Denis Tagu

Présentation

Areas of Focus

Genomics

Integrative genomics

Bioinformatics

Insect adaptation

Phenotypic plasticity

Management

International Aphid Genomics Consortium (

www.aphidbase.com

)

Associate Editor Insect Science

Member of the i5K coordinating group (

http://arthropodgenomes.org/wiki/i5K

)

Member of the GIGA consortium (

http://giga-cos.org/

)

Coordination of 4 insect genome sequencing (

http://www.spe.inra.fr/Toutes-les-actualites/i5k-sequencer-5000-genomes-d-insectes

)

Coordination of ANR project on association genetics in the pea aphid (2012-2014)

Coordination of ANR project on microRNAs and gene network in the pea aphid (2009-2012)

Coordination of ANR project on genes responsible for sex determination in aphids (2018-2020)

Partner of the European Training Network IGNITE on invertebrate genomics (2018-2022)

Head of the Institute of Genetics, Environment and Plant Protection: more than 260 persons involved in describing, understanding and modeling agroecosystems, plants and their pathogens, pests and auxiliaries (2012-2016)

Associate Editor BMC Genomics

Associate Editor Current Opinion Insect Science

Citizen science for genome annotation

Publications

Article dans une revue (108)

Academic work as craft: Towards a qualitative and multicriteria assessment Denis Tagu,Francoise Boudet-Bône,Camille Brard,Edith Legouy,Frédéric Gaymard Peer Community In Organization Studies, 2024, 4, pp.e77. ⟨10.24072/pci.orgstudies.100004⟩ Article dans une revue hal-04680504v1
Transcriptomic basis of sex loss in the pea aphid M D Huguet,Stéphanie Robin,Sylvie Hudaverdian,Sylvie Tanguy,Nathalie Prunier-Letermeet al. BMC Genomics, 2024, Bmc Genomics, 25 (1), pp.202. ⟨10.1186/s12864-023-09776-6⟩ Article dans une revue hal-04484084v1
A qualitative and multicriteria assessment of scientists: a perspective based on a case study of INRAE, France Denis Tagu,Francoise Boudet-Bône,Camille Brard,Edith Legouy,Frédéric Gaymard Peer Community Journal, 2024, 4, pp.e77. ⟨10.24072/pcjournal.432⟩ Article dans une revue hal-04737567v2
MTG-Link: leveraging barcode information from linked-reads to assemble specific loci Anne Guichard,Fabrice Legeai,Denis Tagu,Claire Lemaitre BMC Bioinformatics, 2023, 24 (1), pp.284. ⟨10.1186/s12859-023-05395-w⟩ Article dans une revue hal-04166273v1
Contrasting Evolutionary Patterns Between Sexual and Asexual Lineages in a Genomic Region Linked to Reproductive Mode Variation in the pea aphid Maud Rimbault,Fabrice Legeai,Jean Peccoud,Lucie Mieuzet,Elsa Callet al. Genome Biology and Evolution, 2023, 15 (9), pp.evad168. ⟨10.1093/gbe/evad168⟩ Article dans une revue hal-04232477v1
Dopamine pathway characterization during the reproductive mode switch in the pea aphid Gaël Le Trionnaire,Sylvie Hudaverdian,Gautier Richard,Sylvie Tanguy,Florence Gleonnecet al. Peer Community Journal, 2022, 2, pp.e43. ⟨10.24072/pcjournal.152⟩ Article dans une revue hal-03766639v1
pH effect on strain-specific transcriptomes of the take-all fungus Kévin Gazengel,Lionel Lebreton,Nicolas Lapalu,Joëlle Amselem,Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudtet al. PLoS ONE, 2020, 15 (7), pp.e0236429. ⟨10.1371/journal.pone.0236429⟩ Article dans une revue hal-02979591v1
Functional insights from the GC-poor genomes of two aphid parasitoids, &quot;Aphidius ervi&quot; and &quot;Lysiphlebus fabarum Alice Dennis,Gabriel Ballesteros,Stéphanie Robin,Lukas Schrader,Jens Bastet al. BMC Genomics, 2020, 21 (Art. 376), pp.1-27. ⟨10.1186/s12864-020-6764-0⟩ Article dans une revue hal-02649295v1
Les surprises du séquençage du génome du phylloxéra Denis Tagu,Nathalie Ollat,François Delmotte,Sébastien Julliard Sciences et Avenir, 2020, 884, pp.12-13 Article dans une revue hal-02958737v1
Genomic architecture of endogenous ichnoviruses reveals distinct evolutionary pathways leading to virus domestication in parasitic wasps Fabrice F. Legeai,Bernardo F Santos,Stéphanie Robin,Anthony Bretaudeau,Rebecca B Dikowet al. BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.1-23. ⟨10.1186/s12915-020-00822-3⟩ Article dans une revue hal-02918230v1
Correction to: The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest Claude Rispe,Fabrice Legeai,Paul Nabity,Rosa Fernández,Arinder Aroraet al. BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.123. ⟨10.1186/s12915-020-00864-7⟩ Article dans une revue hal-05190973v1
The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest Claude Rispe,Fabrice Legeai,Paul Nabity,Rosa Fernández,Arinder Aroraet al. BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.90. ⟨10.1186/s12915-020-00820-5⟩ Article dans une revue hal-02917617v1
Selection following Gene Duplication Shapes Recent Genome Evolution in the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum Rosa Fernández,Marina Marcet-Houben,Fabrice Legeai,Gautier Richard,Stéphanie Robinet al. Molecular Biology and Evolution, 2020, 37 (9), pp.2601-2615. ⟨10.1093/molbev/msaa110⟩ Article dans une revue hal-03065353v1
Acyrthosiphon pisum Federica Calevro,Denis Tagu,Patrick Callaerts Trends in Genetics, 2019, 35 (10), pp.781-782. ⟨10.1016/j.tig.2019.07.003⟩ Article dans une revue hal-02279584v1
An integrated protocol for targeted mutagenesis with CRISPR-Cas9 system in the pea aphid Gaël Le Trionnaire,Sylvie Tanguy,Sylvie Hudaverdian,Florence Gléonnec,Gautier Richardet al. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2019, 110, pp.34-44. ⟨10.1016/j.ibmb.2019.04.016⟩ Article dans une revue hal-02154486v1
Dosage compensation and sex-specific epigenetic landscape of the X chromosome in the pea aphid. Gautier Richard,Fabrice Legeai,Nathalie Prunier-Leterme,Anthony Bretaudeau,Denis Taguet al. Epigenetics & Chromatin, 2017, 10 (1), pp.1-17. ⟨10.1186/s13072-017-0137-1⟩ Article dans une revue hal-01555242v1
Rapid transcriptional plasticity of duplicated gene clusters enables a clonally reproducing aphid to colonise diverse plant species Thomas C. Mathers,Yazhou Chen,Gemy Kaithakottil,Fabrice Legeai,Sam T. Mugfordet al. Genome Biology, 2017, 18 (1), pp.27. ⟨10.1186/s13059-016-1145-3⟩ Article dans une revue hal-01500475v1
Erratum to: Rapid transcriptional plasticity of duplicated gene clusters enables a clonally reproducing aphid to colonise diverse plant species Thomas C. Mathers,Yazhou Chen,Gemy Kaithakottil,Fabrice Legeai,Sam T. Mugfordet al. Genome Biology, 2017, 18 (1), pp.63. ⟨10.1186/s13059-017-1202-6⟩ Article dans une revue hal-01588181v1
De novo transcriptome assembly of the grapevine phylloxera allows identification of genes differentially expressed between leaf- and root-feeding forms Claude Rispe,Fabrice Legeai,Daciana Papura,Anthony Bretaudeau,Sylvie Hudaverdianet al. BMC Genomics, 2016, 17 (1), pp.219. ⟨10.1186/s12864-016-2530-8⟩ Article dans une revue hal-01286528v1
Editorial overview: Insect genomics: How to sequence five thousand insect genomes? Susan J. Brown,Denis Tagu Current Opinion in Insect Science, 2015, 7, pp.IV-V. ⟨10.1016/j.cois.2015.02.006⟩ Article dans une revue hal-01228842v1
Transcriptomic responses of the aphid [i]Myzus persicae nicotianae[/i] Blackman (Hemiptera: Aphididae) to insecticides: Analyses in the single Chilean clone of the tobacco aphid Marco Cabrera-Brandt,Andrea X. Silva,Gaël Le Trionnaire,Denis Tagu,Christian C. Figueroa Chilean Journal of Agricultural Research, 2014, 74 (2), pp.191-199. ⟨10.4067/S0718-58392014000200010⟩ Article dans une revue hal-01208769v1
Genomic data integration for ecological and evolutionary traits in non-model organisms Denis Tagu,John K. Colbourne,Nicolas Negre BMC Genomics, 2014, 15, pp.490. ⟨10.1186/1471-2164-15-490⟩ Article dans une revue hal-01208730v1
