Elise Billoir

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	A new chronic larval bioassay using the wild marine shrimp Palaemon serratus, integrating inter-female variability and non-monotonic dose-responses Jason Jeanne , Benoit Xuereb , Marie-Laure Delignette-Muller , Elise Billoir , Aurélie Siberchicot et al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2026, 322, ⟨10.1016/j.ecoenv.2026.120489⟩ Article dans une revue hal-05710914v1
	Effects of dibutyl phthalate (DBP) on life history traits and population dynamics of Daphnia magna: comparison of two exposure regimes Jérémie Ohanessian , Sophie Martine Prud’homme , Ellis Franklin , Géraldine Kitzinger , Catherine Lorgeoux et al. Peer Community Journal, 2025, 5, pp.e85. ⟨10.24072/pcjournal.586⟩ Article dans une revue hal-05360573v1
	Transcriptomics highlights dose-dependent response of poplar to a phenanthrene contamination Lilian Gréau , Damien Blaudez , Marie Le Jean , Nicolas Gallois , Christine Paysant-Le-Roux et al. Environmental Science and Pollution Research, 2025, 32 (8), pp.4794-4812. ⟨10.1007/s11356-025-36002-5⟩ Article dans une revue hal-05029675v1
	How macrophytes can improve the ecological assessment of rivers in a multiple-pressure context: development of a new diagnostic tool Thibault Leboucher , Jérémy Bacon , Christian Chauvin , Elise Billoir , Maud Pierre et al. Water Research, 2025, 286, pp.124173. ⟨10.1016/j.watres.2025.124173⟩ Article dans une revue hal-05184203v1
	Cluefish: mining the dark matter of transcriptional data series with over-representation analysis enhanced by aggregated biological prior knowledge Ellis Franklin , Elise Billoir , Philippe Veber , Jérémie Ohanessian , Marie Laure Delignette-Muller et al. NAR Genomics and Bioinformatics, 2025, 7 (3), pp.lqaf103. ⟨10.1093/nargab/lqaf103⟩ Article dans une revue hal-05282545v1
	Individual and combined effects of design and inter-operator variability on stream ecological assessment Albin Meyer , Elise Billoir , Virginie Archaimbault , Cédric P Mondy , Philippe Usseglio-Polatera Science of the Total Environment, 2025, 974, pp.179218. ⟨10.1016/j.scitotenv.2025.179218⟩ Article dans une revue hal-05011887v1
	Effects of water nutrient concentrations on stream macroinvertebrate community stoichiometry: a large-scale study Miriam Beck , Elise Billoir , Philippe Usseglio-Polatera , Albin Meyer , Edwige Gautreau et al. Peer Community Journal, 2024, 4, pp.e69. ⟨10.24072/pcjournal.441⟩ Article dans une revue hal-04782453v1
	A toxicokinetic–toxicodynamic model with a transgenerational damage to explain toxicity changes over generations (in Daphnia magna exposed to depleted uranium) Frédéric Alonzo , Marie Trijau , Delphine Plaire , Elise Billoir Science of the Total Environment, 2024, 914, pp.169845. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.169845⟩ Article dans une revue hal-04394911v1
	Disentangling the effects of microalgal diversity and thermal history on freshwater phototrophic biofilms facing heat stress: A thermal dose approach Camille Courcoul , Martin Laviale , Vincent Baillard , Elise Billoir , Joséphine Leflaive et al. Journal of Ecology, 2023, ⟨10.1111/1365-2745.14058⟩ Article dans une revue hal-03895245v1
	Effects of chemical compounds on the activity of the N‐Acetyl‐ β ‐D‐Glucosaminidase of the marine prawn, Palaemon serratus : screening in vitro . Marc Rollin , Romain Coulaud , Béatrice Rocher , Elise Billoir , Olivier Geffard et al. Environmental Toxicology and Chemistry, 2023, ⟨10.1002/etc.5567⟩ Article dans une revue hal-03959926v1
	DRomics, a workflow to exploit dose-response omics data in ecotoxicology Marie Laure Delignette-Muller , Aurélie Siberchicot , Floriane Larras , Elise Billoir Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e90. ⟨10.24072/pcjournal.325⟩ Article dans une revue hal-04231043v1
	A 34-year survey under phosphorus decline and warming: Consequences on stoichiometry and functional trait composition of freshwater macroinvertebrate communities Miriam Beck , Elise Billoir , Mathieu Floury , Philippe Usseglio-Polatera , Michael Danger Science of the Total Environment, 2023, 858, Part 3, pp.159786. ⟨10.1016/j.scitotenv.2022.159786⟩ Article dans une revue hal-03922830v1
	Influence of microorganisms on uranium release from mining-impacted lake sediments under various oxygenation conditions Marina Seder-Colomina , Arnaud Mangeret , Pascale Bauda , Jessica Brest , Lucie Stetten et al. Environmental Science: Processes & Impacts, 2022, 24 (10), pp.1830-1843. ⟨10.1039/D2EM00104G⟩ Article dans une revue hal-03852156v1
	Linking Micropollutants to Trait Syndromes across Freshwater Diatom, Macroinvertebrate, and Fish Assemblages Albin Meyer , Benjamin Alric , Olivier Dézerald , Elise Billoir , Romain Coulaud et al. Water, 2022, 14 (8), pp.1184. ⟨10.3390/w14081184⟩ Article dans une revue hal-03738769v1
	A database of West European headwater macroinvertebrate stoichiometric traits Miriam Beck , Elise Billoir , Vincent Felten , Albin Meyer , Philippe Usseglio-Polatera et al. Global Ecology and Biogeography, 2022, 31 (1), pp.4-9. ⟨10.1111/geb.13413⟩ Article dans une revue hal-03451714v1
