Christophe Mougel

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Article dans une revue (83)

The capacity to suppress wheat crown rot disease occurs naturally in contrasted farm soils Alix Catry,Simon de Donder,Richard Blanc,Michaël Denefle,Romain Bouquetet al. Rhizosphere, 2026, 38, pp.101320. ⟨10.1016/j.rhisph.2026.101320⟩ Article dans une revue hal-05587477v1
Carbon substrates utilization determine antagonistic fungal-fungal interactions among root-associated fungi Rosa Kemmerling,Louise-Elisabeth Dintilhac,Anouk Zancarini,Alice Mataigne,Christophe Mougelet al. Frontiers in Microbiology, 2025, 16, pp.1645107. ⟨10.3389/fmicb.2025.1645107⟩ Article dans une revue hal-05227488v1
Medicago truncatula genotype drives the plant nutritional strategy and its associated rhizosphere bacterial communities Anouk Zancarini,Christine Le Signor,Sébastien Terrat,Julie Aubert,Christophe Salonet al. New Phytologist, 2025, 245 (2), pp.767-784. ⟨10.1111/nph.20272⟩ Article dans une revue hal-04835437v1
Contrasting glucosinolate profiles in rapeseed genotypes shape the rhizosphere-insect continuum and microbial detoxification potential in a root herbivore Juliette M. Carpentier,Stéphane Derocles,Sylvain Chéreau,Bruno Marquer,Juliette Linglinet al. mSystems, 2025, 10 (12), pp.e01269-25. ⟨10.1128/msystems.01269-25⟩ Article dans une revue hal-05391655v1
Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence S. Soubeyrand,Arnaud Estoup,Astrid Cruaud,Sylvie Malembic-Maher,Christine Meynardet al. CABI Agriculture and Bioscience, 2024, 5, pp.72. ⟨10.1186/s43170-024-00273-8⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-04672656v1
A field indicator for rhizosphere effect monitoring in arable soils Sébastian Mira,Mathieu Emily,Christophe Mougel,Morgane Ourry,Edith Le Cadre-Barthélemy Plant and Soil, 2022, 478, pp.325-346. ⟨10.1007/s11104-021-05284-2⟩ Article dans une revue hal-03524069v1
Les microbiotes associés aux plantes : un enjeu majeur Lionel Lebreton,Christophe Mougel Phytoma, 2021, 747, pp.14-18 Article dans une revue hal-03407614v1
Influential Insider: Wolbachia, an Intracellular Symbiont, Manipulates Bacterial Diversity in Its Insect Host Morgane Ourry,Agathe Crosland,Valérie Lopez,Stephane A. P. Derocles,Christophe Mougelet al. Microorganisms, 2021, 9 (6), ⟨10.3390/microorganisms9061313⟩ Article dans une revue hal-03285205v1
Fast computation of genome-metagenome interaction effects Florent Guinot,Marie Szafranski,Julien Chiquet,Anouk Zancarini,Christine Le Signoret al. Algorithms for Molecular Biology, 2020, 15 (1), art.13 (21p.). ⟨10.1186/s13015-020-00173-2⟩ Article dans une revue hal-01906069v3
MinYS: mine your symbiont by targeted genome assembly in symbiotic communities Cervin Guyomar,Wesley Delage,Fabrice Legeai,Christophe Mougel,Jean-Christophe Simonet al. NAR Genomics and Bioinformatics, 2020, 2 (3), pp.1-11. ⟨10.1093/nargab/lqaa047⟩ Article dans une revue hal-02891885v1
A core microbiota of the plant-earthworm interaction conserved across soils Samuel Jacquiod,Ruben Puga-Freitas,Aymé Spor,Arnaud Mounier,Cécile Monardet al. Soil Biology and Biochemistry, 2020, 144, pp.107754. ⟨10.1016/j.soilbio.2020.107754⟩ Article dans une revue hal-02535174v1
Hatching of Globodera pallida Induced by Root Exudates Is Not Influenced by Soil Microbiota Composition Camille Gautier,Lisa Martinez,Sylvain Fournet,Josselin Montarry,Jean-Claude Yvinet al. Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.536932. ⟨10.3389/fmicb.2020.536932⟩ Article dans une revue hal-03140131v1
Long-lasting effects of antibiotics on bacterial communities of adult flies M. Ourry,V. Lopez,M. Hervé,Lionel Lebreton,Christophe Mougelet al. FEMS Microbiology Ecology, 2020, 96 (4), pp.fiaa028. ⟨10.1093/femsec/fiaa028⟩ Article dans une revue hal-02865290v1
Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes Stéphanie Daval,Kévin Gazengel,Arnaud Belcour,Juliette Linglin,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudtet al. Microbial Biotechnology, 2020, 13 (5), pp.1648-1672. ⟨10.1111/1751-7915.13634⟩ Article dans une revue hal-02624824v2
Optimize the plant microbiota to increase plant growth and health Matthieu Barret,P. Dufour,Mylène Durand-Tardif,Mahendra Mariadassou,Christophe Mougelet al. Consortium Biocontrôle et GIS Biotechnologies Vertes , 2019, ⟨10.15454/1fve-e105⟩ Article dans une revue hal-03297096v1
Computational analysis of the Plasmodiophora brassicae genome: mitochondrial sequence description and metabolic pathway database design Stéphanie Daval,Arnaud Belcour,Kévin Gazengel,Ludovic Legrand,Jerome Gouzyet al. Genomics, 2019, 111 (6), pp.1629-1640. ⟨10.1016/j.ygeno.2018.11.013⟩ Article dans une revue hal-01943250v1
Temporal dynamics of bacterial and fungal communities during the infection of Brassica rapa roots by the protist Plasmodiophora brassicae. Lionel Lebreton,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt,Kévin Gazengel,Juliette Linglin,Morgane Ourryet al. PLoS ONE, 2019, 14 (2), pp.e0204195. ⟨10.1371/journal.pone.0204195⟩ Article dans une revue hal-02094715v1
Host-microbiota interactions: from holobiont theory to analysis Jean-Christophe Simon,Julian R. Marchesi,Christophe Mougel,Marc-André Selosse Microbiome, 2019, 7 (1), pp.7:5. ⟨10.1186/s40168-019-0619-4⟩ Article dans une revue hal-01980500v1
Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approaches Cervin Guyomar,Fabrice Legeai,Emmanuelle Jousselin,Christophe Mougel,Claire Lemaitreet al. Microbiome, 2018, 6 (1), pp.1-21. ⟨10.1186/s40168-018-0562-9⟩ Article dans une revue hal-01926402v1
Influence of Belowground Herbivory on the Dynamics of Root and Rhizosphere Microbial Communities Morgane Ourry,Lionel Lebreton,Valérie Chaminade,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt,Maxime Hervéet al. Frontiers in Ecology and Evolution, 2018, 6, pp.1-21. ⟨10.3389/fevo.2018.00091⟩ Article dans une revue hal-02184354v1
Can soil microbial diversity influence plant metabolites and life history traits of a rhizophagous insect? Tom Lachaise,Morgane Ourry,Lionel Lebreton,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt,Juliette Linglinet al. Insect Science, 2017, 24 (6), pp.1045-1056. ⟨10.1111/1744-7917.12478⟩ Article dans une revue hal-01661250v1
