Erwan Quéméré

Publications

Article dans une revue (37)

Eco‐evolutionary responses of a cold‐water fish (Salmo trutta) to the combined effects of an emerging pathogen and temperature Eloïse Duval,Simon Blanchet,Lisa Jacquin,Charlotte Veyssière,Géraldine Lootet al. Functional Ecology, 2025, 39 (8), pp.2096 - 2110. ⟨10.1111/1365-2435.70105⟩ Article dans une revue hal-05311467v1
Inter-laboratory ring test for environmental DNA extraction protocols: implications for marine megafauna detection using three novel qPCR assays Lauren Kelly Rodriguez,Lorenzo de Bonis,Jack Mckee,James Mckenna,Teddy Urvoiset al. Metabarcoding and Metagenomics, 2025, 9, ⟨10.3897/mbmg.9.128235⟩ Article dans une revue hal-05095865v1
Peut-on utiliser l’ADN environnemental pour le suivi quantitatif des populations de poissons migrateurs ? Erwan Quéméré,Zoé Raphalen,Anne-Laure Besnard,Marine Vautier,Natacha Nikolic Sciences Eaux & Territoires, 2025, 47, pp.8475. ⟨10.20870/Revue-SET.2025.47.8475⟩ Article dans une revue hal-05311443v1
When does a parasite become a disease? eDNA unravels complex host-pathogen dynamics across environmental stress gradients in wild salmonid populations Eloïse Duval,Simon Blanchet,Erwan Quéméré,Lisa Jacquin,Charlotte Veyssièreet al. Science of the Total Environment, 2024, 946, pp.174367. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.174367⟩ Article dans une revue hal-04768071v1
Brucellosis in Alpine ibex: 10 years of research and expert assessments Sébastien Lambert,Anne Thébault,Stéphane Anselme-Martin,Clément Calenge,Charlotte Dunoyeret al. Médecine/Sciences, 2023, 39 (10), pp.722-731. ⟨10.1051/medsci/2023132⟩ Article dans une revue anses-04276841v1
Spatial Patterns of Neutral and Functional Genetic Variations along Dendritic Networks of Riverscape in Brown Trout Populations Laurine Gouthier,Eloïse Duval,Simon Blanchet,Géraldine Loot,Charlotte Veyssièreet al. Diversity, 2023, 15 (6), pp.784. ⟨10.3390/d15060784⟩ Article dans une revue hal-04180873v1
Highly Variable Densities and a Decline in Critically Endangered Golden-Crowned Sifaka (Propithecus tattersalli) Abundance from 2008–2018 Brandon Semel,Sarah Karpanty,Meredith Semel,Dean Stauffer,Erwan Quéméréet al. International Journal of Primatology, 2023, 44, pp.94-115. ⟨10.1007/s10764-022-00314-x⟩ Article dans une revue hal-03837068v1
A multifaceted index of population health to detect risk-prone populations and underlying stressors in wildlife Eloïse Duval,Erwan Quéméré,Géraldine Loot,Lisa Jacquin,Charlotte Veyssièreet al. Biological Conservation, 2022, 274, pp.109706. ⟨10.1016/j.biocon.2022.109706⟩ Article dans une revue hal-03837981v1
Quantifying heritability and estimating evolutionary potential in the wild when individuals that share genes also share environments Laura Gervais,Nicolas Morellet,Ingrid David,Mark Hewison,Denis Réaleet al. Journal of Animal Ecology, 2022, 91 (6), pp.1239-1250. ⟨10.1111/1365-2656.13677⟩ Article dans une revue hal-03600994v1
Pathogen‐mediated selection favours the maintenance of innate immunity gene polymorphism in a widespread wild ungulate Erwan Quéméré,Pauline Hessenauer,Maxime Galan,Marie Fernandez,Joël Merletet al. Journal of Evolutionary Biology, 2021, 34 (7), pp.1156-1166. ⟨10.1111/jeb.13876⟩ Article dans une revue hal-03261570v1
Maternal effects shape offspring physiological condition but do not senesce in a wild mammal Louise Cheynel,Emmanuelle Gilot-Fromont,Benjamin Rey,Erwan Quéméré,François Débiaset al. Journal of Evolutionary Biology, 2021, 34 (4), pp.661-670. ⟨10.1111/jeb.13768⟩ Article dans une revue hal-03223446v1
Urine DNA (uDNA) as a non‐lethal method for endoparasite biomonitoring Eloïse Duval,Simon Blanchet,Lisa Jacquin,Charlotte Veyssière,Armand Lautraiteet al. Environmental DNA, 2021, 3 (5), pp.1035-1045. ⟨10.1002/edn3.228⟩ Article dans une revue hal-03334982v1
