de protéomique ([www.p3s.sorbonne-universite.fr](http://www.p3s.sorbonne-universite.fr "Plateforme P3S")) *2003-2005* CDD d’Ingénieur d’études au Laboratoire de Biologie et Biochimie des Protéines – UFR SMBH, Université Paris XIII – Recherche de biomarqueurs du cancer par approche protéomique *2002* Stage de DESS Protéomique – société LESAFFRE INTERNATIONAL à Lille – Electrophorèse bidimensionnelle de protéines de levure de boulangerie *2000* CDD au laboratoire CNRS de Génétique et Evolution des Populations Végétales, Université de Lille – Génotypage d’une population d’algue rouge à l’aide de marqueurs microsatellites, analyses statistiques des résultats (logiciels MINITAB et STATGRAPHICS) *1999-2000* CDI Analyste-réalisateur, ABACA INSERTION, Paris – Gestion d’une interface logicielle assurant la migration des données de la base du personnel de la société Renault *1998* stage de DEA au Laboratoire d’Amélioration Génétique des Arbres Forestiers - INRA à Cestas-Pierroton (33) – Electrophorèse bidimensionnelle de protéines de xylème en formation chez le pin maritime et l’eucalyptus *1996-1997* stage au Laboratoire d’Amélioration Génétique des Arbres Forestiers – INRA à Cestas-Pierroton – Génotypage d’une descendance de pin maritime à l’aide de marqueurs RAPD, cartographie génétique

Publications

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Differential proteomics argues against a general role for CD9, CD81 or CD63 in the sorting of proteins into extracellular vesicles

Yé Fan , Cédric Pionneau , Federico Cocozza , Pierre‐yves Boëlle , Solenne Chardonnet
Journal of Extracellular Vesicles, 2023, 12 (8), ⟨10.1002/jev2.12352⟩
Journal articles hal-04178027v1
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The Autophagy Receptor TAX1BP1 ( T6BP ) improves antigen presentation by MHC‐II molecules

Gabriela Sarango , Clémence Richetta , Mathias Pereira , Anita Kumari , Michael Ghosh
EMBO Reports, 2022, ⟨10.15252/embr.202255470⟩
Journal articles hal-03864670v1
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The Autophagy Receptor TAX1BP1 ( T6BP ) improves antigen presentation by MHC‐II molecules

Gabriela Sarango , Clémence Richetta , Mathias Pereira , Anita Kumari , Michael Ghosh
EMBO Reports, 2022, 23 (12), ⟨10.15252/embr.202255470⟩
Journal articles hal-04253768v1
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Sublethal Exposure Effects of the Neonicotinoid Clothianidin Strongly Modify the Brain Transcriptome and Proteome in the Male Moth Agrotis ipsilon

Camille Meslin , Françoise Bozzolan , Virginie Braman , Solenne Chardonnet , Cédric Pionneau
Insects, 2021, 12 (2), ⟨10.3390/insects12020152⟩
Journal articles hal-03138710v1
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In‐depth proteomic analysis of Plasmodium berghei sporozoites using trapped ion mobility spectrometry with parallel accumulation‐serial fragmentation

Soumia Hamada , Cédric Pionneau , Christophe Parizot , Olivier Silvie , Solenne Chardonnet
Proteomics, 2021, 21 (6), pp.2000305. ⟨10.1002/pmic.202000305⟩
Journal articles hal-03351384v1
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Proteomic Analysis of Tears and Conjunctival Cells Collected with Schirmer Strips Using timsTOF Pro: Preanalytical Considerations

Murat Akkurt Arslan , Ioannis Kolman , Cédric Pionneau , Solenne Chardonnet , Romain Magny
Metabolites, 2021, 12 (1), pp.2. ⟨10.3390/metabo12010002⟩
Journal articles hal-03540499v1
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Integrative Cell Type-Specific Multi-Omics Approaches Reveal Impaired Programs of Glial Cell Differentiation in Mouse Culture Models of DM1

Anchel González-Barriga , Louison Lallemant , Diana M Dincã , Sandra O Braz , Hélène Polvèche
Frontiers in Cellular Neuroscience, 2021, 15, pp.662035. ⟨10.3389/fncel.2021.662035⟩
Journal articles hal-03235993v1
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Anti-integrin αv therapy improves cardiac fibrosis after myocardial infarction by blunting cardiac PW1+ stromal cells

Marion Bouvet , Olivier Claude , Maguelonne Roux , Dan Skelly , Nihar Masurkar
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.11404. ⟨10.1038/s41598-020-68223-8⟩
Journal articles hal-02899381v1