Pseudomonas fluorescens C7R12 type III secretion system impacts mycorrhization of Medicago truncatula and associated microbial communities Amandine Viollet,Barbara Pivato,Christophe Mougel,Jean Claude Cleyet-Marel,Cécile Gubry-Ranginet al. Mycorrhiza, 2017, 27 (1), pp.23-33. ⟨10.1007/s00572-016-0730-3⟩ Article dans une revue hal-01606859v1
Bacterial community diversity harboured by interacting species Mikaël Bili,Anne-Marie Cortesero,Christophe Mougel,Jean-Pierre Gauthier,Gwennola Ermelet al. PLoS ONE, 2016, 11 (6), 23 p. ⟨10.1371/journal.pone.0155392⟩ Article dans une revue hal-02630825v1
Soil conditions and land use intensification effects on soil microbial communities across a range of European field sites Bruce C. Thomson,Emilie Tisserant,Pierre Plassart,Stéphane Uroz,Rob I. Griffithset al. Soil Biology and Biochemistry, 2015, 88, pp.403-413. ⟨10.1016/j.soilbio.2015.06.012⟩ Article dans une revue hal-01269419v1
Plant traits related to nitrogen uptake influence plant-microbe competition Delphine Moreau,Barbara Pivato,David Bru,Hugues Busset,Florence Deauet al. Ecology, 2015, 96 (8), pp.2300-2310. ⟨10.1890/14-1761.1⟩ Article dans une revue hal-02637764v1
Understanding and managing soil biodiversity: a major challenge in agroecology Philippe P. Lemanceau,Pierre-Alain Maron,Sylvie Mazurier,Christophe Mougel,Barbara Pivatoet al. Agronomy for Sustainable Development, 2015, 35 (1), pp.67-81. ⟨10.1007/s13593-014-0247-0⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-01208787v1
Les légumineuses dans l'Europe du XXIè siècle : Quelle place dans les systèmes agricoles et alimentaires actuels et futurs ? Quels nouveaux défis pour la recherche ? Anne-Sophie Voisin,Jacques Guéguen,Christian Huyghe,Marie-Helene Jeuffroy,Marie-Benoît Magriniet al. Innovations Agronomiques, 2013, 30, pp.283-312. ⟨10.17180/767p-n553⟩ Article dans une revue hal-01005055v1
Stimulation of different functional groups of bacteria by various plant residues as a driver of soil priming effect. Noémie Pascault,Lionel Ranjard,Aurore Kaisermann,Dipankar Bachar,Richard Christenet al. Ecosystems, 2013, 16 (5), pp.810-822. ⟨10.1007/s10021-013-9650-7⟩ Article dans une revue istex hal-00847889v1
Legumes for feed, food, biomaterials and bioenergy in Europe : a review Anne-Sophie Voisin,Jacques J. Guéguen,Christian C. Huyghe,Marie-Helene M.-H. Jeuffroy,Marie-Benoît Magriniet al. Agronomy for Sustainable Development, 2013, décembre (Online), pp.1-20. ⟨10.1007/s13593-013-0189-y⟩ Article dans une revue hal-00956058v1
Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to study the relationship between Medicago truncatula genotypes and their associated rhizosphere bacterial communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Sébastien Terrat,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain Plant and Soil, 2013, 365 (1-2), pp.183 - 199. ⟨10.1007/s11104-012-1364-7⟩ Article dans une revue istex hal-02646573v1
Interaction between Medicago truncatula and Pseudomonas fluorescens: evaluation of costs and benefits across an elevated atmospheric CO2. Clémentine Lepinay,Thierry Rigaud,Christophe Salon,Philippe P. Lemanceau,Christophe Mougel PLoS ONE, 2012, 7 (9), pp.e45740. ⟨10.1371/journal.pone.0045740⟩ Article dans une revue hal-00736637v1
Soil Nitrogen Availability and Plant Genotype Modify the Nutrition Strategies of M. truncatula and the Associated Rhizosphere Microbial Communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Anne-Sophie Voisin,Marion Prudent,Christophe Salonet al. PLoS ONE, 2012, 7 (10), ⟨10.1371/journal.pone.0047096⟩ Article dans une revue hal-02646215v1
Evaluation of the ISO standard 11063 DNA extraction procedure for assessing soil microbial abundance and community structure Pierre Plassart,Sébastien Terrat,Bruce Thomson,Robert Griffiths,Samuel S. Dequiedtet al. PLoS ONE, 2012, 7 (9), 8 p. ⟨10.1371/journal.pone.0044279⟩ Article dans une revue hal-01190636v1
Molecular biomass and MetaTaxogenomic assessment of soil microbial communities as influenced by soil DNA extraction procedure Sebastien Terrat,Richard Christen,Samuel S. Dequiedt,Mélanie M. Lelievre,Virginie Nowaket al. Microbial Biotechnology, 2012, 5 (1), pp.135-141. ⟨10.1111/j.1751-7915.2011.00307.x⟩ Article dans une revue hal-01546177v1
Translation of metagenomics agroecosystems in ecological services Christophe Mougel,Pierre-Alain Maron,Laurent L. Philippot,Lionel Ranjard,Philippe P. Lemanceau Biofutur, 2011, 319, pp.44 - 47 Article dans une revue hal-02644706v1
Soil microbial diversity: Methodological strategy, spatial overview and functional interest Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,Lionel Ranjard Comptes Rendus. Biologies, 2011, 334 (5-6), pp.403-411. ⟨10.1016/j.crvi.2010.12.003⟩ Article dans une revue istex hal-02644731v1
Traduction de la métagenomique des agrosystemes en services écologiques Christophe Mougel,Pierre-Alain Maron,Laurent L. Philippot,Lionel Ranjard,Philippe P. Lemanceau Biofutur, 2011, 30 (319), pp.44-47 Article dans une revue hal-02645538v1
Fluorescent pseudomonads harboring type III secretion genes are enriched in the mycorrhizosphere of Medicago truncatula Amandine Viollet,Thérèse Corberand,Christophe Mougel,Agnès Robin,Philippe P. Lemanceauet al. FEMS Microbiology Ecology, 2011, 75 (3), pp.457-467. ⟨10.1111/j.1574-6941.2010.01021.x⟩ Article dans une revue hal-02644346v1
Validation and Application of a PCR Primer Set to Quantify Fungal Communities in the Soil Environment by Real-Time Quantitative PCR Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré,Richard Christen,Samuel S. Dequiedt,Christophe Mougel,Mélanie M. Lelievreet al. PLoS ONE, 2011, 6 (9), pp.e24166. ⟨10.1371/journal.pone.0024166⟩ Article dans une revue hal-01254016v1
Biogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative Lionel Ranjard,Samuel S. Dequiedt,Claudy C. Jolivet,Nicolas P.A. Saby,Jean Thioulouseet al. Agronomy for Sustainable Development, 2010, 30 (2), pp.359-365. ⟨10.1051/agro/2009033⟩ Article dans une revue hal-00886549v1
Plant-microbe-soil interactions in the rhizosphere: an evolutionary perspective Hans Lambers,Christophe Mougel,Benoît Jaillard,Philippe Hinsinger Plant and Soil, 2009, 321 (1-2), pp.83-115. ⟨10.1007/s11104-009-0042-x⟩ Article dans une revue istex hal-02665203v1