EMS Mutagenesis in the Pea Aphid [i]Acyrthosiphon pisum[/i] Denis Tagu,Gaël Le Trionnaire,Sylvie Tanguy,Jean-Pierre Gauthier,J.R. Huynh G3, 2014, 4, pp.657-667. ⟨10.1534/g3.113.009639⟩ Article dans une revue hal-01228833v1
Neonicotinoid Binding, Toxicity and Expression of Nicotinic Acetylcholine Receptor Subunits in the Aphid Acyrthosiphon pisum Emiliane Taillebois,Abdelhamid Beloula,Sophie Quinchard,Stéphanie Jaubert-Possamai,Antoine Daguinet al. PLoS ONE, 2014, 9 (5), pp.e96669. ⟨10.1371/journal.pone.0096669⟩ Article dans une revue hal-01208711v1
Masculinization of the X Chromosome in the Pea Aphid Julie Jaquiéry,Claude Rispe,Denis Roze,Fabrice Legeai,Gaël Le Trionnaireet al. PLoS Genetics, 2013, 9 (8), pp.e1003690. ⟨10.1371/journal.pgen.1003690⟩ Article dans une revue hal-00916967v1
Genome expression control during the photoperiodic response of aphids Gaël Le Trionnaire,Valentin Wucher,Denis Tagu Physiological Entomology, 2013, 38 (2), pp.117 - 125. ⟨10.1111/phen.12021⟩ Article dans une revue istex hal-01208628v1
The i5K initiative: Advancing arthropod genomics for knowledge, human health, agriculture, and the environment Jay D. Evans,Susan J. Brown,Kevin J. Hackett,Gene Robinson,Stephen Richardset al. Journal of Heredity, 2013, 104 (5), pp.595-600. ⟨10.1093/jhered/est050⟩ Article dans une revue hal-01208655v1
Transcriptomic profiling of the reproductive mode switch in the pea aphid in response to natural autumnal photoperiod. Gaël Le Trionnaire,Stéphanie Jaubert-Possamai,Joël Bonhomme,Jean-Pierre Gauthier,Grégory Guernecet al. Journal of Insect Physiology, 2012, 58 (12), pp.1517-1524. ⟨10.1016/j.jinsphys.2012.07.009⟩ Article dans une revue istex hal-00753429v1
Juvenile hormone titre and related gene expression during the change of reproductive modes in the pea aphid A. Ishikawa,K. Ogawa,H. Gotoh,T. K. Walsh,Denis Taguet al. Insect Molecular Biology, 2012, 21 (1), pp.49 - 60. ⟨10.1111/j.1365-2583.2011.01111.x⟩ Article dans une revue hal-02645782v1
Evolutionary study of duplications of the miRNA machinery in aphids associated with striking rate acceleration and changes in expression profiles. Benjamin Ortiz Rivas,Stéphanie Jaubert,Sylvie Tanguy,Jean-Pierre Gauthier,Denis Taguet al. BMC Evolutionary Biology, 2012, 12, pp.216. ⟨10.1186/1471-2148-12-216⟩ Article dans une revue hal-01208607v1
Sexual and asexual oogenesis require the expression of unique and shared sets of genes in the insect Acyrthosiphon pisum Aurore Gallot-Le Grand,Shuji Shigenobu,Tomomi Hashiyama,Stéphanie Jaubert,Denis Tagu BMC Genomics, 2012, 13, pp.76. ⟨10.1186/1471-2164-13-76⟩ Article dans une revue hal-01208668v1
Comparison of gene repertoires and patterns of evolutionary rates in eight aphid species that differ by reproductive mode. M. Ollivier,T. Gabaldón,J. Poulain,Frédérick F. Gavory,N. Letermeet al. Genome Biology and Evolution, 2012, 4 (2), pp.155-67. ⟨10.1093/gbe/evr140⟩ Article dans une revue hal-00753402v1
Delayed setting of the photoperiodic response in recombinant clones of the aphid species Sitobion avenae Charles-Antoine Dedryver,Jean Francois Le Gallic,Frédérique Maheo,Nicolas Parisey,Denis Tagu Ecological Entomology, 2012, 37 (4), pp.293 - 299. ⟨10.1111/j.1365-2311.2012.01365.x⟩ Article dans une revue istex hal-01208658v1
Predicted Effector Molecules in the Salivary Secretome of the Pea Aphid (Acyrthosiphon pisum): A Dual Transcriptomic/Proteomic Approach J.C. Carolan,D. Caragea,K.T. Reardon,N.S. Mutti,N. Dittmeret al. Journal of Proteome Research, 2011, 10 (4), pp.1505-1518. ⟨10.1021/pr100881q⟩ Article dans une revue hal-02646917v1
Expansion of Genes Encoding piRNA-Associated Argonaute Proteins in the Pea Aphid: Diversification of Expression Profiles in Different PlasticMorphs Hsiao-Ling Lu,Sylvie Tanguy,Claude Rispe,Jean-Pierre Gauthier,Tom Walshet al. PLoS ONE, 2011, 6 (12), ⟨10.1371/journal.pone.0028051⟩ Article dans une revue hal-02650214v1
When the genomic attacks insects in agricultural landscapes Denis Tagu,Manuel Plantegenest,Jean-Christophe Simon Biofutur, 2011, 319, pp.48 - 50 Article dans une revue hal-01462677v1
Quand la génomique s'attaque aux insectes des paysages agricoles Denis Tagu,Manuel Plantegenest,Jean-Christophe Simon Biofutur, 2011, 30 (319), pp.48-50 Article dans une revue hal-02642419v1
Genomics of Environmentally Induced Phenotypes in 2 Extremely Plastic Arthropods Jean-Christophe Simon,Michael E. Pfrender,Ralph Tollrian,Denis Tagu,John K. Colbourne Journal of Heredity, 2011, 102 (5), pp.512 - 525. ⟨10.1093/jhered/esr020⟩ Article dans une revue hal-02652047v1
Revisiting the anatomy of the central nervous system of a hemimetabolous model insect species: the pea aphid Acyrthosiphon pisum Martin Kollmann,Sebastian Minoli,Joel Bonhomme,Joël Homberg,Joachim Schachtneret al. Cell and Tissue Research, 2011, 343 (2), pp.343-355. ⟨10.1007/s00441-010-1099-9⟩ Article dans une revue istex hal-01189551v1
Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum Iagc The International Aphid Genomics Consortium,Federica Calevro,Hubert Charles,Stefano Colella,Gérard Febvayet al. PLoS Biology, 2010, 8 (2), pp.e1000313. ⟨10.1371/journal.pbio.1000313⟩ Article dans une revue hal-00459970v1
Cuticular proteins and seasonal photoperiodism in aphid Aurore Gallot-Le Grand,Claude Rispe,Nathalie Prunier Leterme,Jean-Pierre Gauthier,Stéphanie Jaubertet al. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2010, 40 (3), pp.235-240. ⟨10.1016/j.ibmb.2009.12.001⟩ Article dans une revue istex hal-02655393v1
Expansion of the miRNA pathway in the hemipteran insect Acyrthosiphon pisum Stéphanie Jaubert,Claude Rispe,Sylvie Tanguy,Karl Gordon,Thomas Walshet al. Molecular Biology and Evolution, 2010, 27 (5), pp.979-987. ⟨10.1093/molbev/msp256⟩ Article dans une revue hal-02666616v1
Transcriptomic analysis of intestinal genes following acquisition of pea enation mosaic virus by the pea aphid [i]Acyrthosiphon pisum[/i] Véronique Brault,Sylvie Tanguy,Catherine Reinbold,Gaël Le Trionnaire,Joël Arneodoet al. Journal of General Virology, 2010, 91 (3), pp.802-808. ⟨10.1099/vir.0.012856-0⟩ Article dans une revue hal-01205028v1
The anatomy of an aphid genome: from sequence to biology. Denis Tagu,Sébastien Dugravot,Yannick Outreman,Claude Rispe,Jean-Christophe Simonet al. Comptes Rendus. Biologies, 2010, 333 (6-7), pp.464-73. ⟨10.1016/j.crvi.2010.03.006⟩ Article dans une revue istex hal-00690655v1
AphidBase: a centralized bioinformatic resource for annotation of the pea aphid genome. Fabrice Legeai,Shuji Shigenobu,Jean-Pierre Gauthier,John Colbourne,Claude Rispeet al. Insect Molecular Biology, 2010, 19 (s2), pp.5-12. ⟨10.1111/j.1365-2583.2009.00930.x⟩ Article dans une revue hal-02658827v1
Bioinformatic prediction, deep sequencing of microRNAs and expression analysis during phenotypic plasticity in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum. Fabrice Legeai,Guillaume Rizk,Thomas Walsh,Owain Edwards,Karl Gordonet al. BMC Genomics, 2010, 11 (1), pp.281. ⟨10.1186/1471-2164-11-281⟩ Article dans une revue inserm-00482283v1
Neuropeptide and neurohormone precursors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum Jurgen Huybrechts,Joel Bonhomme,Sebastian S. Minoli,Nathalie Prunier Leterme,Aviv Dombrovskyet al. Insect Molecular Biology, 2010, 19 (s2), pp.87-95. ⟨10.1111/j.1365-2583.2009.00951.x⟩ Article dans une revue istex hal-02666458v1
Evolutionary and functional insights into reproductive strategies of aphids Jean-Christophe Simon,Solenn Stoeckel,Denis Tagu Comptes Rendus. Biologies, 2010, 333 (6-7), pp.488-496. ⟨10.1016/j.crvi.2010.03.003⟩ Article dans une revue istex hal-02661743v1
