Federica Calevro

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federica-calevro

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0000-0001-7856-9617

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Article dans une revue (68)

Evolutionary trajectories, early diversification and species-specific amplification of the metazoan Inhibitor of Apoptosis (IAP) repertoire Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,François Renoz,Patrice Baa-Puyouletet al. Molecular Biology and Evolution, In press, pp.msag078. ⟨10.1093/molbev/msag078/8539999⟩ Article dans une revue hal-05581229v1
Bis(monoacylglycero)phosphate protects murine RAW 264.7 macrophages against 7-Ketocholesterol-induced apoptosis and impaired autophagy Remi Lambert,Sherine Montillet,Clara Hennot,Agathe Diaz-Gonzalez,Marion Guichardet al. Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, 2026, 259, pp.106955. ⟨10.1016/j.jsbmb.2026.106955⟩ Article dans une revue hal-05525347v1
Interplay between cholesterol, Bis(monoacylglycerol)phosphate, and parasitophorous vacuole dynamics in Leishmania infantum infection of macrophages Clara Hennot,Marine Leroux,Remi Lambert,Fanny Boukherrouba,Marion Guichardet al. Biochimie, 2026, 245, pp.8-17. ⟨10.1016/j.biochi.2026.02.017⟩ Article dans une revue hal-05528508v1
Harnessing essential oil synergy to enhance the repellency of partially biobased polymer against sap-feeding hemipteran pests Sylvain Benhamou,Chrystèle Jouve,Isabelle Rahioui,Zaïnab Belgaidi,Garance Lapetouleet al. Industrial Crops and Products, 2025, 235, pp.121791. ⟨10.1016/j.indcrop.2025.121791⟩ Article dans une revue hal-05368413v1
Quantifying supply and demand in the pea aphid-Buchnera symbiosis reveals the metabolic Achilles’ heels of this interaction Léo Gerlin,Karen Gaget,Garance Lapetoule,Yohann Quivet,Patrice Baa-Puyouletet al. Metabolic Engineering, 2025, 92, pp.284 - 299. ⟨10.1016/j.ymben.2025.07.011⟩ Article dans une revue hal-05368482v1
Annotation of transcription factors, chromatin-associated factors, and basal transcription machinery in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and development of the ATFdb database, a resource for studies of transcriptional regulation Nicolas Parisot,Mélanie Ribeiro Lopes,Sergio Peignier,Patrice Baa-Puyoulet,Hubert Charleset al. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2025, 177, pp.104217. ⟨10.1016/j.ibmb.2024.104217⟩ Article dans une revue hal-04832131v1
ArtSymbioCyc, a metabolic network database collection dedicated to arthropod symbioses: a case study, the tripartite cooperation in Sipha maydis Patrice Baa-Puyoulet,Léo Gerlin,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,François Renozet al. mSystems, 2025, 10 (4), ⟨10.1128/msystems.00140-25⟩ Article dans une revue hal-04987746v1
Analysis of the impact of extrinsic and intrinsic factors on aphid locomotion using a novel machine-learning based system to track insect behavior El-Sayed Baz,Cissy Huygens,Federica Calevro,Patrick Callaerts Entomologia Generalis, 2025, 45 (2), pp.381-389. ⟨10.1127/entomologia/2025/2876⟩ Article dans une revue hal-05128815v1
Cadmium tolerance is associated with tissue-specific plasticity of metallothionein gene expression in Gammarus fossarum field populations Auréline Lalouette,Arnaud Chaumot,Louveline Lepeule,Karen Gaget,Nicolas Delormeet al. Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.13913. ⟨10.1038/s41598-025-98937-6⟩ Article dans une revue hal-05068990v1
Strong impact of orally administered BCR4 defensin on aphid survival, embryo development, and symbiotic cells in three Acyrthosiphon pisum parthenogenetic lines Hugo Terrasson,Karen Gaget,Garance Lapetoule,Isabelle Rahioui,François Renozet al. Journal of Pest Science, 2025, 98 (3), pp.1599-1612. ⟨10.1007/s10340-025-01923-0⟩ Article dans une revue hal-05127596v1
NPF signaling-dependent maintenance of metabolic homeostasis in the pea aphid is mediated by a highly selective ligand-receptor interaction and tissue-specific changes in NPF and NPFR Cissy Huygens,Mélanie Ribeiro Lopes,El-Sayed Baz,Jozef Vanden Broeck,Federica Calevroet al. Heliyon, 2025, 11 (12), pp.e43504. ⟨10.1016/j.heliyon.2025.e43504⟩ Article dans une revue hal-05111335v1
Reference genes to study the sex-biased expression of genes regulating Drosophila metabolism Sofie de Groef,Melanie Ribeiro Lopes,Mattias Winant,Emily Rosschaert,Tom Wilmset al. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.9518. ⟨10.1038/s41598-024-58863-5⟩ Article dans une revue hal-04632870v1
PacBio Hi-Fi genome assembly of Sipha maydis, a model for the study of multipartite mutualism in insects François Renoz,Nicolas Parisot,Patrice Baa-Puyoulet,Léo Gerlin,Samir Fakhouret al. Scientific Data , 2024, 11 (1), pp.450. ⟨10.1038/s41597-024-03297-x⟩ Article dans une revue hal-04632873v1
Proteogenomic reconstruction of organ-specific metabolic networks in an environmental sentinel species, the amphipod Gammarus fossarum Natacha Koenig,Patrice Baa-Puyoulet,Amélie Lafont,Isis Lorenzo-Colina,Vincent Navratilet al. Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics, 2024, 52, pp.101323. ⟨10.1016/j.cbd.2024.101323⟩ Article dans une revue hal-04704294v1
Identification and organ-specific patterns of expression of two metallothioneins in the sentinel species Gammarus fossarum Davide Degli Esposti,Auréline Lalouette,Karen Gaget,Louveline Lepeule,Zineb Chaabiet al. Comparative Biochemistry and Physiology. Part B, Biochemistry and Molecular Biology, 2024, 269, pp.110907. ⟨10.1016/j.cbpb.2023.110907⟩ Article dans une revue hal-04704318v1
GReNaDIne: A Data-Driven Python Library to Infer Gene Regulatory Networks from Gene Expression Data Pauline Schmitt,Baptiste Sorin,Timothée Frouté,Nicolas Parisot,Federica Calevroet al. Genes, 2023, 14 (2), pp.269. ⟨10.3390/genes14020269⟩ Article dans une revue hal-04045297v1
Gene Self-Expressive Networks as a Generalization-Aware Tool to Model Gene Regulatory Networks Sergio Peignier,Federica Calevro Biomolecules, 2023, 13 (3), pp.526. ⟨10.3390/biom13030526⟩ Article dans une revue hal-04154047v1
Ensemble Learning Based Gene Regulatory Network Inference Sergio Peignier,Baptiste Sorin,Federica Calevro International Journal on Artificial Intelligence Tools, 2023, 32 (5), pp.113-120. ⟨10.1142/S0218213023600059⟩ Article dans une revue hal-04044951v1
Editorial: Symbiotic organs in insects: development, metabolism, and physiological regulation Federica Calevro,Patrick Callaerts,Yu Matsuura,Anna Michalik Frontiers in Physiology, 2023, 14, pp.1248654. ⟨10.3389/fphys.2023.1248654⟩ Article dans une revue hal-04225297v1
Plant choice for oviposition in the phytophagous insect Bemisia tabaci: cytotype, including symbionts, knows best! Sylvain Benhamou,Emmanuel Desouhant,Zaïnab Belgaïdi,Hélène Henri,Fabrice Vavreet al. Animal Behaviour, 2023, 200, pp.147-157. ⟨10.1016/j.anbehav.2023.04.001⟩ Article dans une revue hal-04706544v1
Detection of Aphids on Hyperspectral Images Using One-Class SVM and Laplacian of Gaussians Sergio Peignier,Virginie Lacotte,Marie-Gabrielle Duport,Patrice Baa-Puyoulet,Jean-Christophe Simonet al. Remote Sensing, 2023, 15 (8), pp.2103. ⟨10.3390/rs15082103⟩ Article dans une revue hal-04122402v1
Discovery of an Insect Neuroactive Helix Ring Peptide from Ant Venom Valentine Barassé,Laurence Jouvensal,Guillaume Boy,Arnaud Billet,Steven Ascoëtet al. Toxins, 2023, 15 (10), pp.600. ⟨10.3390/toxins15100600⟩ Article dans une revue hal-04390519v1
Compartmentalized into Bacteriocytes but Highly Invasive: the Puzzling Case of the Co-Obligate Symbiont Serratia symbiotica in the Aphid Periphyllus lyropictus François Renoz,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Gabrielle Duport,Marie-Christine Eloyet al. Microbiology Spectrum, 2022, ⟨10.1128/spectrum.00457-22⟩ Article dans une revue hal-03704068v1
Bacteriocyte plasticity in pea aphids facing amino acid stress or starvation during development Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,François Renoz,Marie-Gabrielle Duport,Severine Balmandet al. Frontiers in Physiology, 2022, 13, pp.982920. ⟨10.3389/fphys.2022.982920⟩ Article dans une revue hal-04014003v1
The Di-Symbiotic Systems in the Aphids Sipha maydis and Periphyllus lyropictus Provide a Contrasting Picture of Recent Co-Obligate Nutritional Endosymbiosis in Aphids François Renoz,Jérôme Ambroise,Bertrand Bearzatto,Samir Fakhour,Nicolas Parisotet al. Microorganisms, 2022, 10 (7), pp.1360. ⟨10.3390/microorganisms10071360⟩ Article dans une revue hal-03738802v1
Evolutionary diversification of insulin-related peptides (IRPs) in aphids and spatiotemporal distribution in Acyrthosiphon pisum C. Huygens,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,G. Duport,S. Peignieret al. Insect Biochemistry and Molecular Biology, In press, 141, pp.103670. ⟨10.1016/j.ibmb.2021.103670⟩ Article dans une revue hal-03507324v1
Aphid BCR4 Structure and Activity Uncover a New Defensin Peptide Superfamily Karine Loth,Nicolas Parisot,Françoise Paquet,Hugo Terrasson,Catherine Sivignonet al. International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (20), pp.12480. ⟨10.3390/ijms232012480⟩ Article dans une revue hal-03862651v1
Sexual Dimorphism in Metabolic Responses to Western Diet in Drosophila melanogaster Sofie de Groef,Tom Wilms,Severine Balmand,Federica Calevro,Patrick Callaerts Biomolecules, 2022, 12 (1), pp.33. ⟨10.3390/biom12010033⟩ Article dans une revue hal-03521337v1
Data-driven Gene Regulatory Networks Inference Based on Classification Algorithms Sergio Peignier,Pauline Schmitt,Federica Calevro International Journal on Artificial Intelligence Tools, 2021, 30 (04), pp.2150022. ⟨10.1142/S0218213021500226⟩ Article dans une revue hal-03297056v1
The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae Nicolas Parisot,Carlos Vargas-Chávez,Clément Goubert,Patrice Baa-Puyoulet,Séverine Balmandet al. BMC Biology, 2021, 19 (1), pp.241. ⟨10.1186/s12915-021-01158-2⟩ Article dans une revue hal-03627264v1
At the Gate of Mutualism: Identification of Genomic Traits Predisposing to Insect-Bacterial Symbiosis in Pathogenic Strains of the Aphid Symbiont Serratia symbiotica François Renoz,Vincent Foray,Jérôme Ambroise,Patrice Baa-Puyoulet,Bertrand Bearzattoet al. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2021, 11, pp.660007. ⟨10.3389/fcimb.2021.660007⟩ Article dans une revue hal-03297041v1
Sustainable laser-based technology for insect pest control R. Gaetani,V. Lacotte,Vincent Dufour,A. Clavel,G. Duportet al. Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.11068. ⟨10.1038/s41598-021-90782-7⟩ Article dans une revue hal-03239008v1
Cytotype Affects the Capability of the Whitefly Bemisia tabaci MED Species To Feed and Oviposit on an Unfavorable Host Plant Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Hélène Henri,Hubert Charles,Pedro da Silvaet al. mBio, 2021, 12 (6), pp.1-16. ⟨10.1128/mBio.00730-21⟩ Article dans une revue hal-03432050v1
