CM
Christophe Mougel
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Reference-guided genome assembly in metagenomic samplesJOBIM 2019 - Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France. pp.1-8
Conference papers
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Holobionte : concept et enjeux pour la biologie des plantes et la génétiqueJournées Scientifiques du Département de Biologie et Amélioration des Plantes INRA, Sep 2019, Presqu'île de Giens, France
Conference papers
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Plant genotype: a lever in the interactions between plant and its associated rhizosphere microbiome2nd Plant Microbiome Symposium, Feb 2018, Amsterdam, Netherlands
Conference papers
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Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approachesInternational Conference on Holobionts, Apr 2017, Paris, France
Conference papers
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Le phytobiome: concept et potentiel d'utilisation en amélioration des plantesConseil scientifique du Département BAP, Feb 2017, Paris, France
Conference papers
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Microbial metacommunity: a METABAR coding approach2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
Conference papers
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A core microbiota of plant and earthworm interaction? Phylogenetic and functional aspectsInternational Conference on Holobionts, Apr 2017, paris, France
Conference papers
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Digital Autoradiography technique an efficient tool for sampling procedureD&RS conference 2016 - Decommissioning and Remote Systems Conference, Jul 2016, Pittsburg, United States
Conference papers
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Quels effets la diversité microbienne du sol a-t-elle sur la croissance et la santé des plantes ?Colloque de Génomique Environnementale, Oct 2015, Montpellier, France
Conference papers
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Latent Block Model for ecological abundance data30. European Meeting of Statisticians, Jul 2015, Amsterdam, Netherlands
Conference papers
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Strategies for analyzing interactions between arbuscular mycorrhiza and bacteriaConférences Jacques-Monod, Dec 2013, Roscoff, France
Conference papers
hal-02747379v1
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Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des solsWorkshop"Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements : Circulation, Adaptation", Jun 2012, Dijon, France
Conference papers
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistesJournées d'animation "MEM Days" organisées par l'INRA, Jan 2012, Ecully, France
Conference papers
hal-02809171v1
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Connecting soil biodiversity to functions and ecosystem services: presentation of case studies and of the EU FP7 project EcoFINDERS4. International Congress Eurosoil 2012 - Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment, Jul 2012, Bari, Italy
Conference papers
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Monitoring microbial diversity in European soils: ongoing projects and challenges6. SETAC (Society of Environmental Toxicology and Chemistry)World Congress, SETAC Europe 22nd annual meeting, Securing a sustainable future: Integrating science, policy and people, May 2012, Berlin, Germany. 119 p
Conference papers
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité et la richesse des communautés microbiennes de sols issus d'échantillonnage de grande ampleurEcole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE, Apr 2012, Aussois, France
Conference papers
hal-01208719v1
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Evaluation of the ISO standard 11063 “Soil DNA Extraction Procedure” for Assessing Microbial Abundance and Community Structure14. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Aug 2012, Copenhague, Denmark
Conference papers
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Maîtrise et gestion de la biodiversité dans les sols: quelles perspectives ?Carrefours de l'Innovation Agronomique (CIAG) 2012. Évaluer et gérer la fertilité des sols, Apr 2012, Orléans, France
Conference papers
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Influence of Soil DNA Extraction Procedure to Assess Bacterial Diversity using Pyrosequencing of 16S rDNANENUN ISME-Workshop: Extraction of Microbial DNA & RNA in Environmental Samples, Aug 2012, Copenhague, Denmark
Conference papers
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Diversité et activités microbiennes dans la rhizosphère: des atouts majeurs en agroécologieAlliances au pays des racines - 14e Colloque Scientifique de la Société d'Horticulture de France, May 2012, Paris, France
Conference papers
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes1ères Rencontres bioinformaticiens et statisticiens de l’INRA, Mar 2011, Versailles, France. 1 p
Conference papers
hal-01137014v1
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Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to assess interaction between genotypes of Medicago truncatula and the soil bacterial communitiesRhizosphere 3 International Conference, Sep 2011, Perth, Australia
Conference papers
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Quel renouvellement des questions de recherches sur les légumineuses ?Atelier de réflexion pour un renouvellement des questions de recherche sur les légumineuses : du gène à la filière, Sep 2011, Dijon, France. 4 p
