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Christophe Mougel

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Publications

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Medicago truncatula genotype drives the plant nutritional strategy and its associated rhizosphere bacterial communities

Anouk Zancarini , Christine Le Signor , Sébastien Terrat , Julie Aubert , Christophe Salon et al.
New Phytologist, 2024, 245 (2), pp.767-784. ⟨10.1111/nph.20272⟩
Article dans une revue hal-04835437 v1
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Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence

S. Soubeyrand , Arnaud Estoup , Astrid Cruaud , Sylvie Malembic-Maher , Christine Meynard et al.
CABI Agriculture and Bioscience, 2024, 5, pp.72. ⟨10.1186/s43170-024-00273-8⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-04672656 v1

A field indicator for rhizosphere effect monitoring in arable soils

Sébastian Mira , Mathieu Emily , Christophe Mougel , Morgane Ourry , Edith Le Cadre-Barthélemy
Plant and Soil, 2022, 478, pp.325-346. ⟨10.1007/s11104-021-05284-2⟩
Article dans une revue hal-03524069 v1

Les microbiotes associés aux plantes : un enjeu majeur

Lionel Lebreton , Christophe Mougel
Phytoma, 2021, 747, pp.14-18
Article dans une revue hal-03407614 v1
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Influential Insider: Wolbachia, an Intracellular Symbiont, Manipulates Bacterial Diversity in Its Insect Host

Morgane Ourry , Agathe Crosland , Valérie Lopez , Stephane A. P. Derocles , Christophe Mougel et al.
Microorganisms, 2021, 9 (6), ⟨10.3390/microorganisms9061313⟩
Article dans une revue hal-03285205 v1
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MinYS: mine your symbiont by targeted genome assembly in symbiotic communities

Cervin Guyomar , Wesley Delage , Fabrice Legeai , Christophe Mougel , Jean-Christophe Simon et al.
NAR Genomics and Bioinformatics, 2020, 2 (3), pp.1-11. ⟨10.1093/nargab/lqaa047⟩
Article dans une revue hal-02891885 v1
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Fast computation of genome-metagenome interaction effects

Florent Guinot , Marie Szafranski , Julien Chiquet , Anouk Zancarini , Christine Le Signor et al.
Algorithms for Molecular Biology, 2020, 15 (1), art.13 (21p.). ⟨10.1186/s13015-020-00173-2⟩
Article dans une revue hal-01906069 v3
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A core microbiota of the plant-earthworm interaction conserved across soils

Samuel Jacquiod , Ruben Puga-Freitas , Aymé Spor , Arnaud Mounier , Cécile Monard et al.
Soil Biology and Biochemistry, 2020, 144, pp.107754. ⟨10.1016/j.soilbio.2020.107754⟩
Article dans une revue hal-02535174 v1
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Hatching of Globodera pallida Induced by Root Exudates Is Not Influenced by Soil Microbiota Composition

Camille Gautier , Lisa Martinez , Sylvain Fournet , Josselin Montarry , Jean-Claude Yvin et al.
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.536932. ⟨10.3389/fmicb.2020.536932⟩
Article dans une revue hal-03140131 v1
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Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt et al.
Microbial Biotechnology, 2020, 13 (5), pp.1648-1672. ⟨10.1111/1751-7915.13634⟩
Article dans une revue hal-02624824 v2
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Long-lasting effects of antibiotics on bacterial communities of adult flies

M. Ourry , V. Lopez , M. Hervé , Lionel Lebreton , Christophe Mougel et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2020, 96 (4), pp.fiaa028. ⟨10.1093/femsec/fiaa028⟩
Article dans une revue hal-02865290 v1
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Optimize the plant microbiota to increase plant growth and health

Matthieu Barret , P. Dufour , Mylène Durand-Tardif , Mahendra Mariadassou , Christophe Mougel et al.
Consortium Biocontrôle et GIS Biotechnologies Vertes , 2019, ⟨10.15454/1fve-e105⟩
Article dans une revue hal-03297096 v1
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Computational analysis of the Plasmodiophora brassicae genome: mitochondrial sequence description and metabolic pathway database design

Stéphanie Daval , Arnaud Belcour , Kévin Gazengel , Ludovic Legrand , Jerome Gouzy et al.
Genomics, 2019, 111 (6), pp.1629-1640. ⟨10.1016/j.ygeno.2018.11.013⟩
Article dans une revue hal-01943250 v1
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Temporal dynamics of bacterial and fungal communities during the infection of Brassica rapa roots by the protist Plasmodiophora brassicae.

Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel , Juliette Linglin , Morgane Ourry et al.
PLoS ONE, 2019, 14 (2), pp.e0204195. ⟨10.1371/journal.pone.0204195⟩
Article dans une revue hal-02094715 v1
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Host-microbiota interactions: from holobiont theory to analysis

Jean-Christophe Simon , Julian R. Marchesi , Christophe Mougel , Marc-André Selosse
Microbiome, 2019, 7 (1), pp.7:5. ⟨10.1186/s40168-019-0619-4⟩
Article dans une revue hal-01980500 v1
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Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approaches

Cervin Guyomar , Fabrice Legeai , Emmanuelle Jousselin , Christophe Mougel , Claire Lemaitre et al.
Microbiome, 2018, 6 (1), pp.1-21. ⟨10.1186/s40168-018-0562-9⟩
Article dans une revue hal-01926402 v1
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Influence of Belowground Herbivory on the Dynamics of Root and Rhizosphere Microbial Communities

Morgane Ourry , Lionel Lebreton , Valérie Chaminade , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Maxime Hervé et al.
Frontiers in Ecology and Evolution, 2018, 6, pp.1-21. ⟨10.3389/fevo.2018.00091⟩
Article dans une revue hal-02184354 v1

Can soil microbial diversity influence plant metabolites and life history traits of a rhizophagous insect?

Tom Lachaise , Morgane Ourry , Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Juliette Linglin et al.
Insect Science, 2017, 24 (6), pp.1045-1056. ⟨10.1111/1744-7917.12478⟩
Article dans une revue hal-01661250 v1

Pseudomonas fluorescens C7R12 type III secretion system impacts mycorrhization of Medicago truncatula and associated microbial communities

Amandine Viollet , Barbara Pivato , Christophe Mougel , Jean Claude Cleyet-Marel , Cécile Gubry-Rangin et al.
Mycorrhiza, 2017, 27 (1), pp.23-33. ⟨10.1007/s00572-016-0730-3⟩
Article dans une revue hal-01606859 v1
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Bacterial community diversity harboured by interacting species

Mikaël Bili , Anne-Marie Cortesero , Christophe Mougel , Jean-Pierre Gauthier , Gwennola Ermel et al.
PLoS ONE, 2016, 11 (6), 23 p. ⟨10.1371/journal.pone.0155392⟩
Article dans une revue hal-02630825 v1

Soil conditions and land use intensification effects on soil microbial communities across a range of European field sites

Bruce C. Thomson , Emilie Tisserant , Pierre Plassart , Stéphane Uroz , Rob I. Griffiths et al.
Soil Biology and Biochemistry, 2015, 88, pp.403-413. ⟨10.1016/j.soilbio.2015.06.012⟩
Article dans une revue hal-01269419 v1
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Plant traits related to nitrogen uptake influence plant-microbe competition

Delphine Moreau , Barbara Pivato , David Bru , Hugues Busset , Florence Deau et al.
Ecology, 2015, 96 (8), pp.2300-2310. ⟨10.1890/14-1761.1⟩
Article dans une revue hal-02637764 v1
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Understanding and managing soil biodiversity: a major challenge in agroecology

Philippe P. Lemanceau , Pierre-Alain Maron , Sylvie Mazurier , Christophe Mougel , Barbara Pivato et al.
Agronomy for Sustainable Development, 2015, 35 (1), pp.67-81. ⟨10.1007/s13593-014-0247-0⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01208787 v1
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Les légumineuses dans l'Europe du XXIè siècle : Quelle place dans les systèmes agricoles et alimentaires actuels et futurs ? Quels nouveaux défis pour la recherche ?

