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christele Robert-Granie

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Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

Directrice de Recherche INRAE à l'UMR GenPhySE (Génétique, Physiologie et Systèmes d’Elevage) à Toulouse. Mes travaux de recherche visent à perfectionner les outils issus des travaux de la génétique quantitative classique, fondée sur le modèle polygénique et proposer des méthodes statistiques et génétiques d'analyse de nouvelles données issues des progrès significatifs réalisés dans la connaissance des génomes d'animaux. Je développe des outils et méthodes (i) pour maximiser les connaissances extraites des expériences de QTL, en particulier la cartographie des QTL et des gènes afin d’étudier le déterminisme génétique des caractères, (ii) pour analyser les données omiques (transcriptomes, métabolomes, protéomes, etc), (iii) pour optimiser l'efficacité de la sélection en incorporant les informations moléculaires dans les modèles d’évaluation génétique. Mes principales recherches ont porté sur la modélisation des hétérogénéités de variance dans les modèles mixtes gaussiens, l'analyse et la modélisation des données longitudinales dans le cadre des modèles mixtes, l'analyse des données 'omiques et le développement de méthodes innovantes et originales en sélection génomique. Je contribue à la définition des orientations stratégiques et scientifique, à l'animation et au fonctionnement du collectif de recherche du département via mes fonctions de Cheffe de Département Adjointe du département Génétique Animale depuis 2018.

Publications

"gwenola-tosser"
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Using sequence variants of a QTL region improves the accuracy of genomic evaluation in French Saanen goats

Estelle Talouarn , Marc Teissier , Philippe Bardou , Hélène Larroque , Virginie Clément
Journal of Dairy Science, 2021, 104 (1), pp.588-601. ⟨10.3168/jds.2020-18837⟩
Article dans une revue hal-03146844v1

Genome wide association analysis on semen volume and milk yield using different strategies of imputation to whole genome sequence in French dairy goats

Estelle Talouarn , Philippe Bardou , Isabelle Palhiere , Claire Oget , Virginie Clément
BMC Genetics, 2020, 21 (1), ⟨10.1186/s12863-020-0826-9⟩
Article dans une revue hal-02548369v1
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Differentially expressed genes and gene networks involved in pig ovarian follicular atresia

Elena Mormede , Stéphane Fabre , Agnès Bonnet , Danielle Monniaux , Christèle Robert-Granié
Physiological Genomics, 2017, 49 (2), pp.67-80. ⟨10.1152/physiolgenomics.00069.2016⟩
Article dans une revue hal-01529483v1
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Characterization and comparative analysis of the milk transcriptome in two dairy sheep breeds using RNA sequencing

Aroa Suárez-Vega , Beatriz Gutiérrez-Gil , Christophe C. Klopp , Christèle Robert-Granié , Gwenola Tosser-Klopp
Scientific Reports, 2015, 5, pp.1-11. ⟨10.1038/srep18399⟩
Article dans une revue hal-02638220v1
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Pathway results from the chicken data set using GOTM, Pathway studio and ingenuity softwares

Agnès Bonnet , Sandrine Lagarrigue , Laurence Liaubet , Christèle Robert-Granié , Magali San Cristobal
BMC Proceedings, 2009, 3 (Suppl 4), pp.1-6. ⟨10.1186/1753-6561-3-S4-S11⟩
Article dans une revue hal-00730039v1

Methods for interpreting lists of affected genes obtained in a DNA microarray experiment

C. Arce , S. Bicciato , A. Bonnet , B. Buitenhuis , M. Collado-Romero
BMC Proceedings, 2009, 3, pp.1-7
Article dans une revue hal-00730017v1
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Methods for interpreting lists of affected genes obtained in a DNA microarray experiment

Jakob Hedegaard , Cristina Arce , Silvio Bicciato , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis
BMC Proceedings, 2009, 3, online (Suppl.4), Non paginé. ⟨10.1186/1753-6561-3-S4-S5⟩
Article dans une revue hal-02665629v1
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A pilot study on transcriptome data analysis of folliculogenesis in pigs

Gwenola Tosser-Klopp , Kim-Anh Lê Cao , Agnès Bonnet , N. Gobert , François Hatey
Animal, 2008, 3 (3), pp.393-401. ⟨10.1017/S1751731108003479⟩
Article dans une revue hal-00658787v1

In vivo gene expression in granulosa cells during pig terminal follicular development

A Bonnet , K Lê Cao , M Sancristobal , F Benne , Christèle Robert-Granié
Reproduction, 2008, 136 (2), pp.211-224. ⟨10.1530/REP-07-0312⟩
Article dans une revue hal-03137518v1
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In vivo gene expression in granulosa cells during pig terminal follicular development.