	Lessons from linking bio‐ and ecological traits to stoichiometric traits in stream macroinvertebrates Miriam Beck , Elise Billoir , Vincent Felten , Albin Meyer , Philippe Usseglio-Polatera et al. Ecology and Evolution, 2022, 12 (12), ⟨10.1002/ece3.9605⟩ Article dans une revue hal-03922839v1
	How diatom-, invertebrate- and fish-based diagnostic tools can support the ecological assessment of rivers in a multi-pressure context: Temporal trends over the past two decades in France Benjamin Alric , Olivier Dézerald , Albin Meyer , Elise Billoir , Romain Coulaud et al. Science of the Total Environment, 2021, 762, pp.143915. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.143915⟩ Article dans une revue hal-03100921v1
	How does interspecific competition modify the response of grass plants against herbicide treatment? A hierarchical concentration-response approach Vincent Baillard , Marie Laure Delignette-Muller , Cécile Sulmon , Anne-Kristel Bittebiere , Cendrine Mony et al. Science of the Total Environment, 2021, 778, pp.146108. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.146108⟩ Article dans une revue hal-03167363v1
	Extending the growth rate hypothesis to species development: Can stoichiometric traits help to explain the composition of macroinvertebrate communities? Miriam Beck , Cédric Mondy , Michael Danger , Elise Billoir , Philippe Usseglio‐polatera Oikos, 2021, 130 (6), pp.879-892. ⟨10.1111/oik.08090⟩ Article dans une revue hal-03451691v1
	Effect of interspecific competition on species sensitivity distribution models: Analysis of plant responses to chemical stress Vincent Baillard , Cécile Sulmon , Anne-Kristel Bittebiere , Cendrine Mony , Ivan Couée et al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2020, 200, pp.110722. ⟨10.1016/j.ecoenv.2020.110722⟩ Article dans une revue hal-02619516v1
	A multi-omics concentration-response framework uncovers novel understanding of triclosan effects in the chlorophyte Scenedesmus vacuolatus Floriane Larras , Elise Billoir , Stefan Scholz , Mika Tarkka , Tesfaye Wubet et al. Journal of Hazardous Materials, 2020, 397, pp.122727. ⟨10.1016/j.jhazmat.2020.122727⟩ Article dans une revue hal-02892773v1
	Microplastics enhance Daphnia magna sensitivity to the pyrethroid insecticide deltamethrin: Effects on life history traits Vincent Felten , Héla Toumi , Jean-François Masfaraud , Elise Billoir , Baba Issa Camara et al. Science of the Total Environment, 2020, 714, pp.136567. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.136567⟩ Article dans une revue hal-03097950v1
	Agricultural and domestic pesticides in house dust from different agricultural areas in France Rémi Béranger , Elise Billoir , John Nuckols , Jeffrey Blain , Maurice Millet et al. Environmental Science and Pollution Research, 2019, 26 (19), pp.19632-19645. ⟨10.1007/s11356-019-05313-9⟩ Article dans une revue hal-03099918v1
	High food quality increases infection of Gammarus pulex (Crustacea: Amphipoda) by the acanthocephalan parasite Pomphorhynchus laevis. Kevin Sanchez-Thirion , Michaël Danger , Alexandre Bec , Elise Billoir , Sophie Labaude et al. International Journal for Parasitology, 2019, 49 (10), pp.805-817. ⟨10.1016/j.ijpara.2019.05.005⟩ Article dans une revue hal-02281395v1
	Does intraspecific variability matter in ecological risk assessment? Investigation of genotypic variations in three macrophyte species exposed to copper Eva Roubeau Dumont , Camille Larue , Sophie Lorber , Hervé Gryta , Elise Billoir et al. Aquatic Toxicology, 2019, 211, pp.29-37. ⟨10.1016/j.aquatox.2019.03.012⟩ Article dans une revue hal-02324925v1
	DRomics: A Turnkey Tool to Support the Use of the Dose–Response Framework for Omics Data in Ecological Risk Assessment Floriane Larras , Elise Billoir , Vincent Baillard , Aurélie Siberchicot , Stefan Scholz et al. Environmental Science and Technology, 2018, 52 (24), pp.14461-14468. ⟨10.1021/acs.est.8b04752⟩ Article dans une revue hal-02309919v1
	High stoichiometric food quality increases moulting organism vulnerability to pollutant impacts: An experimental test with Gammarus fossarum (Crustacea: Amphipoda) Julio Arce-Funck , Clément Crenier , Michael Danger , Elise Billoir , Philippe Usseglio-Polatera et al. Science of the Total Environment, 2018, 645, pp.1484--1495. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.07.227⟩ Article dans une revue istex hal-02061710v1
	Minor food sources can play a major role in secondary production in detritus-based ecosystems Clément Crenier , Julio Arce-Funck , Alexandre Bec , Elise Billoir , Fanny Perrière et al. Freshwater Biology, 2017, 62 (7), pp.1155-1167. ⟨10.1111/fwb.12933⟩ Article dans une revue hal-02319294v1
	Assessing anthropogenic pressures on streams: A random forest approach based on benthic diatom communities Floriane Larras , Romain Coulaud , Edwige Gautreau , Elise Billoir , Juliette Tison-Rosebery et al. Science of the Total Environment, 2017, 586, pp.1101 - 1112. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.02.096⟩ Article dans une revue istex hal-01917251v1
	Efficiency of wipe sampling on hard surfaces for pesticides and PCB residues in dust Joane Cettier , Marie-Laure Bayle , Rémi Beranger , Elise Billoir , John Nuckols et al. Science of the Total Environment, 2015, 505, pp.11 - 21. ⟨10.1016/j.scitotenv.2014.09.086⟩ Article dans une revue istex hal-01777749v1
