emmanuel denimal

Présentation

Publications

Article dans une revue (22)

Integration DeepLabv3+ applied to RGB images and vegetation indices for nitrogen status in cereal–legume intercropping system Zexing Yao,Emmanuel Denimal,Laurence Dujourdy,Christelle Gée Smart Agricultural Technology, 2026, 13, pp.101752. ⟨10.1016/j.atech.2025.101752⟩ Article dans une revue hal-05453653v1
Rapid viral detection in milk using near infrared spectroscopy combined with Swiss knife partial least squares (SKPLS) 3-way multiblock Samy de Oliveira,Stéphane Guyot,Laurence Dujourdy,Emmanuel Denimal,Laurent Galet al. Food Chemistry: X, 2026, 499, pp.147336. ⟨10.1016/j.foodchem.2025.147336⟩ Article dans une revue hal-05394400v1
Sodium Alginate as a promising encapsulating material for extremely-oxygen sensitive probiotics Thị-Thanh-Trúc Phùng,Hải-Ngân Đinh,María Ureña,Bonastre Oliete,Emmanuel Denimalet al. Food Hydrocolloids, 2025, 160 (Part 3), pp.110857. ⟨10.1016/j.foodhyd.2024.110857⟩ Article dans une revue hal-04811512v1
In Vitro Monitoring of Taste Compound Release During Chewing According to Process‐Related Parameters of the Food Raphaël Monod,Ana Carolina Conti,Emmanuel Denimal,Chantal Septier,Bérénice Houinsou-Houssouet al. Journal of Texture Studies, 2025, 56 (6), pp.e70053. ⟨10.1111/jtxs.70053⟩ Article dans une revue hal-05405892v1
Oral processing of meat-flavour textured soy proteins – Part I: Bolus properties and relationships with the texture profile analysis of the products Ana Carolina Conti,Chantal Septier,Emmanuel Denimal,Hélène Labouré,Christian Salles Food Research International, 2025, 208, pp.116169. ⟨10.1016/j.foodres.2025.116169⟩ Article dans une revue hal-05002665v1
Ex-vivo investigation of probiotic bacterial adhesion to the intestinal mucus Thị Thanh-Trúc Phùng,Sébastien Dupont,Laurent Beney,Sylvie Moundanga,Emmanuel Denimalet al. Heliyon, 2024, 10 (16), pp.e36339. ⟨10.1016/j.heliyon.2024.e36339⟩ Article dans une revue hal-04696440v1
Programming and Setting Up the Object Detection Algorithm YOLO to Determine Feeding Activities of Beef Cattle: A Comparison between YOLOv8m and YOLOv10m Pablo Guarnido-Lopez,John-Fredy Ramirez-Agudelo,Emmanuel Denimal,Mohammed Benaouda Animals, 2024, 14 (19), pp.2821. ⟨10.3390/ani14192821⟩ Article dans une revue hal-04751826v1
Cell morphology observations for discriminating between &lt;i&gt;Brettanomyces bruxellensis&lt;/i&gt; strains among genetic groups Sandrine Rousseaux,Manon Lebleux,Emmanuel Denimal,Stéphanie Weidmann IVES Technical Reviews vine and wine, 2023, ⟨10.20870/IVES-TR.2023.7339⟩ Article dans une revue hal-04038645v1
Assessment of Nitrogen Nutrition Index of Winter Wheat Canopy from Visible Images for a Dynamic Monitoring of N Requirements Christelle Gée,Emmanuel Denimal,De Yparraguirre,,Laurence Dujourdy,Anne-Sophie Voisin Remote Sensing, 2023, 15 (10), pp.art. 2510. ⟨10.3390/rs15102510⟩ Article dans une revue hal-04095363v1
The Yin-Yang of the Green Fluorescent Protein: Impact on Saccharomyces cerevisiae stress resistance Mélanie Ragon,Lucie Bertheau,Jennifer Dumont,Tiffany Bellanger,Marie Grosselinet al. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2023, 238, pp.112603. ⟨10.1016/j.jphotobiol.2022.112603⟩ Article dans une revue hal-03902943v1
Mesocosm evaluation of the competittive ability of common and segetal weed species against barley Veron Zarate,Bruno Chauvel,Emmanuel Denimal,Christelle Gée Revista de Investigaciones de Ciensias Agronomicas, 2022, 40 (Suplemento Seminario científico franco-argentino sobre agroecología 22-23 novembre, Rosario, Argentine), pp.81-82 Article dans une revue hal-04115266v1