Anne-Sophie Voisin , Jacques Guéguen , Christian Huyghe , Marie-Helene Jeuffroy , Marie-Benoît Magrini et al.
Innovations Agronomiques, 2013, 30, pp.283-312. ⟨10.17180/767p-n553⟩
Article dans une revue hal-01005055 v1

Stimulation of different functional groups of bacteria by various plant residues as a driver of soil priming effect.

Noémie Pascault , Lionel Ranjard , Aurore Kaisermann , Dipankar Bachar , Richard Christen et al.
Ecosystems, 2013, 16 (5), pp.810-822. ⟨10.1007/s10021-013-9650-7⟩
Article dans une revue istex hal-00847889 v1
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Legumes for feed, food, biomaterials and bioenergy in Europe : a review

Anne-Sophie Voisin , Jacques J. Guéguen , Christian C. Huyghe , Marie-Helene M.-H. Jeuffroy , Marie-Benoît Magrini et al.
Agronomy for Sustainable Development, 2013, décembre (Online), pp.1-20. ⟨10.1007/s13593-013-0189-y⟩
Article dans une revue hal-00956058 v1
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Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to study the relationship between Medicago truncatula genotypes and their associated rhizosphere bacterial communities

Anouk Zancarini , Christophe Mougel , Sébastien Terrat , Christophe Salon , Nathalie Munier-Jolain
Plant and Soil, 2013, 365 (1-2), pp.183 - 199. ⟨10.1007/s11104-012-1364-7⟩
Article dans une revue istex hal-02646573 v1
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Interaction between Medicago truncatula and Pseudomonas fluorescens: evaluation of costs and benefits across an elevated atmospheric CO2.

Clémentine Lepinay , Thierry Rigaud , Christophe Salon , Philippe P. Lemanceau , Christophe Mougel
PLoS ONE, 2012, 7 (9), pp.e45740. ⟨10.1371/journal.pone.0045740⟩
Article dans une revue hal-00736637 v1
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Soil Nitrogen Availability and Plant Genotype Modify the Nutrition Strategies of M. truncatula and the Associated Rhizosphere Microbial Communities

Anouk Zancarini , Christophe Mougel , Anne-Sophie Voisin , Marion Prudent , Christophe Salon et al.
PLoS ONE, 2012, 7 (10), ⟨10.1371/journal.pone.0047096⟩
Article dans une revue hal-02646215 v1
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Evaluation of the ISO standard 11063 DNA extraction procedure for assessing soil microbial abundance and community structure

Pierre Plassart , Sébastien Terrat , Bruce Thomson , Robert Griffiths , Samuel S. Dequiedt et al.
PLoS ONE, 2012, 7 (9), 8 p. ⟨10.1371/journal.pone.0044279⟩
Article dans une revue hal-01190636 v1

Molecular biomass and MetaTaxogenomic assessment of soil microbial communities as influenced by soil DNA extraction procedure

Sebastien Terrat , Richard Christen , Samuel S. Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Virginie Nowak et al.
Microbial Biotechnology, 2012, 5 (1), pp.135-141. ⟨10.1111/j.1751-7915.2011.00307.x⟩
Article dans une revue hal-01546177 v1

Translation of metagenomics agroecosystems in ecological services

Christophe Mougel , Pierre-Alain Maron , Laurent L. Philippot , Lionel Ranjard , Philippe P. Lemanceau
Biofutur, 2011, 319, pp.44 - 47
Article dans une revue hal-02644706 v1

Fluorescent pseudomonads harboring type III secretion genes are enriched in the mycorrhizosphere of Medicago truncatula

Amandine Viollet , Thérèse Corberand , Christophe Mougel , Agnès Robin , Philippe P. Lemanceau et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2011, 75 (3), pp.457-467. ⟨10.1111/j.1574-6941.2010.01021.x⟩
Article dans une revue hal-02644346 v1

Traduction de la métagenomique des agrosystemes en services écologiques

Christophe Mougel , Pierre-Alain Maron , Laurent L. Philippot , Lionel Ranjard , Philippe P. Lemanceau
Biofutur, 2011, 30 (319), pp.44-47
Article dans une revue hal-02645538 v1

Soil microbial diversity: Methodological strategy, spatial overview and functional interest

Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Lionel Ranjard
Comptes Rendus Biologies, 2011, 334 (5-6), pp.403-411. ⟨10.1016/j.crvi.2010.12.003⟩
Article dans une revue istex hal-02644731 v1
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Validation and Application of a PCR Primer Set to Quantify Fungal Communities in the Soil Environment by Real-Time Quantitative PCR

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Richard Christen , Samuel S. Dequiedt , Christophe Mougel , Mélanie M. Lelievre et al.
PLoS ONE, 2011, 6 (9), pp.e24166. ⟨10.1371/journal.pone.0024166⟩
Article dans une revue hal-01254016 v1
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Biogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative

Lionel Ranjard , Samuel S. Dequiedt , Claudy C. Jolivet , Nicolas P.A. Saby , Jean Thioulouse et al.
Agronomy for Sustainable Development, 2010, 30 (2), pp.359-365. ⟨10.1051/agro/2009033⟩
Article dans une revue hal-00886549 v1

Plant-microbe-soil interactions in the rhizosphere: an evolutionary perspective

Hans Lambers , Christophe Mougel , Benoît Jaillard , Philippe Hinsinger
Plant and Soil, 2009, 321 (1-2), pp.83-115. ⟨10.1007/s11104-009-0042-x⟩
Article dans une revue istex hal-02665203 v1

Impact of inoculation with the phytostimulatory PGPR Azospirillum lipoferum CRT1 on the genetic structure of the rhizobacterial community of field-grown maize

Ezekiel Baudoin , Sylvie Nazaret , Christophe Mougel , Lionel Ranjard , Yvan Moenne-Loccoz
Soil Biology and Biochemistry, 2009, 41 (2), pp.409-413. ⟨10.1016/j.soilbio.2008.10.015⟩
Article dans une revue istex halsde-00525716 v1
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ECOMIC-RMQS : biogéographie microbienne à l’échelle de la France. Etat d’avancement et premiers résultats

Samuel Dequiedt , Maud Lelièvre , Claudy C. Jolivet , Nicolas N. Saby , Manuel Pascal Martin et al.
Étude et Gestion des Sols, 2009, 16 (3-4), pp.219-231
Article dans une revue hal-02656049 v1

Bacterial effects on arbuscular mycorrhizal fungi and mycorrhiza development as influenced by the bacteria, fungi, and host plant

Barbara Pivato , Pierre Offre , Sara Marchelli , Bruno Barbonaglia , Christophe Mougel et al.
Mycorrhiza, 2009, 19 (2), pp.81-90. ⟨10.1007/s00572-008-0205-2⟩
Article dans une revue istex hal-02665834 v1

Contamination of soil by copper affects the dynamics, diversity, and activity of soil bacterial communities involved in wheat decomposition and carbon storage.