	Sample size calculation in metabolic phenotyping studies Elise Billoir , Vincent Navratil , Benjamin J. Blaise Briefings in Bioinformatics, 2015, 16 (5), pp.813-819. ⟨10.1093/bib/bbu052⟩ Article dans une revue hal-01251729v1
	Time-dependent species sensitivity distributions David Fox , Elise Billoir Environmental Toxicology and Chemistry, 2013, 32 (2), pp.378-383. ⟨10.1002/etc.2063⟩ Article dans une revue hal-03099929v1
	SRV: an open-source toolbox to accelerate the recovery of metabolic biomarkers and correlations from metabolic phenotyping datasets V. Navratil , C. Pontoizeau , Elise Billoir , B. Blaise Bioinformatics, 2013, 29 (10), pp.1348-1349. ⟨10.1093/bioinformatics/btt136⟩ Article dans une revue hal-03106770v1
	Population-Level Modeling to Account for Multigenerational Effects of Uranium in Daphnia magna P-A. Biron , S. Massarin , F. Alonzo , L. Garcia-Sanchez , Sandrine Charles et al. Environmental Science and Technology, 2012, 46, pp.1136--1143. ⟨10.1021/es202658b⟩ Article dans une revue hal-02297352v1
	What to do with NOECS/NOELS - prohibition or innovation? Dr Fox , Elise Billoir , S. Charles , Marie-Laure Delignette-Muller , C. Lopes Integr Environ Assess Manag, 2012, 8, pp.764--766. ⟨10.1002/ieam.1350⟩ Article dans une revue istex hal-02296816v1
	Survival data analyses in ecotoxicology: critical effect concentrations, methods and models. What should we use? Carole Forfait-Dubuc , Sandrine Charles , Elise Billoir , Marie-Laure Delignette-Muller Ecotoxicology, 2012, 21, pp.1072--1083. ⟨10.1007/s10646-012-0860-0⟩ Article dans une revue istex hal-02297003v1
	Comparison of bioassays with different exposure time patterns: The added value of dynamic modelling in predictive ecotoxicology Elise Billoir , Hélène Delhaye , Carole Forfait-Dubuc , Bernard Clément , Gaëlle Triffault-Bouchet et al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2012, 75, pp.80-86. ⟨10.1016/j.ecoenv.2011.08.006⟩ Article dans une revue istex halsde-00685679v1
	Temperature limits trail following behaviour through pheromone decay in ants Louise van Oudenhove , Elise Billoir , Raphaël Boulay , Carlos Bernstein , Xim Cerda The Science of Nature Naturwissenschaften, 2011, 98 (12), pp.1009-1017. ⟨10.1007/s00114-011-0852-6⟩ Article dans une revue hal-02651505v1
	A New Perspective on the Dunnett Procedure: Filling the Gap Between Noec/Loec and Ecx Concepts Marie Laure Delignette-Muller , Carole Forfait-Dubuc , Elise Billoir , Sandrine Charles Environmental Toxicology and Chemistry, 2011, 30, pp.2888-2891. ⟨10.1002/etc.686⟩ Article dans une revue istex hal-02299273v1
	Individual versus population effects in concentration-response modeling D.R. Fox , Elise Billoir Integrated Environmental Assessment and Management, 2011, 7, pp.501-502. ⟨10.1002/ieam.199⟩ Article dans une revue istex hal-02299081v1
	Bayesian modelling of daphnid responses to time-varying cadmium exposure in laboratory aquatic microcosms Elise Billoir , Hélène Delhaye , Bernard Clément , Marie Laure Delignette-Muller , Sandrine Charles Ecotoxicology and Environmental Safety, 2011, 74 (4), pp.693-702. ⟨10.1016/j.ecoenv.2010.10.023⟩ Article dans une revue istex halsde-00685607v1
	Probabilistic modeling of the fate of Listeria monocytogenes in diced bacon during the manufacturing process Elise Billoir , Jean-Baptiste Denis , Natalie Commeau , Marie Cornu , Véronique Zuliani Risk Analysis, 2011, 31 (2), pp.237-254. ⟨10.1111/j.1539-6924.2010.01494.x⟩ Article dans une revue istex hal-01190200v1
	From individual to population level effects of toxicants in the tubicifid branchiura sowerbyi using threshold effect models in a bayesian framework Virginie Ducrot , Elise Billoir , Alexandre R.R. Pery , Jeanne Garric , Sandrine Charles Environmental Science and Technology, 2010, 44 (9), pp.3566-3571. ⟨10.1021/es903860w⟩ Article dans une revue ineris-00963240v1
	DEBtox theory and matrix population models as helpful tools in understanding the interaction between toxic cyanobacteria and zooplankton Elise Billoir , Aloysio da Silva Ferrão-Filho , Marie Laure Delignette-Muller , Sandrine Charles Journal of Theoretical Biology, 2009, 258 (3), pp.380. ⟨10.1016/j.jtbi.2008.07.029⟩ Article dans une revue hal-00554502v1
	Statistical cautions when estimating DEBtox parameters Elise Billoir , M.L. Delignette-Müller , A. Pery , Olivier Geffard , S. Charles Journal of Theoretical Biology, 2008, 254 (1), pp.55-64. ⟨10.1016/j.jtbi.2008.05.006⟩ Article dans une revue istex hal-02591278v1
	A bayesian approach to analyse ecotoxicological data Elise Billoir , Marie Laure Delignette-Muller , Alexandre R.R. Pery , Sandrine Charles Environmental Science and Technology, 2008, 42 (23), pp.8978-8984. ⟨10.1021/es801418x⟩ Article dans une revue ineris-00963142v1
	Integrating the lethal and sublethal effects of toxic compounds into the population dynamics of Daphnia magna: A combination of the DEBtox and matrix population models Elise Billoir , A. Pery , S. Charles Ecological Modelling, 2007, 203 (3-4), pp.204-214. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2006.11.021⟩ Article dans une revue istex hal-02589932v1

