
DENIS BOURGUET
Présentation
Co-founder and co-manager (with Thomas Guillemaud and Benoit Facon) of Peer Community In, an alternative publication system, based on peer-reviews and recommendations of preprints.
Recommender for PCI Evol Biol, PCI Ecology and PCI Zoology.
PARCOURS
2023 - Directeur de recherche de classe exeptionnelle (DRCE1) INRAE. Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP), centre INRA de Montpellier.
2009- 2022 Directeur de recherche 1ière classe (DR1) INRAE. Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP), centre INRA de Montpellier.
2005-2008 Directeur de recherche 2ième classe (DR2) INRA. Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP), centre INRA de Montpellier.
2001-2004 Chargé de recherche 1ière classe (CR1) INRA. Unité de Recherches de Lutte Biologique, La Minière, centre INRA de Versailles (2001-2003) puis Centre de Biologie et de Gestion des Populations (CBGP), centre INRA de Montpellier (2003-2004).
1997-2000 Chargé de recherche 2ième classe (CR2) INRA. Unité de Recherches de Lutte Biologique, La Minière, centre INRA de Versailles-Grignon.
CURSUS UNIVERSITAIRE
2002 HDR. Spécialité: Biologie des populations et Ecologie. U. Montpellier II. Titre : De l'influence de la sélection naturelle: sexe, dominance, adaptation et spéciation.
1996-1998 Post-Doctorat. U. British Columbia, Vancouver, Canada. (collaborations avec M.C. Whitlock et S.P. Otto).
1993-1996 Thèse de Doctorat. Spécialité : Biologie des populations et Ecologie. U. Montpellier II (direction: M. Raymond). Titre : Mécanismes biochimiques, plasticité et évolution de la dominance : l’acétylcholinestérase et la résistance aux insecticides chez le moustique Culex pipiens.
1992-1993 DEA Evolution et Ecologie. U. Montpellier II (direction: M. Raymond). Titre : Coût des gènes de résistance aux insecticides in natura.
1991-1993 Diplôme d'Ingénieur Agronome. Montpellier SupAgro.
1990-1991 Maîtrise Sciences Naturelles. U. Montpellier II.
1989-1990 Licence Sciences Naturelles. U. Montpellier II.
FORMATION
2008 École Pratique du Management de la Recherche Agronomique (EPMRA).
DISTINCTION
2011 Lauréat du Prix Jean Dufrenoy décerné par l’Académie de l’Agriculture de France.
FONCTIONS OCCUPEES
Fonctions actuelles
• Co-fondateur du projet Peer Community in – depuis 2017
Précédentes fonctions
• Membre du groupe « Biodiversité » de l’AllEnvi – 2012 - 2019
• Membre de la CAP CR de l’INRA – 2013 - 2019
• Membre de la section 29 du CoNRS – 2011 - 2016
• Membre suppléant du Conseil Scientifique du Département SPE de l’INRA – 2011 - 2016
• Membre du Conseil Scientifique du Centre INRA de Montpellier – 2011 - 2016
• Membre du Conseil d’Unité du CBGP – 2014 - 2016
• Membre de la CSS BPE de l’INRA – 2012 - 2016
• Membre du Haut Conseil des Biotechnologies (HCB) – 2009 - 2014
• Directeur du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP) – 2007 - 2010
• Directeur adjoint du CBGP – 2004 - 2006
• Co-président du comité chargé de coordonner la contribution INRA aux Assises de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche 2012
• Membre du Comité Scientifique et Technique d’Agropolis International – 2008 - 2011
• Membre du Conseil de l’Ecole Doctorale SIBAGHE (U. Montpellier II) – 2007 - 2010
• Membre du Comité de Direction du Pôle de Formation et Recherche EVAP (Environnement Vie Agronomie Planète) de l’U. Montpellier II – 2009 - 2011
• Membre du Conseil Scientifique du Département des Ressources Vivantes de l’IRD – 2007 - 2010
• Membre du Comité du Génie Biomoléculaire (CGB) – 2006 - 2007
• Membre du Comité de Préfiguration d’une Haute Autorité sur les OGM – 2007 - 2008
• Membre du programme ESF Assessing the Environmental Impact of GMO – 1998 - 2000
• Membre du Comité de l’AIP INRA OGM et Environnement – 1998 - 2001
• Membre de la Commission de Spécialistes de l’U. de Tours (sections 67 et 68) – 1999 - 2001
ACTIVITES ET COORDINATION DE RECHERCHES
Publications : 121 articles parus ou sous presse dont 102 dans des revues internationales à comité de lecture. Publication d’un ouvrage et de 8 chapitres d’ouvrages.
Communications : 35 présentations dont 23 dans des congrès internationaux.