Laetitia Bernard , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Virginie Nowak , Jean Lévêque et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (23), pp.7565-7569. ⟨10.1128/AEM.00616-09⟩
Article dans une revue hal-00434100 v1

Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity

Lionel Ranjard , Samuel Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel et al.
Environmental Microbiology Reports, 2009, 1 (2), pp.97 - 99. ⟨10.1111/j.1758-2229.2009.00023.x⟩
Article dans une revue hal-02668342 v1

Response of soil bacterial community structure to successive perturbations of different types and intensities

Melanie Bressan , Christophe Mougel , Samuel Dequiedt , Pierre-Alain Maron , Philippe P. Lemanceau et al.
Environmental Microbiology, 2008, 10 (8), pp.2184-2187. ⟨10.1111/j.1462-2920.2008.01641.x⟩
Article dans une revue istex hal-02665170 v1

Microdiversity of Burkholderiales associated with mycorrhizal and nonmycorrhizal roots of Medicago truncatula

Pierre Offre , Barbara Pivato , Sylvie S. Mazurier , Séverine S. Siblot , Graziella Berta et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2008, 65 (2), pp.180-192. ⟨10.1111/j.1574-6941.2008.00504.x⟩
Article dans une revue hal-02661182 v1

Biologie des communautés dans la rhizosphère : analyse des interactions plantes - champignons mycorhizogènes à arbuscules - bactéries

Barbara Pivato , Pierre Offre , Christophe Mougel , Sylvie S. Mazurier , Diederik D. van Tuinen et al.
uB Sciences, 2008, 3, pp.116-125
Article dans une revue hal-02669103 v1
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Fingerprinting and diversity of bacterial copA genes in response to soil types, soil organic status and copper contamination

David P. H. Lejon , Virginie Nowak , Sabrina Bouko , Noemie Pascault , Christophe Mougel et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2007, 61 (3), pp.424 à 437. ⟨10.1111/j.1574-6941.2007.00365.x⟩
Article dans une revue insu-00386976 v1

Dynamics and identification of soil microbial populations actively assimilating carbon from 13C-labelled wheat residue as estimated by DNA- and RNA-SIP techniques.

Laetitia Bernard , Christophe Mougel , Pierre-Alain Maron , Virginie Nowak , Jean Lévêque et al.
Environmental Microbiology, 2007, 9 (3), pp.752-764. ⟨10.1111/j.1462-2920.2006.01197.x⟩
Article dans une revue hal-00294737 v1

Metaproteomics : a new approach for studying functional microbial ecology

Pierre-Alain Maron , Lionel Ranjard , Christophe Mougel , Philippe P. Lemanceau
Microbial ecology, 2007, 53 (3), pp.486-493. ⟨10.1007/s00248-006-9196-8⟩
Article dans une revue istex hal-02658508 v1

Protein extraction and fingerprinting optimization of bacterial communities in natural environment

Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Séverine S. Siblot , Houria Abbas , Philippe P. Lemanceau et al.
Microbial ecology, 2007, 53 (3), pp.426-434. ⟨10.1007/s00248-006-9121-1⟩
Article dans une revue istex hal-02661837 v1

Diversity of root-associated fluorescent pseudomonads as affected by ferritin overexpression in tobacco.

Agnès Robin , Sylvie Mazurier , Christophe Mougel , Gérard Vansuyt , Thérèse Corberand et al.
Environmental Microbiology, 2007, 9 (7), pp.1724-37. ⟨10.1111/j.1462-2920.2007.01290.x⟩
Article dans une revue istex hal-00185892 v1

Medicago species affect the community composition of arbuscular mycorrhizal fungi associated with roots

Barbara Pivato , Sylvie S. Mazurier , Philippe P. Lemanceau , Séverine S. Siblot , Graziella Berta et al.
New Phytologist, 2007, 176 (1), pp.197-210. ⟨10.1111/j.1469-8137.2007.02151.x⟩
Article dans une revue hal-02664961 v1

Identification of bacterial groups preferentially associated with mycorrhizal roots of Medicago truncatula

Pierre Offre , Barbara Pivato , Séverine S. Siblot , E. Gamalero , Thérèse Corberand et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2007, 73 (3), pp.913-921. ⟨10.1128/aem.02042-06⟩
Article dans une revue hal-02665197 v1

Identification of cellulolytic bacteria in soil by stable isotope probing.

Feth El Zahar Haichar , Wafa Achouak , Richard Christen , Thierry Heulin , Christine Marol et al.
Environmental Microbiology, 2007, 9 (3), pp.625-34. ⟨10.1111/j.1462-2920.2006.01182.x⟩
Article dans une revue istex hal-00318792 v1

Dynamic of the genetic structure of bacterial and fungal communities at different developmental stages of Medicago truncatula Gaertn. cv. Jemalong line J5

Christophe Mougel , Pierre Offre , Lionel Ranjard , Thérèse Corberand , E. Gamalero et al.
New Phytologist, 2006, 170 (1), pp.165-175. ⟨10.1111/j.1469-8137.2006.01650.x⟩
Article dans une revue hal-02668733 v1

Effect of ferritin over-expression in tobacco on the structure of bacterial and pseudomonad communities associated with the roots

Agnès Robin , Christophe Mougel , Séverine S. Siblot , Gérard G. Vansuyt , Sylvie S. Mazurier et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2006, 58 (3), pp.492 - 502. ⟨10.1111/j.1574-6941.2006.00174.x⟩
Article dans une revue hal-02661715 v1

Temporal variability of airborne bacterial community structure in an urban area

Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , David Lejon , Esmeralda Carvalho , Karine Bizet et al.
Atmospheric Environment, 2006, 40 (40), pp.8074-8080. ⟨10.1016/j.atmosenv.2006.08.047⟩
Article dans une revue istex hal-02662697 v1
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Identification of Genomic Species in Agrobacterium Biovar 1 by AFLP Genomic Markers

Perrine Portier , Marion Fischer-Le Saux , Christophe Mougel , Catherine Lerondelle , David Chapulliot et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (11), pp.7123-7131. ⟨10.1128/AEM.00018-06⟩
Article dans une revue hal-00128068 v1

Assessing genetic structure and diversity of airborne bacterial communities by DNA fingerprinting and 16S rDNA clone library

Pierre-Alain Maron , David Lejon , Esmeralda Carvalho , Karine Bizet , Philippe P. Lemanceau et al.
Atmospheric Environment, 2005, 39 (20), pp.3687-3695. ⟨10.1016/j.atmosenv.2005.03.002⟩
Article dans une revue istex hal-02683032 v1

A Highly Selectable and Highly Transferable Ti Plasmid to Study Conjugal Host Range and Ti Plasmid Dissemination in Complex Ecosystems

S. Teyssier-Cuvelle , Phil M. Oger , Christophe Mougel , K. Groud , S. Farrand et al.
Microbial ecology, 2004, 48 (1), pp.10-18. ⟨10.1007/s00248-003-2023-6⟩
Article dans une revue istex hal-02123026 v1

Distribution and diversity of type III secretion system-like genes in saprophytic and phytopathogenic fluorescent pseudomonads

Sylvie S. Mazurier , M. Lemunier , Séverine Siblot , Christophe Mougel , Philippe P. Lemanceau
FEMS Microbiology Ecology, 2004, 49, pp.455-467
Article dans une revue hal-02672136 v1