Proxi-detection to monitor the growth status of wheat in the presence of weeds using low-cost and simple digital tools to track the emergence of stress Christelle Gée,Laurence Dujourdy,Victor Mignon,Emmanuel Denimal Precision Agriculture, 2022, 23 (2115-2134), ⟨10.1007/s11119-022-09963-7⟩ Article dans une revue hal-03821889v1
Potential of visible (RGB) imagery for dynamic monitoring of nitrogen requirements in winter wheat using the innovative APPI-N method Christelle Gée,M Yparraguire,Emmanuel Denimal,Anne-Sophie Voisin Revista de Investigaciones de Ciensias Agronomicas, 2022, 40 (Suplemento Seminario científico franco-argentino sobre agroecología 22-23 novembre, Rosario, Argentine), pp.66-68 Article dans une revue hal-04107243v1
Prediction of Genetic Groups within Brettanomyces bruxellensis through Cell Morphology Using a Deep Learning Tool Manon Lebleux,Emmanuel Denimal,Déborah de Oliveira,Ambroise Marin,Nicolas Desrocheet al. Journal of Fungi, 2021, 7 (8), pp.581. ⟨10.3390/jof7080581⟩ Article dans une revue hal-03342935v1
Increased xerotolerance of Saccharomyces cerevisiae during an osmotic pressure ramp over several generations Stéphane Guyot,Laurence Pottier,Lucie Bertheau,Jennifer Dumont,Eminence Dorelle Hondjuila Miokonoet al. Microbial Biotechnology, 2021, 14 (4), pp.1445-1461. ⟨10.1111/1751-7915.13789⟩ Article dans une revue hal-03174738v1
Evaluation of weed impact on wheat biomass by combining visible imagery with a plant growth model: towards new non-destructive indicators for weed competition Christelle Gée,Emmanuel Denimal,Josselyn Merienne,Annabelle Larmure Precision Agriculture, 2021, 22, pp.550-568. ⟨10.1007/s11119-020-09776-6⟩ Article dans une revue hal-03103918v1
RGB Image-Derived Indicators for Spatial Assessment of the Impact of Broadleaf Weeds on Wheat Biomass Christelle Gée,Emmanuel Denimal Remote Sensing, 2020, 12 (18), pp.2982. ⟨10.3390/rs12182982⟩ Article dans une revue hal-02958624v1
Automatic Counting of Intra-Cellular Ribonucleo-Protein Aggregates in Saccharomyces cerevisiae Using a Textural Approach Ambroise Marin,Emmanuel Denimal,Lucie Bertheau,Stéphane Guyot,Ludovic Journauxet al. Microscopy and Microanalysis, 2019, 25 (1), pp.164-179. ⟨10.1017/S1431927619000084⟩ Article dans une revue hal-02171876v1
Effect of high hydrostatic pressure on extraction of B-phycoerythrin from Porphyridium cruentum: Use of confocal microscopy and image processing Thierry Tran,Emmanuel Denimal,Céline Lafarge,Ludovic Journaux,John Aldo Leeet al. Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2019, 38 (UNSP 101394), pp.1-8. ⟨10.1016/j.algal.2018.101394⟩ Article dans une revue istex hal-02173597v1
Automatic Biological Cell Counting Using a Modified Gradient Hough Transform Emmanuel Denimal,Ambroise Marin,Stéphane Guyot,Ludovic Journaux,Paul Molin Microscopy and Microanalysis, 2017, 23 (01), pp.11 - 21. ⟨10.1017/S1431927616012617⟩ Article dans une revue hal-01509941v1
Reliable Detection and Smart Deletion of Malassez Counting Chamber Grid in Microscopic White Light Images for Microbiological Applications Emmanuel Denimal,Ambroise Marin,Ludovic Journaux,Stéphane Guyot,Paul Molin Microscopy and Microanalysis, 2015, pp.1-7. ⟨10.1017/S1431927615000665⟩ Article dans une revue hal-01164294v1
A Robust Generic Method for Grid Detection in White Light Microscopy Malassez Blade Images in the Context of Cell Counting Ambroise Marin,Emmanuel Denimal,Stéphane Guyot,Ludovic Journaux,Paul Molin Microscopy and Microanalysis, 2015, 21 (01), pp.239-248. ⟨10.1017/S1431927614013671⟩ Article dans une revue hal-01114543v1

