Elisa Michel

Identifiants chercheurs

IdHAL :

elisa-michel

ORCID :

0000-0003-4888-0732

Présentation

Chargée de recherche à INRAE depuis octobre 2023, j'étudie les évolutions, les sélections, les flux et les rôles des communautés microbiennes des filières fromagères, en lien avec des pratiques agricoles et environnementales durables et raisonnées, garantie d’une sécurité sanitaire le long des filières.

#flux microbiens #omics #durabilité des systèmes #systèmes agri/agroalimentaire fromagers #sécurité sanitaire

Publications

Article dans une revue (7)

ADAMOS - Un nouveau regard sur les écosystèmes microbiens laitiers et fromagers apporté par les méthodes omiques Christophe Monnet,Eric Dugat-Bony,Céline Delbès,Cresciense Lecaudé,Yvette Boutonet al. Innovations Agronomiques, 2025, 107, pp.342-356. ⟨10.17180/ciag-2025-vol107-art25⟩ Article dans une revue hal-05391519v1
Microbial community transfers across a pilot ripening cellar are increased by cheese wiping Reshad Fantelli,Patricia Battais,Sébastien Theil,Elisa Michel,Mathilde Lacalmontieet al. Food Microbiology, 2025, 136, pp.105006. ⟨10.1016/j.fm.2025.105006⟩ Article dans une revue hal-05455609v1
Comparison of metabarcoding taxonomic markers to describe fungal communities in fermented foods Olivier Rué,Monika Coton,Eric Dugat-Bony,Kate Howell,Françoise Irlingeret al. Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e97. ⟨10.24072/pcjournal.321⟩ Article dans une revue hal-04234976v1
Artisanal and farmer bread making practices differently shape fungal species community composition in French sourdoughs Elisa Michel,Estelle Masson,Sandrine Bubbendorf,Léocadie Lapicque,Thibault Nideletet al. Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e11. ⟨10.24072/pcjournal.237⟩ Article dans une revue hal-04206586v1
Microbial community dispersal from wheat grains to sourdoughs : a contribution of participatory research Lucas von Gastrow,Elisa Michel,Judith Legrand,Rémy Amelot,Diego Segondet al. Molecular Ecology, 2023, 32 (10), pp.2413-2427. ⟨10.1111/mec.16630⟩ Article dans une revue hal-03741463v2
Survival and electrotransformation of Pseudomonas syringae strains under simulated cloud-like conditions. Laurine S Blanchard,Anaïs Monin,Hounaïda Ouertani,Lamia Touaibia,Elisa Michelet al. FEMS Microbiology Ecology, 2017, 93 (5), pp.fix057. ⟨10.1093/femsec/fix057⟩ Article dans une revue hal-01608828v1
Characterization of relative abundance of lactic acid bacteria species in French organic sourdough by cultural, qPCR and MiSeq high-throughput sequencing methods Elisa Michel,Clarisse Monfort,Marion Deffrasnes,Stéphane Guezenec,Emilie Lhommeet al. International Journal of Food Microbiology, 2016, 239, pp.35-43. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2016.07.034⟩ Article dans une revue hal-01527569v1

Communication dans un congrès (15)