A functional DNA methylation system in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum T.K. Walsh,Jennifer Brisson,H.M. Robertson,Karl Gordon,Stéphanie Jaubertet al. Insect Molecular Biology, 2010, 19 (s2), pp.215-228. ⟨10.1111/j.1365-2583.2009.00974.x⟩ Article dans une revue istex hal-02663013v1
Transcriptomic and proteomic analyses of seasonal photoperiodism in the pea aphid. Gaël Le Trionnaire,F. Francis,S. Jaubert-Possamai,J. Bonhomme,E. de Pauwet al. BMC Genomics, 2009, 10, pp.456. ⟨10.1186/1471-2164-10-456⟩ Article dans une revue inria-00435791v1
Hydrophobins in ectomycorrhizas: heterologous transcription of the Pisolithus HydPt-1 gene in yeast and Hebeloma cylindrosporum Denis Tagu,R Marmeisse,Y Baillet,S Rivière,B Palinet al. European Journal of Histochemistry, 2009, 46 (1), pp.23. ⟨10.4081/1651⟩ Article dans une revue hal-02937738v1
Shifting from clonal to sexual reproduction in aphids: physiological and developmental aspects Gaël Le Trionnaire,J. Hardie,Stéphanie Jaubert,Jean-Christophe Simon,Denis Tagu Biology of the Cell, 2008, 100 (8), pp.441-451. ⟨10.1042/bc20070135⟩ Article dans une revue hal-02660672v1
Early progress in aphid genomics and consequences for plant-aphid interactions studies Denis Tagu,J.P. Klingler,A. Moya,Jean-Christophe Simon Molecular Plant-Microbe Interactions, 2008, 21 (6), pp.701-708. ⟨10.1094/MPMI-21-6-0701⟩ Article dans une revue hal-02655362v1
Sex versus parthenogenesis: A transcriptomic approach of photoperiod response in the model aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphididae) T. Cortés,Denis Tagu,Jean-Christophe Simon,A. Moya,D. Martinez-Torres Gene, 2008, 408 (1-2), pp.146-156. ⟨10.1016/j.gene.2007.10.030⟩ Article dans une revue istex hal-02663331v1
Seasonal photoperiodism regulates the expression of cuticular and signalling protein genes in the pea aphid Gaël Le Trionnaire,Stéphanie Jaubert,B. Sabater-Munoz,A. Benedetto,Joel Bonhommeet al. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2007, 37 (10), pp.1094-1102. ⟨10.1016/j.ibmb.2007.06.008⟩ Article dans une revue istex hal-02656485v1
Annotated expressed sequence tags and xenobiotic detoxification in the aphid Myzus persicae (Sulzer) C.C. Figueroa,Nathalie Prunier Leterme,Claude Rispe,F. Sepulveda,E. Fuentes-Contreraset al. Insect Science, 2007, 14 (1), pp.29-45. ⟨10.1111/j.1744-7917.2007.00123.x⟩ Article dans une revue hal-02655378v1
Large Gene Family Expansion and Variable Selective Pressures for Cathepsin B in Aphids Claude Rispe,Mayako Kutsukabe,Vincent Doublet,Sylvie Hudaverdian,Fabrice Legeaiet al. Molecular Biology and Evolution, 2007, 25 (Oct 13), pp.5-17. ⟨10.1093/molbev/msm222⟩ Article dans une revue inria-00180087v1
AphidBase: a database for aphid genomic resources Jean-Pierre Gauthier,Fabrice Legeai,Alain Zasadzinski,Claude Rispe,Denis Tagu Bioinformatics, 2007, 23 (6), pp.783-784. ⟨10.1093/bioinformatics/btl682⟩ Article dans une revue inria-00180141v1
Gene knockdown by RNAi in the pea aphid Acyrthosiphon pisum Stéphanie Jaubert,Gaël Le Trionnaire,Joel Bonhomme,G.K. Christophides,Claude Rispeet al. BMC Biotechnology, 2007, 7 (63), n.p. ⟨10.1186/1472-6750-7-63⟩ Article dans une revue hal-02666126v1
La vie sexuée et asexuée des pucerons Jean-Christophe Simon,Stéphanie Jaubert,Claude Rispe,Denis Tagu Biofutur, 2007, 279, pp.53-56 Article dans une revue hal-02654851v1
MicroRNAs in Drosophila: The magic wand to enter the Chamber of Secrets? Stéphanie Jaubert,Agnès Méreau,Christophe Antoniewski,Denis Tagu Biochimie, 2007, 89 (10), pp.1211-1220. ⟨10.1016/j.biochi.2007.05.012⟩ Article dans une revue istex hal-02202002v1
Strong Heterogeneity in Nucleotidic Composition and Codon Bias in the Pea Aphid (Acyrthosiphon pisum) Shown by EST-Based Coding Genome Reconstruction. Claude Rispe,Fabrice Legeai,Jean-Pierre Gauthier,Denis Tagu Journal of Molecular Evolution, 2007, Oct 10 (4), pp.413-424. ⟨10.1007/s00239-007-9023-y⟩ Article dans une revue istex inria-00180094v1
Le génome du puceron en cours de décryptage Denis Tagu,Stéphanie Jaubert,Claude Rispe Biofutur, 2007, 279, pp.57 Article dans une revue hal-02654186v1
Large-scale gene discovery in the pea aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera) Beatriz Sabater-Munoz,Fabrice Legeai,Claude Rispe,Joël Bonhomme,Peter Deardenet al. Genome Biology, 2006, 7-3 (r21), pp.1-11. ⟨10.1186/gb-2006-7-3-r21⟩ Article dans une revue inria-00180157v1
Transcript patterns associated with ectomycorrhiza development in Eucalyptus globulus and Pisolithus microcarpus Sébastien Duplessis,Pierre-Emmanuel Courty,Denis Tagu,F. Martin New Phytologist, 2005, 165, pp.599-611 Article dans une revue hal-02680580v1
T-DNA transfer from Agrobacterium tumefaciens to the ectomycorrhizal fungus Pisolithus microcarpus A.G. Pardo,Minna Kemppainen,D. Valdemoros,Sébastien Duplessis,Francis Martinet al. Revista Argentina de Microbiología, 2005, 37, pp.69-72 Article dans une revue hal-02681826v1
Genetic analysis of phenotypic variation for ectomycorrhiza formation in an interspecific F1 poplar full-sib family Denis Tagu,Catherine Bastien,Patricia P. Faivre-Rampant,Jean J. Garbaye,Patrice Vionet al. Mycorrhiza, 2005, 15, pp.87-91. ⟨10.1007/s00572-004-0302-9⟩ Article dans une revue istex hal-02682244v1
Aster self-organization at meiosis: a conserved mechanism in insect parthenogenesis ? M.G. Riparbelli,Denis Tagu,Joel Bonhomme,G. Callaini Developmental Biology, 2005, 278 (1), pp.220-230. ⟨10.1016/j.ydbio.2004.11.009⟩ Article dans une revue hal-02680387v1
Deciphering reproductive polyphenism in aphids Denis Tagu,B. Sabater-Munoz,Jean-Christophe Simon Invertebrate Reproduction and Development, 2005, 48 (1-3), pp.71-80 Article dans une revue hal-02678056v1
Agrobacterium-mediated transformation of the ectomycorrhizal symbiont Laccaria bicolor S238N Minna Kemppainen,A. Circosta,Denis Tagu,F. Martin,A.G. Pardo Mycorrhiza, 2005, 16, pp.19-22 Article dans une revue hal-02671053v1
Fungal ectomycorrhizal community and drought affect root hydraulic properties and soil adherence to roots of Pinus pinaster seedlings Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot,François Bartoli,Jean J. Garbaye,Roland Marmeisse,Denis Tagu Plant and Soil, 2004, 267 (1-2), pp.213-223. ⟨10.1007/s11104-005-5349-7⟩ Article dans une revue istex hal-02682688v1
Annotated expressed sequence tags for studies of the regulation of reproductive modes in aphids Denis Tagu,N. Prunier-Leterme,F. Legeai,J.-P Gauthier,A Duclertet al. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2004, 34, pp.809 - 822. ⟨10.1016/j.ibmb.2004.05.001⟩ Article dans une revue hal-02915291v1
Identification of Ty1-copia retrotransposons in three ectomycorrhizal basidiomycetes: evolutionary relationships and use as molecular markers Julien Diez,Thierry Beguiristain,François Le Tacon,J.M. Casacuberta,Denis Tagu Current Genetics, 2003, 43 (1), pp.34-44 Article dans une revue hal-02673260v1
Characterization of a symbiosis- and auxin-regulated glutathione-S-transferase from Eucalyptus globulus roots Denis Tagu,Béatrice Palin,R. Balestrini,Éric Gelhaye,Frédéric Lapeyrieet al. Plant Physiology and Biochemistry, 2003, 41 (6), pp.611-618 Article dans une revue hal-02682135v1
Analysis of expressed sequence tags from the ectomycorhizal basidiomycetes Laccaria bicolor and Pisolithus microcarpus Martina Peter,Pierre‐emmanuel Courty,Annegret Kohler,Christine Delaruelle,David Martinet al. New Phytologist, 2003, 159 (1), pp.117-129. ⟨10.1046/j.1469-8137.2003.00796.x⟩ Article dans une revue hal-02680906v1
The ectomycorrhizal symbiosis: genetics and development Denis Tagu,Frédéric Lapeyrie,F. Martin Plant and Soil, 2002, 244, pp.97-105 Article dans une revue hal-02670624v1