Impact of inoculation with the phytostimulatory PGPR Azospirillum lipoferum CRT1 on the genetic structure of the rhizobacterial community of field-grown maize Ezekiel Baudoin,Sylvie Nazaret,Christophe Mougel,Lionel Ranjard,Yvan Moenne-Loccoz Soil Biology and Biochemistry, 2009, 41 (2), pp.409-413. ⟨10.1016/j.soilbio.2008.10.015⟩ Article dans une revue istex halsde-00525716v1
Bacterial effects on arbuscular mycorrhizal fungi and mycorrhiza development as influenced by the bacteria, fungi, and host plant Barbara Pivato,Pierre Offre,Sara Marchelli,Bruno Barbonaglia,Christophe Mougelet al. Mycorrhiza, 2009, 19 (2), pp.81-90. ⟨10.1007/s00572-008-0205-2⟩ Article dans une revue istex hal-02665834v1
ECOMIC-RMQS : biogéographie microbienne à l’échelle de la France. Etat d’avancement et premiers résultats Samuel Dequiedt,Maud Lelièvre,Claudy C. Jolivet,Nicolas N. Saby,Manuel Pascal Martinet al. Étude et Gestion des Sols, 2009, 16 (3-4), pp.219-231 Article dans une revue hal-02656049v1
Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity Lionel Ranjard,Samuel Dequiedt,Mélanie M. Lelievre,Pierre-Alain Maron,Christophe Mougelet al. Environmental Microbiology Reports, 2009, 1 (2), pp.97 - 99. ⟨10.1111/j.1758-2229.2009.00023.x⟩ Article dans une revue hal-02668342v1
Contamination of soil by copper affects the dynamics, diversity, and activity of soil bacterial communities involved in wheat decomposition and carbon storage. Laetitia Bernard,Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,Virginie Nowak,Jean Lévêqueet al. Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (23), pp.7565-7569. ⟨10.1128/AEM.00616-09⟩ Article dans une revue hal-00434100v1
Response of soil bacterial community structure to successive perturbations of different types and intensities Melanie Bressan,Christophe Mougel,Samuel Dequiedt,Pierre-Alain Maron,Philippe P. Lemanceauet al. Environmental Microbiology, 2008, 10 (8), pp.2184-2187. ⟨10.1111/j.1462-2920.2008.01641.x⟩ Article dans une revue istex hal-02665170v1
Microdiversity of Burkholderiales associated with mycorrhizal and nonmycorrhizal roots of Medicago truncatula Pierre Offre,Barbara Pivato,Sylvie S. Mazurier,Séverine S. Siblot,Graziella Bertaet al. FEMS Microbiology Ecology, 2008, 65 (2), pp.180-192. ⟨10.1111/j.1574-6941.2008.00504.x⟩ Article dans une revue hal-02661182v1
Biologie des communautés dans la rhizosphère : analyse des interactions plantes - champignons mycorhizogènes à arbuscules - bactéries Barbara Pivato,Pierre Offre,Christophe Mougel,Sylvie S. Mazurier,Diederik D. van Tuinenet al. uB Sciences, 2008, 3, pp.116-125 Article dans une revue hal-02669103v1
Protein extraction and fingerprinting optimization of bacterial communities in natural environment Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,Séverine S. Siblot,Houria Abbas,Philippe P. Lemanceauet al. Microbial ecology, 2007, 53 (3), pp.426-434. ⟨10.1007/s00248-006-9121-1⟩ Article dans une revue istex hal-02661837v1
Dynamics and identification of soil microbial populations actively assimilating carbon from 13C-labelled wheat residue as estimated by DNA- and RNA-SIP techniques. Laetitia Bernard,Christophe Mougel,Pierre-Alain Maron,Virginie Nowak,Jean Lévêqueet al. Environmental Microbiology, 2007, 9 (3), pp.752-764. ⟨10.1111/j.1462-2920.2006.01197.x⟩ Article dans une revue hal-00294737v1
Metaproteomics : a new approach for studying functional microbial ecology Pierre-Alain Maron,Lionel Ranjard,Christophe Mougel,Philippe P. Lemanceau Microbial ecology, 2007, 53 (3), pp.486-493. ⟨10.1007/s00248-006-9196-8⟩ Article dans une revue istex hal-02658508v1
Fingerprinting and diversity of bacterial copA genes in response to soil types, soil organic status and copper contamination David P. H. Lejon,Virginie Nowak,Sabrina Bouko,Noémie Pascault,Christophe Mougelet al. FEMS Microbiology Ecology, 2007, 61 (3), pp.424 à 437. ⟨10.1111/j.1574-6941.2007.00365.x⟩ Article dans une revue insu-00386976v1
Diversity of root-associated fluorescent pseudomonads as affected by ferritin overexpression in tobacco. Agnès Robin,Sylvie Mazurier,Christophe Mougel,Gérard Vansuyt,Thérèse Corberandet al. Environmental Microbiology, 2007, 9 (7), pp.1724-37. ⟨10.1111/j.1462-2920.2007.01290.x⟩ Article dans une revue istex hal-00185892v1
Identification of bacterial groups preferentially associated with mycorrhizal roots of Medicago truncatula Pierre Offre,Barbara Pivato,Séverine S. Siblot,E. Gamalero,Thérèse Corberandet al. Applied and Environmental Microbiology, 2007, 73 (3), pp.913-921. ⟨10.1128/aem.02042-06⟩ Article dans une revue hal-02665197v1
Medicago species affect the community composition of arbuscular mycorrhizal fungi associated with roots Barbara Pivato,Sylvie S. Mazurier,Philippe P. Lemanceau,Séverine S. Siblot,Graziella Bertaet al. New Phytologist, 2007, 176 (1), pp.197-210. ⟨10.1111/j.1469-8137.2007.02151.x⟩ Article dans une revue hal-02664961v1
Identification of cellulolytic bacteria in soil by stable isotope probing. Feth El Zahar Haichar,Wafa Achouak,Richard Christen,Thierry Heulin,Christine Marolet al. Environmental Microbiology, 2007, 9 (3), pp.625-34. ⟨10.1111/j.1462-2920.2006.01182.x⟩ Article dans une revue istex hal-00318792v1
Dynamic of the genetic structure of bacterial and fungal communities at different developmental stages of Medicago truncatula Gaertn. cv. Jemalong line J5 Christophe Mougel,Pierre Offre,Lionel Ranjard,Thérèse Corberand,E. Gamaleroet al. New Phytologist, 2006, 170 (1), pp.165-175. ⟨10.1111/j.1469-8137.2006.01650.x⟩ Article dans une revue hal-02668733v1
Temporal variability of airborne bacterial community structure in an urban area Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,David Lejon,Esmeralda Carvalho,Karine Bizetet al. Atmospheric Environment, 2006, 40 (40), pp.8074-8080. ⟨10.1016/j.atmosenv.2006.08.047⟩ Article dans une revue istex hal-02662697v1
Effect of ferritin over-expression in tobacco on the structure of bacterial and pseudomonad communities associated with the roots Agnès Robin,Christophe Mougel,Séverine S. Siblot,Gérard G. Vansuyt,Sylvie S. Mazurieret al. FEMS Microbiology Ecology, 2006, 58 (3), pp.492 - 502. ⟨10.1111/j.1574-6941.2006.00174.x⟩ Article dans une revue hal-02661715v1
Identification of Genomic Species in Agrobacterium Biovar 1 by AFLP Genomic Markers Perrine Portier,Marion Fischer-Le Saux,Christophe Mougel,Catherine Lerondelle,David Chapulliotet al. Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (11), pp.7123-7131. ⟨10.1128/AEM.00018-06⟩ Article dans une revue hal-00128068v1