Unraveling the dietary diversity of Neotropical top predators using scat DNA metabarcoding: A case study on the elusive Giant Otter Erwan Quéméré,Marie Aucourd,Valérie Troispoux,Sébastien Brosse,Jérôme Murienneet al. Environmental DNA, 2021, 3 (5), pp.889-900. ⟨10.1002/edn3.195⟩ Article dans une revue hal-03217686v1
Pedigree‐free quantitative genetic approach provides evidence for heritability of movement tactics in wild roe deer Laura Gervais,A.J. Mark Hewison,Nicolas Morellet,Maria Bernard,Joel Merletet al. Journal of Evolutionary Biology, 2020, ⟨10.1111/jeb.13594⟩ Article dans une revue hal-02622271v1
Genetic consequences of social structure in the golden-crowned sifaka Bárbara Parreira,Erwan Quéméré,Cécile Vanpé,Inês Carvalho,Lounès Chikhi Heredity, 2020, 125 (5), pp.328-339. ⟨10.1038/s41437-020-0345-5⟩ Article dans une revue hal-03026878v1
Demography and adaptation promoting evolutionary transitions in a mammalian genus that diversified during the Pleistocene Menno Jong,Zhipeng Li,Yanli Qin,Erwan Quéméré,Karis Bakeret al. Molecular Ecology, In press, 00, ⟨10.1111/mec.15450⟩ Article dans une revue hal-02907179v1
Genetic epidemiology of the Alpine ibex reservoir of persistent and virulent brucellosis outbreak Erwan Quéméré,Sophie Rossi,Elodie Petit,Pascal Marchand,Joel Merletet al. Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.1-10. ⟨10.1038/s41598-020-61299-2⟩ Article dans une revue hal-02627770v1
Old females rarely mate with old males in roe deer, &lt;i&gt;Capreolus capreolus&lt;/i&gt; Cécile Vanpé,Jean-Michel Gaillard,A. Hewison,Erwan Quéméré,Petter Kjellanderet al. Biological Journal of the Linnean Society, 2019, 128 (3), pp.515-525. ⟨10.1093/biolinnean/blz110⟩ Article dans une revue hal-02390022v1
RAD‐sequencing for estimating genomic relatedness matrix‐based heritability in the wild: A case study in roe deer Laura Gervais,Charles Perrier,Maria Bernard,Joel Merlet,Josephine Pembertonet al. Molecular Ecology Resources, 2019, 19 (5), pp.1205-1217. ⟨10.1111/1755-0998.13031⟩ Article dans une revue hal-02349032v1
Brucella melitensis Rev.1 vaccination generates a higher shedding risk of the vaccine strain in Alpine ibex (Capra ibex) compared to the domestic goat (Capra hircus) Claire Ponsart,Mickaël Riou,Yann Locatelli,Isabelle Jacques,Alain Fadeauet al. Veterinary Research, 2019, 50 (1), 13 p. ⟨10.1186/s13567-019-0717-0⟩ Article dans une revue hal-02388531v1
Between-population differences in the genetic and maternal components of body mass in roe deer Erwan Quéméré,J. M. Gaillard,Maxime Galan,Cécile Vanpé,Ingrid Davidet al. BMC Evolutionary Biology, 2018, 18, ⟨10.1186/s12862-018-1154-9⟩ Article dans une revue hal-02626208v1
Bouquetins du Bargy et infection brucellique : que nous révèle la génétique ? Erwan Quéméré,Sophie Rossi,Yvette Game,Elodie Petit,Maxime Galanet al. Epidémiologie et Santé Animale, 2018, 74, pp.17-24 Article dans une revue hal-02618249v1
Vaccination anti-brucellique du bouquetin des Alpes (Capra ibex), une option pour l'assainissement du massif du Bargy ? Résultats d'une première expérimentation visant à comparer le niveau d'innocuité du vaccin REV.1 conjonctival chez le bouquetin des Alpes et la chèvre domestique (C. hircus) Claire Ponsart,Bruno Garin-Bastuji,Mickaël Riou,Yann Locatelli,Alain Fadeauet al. Epidémiologie et Santé Animale, 2018, 74, pp.25-42 Article dans une revue hal-02620515v1
Climate change and human colonization triggered habitat loss and fragmentation in Madagascar Jordi Salmona,Rasmus Heller,Erwan Quéméré,Lounès Chikhi Molecular Ecology, 2017, 26 (19), pp.5203-5222. ⟨10.1111/mec.14173⟩ Article dans une revue hal-02619381v1
Immune gene variability influences roe deer natal dispersal Cécile Vanpé,Lucie Debeffe,Maxime Galan,A. J Mark Hewison,Jean-Michel Gaillardet al. Oikos, 2016, 125 (12), pp.1790-1801. ⟨10.1111/oik.02904⟩ Article dans une revue istex hal-01595001v1