The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest Claude Rispe,Fabrice Legeai,Paul Nabity,Rosa Fernández,Arinder Aroraet al. BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.90. ⟨10.1186/s12915-020-00820-5⟩ Article dans une revue hal-02917617v1
Sawfly genomes reveal evolutionary acquisitions that fostered the mega-radiation of parasitoid and eusocial Hymenoptera Jan Philip Oeyen,Patrice Baa-Puyoulet,Joshua Benoit,Leo Beukeboom,Erich Bornberg-Baueret al. Genome Biology and Evolution, 2020, 12 (7), pp.1099-1118. ⟨10.1093/gbe/evaa106⟩ Article dans une revue hal-02618254v1
Evolutionary novelty in the apoptotic pathway of aphids Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Cissy Huygens,Sergio Peignieret al. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (51), pp.32545-32556. ⟨10.1073/pnas.2013847117⟩ Article dans une revue hal-03052353v1
Draft Genome Sequences of Two Cultivable Strains of the Bacterial Symbiont Serratia symbiotica François Renoz,Jérôme Ambroise,Bertrand Bearzatto,Patrice Baa-Puyoulet,Federica Calevroet al. Microbiology Resource Announcements, 2020, 9 (10), pp.e01579-19. ⟨10.1128/MRA.01579-19⟩ Article dans une revue hal-02505875v1
Drosophila-associated bacteria differentially shape the nutritional requirements of their host during juvenile growth Jessika Consuegra,Théodore Grenier,Patrice Baa-Puyoulet,Isabelle Rahioui,Houssam Akherrazet al. PLoS Biology, 2020, 18 (3), pp.e3000681. ⟨10.1371/journal.pbio.3000681⟩ Article dans une revue hal-02919023v1
Correction to: The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest Claude Rispe,Fabrice Legeai,Paul Nabity,Rosa Fernández,Arinder Aroraet al. BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.123. ⟨10.1186/s12915-020-00864-7⟩ Article dans une revue hal-05190973v1
Acyrthosiphon pisum Federica Calevro,Denis Tagu,Patrick Callaerts Trends in Genetics, 2019, 35 (10), pp.781-782. ⟨10.1016/j.tig.2019.07.003⟩ Article dans une revue hal-02279584v1
Bis(monoacylglycero)phosphate regulates oxysterol binding protein-related protein 11 dependent sterol trafficking Maud Arnal-Levron,Yinan Chen,Peter Greimel,Federica Calevro,Karen Gagetet al. Biochimica et Biophysica Acta Molecular and Cell Biology of Lipids, 2019, 1864 (9), pp.1247-1257. ⟨10.1016/j.bbalip.2019.05.011⟩ Article dans une revue hal-02146150v1
Identification of Plant Virus Receptor Candidates in the Stylets of Their Aphid Vectors Craig Webster,Elodie Pichon,Manuella van Munster,Baptiste Monsion,Maelle Deshouxet al. Journal of Virology, 2018, 92 (14), pp.e00432-18. ⟨10.1128/JVI.00432-18⟩ Article dans une revue hal-01922319v1
Bacteriocyte cell death in the pea aphid/ Buchnera symbiotic system Pierre Simonet,Karen Gaget,Severine Balmand,Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisotet al. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115 (8), pp.E1819 - E1828. ⟨10.1073/pnas.1720237115⟩ Article dans une revue hal-01768487v1
Bacteriocyte Reprogramming to Cope With Nutritional Stress in a Phloem Sap Feeding Hemipteran, the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum Stefano Colella,Nicolas Parisot,Pierre Simonet,Karen Gaget,Gabrielle Duportet al. Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.1498. ⟨10.3389/fphys.2018.01498⟩ Article dans une revue hal-01905508v1
Direct flow cytometry measurements reveal a fine-tuning of symbiotic cell dynamics according to the host developmental needs in aphid symbiosis Pierre Simonet,Gabrielle Duport,Karen Gaget,Michèle Weiss-Gayet,Stefano Colellaet al. Scientific Reports, 2016, 6, pp.19967. ⟨10.1038/srep19967⟩ Article dans une revue hal-01352561v1
Assessment of a 16S rRNA amplicon Illumina sequencing procedure for studying the microbiome of a symbiont-rich aphid genus Eric Jousselin,Anne-Laure Clamens,M. Galan,M. M. Bernard,Sarah Mamanet al. Molecular Ecology Resources, 2016, 16 (3), pp.628-640. ⟨10.1111/1755-0998.12478⟩ Article dans une revue istex hal-01449134v1
Disruption of phenylalanine hydroxylase reduces adult lifespan and fecundity, and impairs embryonic development in parthenogenetic pea aphids Pierre Simonet,Karen Gaget,Nicolas Parisot,Gabrielle Duport,Marjolaine Reyet al. Scientific Reports, 2016, 6, pp.1-12. ⟨10.1038/srep34321⟩ Article dans une revue hal-01388523v1
ArthropodaCyc: a CycADS powered collection of BioCyc databases to analyse and compare metabolism of arthropods Patrice Baa-Puyoulet,Nicolas Parisot,Gérard Febvay,Jaime Huerta-Cepas,Augusto F Vellozoet al. Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2016, pp.1-9. ⟨10.1093/database/baw081⟩ Article dans une revue hal-01352558v1
New insight into the RNA interference response against cathepsin-L gene in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum: Molting or gut phenotypes specifically induced by injection or feeding treatments. Panagiotis Sapountzis,Gabrielle Duport,Severine Balmand,Karen Gaget,Stéphanie Jaubert-Possamaiet al. Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2014, 51, to be published. ⟨10.1016/j.ibmb.2014.05.005⟩ Article dans une revue hal-01002574v1
Genomic analysis of the regulatory elements and links with intrinsic DNA structural properties in the shrunken genome of Buchnera Lilia Brinza,Federica Calevro,Hubert Charles BMC Genomics, 2013, 14 (1), pp.73. ⟨10.1186/1471-2164-14-73⟩ Article dans une revue hal-00788161v1
Tyrosine pathway regulation is host-mediated in the pea aphid symbiosis during late embryonic and early larval development Andréane Rabatel,Gérard Febvay,Karen Gaget,Gabrielle Duport,Patrice Baa-Puyouletet al. BMC Genomics, 2013, 14 (1), pp.235. ⟨10.1186/1471-2164-14-235⟩ Article dans une revue hal-00824527v1
A genomic reappraisal of symbiotic function in the aphid/buchnera symbiosis: reduced transporter sets and variable membrane organisations. Hubert Charles,Severine Balmand,Araceli Lamelas,Ludovic Cottret,Vicente Pérez-Brocalet al. PLoS ONE, 2011, 6 (12), pp.e29096. ⟨10.1371/journal.pone.0029096⟩ Article dans une revue hal-00659506v1
CycADS: an annotation database system to ease the development and update of BioCyc databases. Augusto F Vellozo,Amélie S Véron,Patrice Baa-Puyoulet,Jaime Huerta-Cepas,Ludovic Cottretet al. Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2011, 2011, pp.bar008. ⟨10.1093/database/bar008⟩ Article dans une revue hal-00632965v1
Multimodal dynamic response of the Buchnera aphidicola pLeu plasmid to variations in leucine demand of its host, the pea aphid Acyrthosiphon pisum. José Viñuelas,Gérard Febvay,Gabrielle Duport,Stefano Colella,Jean-Michel Fayardet al. Molecular Microbiology, 2011, 81 (5), pp.1271-1285. ⟨10.1111/j.1365-2958.2011.07760.x⟩ Article dans une revue hal-00746846v1
Genomic insight into the amino acid relations of the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, with its symbiotic bacterium Buchnera aphidicola. A. C. C. Wilson,P. D. Ashton,Federica Calevro,H. Charles,Stefano Colellaet al. Insect Molecular Biology, 2010, 19 Suppl 2 (S2), pp.249-58. ⟨10.1111/j.1365-2583.2009.00942.x⟩ Article dans une revue hal-00539196v1
Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum Iagc The International Aphid Genomics Consortium,Federica Calevro,Hubert Charles,Stefano Colella,Gérard Febvayet al. PLoS Biology, 2010, 8 (2), pp.e1000313. ⟨10.1371/journal.pbio.1000313⟩ Article dans une revue hal-00459970v1
Structure and dynamics of the operon map of Buchnera aphidicola sp. strain APS. Lilia Brinza,Federica Calevro,Gabrielle Duport,Karen Gaget,Christian Gautieret al. BMC Genomics, 2010, 11 (666), pp.666. ⟨10.1186/1471-2164-11-666⟩ Article dans une revue hal-00632959v1
Un vieux couple inséparable à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et Buchnera, sa bactérie symbiotique Yvan Rahbé,Gérard Febvay,Stefano Colella,Hubert Charles,Federica Calevro Comptes Rendus de l'Académie d'Agriculture de France, 2009, 95 (5), pp.78-78 Article dans une revue hal-02657684v1
Impact of host developmental age on the transcriptome of the symbiotic bacterium Buchnera aphidicola in the pea aphid (Acyrthosiphon pisum). John Bermingham,Andréane Rabatel,Federica Calevro,José Viñuelas,Gérard Febvayet al. Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (22), pp.7294-7. ⟨10.1128/AEM.01472-09⟩ Article dans une revue hal-00445867v1
Systemic analysis of the symbiotic function of Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum. Lilia Brinza,José Viñuelas,Ludovic Cottret,Federica Calevro,Yvan Rahbéet al. Comptes Rendus. Biologies, 2009, 332 (11), pp.1034-49. ⟨10.1016/j.crvi.2009.09.007⟩ Article dans une revue istex hal-00445861v1
Conservation of the links between gene transcription and chromosomal organization in the highly reduced genome of Buchnera aphidicola. José Viñuelas,Federica Calevro,Didier Remond,Jacques Bernillon,Yvan Rahbéet al. BMC Genomics, 2007, 8, pp.143. ⟨10.1186/1471-2164-8-143⟩ Article dans une revue hal-00373371v1
Unis pour survivre : les pucerons et leurs bactéries symbiotiques Yvan Rahbé,H. Charles,Federica Calevro,Jean-Christophe Simon,C. Rispe Biofutur, 2007, 279, pp.49-52 Article dans une revue hal-00391504v1
Different levels of transcriptional regulation due to trophic constraints in the reduced genome of Buchnera aphidicola APS N. Reymond,Federica Calevro,J. Vinuelas,N. Morin,Yvan Rahbéet al. Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (12), pp.7760-7766. ⟨10.1128/AEM.01118-06⟩ Article dans une revue hal-00391509v1
Codon usage bias and tRNA over-expression in Buchnera aphidicola after aromatic amino acid nutritional stress on its host Acyrthosiphon pisum H. Charles,Federica Calevro,J. Vinuelas,J.M. Fayard,Yvan Rahbé Nucleic Acids Research, 2006, 34 (16), pp.4583-4592. ⟨10.1093/nar/gkl597⟩ Article dans une revue hal-00391277v1
SITRANS: a web information system for microarray experiments Frederique Laforest,A. Tchounikine,T. Chaari,H. Charles,Federica Calevro Studies in Health Technology and Informatics, 2005, 116, pp.33-38 Article dans une revue hal-00391451v1
Bioinformatique des puces à ADN et application à l'analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola H. Charles,Federica Calevro,N. Reymond,Yvan Rahbé,G. Febvayet al. L'Echo des Puys, INRA Clermont-Ferrand, 2005, 79, pp.6 Article dans une revue hal-00391275v1
ROSO : Research on Optimized Oligonucleotide Probes for Microarrays N. Reymond,H. Charles,L. Duret,Federica Calevro,G. Beslonet al. Bioinformatics, 2004, 20, pp.271-273 Article dans une revue hal-00427641v1
Assessment of 35mer amino-modified oligonucleotide based microarray with bacterial samples. Federica Calevro,Hubert Charles,Nancie Reymond,Vincent Dugas,Jean-Pierre Cloarecet al. Journal of Microbiological Methods, 2004, 57 (2), pp.207-18. ⟨10.1016/j.mimet.2004.01.009⟩ Article dans une revue istex hal-00402180v1

Communication dans un congrès (144)