Assessing genetic structure and diversity of airborne bacterial communities by DNA fingerprinting and 16S rDNA clone library Pierre-Alain Maron,David Lejon,Esmeralda Carvalho,Karine Bizet,Philippe P. Lemanceauet al. Atmospheric Environment, 2005, 39 (20), pp.3687-3695. ⟨10.1016/j.atmosenv.2005.03.002⟩ Article dans une revue istex hal-02683032v1
A Highly Selectable and Highly Transferable Ti Plasmid to Study Conjugal Host Range and Ti Plasmid Dissemination in Complex Ecosystems S. Teyssier-Cuvelle,Phil M. Oger,Christophe Mougel,K. Groud,S. Farrandet al. Microbial ecology, 2004, 48 (1), pp.10-18. ⟨10.1007/s00248-003-2023-6⟩ Article dans une revue istex hal-02123026v1
Distribution and diversity of type III secretion system-like genes in saprophytic and phytopathogenic fluorescent pseudomonads Sylvie S. Mazurier,M. Lemunier,Séverine Siblot,Christophe Mougel,Philippe P. Lemanceau FEMS Microbiology Ecology, 2004, 49, pp.455-467 Article dans une revue hal-02672136v1
Comparative genetic diversity of the narG, nosZ, and 16S rRNA genes in fluorescent Pseudomonads S. Delorme,Laurent L. Philippot,Véronique Edel-Hermann,Chrystel Deulvot,Christophe Mougelet al. Applied and Environmental Microbiology, 2003, 69 (2), pp.1004-1012 Article dans une revue hal-02674671v1
Sampling strategy in molecular microbial ecology : influence of soil sample size on DNA fingerprinting analysis of fungal and bacterial communities Lionel Ranjard,D.P. Lejon,Christophe Mougel,Loik Scherer,Didier Merdinogluet al. Environmental Microbiology, 2003, 5 (11), pp.1111-1120 Article dans une revue hal-02679013v1
Relationships between Staphylococcus aureus genetic background, virulence factors, agr groups (alleles), and human disease S. Jarraud,Christophe Mougel,Jean Thioulouse,Gérard Lina,H. Meugnieret al. Infection and Immunity, 2002, 70 (2), pp.631-641 Article dans une revue hal-02681316v1
A mathematical method for determining genome divergence and species delineation using AFLP Christophe Mougel,Jean Thioulouse,Guy Perrière,Xavier Nesme International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2002, 52, pp.573-586 Article dans une revue hal-02673208v1
A mathematical method for determining genome divergence and species delineation using AFLP Christophe Mougel,J. Thioulouse,G. Perrière,X. Nesme International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2002, 52, pp.573-586. ⟨10.1099/00207713-52-2-573⟩ Article dans une revue hal-00427290v1
Relationships between Staphylococcus aureus genetic background virulence factors agr groups (alleles) and human disease. S. Jarraud,Christophe Mougel,J. Thioulouse,G. Lina,H. Meugnieret al. Infection and Immunity, 2002, 70, pp.631-641. ⟨10.1128/IAI.70.2.631-641.2002⟩ Article dans une revue hal-00427274v1
Seasonal fluctuations and long-term persistence of pathogenic populations of Agrobacterium spp. in soils Z. Krimi,A. Petit,Christophe Mougel,Yves Dessaux,Xavier Nesme Applied and Environmental Microbiology, 2002, 68, pp.3358-3365 Article dans une revue hal-02669536v1
Direct conjugal transfers of Ti plasmid to soil microflora S. Teyssier-Cuvelle,Christophe Mougel,Xavier Nesme Molecular Ecology, 2002, 8 (8), pp.1273-1284. ⟨10.1046/j.1365-294X.1999.00689.x⟩ Article dans une revue istex hal-02573551v1
Seasonal fluctuations and long-term persistence of pathogenic populations of Agrobacterium spp. in soils. Z. Krimi,A. Petit,Christophe Mougel,Y. Dessaux,X. Nesme Applied and Environmental Microbiology, 2002, 68 (7), pp.3358-65. ⟨10.1128/AEM.68.7.3358-3365.2002⟩ Article dans une revue hal-00145324v1
CHASE : an extracellular sensing domain common to transmembrane receptors from prokariotes, lower eukaryotes and plants Christophe Mougel,I.B. Zhulin Trends in Biochemical Sciences, 2001, 26 (10), pp.582-584 Article dans une revue hal-02671662v1
Characterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints : biological and methodological variability Lionel Ranjard,F. Poly,J.C. Lata,Christophe Mougel,Jean Thioulouseet al. Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67 (10), pp.4479-4487 Article dans une revue hal-02674586v1
Novel tellurite-amended media and specific chromosomal and Ti plasmid probes for direct analysis of soil populations of Agrobacterium biovars 1 and 2 Christophe Mougel,Benoît Cournoyer,Xavier Nesme Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67, pp.65-74. ⟨10.1128/AEM.67.1.65-74.2001⟩ Article dans une revue hal-02669542v1
Experimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics Christophe Mougel,S. Teyssier,C. d'Angelo,K. Groud,M. Neyraet al. Genetics Selection Evolution, 2001, 33, pp.S319-S338 Article dans une revue hal-00427187v1
Characterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints: biological and methodological variability. L. Ranjard,F. Poly,J. C. Lata,Christophe Mougel,J. Thioulouseet al. Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67 (10), pp.4479-87. ⟨10.1128/AEM.67.10.4479–4487.2001⟩ Article dans une revue bioemco-00353796v1
egc, a hyfhly prevalent operon of enterotixin gene, forms a putative nursery of superantigens in Staphylococcus aureus S. Jarraud,M.A. Peyrat,A. Lim,A. Tristan,M. Beset al. Journal of Immunology, 2001, 166, pp.669-677 Article dans une revue hal-02679012v1
Experimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics Christophe Mougel,Sabrina Teyssier,C. d'Angelo,K. Groud,M. Neyraet al. Genetics Selection Evolution, 2001, 33 (1), pp.319-338 Article dans une revue hal-02670077v1
Biological, serological and molecular variability suggest three distinct polerovirus species infecting beet or rape S. Hauser,M. Stevens,Christophe Mougel,H.G. Smith,C. Fritschet al. Phytopathology, 2000, 90 (5), pp.460-466 Article dans une revue hal-02698195v1
Direct conjugal transfers of Ti plasmid to soil microflora S. Teyssier-Cuvelle,Christophe Mougel,Xavier Nesme Molecular Ecology, 1999, 8, pp.1273-1284 Article dans une revue hal-02692194v1
Role of the fixGHI region of Azorhizobium caulinodans in free-living and symbiotic nitrogen fixation Karine Mandon,Pierre-Alexandre Kaminski,Christophe Mougel,Nicole Desnoues,Bernard Dreyfuset al. FEMS Microbiology Letters, 1993, 114 (2), pp.185-190. ⟨10.1111/j.1574-6968.1993.tb06571.x⟩ Article dans une revue hal-02714131v1

