Francis Orvain

Publications

Article dans une revue (55)

Influence of cockle bioturbation on microphytobenthic primary producers: habitat and density-dependent effects Anais Richard,Francis Orvain,Annabelle Dairain,Jérôme Morelle,Alicia Roméro-Ramirezet al. Marine Biology, 2025, 172 (5), pp.70. ⟨10.1007/s00227-025-04629-0⟩ Article dans une revue hal-05026490v1
A novel quantile regression approach to define optimal ecological niche: a case study on habitat suitability of cockle populations (Cerastoderma edule) Amélie Lehuen,Chloé Dancie,Florent Grasso,Sven Smolders,Francesco Cozzoliet al. Peer Community In Ecology, 2025 Article dans une revue hal-04438267v5
Multispecies macrozoobenthic seasonal bioturbation effect on sediment erodibility Amélie Lehuen,Oulhen Rose-Marie,Zhou Zhengquan,Smit Jaco De,Ijzerloo Lennart Vanet al. Journal of Sea Research (JSR), 2024, 201, pp.102525 Article dans une revue hal-04608768v2
Antagonistic impacts of benthic bioturbator species: Interconnected effects on sedimentary properties, biogeochemical variables, and microbial dynamics Jérôme Morelle,A. Huguet,A. Richard,Anniet M. Laverman,C. Roose-Amsaleget al. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2024, 573, pp.152000-152000. ⟨10.1016/j.jembe.2024.152000⟩ Article dans une revue hal-04477915v1
Impact of Sediment Bioturbation on Microphytobenthic Primary Producers: Importance of Macrobenthic Functional Traits Anais Richard,Francis Orvain,Jérôme Morelle,Alicia Romero-Ramirez,Guillaume Bernardet al. Ecosystems, 2023, ⟨10.1007/s10021-022-00817-x⟩ Article dans une revue hal-04120330v1
Heterogeneous microgeographic genetic structure of the common cockle (Cerastoderma edule) in the Northeast Atlantic Ocean: biogeographic barriers and environmental factors Manuel Vera,Sophie B Wilmes,Francesco Maroso,Miguel Hermida,Andrés Blancoet al. Heredity, 2023, 131 (4), pp.292 - 305. ⟨10.1038/s41437-023-00646-1⟩ Article dans une revue hal-05549181v1
Influence of nutrient enrichment on colonisation and photosynthetic parameters of hard substrate marine microphytobenthos Baptiste Vivier,Caroline Faucheux-Bourlot,Francis Orvain,Léo Chasselin,Orianne Jollyet al. Biofouling, 2023, pp.1-18. ⟨10.1080/08927014.2023.2261852⟩ Article dans une revue hal-04227448v1
Aluminium-based galvanic anode impacts the photosynthesis of microphytobenthos and supports the bioaccumulation of metals released Alexandre Levallois,Baptiste Vivier,Christelle Caplat,Didier Goux,Francis Orvainet al. Aquatic Toxicology, 2023, 258, pp.106501. ⟨10.1016/j.aquatox.2023.106501⟩ Article dans une revue hal-04196500v1
Colonisation of artificial structures by primary producers: competition and photosynthetic behaviour Baptiste Vivier,Maxime Navon,Jean-Claude Dauvin,Léo Chasselin,Maël Delooret al. Biofouling, 2022, The Journal of Bioadhesion and Biofilm Research, pp.1-14. ⟨10.1080/08927014.2022.2088285⟩ Article dans une revue hal-03719904v1
Changes in benthic macrofauna in oyster parks during an OsHV-1 μVar oyster spat mortality outbreak Charles Vanhuysse,Julien Normand,Mélanie Lepoittevin,Francis Orvain Marine Pollution Bulletin, 2021, 166, pp.112239. ⟨10.1016/j.marpolbul.2021.112239⟩ Article dans une revue hal-03793601v1