Microbial transfers of traditional Saint-Nectaire PDO cheeses during cheese wiping under controlled conditions highlighted by omics method Reshad Fantelli,Patricia Battais,Sébastien Theil,Elisa Michel,Mathilde Lacalmontieet al. Congrès National de la SFM, Société Française de Microbiologie (SFM), Sep 2025, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-05536163v1
Combiner des données omics : exemple sur une étude sur l’amertume des fromages « Bleus d’Auvergne » Elisa Michel,Sébastien Theil Animation Scientifique UMRF, UMRF, Dec 2024, Aurillac, France Communication dans un congrès hal-04873846v1
Domestication of microbial communities for bread making: insights from a participatory research project Elisa Michel,Judith Legrand,Estelle Masson,Sandrine Bubendorff,Stephane Guezenecet al. The 2019 Congress of the European Society for Evolutionary Biology, ESEB, Aug 2019, Turku, Finland Communication dans un congrès hal-02950758v1
Baker’s bread-making practices and house microbiota shape fungal species diversity in french sourdoughs Delphine Sicard,Elisa Michel,Judith Legrand,Estelle Masson,Sandrine Bubendorffet al. Harlan III, Jun 2019, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02950822v1
Sourdough bread diversity: Which drivers? Participative research from seeds to bread. Elisa Michel,Delphine Sicard European Diversity Cereal festival : Second CERERE EU Event, Cerere network, Jun 2019, Kalø, Denmark Communication dans un congrès hal-02950604v1
Domestication of microbial community in action : a participatory research and multidisciplinary study of sourdough bread Elisa Michel,Maria Belen Carbonetto,Charlotte Urien,Emilie Lhomme,Stephane Guezenecet al. Second Joint Congress on Evolutionary Biology (EVOLUTION 2018), Aug 2018, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02008729v1
Représentations sociales, pratiques et biodiversité : du souci de l’environnemental à la biodiversité microbienne. Estelle Masson,Elisa Michel,Sandrine Bubendorff,Delphine Sicard 14. International Conference on Social Representations, Aug 2018, Buenos Aires, Argentine Communication dans un congrès hal-02006839v1
La diversité des levains français Elisa Michel,Delphine Sicard La Biodiversité cultivée du champ à l'assiette, GABB 49, Jul 2017, Bouchemaine, France Communication dans un congrès hal-04599371v1
Ecology and domestication of yeasts in wine and bread ecosystems Delphine Sicard,Elisa Michel,Thibault Nidelet,Lucie Farrera,Jean-Luc Legraset al. MicrobiOccitanie 2017 - 1. Rencontre des Microbiologistes Région Occitanie, Apr 2017, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-01605558v1
Effects of terroir, wheat varieties and breadmaking practices on the microbial diversity of leaven and the quality of the bread Delphine Sicard,Elisa Michel Let's Cultivate Diversity 2017, Jun 2017, Virton, Belgique Communication dans un congrès hal-01606258v1
Les micro-organismes : définition, diversité et rôle dans notre alimentation Delphine Sicard,Elisa Michel,Amandine Deroite,Sandrine Mallet Terres d'Octobre-Faite le plein d’idées durables, Oct 2016, Maison départementale de l'environnement, Restinclière, France Communication dans un congrès hal-01602307v1
Diversité des ferments, des blés, des farines de blé tendre en panification Elisa Michel,Delphine Sicard Blé dur un jour, blé dur toujours, Institut Agro Montpellier, 2016, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04599400v1
Wheat sourdoughs: a new model to link ecology and evolution Belen Carbonetto,Elisa Michel,Yoann Robert,Johan Ramsayer,Charlotte Urienet al. EMBO conference New Model Systems for Linking Evolution and Ecology, May 2016, Heidelberg, Germany Communication dans un congrès hal-01606190v1
Le levain, un microbiote riche de diversité Delphine Sicard,Elisa Michel Pain au levain, entre tradition et modernité, Nov 2016, Paris, France Communication dans un congrès hal-01602303v1
Diversité des terroirs, des blés, des levures, des bactéries, des pratiques boulangères: quel impact sur la saveur et la qualité nutritionnelle du pain ? Delphine Sicard,Elisa Michel,Amandine Deroite,Sandrine Mallet Terres d'Octobre-Faite le plein d’idées durables., Oct 2016, Maison départementale de l'environnement, Restinclière, France Communication dans un congrès hal-01602306v1

Poster de conférence (12)