Decoding Gene Regulation in Alzheimer’s Disease with Transfer Learning and Explainable Machine Learning Sergio Peignier,Amanda Lo Van,Yann Meunier,Elea Pauliat,Matis Zouariet al. International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2025, Villeurbanne, France. pp.258-275, ⟨10.1007/978-3-032-01436-8_14⟩ Communication dans un congrès hal-05418773v1
Decoding Gene Regulation in Alzheimer's disease with Transfer Learning and Explainable Machine Learning Sergio Peignier,Amanda Lo Van,Yann Meunier,Elea Pauliat,Matis Zouariet al. Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2025., Sep 2025, Lyon, France. ⟨10.1007/978-3-032-01436-8_14⟩ Communication dans un congrès hal-05255057v1
Détection et segmentation automatisées de bactériocytes à partir d'images de microscopie optique Nathan Hutin,Chantal Revol-Muller,Karen Gaget,Séverine Balmand,Federica Calevroet al. Groupe de Recherche et d'Etudes de Traitement du Signal et des Images (GRETSI), Aug 2025, Strasboug, France Communication dans un congrès hal-05184270v1
Functional analysis of interactions between bed bugs and their symbionts Wolbachia and BEV-like Raphaël Jorge,Marius Poulain,Elodie Rosinski,Hélène Henri,Adil El Filaliet al. REID (réseaux écologie des interactions durables), May 2025, Lyon, France Communication dans un congrès hal-05417648v1
Specific expansion and diversification of Inhibitors of APoptosis (IAPs) support symbiont maintenance and morph-specific regulation in aphids Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Sergio Peignier,Emmanuelle Jousselinet al. XII International Symposium on Aphids (ISA), Oct 2025, Pyeongchang, South Korea Communication dans un congrès hal-05290694v1
Rôle des BCR dans le contrôle de la symbiose chez Acyrthosiphon pisum Hugo Terrasson,Karen Gaget,Séverine Balmand,Isabelle Rahioui,Garance Lapetouleet al. Wébinaire des Rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Oct 2025, Webinaire, France Communication dans un congrès hal-05417617v1
Search for key regulators of endogenous viruses replication in ichneumonid wasps through differential gene expression analysis Yael Tirlet,Mélanie Ribeiro Lopes,Véronique Jouan,Pierre-Alain Girard,Stéphanie Robinet al. 8. International Entomophagous Insects Conference (IEIC), Jul 2025, Tours, France Communication dans un congrès hal-05290690v1
The genome of G. fossarum: a genomic toolkit to investigate endocrine and metabolic disruption in amphipod sentinel species Davide Degli Esposti,Damien Hinsinger,Joao Sousa,Patrice Baa-Puyoulet,Aurélie Bérardet al. Colloque INRAE Genomics, Jun 2025, Clermon-Ferrand, France Communication dans un congrès hal-05137926v1
The genome of G. fossarum: a genomic toolkit to investigate endocrine and metabolic disruption in amphipod sentinel species Davide Degli Esposti,Damien Hinsinger,Joao Sousa,Patrice Baa-Puyoulet,Aurélie Bérardet al. 20th International Conference on Amphipoda, Sep 2025, Lodz, Poland Communication dans un congrès hal-05419622v1
Métabolisme d'une bactérie symbiotique et besoins nutritionnels de son hôte : une question d'offre et de demande ? Léo Gerlin,Patrice Baa-Puyoulet,Karen Gaget,Garance Lapetoule,Isabelle Rahiouiet al. 2nd Workshop Modélisation du Métabolisme, Mar 2024, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-04524685v1
Evolution towards a two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosis François Renoz,Karen Gaget,Hubert Charles,Nicolas Parisot,Patrice Baa-Puyouletet al. International congress of Ecology and Evolution (SFE2), Société Française d'Ecologie et d'Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04753005v1
Functional analysis of interactions between bed bugs and their symbionts Wolbachia and BEV-like Raphaël Jorge,Marius Poulain,Elodie Rosinski,Hélène Henri,Adil El Filaliet al. International congress of Ecology and Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04805333v1
Subcellular localization of BCR4, an aphid-specific defensin peptide, in the bacteriocytes of Acyrthosiphon pisum Hugo Terrasson,Karen Gaget,Séverine Balmand,Isabelle Rahioui,Patrick Callaertset al. 2nd Webinaire du réseau "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Apr 2024, Virtual, France Communication dans un congrès hal-04633387v1
Two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosis François Renoz,Karen Gaget,Hubert Charles,Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisotet al. 3rd Joint Congress on Evolutionary Biology, Jul 2024, Montreal, Canada Communication dans un congrès hal-04753845v1
BCR4, a defensin with a strong impact on aphid survival, embryo development and symbiotic cells of three Acyrthosiphon pisum lines Hugo Terrasson,Karen Gaget,Garance Lapetoule,Isabelle Rahioui,François Renozet al. 14èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04772051v1
RNAseq analysis reveals new roles for conserved metazoan pathways in the regulation of bacteriocyte dynamics Mélanie Ribeiro Lopes,Sergio Peignier,Karen Gaget,François Renoz,Patrick Callaertset al. 14èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Oct 2024, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04783705v1
Evolutionarily conserved metazoan pathways have evolved new functions and regulate bacteriocytes' dynamics in the context of symbiosis Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,Karen Gaget,François Renozet al. XXVII International Congress of Entomology, Aug 2024, Kyoto, Japan Communication dans un congrès hal-04702864v1
Evolutionarily conserved metazoan pathways have evolved new functions in the context of symbiotic interactions Federica Calevro ERATO (Evolving Symbiosis Project International Seminar Series), Ryuichi Koga et Takema Fukatsu, May 2023, Webinar, Japan Communication dans un congrès hal-04783979v1
Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich (BCR) peptides form a new aphid-specific defensin-like family and are promising regulators of aphid symbiosis Hugo Terrasson,Karine Loth,Nicolas Parisot,Françoise Paquet,Isabelle Rahiouiet al. Rencontres du Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), May 2023, Poitiers, France Communication dans un congrès hal-04633283v1
Study of host-symbionts coevolution in the whitefly Bemisia tabaci: an experimental evolution approach Hubert Charles,Hélène Henri,Zainab Belgaidi,Isabelle Rahioui,Karen Gagetet al. 13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-04524543v1
A genome-wide annotation of transcription factors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and the related database, ATFdb Nicolas Parisot,Mélanie Ribeiro Lopes,Hubert Charles,Sergio Peignier,Patrice Baa-Puyouletet al. 13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-04524595v1
Acyrthosiphon pisum tissue-specific gene regulatory network inference Sergio Peignier,Erwan Cruché,Elea Pauliat,Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisotet al. 13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-04670574v1
Deciphering growth/nutrition dynamics at the aphid – symbiont interface through metabolic modeling Léo Gerlin,Patrice Baa-Puyoulet,Karen Gaget,Isabelle Rahioui,Marie-Gabrielle Duportet al. 13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-04524579v1
The pea aphid Acyrtosiphon pisum, an emerging model for developmental and evolutionary studies Patrick Callaerts,Cissy Huygens,Federica Calevro Unconventional and emerging experimental organisms in cell and developmental biology Meeting, The Company of Biologists, Sep 2023, Surrey, United Kingdom Communication dans un congrès hal-04785423v1
Characterization of Neuropeptide F and its receptor in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum Cissy Huygens,Jasmine Donckers,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Federica Calevroet al. 13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-04670572v1
Immunolocalisation des peptides &quot;Bacteriocyte-specific cystein rich&quot; (BCR), potentiels régulateurs de la symbiose chez les pucerons Hugo Terrasson,Karen Gaget,Severine Balmand,Isabelle Rahioui,Patrick Callaertset al. 13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04633315v1
Modélisation du métabolisme et des interactions symbiotiques chez les pucerons Léo Gerlin,Patrice Baa-Puyoulet,Federica Calevro,Hubert Charles Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Villeurbane, France Communication dans un congrès hal-04121080v1
The pea aphid, Acyrthosiphon pisum: an emerging genomic model to study the cellular and molecular bases of bacterial symbiosis in insects Federica Calevro 14th BioSciences SFR Day: Top Models in Biology, SFR Biosciences, Jun 2022, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04783527v1
Plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses in the pea aphid development. Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,François Renoz,Marie-Gabrielle Duport,Severine Balmandet al. 12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France Communication dans un congrès hal-03741301v1
Réseaux de régulation géniques : Méthodes d'inférence et questions biologiques dans le modèle puceron Federica Calevro,Nicolas Parisot,Sergio Peignier Première rencontre SPE et Numérique, INRAE département SPE, May 2022, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04783124v1
Utilisation de méthodes d'apprentissage automatique pour la reconstruction et modélisation de réseaux géniques développementaux chez les bactériocytes d'insectes Sergio Peignier,Nicolas Parisot,Federica Calevro 1er séminaire Métaprogramme DIGIT-BIO, Dec 2022, Ecully, France Communication dans un congrès hal-04889858v1
Les peptides « Bacteriocyte-specific Cystein-Rich » : une nouvelle famille de défensine. Régulateurs de la symbiose chez les pucerons ? Hugo Terrasson,Karine Loth,Nicolas Parisot,Françoise Paquet,Isabelle Rahiouiet al. 9ème Journées du GDR "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Oct 2022, Amboise, France Communication dans un congrès hal-04633233v1
Peptides « Bacteriocyte-specific Cysteine Rich » (BCR) : un rôle dans le contrôle de la symbiose ? Focus sur BCR4 chez le puceron du pois. Hugo Terrasson,Karine Loth,Nicolas Parisot,Françoise Paquet,Isabelle Rahiouiet al. 12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France Communication dans un congrès hal-04771966v1
The bacteriocyte: a biological innovation to sustain and control bacterial symbionts in insect nutritional symbioses Mélanie Ribeiro Lopes,Federica Calevro Invited seminar at UMR 754 IVPC-SFR Biosciences, Nov 2022, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04670597v1
Bacteriocyte differentiation and cell death in the aphid/Buchnera symbiotic system Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Patrick Callaerts,Federica Calevro XXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland Communication dans un congrès hal-04670590v1
Sustainable laser-based technology for insect pest control R. Gaetani,V. Lacotte,Vincent Dufour,Clavel A.,Marie-Gabrielle Duportet al. 6th International Conference on Energy and Environmental Science, Jan 2022, Virtual, France Communication dans un congrès hal-03543644v1