Inter‐country differences in the cultural ecosystem services provided by cockles Mathilde Jackson‐bue,Ana C. Brito,Sara Cabral,David N. Carss,Frederico Carvalhoet al. People and Nature, 2021, 4 (1), pp.71-87. ⟨10.1002/pan3.10252⟩ Article dans une revue hal-03844505v1
Marine artificial reefs, a meta-analysis of their design, objectives and effectiveness Baptiste Vivier,Jean-Claude Dauvin,Maxime Navon,Anne-Marie Rusig,Isabelle Mussioet al. Global Ecology and Conservation, 2021, 27, pp.e01538. ⟨10.1016/j.gecco.2021.e01538⟩ Article dans une revue hal-03172105v1
Influence of infrastructure material composition and microtopography on marine biofilm growth and photobiology Baptiste Vivier,Pascal Claquin,Christophe Lelong,Quentin Lesage,Mathias Peccateet al. Biofouling, 2021, 37 (7), pp.740-756. ⟨10.1080/08927014.2021.1959918⟩ Article dans une revue hal-03320902v1
Contrasted impact of two macrofaunal species (Hediste diversicolor and Scrobicularia plana) on microphytobenthos spatial distribution and photosynthetic activity at microscale Jerome Morelle,Olivier Maire,Anais Richard,Alex Slimani,Francis Orvain Marine Environmental Research, 2021, 163, pp.105228. ⟨10.1016/j.marenvres.2020.105228⟩ Article dans une revue hal-03155944v1
Ecosystem services provided by a non-cultured shellfish species: The common cockle Cerastoderma edule Aurélie Ciutat,Rosa Fernández Otero,Mónica Incera Filgueira,David N Carss,Ana C Britoet al. Marine Environmental Research, 2020, 158, pp.104931. ⟨10.1016/j.marenvres.2020.104931⟩ Article dans une revue hal-02873928v1
Does parasitism influence sediment stability? Evaluation of trait-mediated effects of the trematode Bucephalus minimus on the key role of cockles Cerastoderma edule in sediment erosion dynamics Annabelle Dairain,Olivier Maire,Guillaume Meynard,Francis Orvain Science of the Total Environment, 2020, 733, pp.139307. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.139307⟩ Article dans une revue hal-03793607v1
Sediment stability: can we disentangle the effect of bioturbating species on sediment erodibility from their impact on sediment roughness? Annabelle Dairain,Olivier Maire,Guillaume Meynard,Anaïs Richard,Tiffany Rodolfo-Damianoet al. Marine Environmental Research, 2020, 162, pp.105147. ⟨10.1016/j.marenvres.2020.105147⟩ Article dans une revue hal-05378002v1
Evidence for better microphytobenthos dynamics in mixed sand/mud zones than in pure sand or mud intertidal flats (Seine estuary, Normandy, France) Jerome Morelle,Pascal Claquin,Francis Orvain PLoS ONE, 2020, 15 (8), ⟨10.1371/journal.pone.0237211⟩ Article dans une revue hal-02956123v1
Impact of Chronic and Massive Resuspension Mechanisms on the Microphytobenthos Dynamics in a Temperate Intertidal Mudflat R. Savelli,Xavier Bertin,F. Orvain,Pierre Gernez,A. Daleet al. Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 2019, ⟨10.1029/2019JG005369⟩ Article dans une revue hal-02416071v1
Connectivities with shellfish farms and channel rivers are associated with mortality risk in oysters A. Gangnery,J. Normand,C Duval,P. Cugier,K Grangeréet al. Aquaculture Environment Interactions, 2019, 11, pp.493-506. ⟨10.3354/aei00327⟩ Article dans une revue hal-02344741v1
Modelling the functioning of a coupled microphytobenthic-EPS-bacterial system in intertidal mudflats C. Rakotomalala,Katell Guizien,K. Grangeré,S. Lefebvre,C. Dupuyet al. Marine Environmental Research, 2019, 150, pp.104754. ⟨10.1016/j.marenvres.2019.104754⟩ Article dans une revue hal-02354725v1