Encadrements : 25 étudiants stagiaires dont 11 Master 2, 4 doctorants et 5 post-doctorants.
Soutiens financiers par les programmes suivants :
• AIP INRA OGM et Environnement (1998-2001). Financement : 360 KF.
• AO MENRT Impacts des OGM (2000-2002). Financement : 700 KF.
• AO IFB Biodiversité (2001-2003). Financement : 180 KF.
• AO CNRS Impact des Biotechnologies dans les agro-écosystèmes (2002-2004). Financement : 280 KF.
• AIP INRA Typage de bio-agresseurs et de symbiotes (2002). Financement : 30 KF.
• AO MENRT Impacts des OGM (2002-2004). Financement : 36 K€.
• EU 5ième PCRD (2000-2003). Financement : 245 K€.
• AO IFB Biodiversité et changement global (2004-2006). Financement : 45 K€.
• AO CNRS Impact des Biotechnologies dans les agro-écosystèmes (2004-2006). Financement : 60 K€.
• AO ANR Ecoger (2005-2007). Financement : 50 K€.
• AO ANR Systerra (2009-2013). Financement : 540 K€
• AO INRA SPE (2011-2013). Financement : 45 K€
• AO ANR Bioadapt (2012-2015). Financement : 45 K€.
• AO ANR Blanc (2014-2017). Financement : 280 K€
• AO INRA SPE (2014-2015). Financement : 15 K€
• "Peer Community in" (2017-2020). Financement : 100 K€
EXPERTISES, JURYS ET ENSEIGNEMENTS
Expertises
• Comité Scientifique sur les Plantes de l’Union Européenne.
• Commission du Génie Biomoléculaire.
• Comité de Biovigilance.
• European Food Safety Authority (EFSA).
Relecteur : Science, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Mol. Ecol., Evolution, Insect Biochem., Mol. Biol. Evol., Proc. R. Soc. Lond. B…
Participation à 33 comités de thèse, 34 jurys de thèse et de 16 jurys de HDR
Jurys de concours : CoNRS section 29 (2012, 2014), Commissions de spécialistes de l’U. Tours (2001), Techniciens de la Recherche INRA (2000), DEA Ecologie et Evolution U. Montpellier II (2004), ED Biologie Intégrative U. Montpellier II (2004), Directeur de Recherche 2nd Classe INRA (2007), Ingénieur d’Etude INRA (2008), Commissions de spécialistes de l’U. Montpellier II (2009), Chargés de Rechercher CIRAD (2005, 2015), Chargés de Recherche INRA (2002, 2009, 2010, 2012, 2013, 2016, 2018, 2020), Directeur de Recherche 1ière classe INRA (2011, 2013), Professeur des Universités de l’Université de Lyon 1 (2012), Maitre de conférence of MNHN (2014).
Enseignement : U. Montpellier II, ISA Beauvais, AgroParisTech, Montpellier SupAgro, U. de Tours et U. Lille I.
Membre du comité AERES/HCERES pour l’évaluation de l’UMR 7205 (OSEB) et de l’UPR 9034 (LEGS).
Président du comité AERES/HCERES pour l’évaluation de l’UMR 5553 (LECA).
Publications
Publications
Pratiques de publication, pratiques de recherches et science ouverteProspectives du CNRS-Ecologie et Environnement 2022, CNRS, Oct 2022, La Rochelle, France
Communication dans un congrès
hal-04694658
v1
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Crise de reproductibilité et science ouverte : Les Registered ReportsProspectives du CNRS-Ecologie et Environnement 2022, CNRS, Oct 2022, La Rochelle, France
Communication dans un congrès
hal-04694666
v1
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Peer Community In… A free recommendation process of preprints based on peer reviewsEcotoxicoMicYR Webinar 2021, Nov 2021, Webinar, France
Communication dans un congrès
hal-03484190
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Western European populations of the ichneumonid wasp Hyposoter didymator belong to a single taxon6. International Entomophagous Insects Conference, Sep 2019, Perugia, Italy
Communication dans un congrès
hal-02446499
v1
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Peer Community In: A free process for the recommendation of unpublished scientific papers based on peer reviewELPUB 2019 23rd edition of the International Conference on Electronic Publishing, Jun 2019, Marseille, France. ⟨10.4000/proceedings.elpub.2019.23⟩
Communication dans un congrès
hal-02142244
v1
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Peer Community In: a free process for the recommendation of preprints based on peer reviewFORCE2019, Oct 2019, Edinburgh, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02327583
v1
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Western European populations of the ichneumonid wasp Hyposoter didymator belong to a single taxon6th International Entomophagous Insects Conference (IEIC6), Sep 2019, Perugia, Italy
Communication dans un congrès
hal-04873432
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Can evolutionary biology help better predict the risks associated with population control using gene drives?2. Joint Congress on Evolutionary Biology (EVOLUTION 2018), Aug 2018, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-02785305
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Arthropodes cibles et non cibles des PGMs : forces et faiblesses des études et des plans d'action proposés par les pétitionnairesGT « Biotechnologie » de l’ANSES, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES). FRA., Feb 2014, Maisons-Alfort, France
Communication dans un congrès
hal-02796178