La face cachée des LncRNAs d’Acyrthosiphon pisum Marion Cardinaud,Nicolas Parisot,Antonin Schmitz,Joris Villalba,Marie-Gabrielle Duportet al. 12ème Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés - BAPOA, May 2022, Nice, France Communication dans un congrès hal-04783582v1
The assembly of the rice weevil Sitophilus oryzae is dominated by transposable elements and shades light on the evolution of endosymbiosis in a major crop pest. Nicolas Parisot,Carlos Vargas-Chávez,Clément Goubert,Patrice Baa-Puyoulet,Severine Balmandet al. Arthropod Genomics Symposium 2022, Jun 2022, Notre Dame, United States Communication dans un congrès hal-04783673v1
Sustainable laser‑based technology for insect pest control R. Gaetani,V. Lacotte,Vincent Dufour,Alain Clavel,Marie-Gabrielle Duportet al. 5th International Conference on Software and e-Business, Dec 2021, Virtual, France. pp.11068 Communication dans un congrès hal-04772105v1
Ensemble Learning Based Gene Regulatory Network Inference Sergio Peignier,Baptiste Sorin,Federica Calevro 33rd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2021, Washington, United States. pp.113-120, ⟨10.1109/ICTAI52525.2021.00024⟩ Communication dans un congrès hal-03630485v1
Détection de pucerons par imagerie hyperspectrale en conditions de laboratoire V. Lacotte,Sergio Peignier,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Abdelaziz Heddiet al. Webinaire du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Sep 2021, Virtual, France Communication dans un congrès hal-04772039v1
Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Hélène Henri,Hubert Charles,Pedro da Silvaet al. Webinaires du Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI) 2021, 2021, Villeurbanne (virtual), France Communication dans un congrès hal-03514239v1
Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaci Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Hélène Henri,Hubert Charles,Pedro da Silvaet al. DECRYPthèse E2M2 Edition 20, May 2021, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-03514227v1
Gene Regulatory Network Inference Using Ensembles of Predictors Sergio Peignier,Baptiste Sorin,Federica Calevro 33rd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, IEEE, Nov 2021, Virtual event, United States Communication dans un congrès hal-03022606v2
The Inhibitor of APoptosis (IAP) gene family in aphids: between expansion and functional diversification Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duportet al. Webinaire du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), 2021, Villeurbanne (virtual), France Communication dans un congrès hal-03514209v1
Sustainable laser-based technology for insect pest control R. Gaetani,V. Lacotte,Vincent Dufour,Alain Clavel,Marie-Gabrielle Duportet al. International Conference on Sustainable Agriculture, Environment and Forestry, Jun 2021, London, United Kingdom Communication dans un congrès hal-04802970v1
Intégration de données multi-omiques pour l’identification d’enzymes clés du métabolisme lipidique chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarum Natacha Koenig,Patrice Baa-Puyoulet,Maxime Leprêtre,Jean-Charles Gaillard,J. Armengaudet al. GDR Ecotoxicologie, Nov 2021, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03810311v1
Evidence for high plasticity and modularity of the Inhibitor of APoptosis (IAP) repertoire in insects Mélanie Ribeiro Lopes,Federica Calevro Invited seminar at University of Pisa, Dec 2021, Pise, Italy Communication dans un congrès hal-04670594v1
Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplifications Mélanie Ribeiro Lopes,Jousselin Emmanuelle,Patrice Baa-Puyoulet,C. Huygens,Karen Gagetet al. Incontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy Communication dans un congrès hal-03514196v1
The bacteriocyte: “chamber of secrets” of insect-bacterial symbiosis Federica Calevro Earth and Life Institute - Université Catholique de Louvain, séminaire invité, Apr 2019, Louvain-la-Neuve, Belgium Communication dans un congrès hal-04904118v1
Data-driven Gene Regulatory Network Inference based on Classification Algorithms Sergio Peignier,Pauline Schmitt,Federica Calevro 31st IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2019, Portland, Oregon, United States. pp.1065-1072, ⟨10.1109/ICTAI.2019.00149⟩ Communication dans un congrès hal-02361914v1
IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphids Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Korneel Henset al. 2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomologial Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom Communication dans un congrès hal-03512999v1
Live and die another way for aphid bacteriocytes: new secrets of an ancient insect-bacterial symbiotic system Federica Calevro 2nd annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont Interaction network (PISI-net), Nov 2019, Rennes, France Communication dans un congrès hal-04904131v1
IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional characterization in aphids Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Korneel Henset al. 8th International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2019, Sitges, Spain Communication dans un congrès hal-03741297v1
Influence of symbionts on their host niche and partner's choice Sylvain Benhamou,Emmanuel Desouhant,Fabrice Vavre,Federica Calevro,Laurence Mouton 2nd annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont Interaction network (PISI-net), Apr 2019, Le Rheu, France Communication dans un congrès hal-04788476v1
Amplification des gènes codant les protéines de la famille des IAP et leur rôle dans l'homéostasie bactériocytaire Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Korneel Henset al. 11èmes rencontres du réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03741308v1
Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic system Mélanie Ribeiro Lopes,Pierre Simonet,Karen Gaget,Severine Balmand,Kurt Buhleret al. Journée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France Communication dans un congrès hal-03510629v1
Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisum Nicolas Parisot,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Patrice Baa-Puyouletet al. France-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-03514051v1
Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisum Nicolas Parisot,Stefano Colella,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duportet al. INSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-03514034v1
Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Pierre Simonet,Severine Balmandet al. 22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France Communication dans un congrès hal-03509938v1
AphidCyc, une collection de bases de données métaboliques dédiée à l'étude et la comparaison du métabolisme chez les pucerons Patrice Baa-Puyoulet,Hubert Charles,Federica Calevro 11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03510642v1
Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels Federica Calevro,Nicolas Parisot,Mélanie Ribeiro Lopes,Stefano Colella,Karen Gagetet al. 11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03514026v1
A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid aging Mélanie Ribeiro Lopes,Pierre Simonet,Karen Gaget,Severine Balmand,Nicolas Parisotet al. France-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-03514078v1
Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire Mélanie Ribeiro Lopes,Pierre Simonet,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Severine Balmandet al. 10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France Communication dans un congrès hal-03506807v1
Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet Nicolas Parisot,Pierre Simonet,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Patrice Baa-Puyouletet al. 9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France Communication dans un congrès hal-03506796v1
Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum Pierre Simonet,Severine Balmand,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Nicolas Parisotet al. 18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France Communication dans un congrès hal-03506790v1
The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes Pierre Simonet,Severine Balmand,Karen Gaget,Karine Buhler,Nicolas Parisotet al. 9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France Communication dans un congrès hal-03506794v1
Systems biology of symbiosis: from partners’ genomics to physiology of interactions Hubert Charles,Federica Calevro,Gérard Febvay,Patrice Baa-Puyoulet,Marie-Gabrielle Duportet al. First Meeting of the PRC Israel-France, Sep 2016, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-03506791v1
From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathways Patrice Baa-Puyoulet,Mathieu Labernardiere,Nicolas Parisot,Jean-Pierre Gauthier,Gérard Febvayet al. JOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01208786v1
Direct flow cytometry measurements and cell imaging reveal a fine-tuning of endosymbiont and bacteriocyte cell dynamics during aphid development Pierre Simonet,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Severine Balmand,Stefano Colellaet al. UK – France joint meeting on Aphids (Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés – Aphids Special Interest Group of Royal Entomological Sociaty), Nov 2015, Paris, France Communication dans un congrès hal-03506775v1
Coordination des dynamiques cellulaires entre bactériocytes et endosymbiotes au cours du développement des insectes : Une nouvelle approche par cytométrie en flux. Pierre Simonet,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Michèle Weiss-Gayet,Stefano Colellaet al. Réunion annuelle du REID (Réseau National Ecologie des Interactions Durables), Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID). Montferrier/ Lez, FRA., Mar 2015, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-02801005v1
Specific body compartment phenotypes induced by dsRNA treatments in the pea aphid: the cathepsin-L and phenylalanine hydroxylase examples Pierre Simonet,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Federica Calevro 7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France Communication dans un congrès hal-02795336v1
Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois Pierre Simonet,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,M. Weiss-Gayet,Stefano Colellaet al. 7. Journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), 2014, Avignon, France Communication dans un congrès hal-03513906v1
Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois Pierre Simonet,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Michèle Weiss-Gayet,Stefano Colellaet al. 7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France Communication dans un congrès hal-02795335v1
SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations Mathieu Labernardiere,Patrice Baa-Puyoulet,Jean-Pierre Gauthier,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01208785v1
Symbiose puceron – Buchnera : approche métabolomique chez Acyrthosiphon pisum Marjolaine Rey,Floriant Bellvert,Marie-Gabrielle Duport,Patrice Baa-Puyoulet,Federica Calevroet al. 6èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Oct 2013, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-03506758v1
L'inactivation par RNAi du gène codant la phénylalanine hydrolase dans les compartiments symbiotiques provoque une baisse de la fécondité et des défauts de développement chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Marjolaine Rey,Severine Balmand,Hubert Charleset al. Réunion du GRREMI (Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions), Oct 2013, Lyon, France Communication dans un congrès hal-03506724v1
Analyse métabolomique de la symbiose entre le puceron Acyrthosiphon pisum et la bactérie Buchnera aphidicola Marjolaine Rey,Floriant Bellvert,Marie-Gabrielle Duport,Patrice Baa-Puyoulet,Federica Calevroet al. 7èmes Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France Communication dans un congrès hal-03506751v1
dsRNAi in aphids induces variable individual and tissue responses, and phenotypes specific to the administration methods Panagiotis Sapountzis,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,G. Febvay,Hubert Charleset al. Cycle de séminaires en Biophysique et Biologie Moléculaire de la Cellule et du Développement, Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Oct 2013, Pisa, Italy Communication dans un congrès hal-03506764v1
Organisation, gene expression regulation and DNA structural properties in the shrunken genome of Buchnera, the endosymbiont of aphids Hubert Charles,Federica Calevro,Stefano Colella,Gérard Febvay 1. International Research Workshop Lyon- France / São Paulo - Brazil, Nov 2013, Lyon, France Communication dans un congrès hal-03506769v1
Phénotypes induits par l'inactivation fonctionnelle par RNAi du gène ACYPY007803 (phényalanine hydroxylase) chez le puceron du pois Andréane Rabatel,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Hubert Charles,Gérard Febvayet al. 5. Journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2012, Lyon, France Communication dans un congrès hal-03506379v1
Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides Yvan Rahbé,Denis Tagu,Guy Condemine,E Guiderdoni,Federica Calevroet al. ANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France Communication dans un congrès hal-03506701v1
Key genes for symbiosis and development in an emerging genomic model, the pea aphid Federica Calevro,Stefano Colella,Gérard Febvay,Hubert Charles Séminaire invité au Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Universita degli studi di Pisa. Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Pisa, ITA., 2012, Pisa, Italy Communication dans un congrès hal-02804850v1
Analyse génomique des éléments régulateurs et des propriétés structurales intrinsèques de l'ADN dans le génome réduit de Buchnera Lilia Brinza,Federica Calevro,Hubert Charles 5. Réunion Réseau BAPOA, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2012, Villeurbanne, France. 22 diapos Communication dans un congrès hal-02808160v1
Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable Hubert Charles,Severine Balmand,Araceli Lamelas,Ludovic Cottret,Vicente Pérez-Brocalet al. 4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France Communication dans un congrès hal-02808863v1
Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development Andréane Rabatel,Gérard Febvay,Karen Gaget,Gabrielle Duport,Nadia Bendridiet al. Sixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands Communication dans un congrès hal-00748785v1
Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiques Hubert Charles,Stefano Colella,Federica Calevro,Gérard Febvay,Yvan Rahbéet al. Journée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p Communication dans un congrès hal-02804281v1
Fate of transcription units in the reductive evolution of the genome of Buchnera aphidicola Lilia Brinza,Federica Calevro,Hubert Charles 6th International Symbiosis Society Congress (6 ISS 2009) Madison, Wisconsin USA, August 9-15 2009, Aug 2009, United States Communication dans un congrès hal-00497818v1
Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphid Andréane Rabatel,Gérard Febvay,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Yvan Rahbéet al. IPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France Communication dans un congrès hal-02814211v1
Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid model Andréane Rabatel,Gérard Febvay,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Yvan Rahbéet al. EMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p Communication dans un congrès hal-01231279v1
Genomic insight into the amino acid relations of the pea aphid with its symbiotic bacterium Buchnera aphidicola A.C.C. Wilson,P. Ashton,Federica Calevro,Hubert Charles,Stefano Colellaet al. 8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), Catania, juin 2009, Italy, 2009, Italy Communication dans un congrès hal-00497625v1
The power of combining genome annotation and systems level modeling. S.J. Macdonald,J. Ramsey,G. Jander,Atsushi Nakabachi,G.H. Thomaset al. 5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2", Barcelona, Espagne, Juin 2009, Jun 2009, Spain Communication dans un congrès hal-00498405v1
Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters Panagiotis Sapountzis,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Severine Balmand,Gérard Febvayet al. 3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France Communication dans un congrès hal-02821530v1
Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum) Nicolas Parisot,Karen Gaget,Stefano Colella,Andréane Rabatel,Federica Calevroet al. 3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p Communication dans un congrès hal-02818835v1
Xylem consumption response to osmotic stress in aphids J. Pompon,Yvan Rahbé,Federica Calevro,D. Quiring,C. Goyeret al. Annual meeting, Entomological Society of Canada, Winnipeg - Canada, 2009, Canada Communication dans un congrès hal-00496044v1
Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum Andréane Rabatel,Gérard Febvay,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Yvan Rahbéet al. 16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p Communication dans un congrès hal-02755293v1
Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides Yvan Rahbé,Denis Tagu,Guy Condemine,Emmanuel Guiderdoni,Federica Calevroet al. Genoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos Communication dans un congrès hal-02824684v1
Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum Yvan Rahbé,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Stefano Colella,Andréane Rabatelet al. 5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p Communication dans un congrès hal-02823073v1
Chromosome organization and gene expression regulation in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular bacteria of the pea aphid Acyrthosiphon pisum Hubert Charles,Lilia Brinza,Federica Calevro 58. Annual Meeting of the Entomological Society of America, Entomological Society of America (ESA). Annapolis, MD, USA., Dec 2010, San Diego, CA, United States Communication dans un congrès hal-02757719v1
The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism Stefano Colella,A. Vellozo,Ludovic Cottret,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France Communication dans un congrès hal-00498411v1
AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses Stefano Colella,Augusto Vellozo,Ludovic Cottret,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France Communication dans un congrès hal-02815123v1
Besoins en acides aminés des embryons de femelles parthénogénétiques du puceron du pois. Andréane Rabatel,Nadia Bendridi,Gabrielle Duport,Marjolaine Rey,Stefano Colellaet al. Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Jun 2009, PARIS, France Communication dans un congrès hal-00511624v1
AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis Stefano Colella,Augusto Vellozo,Ludovic Cottret,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States Communication dans un congrès hal-02814342v1
Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos Andréane Rabatel,Nadia Bendridi,- Duport, G.,Marjolaine Rey,Stefano Colellaet al. 8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy Communication dans un congrès hal-02820893v1
Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos A. Rabatel,N. Bendridi,G. Duport,Stefano Colella,J. Berminghamet al. 8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391499v1
CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases A. Vellozo,Patrice Baa-Puyoulet,A. Veron,Jaime Huerta-Cepas,Ludovic Cottretet al. 1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France Communication dans un congrès hal-00496032v1
AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses Stefano Colella,A. Vellozo,L. Cottret,G. Febvay,Federica Calevroet al. 8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391280v1
Un vieux couple à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et sa bactérie symbiotique Federica Calevro,Stefano Colella,Gérard Febvay,Hubert Charles,Yvan Rahbé Séance commune Académie Agriculture et Académie des Sciences, Académie d'Agriculture de France (AAF). Paris, FRA., Dec 2009, Paris, France. 23 diapos Communication dans un congrès hal-02824438v1
Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentiels Federica Calevro,H. Charles,J.M. Fayard,G. Febvay,Yvan Rahbéet al. Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391259v1
Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum H. Charles,Federica Calevro,Stefano Colella,J.M. Fayard,G. Febvayet al. Séminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391273v1
Evolution des organismes bactériens G. Beslon,Federica Calevro,H. Charles,J.M. Fayard,C. Knibbeet al. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391156v1
Evolution des organismes bactériens Guillaume Beslon,Federica Calevro,Hubert Charles,Jean-Michel Fayard,Carole Knibbeet al. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", Jul 2008, Villeurbanne, France. 12 diapos Communication dans un congrès hal-02822501v1
Les réseaux métaboliques et génétiques H. Charles,G. Beslon,Federica Calevro,Jean-François Boulicaut,J.M. Fayardet al. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391271v1
Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum Hubert Charles,Federica Calevro,Stefano Colella,Jean-Michel Fayard,Gérard Febvayet al. Séminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France Communication dans un congrès hal-02824972v1
Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analyses Augusto Vellozo,Stefano Colella,Ludovic Cottret,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. Integrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France Communication dans un congrès hal-02821711v1
Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentiels Federica Calevro 1. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons. FRA., Jan 2008, Paris, France. 9 diapos Communication dans un congrès hal-02820252v1
Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses Stefano Colella,A. Vellozo,L. Cottret,G. Febvay,Federica Calevroet al. 4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391279v1
Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analyses A. Vellozo,Stefano Colella,L. Cottret,G. Febvay,Federica Calevroet al. Integrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391519v1
Transcriptomique Jean-François Boulicaut,Federica Calevro,H. Charles,J.M. Fayard,G. Febvayet al. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391255v1
Comparative analysis of gene expression in the aphid-Buchnera symbiosis: the role of Buchnera in the nutrition of aphid embryos J. Bermingham,Federica Calevro,J. Vinuelas,H. Charles,T. Wilkinson Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2007 (SEB 2007), 2007, Glasgow (UK), avril 2007, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391155v1
IGOIM, une méthode d'inférence de réseaux génétiques utilisant l'information mutuelle L. Brinza,Federica Calevro,H. Charles Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite "Analyse statistique du transcriptome", 2007, Marseille (France), juillet 2007, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391258v1
Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, &quot;Is there any life left? Yvan Rahbé,H. Charles,J. Vinuelas,N. Reymond,Federica Calevroet al. Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391505v1
Conservation de la relation entre niveau d'expression des gènes et organisation du chromosome chez Buchnera aphidicola, symbiote primaire des pucerons : exemple d'un génome réduit mais non dégénéré J. Vinuelas,Federica Calevro,D. Remond,J. Bernillon,Yvan Rahbéet al. XVème Colloque de Physiologie de l'Insecte, Jul 2007, Rennes, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00373311v1
Relationships between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid J. Vinuelas,Federica Calevro,J. Bernillon,Didier Remond,Yvan Rahbéet al. 5th International of Symbiosis Society Congress, Aug 2006, Autriche Communication dans un congrès hal-00506826v1
Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicola J. Vinuelas,Federica Calevro,Didier Remond,J. Bernillon,Yvan Rahbéet al. Theoretical Approaches for the Genome Workshop, Nov 2006, France Communication dans un congrès hal-00506911v1
Relationship between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum J. Vinuelas,Federica Calevro,J. Bernillon,D. Remond,Yvan Rahbéet al. 5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391524v1
Buchnera aphidicola, endocytobiote du puceron : transcriptome d'un génome &quot;dégénéré H. Charles,Federica Calevro,J. Vinuelas,G. Febvay,Yvan Rahbéet al. Rencontres 2006 des Microbiologistes de l'INRA, 2006, Dourdan (France), juin 2006, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391278v1
Metabolic interactions between the bacterium Buchnera aphidicola and its obligate symbiotic partner, the pea aphid: nutritional studies combined with transcriptome analyses Federica Calevro,N. Reymond,J. Vinuelas,G. Febvay,Yvan Rahbéet al. 5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391262v1
Régulation génétique et métabolique chez Buchnera aphidicola (AgroBi 2006) L. Cottret,L. Brinza,J. Vinuelas,G. Duport,Federica Calevroet al. Journée INRA-INRIA "Insertion des mathématiques dans les approches biologiques : du gène à l'organisme", 2006, Lyon (France), décembre 2006, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391289v1
Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicola J. Vinuelas,Federica Calevro,D. Remond,J. Bernillon,Yvan Rahbéet al. Workshop "Theoretical Approaches for the Genome", 2006, Annecy-le-Vieux (France), novembre 2006, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391525v1
Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genome Federica Calevro,N. Reymond,J. Vinuelas,A. Groppi,A. Barreet al. Colloque INRA "Apports de la génomique à la physiologie et la pathologie de l'insecte", 2006, Montpellier (France), mars 2006, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391267v1
Bioinformatics analysis of the nucleoid associated protein FIS in Buchnera aphidicola, the intracellular symbiotic bacteria of aphids L. Brinza,C. Armenise,E. Leproult,A. Paun,P. da Silvaet al. Integrative Post-Genomics - IPG'06, 2006, Lyon (France), novembre-décembre 2006, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391257v1
Genomewide transcriptional changes associated with nutritional alterations affecting phenylalanine and tyrosine metabolism in Buchnera aphidicola H. Charles,Federica Calevro,N. Reymond,N. Morin,Yvan Rahbéet al. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391274v1
Of lice and plants: metabolite flows in the trophic pathway of phloem feeding insects as analysed through genomic and EST data from the aphid symbiosis Yvan Rahbé,Federica Calevro,H. Charles,G. Febvay,Denis Tagu Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S233 Communication dans un congrès hal-00391503v1
Analyse transcriptomique de la réponse de Buchnera aphidicola à un stress métabolique subi par son hôte le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum Federica Calevro,N. Reymond,N. Morin,A. Dumitru,Yvan Rahbéet al. Journées Reseau Ecologie et Interactions Durables (REID), 2005, Lyon (France), janvier 2005, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391260v1
SITRANS: a web information system for microarray experiments Frederique Laforest,A. Tchounikine,T. Chaari,H. Charles,Federica Calevro XIX International Congress of the European Federation for Medical Informatics, 2005, Genève (Suisse), août-septembre 2005, France. pp.33-38 Communication dans un congrès hal-00391450v1
Transcriptional responses of Buchnera aphidicola to combined amino acid and osmotic stress in the diet of its symbiotic partner, Acyrthosiphon pisum H. Charles,Federica Calevro,J. Vinuelas COST853: Agricultural Biomarkers for Array-Technology - Combined WG4 & WG5 meetings "Chip production and analysis, and environmental monitoring", 2005, Lyon (France), novembre 2005, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391276v1
Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genome Federica Calevro,N. Reymond,J. Vinuelas,A. Groppi,A. Barreet al. Integrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391266v1
Global transcriptional responses of Buchnera aphidicola to aromatic amino acid limitation in the diet of its symbiotic partner, the phloem sap feeding insect Acyrthosiphon pisum Federica Calevro,N. Reymond,N. Morin,Yvan Rahbé,J. Bernillonet al. Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S226 Communication dans un congrès hal-00391261v1
Gene expression measurements with microarray technology in bacteria: transcriptomic analysis af the symbiotic bacteria, Buchnera aphidicola, in nutritional stress conditions of its aphid host Acyrthosiphon pisum H. Charles,Federica Calevro Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite Vicanne, 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1 Communication dans un congrès hal-00391272v1
Influence of probe sequence and strand lenght on the morphology and structuration of DNA chip M.H. Rouillat,Vincent Dugas,Federica Calevro,J.P. P Cloarec,Hubert Charleset al. Nano 8 : 8. International Conference of nanometer scale science and technology, Jul 2004, Venise, Italy Communication dans un congrès hal-03506638v1
Influence of sequence and strand length on the structuration of DNA-chip. M.H. Rouillat,Vincent Dugas,Federica Calevro,Magali Phaner-Goutorbe Nano-8, 8th International Conference on Nanometer Scale Science and Technology, Jun 2004, Venise, Italy Communication dans un congrès hal-04924419v1
Analyse du transcriptome de Buchnera, la bactérie symbiotique intracellulaire des pucerons : une approche méthodologique Federica Calevro,Hubert Charles,Nancie Reymond,Vincent Dugas,J.P. P Cloarecet al. 14. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France Communication dans un congrès hal-03506495v1
Buchnera aphidicola, bactérie endosymbiotique des pucerons : génomes et physiologie symbiotique Yvan Rahbé,Z Al Ayoubi,Federica Calevro,Hubert Charles,Jean-Michel Fayardet al. 4. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France Communication dans un congrès hal-03506623v1

Poster de conférence (66)

Automated detection and segmentation of bacteriocytes from light microscopy images Nathan Hutin,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Federica Calevro,Chantal Revol-Mulleret al. Colloque d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical (IABM), Mar 2025, Nice, France Poster de conférence hal-05109817v1
Origin and evolution of Inhibitors of apoptosis (IAP) in early metazoans Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,François Renoz,Patrice Baa-Puyouletet al. Jacque Monod conference, Molecular basis for membrane remodelling and organisation, Jun 2025, Roscoff, France Poster de conférence hal-05137897v1
Unraveling the impact of microbiota xenobiotic interactions on the mosquito metabolome through clustering-based analyses Pierre Antonelli,Guillaume Meiffren,Patrice Baa-Puyoulet,Laurent Vallon,Edwige Martinet al. 17èmes Journées Scientifiques du RFMF, Jun 2025, Paris, France Poster de conférence hal-05137853v1
GReNaDIne+: Generalization-Aware Gene Regulatory Networks Inference Erwan Cruché,Matis Zouari,Mélanie Ribeiro Lopes,Federica Calevro,Clément Marteauet al. 23rd International Conference on Computational Methods in Systems Biology, CMSB 2025, Sep 2025, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-05261758v1
Origin and evolution of Inhibitors of apoptosis (IAPs) in early metazoans Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,François Renoz,Patrice Baa-Puyouletet al. EVOLYON 2025, Nov 2025, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-05290683v1
Venin de la fourmi Tetramorium bicarinatum : découverte d'un peptide original neuroactif chez les insectes Axel Touchard,Valentine Barassé,Laurence Jouvensal,Guillaume Boy,Arnaud Billetet al. 52ème Congrès du Groupe Français de Recherches sur les Pesticides, May 2024, Lyon, France. 2024 Poster de conférence hal-05169446v1
The aphid BCR4 structure and activity uncover a new defensin peptide superfamily Hugo Terrasson,Karine Loth,Nicolas Parisot,Françoise Paquet,Isabelle Rahiouiet al. XXVII International Congress of Entomology, Aug 2024, Kyoto, Japan Poster de conférence hal-04702878v1