A simple, user friendly tool to readjust raw PAM data from field measurements to avoid over- or underestimating of microphytobenthos photosynthetic parameters Jerome Morelle,Francis Orvain,Pascal Claquin Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2018, 503, pp.136-146. ⟨10.1016/j.jembe.2018.02.007⟩ Article dans une revue hal-02433658v1
Annual Phytoplankton Primary Production Estimation in a Temperate Estuary by Coupling PAM and Carbon Incorporation Methods Jerome Morelle,Mathilde Schapira,Francis Orvain,Philippe Riou,Pascal Jean Lopezet al. Estuaries and Coasts, 2018, 41 (5), pp.1337-1355. ⟨10.1007/s12237-018-0369-8⟩ Article dans une revue hal-02410790v1
Dynamics of exopolymeric carbon pools in relation with phytoplankton succession along the salinity gradient of a temperate estuary (France) Jerome Morelle,Mathilde Schapira,Sylvaine Françoise,Gaëlle Courtay,Francis Orvainet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2018, 209, pp.18-29. ⟨10.1016/j.ecss.2018.05.008⟩ Article dans une revue hal-02433644v1
Regional and latitudinal patterns of soft-bottom macrobenthic invertebrates along French coasts: Results from the RESOMAR database Régis K. Gallon,Nicolas Lavesque,Jacques Grall,Céline Labrune,Antoine Grémareet al. Journal of Sea Research (JSR), 2017, 130, pp.96-106. ⟨10.1016/j.seares.2017.03.011⟩ Article dans une revue hal-01510350v1
Impact of biofilm resuspension on mesozooplankton in a shallow coastal ecosystem characterized by a bare intertidal mudflat Valérie V. David,Hans J. Hartmann,Alexandre Barnett Barnett,Martine Bréret,Hélène Montaniéet al. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 2016, ⟨10.1017/S0025315416000552⟩ Article dans une revue hal-01322859v1
Modelling the Effect of Cerastoderma edule Bioturbation on Microphytobenthos Resuspension Towards the Planktonic Food Web of Estuarine Ecosystem Christiane Rakotomalala,Karine Grangeré,Martin Ubertini,Martin Forêt,Francis Orvain Ecological Modelling, 2015, 316, pp.155-167. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2015.08.010⟩ Article dans une revue hal-03227917v1
Microbial interactions in marine water amended by eroded benthic biofilm: A case study from an intertidal mudflat Hélène Montanié,Pascaline Ory,Francis Orvain,Daniel Delmas,Christine Dupuy Journal of Sea Research (JSR), 2014, 92, pp.74 - 85. ⟨10.1016/j.seares.2013.11.011⟩ Article dans une revue hal-01097525v1
Structures of benthic prokaryotic communities and their hydrolytic enzyme activities resuspended from samples of intertidal mudflats: An experimental approach Clarisse Mallet,Hélène Agogué,Frédérique Bonnemoy,Katell Guizien,Francis Orvainet al. Journal of Sea Research (JSR), 2014, Trophic significance of microbial biofilm in tidal flats, 92, pp.158-169. ⟨10.1016/j.seares.2014.01.005⟩ Article dans une revue hal-01356084v1
Relevance of macrozoobenthic grazers to understand the dynamic behavior of sediment erodibility and microphytobenthos resuspension in sunny summer conditions Francis Orvain,Katell Guizien,Sébastien Lefebvre,Martine Bréret,Christine Dupuy Journal of Sea Research (JSR), 2014, ⟨10.1016/j.seares.2014.03.004⟩ Article dans une revue hal-01248060v1
