Elise Prieur-Gaston

Identifiants chercheurs

IdHAL :

elise-prieur-gaston

ORCID :

0009-0005-2318-365X

IdRef :

123340373

Publications

Article dans une revue (15)

UMI-VarCal: a new UMI-based variant caller that efficiently improves low-frequency variant detection in paired-end sequencing NGS libraries Vincent Sater,Pierre-Julien Viailly,Thierry Lecroq,Élise Prieur-Gaston,Elodie Boherset al. Bioinformatics, 2020, 36 (9), pp.2718-2724. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa053⟩ Article dans une revue hal-02468271v1
Fast practical online exact single and multiple pattern matching algorithms in highly similar sequences Nadia Ben Nsira,Thierry Lecroq,Élise Prieur Gaston International Journal of Data Mining and Bioinformatics, 2019, 22 (1), pp.1. ⟨10.1504/IJDMB.2019.099285⟩ Article dans une revue hal-02113316v1
A survey of string orderings and their application to the Burrows–Wheeler transform Jacqueline Daykin,Richard Groult,Yannick Guesnet,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvreet al. Theoretical Computer Science, 2018, 710, pp.52 - 65. ⟨10.1016/j.tcs.2017.02.021⟩ Article dans une revue hal-01894859v1
A note on easy and efficient computation of full abelian periods of a word Gabriele Fici,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston,William F. Smyth Discrete Applied Mathematics, 2016, 212, pp.88 - 95. ⟨10.1016/j.dam.2015.09.024⟩ Article dans une revue hal-01894875v1
Abelian powers and repetitions in Sturmian words Gabriele Fici,Alessio Langiu,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Filippo Mignosiet al. Theoretical Computer Science, 2016, 635, pp.16 - 34. ⟨10.1016/j.tcs.2016.04.039⟩ Article dans une revue hal-01894873v1
Binary block order Rouen transform J. W. Daykin,Richard Groult,Guesnet Yannick,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvreet al. Theoretical Computer Science, 2016, ⟨10.1016/j.tcs.2016.05.028⟩ Article dans une revue hal-01323759v1
Fast computation of abelian runs Gabriele Fici,Tomasz Kociumaka,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston Theoretical Computer Science, 2016, 656, pp.256-264. ⟨10.1016/j.tcs.2015.12.010⟩ Article dans une revue hal-01956124v1
Combining MEDLINE and publisher data to create parallel corpora for the automatic translation of biomedical text Antonio Jimeno Yepes,Elise Prieur-Gaston,Aurelie Neveol BMC Bioinformatics, 2013, 14 (1), pp.146. ⟨10.1186/1471-2105-14-146⟩ Article dans une revue hal-01916051v1
Matching health information seekers' queries to medical terms Lina F Soualmia,Elise Prieur-Gaston,Zied Moalla,Thierry Lecroq,Stéfan J Darmoni BMC Bioinformatics, 2012, 13 Suppl 14, pp.S11. ⟨10.1186/1471-2105-13-S14-S11⟩ Article dans une revue hal-00845358v1
EVA: Exome Variation Analyzer, an efficient and versatile tool for filtering strategies in medical genomics Sophie Coutant,Chloé Cabot,Arnaud Lefebvre,Martine Léonard,Elise Prieur-Gastonet al. BMC Bioinformatics, 2012, 13 (Suppl 14), pp.S9 Article dans une revue inserm-00730215v1
Multiplions et divisons avec des bâtons : Les réglettes de Genaille et Lucas. Benoist Gaston,Richard Groult,Arnaud Lefebvre,Martine Léonard,Elise Prieur-Gaston Le Bulletin Vert = Bulletin de l'APMEP, 2010, 488, p. 339-348 Article dans une revue hal-00488540v1
Counting distinct palindromes in a word in linear time Richard Groult,Elise Prieur-Gaston,Gwenaël Richomme Information Processing Letters, 2010, 110, pp.908-912. ⟨10.1016/j.ipl.2010.07.018⟩ Article dans une revue istex hal-00507481v1
Identification de répétitions dans les navigations au sein d'un catalogue de santé Alexandre Pauchet,Mohamad El-Abed,Tayeb Merabti,Élise Prieur,Thierry Lecroqet al. Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série RIA : Revue d'Intelligence Artificielle, 2009, 23 (1), pp.113-132 Article dans une revue hal-00450114v1
On-line construction of compact suffix vectors and maximal repeats Elise Prieur,Thierry Lecroq Theoretical Computer Science, 2008, 407 (1-3), pp.290-301 Article dans une revue hal-00469299v1
From Suffix Trees to Suffix Vectors Elise Prieur,Thierry Lecroq International Journal of Foundations of Computer Science, 2006, 17 (6), pp.1385-1402 Article dans une revue hal-00469409v1

