Eve Afonso

Publications

Article dans une revue (40)

Unveiling the genetics of Eurasian Lynx (Lynx lynx) in France: Insights for conservation in the Jura and Northern Alps Laurie Bedouet,Rebecca Burlaud,Marine Drouilly,Juliette Caillé,Michael Coeurdassieret al. Global Ecology and Conservation, 2026, 67, pp.e04181. ⟨10.1016/j.gecco.2026.e04181⟩ Article dans une revue hal-05594958v1
Defining biodiversity data Eric Garnier,Dominique Pelletier,Philip Roche,Rodolphe Rougerie,Eve Afonsoet al. Trends in Ecology & Evolution, 2025, 40 (8), pp.731-735. ⟨10.1016/j.tree.2025.06.004⟩ Article dans une revue hal-05230422v1
Evaluating trace elements as a conservation concern for Eurasian lynx (Lynx lynx) in Switzerland Laurie Bedouet,Marie-Pierre Ryser-Degiorgis,Stéphanie Borel,Caroline Amiot,Eve Afonsoet al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2025, 298, pp.118300. ⟨10.1016/j.ecoenv.2025.118300⟩ Article dans une revue hal-05068062v1
Assessing the role of individual foxes in environmental contamination with Echinococcus multilocularis through faecal samples Abdou Malik da Silva,Eve Afonso,Francis Raoul,Patrick Giraudoux,Marina Mergeyet al. International Journal for Parasitology, 2024, 54 (7), pp.321-332. ⟨10.1016/j.ijpara.2024.03.003⟩ Article dans une revue hal-04603452v1
Conservation du Rhinopithèque de Biet (Rhinopithecus bieti) et tourisme animalier : quels enjeux ? Patrick Giraudoux,Ève Afonso,Céline Clauzel,Cécile Callou,Li Li Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2024, epub, pp.1-16. ⟨10.3406/bavf.024.71106⟩ Article dans une revue hal-04757966v2
Pervasive exposure of wild small mammals to legacy and currently used pesticide mixtures in arable landscapes Clémentine Fritsch,Brice Appenzeller,Louisiane Burkart,Michael Coeurdassier,Renaud Scheifleret al. Scientific Reports, 2022, 12, pp.1-23. ⟨10.1038/s41598-022-19959-y⟩ Article dans une revue hal-04193413v1
Creating small food-habituated groups might alter genetic diversity in the endangered Yunnan snub-nosed monkey Eve Afonso,Rong Fu,Amaël Dupaix,Anne-Claude Goydadin,Zhonghua Yuet al. Global Ecology and Conservation, 2021, 26, pp.e01422. ⟨10.1016/j.gecco.2020.e01422⟩ Article dans une revue hal-03174983v1
Feeding sites promoting wildlife-related tourism might highly expose the endangered Yunnan snub-nosed monkey (Rhinopithecus bieti) to parasite transmission Eve Afonso,Rong Fu,Amaël Dupaix,Anne-Claude Goydadin,Zhonghua Yuet al. Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.15817. ⟨10.1038/s41598-021-95166-5⟩ Article dans une revue hal-03358485v1
Prevalence of hematozoan parasites in Red Kite nestlings from France Michael Coeurdassier,Nicolas Bassin,Thibaut Powolny,Christophe Morin,Eve Afonso Wilson journal of ornithology, 2021, 162 (2), pp.521-527. ⟨10.1007/s10336-020-01838-w⟩ Article dans une revue hal-03278548v1
Behavioural responses of breeding arctic sandpipers to ground-surface temperature and primary productivity Nicolas Meyer,Loïc Bollache,Matthias Galipaud,Jérôme Moreau,François-Xavier Dechaume-Moncharmontet al. Science of the Total Environment, 2021, 755 (2), pp.142485. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.142485⟩ Article dans une revue hal-02986001v1
Numerical response of predators to large variations of grassland vole abundance and long‐term community changes Patrick Giraudoux,Aurélien Levret,Eve Afonso,Michael Coeurdassier,Geoffroy Couval Ecology and Evolution, 2020, 10 (24), pp.14221-14246. ⟨10.1002/ece3.7020⟩ Article dans une revue hal-03011763v1
Nest attentiveness drives nest predation in arctic sandpipers Nicolas Meyer,Loïc Bollache,François‐xavier Dechaume‐moncharmont,Jérôme Moreau,Eve Afonsoet al. Oikos, 2020, 129 (10), pp.1481-1492. ⟨10.1111/oik.07311⟩ Article dans une revue hal-02961741v1
Suivi à long-terme de la réponse numérique des prédateurs aux grandes variations d’abondance de campagnols prairiaux dans le Val d’Usiers, Massif du Jura Patrick Giraudoux,Aurélien Levret,Eve Afonso,Michael Coeurdassier,Geoffroy Couval Bourgogne-Franche-Comté Nature, 2020, 32, pp.151-168 Article dans une revue hal-04454453v1