	Effets du changement climatique et de l'éthinylestradiol sur la croissance et le transcriptome hépatique de l'épinoche à trois épines (Gasterosteus aculeatus) Simon Thiry , Fabrice Teletchea , Elise Billoir , Bénédicte Sohm , Cyril Turiès et al. ECOBIM, UMR-I 02 SEBIO; Université Le Havre Normandie, May 2026, Le Havre, France Communication dans un congrès hal-05711829v1
	Développement d’une méthode d’analyse intégrative de données transcriptomiques temps-dose-réponse Ellis Franklin , Sophie Prud'Homme , Jérémie Ohanessian , Elise Billoir , Marie-Laure Delignette-Muller EcoBIM Réseau international en écotoxicologie aquatique, UMR-I 02 SEBIO; Université Le Havre Normandie, May 2026, Le Havre, France Communication dans un congrès hal-05633874v1
	Macrophytes can improve the ecological assessment of rivers in a multi-pressure context: a new diagnostic tool Thibault Leboucher , Jérémy Bacon , Christian Chauvin , Elise Billoir , Maud Pierre et al. Conférence internationale I.S.Rivers 2025, Jun 2025, Lyon, France Communication dans un congrès hal-05175593v1
	Exploring transcriptomic data with over-representation analysis enhanced by aggregated biological prior knowledge Ellis Franklin , Elise Billoir , Philippe Veber , Jérémie Ohanessian , Marie Laure Delignette-Muller et al. 35th Society of Environmental Toxicology and Chemistry (SETAC 2025), Society of Environmental Toxicology and Chemistry, May 2025, Vienne, Austria Communication dans un congrès hal-05283494v1
	Contribution of dose-response modelling for mechanistic understanding of multi-omics data and risk assessment Elise Billoir , Aurélie Siberchicot , Marie Laure Delignette-Muller 35th Society of Environmental Toxicology and Chemistry (SETAC 2025), Society of Environmental Toxicology and Chemistry, May 2025, Vienne, Austria Communication dans un congrès hal-05633786v1
	Effets du di-n-butyl phtalate (DBP) sur les traits d’histoire de vie de Daphnia magna et conséquences sur la dynamique de population : comparaison de deux régimes d’exposition Jérémie Ohanessian , Sophie Prud'Homme , Vincent Felten , Elise Billoir ECOBIM, May 2024, Banyuls, France Communication dans un congrès hal-05455876v1
	DRomics, a workflow to exploit and make sense of dose-response (multi) omics data Elise Billoir , Aurélie Siberchicot , Marie-Laure Delignette-Muller 22nd Pollutant Responses in Marine Organisms (PRIMO22), Ifremer, May 2024, Nantes (France), France Communication dans un congrès hal-05633789v1
	Interests and constraints towards unravelling endocrine disruptors mechanisms using dose-response transcriptomic data: application to the impact of di-n-butyl phthalate on zebrafish Ellis Franklin , Marie-Laure Delignette-Muller , Elise Billoir , Sophie Prud'Homme 22nd Pollutant Responses in Marine Organisms (PRIMO22), Ifremer, May 2024, Nantes (France), France Communication dans un congrès hal-05282728v1
	Disponibilité du phosphore dans les cours d'eau : quel rôle des populations de gammares ? Titouan Dionet , Mehdi Cherif , Elise Billoir , Vincent Felten , Michaël Danger 6èmes Journées internationales de Limnologie et Océanographie, Association Française de Limnologie, Oct 2024, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04752236v1
	Effect of heat stress on phototrophic biofilm photosynthesis in the context of climate change: a thermal dose approach Martin Laviale , Camille Courcoul , Lorraine Guyot , Vincent Baillard , Elise Billoir et al. 8th European Phycological Congress - EPC8, Aug 2023, Brest, France Communication dans un congrès hal-04187554v1
	Effets du di-n-butyl phtalate (DBP) sur les traits d'histoire de vie de Daphnia magna : comparaison de deux fenêtres d'exposition Jérémie Ohanessian , Sophie Prud'Homme , Vincent Felten , Elise Billoir SEFA, Jul 2023, Havre, France Communication dans un congrès hal-05456043v1
	La réponse des biofilms phototrophes au stress thermique dépend-elle de leur complexité, de leur histoire thermique, ou des deux ? Camille Courcoul , Martin Laviale , Vincent Baillard , Elise Billoir , Joséphine Leflaive et al. 41ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France Communication dans un congrès hal-04208741v1
	Chronologie des effets et des réactions face à une exposition à un contaminant : de la réponse moléculaire à apicale Ellis Franklin , Jérémie Ohanessian , Sophie Prud'Homme , Vincent Felten , Marie-Laure Delignette-Muller et al. GDR EA -Ecotoxicologie Aquatique, Dec 2023, Metz, France Communication dans un congrès hal-05455962v1
	Meta-transcriptomics reveals stress adaptation processes in microbial communities differing in exposure history Floriane Larras , Elise Billoir , Stefan Lips , Stephan Schreiber , Philippe Veber et al. "Ecology and Evolution: New perspectives and societal challenges" SFE2-GfÖ-EEF joint meeting, International conference on ecological sciences, Nov 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-04077768v1
	Can the functional stability of microbial communities exposed to multiple disturbances of the same nature be predicted? Camille Courcoul , Stéphanie Boulêtreau , Vincent Baillard , Martin Laviale , Elise Billoir et al. SFE²-GfÖ-EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Nov 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-03879385v1