SCAR markers to detect mycorrhizas of an American Laccaria bicolor strain inoculated in European Douglas-fir plantations Jean Weber,Jesús Díez,Marc-Andre Selosse,Denis Tagu,François Tacon Mycorrhiza, 2002, 12 (1), pp.19-27. ⟨10.1007/s00572-001-0142-9⟩ Article dans une revue istex hal-02922685v1
Modification of Electrodes with Self-Assembled Hydrophobin Layers Renata Bilewicz,Jaroslaw Witomski,Angeline van Der Heyden,Denis Tagu,Béatrice Palinet al. Journal of Physical Chemistry B, 2001, 105 (40), pp.9772-9777. ⟨10.1021/jp0113782⟩ Article dans une revue istex hal-02937741v1
Variation in the ability to form ectomycorrhizas in the F1 progeny of an interspecific poplar (Populus spp.) cross Denis Tagu,Patricia Faivre-Rampant,Frédéric Lapeyrie,Pascale Frey-Klett,Patrice Vionet al. Mycorrhiza, 2001, 10 (5), pp.237-240 Article dans une revue hal-02670332v1
Isolation and characterization of a new peroxiredoxin from poplar sieve tubes that uses either glutaredoxin or thioredoxin as a proton donor Nicolas Rouhier,Éric Gelhaye,Pierre-Eric Sautiere,Annick Brun,Pascal Laurentet al. Plant Physiology, 2001, 127 (3), pp.1299-1309. ⟨10.1104/pp.010586⟩ Article dans une revue hal-02915286v1
Immunolocalization of hydrophobin HYDPt-1 from the ectomycorrhizal basidiomycete Pisolithus tinctorius during colonization of Eucalyptus globulus roots Denis Tagu,R. de Bellis,R. Balestrini,O.M.H. de Vries,G. Piccoliet al. New Phytologist, 2001, 149, pp.127-135 Article dans une revue hal-02674884v1
Cloning and expression analysis of a new hydrophobin cDNA from the ectomycorrhizal basidiomycete Pisolithus Sébastien Duplessis,Céline Sorin,Catherine Voiblet,Béatrice Palin,Francis Martinet al. Current Genetics, 2001, ⟨10.1007/s002940100224⟩ Article dans une revue istex hal-02915287v1
The roles of auxins and cytokinins in mycorrhizal symbioses Susan Jane Barker,Denis Tagu Journal of Plant Growth Regulation, 2000, 19 (2), pp.144-154. ⟨10.1007/s003440000021⟩ Article dans une revue istex hal-02695388v1
Cell wall proteins of the ectomycorrhizal basidiomycete Pisolithus tinctorius: identification, function, and expression in symbiosis F. Martin,P. Laurent,Déborah de Carvalho,C. Voiblet,R. Balestriniet al. Fungal Genetics and Biology, 1999, 27, pp.161-174 Article dans une revue hal-02687952v1
A novel class of ectomycorrhiza-regulated cell wall polypeptides in Pisolithus tinctorius P. Laurent,C. Voiblet,Denis Tagu,Déborah de Carvalho,Uwe Nehlset al. Molecular Plant-Microbe Interactions, 1999, 12 (10), pp.862-871 Article dans une revue hal-02697879v1
Regulation of root and fungal morphogenesis in mycorrhizal symbioses S.J. Barker,Denis Tagu,G. Delp Plant Physiology, 1998, 116, pp.1201-1207 Article dans une revue hal-02695100v1
Hydrophobins in ectomycorrhizal symbiosis: hypothesis Denis Tagu,I. Kottke,F. Martin Symbiosis, 1998, 25, pp.5-18 Article dans une revue hal-02695843v1
Plantes et champignons : ça colle! Denis Tagu INRA Mensuel, 1997, 91, pp.6-7 Article dans une revue hal-02687799v1
Ribosomal DNA internal transcribed spacers to estimate the proportion of Pisolithus tinctorius and Eucalyptus globulus RNAs in ectomycorrhiza E. Carnero Diaz,Denis Tagu,F. Martin Applied and Environmental Microbiology, 1997, 63 (3), pp.840-843 Article dans une revue hal-02696685v1
At the root of mycorrhizal symbioses Denis Tagu,S.J. Barker Trends in Plant Science, 1997, 2 (1), pp.2-3 Article dans une revue hal-02687978v1
Molecular analysis of cell wall proteins expressed during the early steps of ectomycorrhiza development Denis Tagu,F. Martin New Phytologist, 1996, 133, pp.73-85 Article dans une revue hal-02686511v1
Eucalypt à-tubulin: cDNA cloning and increased level of transcripts in ectomycorrhizal root system E. Carnero Diaz,F. Martin,Denis Tagu Plant Molecular Biology, 1996, 31, pp.905-910 Article dans une revue hal-02689072v1
Cloning and characterization of hydrophobins-encoding cDNAs from the ectomycorrhizal basidiomycete Pisolithus tinctorius Denis Tagu,B. Nasse,F. Martin Gene, 1996, 168, pp.93-97 Article dans une revue hal-02692269v1
Fungal gene expression during ectomycorrhiza formation F. Martin,P. Laurent,Déborah de Carvalho,T. Burgess,P. Murphyet al. Canadian Journal of Botany, 1995, 73 (suppl.), pp.S541-S547 Article dans une revue hal-02709465v1
Expressed sequence tags of randomly selected cDNA clones from Eucalyptus globulus-Pisolithus tinctorius ectomycorrhiza Denis Tagu,F. Martin Molecular Plant-Microbe Interactions, 1995, 8 (5), pp.781-783 Article dans une revue hal-02708077v1
Caractérisation d'ADNc dont l'expression est régulée lors du développement de l'ectomycorhize d'Eucalyptus Denis Tagu,F. Martin Acta Botanica Gallica, 1994, 141 (4), pp.421-427 Article dans une revue hal-02702317v1
Genetics of ectomycorrhizal fungi : progress and prospects F. Martin,I.C. Tommerup,Denis Tagu Plant and Soil, 1994, 159, pp.159-170 Article dans une revue hal-02704633v1
Analysis of a maize a-tubulin gene promoter by transient expression and in transgenic tobacco plants J. Rigau,M. Capellades,Lluis Montoliu,M.A. Torres,C. Romeraet al. The Plant Journal, 1993, 4 (6), pp.1043-1050 Article dans une revue hal-02706106v1
Biofeedback. Identifying false positives during the first round of cDNA library screening Denis Tagu Biotechniques, 1993, 15 (5), pp.822 Article dans une revue hal-02705112v1
Cloning symbiosis-related cDNAs from eucalypt ectomycorrhiza by PCR-assisted differential screening Denis Tagu,M. Python,C. Cretin,F. Martin New Phytologist, 1993, 125, pp.339-343 Article dans une revue hal-02707230v1
Complete nucleotide sequence of a sorghum gene coding for the phosphoenolpyruvate carboxylase involved in C4 photosynthesis Loic L. Lepiniec,E. Keryer,Denis Tagu,P. Gadal,C. Cretin Plant Molecular Biology, 1992, 19, pp.339-342 Article dans une revue hal-02704851v1
Regulation of the maize HRGP gene expression by ethylene and wounding. mRNA accumulation and qualitative expression analysis of the promoter by microprojectile bombardment Denis Tagu,Nicola-Denise Walker,L. Ruiz-Avila,S. Burgess,J.A. Martinez-Izquierdoet al. Plant Molecular Biology, 1992, 20, pp.529-538 Article dans une revue hal-02715534v1
The phosphoenolpyruvate carboxylase gene family of Sorghum: promoter structures, amino acid sequences and expression of genes C. Cretin,S. Santi,E. Keryer,Loic L. Lepiniec,Denis Taguet al. Gene, 1991, 99, pp.87-94 Article dans une revue hal-02706500v1
Transcription in a Sorghum phosphoenolpyruvate carboxylase gene in transgenic tobacco leaves: maturation of monocot Pre-mRNA by dicot cells Denis Tagu,C. Cretin,Catherine Bergounioux,P. Gadal Plant Cell Reports, 1991, 9, pp.vol. 9 no. 688-690 Article dans une revue hal-02707459v1
Complete cDNA sequence of sorghum phosphoenolpyruvase carboxylase involved in C4 photosynthesis C. Cretin,E. Keryer,Denis Tagu,Loic L. Lepiniec,G. Vidalet al. Nucleic Acids Research, 1990, 18 (3), 1 p Article dans une revue hal-02704669v1
Inheritance of two foreign genes co-introduced into Petunia hybrida by direct gene transfer Denis Tagu,Catherine Bergounioux,C. Perennes,P. Gadal Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 1990, 21, pp.vol. 21 no. 259-266 Article dans une revue hal-02703716v1
Transformed calli obtained by direct gene transfer into sunflower protoplasts Anne-Laure Moyne,Denis Tagu,Véronique Thor,Catherine Bergounioux,Georges Freyssinetet al. Plant Cell Reports, 1989, 8 (2), pp.97-100. ⟨10.1007/BF00716848⟩ Article dans une revue istex hal-02937744v1
Analysis by flow cytometry of the primary events of Petunia hybrida protoplast transformation Denis Tagu,Catherine Bergounioux,Claudette Perennes,Spencer Brown,Philippe Mulleret al. Plant Science, 1987, 51 (2-3), pp.215-223. ⟨10.1016/0168-9452(87)90195-6⟩ Article dans une revue istex hal-02937734v1