Agnès Bonnet , Kim-Anh Lê Cao , M. Sancristobal , F. Benne , Christèle Robert-Granié
Reproduction, 2008, 136 (2), pp.211-24. ⟨10.1530/REP-07-0312⟩
Article dans une revue hal-00960020v1
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Analysis of the real EADGENE data set : Multivariate approaches and post analysis

Peter Sorensen , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis , Rodrigue Closset , Sébastien Dejean
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.651-668
Article dans une revue hal-02658153v1
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Analysis of the real EADGENE data set: Multivariate approaches and post analysis (Open Access publication)

Peter Sørensen , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis , Rodrigue Closset , Sébastien Dejean
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.651-668
Article dans une revue hal-00894625v1
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Analysis of a simulated microarray dataset : Comparison of methods for data normalisation and detection of differential expression

Michael Watson , Mónica Pérez-Alegre , Michael Denis Baron , Céline Delmas , Peter Dovč
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.669-683
Article dans une revue hal-02657926v1
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Analysis of a simulated microarray dataset: Comparison of methods for data normalisation and detection of differential expression (Open Access publication)

Michael Watson , Mónica Pérez-Alegre , Michael Denis Baron , Céline Delmas , Peter Dovč
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.669-683
Article dans une revue hal-00894626v1
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Analysis of the real EADGENE data set : Comparison of methods and guidelines for data normalisation and selection of differentially expressed genes

Florence Jaffrezic , Dirk-Jan Koning , P.J. Boettcher , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.633-650. ⟨10.1051/gse:2007029⟩
Article dans une revue hal-02657968v1
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Analysis of the real EADGENE data set: Comparison of methods and guidelines for data normalisation and selection of differentially expressed genes (Open Access publication)

Florence Jaffrezic , Dirk-Jan de Koning , Paul J. Boettcher , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.633-650
Article dans une revue hal-00894624v1

Genomic selection in French Dairy Goats

Virginie Clement , Céline Carillier-Jacquin , Marc Tessier , Rachel Rupp , Gwenola Tosser-Klopp
28. Plant and Animal Genome, Jan 2020, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-03155964v1

Imputation from CaprineSNP50 BeadChip to sequence : a case-study in French Alpine and Saanen data from the VarGoats project

Estelle Talouarn , Philippe Bardou , Gwenola Tosser , Rachel Rupp , Christèle Robert-Granié
PAG XXVII - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2019, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02790419v1

Les recherches en génomique des caprins : Etat d'avancement

Helene H. Larroque , Cyrielle Maroteau , Céline Carillier , Isabelle Palhiere Palhière , Rachel Rupp
Séminaire d'information de la comission caprine de FGE, Sep 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02807743v1
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Searching for genes of interest in sheep

Carole Moreno-Romieux Moreno , Jean Michel J. M. Elsen , Andres Legarra , Rachel Rupp , Jacques J. Bouix
8. World Merino Conference, May 2010, Rambouillet, France. pp.1-7
Communication dans un congrès hal-02817254v1

Unravelling the mechanisms of mammalian ovarian follicular development and atresia: a cattle vs pig transcriptome and proteome study

Nadine Gérard , Gwenola Tosser-Klopp , Francis Benne , Agnès Bonnet , Thierry Delpuech
60. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2009, Barcelone, Spain
Communication dans un congrès hal-02755880v1

Pathway results from the chicken data set using several softwares

Agnès Bonnet , Sandrine Lagarrigue , Laurence Liaubet , Christèle Robert-Granié , Magali San Cristobal
EADGENE and SABRE Post-Analyses, Animal Sciences Group, Nov 2008, Lelystad (NL), Netherlands
Communication dans un congrès hal-00729781v1