	Modelling for risk assessment Marie-Laure Delignette-Muller , Elise Billoir Journées du LIEC : l’interdisciplinarité au service de l’environnement, Jan 2020, Metz, France Communication dans un congrès hal-04968222v1
	Stoichiometric traits predict the composition of macroinvertebrate communities: Extending the Growth Rate Hypothesis to species development Miriam Beck , Cédric P. Mondy , Michaël Danger , Elise Billoir , Philippe Usseglio-Polatera 11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS 11), Jun 2019, Zagreb, Croatia Communication dans un congrès hal-03140645v1
	Effet du stress thermique sur les diatomées benthiques dans le contexte du changement climatique : le cas du microphytobenthos intertidal Martin Laviale , Lorraine Guyot , Sakina-Dorothée Ayata , Elise Billoir , Bruno Jesus 38e colloque de l'ADLaF (Association des Diatomistes de Langue Française), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03234362v1
	Une certaine incertitude : précision et confiance en bio-indication. L’exemple des diatomées et des macro-invertébrés Albin Meyer , Elise Billoir , Philippe Usseglio-Polatera 38e Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03140643v1
	Molecular and metabolic mechanisms of transgenerational effects in Daphnia exposed to radionuclides Frederic Alonzo , Marie Trijau , Elise Billoir 6th International Symposium on DEB theory for metabolic organization, DEB2019, Apr 2019, BREST, France Communication dans un congrès hal-02635527v1
	Importance de la variabilité intraspécifique de la polluosensibilité pour l’évaluation du risque ecotoxicologique basée sur l’approche SSD (Species Sensitivity Distribution) Vincent Baillard , Laurine Malardier , Marie Laure Delignette-Muller , Eva Roubeau Dumont , Arnaud Elger et al. 38ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03172724v1
	Utilisation de DRomics pour modéliser les données omiques de type dose-réponse dans le cadre de l’appréciation du risque environnemental Marie-Laure Delignette-Muller , F. Larras , Elise Billoir , Aurélie Siberchicot , Mechthild Schmitt-Jansen SEFA (Société d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée), Jun 2019, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04963332v1
	Approche de Modélisation Hiérarchique pour la Description de l'Effet de la Compétition Interspécifique sur la Tolérance Chimique d'Herbacées Vincent Baillard , Marie Laure Delignette-Muller , Cécile Sulmon , Anne‐kristel Bittebière , Cendrine Mony et al. SEFA 2019 Lyon, Jun 2019, Lyon, France Communication dans un congrès hal-02667646v1
	Diversity-function relationships in contaminated soils – A functional trait approach Florence Maunoury-Danger , Delphine Aran , Apolline Auclerc , Quentin Bachelet , Thierry Beguiristain et al. Sfécologie2018, Oct 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03140666v1
	Evaluer la probabilité d'impact significatif des principales pressions anthropiques en cours d'eau via l'outil diagnostique « diatomées » F. Larras , E. Gautreau , Elise Billoir , R. Coulaud , J. Rosebery et al. Colloque annuel des diatomistes de langue française (ADLAF), Sep 2017, Dijon, France Communication dans un congrès hal-03245497v1
	Ecoscope: une plate-forme expérimentale en écologie et écotoxicologie des milieux aquatiques ? Vincent Felten , Michael Danger , Simon Devin , Elise Billoir , Christophe Pagnout et al. Séminaire OTELo, Jan 2017, Nancy, France Communication dans un congrès hal-03185946v1
	Development of a mixed hierarchical multinomial regression model to analyze community composition Elise Billoir , Julio Arce Funck , Clément Crenier , Philippe Usseglio-Polatera , Jonathan Bouquerel et al. International Statistical Ecology Conference, Jun 2016, Seattle, United States Communication dans un congrès hal-03184197v1
	Using benthic diatom life-history traits to assess stream impairment risk Floriane Larras , E. Gautreau , Elise Billoir , Soizic Morin , Juliette Tison-Rosebery et al. 9th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jul 2015, Genève, Switzerland Communication dans un congrès hal-02601471v1
	Modèle mixte hiérarchisé pour analyser la composition de communautés Elise Billoir , Julio Arce Funck , Clément Crenier , Philippe Usseglio-Polatera , Jonathan Bouquerel et al. Journée du GDR Ecologie statistique, Mar 2015, Lyon, France Communication dans un congrès hal-03185949v1
	Probabilistic modeling of listeria monocytognes behaviour in diced bacon during the manufacture process Elise Billoir , Jean-Baptiste Denis , Natalie Commeau , Marie Cornu , Véronique Zuliani 6th international conference on Predictive Modeling in Foods, Sep 2009, Washington, United States Communication dans un congrès hal-01197519v1
	Stochasticity and spatial heterogeneity in population dynamics: implications for ecotoxicological risk assessment Arnaud Chaumot , Elise Billoir , S. Charles SETAC Europe 17th Annual Meeting, Porto, Portugal, PRT, 20-24 May 2007, 2007, pp.1 Communication dans un congrès hal-02589497v1

