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Clémence BONNOT
Chargée de recherche, Équipe ‘Écogénomique des interactions’, UMR 1136 IAM, INRAE-Université de Lorraine, France.
• Compréhension des mécanismes moléculaires d’intégration des besoins nutritifs, signaux de stress et associations ectomycorhiziennes chez les arbres forestiers.
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Affiliations actuelles
- 1002417
Identifiants chercheurs
- clemence-bonnot
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- 0000-0002-5669-0982
Domaines de recherche
Sciences du Vivant [q-bio]
Compétences
Physiologie: Marquages (P,N,C) ; Analyses de flux (nutriments, drogues etc.) ; Dosages de nutriments (Pi, NO3-, NH4+) dans les tissus et sol ; Dosages d’amidon et anthocyanes ; Préparation d’échantillons pour ICP-OES; Greffes.
Biotechnologie: Cultures axéniques de plantes, algues, champignons et bactéries modèles ou non; Transformations stables (A. thaliana, M. polymorpha, P X canescens, L. bicolor, S. cerevisiae) et transitoire (N. benthamiana) ; Tests de complémentation sur levure ; Isolation et inoculation fongiques.
Génétique: Génétique classique, réverse et chimique ; Mutagenèse (UV, EMS, T-DNA) et cribles haut-débits de mutants, drogues et peptides.
Biologie moléculaire et biochimie: Transcriptomique ; Clonages ; PCRs (nichée, dégénérée, TAIL, RACE, RT-PCR, qPCR) ; Extraction de protéines (membranaire, soluble, acides) ; Western blot ; Test d’activités enzymatiques ; Extraction/quantification de métabolites/drogues (HPLC-MS, HPLC-UV) ; Extraction de sève brute pour sécrétomique et métabolomique.
Histologie: Sections en agarose, cire et plastique ; Hybridation In situ ; Colorations tissulaires (marqueurs tissulaires, GUS, ROS, amidon, phosphatase…) ; Immunocytolocalisation ; Microscopie (Confocale, Luminescence…).
Bioinformatique: Langage R ; Cartographie et analyse de transcriptomes (CLC, FastQc, WGCNA, DiSeq, Mapman, Morpheus) ; Phylogénies (Bayésienne, Maximum-likelihood) ; CLANS.
Publications
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Transcriptome changes in chlorsulfuron-treated plants are caused by acetolactate synthase inhibition and not induction of a herbicide detoxification system in Marchantia polymorphaPesticide Biochemistry and Physiology, 2023, 191, pp.105370. ⟨10.1016/j.pestbp.2023.105370⟩
Article dans une revue
hal-04186014v1
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Reduced coenzyme Q synthesis confers non-target site resistance to the herbicide thaxtomin APLoS Genetics, 2023, 19 (1), pp.e1010423. ⟨10.1371/journal.pgen.1010423⟩
Article dans une revue
hal-04186008v1
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