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Résistances et plantes génétiquement modifiéesColloque sur « Les Plantes Génétiquement Modifiées » co-organisée par l’Académie des Sciences, l’Académie des Biotechnologies et l’Académie d’Agriculture de France, Nov 2013, Paris, France. 6 p
Communication dans un congrès
hal-02749026
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Transgenic poplar and the poplar leaf beetle: state-of-the-art on the risk of evolution of insect resistance22. session international poplar commission: The contribution of poplars and willows to sustainable forestry and rural development, Nov 2004, Santiago, Chile. p. 6
Communication dans un congrès
hal-02832242
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Pyrale du maïs et maïs transgénique Bt : sélection et gestion de la résistanceAIP-INRA "OGM et Environnement", Apr 2002, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02762708
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Interaction between acetylcholinesterase and choline acethyltransferase: An hypothesis to explain unusual toxicological responsesResistance '97: Integrated approach to combating resistance, Apr 1997, Harpenden, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02840414
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Study of the mechanism of resistance to Bacillus thuringiensis Cry3A toxin in a natural population of the leaf beetle, Chrysomela tremulae (Coleoptera: Chrysomelidae)40. Annual Meeting of the Society for Invertebrate Pathology;1. International Forum on Entomopathogenic Nematodes and Symbiotic Bacteria, Aug 2007, Quebec, Canada. 1 p., 2007
Poster de conférence
hal-02818563
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Un monde sans moustiques ni cafards est-il possible ?Editions le Pommier, 58 p., 2011, Les Petites Pommes du savoir, 978-2-7465-0562-9
Ouvrages
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Diffusion et promotion de la méthode scientifique et des sciencesProspectives CNRS Écologie & Environnement 2023, Sciences et société : du savoir à l'action, CNRS, pp.221-231, 2023
Chapitre d'ouvrage
hal-04694642
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The hidden and external costs of pesticide useSustainable Agriculture Reviews, 19, Springer International Publishing, pp.35-120, 2016, Sustainable Agriculture Reviews, 978-3-319-26776-0. ⟨10.1007/978-3-319-26777-7_2⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01303109
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Plantes génétiquement modifiées et résistanceEncyclopaedia Universalis, 2015
Chapitre d'ouvrage
hal-02798283
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La lutte microbiologique contre les insectes ravageurs des cultures : contraintes, bilan et perspectivesEnjeux phytosanitaires pour l'agriculture et l'environnement : Pesticides et biopesticides OGM Lutte intégrée et biologique Agriculture durable, Tec et Doc, 2005, 978-2-7430-0785-0
Chapitre d'ouvrage
hal-02834071
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Acetylcholinesterase and insecticide resistance in the mosquito Culex PipiensStructure and function of cholinesterases and related proteins, Plenum Press, 1998
Chapitre d'ouvrage
hal-02839572
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Peer Community In… A free recommendation process of preprints based on peer reviews2022, https://www.canal-u.tv/chaines/fire/christian-mougin-l-initiative-peer-community-in
Autre publication scientifique
hal-03679088
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Peer Community in Ecotoxicology & Environmental Chemistry, un nouveau média ouvert, transparent et gratuit pour la valorisation et la diffusion de vos recherches2021
Autre publication scientifique
hal-03228265
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Pour une plus grande indépendance de l’expertise scientifique2013
Autre publication scientifique
hal-02940281
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Pratiques intègres de publication scientifique à l’heure de la science ouverte. Note de recommandationsINRAE. 2025, 12 pp
Rapport
hal-04964196
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Avis en réponse à la saisine 130919-saisine HCB - dossier C-NL-13-01 concernant le dossier C/NL/13/01[0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013
Rapport
(rapport d’expertise collective)
hal-02807779
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AVIS en réponse à la saisine 130905- saisine HCB - dossier 2009-681 concernant le dossier EFSA-GMO-NL-2009-68[0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2013
Rapport
(rapport d’expertise collective)
hal-02915573
v1
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Avis concernant les recommandations du Comité de surveillance biologique du territoire relatives à la surveillance des PGM[0] Haut Conseil des Biotechnologies. 2012
Rapport
(rapport d’expertise collective)
hal-02809619
v1
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