	Inter-individual variability in transcriptomes Simon Thiry , Fabrice Teletchea , Elise Billoir , Sophie Prud'Homme JOBIM 2026, Jun 2026, Strasbourg, France. Poster de conférence hal-05711867v1
	Impact of global change on growth and gene transcription of three-spined stickleback (Gasterosteus aculeatus) Simon Thiry , Fabrice Teletchea , Elise Billoir , Bénédicte Sohm , Anne Bado-Nilles et al. FishPhysAqua, Jul 2026, Namur, Belgium. Poster de conférence hal-05711877v1
	Effets transcriptionnels dose- et temps- dépendants chez Daphnia magna exposée au di-n-butyl phtalate Jérémie Ohanessian , Ellis Franklin , Simon Thiry , Vincent Felten , Marie-Laure Delignette-Muller et al. ECOBIM, May 2024, Banyuls-sur-Mer, France Poster de conférence hal-05455903v1
	From dose-response modelling of transcriptomic data to biological interpretation: an application to embryonic exposure of zebrafish (Danio rerio) to di-n-butyl phthalate (DBP) Ellis Franklin , Elise Billoir , Marie Laure Delignette-Muller , Sophie M Prud'Homme 22nd Pollutant Responses in Marine Organisms Symposium (PRIMO22), May 2024, Nantes, France. Poster de conférence hal-05282671v1
	Simulation des conséquences d'une exposition au cadmium sur la composition élémentaire de la ressource gammare Titouan Dionet , Mehdi Cherif , Elise Billoir , Vincent Felten , Romain Coulaud et al. Colloque annuel de la Société d'Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée 2023, Jul 2023, Le Havre, France Poster de conférence hal-04434050v1
	Évaluation des effets chroniques du di-n-butyl phtalate (DBP) sur les traits d'histoire de vie de Daphnia magna et sa descendance Jérémie Ohanessian , Marianne Houin , Sophie Prud'Homme , Vincent Felten , Elise Billoir SEFA, Jun 2022, Metz, France Poster de conférence hal-05456063v1
	Effet dose-dépendant du di-n-butyl phtalate sur le développement embryo-larvaire du poisson zèbre (Danio rerio) : Intérêt de l’intégration de gradients de concentration dans les analyses transcriptomiques Elise Billoir , Bénédicte Sohm , C. Cossu-Leguille , Sophie Prud'Homme Ecobim 2022, May 2022, Namur, Belgique Poster de conférence hal-03777388v1
	DRomics: an R tool for modelling omics dose-response data Marie-Laure Delignette-Muller , Floriane Larras , Elise Billoir , Aurélie Siberchicot , Mechthild Schmitt-Jansen Congrès useR!, 2019, Toulouse, France. Communication par affiche (poster), 2019 Poster de conférence hal-04940104v1
	Evaluating the taxonomic and functional diversity of stream benthic invertebrate assemblages: morphological versus DNA metabarcoding approaches Albin Meyer , Elise Billoir , Floriane Larras , Virginie Archaimbault , Cedric Mondy et al. 11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS 11), Jun 2019, Zagreb, Croatia Poster de conférence hal-03140516v1
	Diversity-function relationships in contaminated soils–A functional trait approach Florence Maunoury-Danger , Delphine Aran , A. Auclerc , Quentin Bachelet , Thierry Beguiristain et al. SFE, Oct 2018, Rennes, France Poster de conférence hal-03185981v1
	Can SSD models help assessing interspecific competition impact on organisms' tolerance against chemical stress? Vincent Baillard , Cécile Sulmon , Anne‐kristel Bittebière , Cendrine Mony , Simon Devin et al. SFEcologie2018 International Conference on Ecological Sciences, Oct 2018, Rennes, France Poster de conférence hal-02492034v1
	Interspecific competition impact on organism responses to chemical stress: an SSD based approach Vincent Baillard , Cécile Sulmon , Anne‐kristel Bittebière , Cendrine Mony , Simon Devin et al. SETAC Europe Meeting,, May 2018, Rome, Italy Poster de conférence hal-02492022v1
	Relation diversité−fonction dans les sols contaminés – Une approche base sur les traits fonctionnels Florence Maunoury-Danger , Delphine Aran , Appoline Auclerc , Quentin Bachelet , Thierry Beguiristain et al. VIIème journées TEBIS, Oct 2018, Avignon, France Poster de conférence hal-03145569v1
	Soil pollution induced changes in leaf litter chemical composition and in detritivore physiology and activity Adrien Le Navenant , Elise Billoir , Aurélie Cébron , Sylvain Coq , V. Felten et al. SETAC Europe 28th Annual Meeting, May 2018, Rome, France Poster de conférence hal-03186720v1
	Pollution effects on leaf litter decomposition Adrien Le Navenant , Elise Billoir , Aurélie Cébron , Sylvain Coq , Vincent Felten et al. Journée d'écologie fonctionnelle, Mar 2017, La grande motte, France Poster de conférence hal-03145624v1
	ECOSCOPE : une plate-forme de mésocosmes pour évaluer l'impact de stresseurs anthropique sur les écosystèmes aquatiques à plusieurs niveaux d'organisation biologique Simon Devin , P. Bauda , Elise Billoir , Michael Danger , V. Felten et al. Congrès de la Société d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée - SEFA, Jun 2016, Reims, France Poster de conférence hal-03172499v1
	ECOSCOPE: a mesocosm facility to evaluate stressor impacts on headwater streams across multiple levels of biological organization Simon Devin , Pascale Bauda , Elise Billoir , Michaël Danger , Vincent Felten et al. SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France Poster de conférence hal-03133869v1

