Cédric Pionneau

Présentation

COMPETENCES PROFESSIONNELLES

Protéomique Biochimie des protéines (extraction, fractionnement, chromatographie) Electrophorèse bidimensionnelle 2D-DIGE Spectrométrie de masse MALDI-TOF/TOF et LC-MS/MS

Bioinformatique Analyse des données MS (identification, quantification label-free) Analyse d’images de gels 2D (DeCyder, SameSpots)

Biologie moléculaire Extraction d’ADN, PCR Techniques de marquage moléculaire (microsatellites, RAPD, RFLP, SSCP)

Informatique Bases de données relationnelles Langages PHP, HTML, Visual Basic

FORMATIONS

2019 Annotation fonctionnelle et interprétation de données protéomiques (PROFI/IFB) 2018 Analyses statistiques : ANOVA pour les « omiques » (INSERM) 2016 Utilisation des outils bioinformatiques de la plateforme PAPPSO pour l’analyse de données protéomiques (INRA) 2015 Sensibilisation aux enjeux ISO 9001 et NFX 50-900 (société LRQA) 2014 Gestion et Management du temps (UPMC)

EXPERIENCE PROFESSIONNELLE – STAGES

Depuis 2006 Ingénieur d’études Sorbonne Université sur la Plateforme Post-génomique de la Pitié-Salpêtrière (P3S) : réalisation des projets de protéomique (www.p3s.sorbonne-universite.fr)

2003-2005 CDD d’Ingénieur d’études au Laboratoire de Biologie et Biochimie des Protéines – UFR SMBH, Université Paris XIII – Recherche de biomarqueurs du cancer par approche protéomique

2002 Stage de DESS Protéomique – société LESAFFRE INTERNATIONAL à Lille – Electrophorèse bidimensionnelle de protéines de levure de boulangerie

2000 CDD au laboratoire CNRS de Génétique et Evolution des Populations Végétales, Université de Lille – Génotypage d’une population d’algue rouge à l’aide de marqueurs microsatellites, analyses statistiques des résultats (logiciels MINITAB et STATGRAPHICS)

1999-2000 CDI Analyste-réalisateur, ABACA INSERTION, Paris – Gestion d’une interface logicielle assurant la migration des données de la base du personnel de la société Renault

1998 stage de DEA au Laboratoire d’Amélioration Génétique des Arbres Forestiers - INRA à Cestas-Pierroton (33) – Electrophorèse bidimensionnelle de protéines de xylème en formation chez le pin maritime et l’eucalyptus

1996-1997 stage au Laboratoire d’Amélioration Génétique des Arbres Forestiers – INRA à Cestas-Pierroton – Génotypage d’une descendance de pin maritime à l’aide de marqueurs RAPD, cartographie génétique

Publications

Article dans une revue (32)