Insulin and AKH signaling during development and under nutritional stress in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum Cissy Huygens,Jozef Vanden Broeck,Federica Calevro,Patrick Callaerts 14èmes Rencontres du Réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associées (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France Poster de conférence hal-04783651v1
Mathematical modeling of pea aphid metabolism Ariane Paradan,Patrice Baa-Puyoulet,Federica Calevro,Hubert Charles,Léo Gerlin 14èmes rencontres du réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France Poster de conférence hal-04788746v1
Neprilysin 1 controls SIFamide Levels to Regulate Feeding-related Behavior in Drosophila melanogaster El-Sayed Baz,Maria Pons Vizcarra,Veerle Vulsteke,Sofie de Groef,Thomas Riemenspergeret al. 27th European Drosophila Conference, Oct 2023, Lyon, France Poster de conférence hal-04783950v1
The Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich (BCR) proteins: a role in the control of aphid symbiosis ? Hugo Terrasson,Karine Loth,Françoise Paquet,Nicolas Parisot,Isabelle Rahiouiet al. Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-04633269v1
Genome assembly of the cereal aphid Sipha maydis, a model for the study of dual endosymbiosis in insects François Renoz,Nicolas Parisot,Patrice Baa-Puyoulet,Léo Gerlin,Samir Fakhouret al. 13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-04524568v1
Dynamics of endosymbionts in bed bugs during development Raphaël Jorge,Marius Poulain,Elodie Rosinski,Hélène Henri,Adil El Filaliet al. Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI), Nov 2023, Lyon, France Poster de conférence hal-04805370v1
Secondary symbionts influence feeding and oviposition behavior in the whitefly Bemisia tabaci Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Hélène Henri,Hubert Charles,Pedro da Silvaet al. XII European Congress of Entomology, Oct 2023, Heraklion, Greece Poster de conférence hal-04524520v1
Functional analysis of interactions between bed bugs and their nutritional symbiont Wolbachia Raphaël Jorge,Marius Poulain,Elodie Rosinski,Hélène Henri,Adil El Filaliet al. Rencontres du Réseau Ecologie des Interactions Durables 2023, May 2023, Poitiers, France Poster de conférence hal-04805475v1
Functional analysis of interactions between bed bugs and their nutritional symbiont Wolbachia Raphaël Jorge,Marius Poulain,Elodie Rosinski,Hélène Henri,Adil El Filaliet al. Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Lyon, France Poster de conférence hal-04805501v1
From genomes to metabolism reconstruction: companion collections of databases to study symbiotic interactions between insects and their bacterial symbionts Patrice Baa-Puyoulet,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,Federica Calevro,Hubert Charles 10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France Poster de conférence hal-04784498v1
Embedded into bacteriocytes, but highly invasive: the puzzling case of the co-obligate symbiont Serratia symbiotica in the aphid Periphyllus lyropictus François Renoz,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Marie-Christine Eloyet al. ELI-Day, Annual meeting of the Earth and Life Institute of the University of Louvain-la-Neuve, May 2022, Louvain-la-Neuve, Belgium Poster de conférence hal-03741341v1
Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: an integrative approach in a whitefly model Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Hélène Henri,Pedro da Silva,Hubert Charleset al. XXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland Poster de conférence hal-03927204v1
High-throughput genomics and transcriptomics to decipher host-symbiont molecular dialogue in the cereal weevil Sitophilus oryzae and Sodalis pierantonius endosymbiotic association Nicolas Parisot,Mariana Galvão Ferrarini,Clément Goubert,Carlos Vargas-Chávez,Agnès Vallieret al. 10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France Poster de conférence hal-03810657v1
Extreme plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses during pea aphid development Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,François Renoz,Marie-Gabrielle Duport,Severine Balmandet al. 10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France Poster de conférence hal-03741327v1
Role of symbionts in insects' ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae). Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Zainab Belgaidi,Hélène Henri,Hubert Charleset al. Rencontres du Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI) 2022, Nov 2022, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-03927225v1
From genomes to metabolism reconstruction: companion collections of databases to study symbiotic interactions between insects and their bacterial symbionts. Patrice Baa-Puyoulet,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,Federica Calevro,Hubert Charles 12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France Poster de conférence hal-03810352v1
ER stress as a major regulator of aphid bacteriocyte cell death Karen Gaget,Mélanie Ribeiro Lopes,Marie-Gabrielle Duport,Patrick Callaerts,Nicolas Parisotet al. 12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France Poster de conférence hal-03741344v1
Influence of secondary symbionts on host plant utilization and selection in the whitefly Bemisia tabaci. Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Hélène Henri,Zainab Belgaidi,Hubert Charleset al. 10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France Poster de conférence hal-03927184v1
Bacteriocytes and the interorgan communication network regulating physiology and metabolism of the pea aphid Cissy Huygens,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Sergio Peignieret al. 10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France Poster de conférence hal-03741324v1
The role of GPCRs in metabolism and physiology of the pea aphid, Acyrthosiphon pisum Cissy Huygens,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Federica Calevroet al. XXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland Poster de conférence hal-03741320v1
Bacteriocyte specific Cystein Rich peptides, a new defensin like protein family , are promising regulators of aphid symbiosis Hugo Terrasson,Karine Loth,Nicolas Parisot,Françoise Paquet,Isabelle Rahiouiet al. 10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France Poster de conférence hal-04771990v1
From genomes to metabolism reconstruction: companion collections of databases to study symbiotic interactions between insects and their bacterial symbionts Patrice Baa-Puyoulet,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,Federica Calevro,Hubert Charles 13. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), 2020, Nice (virtuel), France Poster de conférence hal-03514174v1
Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model. Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Emmanuel Desouhant,Abdelaziz Heddi,Fabrice Vavreet al. Colloque Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID) et le réseau Immunologie des Invertébrés (IMMUNINV), May 2019, Montpellier, France Poster de conférence hal-04788462v1
A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system Mélanie Ribeiro Lopes,Pierre Simonet,Karen Gaget,Severine Balmand,Nicolas Parisotet al. 2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomological Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom Poster de conférence hal-03513018v1
Développement d’approches métabolomiques pour étudier la contribution des symbiotes à l’exploitation et à la spécialisation de niche de Bemisia tabaci, insecte invasif ravageur de cultures Federica Calevro,Isabelle Rahioui,Laurence Mouton Journées d’échanges - Fédération BioEnvironnement et Santé, Feb 2019, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-04904092v1
Les insectes, leur biodiversité et leur potentiel en ingénierie bio-inspirée : structure, fonctions, adaptations Federica Calevro,Patrick Callaerts,Pedro da Silva,Abdelaziz Heddi,Yvan Rahbé Exposition/Colloque “Biomimétique : l’imitation sans limitation, Mar 2019, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-04904104v1
Bacteriocyte reprogramming to maintain organismal homeostasis under nutritional stress in aphid symbiosis Nicolas Parisot,Stefano Colella,Pierre Simonet,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duportet al. 2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomological Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom Poster de conférence hal-03513048v1
Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model. Sylvain Benhamou,Isabelle Rahioui,Abdelaziz Heddi,Emmanuel Desouhant,Fabrice Vavreet al. Auvergne Rhône-Alpes Regional Workshop on Microbiome, Nov 2019, Lyon, France Poster de conférence hal-04788456v1
A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system Karen Gaget,Severine Balmand,Kurt Buhler,Patrick Callaerts,Nicolas Parisotet al. INSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France Poster de conférence hal-03514067v1
Molecular characterization of aphid bacteriocyte cell death by RNAseq analysis Nicolas Parisot,Stefano Colella,Mélanie Ribeiro Lopes,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duportet al. INSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Lyon, France Poster de conférence hal-03741347v1
A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system Mélanie Ribeiro Lopes,Pierre Simonet,Karen Gaget,Severine Balmand,Nicolas Parisotet al. 11. European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy Poster de conférence hal-03509913v1
Molecular characterization of aphid bacteriocyte cell death by RNAseq analysis Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Karen Gaget,Patrick Callaerts,Federica Calevro 11th European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy Poster de conférence hal-03741337v1
Evaluating the essentiality of the primary endosymbiont of the rice weevil Sitophilus oryzae through genome analysis Carlos Vargas-Chavez,Nicolas Parisot,C. Goubert,Patrice Baa-Puyoulet,Severine Balmandet al. 6. Meeting of the Spanish Society for Evolutionary Biology (SESBE), Jan 2018, Palma of Mallorca, Balearic Islands, Spain Poster de conférence hal-03514015v1
Bacteriocyte reprogramming to maintain organismal homeostasis under nutritional stress in aphid symbiosis Nicolas Parisot,Stefano Colella,Pierre Simonet,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duportet al. XIth European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy Poster de conférence hal-03509885v1
The draft genome sequence of the rice weevil Sitophilus oryzae as a model to explore the host-symbiont interactions in a nascent stage of endosymbiosis Carlos Vargas-Chavez,Nicolas Parisot,Clément Goubert,Patrice Baa-Puyoulet,Severine Balmandet al. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Jun 2016, Lyon, France Poster de conférence hal-03506786v1