Communication dans un congrès (10)

Three Strategies for the Dead-Zone String Matching Algorithm Jacqueline W. Daykin,Richard Groult,Yannick Guesnet,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvreet al. Proceedings of the Prague Stringology Conference 2018, Aug 2017, Prague, Czech Republic. pp.117--128 Communication dans un congrès hal-01956358v1
Practical fast on-line exact pattern matching algorithms for highly similar sequences Nadia Ben Nsira,Thierry Lecroq,Élise Prieur-Gaston Proceedings of the IEEE BIBM 2018 Workshop on Data Mining from Genomic Variants and Its Application to Genome-wide Analysis, Dec 2018, Madrid, Spain. pp.1772--1777, ⟨10.1109/BIBM.2018.8621319⟩ Communication dans un congrès hal-01956537v1
Online Computation of Abelian Runs Gabriele Fici,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston LATA, Feb 2015, Nice, France. pp.391-401 Communication dans un congrès hal-01955960v1
Computing Abelian Periods in Words Gabriele Fici,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston Prague Stringology Conference, 2011, Prague, Czech Republic. pp.184-196 Communication dans un congrès hal-00627216v1
Computing abelian periods in words Gabriele Fici,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston London Stringology Days/London Algorithmic Workshop 2011, 2011, Londres, United Kingdom Communication dans un congrès hal-00569139v1
Computing Abelian Periods in Words Gabriele Fici,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston SeqBi11 - Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, 2011, Rennes, France Communication dans un congrès hal-00560414v1
Counting different palindromes in a word in linear time Richard Groult,Elise Prieur,Gwenaël Richomme Journées GdT COMATEGE du GDR IM, 2010, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-00516721v1
Multiple terminologies in an health portal: automatic indexing and information retrieval Stéfan Darmoni,Suzanne Pereira,Saoussen Sakji,Tayeb Merabti,Elise Prieuret al. Artificial Intelligence in Medicine, 2009, Italy. pp.255-259, ⟨10.1007/978-3-642-02976-9_37⟩ Communication dans un congrès istex hal-00482844v1
Recherche d'information multi-terminologique en contexte : Etude préliminaire Ahmed Diouf Dirieh Dibad,Saoussen Sakji,Elise Prieur,Suzanne Pereira,Michel Joubertet al. JFIM, 2009, France. pp.101-112 Communication dans un congrès hal-00483040v1
On-line construction of compact suffix vectors and maximal repeats Elise Prieur,Thierry Lecroq Journées montoises, 2006, Rennes, France. pp.311-322 Communication dans un congrès hal-00469601v1

Pré-publication, Document de travail (4)

A Note on Easy and Efficient Computation of Full Abelian Periods of a Word Gabriele Fici,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston,William F. Smyth 2018 Pré-publication, Document de travail hal-01956126v1
Efficient pattern matching in degenerate strings with the Burrows-Wheeler transform Jacqueline W. Daykin,Richard Groult,Yannick Guesnet,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvreet al. 2018 Pré-publication, Document de travail hal-01956003v1
Abelian Powers and Repetitions in Sturmian Words Gabriele Fici,Alessio Langiu,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Filippo Mignosiet al. 2018 Pré-publication, Document de travail hal-01956122v1
Online Computation of Abelian Runs Gabriele Fici,Thierry Lecroq,Arnaud Lefebvre,Elise Prieur-Gaston 2015 Pré-publication, Document de travail hal-01956121v1