Comparative genetic diversity of the narG, nosZ, and 16S rRNA genes in fluorescent Pseudomonads

S. Delorme , Laurent L. Philippot , Véronique Edel-Hermann , Chrystel Deulvot , Christophe Mougel et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2003, 69 (2), pp.1004-1012
Article dans une revue hal-02674671 v1

Sampling strategy in molecular microbial ecology : influence of soil sample size on DNA fingerprinting analysis of fungal and bacterial communities

Lionel Ranjard , D.P. Lejon , Christophe Mougel , Loik Scherer , Didier Merdinoglu et al.
Environmental Microbiology, 2003, 5 (11), pp.1111-1120
Article dans une revue hal-02679013 v1

Relationships between Staphylococcus aureus genetic background, virulence factors, agr groups (alleles), and human disease

S. Jarraud , Christophe Mougel , Jean Thioulouse , Gérard Lina , H. Meugnier et al.
Infection and Immunity, 2002, 70 (2), pp.631-641
Article dans une revue hal-02681316 v1

Relationships between Staphylococcus aureus genetic background virulence factors agr groups (alleles) and human disease.

S. Jarraud , Christophe Mougel , J. Thioulouse , G. Lina , H. Meugnier et al.
Infection and Immunity, 2002, 70, pp.631-641. ⟨10.1128/IAI.70.2.631-641.2002⟩
Article dans une revue hal-00427274 v1

A mathematical method for determining genome divergence and species delineation using AFLP

Christophe Mougel , J. Thioulouse , G. Perrière , X. Nesme
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2002, 52, pp.573-586. ⟨10.1099/00207713-52-2-573⟩
Article dans une revue hal-00427290 v1

A mathematical method for determining genome divergence and species delineation using AFLP

Christophe Mougel , Jean Thioulouse , Guy Perrière , Xavier Nesme
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2002, 52, pp.573-586
Article dans une revue hal-02673208 v1

Seasonal fluctuations and long-term persistence of pathogenic populations of Agrobacterium spp. in soils

Z. Krimi , A. Petit , Christophe Mougel , Yves Dessaux , Xavier Nesme
Applied and Environmental Microbiology, 2002, 68, pp.3358-3365
Article dans une revue hal-02669536 v1

Direct conjugal transfers of Ti plasmid to soil microflora

S. Teyssier-Cuvelle , Christophe Mougel , Xavier Nesme
Molecular Ecology, 2002, 8 (8), pp.1273-1284. ⟨10.1046/j.1365-294X.1999.00689.x⟩
Article dans une revue istex hal-02573551 v1

Seasonal fluctuations and long-term persistence of pathogenic populations of Agrobacterium spp. in soils.

Z. Krimi , A. Petit , Christophe Mougel , Y. Dessaux , X. Nesme
Applied and Environmental Microbiology, 2002, 68 (7), pp.3358-65. ⟨10.1128/AEM.68.7.3358-3365.2002⟩
Article dans une revue hal-00145324 v1

Characterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints : biological and methodological variability

Lionel Ranjard , F. Poly , J.C. Lata , Christophe Mougel , Jean Thioulouse et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67 (10), pp.4479-4487
Article dans une revue hal-02674586 v1

CHASE : an extracellular sensing domain common to transmembrane receptors from prokariotes, lower eukaryotes and plants

Christophe Mougel , I.B. Zhulin
Trends in Biochemical Sciences, 2001, 26 (10), pp.582-584
Article dans une revue hal-02671662 v1

Novel tellurite-amended media and specific chromosomal and Ti plasmid probes for direct analysis of soil populations of Agrobacterium biovars 1 and 2

Christophe Mougel , Benoît Cournoyer , Xavier Nesme
Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67, pp.65-74. ⟨10.1128/AEM.67.1.65-74.2001⟩
Article dans une revue hal-02669542 v1

Characterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints: biological and methodological variability.

L. Ranjard , F. Poly , J. C. Lata , Christophe Mougel , J. Thioulouse et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67 (10), pp.4479-87. ⟨10.1128/AEM.67.10.4479–4487.2001⟩
Article dans une revue bioemco-00353796 v1

Experimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics

Christophe Mougel , S. Teyssier , C. d'Angelo , K. Groud , M. Neyra et al.
Genetics Selection Evolution, 2001, 33, pp.S319-S338
Article dans une revue hal-00427187 v1

egc, a hyfhly prevalent operon of enterotixin gene, forms a putative nursery of superantigens in Staphylococcus aureus

S. Jarraud , M.A. Peyrat , A. Lim , A. Tristan , M. Bes et al.
Journal of Immunology, 2001, 166, pp.669-677
Article dans une revue hal-02679012 v1
Image document

Experimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics

Christophe Mougel , Sabrina Teyssier , C. d'Angelo , K. Groud , M. Neyra et al.
Genetics Selection Evolution, 2001, 33 (1), pp.319-338
Article dans une revue hal-02670077 v1

Biological, serological and molecular variability suggest three distinct polerovirus species infecting beet or rape

S. Hauser , M. Stevens , Christophe Mougel , H.G. Smith , C. Fritsch et al.
Phytopathology, 2000, 90 (5), pp.460-466
Article dans une revue hal-02698195 v1

Direct conjugal transfers of Ti plasmid to soil microflora

S. Teyssier-Cuvelle , Christophe Mougel , Xavier Nesme
Molecular Ecology, 1999, 8, pp.1273-1284
Article dans une revue hal-02692194 v1

Etude phylogénétique des luteoviridae pathogènes pour la betterave sucrière

S. Hauser , M. Stevens , Christophe Mougel , Etienne E. Herrbach , H. Smith et al.
Virologie, 1999, 3 (2), pp.165
Article dans une revue hal-02690064 v1

Role of the fixGHI region of Azorhizobium caulinodans in free-living and symbiotic nitrogen fixation

Karine Mandon , Pierre-Alexandre Kaminski , Christophe Mougel , Nicole Desnoues , Bernard Dreyfus et al.
FEMS Microbiology Letters, 1993, 114 (2), pp.185-190. ⟨10.1111/j.1574-6968.1993.tb06571.x⟩
Article dans une revue hal-02714131 v1

Holobionte : concept et enjeux pour la biologie des plantes et la génétique

Virginie Bourion , Christophe Mougel
Journées Scientifiques du Département de Biologie et Amélioration des Plantes INRA, Sep 2019, Presqu'île de Giens, France
Communication dans un congrès hal-03225437 v1
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Reference-guided genome assembly in metagenomic samples

Cervin Guyomar , Wesley Delage , Fabrice Legeai , Christophe Mougel , Jean-Christophe Simon et al.
JOBIM 2019 - Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France. pp.1-8
Communication dans un congrès hal-02308257 v1

Plant genotype: a lever in the interactions between plant and its associated rhizosphere microbiome

Anouk Zancarini , Christine Le Signor , Julie J. Aubert , Sébastien Terrat , Joëlle Ronfort et al.
2nd Plant Microbiome Symposium, Feb 2018, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-04081016 v1

A core microbiota of plant and earthworm interaction? Phylogenetic and functional aspects

Manuel Blouin , Samuel Jacquiod , Arnaud Mounier , Aymé Spor , Ruben Puga Freitas et al.
International Conference on Holobionts, Apr 2017, paris, France
Communication dans un congrès hal-02953650 v1

Microbial metacommunity: a METABAR coding approach

Marc Buée , Matthieu Barret , Maria Bernard , Didier Debroas , Isabelle Domaizon et al.
2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01607836 v1

Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approaches

Cervin Guyomar , Fabrice Legeai , Christophe Mougel , Claire Lemaitre , Jean-Christophe Simon
International Conference on Holobionts, Apr 2017, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01638839 v1

Le phytobiome: concept et potentiel d'utilisation en amélioration des plantes

Corinne Vacher , Christophe Mougel , Marc Buée , Matthieu Barret
Conseil scientifique du Département BAP, Feb 2017, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01605029 v1
Image document

Digital Autoradiography technique an efficient tool for sampling procedure

P. Fichet , R. Haudebourg , Christophe Mougel
D&RS conference 2016 - Decommissioning and Remote Systems Conference, Jul 2016, Pittsburg, United States
Communication dans un congrès cea-02509795 v1

Quels effets la diversité microbienne du sol a-t-elle sur la croissance et la santé des plantes ?

