Christophe Sola

Professeur de Microbiologie, Université Paris-Saclay Chercheur-Senior IAME UMR1137
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Documents

Présentation

Christophe Sola est titulaire d'un doctorat en pharmacie (1984, U. Grenoble1) et d'un doctorat en sciences de la vie (1991, U. Paris6). Il a été interne des hôpitaux de Lyon, chercheur à l'Institut Pasteur de Paris et à l'Institut de recherche clinique de Montréal (IRCM). Entre 1989 et 1994, il a occupé divers postes de R&D dans des entreprises biotechnologiques et pharmaceutiques françaises (Limagrain Seed Group), allemandes (Boehringer-Mannheim) et américaines (Parexel Corporation), avant de s'installer dans le département ultramarin français de la Guadeloupe, où il a passé 12 ans, d'abord en tant que chercheur contractuel, puis en tant que chercheur permanent à l'Institut Pasteur de la Guadeloupe, membre du Réseau international des instituts Pasteur.

De retour à l'Institut Pasteur Paris en 2006, Christophe Sola occupe depuis septembre 2007 un poste de professeur titulaire à l'Université Paris-Sud devenue Paris-Saclay (UPSay) où il enseigne la microbiologie et où il a été Investigateur Principale entre 2007 et 2020 de l'équipe de recherche Infection Genetique Evolution des Pathogenes Emergents (IGEPE), au sein de l'IGM et de l'I2BC (Institute for Integrative Cell Biology), un institut de recherche commun créé en 2015, entre le CEA, le CNRS et l'Université Paris-Saclay. Depuis le 1er janvier 2021, il a rejoint l'unité mixte de recherche UMR1137 "IAME" (Infection-Antimicrobiens-Modélisation-Evolution), Laboratoire INSERM-Université de Paris, dirigée par le Pr. E. Denamur et travaillant au sein du laboratoire associé au laboratoire national de référence sur tuberculose à l'hôpital Bichat (Paris Nord). Ses recherches portent principalement sur la biologie évolutive, l'épidémiologie génomique, la génomique comparative, la bioinformatique, l'anthropologie et le big data dans le cadre de l'étude de la diversité génétique de Mycobacterium tuberculosis et des interactions hôte-pathogène, que ce soit pour la santé publique ou la recherche académique.

Il s'intéresse principalement aux maladies infectieuses, à la biologie évolutive et à la santé publique, et en particulier à la tuberculose, par le biais d'études sur la génomique et la diversité génétique du complexe Mycobacterium tuberculosis en relation avec l'anthropologie, l'épidémiologie systémique, la génétique évolutive, l'adaptation moléculaire aux médicaments et les mécanismes de résistance aux médicaments, la génomique, la bioinformatique et les méthodes de diagnostic moléculaire de haute technologie. Il est également actif dans la recherche sur la diversité génétique CRISPR (Clustured Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats) en utilisant la diversité CRISPR pour le typage moléculaire des pathogènes et plus fondamentalement pour mieux comprendre la plasticité génomique et l'adaptation chez les bactéries.

Christophe Sola est l'auteur de plus de 150 articles internationaux évalués par des pairs et un membre actif de la communauté de la tuberculose (Société européenne de mycobactériologie, membre du comité de pilotage depuis 2023), Société euro-latino-américaine de mycobactériologie.

Il est associé fondateur de la société Beamedex® SAS, créée en décembre 2014, une société basée à Orsay, qui a produit, développé et vendu des tests multiplexés de recherche innovants pour les plateformes Luminex dans une perspective de " Global Health ".


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Genome-wide analysis of multi- and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis

Muhammed Rabiu Sahal , Gaetan Senelle , Kevin La , Tukur Wada Panda , Dalha Wada Taura et al.
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2023, 50 (2), pp.307-316. ⟨10.1371/journal.pntd.0011619⟩
Article dans une revue hal-04244654 v1
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Towards the reconstruction of a global TB history using a new pipeline “TB-Annotator

Gaetan Senelle , Muhammed Rabiu Sahal , Kevin La , Typhaine Billard-Pomares , Julie Marin et al.
Tuberculosis, 2023, 143, ⟨10.1016/j.tube.2023.102376⟩
Article dans une revue hal-04312194 v1
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Connection between two historical tuberculosis outbreak sites in Japan, Honshu, by a new ancestral Mycobacterium tuberculosis L2 sublineage