Métabolisme de la tyrosine et développement parthénogénétique chez le puceron du pois : la fonction centrale de la phenylalanine hydroxylase Pierre Simonet,Karen Gaget,Marjolaine Rey,Marie-Gabrielle Duport,Hubert Charleset al. 7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2014, Avignon, France. 2014 Poster de conférence hal-02795333v1
SymbAphidBase: a new database dedicated to aphid symbionts to store novel sequenced genomes and standardize their annotations Mathieu Labernardiere,Patrice Baa-Puyoulet,Jean-Pierre Gauthier,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 13. European Conference on Computational Biology (ECCB), Sep 2014, Strasbourg, France. , 1 p., 2014 Poster de conférence hal-02798649v1
Cathepsin-L proteinase is involved in cuticle remodeling during the molting process in the pea aphid, &lt;em&gt;Acyrthosiphon pisum&lt;/em&gt; Pierre Simonet,Panagiotis Sapountzis,Marie-Gabrielle Duport,Severine Balmand,Karen Gagetet al. 7. International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2014, Amsterdam, Netherlands. , 1 p., 2014 Poster de conférence hal-02797200v1
Tyrosine metabolism and parthenogenetic development in a symbiotic insect, the pea aphid: the central function of phenylalanine hydroxylase Pierre Simonet,Karen Gaget,Marjolaine Rey,Marie-Gabrielle Duport,Hubert Charleset al. 7. International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2014, Amsterdam, Netherlands. 1 p., 2014 Poster de conférence hal-02792558v1
Implication de la cathepsine-L dans le remodelage cuticulaire durant le processus de mue chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum Pierre Simonet,Panagiotis Sapountzis,Marie-Gabrielle Duport,Severine Balmand,Karen Gagetet al. 7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2014, Avignon, France. 2014 Poster de conférence hal-02795332v1
Génomique fonctionnelle des interactions bactérie / hôte eucaryote : intégration systémique de données génomiques et métaboliques Floriant Bellvert,Federica Calevro,Hubert Charles,Stefano Colella,Gérard Febvayet al. Journée de la FR41 BioEnvironnement et Santé, Feb 2014, Villeurbanne, France. 1 p., 2014 Poster de conférence hal-02791821v1
Annotating arthropods genome to study and compare their metabolism: the ArthropodaCyc collection of Cyc databases powered by CycADS Patrice Baa-Puyoulet,Augusto Vellozo,Jaime Huerta-Cepas,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 13. European Conference on Computational Biology (ECCB), Sep 2014, Strasbourg, France. , 1 p., 2014 Poster de conférence hal-02798101v1
Phenotypic effects of ACYPI007803 knockdown by RNAi in the pea aphid Andréane Rabatel,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Hubert Charles,Gérard Febvayet al. 8. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium., Jan 2013, Harpenden, United Kingdom Poster de conférence hal-03506744v1
The CycADS annotation database system to support the development and update of enriched BioCyc databases: development of ad hoc BioCyc DB (AcypiCyc, ArthropodaCyc Patrice Baa-Puyoulet,Augusto Vellozo,Jaime Huerta-Cepas,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 8. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium, Jan 2013, Harpenden, United Kingdom Poster de conférence hal-03506707v1
Diminution de fécondité et défauts de développement induits par l’inactivation fonctionnelle par RNAi du gène codant la phénylalanine hydroxylase chez le puceron du pois, Acyrthosiphon Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Marjolaine Rey,Severine Balmand,Hubert Charleset al. 17. Colloque de Biologie de l’Insecte - CBI-2013, Oct 2013, Montpellier, France Poster de conférence hal-03506719v1
« ArthropodaCyc » : une collection de bases de données enrichies à l’aide de CycADS pour étudier et comparer le métabolisme des arthropodes. Patrice Baa-Puyoulet,Stefano Colella,Augusto Vellozo,Jaime Huerta-Cepas,Gérard Febvayet al. 17. Colloque de Biologie de l’Insecte - CBI-2013, Oct 2013, Montpellier, France Poster de conférence hal-03506713v1
Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development Andréane Rabatel,Gérard Febvay,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Nadia Bendridiet al. 4. Réunion Réseau BAPOA, Nov 2011, Paris, France. 1 p., 2011 Poster de conférence hal-02805925v1
Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development Andréane Rabatel,Gérard Febvay,Karen Gaget,Marie-Gabrielle Duport,Nadia Bendridiet al. 6. International Symposium on Molecular Insect Science, Oct 2011, Amsterdam, Netherlands. Elsevier, 2011, Poster de conférence hal-02747829v1
Single insect and tissue compartment specific response to RNAi microinjection in aphids: each individual matters Panagiotis Sapountzis,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Thomas Horn,Michael Boutroset al. 4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Jun 2010, Kansas City, United States. 1 p., 2010 Poster de conférence hal-02820936v1
Evolution of the regulatory network in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular symbiotic bacteria of aphids Lilia Brinza,Federica Calevro,Marie-Gabrielle Duport,Yvan Rahbé,Pedro da Silvaet al. 18. Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, Apr 2010, Lyon, France. 1 p., 2010 Poster de conférence hal-02811608v1
Réponse tissu-spécifique au traitement par RNAi chez le puceron du pois : une étude cinétique à l’échelle de l’individu Panagiotis Sapountzis,Marie-Gabrielle Duport,Karen Gaget,Severine Balmand,Stéphanie Jaubert-Possamaiet al. 16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. , 126 p., 2010, CB-2010 : 16ème Colloque de Biologie de l'Insecte, Lyon, 18 au 20 octobre 2010 Poster de conférence hal-02755004v1
Analyse génomique de la fonction de transport dans le système symbiotique du puceron du pois Acyrthosiphon pisum Nicolas Parisot,Karen Gaget,Stefano Colella,Andréane Rabatel,Federica Calevroet al. 16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. , 126 p., 2010, CBI-2010 : 16ème Colloque de Biologie de l’Insecte, Lyon, 18 au 20 octobre 2010 Poster de conférence hal-02755294v1
Using the “CycADS” annotation management system to develop a BioCyc metabolic network database for sequenced arthropods genomes: first steps towards “ArthropodsCyc” Augusto Vellozo,Patrice Baa-Puyoulet,Jaime Huerta-Cepas,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Jun 2010, Kansas City, United States. 45 p., 2010, Fourth Annual Arthropod Genomics Symposium Poster de conférence hal-02753908v1
Chromosome organisation in Buchnera: a dynamic active structure involved in gene expression regulation Lilia Brinza,Federica Calevro,J. Vinuelas,Christian Gautier,Hubert Charles Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Jun 2009, Nantes, France Poster de conférence hal-03506644v1
Annotation of metabolism genes : towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses Stefano Colella,Augusto Vellozo,L. Cottret,Gérard Febvay,Federica Calevroet al. 4. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown, juillet 2008, United States. 2008 Poster de conférence hal-02818508v1
Genomic DNA: an attractive candidate for microarray data normalization J. Vinuelas,Federica Calevro,J. Bernillon,Yvan Rahbé,G. Febvayet al. Integrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. , pp.1-1, 2005 Poster de conférence hal-00391523v1
A preliminary methodological approach to study the transcriptome of Buchnera, the intracellular symbiotic bacteria of aphids Federica Calevro,Hubert Charles,Nancie Reymond,Vincent Dugas,J.P. P Cloarecet al. Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'03, May 2003, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-03506498v1
Bioinformatique du transcriptome de Buchnera, symbiote intracellulaire des pucerons Hubert Charles,Federica Calevro,Nancie Reymond,Frederique Laforest,Anne Tchounikineet al. Rencontres 2003 des Microbiologistes de l'INRA, May 2003, Dourdan, France Poster de conférence hal-03506503v1
Analyse du transcriptome de Buchnera: développement d'une première puce à ADN Federica Calevro,Hubert Charles,Nancie Reymond,J.P. P Cloarec,Yvan Rahbéet al. Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'02, Mar 2002, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-03506459v1

Chapitre d'ouvrage (4)

Isolation of Insect as a Platform for Transcriptomic Analyses Mélanie Ribeiro Lopes,Pierre Simonet,Gabrielle Duport,Karen Gaget,Severine Balmandet al. RNA abundance analysis, 2170, pp.185-198, 2021, ⟨10.1007/978-1-0716-0743-5_13⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03052268v1
Genetic Diversity of the Apoptotic Pathway in Insects Mélanie Ribeiro Lopes,Nicolas Parisot,Patrick Callaerts,Federica Calevro Evolution, Origin of Life, Concepts ans Methods, Springer International Publishing, pp.253-285, 2019, 978-3-030-30363-1. ⟨10.1007/978-3-030-30363-1_13⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02304321v1
Functional and evolutionary genomics in aphids. Denis Tagu,Federica Calevro,Stefano Colella,Toni Gabaldon,Akiko Sugio Biology and Ecology of Aphids, 3, CRC Press, 2016, 978-1-4822-3678-1 Chapitre d'ouvrage hal-02800093v1
Définition des séquences sonde pour la PCR et pour les puces à ADN Hubert Charles,Federica Calevro Bioinformatique : Principes d’utilisation des outils, Editions Quae, 272 p., 2010, Savoir Faire (Quae), 978-2-7592-0870-8 978-2-7592-0870-8 Chapitre d'ouvrage hal-02813659v1

Pré-publication, Document de travail (5)

Cadmium tolerance is associated with metallothionein gene expression plasticity in Gammarus fossarum field populations Auréline Lalouette,Arnaud Chaumot,Louveline Lepeule,Karen Gaget,Nicolas Delormeet al. 2024 Pré-publication, Document de travail hal-04792699v1
Comprehensive annotation of transcription factors, chromatin-associated factors, and basal transcription machinery in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum Nicolas Parisot,Mélanie Ribeiro Lopes,Sergio Peignier,Patrice Baa-Puyoulet,Hubert Charleset al. 2024 Pré-publication, Document de travail hal-04792881v1
Strong impact of orally administered BCR4 defensin on aphid survival, embryo development and symbiotic cells in three Acyrthosiphon pisum parthenogenetic lines Hugo Terrasson,Karen Gaget,Garance Lapetoule,Isabelle Rahioui,François Renozet al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-04987737v1
The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae Nicolas Parisot,Carlos Vargas-Chavez,Clément Goubert,Patrice Baa-Puyoulet,Séverine Balmandet al. 2024 Pré-publication, Document de travail hal-04706472v1
GReNaDIne: Data-Driven Approaches to Infer Gene Regulatory Networks in Python Sergio Peignier,Pauline Schmitt,Federica Calevro 2020 Pré-publication, Document de travail hal-02863880v1

Rapport (1)

Biomimétique, l’imitation sans limitation @ INSA-Lyon Marie-Paule Voïta,Aline Bel-Brunon,Federica Calevro,Julien Castellani,Jean-Philippe Farrugiaet al. [Rapport de recherche] INSA-Lyon. 2019 Rapport (rapport de recherche) hal-02123536v1