Ouvrages (8)

Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée Denis Tagu,Stéphanie Jaubert-Possamai,Agnès Méreau , 312 p., 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Ouvrages hal-03318953v1
Jobim 2012, 13e Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, 3-6 Juillet 2012, Rennes François Coste,Denis Tagu François Coste and Denis Tagu. Inria Rennes - Bretagne Atlantique, pp.558, 2012, 13 978-2-7261-1301-1 Ouvrages hal-00740287v1
Bio-informatique Denis Tagu,Jean Loup Risler Editions QUAE, 2010, Denis Tagu; Jean-Loup Risler, 978-2-7592-0870-8 Ouvrages hal-02915383v1
分子生物学技术原理 Denis Tagu,Moussard Christian China Agricultural University Press, 2008, Denis Tagu; Christian Moussard, 2-7380-1067-9 Ouvrages hal-02915376v1
Techniques for molecular biology Denis Tagu,Moussard Christian Science Publishers, 2006, Denis Tagu; Christian Moussard, 1-57808-361-3 Ouvrages hal-02915380v1
Fundamentos de las técnicas de biologia molecular Denis Tagu,Moussard Christian ACRIBIA, 2006, Denis Tagu; Christian Moussard, 978-84-200-1067-0 Ouvrages hal-02915368v1
Principes des techniques de biologie moléculaire Denis Tagu,Moussard Christian INRA Editions, 2003, Denis Tagu; Christian Moussard, 2-7380-1067-9 Ouvrages hal-02915364v1
Principes des techniques de biologie moléculaire Denis Tagu INRA Editions, 131 p., 1999, Mieux Comprendre, 2-7380-0859-3 Ouvrages hal-02834884v1