Communication dans un congrès (48)

A soil legacy effect shapes the interaction between the nematode Heterodera schachtii and oilseed rape roots Lionel Lebreton,Josselin Montarry,Nathan Vannier,Kévin Gazengel,Christophe Mougelet al. Colloque de la Société Française de Phytopathologie, May 2025, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-05101597v1
Holobionte : concept et enjeux pour la biologie des plantes et la génétique Virginie Bourion,Christophe Mougel Journées Scientifiques du Département de Biologie et Amélioration des Plantes INRA, Sep 2019, Presqu'île de Giens, France Communication dans un congrès hal-03225437v1
Reference-guided genome assembly in metagenomic samples Cervin Guyomar,Wesley Delage,Fabrice Legeai,Christophe Mougel,Jean-Christophe Simonet al. JOBIM 2019 - Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France. pp.1-8 Communication dans un congrès hal-02308257v1
Plant genotype: a lever in the interactions between plant and its associated rhizosphere microbiome Anouk Zancarini,Christine Le Signor,Julie J. Aubert,Sébastien Terrat,Joëlle Ronfortet al. 2nd Plant Microbiome Symposium, Feb 2018, Amsterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-04081016v1
A core microbiota of plant and earthworm interaction? Phylogenetic and functional aspects Manuel Blouin,Samuel Jacquiod,Arnaud Mounier,Aymé Spor,Ruben Puga Freitaset al. International Conference on Holobionts, Apr 2017, paris, France Communication dans un congrès hal-02953650v1
Microbial metacommunity: a METABAR coding approach Marc Buée,Matthieu Barret,Maria Bernard,Didier Debroas,Isabelle Domaizonet al. 2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France Communication dans un congrès hal-01607836v1
Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approaches Cervin Guyomar,Fabrice Legeai,Christophe Mougel,Claire Lemaitre,Jean-Christophe Simon International Conference on Holobionts, Apr 2017, Paris, France Communication dans un congrès hal-01638839v1
Le phytobiome: concept et potentiel d'utilisation en amélioration des plantes Corinne Vacher,Christophe Mougel,Marc Buée,Matthieu Barret Conseil scientifique du Département BAP, Feb 2017, Paris, France Communication dans un congrès hal-01605029v1
Digital Autoradiography technique an efficient tool for sampling procedure P. Fichet,R. Haudebourg,Christophe Mougel D&RS conference 2016 - Decommissioning and Remote Systems Conference, Jul 2016, Pittsburg, United States Communication dans un congrès cea-02509795v1
Latent Block Model for ecological abundance data Julie Aubert,Sophie Schbath,Christophe Mougel,Stephane Robin 30. European Meeting of Statisticians, Jul 2015, Amsterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-01661254v1
Quels effets la diversité microbienne du sol a-t-elle sur la croissance et la santé des plantes ? Christophe Mougel,Julie Aubert,Lydia Bousset,Anne-Marie Cortesero,Stéphanie Davalet al. Colloque de Génomique Environnementale, Oct 2015, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-03349078v1
Strategies for analyzing interactions between arbuscular mycorrhiza and bacteria Barbara Pivato,Sylvie S. Mazurier,Christophe Mougel,Pierre Offre,Amandine Violletet al. Conférences Jacques-Monod, Dec 2013, Roscoff, France Communication dans un congrès hal-02747379v1
Connecting soil biodiversity to functions and ecosystem services: presentation of case studies and of the EU FP7 project EcoFINDERS Philippe P. Lemanceau,Mark Bailey,Jack H. Faber,Bryan Griffiths,Pierre-Alain Maronet al. 4. International Congress Eurosoil 2012 - Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment, Jul 2012, Bari, Italy Communication dans un congrès hal-01268038v1
Maîtrise et gestion de la biodiversité dans les sols: quelles perspectives ? Philippe P. Lemanceau,Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,Laurent L. Philippot,Barbara Pivatoet al. Carrefours de l'Innovation Agronomique (CIAG) 2012. Évaluer et gérer la fertilité des sols, Apr 2012, Orléans, France Communication dans un congrès hal-02807825v1
Diversité et activités microbiennes dans la rhizosphère: des atouts majeurs en agroécologie Philippe P. Lemanceau,Barbara Pivato,Christophe Mougel,Laure L. Avoscan,Sylvie S. Mazurier Alliances au pays des racines - 14e Colloque Scientifique de la Société d'Horticulture de France, May 2012, Paris, France Communication dans un congrès hal-02747709v1
Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité et la richesse des communautés microbiennes de sols issus d'échantillonnage de grande ampleur Sébastien Terrat,Samuel S. Dequiedt,Richard Christen,Dipankar Bachar,Mélanie M. Lelievreet al. Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE, Apr 2012, Aussois, France Communication dans un congrès hal-01208719v1
Evaluation of the ISO standard 11063 “Soil DNA Extraction Procedure” for Assessing Microbial Abundance and Community Structure Pierre Plassart,Sébastien Terrat,Bruce Thomson,Robert Griffiths,Samuel S. Dequiedtet al. 14. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Aug 2012, Copenhague, Denmark Communication dans un congrès hal-01208715v1
Monitoring microbial diversity in European soils: ongoing projects and challenges Philippe P. Lemanceau,Dominique Arrouays,Mark J. Bailey,Antonio Bispo,Marc Buéeet al. 6. SETAC (Society of Environmental Toxicology and Chemistry)World Congress, SETAC Europe 22nd annual meeting, Securing a sustainable future: Integrating science, policy and people, May 2012, Berlin, Germany. 119 p Communication dans un congrès hal-01268308v1
Influence of Soil DNA Extraction Procedure to Assess Bacterial Diversity using Pyrosequencing of 16S rDNA Sébastien Terrat,Richard Christen,Samuel S. Dequiedt,Christophe Mougel,Mélanie M. Lelievreet al. NENUN ISME-Workshop: Extraction of Microbial DNA & RNA in Environmental Samples, Aug 2012, Copenhague, Denmark Communication dans un congrès hal-01208718v1
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols Sébastien Terrat,Pierre Plassart,Richard Christen,Samuel S. Dequiedt,Tiffanie Regnieret al. Workshop"Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements : Circulation, Adaptation", Jun 2012, Dijon, France Communication dans un congrès hal-01208716v1
Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes Sébastien Terrat,Samuel Dequiedt,Richard Christen,Mélanie M. Lelievre,Tiffanie Regnieret al. Journées d'animation "MEM Days" organisées par l'INRA, Jan 2012, Ecully, France Communication dans un congrès hal-02809171v1
Costs-benfits trade-off in the intercation between Medicago truncatula and Pseudomonas fluorescens C7R12 across atmospheric carbon dioxide modulation Clémentine C. Lepinay,Thierry Rigaud,Christophe Salon,Philippe P. Lemanceau,Christophe Mougel Rhizosphere 3, University of Western Australia. Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Perth, AUS., Sep 2011, Perth, Australia. 1 p Communication dans un congrès hal-00999982v1
Vers une optimisation de la procédure d'extraction d'ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes ribosomiques Pierre Plassart,Sébastien Terrat,Mélanie M. Lelievre,Tiffanie Regnier,Samuel S. Dequiedtet al. 5ième colloque de l’Association Francophone Ecologie Microbienne (AFEM), Ville service., Nov 2011, Hammamet, Tunisie. 1 p Communication dans un congrès hal-01231285v1
Influence of Soil DNA Extraction Procedure to Assess Bacterial Diversity using Pyrosequencing of 16S rDNA Sébastien Terrat,Richard Christen,Samuel Dequiedt,Christophe Mougel,Mélanie M. Lelievreet al. 6. ISMOM: International Symposium of Interactions of Soil Minerals withOrganic Components and Microorganisms.3. InterCongress of Commission 2.5 IUSSSoil chemical, physical and biological interfacial reactions, Labo/service de l'auteur, Ville service, Pays service., Jun 2011, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02746836v1
Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes Sébastien Terrat,Richard Christen,Samuel S. Dequiedt,Pierre-Alain Maron,Christophe Mougelet al. 1ères Rencontres bioinformaticiens et statisticiens de l’INRA, Mar 2011, Versailles, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01137014v1
