Clémence Sebe

Publications

Communication dans un congrès (3)

Extracting Information in a Low-resource Setting: Case Study on Bioinformatics Workflows Clémence Sebe,Sarah Cohen-Boulakia,Olivier Ferret,Aurélie Névéol Symposium on Intelligent Data Analysis (IDA 2025), May 2025, Konstanz, Germany. pp.274-287, ⟨10.1007/978-3-031-91398-3_21⟩ Communication dans un congrès hal-05244222v1
Extraction d’entités nommées décrivant des chaînes de traitement bioinformatiques dans des articles scientifiques en anglais Clémence Sebe,Sarah Cohen-Boulakia,Olivier Ferret,Aurélie Névéol 31ème Conférence sur le Traitement Automatique des Langues Naturelles (TALN 2024), Jul 2024, Toulouse, France. pp.422-434 Communication dans un congrès hal-04623033v1
Extraction d'informations sur les workflows scientifiques à partir de la littérature Clémence Sebe,Aurélie Névéol,Sarah Cohen-Boulakia,Alban Gaignard 23ème conférence francophone sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances (EGC), Jan 2023, Lyon, France. pp.313-320 Communication dans un congrès hal-03991363v1

Poster de conférence (2)

Representing bioinformatics Nextflow workflows in RO-Crate : challenges and opportunities George Marchment,Marie Schmit,Clémence Sebe,Frédéric Lemoine,Hervé Ménageret al. Semantic Web Applications and Tools for Health Care and Life Sciences, Feb 2024, Leiden, Netherlands. Zenodo, 2024, ⟨10.5281/zenodo.10822156⟩ Poster de conférence hal-04540040v1
Towards improving workflows reproducibility : Extracting information on workflows from text and code repositories Clémence Sebe,Frédéric Lemoine,Alban Gaignard,Olivier Ferret,Sarah Cohen-Boulakiaet al. 31st Annual Intelligent Systems For Molecular Biology and 22nd Annual European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2023), Jul 2023, Lyon, France. Poster de conférence hal-04363577v1

Article dans une revue (1)

Developing and reusing bioinformatics data analysis pipelines using scientific workflow systems Marine Djaffardjy,George Marchment,Clémence Sebe,Raphaël Blanchet,Khalid Belhajjameet al. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2023, 21, pp.2075-2085. ⟨10.1016/j.csbj.2023.03.003⟩ Article dans une revue hal-04037221v2