The MPK 8‐ TCP 14 pathway promotes seed germination in Arabidopsis

Wei Zhang , Françoise Cochet , Maharajah Ponnaiah , Sandrine Lebreton , Lucrèce Mathéron
Plant Journal, inPress, 100 (4), pp.677-692. ⟨10.1111/tpj.14461⟩
Journal articles hal-02322115v1
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Reverse Immunology Approach to Define a New HIV-gp41-Neutralizing Epitope

Karim Dorgham , Nicolas Pietrancosta , Amel Affoune , Olivier Lucar , Tahar Bouceba
Journal of Immunology Research, 2019, 2019, pp.9804584. ⟨10.1155/2019/9804584⟩
Journal articles hal-02162037v1
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Identification of Plasmodium falciparum nuclear proteins by mass spectrometry and proposed protein annotation

Sylvie Briquet , Asma Ourimi , Cédric Pionneau , Juliana Bernardes , Alessandra Carbone
PLoS ONE, 2018, 13 (10), pp.e0205596. ⟨10.1371/journal.pone.0205596⟩
Journal articles hal-01927646v1
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Neural Mechanisms Underlying the Disruption of Male Courtship Behavior byAdult Exposure to Di(2-ethylhexyl) Phthalate in Mice

Carlos Dombret , Daphné Capela , Kévin Poissenot , Caroline Parmentier , Emma Bergsten
Environmental Health Perspectives, 2017, 125 (9), pp.1-15. ⟨10.1289/EHP1443⟩
Journal articles hal-01595166v1

Protein profile of mouse ovarian follicles grown in vitro

Amandine Anastacio , Kenny Rodriguez-Wallberg , Solenne Chardonnet , Cédric Pionneau , Christian Federici
Molecular Human Reproduction, 2017, 23 (12), pp.827-841. ⟨10.1093/molehr/gax056⟩
Journal articles hal-02552340v1

Dp71 Delta(78-79) dystrophin mutant stimulates neurite outgrowth in PC12 cells via upregulation and phosphorylation of HspB1

Candelaria Merino-Jimenez , Jorge Aragón , Victor Ceja , Griselda Rodriguez-Martinez , Febe E. Cazares-Raga
Proteomics, 2016, 16 (9), pp.1331-1340. ⟨10.1002/pmic.201500211⟩
Journal articles hal-01515294v1
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Plasmodium falciparum proteins involved in cytoadherence of infected erythrocytes to chemokine CX3CL1

Patricia Hermand , Liliane Cicéron , Cédric Pionneau , Catherine Vaquero , Christophe Combadière
Scientific Reports, 2016, 6, pp.33786. ⟨10.1038/srep33786⟩
Journal articles hal-01371569v1

Evaluation of dermal extracellular matrix and epidermal-dermal junction modifications using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometric imaging, in vivo reflectance confocal microscopy, echography, and histology: effect of age and peptide applications

Philippe Mondon , Melanie Hillion , Olivier Peschard , Nada Andre , Thibault Marchand
Journal of Cosmetic Dermatology, 2015, 14 (2), pp.152-160. ⟨10.1111/jocd.12135⟩
Journal articles hal-01514442v1

Ultraviolet light converts propranolol, a nonselective β-blocker and potential lupus-inducing drug, into a proinflammatory AhR ligand

Karim Dorgham , Zahir Amoura , Christophe Parizot , Laurent Arnaud , Camille Frances
European Journal of Immunology, 2015, 45 (11), pp.3174-3187. ⟨10.1002/eji.201445144⟩
Journal articles hal-02556942v1

SASH1, a new potential link between smoking and atherosclerosis

Henri Weidmann , Zahia Touat-Hamici , Hervé Durand , Christian Mueller , Solenne Chardonnet
Atherosclerosis, 2015, 242 (2), pp.571-579. ⟨10.1016/j.atherosclerosis.2015.08.013⟩
Journal articles hal-01514450v1

Mechanical clearance of red blood cells by the human spleen: Potential therapeutic applications of a biomimetic RBC filtration method

J. Duez , J. P. Holleran , P. A. Ndour , Cédric Pionneau , S. Diakité
Transfusion Clinique et Biologique, 2015, 22 (3), pp.151-157. ⟨10.1016/j.tracli.2015.05.004⟩
Journal articles hal-01514449v1

Proteomic identification of target proteins in normal but nonfertilizing sperm

Cynthia Frapsauce , Cédric Pionneau , Julien Bouley , Vanina Delarouziere , Isabelle Berthaut
Fertility and Sterility, 2014, 102 (2), pp.372-380. ⟨10.1016/j.fertnstert.2014.04.039⟩
Journal articles hal-01514458v1