A database to predict safety risks of raw milk cheeses from farming practices in climate change context Elisa Michel,Marie Bourlioux,Christophe Poix,Paul-Marie Grollemund,Sébastien Theilet al. JOBIM 2025, Jul 2025, Bordeaux, France Poster de conférence hal-05169800v1
Microbial transfers in dairy systems under changing climate and farming practices Sébastien Theil,Mahendra Mariadassou,Philippe Ruiz,Guillaume Kon Kam King,Matthieu Bouchonet al. JOBIM 20025, Jul 2025, Bordeaux, France Poster de conférence hal-05168268v1
Microbial transfers in dairy systems under changing climate and farming practices Sébastien Theil,Mahendra Mariadassou,Philippe Ruiz,Guillaume Kon Kam King,Matthieu Bouchonet al. FROGS Days, Dec 2025, Toulouse, France Poster de conférence hal-05462857v1
A multiomic microbiome approach to decipher drivers of bitterness in French blue-veined PDO Bleu d’Auvergne cheeses Elisa Michel,Sébastien Theil,Bastien Imler,Pauline Gerber,Blandine Polturatet al. IDF Cheese Science & Technology Symposium 2024, Jun 2024, Bergen (NO), Norway Poster de conférence hal-04601131v1
Testing markers to characterize microbial communities in food ecosystems using a metagenomics approach Claire Vincent,Serge Casaregola,Monika Coton,Céline Delbès,Hugo Devillerset al. JOBIM, Jun 2020, Montpellier, France Poster de conférence hal-02914960v1
Role of agronomic and bread-making practices in sourdough microbial diversity and bread nutritional and organoleptic properties Elisa Michel,Stephane Guezenec,Judith Legrand,Isabelle Goldringer,Simon Rousselotet al. 7. international symposium on sourdough, Jul 2018, Cork, Ireland. 2018 Poster de conférence hal-02154390v1
Terroir, baker’s practices, wheat varieties and their influence on sourdough microbial diversity Elisa Michel,Héloise Debroise,Marion Deffrasnes,Stéphane Guezenec,Judith Legrandet al. Colloque du métaprogramme Méta-omiques et écosystèmes microbiens (MEM), Jan 2017, Paris, France Poster de conférence hal-04599898v1
Impact of baker’s practices, terroir and wheat varieties on sourdough microbial taxonomic and functional diversity Elisa Michel,Héloise Debroise,Marion Deffrasnes,Isabelle Hue,Stephane Guezenecet al. 4. International Conference on Microbial Diversity 2017, Oct 2017, Bari, Italy. , 2017 Poster de conférence hal-02154391v1
Importanza dei micro-organismi nel sistema alimentare Elisa Michel,Delphine Sicard,Estelle Serpolay-Besson Coltiviamo la diversità, Jun 2017, Peccioli, France Poster de conférence hal-04599326v1
Analyses Physico-Chimiques et microbiologiques de 30 levains naturels et pains français Elisa Michel,Marion Deffrasnes,Stéphane Guezenec,Xavier Dousset,Delphine Sicardet al. Séminaire Projet BAKERY, 2016, Broué, France Poster de conférence hal-04599856v1
Diversité des bactéries lactiques dans les levains naturels français Elisa Michel,Marion Deffrasnes,Emilie Lhomme,Marie Noëlle Madec,Florence Valenceet al. Séminaire Projet BAKERY, 2016, Broué, France Poster de conférence hal-04599847v1
Diversité des espèces de levures dans les levains naturels français Elisa Michel,Charlotte Urien,Stéphane Guezenec,Delphine Sicard Séminaire Projet BAKERY, 2016, Broué, France Poster de conférence hal-04599853v1

Ouvrages (2)

Du Blé au Pain, impact des levains en panification biologique Bernard Onno,Philippe Roussel,Elisa Michel,Delphine Sicard Editions Universitaires Européennes, 2021, Du Blé au Pain, impact des levains en panification biologique, 978-620-2-55127-4 Ouvrages hal-03345315v1
La panification au levain naturel. Glossaire des savoirs Philippe Roussel,Bernard Onno,Elisa Michel,Delphine Sicard Éditions Quae, pp.100, 2020, 978-2-7592-3166-9 Ouvrages hal-02965827v1

Thèse (1)

Dispersion, sélection et rôle des espèces microbiennes des levains en boulangerie française à faible intrant Elisa Michel Ingénierie des aliments. Montpellier SupAgro, 2018. Français. ⟨NNT : 2018NSAM0037⟩ Thèse tel-04355700v2

Vidéo (1)

Projet Bakery : ferments d’innovation en boulangerie française Elisa Michel,Delphine Sicard,Delphine Sicard 2018 Vidéo hal-04599427v1