Christophe Mougel , Julie Aubert , Lydia Bousset , Anne-Marie Cortesero , Stéphanie Daval et al.
Colloque de Génomique Environnementale, Oct 2015, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03349078 v1

Latent Block Model for ecological abundance data

Julie Aubert , Sophie Schbath , Christophe Mougel , Stephane Robin
30. European Meeting of Statisticians, Jul 2015, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-01661254 v1

Strategies for analyzing interactions between arbuscular mycorrhiza and bacteria

Barbara Pivato , Sylvie S. Mazurier , Christophe Mougel , Pierre Offre , Amandine Viollet et al.
Conférences Jacques-Monod, Dec 2013, Roscoff, France
Communication dans un congrès hal-02747379 v1

Connecting soil biodiversity to functions and ecosystem services: presentation of case studies and of the EU FP7 project EcoFINDERS

Philippe P. Lemanceau , Mark Bailey , Jack H. Faber , Bryan Griffiths , Pierre-Alain Maron et al.
4. International Congress Eurosoil 2012 - Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment, Jul 2012, Bari, Italy
Communication dans un congrès hal-01268038 v1

Maîtrise et gestion de la biodiversité dans les sols: quelles perspectives ?

Philippe P. Lemanceau , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Laurent L. Philippot , Barbara Pivato et al.
Carrefours de l'Innovation Agronomique (CIAG) 2012. Évaluer et gérer la fertilité des sols, Apr 2012, Orléans, France
Communication dans un congrès hal-02807825 v1
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Evaluation of the ISO standard 11063 “Soil DNA Extraction Procedure” for Assessing Microbial Abundance and Community Structure

Pierre Plassart , Sébastien Terrat , Bruce Thomson , Robert Griffiths , Samuel S. Dequiedt et al.
14. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Aug 2012, Copenhague, Denmark
Communication dans un congrès hal-01208715 v1

Monitoring microbial diversity in European soils: ongoing projects and challenges

Philippe P. Lemanceau , Dominique Arrouays , Mark J. Bailey , Antonio Bispo , Marc Buée et al.
6. SETAC (Society of Environmental Toxicology and Chemistry)World Congress, SETAC Europe 22nd annual meeting, Securing a sustainable future: Integrating science, policy and people, May 2012, Berlin, Germany. 119 p
Communication dans un congrès hal-01268308 v1
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité et la richesse des communautés microbiennes de sols issus d'échantillonnage de grande ampleur

Sébastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , Richard Christen , Dipankar Bachar , Mélanie M. Lelievre et al.
Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE, Apr 2012, Aussois, France
Communication dans un congrès hal-01208719 v1

Diversité et activités microbiennes dans la rhizosphère: des atouts majeurs en agroécologie

Philippe P. Lemanceau , Barbara Pivato , Christophe Mougel , Laure L. Avoscan , Sylvie S. Mazurier
Alliances au pays des racines - 14e Colloque Scientifique de la Société d'Horticulture de France, May 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02747709 v1
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Influence of Soil DNA Extraction Procedure to Assess Bacterial Diversity using Pyrosequencing of 16S rDNA

Sébastien Terrat , Richard Christen , Samuel S. Dequiedt , Christophe Mougel , Mélanie M. Lelievre et al.
NENUN ISME-Workshop: Extraction of Microbial DNA & RNA in Environmental Samples, Aug 2012, Copenhague, Denmark
Communication dans un congrès hal-01208718 v1

Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes

Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Richard Christen , Mélanie M. Lelievre , Tiffanie Regnier et al.
Journées d'animation "MEM Days" organisées par l'INRA, Jan 2012, Ecully, France
Communication dans un congrès hal-02809171 v1
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Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Sébastien Terrat , Pierre Plassart , Richard Christen , Samuel S. Dequiedt , Tiffanie Regnier et al.
Workshop"Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements : Circulation, Adaptation", Jun 2012, Dijon, France
Communication dans un congrès hal-01208716 v1
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Vers une optimisation de la procédure d'extraction d'ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes ribosomiques

Pierre Plassart , Sébastien Terrat , Mélanie M. Lelievre , Tiffanie Regnier , Samuel S. Dequiedt et al.
5ième colloque de l’Association Francophone Ecologie Microbienne (AFEM), Ville service., Nov 2011, Hammamet, Tunisie. 1 p
Communication dans un congrès hal-01231285 v1

Costs-benfits trade-off in the intercation between Medicago truncatula and Pseudomonas fluorescens C7R12 across atmospheric carbon dioxide modulation

Clémentine C. Lepinay , Thierry Rigaud , Christophe Salon , Philippe P. Lemanceau , Christophe Mougel
Rhizosphere 3, University of Western Australia. Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Perth, AUS., Sep 2011, Perth, Australia. 1 p
Communication dans un congrès hal-00999982 v1
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Influence of Soil DNA Extraction Procedure to Assess Bacterial Diversity using Pyrosequencing of 16S rDNA

Sébastien Terrat , Richard Christen , Samuel Dequiedt , Christophe Mougel , Mélanie M. Lelievre et al.
6. ISMOM: International Symposium of Interactions of Soil Minerals withOrganic Components and Microorganisms.3. InterCongress of Commission 2.5 IUSSSoil chemical, physical and biological interfacial reactions, Labo/service de l'auteur, Ville service, Pays service., Jun 2011, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02746836 v1

Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes

Sébastien Terrat , Richard Christen , Samuel S. Dequiedt , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel et al.
1ères Rencontres bioinformaticiens et statisticiens de l’INRA, Mar 2011, Versailles, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-01137014 v1

Quel renouvellement des questions de recherche sur les légumineuses ?

Anne-Sophie Voisin , Julie Gueguen , Christian Huyghe , Marie-Helene Jeuffroy , Marie-Benoît Magrini et al.
Workshop légumineuses: Atelier de réflexion pour un renouvellement des questions de recherche sur les Légumineuses : du gène à la filière, Sep 2011, Dijon, France. 4 p
Communication dans un congrès hal-02804480 v1

Quel renouvellement des questions de recherches sur les légumineuses ?