Pathway results from the chicken data set using several softwares

Agnès Bonnet , Sandrine Lagarrigue , Laurence Liaubet , Christèle Robert-Granié , Magali San Cristobal
EADGENE and SABRE Post-Analyses, Animal Sciences Group, 2008, Lelystad, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02811912v1

Exploitation de la variabilité génétique intra et inter-espèces pour l'étude du déterminisme génétique du taux d'ovulation

Gwenola Tosser-Klopp , Francis Benne , Loys L. Bodin , Agnès Bonnet , M. Bontoux
Séminaire AGENAE, La Rochelle, Oct 2008, La Rochelle
Communication dans un congrès hal-02823781v1

In vivo gene expression in granulosa cells during pig terminal follicular development

Agnès Bonnet , Kim-Anh Lê Cao , Magali San Cristobal , Francis Benne , Christèle Robert-Granié
Second European Conference on Pig Genomics, Pig Genome II, 2008, Ljubljana, Slovenia
Communication dans un congrès hal-02822121v1

Etude de l'expression des gènes dans les cellules de la granulosa porcine In vivo au cours du développement folliculaire terminal

Agnès Bonnet , Kim-Anh Lê Cao , Magali San Cristobal , Francis Benne , Christèle Robert-Granié
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02817763v1

Exploitation de la variabilité génétique intra et inter-espèces pour l'étude du déterminisme génétique du taux d'ovulation.

Gwenola Tosser-Klopp , Francis Benne , Loys Bodin , Agnès Bonnet , Martine Bontoux
5. Journées AGENAE, Oct 2007, Dourdan, France
Communication dans un congrès hal-02756606v1

What makes the ovarian follicle grow? a transcriptome point of view.

Agnès Bonnet , Kim-Anh Lê Cao , Elena Mormede Terenina , Magali San Cristobal , Christèle Robert-Granié
Congrès Embryogenomics, Oct 2007, Paris, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02821922v1

Gene profile clustering, selection of predictive genes using random forests and a stochastic algorithm, regulatory networks in a transcriptomic kinetics on bovine mastistis

Kim-Anh Lê Cao , Magali San Cristobal , Gwenola Tosser-Klopp , Céline Delmas , Mylene Duval
EADGENE Data Analysis Workshop, Nov 2006, Tune, Denmark. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02813420v1

Two new procedures to detect differentially expressed genes

Céline Delmas , Mylene Duval , Christèle Robert-Granié , Kim-Anh Lê Cao , Gwenola Tosser-Klopp
EADGENE Data Analysis Workshop, Nov 2006, Tune, Denmark
Communication dans un congrès hal-02812711v1

Exploitation de la variabilité génétique intra et inter-espèces pour l'étude du déterminisme génétique du taux d'ovulation

Gwenola Tosser-Klopp , Francis Benne , Agnès Bonnet , Loys L. Bodin , M. Bontoux
Séminaire AGENAE 2006, 28-29 mars 2006, Mar 2006, France
Communication dans un congrès hal-02824971v1

Using sequence data to refine QTL mapping in French dairy goats

Estelle Talouarn , Philippe Bardou , Gwenola Tosser-Klopp , Rachel Rupp , Christèle Robert-Granié
70. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2019, Ghent, Belgium. Wageningen Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 25 (1ère Ed.), 717 p., 2019, Book of the Abstracts of the 70th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP)
Poster de conférence hal-02737623v1
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Présentation et premiers résultats du programme 1000 génomes caprins : VarGoats

Philippe Bardou , Céline Bourdon , Laure Denoyelle , Thomas Faraut , Estelle Talouarn
Journées Scientifiques du Département de Génétique Animale, Oct 2018, Dienné, France
Poster de conférence hal-03817570v1

Searching for genes of interest in sheep

Carole Moreno-Romieux Moreno , Jean Michel J. M. Elsen , Andres Legarra , Rachel Rupp , Jacques J. Bouix
61. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2010, Heraklion, Greece. FEZ - EAAP, 16 (1ère Ed), 2010, 61th Annual Meeting of the European Association for Animal Production
Poster de conférence hal-02755092v1