Conference papers
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Quel renouvellement des questions de recherche sur les légumineuses ?Workshop légumineuses: Atelier de réflexion pour un renouvellement des questions de recherche sur les Légumineuses : du gène à la filière, Sep 2011, Dijon, France. 4 p
Conference papers
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Vers une optimisation de la procédure d'extraction d'ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes ribosomiques5ième colloque de l’Association Francophone Ecologie Microbienne (AFEM), Ville service., Nov 2011, Hammamet, Tunisie. 1 p
Conference papers
hal-01231285v1
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Costs-benfits trade-off in the intercation between Medicago truncatula and Pseudomonas fluorescens C7R12 across atmospheric carbon dioxide modulationRhizosphere 3, University of Western Australia. Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Perth, AUS., Sep 2011, Perth, Australia. 1 p
Conference papers
hal-00999982v1
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Influence of Soil DNA Extraction Procedure to Assess Bacterial Diversity using Pyrosequencing of 16S rDNA6. ISMOM: International Symposium of Interactions of Soil Minerals withOrganic Components and Microorganisms.3. InterCongress of Commission 2.5 IUSSSoil chemical, physical and biological interfacial reactions, Labo/service de l'auteur, Ville service, Pays service., Jun 2011, Montpellier, France
Conference papers
hal-02746836v1
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Crosstalks between soil microbial communities and a nitrogen fixing legume species (medicago truncatula) during its Vegetative Stage5. International Food Legumes Research Conference (IFLRC V) and 7. European Conference on Grain Legumes (AEPVII) ; Legumes for Global Health Legume Crops and Products for Food, Feed and Environmental Benefits, Apr 2010, Antalya, Turkey
Conference papers
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Etude de l’interaction « Plante x Communauté microbienne du sol » chez l’espèce modèle Medicago truncatula16eme Forum des Jeunes Chercheurs, Jun 2010, Besançon, France. 16 p
Conference papers
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Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity4ème Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM), Aug 2009, Lyon, France. 1 p
Conference papers
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Iron dynamics in the rhizosphere as a case study for analysing interactions among soils, plants and microbes8. International PGPR Workshop, May 2009, Portland, United States. n.p
Conference papers
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Implication of pyoverdines in the interactions of fluorescent pseudomonads with soil microflora and plant in the rhizosphere9. International Congress of Plant Pathology ICPP 2008, Aug 2008, Turin, Italy
Conference papers
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Association préférentielle entre les mycorhizes à arbuscules et les pseudomonas saprophytes présentant des systèmes de sécrétion de type IIIJournées Francophones Mycorhizes, Sep 2008, Dijon, France. 47 p
Conference papers
hal-02757118v1
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Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphere12. International Symposium on Micropial Ecology - ISME 12, International Society for Microbial Ecology (ISME). Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Cairns, INT., Aug 2008, Cairns, Australia
Conference papers
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Assessment of the impact of the cultivation of different cultivars of maize, including Bt-maize varieties, on soil- and plant-associated microbial and fungal functional communitiesMonsanto Bt Maize Symposium, Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service., Mar 2008, La Hulpe, Belgium. 1 p
Conference papers
hal-01001208v1
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Proteomes of arbuscular mycorrhizal symbiosis : past and present achievementsProteomlux 2008 : Proteomics in Plants, Microorganisms and Environment, 2008, Luxembourg, Luxembourg
Conference papers
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How genetic pressure of [i]Medicago trunculata[/i] acts on the molecular selection and population pattern of its favourite symbiotic bacteria, [i]Sinorhizobium[/i] sp.?International Conference Rhizosphere 2, Aug 2007, Montpellier, France. 1 p
Conference papers
hal-01190292v1
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Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphereXIII International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2007, Sorrento, Italy
Conference papers
hal-02815878v1
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Effect of arbuscular mycorrhiza establishment on the genetic structure and diversity of bacteria in the rhizosphere of Medicago truncatulaBuffon Legacy Conference, Sep 2007, Dijon, France
Conference papers
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Populations bactériennes associées aux racines mycorhizées de Medicago truncatula: de la communauté à la souche bactérienneRéseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service, FRA., Jan 2007, Brest, France. 1 p
Conference papers
hal-00956065v1
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Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphereIn Buffon Legacy Conference, Sep 2007, Dijon, France