Quel renouvellement des questions de recherche sur les légumineuses ? Anne-Sophie Voisin,Julie Gueguen,Christian Huyghe,Marie-Helene Jeuffroy,Marie-Benoît Magriniet al. Workshop légumineuses: Atelier de réflexion pour un renouvellement des questions de recherche sur les Légumineuses : du gène à la filière, Sep 2011, Dijon, France. 4 p Communication dans un congrès hal-02804480v1
Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to assess interaction between genotypes of Medicago truncatula and the soil bacterial communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain Rhizosphere 3 International Conference, Sep 2011, Perth, Australia Communication dans un congrès hal-02744462v1
Quel renouvellement des questions de recherches sur les légumineuses ? Anne-Sophie Voisin,Jacques Guéguen,Christian Huyghe,Marie-Helene Jeuffroy,Marie-Benoît Magriniet al. Atelier de réflexion pour un renouvellement des questions de recherche sur les légumineuses : du gène à la filière, Sep 2011, Dijon, France. 4 p Communication dans un congrès hal-01003340v1
Crosstalks between soil microbial communities and a nitrogen fixing legume species (medicago truncatula) during its Vegetative Stage Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain 5. International Food Legumes Research Conference (IFLRC V) and 7. European Conference on Grain Legumes (AEPVII) ; Legumes for Global Health Legume Crops and Products for Food, Feed and Environmental Benefits, Apr 2010, Antalya, Turkey Communication dans un congrès hal-02753416v1
Etude de l’interaction « Plante x Communauté microbienne du sol » chez l’espèce modèle &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain 16eme Forum des Jeunes Chercheurs, Jun 2010, Besançon, France. 16 p Communication dans un congrès hal-02822520v1
Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity Samuel S. Dequiedt,Mélanie M. Lelievre,Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,Nicolas Chemidlin Prévost-Bouréet al. 4ème Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM), Aug 2009, Lyon, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01137004v1
Iron dynamics in the rhizosphere as a case study for analysing interactions among soils, plants and microbes Philippe P. Lemanceau,Gérard G. Vansuyt,Laure L. Avoscan,Eric E. Bernaud,Thérèse Corberandet al. 8. International PGPR Workshop, May 2009, Portland, United States. n.p Communication dans un congrès hal-02820723v1
Assessment of the impact of the cultivation of different cultivars of maize, including Bt-maize varieties, on soil- and plant-associated microbial and fungal functional communities Amadou A. Sarr,Laurent L. Philippot,Lionel Ranjard,Christophe Mougel,Véronique Edel-Hermannet al. Monsanto Bt Maize Symposium, Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service., Mar 2008, La Hulpe, Belgium. 1 p Communication dans un congrès hal-01001208v1
Proteomes of arbuscular mycorrhizal symbiosis : past and present achievements Eliane Dumas-Gaudot,Ghislaine Recorbet,Franck Robert,Nardjis Amiour,Pierre Offreet al. Proteomlux 2008 : Proteomics in Plants, Microorganisms and Environment, 2008, Luxembourg, Luxembourg Communication dans un congrès hal-03746917v1
Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphere Philippe P. Lemanceau,Gérard G. Vansuyt,Agnès Robin,Laure L. Avoscan,Sylvie S. Mazurieret al. 12. International Symposium on Micropial Ecology - ISME 12, International Society for Microbial Ecology (ISME). Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Cairns, INT., Aug 2008, Cairns, Australia Communication dans un congrès hal-01001210v1
Association préférentielle entre les mycorhizes à arbuscules et les &lt;em&gt;pseudomonas&lt;/em&gt; saprophytes présentant des systèmes de sécrétion de type III Amandine Viollet,Thérèse Corberand,Agnès Robin,Christophe Mougel,Philippe P. Lemanceauet al. Journées Francophones Mycorhizes, Sep 2008, Dijon, France. 47 p Communication dans un congrès hal-02757118v1
Implication of pyoverdines in the interactions of fluorescent pseudomonads with soil microflora and plant in the rhizosphere Philippe P. Lemanceau,Gérard G. Vansuyt,Agnès Robin,Laure L. Avoscan,Sylvie S. Mazurieret al. 9. International Congress of Plant Pathology ICPP 2008, Aug 2008, Torino, Italy Communication dans un congrès hal-02819512v1
Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphere Philippe P. Lemanceau,Agnès Robin,Gérard G. Vansuyt,Sylvie S. Mazurier,Christophe Mougelet al. 13. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2007, Sorrento, Italy Communication dans un congrès hal-02815878v1
Populations bactériennes associées aux racines mycorhizées de Medicago truncatula: de la communauté à la souche bactérienne Pierre P. Offre,Barbara Pivato,Sylvie S. Mazurier,Séverine S. Siblot,Philippe P. Lemanceauet al. Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service, FRA., Jan 2007, Brest, France. 1 p Communication dans un congrès hal-00956065v1
Medicago species affect the community composition of arbuscular mycorrhizal fungi associated with roots Barbara Pivato,Sylvie S. Mazurier,Philippe P. Lemanceau,Séverine S. Siblot,Graziella Bertaet al. International Conference "Rhizosphere 2", Aug 2007, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02758002v1
Reciprocal interactions between plants and fluorescent pseudomonads in relation with iron in the rhizosphere Philippe P. Lemanceau,Gérard G. Vansuyt,Agnès Robin,Sylvie S. Mazurier,Christophe Mougel In Buffon Legacy Conference, Sep 2007, Dijon, France Communication dans un congrès hal-02754879v1
How genetic pressure of [i]Medicago trunculata[/i] acts on the molecular selection and population pattern of its favourite symbiotic bacteria, [i]Sinorhizobium[/i] sp.? Cécile Rangin,Gilles Béna,Brigitte Brunel,Marie-Mathilde Perrineau,Lucette Mauréet al. International Conference Rhizosphere 2, Aug 2007, Montpellier, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01190292v1
Effect of arbuscular mycorrhiza establishment on the genetic structure and diversity of bacteria in the rhizosphere of Medicago truncatula Pierre Offre,Barbara Pivato,Sylvie S. Mazurier,Séverine S. Siblot,Thérèse Corberandet al. Buffon Legacy Conference, Sep 2007, Dijon, France Communication dans un congrès hal-02753073v1
Interactions durables entre plantes et microorganismes dans les sols Philippe P. Lemanceau,Sylvie S. Mazurier,Christophe Mougel,Pierre Offre,Barbara Pivatoet al. Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Jan 2006, Dijon, France Communication dans un congrès hal-02823861v1
Toward an integrated approach for studying plant-microbe interactions in the rhizosphere: from genomic to proteomic Philippe P. Lemanceau,Sylvie S. Mazurier,Christophe Mougel,Pierre Offre,Barbara Pivatoet al. 2nd annual meeting of the Dutch Ecogenomics Research Program ‘Assessing the living soil’ Royal Sciences Academy of The Netherlands, Apr 2006, Amsterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-02819016v1
La variabilité biologique, sérologique et moléculaire des lutéovirus pathogènes vis-à-vis de la betterave, permet la caractérisation de trois espèces virales distinctes S. Hauser,M. Stevens,Christophe Mougel,Etienne E. Herrbach,H. Smithet al. 7. Rencontres de virologie végétale, Mar 1999, Aussois, France Communication dans un congrès hal-02771425v1
Etude phylogénétique des luteoviridae pathogènes pour la betterave sucrière S. Hauser,M. Stevens,Christophe Mougel,Etienne E. Herrbach,H. Smithet al. 1. Journées francophones de virologie, Apr 1999, Paris, France Communication dans un congrès hal-02837857v1
Serological and genomic variability of sugar beet-infecting beet mild yellowing luteovirus (BMYV) isolates and discrimination with another related luteovirus Olivier O. Lemaire,Etienne E. Herrbach,Christophe Mougel,Catherine Reinbold,Yves Boucheryet al. 2. Colmar symposium for biological sciences, May 1996, Colmar, France. pp.92 Communication dans un congrès hal-02837519v1