Communication dans un congrès (10)

Contribution of visible imagery to the APPI-N fertilization method for monitoring rapeseed Christelle Gée,Emile Lerebour,Raphaël Paut,Emmanuel Denimal,Marie-Hélène Jeuffroyet al. Proceedings of the 15th European Conference on Precision Agriculture, Jun 2025, Barcelone, Spain. pp.502-508, ⟨10.1163/9789004725232_065⟩ Communication dans un congrès hal-05242491v1
12. YoloV5 and visible imagery for assessing nitrogen requirements in TriticaleFababean intercrops Mathias Duboux,Emmanuel Denimal,Zexing Yao,Christelle Gée 15th European Conference on Precision Agriculture, Jun 2025, Barcelogne, Spain. pp.21-22 Communication dans un congrès hal-05157507v1
Monitoring the nitrogen status of a cereal in intercropping by semantic segmentation of RGB images Zexing Yao,Emmanuel Denimal,Christelle Gée Proceedings of the 15th European Conference on Precision Agriculture, Jun 2025, Barcelone, Spain. pp.466-473, ⟨10.1163/9789004725232_060⟩ Communication dans un congrès hal-05242519v1
Exploration of the mechanisms leading to the cell death of Brettanomyces bruxellensis induced by amphidinols derived from marine microalgae. Chloé Abry,Pascale Winckler,Laure Avoscan,Aline Bonnotte,Emmanuel Denimalet al. Cytométrie (AFC), Nov 2025, Dijon, France Communication dans un congrès hal-05515560v1
YoloV5 et imagerie visible pour l'évaluation des besoins azotés dans les cultures associées Mathias Duboux,Emmanuel Denimal,Zexing Yao,Christelle Gée Journée thématique GDR IASIS "Capteurs, données et Intelligence artificielle pour l’agriculture", adel hafiane, christelle gee, raphael canals, Jun 2024, CNRS Ile-de-France Villejuif. 7, rue Guy Môquet 94800 Villejuif,, France Communication dans un congrès hal-04966447v1
Suivi du statut azoté d'une céréale en cultures associées par segmentation sémantique d'images visibles Yao, Zexing,Emmanuel Denimal,Christelle Gée Journée des Doctorants UMR Agroécologie, Nov 2024, Dijon, France Communication dans un congrès hal-04960961v1
Segmentation sémantique d'images visibles en cultures associées Zexing Yao,Mathias Duboux,Emmanuel Denimal,Christelle Gée Journée thématique GDR IASIS "Capteurs, données et Intelligence artificielle pour l’agriculture", adel hafiane, christelle gee, raphael canals, Jun 2024, CNRS Ile-de-France Villejuif. 7, rue Guy Môquet 94800 Villejuif, France Communication dans un congrès hal-04966452v1
87. Evaluation of the competition between barley and different weed species in a controlled environment in relation to selective weed control Christelle Gée,E.A. Veron Zarate,Annick Matejicek,Emmanuel Denimal,Bruno Chauvel 14th European Conference on Precision Agriculture, Jul 2023, Bologne, Italy. pp.693 - 700, ⟨10.3920/978-90-8686-947-3_87⟩ Communication dans un congrès hal-04159640v1
43. Potential of the dark green color index for dynamic monitoring of N requirements in wheat crop Anne-Sophie Voisin,Emmanuel Denimal,M. De-Yparraguirre,Laurence Dujourdy,Christelle Gée 14th European Conference on Precision Agriculture, Jul 2023, Bologne, Italy. pp.351-358, ⟨10.3920/978-90-8686-947-3_43⟩ Communication dans un congrès hal-04158628v1
Estimation de l’indice foliaire et de la biomasse du blé et des adventices par imagerie visible et machine learning : vers un nouvel indicateur non destructif de la compétition culture-adventices ? Christelle Gée,Emmanuel Denimal,Nicolas Boulard,Annabelle Larmure 24. conference du COLUMA - journées internationales sur la lutte contre les mauvaises herbes, Dec 2019, Orléans, France. 11 p Communication dans un congrès hal-02736429v1

Poster de conférence (3)

Machine Learning and Artificial Intelligence for Sustainable Cropping Systems Yao, Zexing,Emmanuel Denimal,Christelle Gée Forum des jeunes chercheurs, Jun 2024, Dijon, France Poster de conférence hal-04743498v1
Segmentation sémantique d’images visibles en cultures associées Zexing Yao,Mathias Duboux,Emmanuel Denimal,Christelle Gée Forum des jeunes chercheurs, Jun 2024, Dijon, France Poster de conférence hal-04743788v1
A new method for analysing the dynamics of individual responses in a stressed yeast population by coupling microscopy video sequence acquisition and image analysis Jérémy Adamuz,Emmanuel Denimal,Cédric Grangeteau,Sébastien Dupont,Laurent Beney Microbes -16ème Congrès National de SFM, 2021, Nantes, France Poster de conférence hal-05251589v1

Chapitre d'ouvrage (1)

High throughput field phenotyping (HTFP) of wheat and weed cover in field experiments using RGB images: assessment of crop-weed competition with a simple ecophysiological model Christelle Gée,Victor Mignon,Laurence Dujourdy,Emmanuel Denimal Precision agriculture ’21. WeedElec: a robotic research platform for individual weed detection and selective electrical weeding, John V. Stafford, pp.225 - 232, 2021, Proceedings "13th European Conference on Precision Agriculture ECPA2021". Budapest, Hongrie, 19-22 Juillet 2021, 978-90-8686-363-1. ⟨10.3920/978-90-8686-916-9_26⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03275337v1

Thèse (1)

Détection de formes compactes en imagerie : développement de méthodes cumulatives basées sur l'étude des gradients : Applications à l'agroalimentaire Emmanuel Denimal Vision par ordinateur et reconnaissance de formes [cs.CV]. Université Bourgogne Franche-Comté, 2018. Français. ⟨NNT : 2018UBFCK006⟩ Thèse tel-01781345v1