Conference papers
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Medicago species affect the community composition of arbuscular mycorrhizal fungi associated with rootsInternational Conference "Rhizosphere 2", Aug 2007, Montpellier, France
Conference papers
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Toward an integrated approach for studying plant-microbe interactions in the rhizosphere: from genomic to proteomic2nd annual meeting of the Dutch Ecogenomics Research Program ‘Assessing the living soil’ Royal Sciences Academy of The Netherlands, Apr 2006, Amsterdam, Netherlands
Conference papers
hal-02819016v1
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Interactions durables entre plantes et microorganismes dans les solsRéseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Jan 2006, Dijon, France
Conference papers
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La variabilité biologique, sérologique et moléculaire des lutéovirus pathogènes vis-à-vis de la betterave, permet la caractérisation de trois espèces virales distinctes7. Rencontres de virologie végétale, Mar 1999, Aussois, France
Conference papers
hal-02771425v1
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Etude phylogénétique des luteoviridae pathogènes pour la betterave sucrière1. Journées francophones de virologie, Apr 1999, Paris, France
Conference papers
hal-02837857v1
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Serological and genomic variability of sugar beet-infecting beet mild yellowing luteovirus (BMYV) isolates and discrimination with another related luteovirus2. Colmar symposium for biological sciences, May 1996, Colmar, France. pp.92
Conference papers
hal-02837519v1
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Plant Microbiota: Diversity, Transmission and FunctionExtended Biocontrol, Springer Netherlands, pp.111-117, 2022, ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_9⟩
Book sections
hal-04059155v1
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Agroecological Protection to Support Plant Health: Where the Microbiota Fits InXavier Fauvergue; Adrien Rusch; Matthieu Barret; Marc Bardin; Emmanuelle Jacquin-Joly; Thibaut Malausa; Christian Lannou. Extended Biocontrol, Springer Netherlands, pp.119-125, 2022, 978-94-024-2150-7. ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_10⟩
Book sections
hal-04181895v1
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Le microbiote des plantes : diversité, transmission et fonctionBiocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Editions Quae, 2020, Savoir Faire, 978-2-7592-3076-1
Book sections
hal-03319624v1
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Protection agroécologique pour le maintien de la santé des plantesBiocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Éditions Quae, 376p., 2020, Savoir faire, 978-2-7592-3076-1
Book sections
hal-04204459v1
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Métagénomique et métatranscriptomePrincipes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3
Book sections
hal-03318972v1
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Qu’attendre des recherches en microbiologie du sol ?Fertilisation et environnement. Quelles pistes pour l'aide à la décision ?, Chapitre 10, Editions Quae ACTA, le réseau des instituts des filières animales et végétales, pp.288, 2014, Matière à Débattre et Décider, 978-2-7592-2055-7 978-2-85794-280-1
Book sections
hal-02797138v1
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Combining molecular microbial ecology with ecophysiology and plant genetics for a better understanding of plant-microbial communities' interactions in the rhizosphere.F.J. de Bruijn. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere, 1, Wiley-Blackwell, pp.69-86, 2013, 978-1-118-29617-2. ⟨10.1002/9781118297674.ch7⟩
Book sections
hal-01119954v1
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Biogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiativeEric Lichtfouse; Marjolaine Hamelin; Mireille Navarrete; Philippe Debaeke. Sustainable Agriculture Volume 2, Springer, pp.857-865, 2011, 978-94-007-0393-3. ⟨10.1007/978-94-007-0394-0_37⟩
Book sections
hal-00860770v1
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Microbial ecology of the rhizosphereMicrobiological methods for assessing soil quality, CABI Publishing, pp.228-230, 2006
Book sections
hal-00119328v1
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Microbial ecology of the rhizosphereMicrobiological methods for assessing soil quality, 2005
Book sections
hal-02832084v1
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Brevet INRA, INOVIAFLOW «Rhizotron et utilisations de celui-ci»N° de brevet: EP 2 679 088 A1. 2012, 28p
Patents
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Le Centre Inra de Dijon2012
Other publications
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Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes2020
Preprints, Working Papers, ...
hal-02487262v1
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Effet de la rotation des cultures sur la microflore du sol et son activité[Contrat] 06516CP015S250, 2009
Reports
hal-02820219v1
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Dynamique des intéractions plante-microorganismes dans la rhizosphère: vers une meilleure prise en compte du fonctionnement de la plante et conséquence évolutiveSciences du Vivant [q-bio]. Université de Bourgogne, 2010
Accreditation to supervise research
tel-02815117v1
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