	Matrix population models as relevant modeling tools in ecotoxicology S. Charles , Elise Billoir , C. Lopes , Arnaud Chaumot , James Devillers Ecotoxicology Modeling, Emerging Topics in Ecotoxicology: Principles, Approaches and Perspectives 2, Springer Science, pp.261-298, 2009 Chapitre d'ouvrage hal-02592300v1

	Testing the Growth Rate Hypothesis at the population level: fast growing populations of Gammarus fossarum do not necessarily exhibit the highest phosphorus contents. Titouan Dionet , Mehdi Cherif , Elise Billoir , Vincent Felten , Romain Coulaud et al. 2026 Pré-publication, Document de travail hal-05641762v1

	Prospective Surfaces et Interfaces Continentales : 2024-2028 Sophie Ayrault , Gilles Pinay , Eric Ferrage , Nizar Abcha , Philippe Ackerer et al. INSU, CNRS; INEE, CNRS. 2024, 147 p Rapport (rapport d’expertise collective) insu-05045026v1
	Finalisation I2M2, chantier Diagnostic multi-EQB et développement d'un indice pour les grands cours d'eau. Rapport final Philippe Usseglio-Polatera , Floriane Larras , Romain Coulaud , Elise Billoir [Rapport de recherche] Rapport Université de Lorraine (LIEC) pour l’ONEMA. 2016, 179 p Rapport (rapport de recherche) hal-03221395v1

	La modélisation pour comprendre les mécanismes d'effet de stress environnementaux Elise Billoir Biodiversité et Ecologie. Université de Lorraine, 2023 HDR tel-04353166v1

	DRomics: Dose Response for Omics Marie-Laure Delignette-Muller , Elise Billoir , Aurélie Siberchicot 2024, ⟨swh:1:dir:07f87aa59d4c611c3909e3ac44d2bd075f88a52b;origin=https://gitlab.in2p3.fr/drgarden/DRomics;visit=swh:1:snp:bdce09e9760ea3e3d387ea9bbf320ec37e9bb4ba;anchor=swh:1:rev:29d443e5310e001c8c32653fb8946084238ed842⟩ Logiciel hal-04976156v1
	Cluefish Ellis Franklin , Elise Billoir , Marie Laure Delignette-Muller , Sophie Prud'Homme , Jérémie Ohanessian 2024, ⟨swh:1:dir:1321b81da1fb01d39f9c126d794f51de95a41c09;origin=https://github.com/ellfran-7/cluefish;visit=swh:1:snp:2784bc2052a6b7e8f8f9040934dcaeef4c5478a0;anchor=swh:1:rev:04eb1a4040e6eff03f30cf72366470be9b11b022⟩ Logiciel hal-05633948v1

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Elise Billoir

Présentation

Publications

Publications

A new chronic larval bioassay using the wild marine shrimp Palaemon serratus, integrating inter-female variability and non-monotonic dose-responses

Effects of dibutyl phthalate (DBP) on life history traits and population dynamics of Daphnia magna: comparison of two exposure regimes

Transcriptomics highlights dose-dependent response of poplar to a phenanthrene contamination

How macrophytes can improve the ecological assessment of rivers in a multiple-pressure context: development of a new diagnostic tool

Cluefish: mining the dark matter of transcriptional data series with over-representation analysis enhanced by aggregated biological prior knowledge

Individual and combined effects of design and inter-operator variability on stream ecological assessment

Effects of water nutrient concentrations on stream macroinvertebrate community stoichiometry: a large-scale study

A toxicokinetic–toxicodynamic model with a transgenerational damage to explain toxicity changes over generations (in Daphnia magna exposed to depleted uranium)

Disentangling the effects of microalgal diversity and thermal history on freshwater phototrophic biofilms facing heat stress: A thermal dose approach

Effects of chemical compounds on the activity of the N‐Acetyl‐ β ‐D‐Glucosaminidase of the marine prawn, Palaemon serratus : screening in vitro .

DRomics, a workflow to exploit dose-response omics data in ecotoxicology

A 34-year survey under phosphorus decline and warming: Consequences on stoichiometry and functional trait composition of freshwater macroinvertebrate communities

Influence of microorganisms on uranium release from mining-impacted lake sediments under various oxygenation conditions

Linking Micropollutants to Trait Syndromes across Freshwater Diatom, Macroinvertebrate, and Fish Assemblages

A database of West European headwater macroinvertebrate stoichiometric traits

Lessons from linking bio‐ and ecological traits to stoichiometric traits in stream macroinvertebrates

How diatom-, invertebrate- and fish-based diagnostic tools can support the ecological assessment of rivers in a multi-pressure context: Temporal trends over the past two decades in France

How does interspecific competition modify the response of grass plants against herbicide treatment? A hierarchical concentration-response approach

Extending the growth rate hypothesis to species development: Can stoichiometric traits help to explain the composition of macroinvertebrate communities?