Anne-Sophie Voisin , Jacques Guéguen , Christian Huyghe , Marie-Helene Jeuffroy , Marie-Benoît Magrini et al.
Atelier de réflexion pour un renouvellement des questions de recherche sur les légumineuses : du gène à la filière, Sep 2011, Dijon, France. 4 p
Communication dans un congrès hal-01003340 v1

Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to assess interaction between genotypes of Medicago truncatula and the soil bacterial communities

Anouk Zancarini , Christophe Mougel , Christophe Salon , Nathalie Munier-Jolain
Rhizosphere 3 International Conference, Sep 2011, Perth, Australia
Communication dans un congrès hal-02744462 v1

Etude de l’interaction « Plante x Communauté microbienne du sol » chez l’espèce modèle <em>Medicago truncatula</em>

Anouk Zancarini , Christophe Mougel , Christophe Salon , Nathalie Munier-Jolain
16eme Forum des Jeunes Chercheurs, Jun 2010, Besançon, France. 16 p
Communication dans un congrès hal-02822520 v1

Crosstalks between soil microbial communities and a nitrogen fixing legume species (medicago truncatula) during its Vegetative Stage

Anouk Zancarini , Christophe Mougel , Christophe Salon , Nathalie Munier-Jolain
5. International Food Legumes Research Conference (IFLRC V) and 7. European Conference on Grain Legumes (AEPVII) ; Legumes for Global Health Legume Crops and Products for Food, Feed and Environmental Benefits, Apr 2010, Antalya, Turkey
Communication dans un congrès hal-02753416 v1
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Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity

Samuel S. Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré et al.
4ème Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM), Aug 2009, Lyon, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-01137004 v1

Iron dynamics in the rhizosphere as a case study for analysing interactions among soils, plants and microbes

Philippe P. Lemanceau , Gérard G. Vansuyt , Laure L. Avoscan , Eric E. Bernaud , Thérèse Corberand et al.
8. International PGPR Workshop, May 2009, Portland, United States. n.p
Communication dans un congrès hal-02820723 v1

Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphere

Philippe P. Lemanceau , Gérard G. Vansuyt , Agnès Robin , Laure L. Avoscan , Sylvie S. Mazurier et al.
12. International Symposium on Micropial Ecology - ISME 12, International Society for Microbial Ecology (ISME). Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Cairns, INT., Aug 2008, Cairns, Australia
Communication dans un congrès hal-01001210 v1

Proteomes of arbuscular mycorrhizal symbiosis : past and present achievements

Eliane Dumas-Gaudot , Ghislaine Recorbet , Franck Robert , Nardjis Amiour , Pierre Offre et al.
Proteomlux 2008 : Proteomics in Plants, Microorganisms and Environment, 2008, Luxembourg, Luxembourg
Communication dans un congrès hal-03746917 v1

Assessment of the impact of the cultivation of different cultivars of maize, including Bt-maize varieties, on soil- and plant-associated microbial and fungal functional communities

Amadou A. Sarr , Laurent L. Philippot , Lionel Ranjard , Christophe Mougel , Véronique Edel-Hermann et al.
Monsanto Bt Maize Symposium, Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service., Mar 2008, La Hulpe, Belgium. 1 p
Communication dans un congrès hal-01001208 v1
Image document

Association préférentielle entre les mycorhizes à arbuscules et les <em>pseudomonas</em> saprophytes présentant des systèmes de sécrétion de type III

Amandine Viollet , Thérèse Corberand , Agnès Robin , Christophe Mougel , Philippe P. Lemanceau et al.
Journées Francophones Mycorhizes, Sep 2008, Dijon, France. 47 p
Communication dans un congrès hal-02757118 v1

Implication of pyoverdines in the interactions of fluorescent pseudomonads with soil microflora and plant in the rhizosphere

Philippe P. Lemanceau , Gérard G. Vansuyt , Agnès Robin , Laure L. Avoscan , Sylvie S. Mazurier et al.
9. International Congress of Plant Pathology ICPP 2008, Aug 2008, Turin, Italy
Communication dans un congrès hal-02819512 v1

Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphere

Philippe P. Lemanceau , Agnès Robin , Gérard G. Vansuyt , Sylvie S. Mazurier , Christophe Mougel et al.
XIII International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2007, Sorrento, Italy
Communication dans un congrès hal-02815878 v1

Medicago species affect the community composition of arbuscular mycorrhizal fungi associated with roots

Barbara Pivato , Sylvie S. Mazurier , Philippe P. Lemanceau , Séverine S. Siblot , Graziella Berta et al.
International Conference "Rhizosphere 2", Aug 2007, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02758002 v1

Populations bactériennes associées aux racines mycorhizées de Medicago truncatula: de la communauté à la souche bactérienne

Pierre P. Offre , Barbara Pivato , Sylvie S. Mazurier , Séverine S. Siblot , Philippe P. Lemanceau et al.
Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service, FRA., Jan 2007, Brest, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-00956065 v1

Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphere

Philippe P. Lemanceau , Gérard G. Vansuyt , Agnès Robin , Sylvie S. Mazurier , Christophe Mougel
In Buffon Legacy Conference, Sep 2007, Dijon, France
Communication dans un congrès hal-02754879 v1
Image document

How genetic pressure of [i]Medicago trunculata[/i] acts on the molecular selection and population pattern of its favourite symbiotic bacteria, [i]Sinorhizobium[/i] sp.?

Cécile Rangin , Gilles Béna , Brigitte Brunel , Marie-Mathilde Perrineau , Lucette Mauré et al.
International Conference Rhizosphere 2, Aug 2007, Montpellier, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-01190292 v1

Effect of arbuscular mycorrhiza establishment on the genetic structure and diversity of bacteria in the rhizosphere of Medicago truncatula

Pierre Offre , Barbara Pivato , Sylvie S. Mazurier , Séverine S. Siblot , Thérèse Corberand et al.
Buffon Legacy Conference, Sep 2007, Dijon, France
Communication dans un congrès hal-02753073 v1

Interactions durables entre plantes et microorganismes dans les sols

Philippe P. Lemanceau , Sylvie S. Mazurier , Christophe Mougel , Pierre Offre , Barbara Pivato et al.
Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Jan 2006, Dijon, France
Communication dans un congrès hal-02823861 v1

Toward an integrated approach for studying plant-microbe interactions in the rhizosphere: from genomic to proteomic

Philippe P. Lemanceau , Sylvie S. Mazurier , Christophe Mougel , Pierre Offre , Barbara Pivato et al.
2nd annual meeting of the Dutch Ecogenomics Research Program ‘Assessing the living soil’ Royal Sciences Academy of The Netherlands, Apr 2006, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02819016 v1

La variabilité biologique, sérologique et moléculaire des lutéovirus pathogènes vis-à-vis de la betterave, permet la caractérisation de trois espèces virales distinctes

S. Hauser , M. Stevens , Christophe Mougel , Etienne E. Herrbach , H. Smith et al.
7. Rencontres de virologie végétale, Mar 1999, Aussois, France
Communication dans un congrès hal-02771425 v1

Etude phylogénétique des luteoviridae pathogènes pour la betterave sucrière

S. Hauser , M. Stevens , Christophe Mougel , Etienne E. Herrbach , H. Smith et al.
1. Journées francophones de virologie, Apr 1999, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02837857 v1

Serological and genomic variability of sugar beet-infecting beet mild yellowing luteovirus (BMYV) isolates and discrimination with another related luteovirus

Olivier O. Lemaire , Etienne E. Herrbach , Christophe Mougel , Catherine Reinbold , Yves Bouchery et al.
2. Colmar symposium for biological sciences, May 1996, Colmar, France. pp.92
Communication dans un congrès hal-02837519 v1
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Medicago truncatula genotype drives the plant nutritional strategy and its associated rhizosphere bacterial communities

A Zancarini , C Le Signor , S Terrat , J Aubert , C Salon et al.
5th Plant Microbiome Symposium, Jun 2024, Amsterdam, Netherlands
Poster de conférence hal-04609167 v1
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Reference guided genome assembly in metagenomic samples

Cervin Guyomar , Wesley Delage , Fabrice Legeai , Christophe Mougel , Jean-Christophe Simon et al.
RECOMB 2018 - 22nd International Conference on Research in Computational Molecular Biology, Apr 2018, Paris, France. pp.1
Poster de conférence hal-01934823 v1

The soil microbiota diversity influences clubroot disease by modulation of Brassica napus and Plasmodiophora brassicae transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt et al.
International Phytobiomes Conference, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03348616 v1

The soil microbiota diversity influences clubroot disease by modulation of host plant and pathogen transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt et al.
Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France
Poster de conférence hal-03348609 v1
Image document

Does the soil microbiota diversity influence the interactions between Brassica napus and its bioagressors ?