Spatio-temporal trends in richness and persistence of bacterial communities in decline-phase water vole populations Petra Villette,Eve Afonso,Geoffroy Couval,Aurélien Levret,Maxime Galanet al. Scientific Reports, 2020, 10, pp.9506. ⟨10.1038/s41598-020-66107-5⟩ Article dans une revue hal-02876769v1
Long-term retrospective assessment of a transmission hotspot for human alveolar echinococcosis in mid-west China Patrick Giraudoux,Yumin Zhao,Eve Afonso,Hongbin Yan,Jenny Knappet al. PLoS Neglected Tropical Diseases, 2019, 13 (8), ⟨10.1371/journal.pntd.0007701⟩ Article dans une revue hal-02276636v1
Are gastrointestinal parasites associated with the cyclic population dynamics of their arctic lemming hosts? Olivier Gilg,Loïc Bollache,Eve Afonso,Glenn Yannic,Niels Martin Schmidtet al. International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife, 2019, 10, pp.6-12. ⟨10.1016/j.ijppaw.2019.06.011⟩ Article dans une revue hal-02281730v1
Spatial and temporal distribution of Yunnan snub-nosed monkey, Rhinopithecus bieti, indices Rong Fu,Li Li,Zhonghua Yu,Eve Afonso,Patrick Giraudoux Mammalia, 2019, 83 (2), pp.103-109. ⟨10.1515/mammalia-2017-0168⟩ Article dans une revue hal-02521009v1
Molecular detection of Anaplasma phagocytophilum DNA in the lesser horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) guano E. Afonso,A.-C. Goydadin Epidemiology and Infection, 2018, 146 (10), pp.1253 - 1258. ⟨10.1017/S0950268818001279⟩ Article dans une revue hal-01863009v1
EWET: Data collection and interface for the genetic analysis of Echinococcus multilocularis based on EmsB microsatellite Jenny Knapp,Sylvie Damy,Jonathan Brillaud,Jean-Daniel Tissot,Jérémy Navionet al. PLoS ONE, 2017, 12 (10), pp.e0183849. ⟨10.1371/journal.pone.0183849⟩ Article dans une revue hal-01667697v1
Investigating Hybridization between the Two Sibling Bat Species Myotis myotis and M. blythii from Guano in a Natural Mixed Maternity Colony. Eve Afonso,Anne-Claude Goydadin,Patrick Giraudoux,Gilles Farny PLoS ONE, 2017, 12 (2), pp.e0170534 Article dans une revue hal-01492347v1
Consequences of organ choice in describing bacterial pathogen assemblages in a rodent population Petra Villette,Eve Afonso,Geoffroy Couval,Aurélien Levret,Maxime Galanet al. Epidemiology and Infection, 2017, 145 (14), pp.3070 - 3075. ⟨10.1017/S0950268817001893⟩ Article dans une revue hal-01665928v1
Is the lesser horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) exposed to causes that may have contributed to its decline? A non-invasive approach Eve Afonso,Pierline Tournant,Jean-Christophe Foltête,Patrick Giraudoux,Pierre-Emmanuel Baurandet al. Global Ecology and Conservation, 2016, 8, pp.123-137. ⟨10.1016/j.gecco.2016.09.002⟩ Article dans une revue hal-01368326v1
Echinococcus multilocularis in Kyrgyzstan: similarity in the Asian EmsB genotypic profiles from village populations of Eastern mole voles (Ellobius tancrei) and dogs in the Alay valley. E Afonso,J Knapp,N Tête,G Umhang,D Rieffelet al. Journal of Helminthology, 2015, pp.1-7 Article dans une revue hal-01175795v1
Blood parameters as biomarkers of cadmium and lead exposure and effects in wild wood mice (Apodemus sylvaticus) living along a pollution gradient Nicolas Tête,Eve Afonso,Ghada Bouguerra,Renaud Scheifler Chemosphere, 2015, 138, pp.940 - 946. ⟨10.1016/j.chemosphere.2014.12.031⟩ Article dans une revue hal-01377059v1
Hair as a noninvasive tool for risk assessment: do the concentrations of cadmium and lead in the hair of wood mice (Apodemus sylvaticus) reflect internal concentrations? Nicolas Tête,Eve Afonso,Nadia Crini,Séverine Drouhot,Anne-Sophie Prudentet al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2014, 108, pp.233-41. ⟨10.1016/j.ecoenv.2014.07.010⟩ Article dans une revue istex hal-01115160v1
First amplification of Eimeria hessei DNA from the lesser horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) and its phylogenetic relationships with Eimeria species from other bats and rodents Eve Afonso,Pierre-Emmanuel Baurand,Pierline Tournant,Nicolas Capelli Experimental Parasitology, 2014, 139, pp.58-62. ⟨10.1016/j.exppara.2014.02.013⟩ Article dans une revue istex hal-01115204v1