Poster de conférence (34)

Medicago truncatula genotype drives the plant nutritional strategy and its associated rhizosphere bacterial communities A Zancarini,C Le Signor,S Terrat,J Aubert,C Salonet al. 5th Plant Microbiome Symposium, Jun 2024, Amsterdam, Netherlands Poster de conférence hal-04609167v1
The soil microbiota diversity influences clubroot disease by modulation of Brassica napus and Plasmodiophora brassicae transcriptomes Stéphanie Daval,Kévin Gazengel,Arnaud Belcour,Juliette Linglin,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudtet al. International Phytobiomes Conference, Dec 2018, Montpellier, France Poster de conférence hal-03348616v1
Reference guided genome assembly in metagenomic samples Cervin Guyomar,Wesley Delage,Fabrice Legeai,Christophe Mougel,Jean-Christophe Simonet al. RECOMB 2018 - 22nd International Conference on Research in Computational Molecular Biology, Apr 2018, Paris, France. pp.1 Poster de conférence hal-01934823v1
The soil microbiota diversity influences clubroot disease by modulation of host plant and pathogen transcriptomes Stéphanie Daval,Kévin Gazengel,Arnaud Belcour,Juliette Linglin,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudtet al. Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France Poster de conférence hal-03348609v1
Influence of soil microbial diversity and host plant genotype on the structure and diversity of root microbiota of Brassica napus infected with Plasmodiophora brassicae Alain Sarniguet,Lionel Lebreton,Kévin Gazengel,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt,Juliette Linglinet al. International Phytobiomes Conference, Dec 2018, Montpellier, France Poster de conférence hal-03348615v1
Does the soil microbiota modulate the interactions between Brassica napus and its bioagressors? Lionel Lebreton,Anne-Marie Cortesero,Stéphanie Daval,Sylvain Fournet,Kévin Gazengelet al. Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France Poster de conférence hal-03348613v1
Does the soil microbiota diversity influence the interactions between Brassica napus and its bioagressors ? Lionel Lebreton,Valérie Chaminade,Anne Marie Cortesero,Stéphanie Daval,Sylvain Fournetet al. Phytobiome, Dec 2018, Montpellier, France Poster de conférence hal-03232457v1
Does crop diversification impact plant-soil interactions? Mira Sébastian,Christophe Mougel,Edith Le Cadre-Barthélemy 15th Congress of the European Society for Agronomy ESA 2018, Aug 2018, Genève, Switzerland. 2018 Poster de conférence hal-03160798v1
Evidence of a core microbiota shaped by plant and earthworm interactions across soils Samuel Jacquiod,Ruben Puga Freitas,Aymé Spor,Arnaud Mounier,Cécile Monardet al. 17. International Society of Microbial Ecology (ISME17), Aug 2018, Leipzig, Germany. , 2018 Poster de conférence hal-02785624v1
Influence de la diversité du microbiome du sol sur l'agent pathogène tellurique responsable de la hernie des crucifères Arnaud Belcour,Kévin Gazengel,Lionel Lebreton,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt,Juliette Linglinet al. Journées d'animation du réseau PhytoMic, Nov 2017, Paris, France Poster de conférence hal-03348606v1
Multi-scale characterization of symbiont diversity in the pea aphid complex through metagenomic approaches Cervin Guyomar,Fabrice Legeai,Christophe Mougel,Claire Lemaitre,Jean-Christophe Simon JOBIM 2017 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2017, Lille, France Poster de conférence hal-01638884v1
Dynamics of bacterial and fungal rhizosphere communities during the infection of Brassica rapa roots by the protist Plasmodiophora brassicae Lionel Lebreton,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt,Kévin Gazengel,Stéphanie Daval,Alain Sarniguetet al. Pathobiome, Jun 2015, Maison-Alfort, France Poster de conférence hal-03231661v1
A new conceptual framework shows that plant genotype and soil nitrogen availability modify both plant nutritional strategies and diversity of their associated rhizosphere microbiome Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Anne-Sophie Voisin,Marion Prudent,Christophe Salonet al. Rhizosphere 4, Jun 2015, Maastricht, Netherlands Poster de conférence hal-04080970v1
Dynamique des communautés bactériennes et fongiques de la rhizosphère au cours de l’infection de racines de Brassica rapa par le protiste obligatoire, agent de la hernie des crucifères, Plasmodiophora brassicae. Lionel Lebreton,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt,Kévin Gazengel,Stéphanie Daval,Alain Sarniguetet al. 9e Colloque de la Société Française de Phytopathologie., Jun 2015, Colmar, France Poster de conférence hal-03348604v1
Optimized and standardized 192-plex solution for 16S rDNA gene sequencing on Illumina Miseq platform to assess soil biodiversity J. Denonfoux,C. Wahl,Jean-Pierre Gauthier,Y. Laurent,Lionel Lebretonet al. 1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), Dec 2014, Dijon, France. 703 p., 2014 Poster de conférence hal-01208772v1
Soil microbial diversity effects on primary production and symbiotic interactions Clémentine Lepinay,Céline Faivre-Primot,Florence Deau,Julie Aubert,Sébastien Terratet al. 32. New Phytologist Symposium. Plant interactions with other organisms: molecules, ecology and evolution, Nov 2013, Buenos Aires, Argentina. , 2013 Poster de conférence hal-01197630v1
Vers une optimisation de la procédure d’extraction d’ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes ribosomiques Pierre Plassart,Sébastien Terrat,Rob I. Griffiths,Bruce Thomson,Mélanie M. Lelievreet al. Workshop Interactions des microorganismes avec leurs environnements: circulation, adaptation, Jun 2012, Dijon, France. 2012 Poster de conférence hal-01208712v1
Influence du système de sécrétion de type III bactérien dans les intéractions plantes-Pseudomonas spp. fluorescents non pathogènes Amandine Viollet,Thérèse Corberand,Christophe Mougel,Laure Avoscan,Gérard Vansuytet al. Workshop Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements : Circulation, Adaptation, Jun 2012, Dijon, France, 6-7 juin 2012, France. , 2012 Poster de conférence hal-01208713v1
Plateforme GenoSol : une structure logistique d'appui à la recherche sur la microbiologie des sols et de l'environnement Samuel S. Dequiedt,Mélanie M. Lelievre,Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,Fabien Morinet al. Workshop Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements: Circulation, Adaptation, Jun 2012, Dijon, France. , 2012, Interactions des microorganismes avec leurs environements : circulation, adaptation Poster de conférence hal-01208689v1
Deep sequencing of 16S rRNA gene to efficiently assess bacterial richness and the rare biosphere in soils Sébastien Terrat,Samuel Dequiedt,Dipankar Bachar,Richard Christen,Christophe Mougelet al. 14. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Aug 2012, Copenhague, Danemark, Netherlands. 1 p., 2012 Poster de conférence hal-02806957v1
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols Sébastien Terrat,Pierre Plassart,Richard Christen,Samuel S. Dequiedt,Mélanie M. Lelievreet al. Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE, Apr 2012, Aussois, France. 2012 Poster de conférence hal-01208717v1
Combining ecophysiological and microbial ecological approaches to assess interaction between genotypes of &lt;em&gt;Medicago truncatula&lt;/em&gt; and the soil bacterial communities Anouk Zancarini,Christophe Mougel,Christophe Salon,Nathalie Munier-Jolain 17eme Forum des Jeunes Chercheurs "Jeunes chercheurs, explorons la bulle professionnelle", Jun 2011, Dijon, France. 155 p., 2011 Poster de conférence hal-02749671v1
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols Sébastien Terrat,Pierre Plassart,R. Christen,Samuel Dequiedt,Tiffanie Régnieret al. 5ième colloque de l’Association Francophone Ecologie Microbienne (AFEM), Nov 2011, Hammamet, Tunisie. , 1 p., 2011 Poster de conférence hal-02808211v1
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols Sébastien Terrat,Pierre Plassart,R. Christen,Samuel Dequiedt,Tiffanie Régnieret al. Colloque Génomique Environnementale, Nov 2011, Ecully, France. , 1 p., 2011 Poster de conférence hal-02807955v1
Description of a strategy for analyzing the feedback loop of the interactions between plants, arbuscular mycorrhizal fungi and bacteria Philippe P. Lemanceau,Sylvie S. Mazurier,Christophe Mougel,Pierre Offre,Barbara Pivatoet al. Ecology of Soil Microorganisms Conference, Apr 2011, Prague, Czech Republic. , 121 p., 2011 Poster de conférence hal-02747493v1
Studying the arbuscular mycorrhizal symbiosis from axenic system to soilborne interactions by proteomics: which challenges to face? Eliane Dumas-Gaudot,Ghislaine Recorbet,Franck Robert,Nardjis Amiour,Pierre Offreet al. Congrès SMAP (Spectrométrie de masse et analyse protéomique), Sep 2009, Dijon, France Poster de conférence hal-03746880v1
Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity Samuel Dequiedt,Mélanie M. Lelievre,Pierre-Alain Maron,Christophe Mougel,Nicolas Chemidlin Prévost-Bouréet al. 10. Symposium on Bacterial Genetics and Ecology - Coexisting on a Changing Planet (BAGECO 10), Jun 2009, Uppsala, Sweden. 18 p., 2009 Poster de conférence hal-02752945v1
Arbuscular mycorrhizae influence the occurence of soil fluorescent pseudomonads harbouring type III secretion systems Amandine Viollet,Thérèse Corberand,Adeline Robin,Christophe Mougel,Philippe P. Lemanceauet al. Bageco 10 - Bacterial genetics and ecology, Jun 2009, Uppsala, Sweden. , 1p., 2009 Poster de conférence hal-02755399v1
Comparison of the genetic structure and diversity of bacteria associated with mycorrhized and non-mycorrhized roots of Medicago truncatula Pierre Offre,Barbara Pivato,Sylvie S. Mazurier,Séverine S. Siblot,Thérèse Corberandet al. International Conference Rhizosphere 2, Aug 2007, Dijon, France. , 1 p., 2007 Poster de conférence hal-02751762v1
Influence des associations symbiotiques de Medicago truncatula sur la microflore rhizosphérique et les transferts de carbone vers la rhizosphère Christophe Mougel,Agnès Robin,Aurélie Talon,Emile Benizri,Thérèse Corberandet al. 5èmes journées d'Ecologie Fonctionnelle, Mar 2003, Nancy, France Poster de conférence hal-04521390v1
Effects of mycorrhization and nodulation on the structure and diversity of fluorescent pseudomonads associated with Medicago truncatula roots Agnès Robin,Thérèse Corberand,Christophe Robin,Emile Benizri,Philippe Lemanceauet al. 1st FEMS Congress of European Microbiologists, Jun 2003, Ljubljana, Slovenia Poster de conférence hal-04475569v1
Influence of symbiotic status of roots on carbon allocation to roots and rhizosphere of Medicago truncatula Aurélie Talon,Christophe Robin,Christophe Mougel,Emile Benizri First meeting of the COST 631 Action, Oct 2002, Vienne (AUT), Austria Poster de conférence hal-04490914v1
Effects of mycorhization and nodulation on the structure and diversity of fluorescent pseudomonads associated with Medicago truncatula roots Agnès Robin,Thérèse Corberand,Christophe Robin,Émile Benizri,Philippe Lemanceauet al. First meeting of the COST 631 Action, Oct 2002, Vienne, Austria Poster de conférence hal-04490859v1
Comment les bactéries perçoivent et répondent aux modifications de leur environnement ? Génomique comparative des systèmes à deux composantes bactériens : organisation, distribution et fonction Christophe Mougel,I.B. Zhulin 3. Colloque Rhizosphère, Nov 2001, Dijon, France. 1 p., 2001 Poster de conférence hal-02826749v1