Lionel Lebreton , Valérie Chaminade , Anne Marie Cortesero , Stéphanie Daval , Sylvain Fournet et al.
Phytobiome, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03232457 v1
Image document

Does crop diversification impact plant-soil interactions?

Mira Sébastian , Christophe Mougel , Edith Le Cadre-Barthélemy
15th Congress of the European Society for Agronomy ESA 2018, Aug 2018, Genève, Switzerland. 2018
Poster de conférence hal-03160798 v1

Does the soil microbiota modulate the interactions between Brassica napus and its bioagressors?

Lionel Lebreton , Anne-Marie Cortesero , Stéphanie Daval , Sylvain Fournet , Kévin Gazengel et al.
Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France
Poster de conférence hal-03348613 v1

Influence of soil microbial diversity and host plant genotype on the structure and diversity of root microbiota of Brassica napus infected with Plasmodiophora brassicae

Alain Sarniguet , Lionel Lebreton , Kévin Gazengel , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Juliette Linglin et al.
International Phytobiomes Conference, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03348615 v1

Evidence of a core microbiota shaped by plant and earthworm interactions across soils

Samuel Jacquiod , Ruben Puga Freitas , Aymé Spor , Arnaud Mounier , Cécile Monard et al.
17. International Society of Microbial Ecology (ISME17), Aug 2018, Leipzig, Germany. , 2018
Poster de conférence hal-02785624 v1

Influence de la diversité du microbiome du sol sur l'agent pathogène tellurique responsable de la hernie des crucifères

Arnaud Belcour , Kévin Gazengel , Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Juliette Linglin et al.
Journées d'animation du réseau PhytoMic, Nov 2017, Paris, France
Poster de conférence hal-03348606 v1
Image document

Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approaches

Cervin Guyomar , Fabrice Legeai , Christophe Mougel , Claire Lemaitre , Jean-Christophe Simon
JOBIM 2017 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2017, Lille, France
Poster de conférence hal-01638884 v1

A new conceptual framework shows that plant genotype and soil nitrogen availability modify both plant nutritional strategies and diversity of their associated rhizosphere microbiome

Anouk Zancarini , Christophe Mougel , Anne-Sophie Voisin , Marion Prudent , Christophe Salon et al.
Rhizosphere 4, Jun 2015, Maastricht, Netherlands
Poster de conférence hal-04080970 v1
Image document

Dynamics of bacterial and fungal rhizosphere communities during the infection of Brassica rapa roots by the protist Plasmodiophora brassicae

Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel , Stéphanie Daval , Alain Sarniguet et al.
Pathobiome, Jun 2015, Maison-Alfort, France
Poster de conférence hal-03231661 v1

Dynamique des communautés bactériennes et fongiques de la rhizosphère au cours de l’infection de racines de Brassica rapa par le protiste obligatoire, agent de la hernie des crucifères, Plasmodiophora brassicae.

Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel , Stéphanie Daval , Alain Sarniguet et al.
9e Colloque de la Société Française de Phytopathologie., Jun 2015, Colmar, France
Poster de conférence hal-03348604 v1
Image document

Optimized and standardized 192-plex solution for 16S rDNA gene sequencing on Illumina Miseq platform to assess soil biodiversity

J. Denonfoux , C. Wahl , Jean-Pierre Gauthier , Y. Laurent , Lionel Lebreton et al.
1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), Dec 2014, Dijon, France. 703 p., 2014
Poster de conférence hal-01208772 v1

Soil microbial diversity effects on primary production and symbiotic interactions

Clémentine Lepinay , Céline Faivre-Primot , Florence Deau , Julie Aubert , Sébastien Terrat et al.
32. New Phytologist Symposium. Plant interactions with other organisms: molecules, ecology and evolution, Nov 2013, Buenos Aires, Argentina. , 2013
Poster de conférence hal-01197630 v1
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Vers une optimisation de la procédure d’extraction d’ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes ribosomiques

Pierre Plassart , Sébastien Terrat , Rob I. Griffiths , Bruce Thomson , Mélanie M. Lelievre et al.
Workshop Interactions des microorganismes avec leurs environnements: circulation, adaptation, Jun 2012, Dijon, France. 2012
Poster de conférence hal-01208712 v1

Plateforme GenoSol : une structure logistique d'appui à la recherche sur la microbiologie des sols et de l'environnement

Samuel S. Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Fabien Morin et al.
Workshop Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements: Circulation, Adaptation, Jun 2012, Dijon, France. , 2012, Interactions des microorganismes avec leurs environements : circulation, adaptation
Poster de conférence hal-01208689 v1

Influence du système de sécrétion de type III bactérien dans les intéractions plantes-Pseudomonas spp. fluorescents non pathogènes

Amandine Viollet , Thérèse Corberand , Christophe Mougel , Laure Avoscan , Gérard Vansuyt et al.
Workshop Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements : Circulation, Adaptation, Jun 2012, Dijon, France, 6-7 juin 2012, France. , 2012
Poster de conférence hal-01208713 v1
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Deep sequencing of 16S rRNA gene to efficiently assess bacterial richness and the rare biosphere in soils

Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Dipankar Bachar , Richard Christen , Christophe Mougel et al.
14. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Aug 2012, Copenhague, Danemark, Netherlands. 1 p., 2012
Poster de conférence hal-02806957 v1

Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Sébastien Terrat , Pierre Plassart , Richard Christen , Samuel S. Dequiedt , Mélanie M. Lelievre et al.
Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE, Apr 2012, Aussois, France. 2012
Poster de conférence hal-01208717 v1

Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to assess interaction between genotypes of <em>Medicago truncatula</em> and the soil bacterial communities

Anouk Zancarini , Christophe Mougel , Christophe Salon , Nathalie Munier-Jolain
17eme Forum des Jeunes Chercheurs "Jeunes chercheurs, explorons la bulle professionnelle", Jun 2011, Dijon, France. 155 p., 2011
Poster de conférence hal-02749671 v1

Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Sébastien Terrat , Pierre Plassart , R. Christen , Samuel Dequiedt , Tiffanie Régnier et al.
5ième colloque de l’Association Francophone Ecologie Microbienne (AFEM), Nov 2011, Hammamet, Tunisie. , 1 p., 2011
Poster de conférence hal-02808211 v1

Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Sébastien Terrat , Pierre Plassart , R. Christen , Samuel Dequiedt , Tiffanie Régnier et al.
Colloque Génomique Environnementale, Nov 2011, Ecully, France. , 1 p., 2011
Poster de conférence hal-02807955 v1
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Description of a strategy for analyzing the feedback loop of the interactions between plants, arbuscular mycorrhizal fungi and bacteria

Philippe P. Lemanceau , Sylvie S. Mazurier , Christophe Mougel , Pierre Offre , Barbara Pivato et al.
Ecology of Soil Microorganisms Conference, Apr 2011, Prague, Czech Republic. , 121 p., 2011
Poster de conférence hal-02747493 v1

Studying the arbuscular mycorrhizal symbiosis from axenic system to soilborne interactions by proteomics: which challenges to face?

