Etienne Baudrier Maître de conférence en informatique HDR

Identifiants chercheurs

IdHAL :

etienne-baudrier

ORCID :

0000-0002-2038-9434

IdRef :

103882685

Publications

Article dans une revue (18)

Unsupervised domain adaptation in biomedical images segmentation with guided diffusion generative prior Alexandre Stenger,Étienne Baudrier,Nicolas Passat,Benoît Naegel IEEE Transactions on Image Processing, In press, ⟨10.1109/TIP.2026.3678763⟩ Article dans une revue hal-05545186v1
Multiview point cloud registration with anisotropic and space-varying localization noise Denis Fortun,Etienne Baudrier,Fabian Zwettler,Markus Sauer,Sylvain Faisan SIAM Journal on Imaging Sciences, 2025, 18 (1), pp.280-307. ⟨10.1137/24M1632401⟩ Article dans une revue hal-03863490v1
RESAMPL-UDA: Leveraging foundation models for unsupervised domain adaptation in biomedical images Alexandre Stenger,Étienne Baudrier,Benoît Naegel,Nicolas Passat Pattern Recognition Letters, 2025, 196, pp.221-227. ⟨10.1016/j.patrec.2025.06.007⟩ Article dans une revue hal-05104207v1
DeepSCEM: A User‐Friendly Solution for Deep Learning‐Based Image Segmentation in Cellular Electron Microscopy Cyril Meyer,Victor Hanss,Etienne Baudrier,Benoît Naegel,Patrick Schultz Biology of the Cell, 2025, 117 (9), ⟨10.1111/boc.70032⟩ Article dans une revue hal-05459294v1
Guest Editorial: Special Issue on Discrete Geometry and Mathematical Morphology Étienne Baudrier,Adrien Krähenbühl,Étienne Le Quentrec,Benoit Naegel Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2023, 65, pp.687-688. ⟨10.1007/s10851-023-01160-z⟩ Article dans une revue hal-04217638v1
Fast and robust single particle reconstruction in 3D fluorescence microscopy Thibaut Eloy,Étienne Baudrier,Marine Laporte,Virginie Hamel,Paul Guichardet al. IEEE Transactions on Computational Imaging, 2023, 9, pp.636 - 648. ⟨10.1109/TCI.2023.3266996⟩ Article dans une revue hal-04010700v1
iU-ExM: nanoscopy of organelles and tissues with iterative ultrastructure expansion microscopy Vincent Louvel,Romuald Haase,Olivier Mercey,Étienne Baudrier,Thibaut Eloyet al. Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.7893. ⟨10.1038/s41467-023-43582-8⟩ Article dans une revue hal-04872814v1
Monotonic sampling of a continuous closed curve from its Gauss digitization. Application to length estimation Étienne Le Quentrec,Loïc Mazo,Étienne Baudrier,Mohamed Tajine Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2022, 64 (8), pp.869-891. ⟨10.1007/s10851-022-01098-8⟩ Article dans une revue hal-02987858v2
Local Turn-Boundedness, a curvature control for continuous curves with application to digitization Etienne Le Quentrec,Loïc Mazo,Étienne Baudrier,Mohamed Tajine Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2020, 62 (5), pp.673-692. ⟨10.1007/s10851-020-00952-x⟩ Article dans une revue hal-02891118v1
Combinatorics of the Gauss digitization under translation in 2D Etienne Baudrier,Loïc Mazo Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2018, 61, pp.224-236. ⟨10.1007/s10851-018-0846-5⟩ Article dans une revue hal-01853991v1
Object digitization up to a translation Loïc Mazo,Étienne Baudrier Journal of Computer and System Sciences, 2018, 95, pp.193-203. ⟨10.1016/j.jcss.2017.08.001⟩ Article dans une revue hal-01384377v2
Moment-based angular difference estimation between two tomographic projections in 2D and 3D Minh Son Phan,Etienne Baudrier,Loïc Mazo,Mohamed Tajine Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2017, 57 (2), pp.164-182. ⟨10.1007/s10851-016-0673-5⟩ Article dans une revue hal-01337071v1
Non-local length estimators and concave functions Loïc Mazo,Étienne Baudrier Theoretical Computer Science, 2017, Volume 690, pp.73-90. ⟨10.1016/j.tcs.2017.06.005⟩ Article dans une revue hal-01346909v2
A tomographical reconstruction method from unknown direction projections for 2D gray-level images Bassem Ben Cheikh,Étienne Baudrier,Gabriel Frey Pattern Recognition Letters, 2017, 86, pp.49-55. ⟨10.1016/j.patrec.2016.11.023⟩ Article dans une revue istex hal-05483231v1
Megavoltage 2D topographic imaging: An attractive alternative to megavoltage CT for the localization of breast cancer patients treated with TomoDirect Philippe Meyer,Fabien Le Pennec,Susanta K. Hui,Nicolas Dehaynin,Delphine Jarnetet al. Physica Medica European Journal of Medical Physics, 2017, 39, pp.33-38. ⟨10.1016/j.ejmp.2017.06.015⟩ Article dans une revue istex hal-04213000v1
Non-local estimators: a new class of multigrid convergent length estimators Loïc Mazo,Etienne Baudrier Theoretical Computer Science, 2016, 645, pp.128-146. ⟨10.1016/j.tcs.2016.07.007⟩ Article dans une revue hal-01058445v2
Polygonal estimation of planar convex-set perimeter from its two projections Étienne Baudrier,Mohamed Tajine,Alain Daurat Discrete Applied Mathematics, 2013, 161 (15), pp.2252--2268. ⟨10.1016/j.dam.2012.07.005⟩ Article dans une revue istex hal-05398246v1
Binary-image comparison with local-dissimilarity quantiﬁcation Étienne Baudrier,Frédéric Nicolier,Gilles Millon,Su Ruan Pattern Recognition, 2008, 41 (5), pp. 1461-1478. ⟨10.1016/j.patcog.2007.07.011⟩ Article dans une revue istex hal-00673692v1