Seascape and its effect on migratory life-history strategy influences gene flow among coastal brown trout (Salmo trutta) populations in the English Channel Erwan Quéméré,Jean-Luc Baglinière,Jean-Marc Roussel,Guillaume Evanno,Philip Mcginnityet al. Journal of Biogeography, 2016, 43 (3), pp.498-509. ⟨10.1111/jbi.12632⟩ Article dans une revue istex hal-01453890v1
Reduced microsatellite heterozygosity does not affect natal dispersal in three contrasting roe deer populations Cécile Vanpé,Lucie Debeffe,A. J. Mark Hewison,Erwan Quéméré,Jean-François Lemaîtreet al. Oecologia, 2015, 177 (3), pp.631-643. ⟨10.1007/s00442-014-3139-8⟩ Article dans une revue hal-02919940v1
Immunogenetic heterogeneity in a widespread ungulate: the European roe deer (Capreolus capreolus) E. Quemere,M. Galan,J. F. Cosson,F. Klein,S. Aulagnieret al. Molecular Ecology, 2015, 24 (15), pp.3873-87. ⟨10.1111/mec.13292⟩ Article dans une revue istex hal-02018985v1
An improved PCR-based method for faster sex determination in brown trout [i](Salmo trutta)[/i] and Atlantic salmon [i](Salmo salar)[/i] Erwan Quéméré,Charles Perrier,Anne-Laure Besnard,Guillaume Evanno,Jean-Luc Baglinièreet al. Conservation Genetics Resources, 2014, 6, pp.825-827. ⟨10.1007/s12686-014-0259-8⟩ Article dans une revue hal-01205112v1
Pyrenean ptarmigans decline under climatic and human influences through the Holocene. N. Bech,C. M. Barbu,E. Quéméré,C. Novoa,Jean-François Allienneet al. Heredity, 2013, 111 (5), pp.402-409. ⟨10.1038/hdy.2013.62⟩ Article dans une revue hal-00843921v1
A DNA Metabarcoding Study of a Primate Dietary Diversity and Plasticity across Its Entire Fragmented Range E. Quemere,F. Hibert,C. Miquel,E. Lhuillier,E. Rasolondraibeet al. PLoS ONE, 2013, 8 (3), pp.e58971. ⟨10.1371/journal.pone.0058971⟩ Article dans une revue hal-02281859v1
The demographic history of populations experiencing asymmetric gene flow: combining simulated and empirical data I. Paz-Vinas,Erwan Quéméré,L. Chikhi,Géraldine Loot,Simon Blanchet Molecular Ecology, 2013, 22 (12), pp.3279 - 3291. ⟨10.1111/mec.12321⟩ Article dans une revue hal-02650228v1
Genetic data suggest a natural prehuman origin of open habitats in northern Madagascar and question the deforestation narrative in this region Erwan Quéméré,Xavier Amelot,Julie Pierson,Brigitte Crouau-Roy,Lounès Chikhi Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012, 109 (32), pp.13028 - 13033. ⟨10.1073/pnas.1200153109⟩ Article dans une revue hal-02650919v1
Landscape genetics of an endangered primate species within its entire fragmented range E. Quéméré,B. Crouau-Roy,C. Rabarivola,E.E.Jr. Louis,L. Chikhi Molecular Ecology, 2010, 19, pp.1606-1621 Article dans une revue hal-00596059v1
Spatial variation in density and total size estimates in fragmented primate populations : the golden-crowned sifaka (Propithecus tattersalli) E. Quéméré,J. Champeau,A. Besolo,E. Rasolondraibe,C. Rabarivolaet al. American Journal of Primatology, 2010, 72, pp.72-80 Article dans une revue hal-00596067v1
Non invasive conservation genetics of the critically endangered golden-crowned sifaka (Propithecus tattersalli) : high diversity and significant genetic differentiation over a small range E. Quéméré,E. Louis,A. Ribéron,L. Chikhi,B. Crouau-Roy Conservation Genetics, 2010, 11, pp.675-687 Article dans une revue hal-00596007v1
Non-invasive conservation genetics of the critically endangered golden-crowned sifaka (P. tattersalli) : high diversity and significant genetic differentiation over a small range. Erwan Quéméré,Ed. Louis,Alexandre Ribéron,Lounès Chikhi,Brigitte Crouau-Roy Conservation Genetics, 2009, pp.0. ⟨10.1007/S10592-009-9837-9⟩ Article dans une revue istex hal-00429367v1