Chapitre d'ouvrage (30)

Clonage moléculaire Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318960v1
Construction de banques d'acides nucléiques Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318959v1
Grands principes de la transgenèse et de la mutagenèse Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318956v1
Electrophorèse des acides nucléiques Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318962v1
Description d'un YAC et autres grands vecteurs Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318961v1
Hybridation moléculaire Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318958v1
Paramètres de description d'un génome Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318967v1
Séquencer un génome : généralités Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318954v1
Structure et expression d'un gène eucaryote codant un ARNm et une protéine Denis Tagu,Stéphanie Jaubert-Possamai Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-02202152v1
Description d'un plasmide et d'un phagemide Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318964v1
Séquençage d'ADN par la technique Sanger Denis Tagu,Françoise Monéger Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318974v1
Enzymes de restriction Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318966v1
Analyse fonctionnelle de promoteurs Denis Tagu,Bruno Favery Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique : 3e édition revue et augmentée, Quae, 2018, Savoir Faire, 978-2-7592-2389-3 Chapitre d'ouvrage hal-03318985v1
Population Genetic Issues: New Insights Using Conventional Molecular Markers and Genomics Tools H.D. Loxdale,D. Edwards,Denis Tagu,C. Vorburger Aphids as Crop Pests, CABI Press, 2017, 9781845932022 Chapitre d'ouvrage hal-02788575v1
Genomics of Phenotypic plastity in Aphids Jenn A. Brisson,Julie Jaquiéry,Fabrice Legeai,Gaël Le Trionnaire,Denis Tagu Henryk Czosnek; Murad Ghanim. Management of Insect Pests to Agriculture, Springer International Publishing, pp.65-96, 2016, 978-3-319-24049-7. ⟨10.1007/978-3-319-24049-7_3⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01314988v1
Functional and evolutionary genomics in aphids. Denis Tagu,Federica Calevro,Stefano Colella,Toni Gabaldon,Akiko Sugio Biology and Ecology of Aphids, 3, CRC Press, 2016, 978-1-4822-3678-1 Chapitre d'ouvrage hal-02800093v1
Integrative Genomic Approaches to Studying Epigenetic Mechanisms of Phenotypic Plasticity in the Aphid Mary Grantham,Jennifer A. Brisson,Denis Tagu,Gaël Le Trionnaire Short Views on Insect Genomics and Proteomics, 3, Springer International Publishing AG, 2015, Entomology in Focus, 978-3-319-24235-4. ⟨10.1007/978-3-319-24235-4_5⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01398438v1
Edge Selection in a Noisy Graph by Concept Analysis – Application to a Genomic Network Valentin Wucher,Denis Tagu,Jacques Nicolas Lausen, Berthold; Krolak-Schwerdt, Sabine; Böhmer, Matthias. Data Science, Learning by Latent Structures, and Knowledge Discovery, Springer, pp.550, 2014, Data Science, Learning by Latent Structures, and Knowledge Discovery, 978-3-662-44982-0. ⟨10.1007/978-3-662-44983-7_31⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01093337v1
Exploring the transcriptome of the ectomycorrhizal symbiosis Francis Martin,Sébastien Duplessis,Annegret Kohler,Denis Tagu Molecular genetics and breeding of forest trees, Haworth Press, 2004, 1560229586 Chapitre d'ouvrage hal-02829658v1
Criblage différentiel : banques soustraites, AFLP-ADNc Jean-Charles Leplé,Denis Tagu Principes des techniques de biologie moléculaire. 2e édition, revue et augmentée, INRA Editions, 2003, Mieux Comprendre, 2-7380-1067-9 Chapitre d'ouvrage hal-02834162v1
Living together underground: a molecular glimpse of the ectomycorrhizal symbiosis Denis Tagu,Sébastien Duplessis,Francis M. Martin Heinz D. Osiewacz. Molecular biology of fungal development, Marcel Dekker, 2002, 0-8247-0744-3 Chapitre d'ouvrage hal-02915362v1
Molecular aspects of ectomycorrhiza development Denis Tagu,Frédéric Lapeyrie,F. Ditengou,H. Lagrange,P. Laurentet al. Current advances in mycorrhizae research, APS Press, 2000, 0-89054-245-7 Chapitre d'ouvrage hal-02843006v1
Developmental biology of a plant-fungus symbiosis: the ectomycorrhiza F. Martín,Denis Tagu Mycorrhiza. Structure, Function, Molecular Biology and Biotechnology, Springer-Verlag, 1999, 3-540-63981-0 Chapitre d'ouvrage hal-02835488v1
Spatial regulation of genes in ectomycorrhiza: mRNA in situ localization and á-glucuronidase detection Denis Tagu,S. Hawkins Mycorrhiza manual, Springer, 1998, 3-540-62437-6 Chapitre d'ouvrage hal-02834267v1
Altered gene expression during ectomycorrhizal development Denis Tagu,Frédéric Lapeyrie,Francis Martin Carrol and Tudzynski Eds. The Mycota, Vol V (Part A), Springer Verlag, 1997, Plant Relationships Chapitre d'ouvrage hal-02915354v1
Marqueurs moléculaires de la différenciation de l'ectomycorhize d'eucalyptus Denis Tagu,F. Martín La symbiose mycorhizienne. Etat des connaissances, Orbis Publishing, 1995, 2-9800545-7-7 Chapitre d'ouvrage hal-02851349v1
Ectomycorrhiza morphogenesis Denis Tagu,Francis Martin,Treena Burgess,Eugénie Carnero-Diaz,Pascal Laurentet al. Bonfante P.; Nuti M.; Stocchi V. Biotechnology of ectomycorrhizae, Molecular approaches, Plenum Press, 1995, 978-1-4615-1889-1 Chapitre d'ouvrage hal-02915317v1
Altered gene expression during ectomycorrhiza development F. Martín,Frédéric Lapeyrie,Denis Tagu The mycota: Plant relationships, Springer Verlag, 1994 Chapitre d'ouvrage hal-02845136v1
Ectomycorrhiza development: a molecular perspective F. Martín,Denis Tagu Mycorrhiza: function, molecular biology and biotechnology, Springer Verlag, 1994 Chapitre d'ouvrage hal-02845509v1
Regulation of the expression of developmental marrers genes in maize: Proline-rich protein genes. J.A. Martinez-Izguirdo,M. Menossi,M. Josè-Estanyol,Nathan Garcia,Denis Taguet al. Profiles on Biotechnology, Université de Santiago, Service des publications, 1992 Chapitre d'ouvrage hal-02849431v1