Chapitre d'ouvrage (10)

Agroecological Protection to Support Plant Health: Where the Microbiota Fits In Claudia Bartoli,Jean-Noël Aubertot,Isabelle Litrico,Christophe Mougel Xavier Fauvergue; Adrien Rusch; Matthieu Barret; Marc Bardin; Emmanuelle Jacquin-Joly; Thibaut Malausa; Christian Lannou. Extended Biocontrol, Springer Netherlands, pp.119-125, 2022, 978-94-024-2150-7. ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_10⟩ Chapitre d'ouvrage hal-04181895v1
Plant Microbiota: Diversity, Transmission and Function Matthieu Barret,Marc Buée,Christophe Mougel,Corinne Vacher Extended Biocontrol, Springer Netherlands, pp.111-117, 2022, ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_9⟩ Chapitre d'ouvrage hal-04059155v1
Le microbiote des plantes : diversité, transmission et fonction Matthieu Barret,Marc Buée,Christophe Mougel,Corinne Vacher Biocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Editions Quae, 2020, Savoir Faire, 978-2-7592-3076-1 Chapitre d'ouvrage hal-03319624v1
Protection agroécologique pour le maintien de la santé des plantes Claudia Bartoli,Jean-Noël Aubertot,Isabelle Litrico-Chiarelli,Christophe Mougel Biocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Éditions Quae, 376p., 2020, Savoir faire, 978-2-7592-3076-1 Chapitre d'ouvrage hal-04204459v1
Métagénomique et métatranscriptome Christophe Mougel Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318972v1
Qu’attendre des recherches en microbiologie du sol ? Philippe P. Lemanceau,Pierre-Alain Maron,Sylvie S. Mazurier,Christophe Mougel,Laurent L. Philippotet al. Fertilisation et environnement. Quelles pistes pour l'aide à la décision ?, Chapitre 10, Editions Quae ACTA, le réseau des instituts des filières animales et végétales, pp.288, 2014, Matière à Débattre et Décider, 978-2-7592-2055-7 978-2-85794-280-1 Chapitre d'ouvrage hal-02797138v1
Combining molecular microbial ecology with ecophysiology and plant genetics for a better understanding of plant-microbial communities' interactions in the rhizosphere. Anouk Zancarini,Clémentine Lepinay,Judith Burstin,Gérard Duc,Philippe P. Lemanceauet al. F.J. de Bruijn. Molecular Microbial Ecology of the Rhizosphere, 1, Wiley-Blackwell, pp.69-86, 2013, 978-1-118-29617-2. ⟨10.1002/9781118297674.ch7⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01119954v1
Biogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative Lionel Ranjard,Samuel Dequiedt,Claudy Jolivet,Nicolas Saby,Jean Thioulouseet al. Eric Lichtfouse; Marjolaine Hamelin; Mireille Navarrete; Philippe Debaeke. Sustainable Agriculture Volume 2, Springer, pp.857-865, 2011, 978-94-007-0393-3. ⟨10.1007/978-94-007-0394-0_37⟩ Chapitre d'ouvrage hal-00860770v1
Microbial ecology of the rhizosphere P. Lemanceau,P. Offre,Christophe Mougel,E. Gamalero,Y. Dessauxet al. Microbiological methods for assessing soil quality, CABI Publishing, pp.228-230, 2006 Chapitre d'ouvrage hal-00119328v1
Microbial ecology of the rhizosphere Philippe P. Lemanceau,Pierre Offre,Christophe Mougel,Elisa Gamalero,Yves Dessauxet al. Microbiological methods for assessing soil quality, 2005 Chapitre d'ouvrage hal-02832084v1

Brevet (1)

Brevet INRA, INOVIAFLOW «Rhizotron et utilisations de celui-ci» Christophe Salon,Christian Jeudy,Céline Bernard,Christophe Mougel,Arnaud Coffinet al. N° de brevet: EP 2 679 088 A1. 2012, 28p Brevet hal-02801042v1

Autre publication scientifique (1)

Le Centre Inra de Dijon Gérard Paillard,Philippe P. Lemanceau,Samuel Dequiedt,Christian Steinberg,Judith Burstinet al. 2012 Autre publication scientifique hal-02810526v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes Stéphanie Daval,Kévin Gazengel,Arnaud Belcour,Juliette J. Linglin,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudtet al. 2020 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02487262v1

Rapport (2)

Vers une meilleure compréhension de la réponse des plantes et du phytobiome aux stress multiples : besoin d’une approche interdisciplinaire Christophe Mougel,Claire Veneault-Fourrey,Estelle Kuhn,Francois Lefèvre,Hatem Rouachedet al. INRAE. 2023, 22p Rapport hal-04981391v1
Effet de la rotation des cultures sur la microflore du sol et son activité Christophe Mougel [Contrat] 06516CP015S250, 2009 Rapport (rapport contrat/projet) hal-02820219v1

HDR (1)

Dynamique des intéractions plante-microorganismes dans la rhizosphère: vers une meilleure prise en compte du fonctionnement de la plante et conséquence évolutive Christophe Mougel Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Bourgogne, 2010 HDR tel-02815117v1