Christophe Guyeux , Gaetan Senelle , Guislaine Refrégier , Florence Bretelle-Establet , Emmanuelle Cambau et al.
Epidemiology and Infection, 2022, 150, pp.e56. ⟨10.1017/S0950268822000048⟩
Article dans une revue hal-03924496 v1

Investigating the Diversity of Tuberculosis Spoligotypes with Dimensionality Reduction and Graph Theory

Gaëtan Senelle , Christophe Guyeux , Guislaine Refrégier , Christophe Sola
Genes, 2022, 13 (12), pp.2328 (9). ⟨10.3390/genes13122328⟩
Article dans une revue hal-03932845 v1
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CRISPRbuilder-TB: “CRISPR-builder for tuberculosis”. Exhaustive reconstruction of the CRISPR locus in mycobacterium tuberculosis complex using SRA

Christophe Guyeux , Christophe Sola , Camille Noûs , Guislaine Refrégier
PLoS Computational Biology, 2021, 17 (3), pp.e1008500. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008500⟩
Article dans une revue hal-04244566 v1
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Spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates using Luminex®-based method in Lebanon

Khaldoun Masoud , George F. Araj , Lina Reslan , Sukayna Fadlallah , Michel Wehbe et al.
Journal of Infection in Developing Countries, 2020, 14 (8), pp.878--885. ⟨10.3855/jidc.12072⟩
Article dans une revue hal-02944245 v1
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Diversity of Mycobacterium tuberculosis in the Middle Fly District of Western Province, Papua New Guinea: microbead-based spoligotyping using DNA from Ziehl-Neelsen-stained microscopy preparations

Vanina Guernier-Cambert , Tanya Diefenbach-Elstob , Bernice J. Klotoe , Graham Burgess , Daniel Pelowa et al.
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.15549. ⟨10.1038/s41598-019-51892-5⟩
Article dans une revue hal-02345362 v1
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Multicenter evaluation of TB-SPRINT 59-Plex Beamedex®: accuracy and cost analysis

Regina Bones Barcellos , Isabela Neves De Almeida , Elisangela Costa Da Silva , Harrison Magdinier Gomes , Lida Jouca De Assis Figueredo et al.
BMC Infectious Diseases, 2019, 19 (1), pp.1047. ⟨10.1186/s12879-019-4646-3⟩
Article dans une revue hal-02413886 v1

Genomic characterization of MDR/XDR-TB in Kazakhstan by a combination of high-throughput methods predominantly shows the ongoing transmission of L2/Beijing 94-32 central Asian/Russian clusters

B. J. Klotoe , S. Kacimi , E. Costa-Conceicão , H. M. Gomes , R. B. Barcellos et al.
BMC Infectious Diseases, 2019, 19 (1), pp.553. ⟨10.1186/s12879-019-4201-2⟩
Article dans une revue hal-02170568 v1

Correlation between the BACTEC MGIT 960 culture system with Genotype MTBDRplus and TB-SPRINT in multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates from Brazil

Nayanne Gama Teixeira Dantas , Phillip Noel Suffys , Wânia da Silva Carvalho , Harrison Magdinier Gomes , Isabela Neves De Almeida et al.
Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, 2017, 112 (11), pp.769--774. ⟨10.1590/0074-02760170062⟩
Article dans une revue hal-02191696 v1
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Turkish and Japanese Mycobacterium tuberculosis sublineages share a remote common ancestor.

Guislaine Refrégier , Edgar Abadia , Tomoshige Matsumoto , Hiromi Ano , Tetsuya Takashima et al.
Infection, Genetics and Evolution, 2016, 45, pp.461-473. ⟨10.1016/j.meegid.2016.10.009⟩
Article dans une revue hal-01439404 v1
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Tuberculosis in evolution.

György Pálfi , Olivier Dutour , Pascale Perrin , Christophe Sola , Albert Zink
Tuberculosis, 2015, 95, pp.S1-3. ⟨10.1016/j.tube.2015.04.007⟩
Article dans une revue hal-01433074 v1