Pré-publication, Document de travail (6)

Identification of a viral gene essential for the genome replication of a domesticated endogenous virus in ichneumonid parasitoid wasps Ange Lorenzi,Fabrice Legeai,Véronique Jouan,Pierre-Alain Girard,Michael R Strandet al. 2024 Pré-publication, Document de travail hal-04558930v1
Diversité des profils d’activité des chercheurs INRAE Francoise Boudet-Bône,Denis Tagu,Denis Vile,Frederic Gaymard 2024 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03969772v2
MTG-Link: leveraging barcode information from linked-reads to assemble specific loci Anne Guichard,Fabrice Legeai,Denis Tagu,Claire Lemaitre 2022 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03886951v1
Functional insights from the GC-poor genomes of two aphid parasitoids, &lt;em&gt;Aphidius ervi&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;Lysiphlebus fabarum&lt;/em&gt; Alice B. Dennis,Gabriel I. Ballesteros,Stéphanie Robin,Lukas Schrader,Jens Bastet al. 2019 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02788571v1
Conserved and specific genomic features of endogenous polydnaviruses revealed by whole genome sequencing of two ichneumonid wasps Fabrice Legeai,Bernardo F. Santos,Stéphanie Robin,Anthony Bretaudeau,Rebecca B. Dikowet al. 2019 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02788577v1
A clonally reproducing generalist aphid pest colonises diverse host plants by rapid transcriptional plasticity of duplicated gene clusters Thomas Mathers,Yazhou Chen,Gemy Kaithakottil,Fabrice Legeai,Sam Mugfordet al. 2020 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02936181v1

Communication dans un congrès (30)