Communication dans un congrès (25)

Label-constrained unsupervised domain adaptation for semantic segmentation with diffusion models Alexandre Stenger,Étienne Baudrier,Benoît Naegel,Nicolas Passat International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing (ICASSP), 2025, Hyderabad, India. ⟨10.1109/ICASSP49660.2025.10888617⟩ Communication dans un congrès hal-04852579v1
First Results on Locally Turn-Bounded Surfaces in the 3D Euclidean Space Lysandre Macke,Étienne Baudrier,Étienne Le Quentrec Discrete Geometry and Mathematical Morphology. DGMM 2025, Nov 2025, Groningen, Netherlands, Netherlands. pp.60-73, ⟨10.1007/978-3-032-09544-2_5⟩ Communication dans un congrès hal-05237782v1
A survey on 2D Euclidean curves with new results Étienne Le Quentrec,Étienne Baudrier,Clément Jacquot International Conference on Discrete Geometry and Mathematical Morphology (DGMM), Florence, Italy, 2024, Florence, Italy Communication dans un congrès hal-04440313v1
Particle detection based on few shot learning in 3D fluorescence microscopy Luc Vedrenne,Étienne Baudrier,Denis Fortun International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), May 2024, Athenes, Greece Communication dans un congrès hal-04785953v1
Fast and interpretable unsupervised domain adaptation for FIB-SEM cell segmentation Alexandre Stenger,Luc Vedrenne,Patrick Schultz,Sylvain Faisan,Étienne Baudrieret al. International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Carthagena, Colombia, april 2023, Apr 2023, Cartagena, Colombia. ⟨10.1109/ISBI53787.2023.10230327⟩ Communication dans un congrès hal-04017099v1
Adaptation de domaine par une méthode d'apprentissage profond parcimonieuse. Application à la segmentation d'images biomédicales. Alexandre Stenger,Luc Vedrenne,Patrick Schultz,Sylvain Faisan,Benoît Naegelet al. ORASIS 2023, Laboratoire LIS, UMR 7020, May 2023, Carqueiranne, France Communication dans un congrès hal-04219289v1
Combining max-tree and CNN for segmentation of cellular FIB-SEM images Cyril Meyer,Étienne Baudrier,Patrick Schultz,Benoit Naegel Fourth International Workshop, RRPR 2022, Montreal, Canada, August 21, 2022, Aug 2022, Montreal, Canada. ⟨10.1007/978-3-031-40773-4_7⟩ Communication dans un congrès hal-04352017v1
Stacked PointNets for alignment of particles with cylindrical symmetry in single molecule localization microscopy Youbo Fan,Sylvain Faisan,Étienne Baudrier,Fabian Zwettler,Markus Saueret al. International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2021, Nice, France. ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9434116⟩ Communication dans un congrès hal-03453438v1
Locally turn-bounded curves are quasi-regular Etienne Le Quentrec,Loic Mazo,Etienne Baudrier,Mohamed Tajine First International Joint Conference, DGMM 2021, Uppsala, Sweden, May 24–27, 2021, May 2021, Uppsala, Sweden. ⟨10.1007/978-3-030-76657-3_14⟩ Communication dans un congrès hal-03245638v1
Automatic multi class organelles segmentation for cellular FIB-SEM images Cyril Meyer,Véronique Mallouh,Danièle Spehner,Etienne Baudrier,Patrick Schultzet al. International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2021, En ligne, France. ⟨10.1109/ISBI48211.2021.9434075⟩ Communication dans un congrès hal-03238132v1
Local turn-boundedness: a curvature control for a good digitization Etienne Le Quentrec,Loïc Mazo,Etienne Baudrier,Mohamed Tajine 21st IAPR International Conference on Discrete Geometry for Computer Imagery, Mar 2019, Paris, France Communication dans un congrès hal-01898138v1