Evaluating the effect of habitat connectivity on the distribution of the lesser horseshoe bat using landscape graphs Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête Biological Conservation, 2013, 164, pp.39-49. ⟨10.1016/j.biocon.2013.04.013⟩ Article dans une revue istex hal-00815304v1
Transmission ecosystems of Echinococcus multilocularis in China and Central Asia. Patrick Giraudoux,Francis Raoul,Eve Afonso,Iskender Ziadinov,Yurong Yanget al. Parasitology, 2013, 140 (13), pp.1-12. ⟨10.1017/S0031182013000644⟩ Article dans une revue hal-00831986v1
Can Body Condition and Somatic Indices be Used to Evaluate Metal-Induced Stress in Wild Small Mammals? Nicolas Tête,Clémentine Fritsch,Eve Afonso,Michael Coeurdassier,Jean-Claude Lambertet al. PLoS ONE, 2013, 8 (6), pp.e66399. ⟨10.1371/journal.pone.0066399⟩ Article dans une revue hal-00925928v1
Environmental determinants of spatial and temporal variations in the transmission of Toxoplasma gondii in its definitive hosts. Eve Afonso,Estelle Germain,Marie-Lazarine Poulle,Sandrine Ruette,Sébastien Devillardet al. International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife, 2013, 2, pp.278-85. ⟨10.1016/j.ijppaw.2013.09.006⟩ Article dans une revue hal-00972560v1
La génétique au service de l'étude des espèces : y a-t'il des échanges entre les colonies de petits rhinolophes en Franche-Comté ? Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête L'Azuré, 2011, 12, pp.6-7 Article dans une revue hal-00815481v1
Development of a sensitive method for Toxoplasma gondii oocyst extraction in soil. Maud Lélu,Emmanuelle Gilot-Fromont,Dominique Aubert,Agnès Richaume,Eve Afonsoet al. Veterinary Parasitology, 2011, 183 (1-2), pp.59-67. ⟨10.1016/j.vetpar.2011.06.018⟩ Article dans une revue istex hal-00672164v1
Seroprevalence and factors associated with Toxoplasma gondii infection in wild boar ( Sus scrofa) in a Mediterranean island. Céline Richomme,Eve Afonso,V. Tolon,Christian Ducrot,Lénaig Haloset al. Epidemiology and Infection, 2010, 138 (9), pp.1257-1266. ⟨10.1017/S0950268810000117⟩ Article dans une revue hal-00451029v1
Local meteorological conditions, dynamics of seroconversion to Toxoplasma gondii in cats ( Felis catus) and oocyst burden in a rural environment. Eve Afonso,P. Thulliez,Emmanuelle Gilot-Fromont Epidemiology and Infection, 2010, 138, pp.1105-1113. ⟨10.1017/S0950268809991270⟩ Article dans une revue hal-00443531v1
Spatial distribution of soil contamination by Toxoplasma gondii in relation to cat defecation behaviour in an urban area. Eve Afonso,Mélissa Lemoine,Marie-Lazarine Poulle,Marie-Caroline Ravat,Stéphane Romandet al. International Journal for Parasitology, 2008, 38 (8-9), pp.1017-23. ⟨10.1016/j.ijpara.2008.01.004⟩ Article dans une revue istex hal-00373504v1
Prevalence of &lt;i&gt;Toxoplasma Gondii&lt;/i&gt; in small mammals from the ardennes region France Eve Afonso,M.-L. Poulle,M. Lemoine,I. Villena,D. Aubertet al. Folia Parasitologica, 2007, 54, pp.313-314 Article dans une revue hal-00434741v1
Toxoplasmosis in prey species and consequences for prevalence in feral cats: not all prey species are equal Eve Afonso,Philippe Thulliez,D. Pontier,Emmanuelle Gilot-Fromont Parasitology, 2007, 134 (Pt.14), pp.1963-71. ⟨10.1017/S0031182007003320⟩ Article dans une revue istex hal-00373507v1
Prevalence of Toxoplasma gondii in small mammals from the Ardennes region, France Eve Afonso,Marie-Lazarine Poulle,Mélissa Lemoine,Isabelle Villena,Dominique Aubertet al. Folia Parasitologica, 2007, 54 (4), pp.313-314. ⟨10.14411/fp.2007.041⟩ Article dans une revue hal-00373506v1
Transmission of Toxoplasma gondii in an urban population of domestic cats (Felis catus). Eve Afonso,Philippe Thulliez,Emmanuelle Gilot-Fromont International Journal for Parasitology, 2006, 36 (13), pp.1373-82. ⟨10.1016/j.ijpara.2006.07.010⟩ Article dans une revue istex hal-00373510v1
Transmission of &lt;i&gt;Toxoplasma gondii&lt;/i&gt; in an urban population of domestic cats (&lt;i&gt;Felis catus&lt;/i&gt;) Eve Afonso,P. Thulliez,Emmanuelle Gilot-Fromont International Journal for Parasitology, 2006, 36, pp.1373-1382 Article dans une revue hal-00428041v1