MTG-Link: filling gaps in draft genome assemblies with linked read data Anne Guichard,Fabrice Legeai,Denis Tagu,Claire Lemaitre JOBIM 2021 - Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2021, Paris, France. pp.1-8 Communication dans un congrès hal-03441914v1
Development of a robust CRISPR-Cas9 mutagenesis protocol in the pea aphid to knock out stylin-01 gene and study the role of Stylin-01 cuticular protein in Cauliflower mosaic virus transmission Gaël Le Trionnaire,Marilyne Uzest,Maelle Deshoux,Bastien Cayrol,Baptiste Monsionet al. UK-France joint meeting on Aphids, Royal Entomological Society. GBR. Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA), FRA., Apr 2019, Rothamsted, Harpenden, United Kingdom Communication dans un congrès hal-02154683v1
CRISPR-Cas9 chez Acyrthosiphon pisum pour valider le rôle de Stylin-01 dans la transmission du Cauliflower mosaic virus Marilyne Uzest,Gaël Le Trionnaire,Bastien Cayrol,Maelle Deshoux,Florence Gléonnecet al. 11. rencontres annuelles du réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes associés), Nov 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02785593v1
A robust and Efficient CRISPR-Cas9 mutagenesis protocol in the pea aphid Gaël Le Trionnaire,Denis Tagu,Amaury Herpin,Marilyne Uzest,Sylvie Tanguyet al. 11. European Congress of Entomology - ECE 2018, Jul 2018, Napoli, Italy. 334 p Communication dans un congrès hal-02733649v1
Integrative genomics and gene networks for studying phenotypic plasticity in the pea aphid Valentin Wucher,Fabrice Legeai,Lucas Bourneuf,Thomas Derrien,Aurore Gallotet al. 10th Arthropod Genomics Symposium, Jun 2017, Notre Dame, United States Communication dans un congrès hal-01566438v1
BIPAA/Askomics, a new and easy approach for querying genomics and epigenomics elements in interaction Fabrice Legeai,Charles Bettembourg,Anthony Bretaudeau,Yvanne Chaussin,Olivier Dameronet al. XXVth International Congress of Entomology 2016, Sep 2016, Orlando, Florida, United States Communication dans un congrès hal-01391080v1
CRISPR-Cas9 mutagenesis in the pea aphid Gaël Le Trionnaire,Sylvie Tanguy,Sylvie Hudaverdian,Florence Gléonnec,Gautier Richardet al. 9. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France Communication dans un congrès hal-02794226v1
Using genomic tools to unravel parasitic wasp genome evolution via acquisition of viral genomes Anne-Nathalie Volkoff,Jean-Michel Drezen,Serge Urbach,Apolline Pichon,Véronique Jouanet al. Arthropod Genomics Symposium, 2015, Manhattan, Kansas, United States Communication dans un congrès hal-01991470v1
Integration of miRNAs data into a gene network of the pea aphid. Valentin Wucher,Jacques Nicolas,Fabrice F. Legeai,Hervé Seitz,Denis Tagu 7th International Symposium on Molecular Insect Science., 2014, Amsterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-01566284v1
Long non-­‐coding RNA in the pea aphid; identification and comparative expression in sexual and asexual embryos Fabrice Legeai,Thomas Derrien,Valentin Wucher,David Audrey,Gaël Le Trionnaireet al. Arthropod Genomics Symposium, Jun 2014, Urbana, United States Communication dans un congrès hal-01091304v1
The grape phylloxera genome sequencing project François Delmotte,Daciana Papura,Claude Rispe,Fabrice Legeai,Julie Jaquiéryet al. 6. International Phylloxera Symposium, Aug 2013, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-01208725v1
A study of phylloxera transcriptomes, comparing root and leaf feeding morphs Claude Rispe,Daciana Papura,Fabrice Legeai,Julie Jaquiéry,Anthony Bretaudeauet al. 6. International Phylloxera Symposium, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne (1287)., Aug 2013, Bordeaux, France. 59 p Communication dans un congrès hal-01208647v1
The genome project of grape phylloxera François Delmotte,A. Forneck,K.S. Powell,Claude Rispe,Denis Tagu 6. International Phylloxera Symposium, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne (1287)., Aug 2013, Bordeaux, France. 59 p Communication dans un congrès hal-01208646v1
Identification de cibles d’insecticides spécifiques du puceron du pois &lt;em&gt;Acyrthosiphon pisum&lt;/em&gt; par analyse des relations structure-fonction des récepteurs nicotiniques Emiliane Taillebois,Claude Charvet,Romulo Araoz,César Mattei,Hélène Rogniauxet al. Journées d'animation scientifique de la FéRI 2013, Jul 2013, Tours, France Communication dans un congrès hal-02804514v1
Edge Selection in a Noisy Graph by Concept Analysis: Application to a Genomic Network Valentin Wucher,Denis Tagu,Jacques Nicolas ECDA - European Conference on Data Analysis - 2013, Jul 2013, Luxembourg, Luxembourg Communication dans un congrès hal-00924413v1
Identification de cibles d’insecticides spécifiques du puceron du pois Acyrthosiphon piusm par analyse des relations structure-fonction des récepteurs nicotiniques Emiliane Taillebois,Claude L. Charvet,Romulo Araoz,César Mattei,Hélène Rogniauxet al. Journées d’animation scientifique de la FéRI, 2013, Parcay Meslay, France Communication dans un congrès hal-03405671v1
Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides Yvan Rahbé,Denis Tagu,Guy Condemine,E Guiderdoni,Federica Calevroet al. ANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France Communication dans un congrès hal-03506701v1
Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides Yvan Rahbé,Denis Tagu,Guy Condemine,Emmanuel Guiderdoni,Federica Calevroet al. Genoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos Communication dans un congrès hal-02824684v1
Prediction and analyzes of non coding RNA sequences in the pea aphid genome Fabrice Legeai,Guillaume Rizk,T. Walsh,Owain Edwards,Jacques Nicolaset al. Arthropods Genomics, Jun 2010, Kansas City, United States Communication dans un congrès inria-00537927v1
Genes regulated in early embryogenesis during the switch from parthenogenetic to sexual reproduction in the pea aphid (Acyrthosiphon pisum) Aurore Gallot,Grégory Guernec,Stefano Colella,Hubert Charles,Stéphanie Jaubert-Possamaiet al. 4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Kansas State University. Center for Genomic Studies on Arthropods Affecting Human, Animal & Plant Health, Manhattan, USA., Jun 2010, Kansas City, United States Communication dans un congrès hal-02755037v1
Transcriptomic analysis of intestinal genes following acquisition of pea enation mosaic virus by the pea aphid Acyrthosiphon pisum Catherine Reinbold,Sylvie Tanguy,Denis Tagu,Véronique Brault,. Société Entomologique de Franceet al. 16. Colloque de Biologie de l'Insecte, Oct 2010, France. 1 p Communication dans un congrès hal-02818371v1
GnpAnnot community annotation system: features, qualifiers, values Stéphanie Sidibe-Bocs,Fabrice Legeai,Gaëtan Droc,Mathieu Rouard,Michael M. Alauxet al. 3. International Biocuration Conference, Apr 2009, Berlin, Germany Communication dans un congrès hal-02758372v1
From AphidBase and Lepido-DB to an Information System for Insect Plant pest genomics studies. Fabrice Legeai,Jean-Pierre Gauthier,François Cousserans,Emmanuelle d'Alençon,Olivier Collinet al. 1st Workshop on Information System for Insect Pest, Nov 2009, Rennes, France Communication dans un congrès inria-00435823v1
Apollo: a tool for the manual annotation of the pea aphid genome Fabrice Legeai,Jean-Pierre Gauthier,Denis Tagu Pea Aphid Genome Annotation Workshop, Jul 2008, Princeton, United States Communication dans un congrès inria-00329196v1
Of lice and plants: metabolite flows in the trophic pathway of phloem feeding insects as analysed through genomic and EST data from the aphid symbiosis Yvan Rahbé,Federica Calevro,H. Charles,G. Febvay,Denis Tagu Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S233 Communication dans un congrès hal-00391503v1
Effets interactifs de la mycorhization et de la sécheresse sur la conductance hydraulique racinaire du pin maritime Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot,François Bartoli,Denis Tagu Réunion Groupe de travail "Xylème-Eau-Croissance": "Flux d'eau dans la plante", Mar 2002, Lusignan, France. 18 diapositives Communication dans un congrès hal-02832162v1
Hydrophobins in ectomycorrhizal symbiosis: hypothesis Denis Tagu,I. Kottke,F. Martín 2. International Congress of Symbiosis, Apr 1997, Woods Hole, United States Communication dans un congrès hal-02839620v1
Molecular analysis of ectomycorrhiza differentiation Denis Tagu,P. Simoneau,F. Martin Eurosilva, Nov 1994, Dourdan, France Communication dans un congrès hal-02772613v1
Ectomycorrhiza morphogenesis. Insights from studies of developmentally regulated genes and proteins F. Martin,T. Burgess,M.E. Carnero Diaz,Déborah de Carvalho,P. Laurentet al. International symposium, Nov 1994, Urbino, Italy Communication dans un congrès hal-02776081v1
Caractérisation d'ADNc dont l'expression est régulée lors du développement de l'ectomycorhize d'Eucalyptus Denis Tagu,F. Martín Journée d'Etude Mycorhizes, Nov 1993, Paris, France Communication dans un congrès hal-02844047v1

Autre publication scientifique (4)

CSS Livret-Guide 2020-2024 Denis Tagu 2023, pp.38 Autre publication scientifique hal-04097315v1
CSS Guide Book 2020-2024 Denis Tagu 2023 Autre publication scientifique hal-04202855v1
Viruses of bacteria: phages evolution across phylum boundaries Denis Tagu 2021, pp.100003. ⟨10.24072/pci.genomics.100003⟩ Autre publication scientifique hal-03190249v1
Proposal to sequence the genome of the grape phylloxera François F. Delmotte,Astrid Forneck,Kevin Powell,Claude Rispe,Denis Tagu 2011, 10 p Autre publication scientifique hal-02809068v1

Rapport (1)

Pratiques intègres de publication scientifique à l’heure de la science ouverte. Note de recommandations Sabine Arbeille,Denis Bourguet,Regina Dashkina,Philippe Delcros,Erwin Dreyeret al. INRAE. 2025, 12 pp Rapport hal-04964196v1