Characterization of the Orphan Cytochrome P450 CYP135B1 from Mycobacterium tuberculosis : Involvement in Metabolism but Not in the Antibacterial Activity of the Antitubercular Drug SQ109 Elodie Sadowski,Nicolas Pietrancosta,Romain Veyron-Churlet,Jean-Luc Boucher,Cédric Pionneauet al. ACS Infectious Diseases, 2025, 11 (4), pp.869-881. ⟨10.1021/acsinfecdis.4c00893⟩ Article dans une revue hal-05131671v1
Differential proteomics argues against a general role for CD9, CD81 or CD63 in the sorting of proteins into extracellular vesicles Yé Fan,Cédric Pionneau,Federico Cocozza,Pierre‐yves Boëlle,Solenne Chardonnetet al. Journal of Extracellular Vesicles, 2023, 12 (8), ⟨10.1002/jev2.12352⟩ Article dans une revue hal-04178027v1
The Autophagy Receptor TAX1BP1 ( T6BP ) improves antigen presentation by MHC‐II molecules Gabriela Sarango,Clémence Richetta,Mathias Pereira,Anita Kumari,Michael Ghoshet al. EMBO Reports, 2022, 23 (12), ⟨10.15252/embr.202255470⟩ Article dans une revue hal-03864670v1
Integrative Cell Type-Specific Multi-Omics Approaches Reveal Impaired Programs of Glial Cell Differentiation in Mouse Culture Models of DM1 Anchel González-Barriga,Louison Lallemant,Diana M Dincã,Sandra O Braz,Hélène Polvècheet al. Frontiers in Cellular Neuroscience, 2021, 15, pp.662035. ⟨10.3389/fncel.2021.662035⟩ Article dans une revue hal-03235993v1
In‐depth proteomic analysis of Plasmodium berghei sporozoites using trapped ion mobility spectrometry with parallel accumulation‐serial fragmentation Soumia Hamada,Cédric Pionneau,Christophe Parizot,Olivier Silvie,Solenne Chardonnetet al. Proteomics, 2021, 21 (6), pp.2000305. ⟨10.1002/pmic.202000305⟩ Article dans une revue hal-03351384v1
Proteomic Analysis of Tears and Conjunctival Cells Collected with Schirmer Strips Using timsTOF Pro: Preanalytical Considerations Murat Akkurt Arslan,Ioannis Kolman,Cédric Pionneau,Solenne Chardonnet,Romain Magnyet al. Metabolites, 2021, 12 (1), pp.2. ⟨10.3390/metabo12010002⟩ Article dans une revue hal-03540499v1
Sublethal Exposure Effects of the Neonicotinoid Clothianidin Strongly Modify the Brain Transcriptome and Proteome in the Male Moth Agrotis ipsilon Camille Meslin,Françoise Bozzolan,Virginie Braman,Solenne Chardonnet,Cédric Pionneauet al. Insects, 2021, 12 (2), pp.152. ⟨10.3390/insects12020152⟩ Article dans une revue hal-03138710v1
Anti-integrin αv therapy improves cardiac fibrosis after myocardial infarction by blunting cardiac PW1+ stromal cells Marion Bouvet,Olivier Claude,Maguelonne Roux,Dan Skelly,Nihar Masurkaret al. Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.11404. ⟨10.1038/s41598-020-68223-8⟩ Article dans une revue hal-02899381v1
The MPK 8‐ TCP 14 pathway promotes seed germination in Arabidopsis Wei Zhang,Françoise Cochet,Maharajah Ponnaiah,Sandrine Lebreton,Lucrèce Mathéronet al. The Plant Journal, In press, 100 (4), pp.677-692. ⟨10.1111/tpj.14461⟩ Article dans une revue hal-02322115v1
Reverse Immunology Approach to Define a New HIV-gp41-Neutralizing Epitope Karim Dorgham,Nicolas Pietrancosta,Amel Affoune,Olivier Lucar,Tahar Boucebaet al. Journal of Immunology Research, 2019, 2019, pp.9804584. ⟨10.1155/2019/9804584⟩ Article dans une revue hal-02162037v1
Identification of Plasmodium falciparum nuclear proteins by mass spectrometry and proposed protein annotation Sylvie Briquet,Asma Ourimi,Cédric Pionneau,Juliana Bernardes,Alessandra Carboneet al. PLoS ONE, 2018, 13 (10), pp.e0205596. ⟨10.1371/journal.pone.0205596⟩ Article dans une revue hal-01927646v1
Neural Mechanisms Underlying the Disruption of Male Courtship Behavior byAdult Exposure to Di(2-ethylhexyl) Phthalate in Mice Carlos Dombret,Daphné Capela,Kévin Poissenot,Caroline Parmentier,Emma Bergstenet al. Environmental Health Perspectives, 2017, 125 (9), pp.1-15. ⟨10.1289/EHP1443⟩ Article dans une revue hal-01595166v1
Protein profile of mouse ovarian follicles grown in vitro Amandine Anastacio,Kenny Rodriguez-Wallberg,Solenne Chardonnet,Cédric Pionneau,Christian Federiciet al. Molecular Human Reproduction, 2017, 23 (12), pp.827-841. ⟨10.1093/molehr/gax056⟩ Article dans une revue hal-02552340v1
Dp71 Delta(78-79) dystrophin mutant stimulates neurite outgrowth in PC12 cells via upregulation and phosphorylation of HspB1 Candelaria Merino-Jimenez,Jorge Aragón,Victor Ceja,Griselda Rodriguez-Martinez,Febe E. Cazares-Ragaet al. Proteomics, 2016, 16 (9), pp.1331-1340. ⟨10.1002/pmic.201500211⟩ Article dans une revue istex hal-01515294v1
Plasmodium falciparum proteins involved in cytoadherence of infected erythrocytes to chemokine CX3CL1 Patricia Hermand,Liliane Cicéron,Cédric Pionneau,Catherine Vaquero,Christophe Combadièreet al. Scientific Reports, 2016, 6, pp.33786. ⟨10.1038/srep33786⟩ Article dans une revue hal-01371569v1