Radial Function Based Ab-Initio Tomographic Reconstruction for Cryo Electron Microscopy Yves Michels,Etienne Baudrier,Loïc Mazo 2018 25th IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Oct 2018, Athens, Greece. ⟨10.1109/ICIP.2018.8451792⟩ Communication dans un congrès hal-01909730v1
Détection des courts-circuits pour la réduction de dimension basée sur les graphes de voisinages Yves Michels,Étienne Baudrier GRETSI 2017, Sep 2017, Nice, France Communication dans un congrès hal-01548619v1
Study on the digitization dual combinatorics and convex case Loïc Mazo,Étienne Baudrier Discrete Geometry for Computer Imagery, Sep 2017, Vienna, Austria. ⟨10.1007/978-3-319-66272-5⟩ Communication dans un congrès hal-01497127v1
Retrieving the parameters of cryo Electron Microscopy dataset in the heterogeneous ab-initio case Yves Michels,Etienne Baudrier ICIP 2016, Sep 2016, Phoenix, United States. ⟨10.1109/ICIP.2016.7532948⟩ Communication dans un congrès hal-01362021v1
Joint 3D alignment-reconstruction multi-scale approach for cryo electron tomography Hmida Rojbani,Etienne Baudrier,Benoît Naegel,Loïc Mazo,Atef Hamouda IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2016), Apr 2016, Prague, Czech Republic. ⟨10.1109/ISBI.2016.7493460⟩ Communication dans un congrès hal-01318729v1
Angular Uncertainty Refinement and Image Reconstruction Improvement in Cryo-electron Tomography Hmida Rojbani,Etienne Baudrier,Benoît Naegel,Loïc Mazo,Atef Hamouda International Conference on Computer Vision Theory and Applications, Feb 2016, Rome, Italy. ⟨10.5220/0005680600940100⟩ Communication dans un congrès hal-01910150v1
Curve Digitization Variability Etienne Baudrier,Loïc Mazo 19th IAPR International Conference on Discrete Geometry for Computer Imagery (DGCI 2016), Apr 2016, Nantes, France. ⟨10.1007/978-3-319-32360-2_5⟩ Communication dans un congrès hal-01314386v1
Estimation of angular difference between tomographic projections taken at unknown directions in 3D Minh Son Phan,Etienne Baudrier,Loïc Mazo,Mohamed Tajine 2015 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Sep 2015, Quebec City, France. ⟨10.1109/ICIP.2015.7350762⟩ Communication dans un congrès hal-01910167v1
Joint direction and volume tomographical Ab-initio reconstruction for electron microscopy Bassem Ben Cheikh,Etienne Baudrier,Gabriel Frey 12th International Symposium on BIOMEDICAL IMAGING: From Nano to Macro, Apr 2015, New-York, United States. pp.1040-1043, ⟨10.1109/ISBI.2015.7164049⟩ Communication dans un congrès hal-01314398v1
Angular difference measure between tomographic projections taken at unknown directions in 2D Minh-Son Phan,Etienne Baudrier,Loïc Mazo,Mohamed Tajine 2014 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Oct 2014, Paris, France. ⟨10.1109/ICIP.2014.7025348⟩ Communication dans un congrès hal-01910194v1
About multigrid convergence of some length estimators Loic Mazo,Etienne Baudrier Discrete Geometry for Computer Imagery, Sep 2014, Siena, Italy. pp.214-225, ⟨10.1007/978-3-319-09955-2_18⟩ Communication dans un congrès hal-00990694v1
Camera motion influence on dynamic saliency central bias Etienne Baudrier,Vincent Rosselli,Mohamed-Chaker Larabi ICASSP, Apr 2009, Taipei, Taiwan. pp 817-820 Communication dans un congrès hal-00467959v1
A Perceptual Image Quality Evaluation based on Local Spatial Information Nathalie Girard,Etienne Baudrier,Jean-Marc Ogier GREC 2009 - Eight IAPR International Workshop on Graphics Recognition, Jul 2009, La Rochelle, France. pp.353-358 Communication dans un congrès hal-00411265v1
Une méthode de comparaison d'images binaires quantifiant les dissimilarités locales Application à la classification d'impressions anciennes Etienne Baudrier,Gilles Millon,Frédéric Nicolier,Su Ruan Sep 2006, pp.211-215 Communication dans un congrès hal-00113595v1