Effect of interspecific competition on species sensitivity distribution models: Analysis of plant responses to chemical stress

A multi-omics concentration-response framework uncovers novel understanding of triclosan effects in the chlorophyte Scenedesmus vacuolatus

Microplastics enhance Daphnia magna sensitivity to the pyrethroid insecticide deltamethrin: Effects on life history traits

Agricultural and domestic pesticides in house dust from different agricultural areas in France

High food quality increases infection of Gammarus pulex (Crustacea: Amphipoda) by the acanthocephalan parasite Pomphorhynchus laevis.

Does intraspecific variability matter in ecological risk assessment? Investigation of genotypic variations in three macrophyte species exposed to copper

DRomics: A Turnkey Tool to Support the Use of the Dose–Response Framework for Omics Data in Ecological Risk Assessment

High stoichiometric food quality increases moulting organism vulnerability to pollutant impacts: An experimental test with Gammarus fossarum (Crustacea: Amphipoda)

Minor food sources can play a major role in secondary production in detritus-based ecosystems

Assessing anthropogenic pressures on streams: A random forest approach based on benthic diatom communities

Efficiency of wipe sampling on hard surfaces for pesticides and PCB residues in dust

Sample size calculation in metabolic phenotyping studies

Time-dependent species sensitivity distributions

SRV: an open-source toolbox to accelerate the recovery of metabolic biomarkers and correlations from metabolic phenotyping datasets

Population-Level Modeling to Account for Multigenerational Effects of Uranium in Daphnia magna

What to do with NOECS/NOELS - prohibition or innovation?

Survival data analyses in ecotoxicology: critical effect concentrations, methods and models. What should we use?

Comparison of bioassays with different exposure time patterns: The added value of dynamic modelling in predictive ecotoxicology

Temperature limits trail following behaviour through pheromone decay in ants

A New Perspective on the Dunnett Procedure: Filling the Gap Between Noec/Loec and Ecx Concepts

Individual versus population effects in concentration-response modeling

Bayesian modelling of daphnid responses to time-varying cadmium exposure in laboratory aquatic microcosms

Probabilistic modeling of the fate of Listeria monocytogenes in diced bacon during the manufacturing process

From individual to population level effects of toxicants in the tubicifid branchiura sowerbyi using threshold effect models in a bayesian framework

DEBtox theory and matrix population models as helpful tools in understanding the interaction between toxic cyanobacteria and zooplankton

Statistical cautions when estimating DEBtox parameters

A bayesian approach to analyse ecotoxicological data

Integrating the lethal and sublethal effects of toxic compounds into the population dynamics of Daphnia magna: A combination of the DEBtox and matrix population models

Effets du changement climatique et de l'éthinylestradiol sur la croissance et le transcriptome hépatique de l'épinoche à trois épines (Gasterosteus aculeatus)

Développement d’une méthode d’analyse intégrative de données transcriptomiques temps-dose-réponse

Macrophytes can improve the ecological assessment of rivers in a multi-pressure context: a new diagnostic tool

Exploring transcriptomic data with over-representation analysis enhanced by aggregated biological prior knowledge

Contribution of dose-response modelling for mechanistic understanding of multi-omics data and risk assessment

Effets du di-n-butyl phtalate (DBP) sur les traits d’histoire de vie de Daphnia magna et conséquences sur la dynamique de population : comparaison de deux régimes d’exposition

DRomics, a workflow to exploit and make sense of dose-response (multi) omics data

Interests and constraints towards unravelling endocrine disruptors mechanisms using dose-response transcriptomic data: application to the impact of di-n-butyl phthalate on zebrafish

Disponibilité du phosphore dans les cours d'eau : quel rôle des populations de gammares ?

Effect of heat stress on phototrophic biofilm photosynthesis in the context of climate change: a thermal dose approach

Effets du di-n-butyl phtalate (DBP) sur les traits d'histoire de vie de Daphnia magna : comparaison de deux fenêtres d'exposition

La réponse des biofilms phototrophes au stress thermique dépend-elle de leur complexité, de leur histoire thermique, ou des deux ?

Chronologie des effets et des réactions face à une exposition à un contaminant : de la réponse moléculaire à apicale

Meta-transcriptomics reveals stress adaptation processes in microbial communities differing in exposure history

Can the functional stability of microbial communities exposed to multiple disturbances of the same nature be predicted?

Modelling for risk assessment

Stoichiometric traits predict the composition of macroinvertebrate communities: Extending the Growth Rate Hypothesis to species development

Effet du stress thermique sur les diatomées benthiques dans le contexte du changement climatique : le cas du microphytobenthos intertidal

Une certaine incertitude : précision et confiance en bio-indication. L’exemple des diatomées et des macro-invertébrés

Molecular and metabolic mechanisms of transgenerational effects in Daphnia exposed to radionuclides

Importance de la variabilité intraspécifique de la polluosensibilité pour l’évaluation du risque ecotoxicologique basée sur l’approche SSD (Species Sensitivity Distribution)

Utilisation de DRomics pour modéliser les données omiques de type dose-réponse dans le cadre de l’appréciation du risque environnemental

Approche de Modélisation Hiérarchique pour la Description de l'Effet de la Compétition Interspécifique sur la Tolérance Chimique d'Herbacées

Diversity-function relationships in contaminated soils – A functional trait approach

Evaluer la probabilité d'impact significatif des principales pressions anthropiques en cours d'eau via l'outil diagnostique « diatomées »

Ecoscope: une plate-forme expérimentale en écologie et écotoxicologie des milieux aquatiques ?

Development of a mixed hierarchical multinomial regression model to analyze community composition

Using benthic diatom life-history traits to assess stream impairment risk

Modèle mixte hiérarchisé pour analyser la composition de communautés