Secretome of Human Bronchial Epithelial Cells in Response to the Fungal Pathogen Aspergillus fumigatus Analyzed by Differential In-Gel Electrophoresis

A. Fekkar , V. Balloy , Cédric Pionneau , C. Marinach-Patrice , M. Chignard
Journal of Infectious Diseases, 2012, 205 (7), pp.1163-1172. ⟨10.1093/infdis/jis031⟩
Journal articles hal-02558514v1

DIGE enables the detection of a putative serum biomarker of fungal origin in a mouse model of invasive aspergillosis

A. Fekkar , Cédric Pionneau , J.Y. Brossas , C. Marinach-Patrice , G. Snounou
Journal of Proteomics, 2012, 75 (9), pp.2536-2549. ⟨10.1016/j.jprot.2012.01.040⟩
Journal articles hal-02558501v1
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Waldenström’s macroglobulinemia harbors a unique proteome where Ku70 is severely underexpressed as compared with other B-lymphoproliferative disorders

A Perrot , Cédric Pionneau , N Azar , C. Baillou , F. M. Lemoine
Blood Cancer Journal, 2012, 2 (9), pp.e88-e88. ⟨10.1038/bcj.2012.35⟩
Journal articles hal-02558486v1

A unique proteomic profile on surface IgM ligation in unmutated chronic lymphocytic leukemia

Aurore Perrot , Cédric Pionneau , Sophie Nadaud , Frederic Davi , Véronique Leblond
Blood, 2011, 118 (4), pp.e1-e15. ⟨10.1182/blood-2011-02-335125⟩
Journal articles hal-02558548v1

Spectrométrie de masse en biologie médicale: principes et applications

C. Marinach-Patrice , Cédric Pionneau , D. Mazier
Bio tribune magazine, 2011, 40 (1), pp.4-12. ⟨10.1007/s11834-011-0061-9⟩
Journal articles hal-02558528v1

Proteomic analysis of BRCA1-depleted cell line reveals a putative role for replication protein A2 up-regulation in BRCA1 breast tumor development

Julien Bouley , Cédric Pionneau , Justine Varinot , Denis Biard , Catherine Genestie
PROTEOMICS - Clinical Applications, 2010, 4 (5), pp.NA-NA. ⟨10.1002/prca.200900107⟩
Journal articles hal-02558561v1

Infertilité masculine chez les patients normospermiques : analyse protéomique des spermes normaux non fécondants en fécondation in vitro classique

C. Frapsauce , Cédric Pionneau , J. Bouley , V. de Larouzière , I. Berthaut
Gynécologie Obstétrique & Fertilité, 2009, 37 (10), pp.796-802. ⟨10.1016/j.gyobfe.2009.07.014⟩
Journal articles hal-02558587v1

Analysis of protein expression along the normal to tension wood gradient in Eucalyptus gunnii

Christophe Plomion , Cédric Pionneau , H. Bailleres
Holzforschung, 2003, 57 (4), pp.353-358
Journal articles hal-02672696v1

Compression wood-responsive proteins in developing xylem of maritime pine (Pinus pinaster Ait.)

Christophe Plomion , Cédric Pionneau , J. Brach , P. Costa , H. Bailleres
Plant Physiology, 2000, 123, pp.959-969
Journal articles hal-02696160v1

A genetic map of Maritime pine based on AFLP, RAPD and protein markers

P. Costa , D. Pot , Christian Dubos , J.M. Frigerio , Cédric Pionneau
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2000, 100, pp.39-48
Journal articles hal-02691111v1

Developing SSCP markers in two Pinus species

Christophe Plomion , P. Hurme , J.M. Frigerio , M. Ridolfi , D. Pot
Molecular Breeding, 1999, 5 (1), pp.21-31
Journal articles hal-02688015v1

Separation and characterization of needle and xylem maritime pine proteins

P. Costa , Cédric Pionneau , G. Bauw , Christian Dubos , N. Bahrmann
Electrophoresis, 1999, 20 (4-5), pp.1098-1108
Journal articles hal-02687346v1

Proteomics for genetic and physiological studies in forest trees : application in Maritime Pine

Christophe Plomion , Nasser N. Bahrman , Paulo Costa , Christian C. Dubos , Jean-Marc Frigerio
Molecular genetics and breeding of forest trees, Haworth press, 2004, 978-1-56022-958-0 978-1-56022-959-9
Book sections hal-02827253v1