Elise Prieur-Gaston

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Affiliations actuelles
  • Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé (LITIS - TIBS)
  • Laboratoire d'Informatique, du Traitement de l'Information et des Systèmes (LITIS)
  • Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Identifiants chercheurs

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Publications

UMI-VarCal: a new UMI-based variant caller that efficiently improves low-frequency variant detection in paired-end sequencing NGS libraries

Vincent Sater , Pierre-Julien Viailly , Thierry Lecroq , Élise Prieur-Gaston , Elodie Bohers et al.

Bioinformatics, 2020, 36 (9), pp.2718-2724. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa053⟩

Article dans une revue hal-02468271v1

Fast practical online exact single and multiple pattern matching algorithms in highly similar sequences

Nadia Ben Nsira , Thierry Lecroq , Élise Prieur Gaston

International Journal of Data Mining and Bioinformatics, 2019, 22 (1), pp.1. ⟨10.1504/IJDMB.2019.099285⟩

Article dans une revue hal-02113316v1

A survey of string orderings and their application to the Burrows–Wheeler transform

Jacqueline Daykin , Richard Groult , Yannick Guesnet , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre et al.

Theoretical Computer Science, 2018, 710, pp.52 - 65. ⟨10.1016/j.tcs.2017.02.021⟩

Article dans une revue hal-01894859v1

A note on easy and efficient computation of full abelian periods of a word

Gabriele Fici , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre , Elise Prieur-Gaston , William F. Smyth

Discrete Applied Mathematics, 2016, 212, pp.88 - 95. ⟨10.1016/j.dam.2015.09.024⟩

Article dans une revue hal-01894875v1

Abelian powers and repetitions in Sturmian words

Gabriele Fici , Alessio Langiu , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre , Filippo Mignosi et al.

Theoretical Computer Science, 2016, 635, pp.16 - 34. ⟨10.1016/j.tcs.2016.04.039⟩

Article dans une revue hal-01894873v1

Binary block order Rouen transform

J. W. Daykin , Richard Groult , Guesnet Yannick , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre et al.

Theoretical Computer Science, 2016, ⟨10.1016/j.tcs.2016.05.028⟩

Article dans une revue hal-01323759v1

Fast computation of abelian runs

Gabriele Fici , Tomasz Kociumaka , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre , Elise Prieur-Gaston

Theoretical Computer Science, 2016, 656, pp.256-264. ⟨10.1016/j.tcs.2015.12.010⟩

Article dans une revue hal-01956124v1
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Combining MEDLINE and publisher data to create parallel corpora for the automatic translation of biomedical text

Antonio Jimeno Yepes , Elise Prieur-Gaston , Aurelie Neveol

BMC Bioinformatics, 2013, 14 (1), pp.146. ⟨10.1186/1471-2105-14-146⟩

Article dans une revue hal-01916051v1
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Matching health information seekers' queries to medical terms

Lina F Soualmia , Elise Prieur-Gaston , Zied Moalla , Thierry Lecroq , Stéfan J Darmoni

BMC Bioinformatics, 2012, 13 Suppl 14, pp.S11. ⟨10.1186/1471-2105-13-S14-S11⟩

Article dans une revue hal-00845358v1
Deposit thumbnail

EVA: Exome Variation Analyzer, an efficient and versatile tool for filtering strategies in medical genomics

Sophie Coutant , Chloé Cabot , Arnaud Lefebvre , Martine Léonard , Elise Prieur-Gaston et al.

BMC Bioinformatics, 2012, 13 (Suppl 14), pp.S9

Article dans une revue inserm-00730215v1

Multiplions et divisons avec des bâtons : Les réglettes de Genaille et Lucas.

Benoist Gaston , Richard Groult , Arnaud Lefebvre , Martine Léonard , Elise Prieur-Gaston

Le Bulletin Vert = Bulletin de l'APMEP, 2010, 488, p. 339-348

Article dans une revue hal-00488540v1

Counting distinct palindromes in a word in linear time

Richard Groult , Elise Prieur-Gaston , Gwenaël Richomme

Information Processing Letters, 2010, 110, pp.908-912. ⟨10.1016/j.ipl.2010.07.018⟩

Article dans une revue istex hal-00507481v1

Identification de répétitions dans les navigations au sein d'un catalogue de santé

Alexandre Pauchet , Mohamad El-Abed , Tayeb Merabti , Élise Prieur , Thierry Lecroq et al.

Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série RIA : Revue d'Intelligence Artificielle, 2009, 23 (1), pp.113-132

Article dans une revue hal-00450114v1

On-line construction of compact suffix vectors and maximal repeats

Elise Prieur , Thierry Lecroq

Theoretical Computer Science, 2008, 407 (1-3), pp.290-301

Article dans une revue hal-00469299v1

From Suffix Trees to Suffix Vectors

Elise Prieur , Thierry Lecroq

International Journal of Foundations of Computer Science, 2006, 17 (6), pp.1385-1402

Article dans une revue hal-00469409v1

Three Strategies for the Dead-Zone String Matching Algorithm

Jacqueline W. Daykin , Richard Groult , Yannick Guesnet , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre et al.

Proceedings of the Prague Stringology Conference 2018, Aug 2017, Prague, Czech Republic. pp.117--128

Communication dans un congrès hal-01956358v1

Practical fast on-line exact pattern matching algorithms for highly similar sequences

Nadia Ben Nsira , Thierry Lecroq , Élise Prieur-Gaston

Proceedings of the IEEE BIBM 2018 Workshop on Data Mining from Genomic Variants and Its Application to Genome-wide Analysis, Dec 2018, Madrid, Spain. pp.1772--1777, ⟨10.1109/BIBM.2018.8621319⟩

Communication dans un congrès hal-01956537v1

Online Computation of Abelian Runs

Gabriele Fici , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre , Elise Prieur-Gaston

LATA, Feb 2015, Nice, France. pp.391-401

Communication dans un congrès hal-01955960v1

Computing abelian periods in words

Gabriele Fici , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre , Elise Prieur-Gaston

London Stringology Days/London Algorithmic Workshop 2011, 2011, Londres, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-00569139v1

Computing Abelian Periods in Words

Gabriele Fici , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre , Elise Prieur-Gaston

Prague Stringology Conference, 2011, Prague, Czech Republic. pp.184-196

Communication dans un congrès hal-00627216v1

Computing Abelian Periods in Words

Gabriele Fici , Thierry Lecroq , Arnaud Lefebvre , Elise Prieur-Gaston

SeqBi11 - Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, 2011, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-00560414v1

Counting different palindromes in a word in linear time

Richard Groult , Elise Prieur , Gwenaël Richomme

Journées GdT COMATEGE du GDR IM, 2010, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-00516721v1

Multiple terminologies in an health portal: automatic indexing and information retrieval

Stéfan Darmoni , Suzanne Pereira , Saoussen Sakji , Tayeb Merabti , Elise Prieur et al.

Artificial Intelligence in Medicine, 2009, Italy. pp.255-259, ⟨10.1007/978-3-642-02976-9_37⟩

Communication dans un congrès istex hal-00482844v1

Recherche d'information multi-terminologique en contexte : Etude préliminaire

Ahmed Diouf Dirieh Dibad , Saoussen Sakji , Elise Prieur , Suzanne Pereira , Michel Joubert et al.

JFIM, 2009, France. pp.101-112

Communication dans un congrès hal-00483040v1

On-line construction of compact suffix vectors and maximal repeats

Elise Prieur , Thierry Lecroq

Journées montoises, 2006, Rennes, France. pp.311-322

Communication dans un congrès hal-00469601v1