Poster de conférence (4)

Comparative study about Vision-Language Models for Subcellular Electron Microscopy Segmentation Antoine Bralet,Étienne Baudrier Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM 2026), Mar 2026, Lyon, France. Poster de conférence hal-05549254v1
Adaptation de domaine pour la segmentation biomédicale à l’ère des modèles de fondation Alexandre Stenger,Étienne Baudrier,Benoît Naegel,Nicolas Passat Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM), Mar 2026, Lyon, France Poster de conférence hal-05470218v1
Vers un apprentissage non supervisé performant, le cas de la segmentation d’images biomédicales Alexandre Stenger,Étienne Baudrier,Nicolas Passat,Benoît Naegel Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM), Mar 2025, Nice, France Poster de conférence hal-04897180v1
L'hypothèse du décalage de covariable à la rencontre des modèles de diffusion pour l'adaptation de domaine non supervisée Alexandre Stenger,Étienne Baudrier,Nicolas Passat,Benoît Naegel,Patrick Schultz Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM), Mar 2024, Grenoble, France Poster de conférence hal-04440876v1

Ouvrages (2)

Discrete Geometry and Mathematical Morphology Étienne Baudrier,Benoît Naegel,Adrien Krähenbühl,Mohamed Tajine Springer International Publishing, 13493, 2022, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-031-19897-7⟩ Ouvrages hal-03838997v1
Informatique Mathématique Une photographie en 2016 Étienne Baudrier,Loïc Mazo 2016, 9782271093356 Ouvrages hal-04606547v1

Chapitre d'ouvrage (3)

First Results on Locally Turn-Bounded Surfaces in 3D Euclidean Space Lysandre Macke,Étienne Baudrier,Étienne Le Quentrec Michael H. F. Wilkinson; Jiří Kosinka. Discrete Geometry and Mathematical Morphology. 4th International Joint Conference, DGMM 2025, Groningen, The Netherlands, November 3–6, 2025, Proceedings, 16296, Springer Nature Switzerland, pp.60-73, 2025, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-032-09543-5. ⟨10.1007/978-3-032-09544-2_5⟩ Chapitre d'ouvrage hal-05237830v1
A New Image Quality Measure Considering Perceptual Information and Local Spatial Feature Nathalie Girard,Jean-Marc Ogier,Etienne Baudrier Ogier Jean-Marc, Liu Wenyin, Llados Josep. Graphics Recognition. Achievements, Challenges, and Evolution, Springer Berlin / Heidelberg, pp.242-250, 2010, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-642-13728-0⟩ Chapitre d'ouvrage hal-00497590v1
A Non-symmetrical Method of Image Local-Difference Comparison for Ancient Impressions Dating Etienne Baudrier,Nathalie Girard,Jean-Marc Ogier Liu Wenyin, Llados Josep, Ogier Jean-Marc. Graphics Recognition. Recent Advances and New Opportunities 7th International Workshop, GREC 2007, Curitiba, Brazil, September 20-21, 2007. Selected Papers), Springer Berlin / Heidelberg, pp.257-265, 2008, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-540-88188-9_24⟩ Chapitre d'ouvrage hal-00385323v1

Rapport (1)

LTB curves with Lipschitz turn are par-regular Etienne Le Quentrec,Loïc Mazo,Étienne Baudrier,Mohamed Tajine [Research Report] Laboratoire ICube, université de Strasbourg. 2021 Rapport (rapport de recherche) hal-03480735v1

Thèse (1)

Comparaison d'images binaires reposant sur une mesure locale des dissimilarités. Application à la classification. Etienne Baudrier Interface homme-machine [cs.HC]. Université de Reims - Champagne Ardenne, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00011570v1