Chapitre d'ouvrage (3)

Conservation du Rhinopithèque de Biet Eve Afonso,Cécile Callou,Céline Clauzel,Patrick Giraudoux,Li Li Patrick Giraudoux. Socio-écosystèmes. L'indiscipline comme exigence du terrain, ISTE éditions, pp.225-258, 2022, 9781789480528 Chapitre d'ouvrage hal-03512103v1
Estimer l'impact des grandes infrastructures de transport sur la distribution des espèces : proposition et test d'un protocole méthodologique Jean-Christophe Foltête,Xavier Girardet,Céline Clauzel,Pierline Tournant,Gilles Vuidelet al. Luginbühl Yves. Infrastructures de transport terrestres, écosystèmes et paysages, des liaisons dangereuses, La documentation française, pp.201-218, 2013 Chapitre d'ouvrage hal-00875870v1
The Life Cycle of &lt;i&gt;Toxoplasma gondii&lt;/i&gt; in the Natural Environment Emmanuelle Gilot-Fromont,Maud Lélu,Marie-Laure Dardé,Céline Richomme,D. Aubertet al. Olgica Djurković Djaković. Toxoplasmosis - Recent Advances, InTech, pp.3-36, 2012, 978-953-51-0746-0. ⟨10.5772/48233⟩ Chapitre d'ouvrage hal-00820888v1