Communication dans un congrès (9)

Diving deep into kelp forest food webs using dietary DNA metabarcoding Bonnie Bailet,Jean-Charles Leclerc,Thibaut de Bettignies,Pascal Provost,Martial Lauranset al. AquaEcomics 2025: Exploring Aquatic Ecology through Omics, INRAE CAARTEL; Université Savoie Mont-Blanc, Mar 2025, Evian-Les-Bains, France Communication dans un congrès hal-05311887v1
Diving deep into kelp forest food webs using dietary DNA metabarcoding Erwan Quéméré,Bonnie Bailet,Thibaut de Bettignies,Pascal Provost,Turpin Yanniset al. SFE2, International Congress in Ecology and Evolution, Nov 2024, Lyon, France Communication dans un congrès hal-05312241v1
A toolbox to assess the spatio-temporal dynamics of Atlantic salmon recolonization after dam removal on the Sélune River (Normandy, France) Emilien Lasne,François Martignac,Erwan Quéméré,Zoé Raphalen,Alan Bazinet al. Free Flow Conference, Apr 2024, Groningen, Netherlands Communication dans un congrès hal-05209171v1
Feline ecology in French Guiana: a Participatory Sciences and molecular non-invasive approach Niklas Tysklind,Stéphanie Barthe,Valérie Troispoux,Maxime Galan,Erwan Guichouxet al. Labex CEBA annual meeting 2024, LabEx CEBA, Oct 2024, Cayenne, French Guiana Communication dans un congrès hal-04736342v1
A toolbox to assess the spatio-temporal dynamics of Atlantic salmon recolonization after dam removal on the Sélune River (Normandy, France) Emilien Lasne,François Martignac,Erwan Quéméré,Zoé Raphalen,Morgan Druetet al. 15th International Symposium on Ecohydraulics and Fish Passage, May 2024, Quebec, Canada Communication dans un congrès hal-05209192v1
Comparison of Rev.1 live vaccine innocuousness between Alpine ibex (&lt;em&gt;Capra ibex&lt;/em&gt;) and domestic goats (&lt;em&gt;Capra hircus&lt;/em&gt;): an unexpected strong species effect Claire Ponsart,Mickaël Riou,Yann Locatelli,Alain Fadeau,M. Jayet al. 13. European Wildlife Disease Association Conference (EWDA), Aug 2018, Larissa, Greece Communication dans un congrès hal-02735131v1
Analyse génétique et immunogénétique de la population de bouquetins (Capra ibex) du massif du Bargy en lien avec l’infection brucellique Erwan Quéméré,Sophie Rossi,Yvette Game,Élodie Petit,Maxime Galanet al. Journée AEEMA, May 2018, Maisons-Alfort, France Communication dans un congrès hal-04682130v1
Vaccination anti-brucellique du bouquetin des Alpes (&lt;em&gt;Capra ibex&lt;/em&gt;), une option pour l'assainissement du massif du Bargy ? Résultats d'une première expérimentation visant à comparer le niveau d'innocuité du vaccin REV.1 conjonctival chez le bouquetin des Alpes et la chèvre domestique (&lt;em&gt;C. hircus&lt;/em&gt;) Claire Ponsart,Bruno Garin-Bastuji,Mickaël Riou,Yann Locatelli,Alain Fadeauet al. Journées de l'AEEMA 2018, Association pour l'Etude de l'Epidémiologie des Maladies Animales (AEEMA). FRA., May 2018, Maisons-Alfort, France Communication dans un congrès hal-02787527v1
Ecologie trophique de l’écrevisse de Louisiane Procambarus clarkia et de ses prédateurs potentiels dans le marais de Brière Jean-Marc Roussel,Jean-Marc Paillisson,Julien Cucherousset,Nicolas Poulet,Jean-Patrice Damienet al. 2ème édition des Rencontres Rennaises ‘Invasions Biologiques’, UMR CNRS 6553 ECOBIO, Nov 2013, Rennes, France Communication dans un congrès hal-01102895v1