Ultraviolet light converts propranolol, a nonselective β-blocker and potential lupus-inducing drug, into a proinflammatory AhR ligand Karim Dorgham,Zahir Amoura,Christophe Parizot,Laurent Arnaud,Camille Franceset al. European Journal of Immunology, 2015, 45 (11), pp.3174-3187. ⟨10.1002/eji.201445144⟩ Article dans une revue hal-02556942v1
Evaluation of dermal extracellular matrix and epidermal-dermal junction modifications using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometric imaging, in vivo reflectance confocal microscopy, echography, and histology: effect of age and peptide applications Philippe Mondon,Melanie Hillion,Olivier Peschard,Nada Andre,Thibault Marchandet al. Journal of Cosmetic Dermatology, 2015, 14 (2), pp.152-160. ⟨10.1111/jocd.12135⟩ Article dans une revue istex hal-01514442v1
SASH1, a new potential link between smoking and atherosclerosis Henri Weidmann,Zahia Touat-Hamici,Hervé Durand,Christian Mueller,Solenne Chardonnetet al. Atherosclerosis, 2015, 242 (2), pp.571-579. ⟨10.1016/j.atherosclerosis.2015.08.013⟩ Article dans une revue hal-01514450v1
Mechanical clearance of red blood cells by the human spleen: Potential therapeutic applications of a biomimetic RBC filtration method J. Duez,J. P. Holleran,P. A. Ndour,Cédric Pionneau,S. Diakitéet al. Transfusion Clinique et Biologique, 2015, 22 (3), pp.151-157. ⟨10.1016/j.tracli.2015.05.004⟩ Article dans une revue hal-01514449v1
Proteomic identification of target proteins in normal but nonfertilizing sperm Cynthia Frapsauce,Cédric Pionneau,Julien Bouley,Vanina Delarouziere,Isabelle Berthautet al. Fertility and Sterility, 2014, 102 (2), pp.372-380. ⟨10.1016/j.fertnstert.2014.04.039⟩ Article dans une revue hal-01514458v1
Waldenström’s macroglobulinemia harbors a unique proteome where Ku70 is severely underexpressed as compared with other B-lymphoproliferative disorders A Perrot,Cédric Pionneau,N Azar,C. Baillou,F. M. Lemoineet al. Blood Cancer Journal, 2012, 2 (9), pp.e88-e88. ⟨10.1038/bcj.2012.35⟩ Article dans une revue hal-02558486v1
DIGE enables the detection of a putative serum biomarker of fungal origin in a mouse model of invasive aspergillosis A. Fekkar,Cédric Pionneau,J.Y. Brossas,C. Marinach-Patrice,G. Snounouet al. Journal of Proteomics, 2012, 75 (9), pp.2536-2549. ⟨10.1016/j.jprot.2012.01.040⟩ Article dans une revue istex hal-02558501v1
Secretome of Human Bronchial Epithelial Cells in Response to the Fungal Pathogen Aspergillus fumigatus Analyzed by Differential In-Gel Electrophoresis A. Fekkar,V. Balloy,Cédric Pionneau,C. Marinach-Patrice,M. Chignardet al. Journal of Infectious Diseases, 2012, 205 (7), pp.1163-1172. ⟨10.1093/infdis/jis031⟩ Article dans une revue hal-02558514v1
A unique proteomic profile on surface IgM ligation in unmutated chronic lymphocytic leukemia Aurore Perrot,Cédric Pionneau,Sophie Nadaud,Frederic Davi,Véronique Leblondet al. Blood, 2011, 118 (4), pp.e1-e15. ⟨10.1182/blood-2011-02-335125⟩ Article dans une revue hal-02558548v1
Spectrométrie de masse en biologie médicale: principes et applications C. Marinach-Patrice,Cédric Pionneau,D. Mazier Bio tribune magazine, 2011, 40 (1), pp.4-12. ⟨10.1007/s11834-011-0061-9⟩ Article dans une revue hal-02558528v1
Proteomic analysis of BRCA1-depleted cell line reveals a putative role for replication protein A2 up-regulation in BRCA1 breast tumor development Julien Bouley,Cédric Pionneau,Justine Varinot,Denis Biard,Catherine Genestieet al. PROTEOMICS - Clinical Applications, 2010, 4 (5), pp.NA-NA. ⟨10.1002/prca.200900107⟩ Article dans une revue istex hal-02558561v1
Infertilité masculine chez les patients normospermiques : analyse protéomique des spermes normaux non fécondants en fécondation in vitro classique C. Frapsauce,Cédric Pionneau,J. Bouley,V. de Larouzière,I. Berthautet al. Gynécologie Obstétrique & Fertilité, 2009, 37 (10), pp.796-802. ⟨10.1016/j.gyobfe.2009.07.014⟩ Article dans une revue istex hal-02558587v1
Analysis of protein expression along the normal to tension wood gradient in Eucalyptus gunnii Christophe Plomion,Cédric Pionneau,H. Bailleres Holzforschung, 2003, 57 (4), pp.353-358 Article dans une revue hal-02672696v1
Compression wood-responsive proteins in developing xylem of maritime pine (Pinus pinaster Ait.) Christophe Plomion,Cédric Pionneau,J. Brach,P. Costa,H. Bailleres Plant Physiology, 2000, 123, pp.959-969 Article dans une revue hal-02696160v1
A genetic map of Maritime pine based on AFLP, RAPD and protein markers P. Costa,D. Pot,Christian Dubos,J.M. Frigerio,Cédric Pionneauet al. TAG Theoretical and Applied Genetics, 2000, 100, pp.39-48 Article dans une revue hal-02691111v1
Developing SSCP markers in two Pinus species Christophe Plomion,P. Hurme,J.M. Frigerio,M. Ridolfi,D. Potet al. Molecular Breeding, 1999, 5 (1), pp.21-31 Article dans une revue hal-02688015v1
Separation and characterization of needle and xylem maritime pine proteins P. Costa,Cédric Pionneau,G. Bauw,Christian Dubos,N. Bahrmannet al. Electrophoresis, 1999, 20 (4-5), pp.1098-1108 Article dans une revue hal-02687346v1