Poster de conférence (6)

Retrospective assessment of the global decline of European bats (1940s-2010s) Eve Afonso,Alexandra Michiels,Anne-Lyse Moreau,Anne-Claude Goydadin,Sylvie Damyet al. International Conference on Ecological Sciences, Ecology and Evolution : New perspectives and societal challenges, Nov 2022, Metz, France Poster de conférence hal-04986342v1
Metabarcoding of Bacterial Pathogens in a Rodent Pest: Which Organ? P. Villette,Eve Afonso,G Couval,A Levret,M. Galanet al. SMBE 2016: Society for Molecular Biology and Evolution Annual Meeting, Jul 2016, Gold Coast, Australia Poster de conférence hal-01870929v1
Spatial variability of biological and chemical contaminants in nurseries of lesser horseshoe bat : preliminary results in Franche-Comté (Eastern France) Eve Afonso,Pierline Tournant,Renaud Scheifler,Francis Raoul,Patrick Giraudoux The 60th Annual International Conference of the Wildlife Disease Association, Aug 2011, Québec, Canada. 2011 Poster de conférence hal-00815878v1
Caractérisation de la structure génétique spatiale des populations de petits rhinolophes en Franche-Comté Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête 5èmes Rencontres Chiroptères Grand Est, Mar 2011, Lorentzen, France. http://pierlinetournant.blogspot.fr/p/communications.html, 2011 Poster de conférence hal-00815858v1
Caractérisation de la connectivité des habitats et distribution du petit rhinolophe en Franche-Comté Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête Colloque nationale d'écologie scientifique, Sep 2010, Montpellier, France. 2010 Poster de conférence hal-00815861v1
Toxoplasmosis in corsican wild boar : a first epidemiological study Céline Richomme,Eve Afonso,Vincent Tolon,Lénaig Halos,Annie Alliotet al. 10. European Multicolloquium of Parasitology, Aug 2008, Paris, France. 1 p., 2008 Poster de conférence hal-02821520v1

Communication dans un congrès (13)