Poster de conférence (5)

Diving deep into kelp forest food webs using dietary DNA metabarcoding Bonnie Bailet,Jean‐charles Leclerc,Thibaut de Bettignies,Pascal Provost,Yannis Turpinet al. 14th International Temperate Reefs Symposium, Jul 2025, Brest, France. Poster de conférence hal-05149858v1
Enhancing neotropical fish monitoring using dietary DNA of detrivorous natural samplers Baptiste Bonnet,Céline Condachou,Gilles Lassalle,Anne-Laure Besnard,Jean-Marc Rousselet al. ID-ADN : L'ADN pour identifier et suivre la biodiversité : avancées, méthodes et données pour la recherche, les collections et les politiques publiques, Nov 2025, Paris, France Poster de conférence hal-05311964v1
New knowledge acquired from the French Alpine ibex (&lt;i&gt;Capra ibex&lt;/i&gt;), a singular wild reservoir of &lt;i&gt;Brucella infection&lt;/i&gt; Claire Ponsart,Guillaume Girault,P. Marchand,S. Lambert,Erwan Quéméréet al. 72th annual brucellosis Research Conference, 2019, Chicago, United States. Congrès international (poster) Poster de conférence hal-04952455v1
Innocuité du vaccin anti-brucellique Rev.1 chez le bouquetin des Alpes Mickaël Riou,Claire Ponsart,Yann Locatelli,Alain Fadeau,Marine Jaÿet al. 14. Congrès national de la Société Française de Microbiologie (SFM), Oct 2018, Paris, France. , 2018 Poster de conférence hal-02738256v1
Coupler isotopes stables et métabarcoding alimentaire pour l’analyse des réseaux trophiques S. Launey,Erwan Quéméré,Anne Tréguier,Jean-Marc Paillisson,A.L. Besnardet al. 2ème Colloque de Génomique Environnementale, Nov 2013, Rennes, France. , 2013 Poster de conférence hal-01103963v1

Rapport (2)

Rapport d'activités 2024 de l'Observatoire des biocénoses aquatiques de la Sélune Alan Bazin,Thibaut Beauverger,Anthony Acou,Flavie Amilien,Ivan I. Bernezet al. INRAE. 2025, 67 p Rapport hal-05167013v1
Expérimentation visant à comparer le niveau d’innocuité du vaccin Rev.1 conjonctival chez le bouquetin des Alpes (&lt;em&gt;Capra ibex&lt;/em&gt;) et la chèvre domestique (&lt;em&gt;Capra hircus&lt;/em&gt;) Claire Ponsart,Mickaël Riou,Yann Locatelli,Alain Fadeau,M. Jayet al. [0] 2017, 55 p Rapport hal-02787530v1