Communication dans un congrès (1)

Approches moléculaires de la qualité du bois chez le pin maritime Christophe Plomion,G. Le Provost,Jorge Almiro Paiva,J.M. Gion,Céline Lalanneet al. 12. Colloque, May 2002, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-02762381v1

Poster de conférence (2)

Proteomic analysis of Plasmodium sporozoites limited samples using the timsTOF Pro Cédric Pionneau,Soumia Hamada,Olivier Silvie,Carine Marinach,Solenne Chardonnet Congrès SMAP 2019, Sep 2019, Strasbourg, France Poster de conférence hal-02861794v1
Analysis of low abundance protein samples using the timsTOF Pro. Solenne Chardonnet,Cédric Pionneau Congrès SFEAP 2018, Sep 2018, Albi, France. 22 (3), pp.151-157, 2018 Poster de conférence hal-02862799v1

Chapitre d'ouvrage (1)

Proteomics for genetic and physiological studies in forest trees : application in Maritime Pine Christophe Plomion,Nasser N. Bahrman,Paulo Costa,Christian C. Dubos,Jean-Marc Frigerioet al. Molecular genetics and breeding of forest trees, Haworth press, 2004, 978-1-56022-958-0 978-1-56022-959-9 Chapitre d'ouvrage hal-02827253v1