Retrospective assessment of the global decline of European bats (1940s-2010s) Alexandra Michiels,Anne-Lyse Moreau,Anne-Claude Goydadin,Renaud Scheifler,Isabelle Jouffroy-Bapicotet al. Historical Ecology for the Future International conference, INRA, May 2021, Metz, France Communication dans un congrès hal-04986394v1
Parental Investment in Nest Attentiveness Reduces Nest Predation in Arctic Sandpipers Nicolas Meyers,Olivier Gilg,Eve Afonso,Jérôme Moreau,Loïc Bollache 14th Ecology And Behaviour Conference, May 2019, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02961723v1
Bacterial Parasite Communities of the Fossorial Water Vole Arvicola terrestris During a Period of High Abundance: Richness and Similarity in a Dynamic World Petra Villette,Eve Afonso,Geoffroy Couval,Aurélien Levret,Jean-François Cossonet al. Rodents 2018: 6th International Conference of Rodent Biology and Management & 16th Rodens et Spatium, Sep 2018, Potsdam, Germany Communication dans un congrès hal-01870903v1
27 year monitoring of an alveolar echinococcosis hotspot in south-Gansu Patrick Giraudoux,Eve Afonso,Jenny Knapp,Wangzhong Jia,Hongbin Yanet al. XXVII World Congress of Echinococcosis, Oct 2017, Algiers, Algeria Communication dans un congrès hal-01614425v1
New approaches to description and modeling of trophic interactions: reliable allies to study trophically-transmitted parasites? Francis Raoul,Antoine Perasso,Virgile Baudrot,Benoit Valot,Eve Afonsoet al. Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China Communication dans un congrès hal-01367367v1
Non-invasive genetic tools to study wildlife populations Eve Afonso,Renaud Scheifler,Jean-Christophe Foltête,A.-C. Goydadin,Li Liet al. Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China Communication dans un congrès hal-01367363v1
27 year monitoring of an alveolar echinococcosis hotspot in south-Gansu Patrick Giraudoux,Eve Afonso,Jenny Knapp,Wangzhong Jia,Hongbin Yanet al. Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China Communication dans un congrès hal-01363734v1
Transmission ecosystems of Echinococcus multilocularis in Eurasia, with particular reference to the Alay Valley Patrick Giraudoux,Eve Afonso,Carole Bodin,Jenny Knapp,Francis Raoulet al. Research Workshop: Echinococcosis in Kyrgyzstan and the Region, Nov 2014, Bishkek, Kyrgyzstan Communication dans un congrès hal-01086211v1
Caractérisation de la structure génétique des colonies de reproduction du petit rhinolophe en Franche-Comté Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête XVIIIème Forum des Jeunes chercheurs, Sep 2012, Besançon, France Communication dans un congrès hal-00815494v1
Spatial approach of Echinococcus multilocularis transmission ecology in continental Asia Patrick Giraudoux,F. Raoul,Eve Afonso,Iskender Ziadinov,Yurong Yanget al. International Symposium for Cestode Zoonosis Control, Oct 2012, Shanghai, China Communication dans un congrès hal-00724870v1
Assessing habitat connectivity of the lesser horseshoe bat using graph theory to explain its distribution Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête VIth European Congress of Mammalogy, Jul 2011, Paris, France Communication dans un congrès hal-00610755v1
Caractérisation de la connectivité des habitats du petit rhinolophe en Franche-Comté Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête Dixième rencontres de Théo Quant, Feb 2011, Besançon, France Communication dans un congrès hal-00815625v1
La fragmentation du paysage peut elle expliquer le déclin du petit rhinolophe ? Utilisation de la théorie des graphes pour caractériser la connectivité de ses habitats Pierline Tournant,Eve Afonso,Sébastien Roué,Patrick Giraudoux,Jean-Christophe Foltête XVIIème Forum des Jeunes chercheurs, Jun 2011, Dijon, France Communication dans un congrès hal-00815619v1

Rapport (4)

Graphab 2 Jean-Christophe Foltête,Eve Afonso,Céline Clauzel,Xavier Girardet,Patrick Giraudouxet al. [Rapport de recherche] ThéMA, UMR 6049; Chrono-Environnement, UMR 6249; MSHE Ledoux, USR 3124. 2015, 96 p Rapport (rapport de recherche) hal-03106236v1
RHINO-URB. Impact de différents modèles de croissance urbaine sur la connectivité écologique et la dispersion génétique des populations, test sur le petit rhinolophe en Franche-Comté Jean-Christophe Foltête,Eve Afonso,Cécile Tannier [Rapport de recherche] Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité. 2013, pp.6 Rapport (rapport de recherche) hal-00864414v1
Paysage et biodiversité en Franche-Comté. Les chauves-souris peuvent-elles se maintenir durablement ? Exemple du petit rhinolophe Jean-Christophe Foltête,Eve Afonso,Renaud Scheifler [Rapport de recherche] Conseil Régional de Franche-Comté. 2013, pp.25 Rapport (rapport de recherche) hal-00864413v1
Graphab Jean-Christophe Foltête,Eve Afonso,Céline Clauzel,Xavier Girardet,Patrick Giraudouxet al. [Rapport de recherche] N° 0001653 – 10/2008, MSHE Ledoux, USR 3124; ThéMA, UMR 6049; Chrono-Environnement, UMR 6249. 2011, 62 p Rapport (rapport de recherche) hal-03105989v1

Thèse (1)

ETUDE DE LA DYNAMIQUE DE LA TRANSMISSION DE TOXOPLASMA GONDII DANS DES MILIEUX CONTRASTES Eve Afonso Ecologie, Environnement. Université de Reims - Champagne Ardenne, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00371738v1