Eliane Dumas-Gaudot , Ghislaine Recorbet , Franck Robert , Nardjis Amiour , Pierre Offre et al.
Congrès SMAP (Spectrométrie de masse et analyse protéomique), Sep 2009, Dijon, France
Poster de conférence hal-03746880 v1
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Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity

Samuel Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré et al.
10. Symposium on Bacterial Genetics and Ecology - Coexisting on a Changing Planet (BAGECO 10), Jun 2009, Uppsala, Sweden. 18 p., 2009
Poster de conférence hal-02752945 v1
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Arbuscular mycorrhizae influence the occurence of soil fluorescent pseudomonads harbouring type III secretion systems

Amandine Viollet , Thérèse Corberand , Adeline Robin , Christophe Mougel , Philippe P. Lemanceau et al.
Bageco 10 - Bacterial genetics and ecology, Jun 2009, Uppsala, Sweden. , 1p., 2009
Poster de conférence hal-02755399 v1
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Comparison of the genetic structure and diversity of bacteria associated with mycorrhized and non-mycorrhized roots of Medicago truncatula

Pierre Offre , Barbara Pivato , Sylvie S. Mazurier , Séverine S. Siblot , Thérèse Corberand et al.
International Conference Rhizosphere 2, Aug 2007, Dijon, France. , 1 p., 2007
Poster de conférence hal-02751762 v1
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Influence des associations symbiotiques de Medicago truncatula sur la microflore rhizosphérique et les transferts de carbone vers la rhizosphère

Christophe Mougel , Agnès Robin , Aurélie Talon , Emile Benizri , Thérèse Corberand et al.
5èmes journées d'Ecologie Fonctionnelle, Mar 2003, Nancy, France
Poster de conférence hal-04521390 v1
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Effects of mycorrhization and nodulation on the structure and diversity of fluorescent pseudomonads associated with Medicago truncatula roots

Agnès Robin , Thérèse Corberand , Christophe Robin , Emile Benizri , Philippe Lemanceau et al.
1st FEMS Congress of European Microbiologists, Jun 2003, Ljubljana, Slovenia
Poster de conférence hal-04475569 v1

Influence of symbiotic status of roots on carbon allocation to roots and rhizosphere of Medicago truncatula

Aurélie Talon , Christophe Robin , Christophe Mougel , Emile Benizri
First meeting of the COST 631 Action, Oct 2002, Vienne (AUT), Austria
Poster de conférence hal-04490914 v1

Effects of mycorhization and nodulation on the structure and diversity of fluorescent pseudomonads associated with Medicago truncatula roots

Agnès Robin , Thérèse Corberand , Christophe Robin , Émile Benizri , Philippe Lemanceau et al.
First meeting of the COST 631 Action, Oct 2002, Vienne, Austria
Poster de conférence hal-04490859 v1

Comment les bactéries perçoivent et répondent aux modifications de leur environnement ? Génomique comparative des systèmes à deux composantes bactériens : organisation, distribution et fonction

Christophe Mougel , I.B. Zhulin
3. Colloque Rhizosphère, Nov 2001, Dijon, France. 1 p., 2001
Poster de conférence hal-02826749 v1

Plant Microbiota: Diversity, Transmission and Function

Matthieu Barret , Marc Buée , Christophe Mougel , Corinne Vacher
Extended Biocontrol, Springer Netherlands, pp.111-117, 2022, ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_9⟩
Chapitre d'ouvrage hal-04059155 v1

Agroecological Protection to Support Plant Health: Where the Microbiota Fits In

Claudia Bartoli , Jean-Noël Aubertot , Isabelle Litrico , Christophe Mougel
Xavier Fauvergue; Adrien Rusch; Matthieu Barret; Marc Bardin; Emmanuelle Jacquin-Joly; Thibaut Malausa; Christian Lannou. Extended Biocontrol, Springer Netherlands, pp.119-125, 2022, 978-94-024-2150-7. ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_10⟩
Chapitre d'ouvrage hal-04181895 v1

Le microbiote des plantes : diversité, transmission et fonction

Matthieu Barret , Marc Buée , Christophe Mougel , Corinne Vacher
Biocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Editions Quae, 2020, Savoir Faire, 978-2-7592-3076-1
Chapitre d'ouvrage hal-03319624 v1

Protection agroécologique pour le maintien de la santé des plantes

Claudia Bartoli , Jean-Noël Aubertot , Isabelle Litrico-Chiarelli , Christophe Mougel
Biocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Éditions Quae, 376p., 2020, Savoir faire, 978-2-7592-3076-1
Chapitre d'ouvrage hal-04204459 v1

Métagénomique et métatranscriptome

Christophe Mougel
Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3
Chapitre d'ouvrage hal-03318972 v1

Qu’attendre des recherches en microbiologie du sol ?

Philippe P. Lemanceau , Pierre-Alain Maron , Sylvie S. Mazurier , Christophe Mougel , Laurent L. Philippot et al.
Fertilisation et environnement. Quelles pistes pour l'aide à la décision ?, Chapitre 10, Editions Quae ACTA, le réseau des instituts des filières animales et végétales, pp.288, 2014, Matière à Débattre et Décider, 978-2-7592-2055-7 978-2-85794-280-1
Chapitre d'ouvrage hal-02797138 v1

Combining molecular microbial ecology with ecophysiology and plant genetics for a better understanding of plant-microbial communities' interactions in the rhizosphere.

Anouk Zancarini , Clémentine Lepinay , Judith Burstin , Gérard Duc , Philippe P. Lemanceau et al.
F.J. de Bruijn. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere, 1, Wiley-Blackwell, pp.69-86, 2013, 978-1-118-29617-2. ⟨10.1002/9781118297674.ch7⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01119954 v1

Biogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative

Lionel Ranjard , Samuel Dequiedt , Claudy Jolivet , Nicolas Saby , Jean Thioulouse et al.
Eric Lichtfouse; Marjolaine Hamelin; Mireille Navarrete; Philippe Debaeke. Sustainable Agriculture Volume 2, Springer, pp.857-865, 2011, 978-94-007-0393-3. ⟨10.1007/978-94-007-0394-0_37⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00860770 v1

Microbial ecology of the rhizosphere

P. Lemanceau , P. Offre , Christophe Mougel , E. Gamalero , Y. Dessaux et al.
Microbiological methods for assessing soil quality, CABI Publishing, pp.228-230, 2006
Chapitre d'ouvrage hal-00119328 v1

Microbial ecology of the rhizosphere

Philippe P. Lemanceau , Pierre Offre , Christophe Mougel , Elisa Gamalero , Yves Dessaux et al.
Microbiological methods for assessing soil quality, 2005
Chapitre d'ouvrage hal-02832084 v1