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Estelle Chaix

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Publications

claire-nedellec
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Bacteria Biotope at BioNLP Open Shared Tasks 2019

Robert Bossy , Louise Deleger , Estelle Chaix , Mouhamadou Ba , Claire Nédellec
5th Workshop on BioNLP Open Shared Tasks BioNLP-OST@EMNLP-IJCNLP 2019, Association for Computational Linguistics, Jin-Dong Kim; Claire Nédellec; Robert Bossy; Louise Deléger, Nov 2019, Hong-Kong, Hong Kong SAR China. ⟨10.18653/v1/D19-5719⟩
Communication dans un congrès hal-02437609v1

A text mining approach to enhance knowledge of food microorganisms

Estelle Chaix , Robert R. Bossy , Louise Deleger , Claire Nédellec
Next Generation Challenges in Food Microbiology, FoodMicro, Aug 2018, Athens, Greece
Communication dans un congrès hal-04420417v1

Recovering the complexity in scientific knowledge: towards automatically reconstructing the maize floral transition gene regulatory network

Adrienne Ressayre , Natalia Conde E Silva , Catherine Damerval , Fabien Chardon , Yves Deveaux
International Conférence on Ecological Science, Oct 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04420441v1
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L'ontologie OntoBiotope pour l'étude de la biodiversité microbienne

Claire Nédellec , Estelle Chaix , Robert Bossy , Louise Deleger , Sandra Derozier
EGC'2018: 18èmes Conférence Internationale sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances, Jan 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02737399v1

Reconstruction and visualisation of gene regulatory networks from different provenances : application at Arabidopsis thaliana

Estelle Chaix , Robert Bossy , Claire Nédellec
BLAH4, Jan 2018, Tokyo, Japan. 2 p
Communication dans un congrès hal-02786388v1

Florilège: a database gathering microbial phenotypes of food interest

Hélène Falentin , Estelle Chaix , Bedis Dridi , Philippe Bessieres , S Buchin
2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01607327v1
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Text mining tools for extracting information about microbial biodiversity in food

Estelle Chaix , Louise Deleger , Robert Bossy , Claire Nédellec
Microbial Spoilers in Food 2017, Association pour le Développement de la Recherche Appliquée aux Industries Agricoles et Alimentaires (ADRIA). FRA., Jun 2017, Quimper, France. pp.95
Communication dans un congrès hal-01602552v1
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Text-mining needs of the food microbiology research community

Estelle Chaix , Sophie Aubin , Louise Deleger , Claire Nédellec
2017 EFITA WCCA Congress, Jul 2017, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01580677v1

Integration of Alvis within the OpenMinTeD platform as Galaxy utilities

Jean-Baptiste Bohuon , Mouhamadou Ba , Estelle Chaix , Robert Bossy , Claire Nédellec
Galaxy Community Conference, Jun 2017, Montpellier, France. pp.1, ⟨10.5281/zenodo.200370⟩
Communication dans un congrès hal-01556276v1
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Text-mining and ontologies: new approaches to knowledge discovery of microbial diversity

Claire Nédellec , Robert Bossy , Estelle Chaix , Louise Deleger
4th International Conference on Microbial Diversity 2017, Oct 2017, Bari, Italy
Communication dans un congrès hal-02736151v1

Overview of the bacteria biotope task at BioNLP shared task

Louise Deleger , Robert Bossy , Estelle Chaix , Mouhamadou Ba , Arnaud Ferré
BioNLP Shared Task, Aug 2016, Berlin, Germany. pp.101
Communication dans un congrès hal-01455857v1

Shared Task SeeDev : Extraction de régulations impliquées dans le développement de la graine d’Arabidopsis thaliana à partir de publications scientifiques

Estelle Chaix , Bertrand Dubreucq , Dialekti Valsamou , Abdelhak Fatihi , Louise Deleger
Les journées Bioinformatique de l'Inra, Mar 2016, Montpellier, France. pp.1
Communication dans un congrès hal-01455855v1
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OntoBiotope: une ontologie pour croiser les habitats microbiens avec les analyses de génomes.

Robert Bossy , Estelle Chaix , Louise Deleger , Arnaud Ferré , Mouhamadou Ba
Les journées Bioinformatique de l'Inra, Mar 2016, Montpellier, France. pp.1
Communication dans un congrès hal-01455856v1
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Overview of the regulatory network of plant seed development (SeeDev) task at the BioNLP shared task 2016

Estelle Chaix , Bertrand Dubreucq , Abdelhak Fatihi , Dialekti Valsamou , Robert Bossy
BioNLP Shared Task, Aug 2016, Berlin, Germany. pp.113
Communication dans un congrès hal-01455854v1

Information extraction challenge Gene Regulation Network in Arabidopsis thaliana (GRNA)

Estelle Chaix , Bertrand Dubreucq , Dialekti Valsamou , Abdelhak Fatihi , Robert Bossy
Paris-Saclay Center for Data Science: Open Software Initiative (OSI), Oct 2015, Orsay, France. pp.14 slides, ⟨10.13140/RG.2.1.4286.6326⟩
Communication dans un congrès hal-01603453v1

Information extraction from articles for the elaboration of the regulatory networks involved in Arabidopsis seed development

Bertrand Dubreucq , Dialekti Valsamou , Abdelhak Fatihi , Estelle Chaix , Robert Bossy
26th International Conference on Arabidopsis Research, Jul 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01524850v1
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Knowledge model of regulatory networks involved in Arabidopsis seed development for information extraction and integration from text

Estelle Chaix , Bertrand Dubreucq , Dialekti Valsamou , Abdelhak Fatihi , Robert Bossy
BioCreative 5, Sep 2015, Madrid, Spain
Communication dans un congrès hal-01512197v1
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Omnicrobe : une base de données d’habitats et de phénotypes microbiens

Hélène Falentin , Olivier Harlé , Sandra Derozier , Louise Deléger , Estelle Chaix
23ème édition du colloque du Club des Bactéries Lactiques, Jun 2022, Rennes, France. , 2022
Poster de conférence hal-03694214v1
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Florilege, a database gathering microbial habitats, phenotypes and uses

Sandra Derozier , Louise Deleger , Estelle Chaix , Reda Mekdad , Mouhamadou Ba
JOBIM 2020, Jun 2020, Montpellier, France
Poster de conférence hal-02904156v1
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FLORILEGE: an integrative database using text mining and ontologies

Estelle Chaix , Sandra Derozier , Louise Deleger , Hélène Falentin , Jean-Baptiste Bohuon
JOBIM 2018, Jul 2018, Marseille, France. , 2018, ABSTRACTS JOBIM 2018
Poster de conférence hal-01827946v1
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Florilege : a database gathering microbial phenotypes of food interest

Hélène Falentin , Estelle Chaix , Bedis Dridi , Philippe Bessieres , S Buchin
4th International Conference on Microbial Diversity 2017, Oct 2017, Bari, Italy. , 2017
Poster de conférence hal-01651302v1