How does the resuspension of the biofilm alter the functioning of the benthos–pelagos coupled food web of a bare mudflat in Marennes-Oléron Bay (NE Atlantic)? Blanche Saint-Béat,Christine Dupuy,Hélène Agogué,Alexandre Carpentier,Julien Chalumeauet al. Journal of Sea Research (JSR), 2014, 92, pp.144-157. ⟨10.1016/j.seares.2014.02.003⟩ Article dans une revue hal-01097877v1
Sequential resuspension of biofilm components (viruses, prokaryotes and protists) as measured by erodimetry experiments in the Brouage mudflat (French Atlantic coast) Christine Dupuy,Clarisse Mallet,Katell Guizien,Hélène Montanié,Martine Bréretet al. Journal of Sea Research (JSR), 2014, 92, pp.56-65. ⟨10.1016/j.seares.2013.12.002⟩ Article dans une revue istex hal-01214993v1
Tidal and seasonal effects on the short-term temporal patterns of bacteria, microphytobenthos and exopolymers in natural intertidal biofilms (Brouage, France) Francis Orvain,Margot de Crignis,Katell Guizien,Sébastien Lefebvre,Clarisse Malletet al. Journal of Sea Research (JSR), 2014, ⟨10.1016/j.seares.2014.02.018⟩ Article dans une revue hal-01425772v1
Bacterial dynamics in a microphytobenthic biofilm: A tidal mesocosm approach Hélène Agogué,Clarisse Mallet,Francis Orvain,Margot de Crignis,Françoise Mornetet al. Journal of Sea Research (JSR), 2014, Trophic significance of microbial biofilm in tidal flats, 92, pp.36 - 45. ⟨10.1016/j.seares.2014.03.003⟩ Article dans une revue hal-01086656v1
Seasonal dynamics of extracellular polymeric substances (EPS) in surface sediments of a diatom-dominated intertidal mudflat (Marennes-Oléron, France). Guillaume Pierre,Jean-Michel Zhao,Francis Orvain,Christine Dupuy,Géraldine Kleinet al. Journal of Sea Research (JSR), 2013, 92, pp.26-35. ⟨10.1016/j.seares.2013.07.018⟩ Article dans une revue hal-01070408v1
Key Features of Intertidal Food Webs That Support Migratory Shorebirds Blanche Saint-Béat,Christine Dupuy,Pierrick Bocher,Julien Chalumeau,Margot de Crigniset al. PLoS ONE, 2013, 8 (10), pp.e76739. ⟨10.1371/journal.pone.0076739⟩ Article dans une revue hal-01097501v1
Accounting for Rough Bed Friction Factors of Mud Beds as a Result of Biological Activity in Erosion Experiments Katell Guizien,Francis Orvain,Jean-Claude Duchêne,Pierre Le Hir Journal of Hydraulic Engineering, 2012, 138 (11), pp.979-984. ⟨10.1061/(ASCE)HY.1943-7900.0000627⟩ Article dans une revue hal-02955352v1
Biochemical composition and changes of extracellular polysaccharides (ECPS) produced during microphytobenthic biofilm development (Marennes-Oléron, France). Guillaume Pierre,Marianne Graber,Beby Rafiliposon,Christine Dupuy,Francis Orvainet al. Microbial ecology, 2012, 63, pp.157 - 169 Article dans une revue hal-00789556v1
Spatial and temporal dynamics of size-structured photosynthetic parameters (PAM) and primary production (13C) of pico- and nano-phytoplankton in an atoll lagoon Sébastien Lefebvre,Pascal Claquin,Francis Orvain,Benoit Véron,Loïc Charpy Marine Pollution Bulletin, 2012, 65 (10-12), pp.478-489. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.04.011⟩ Article dans une revue istex hal-00807541v1
Spatial Variability of Benthic-Pelagic Coupling in an Estuary Ecosystem: Consequences for Microphytobenthos Resuspension Phenomenon Martin Ubertini,Sébastien Lefebvre,Aline Gangnery,Karine Grangeré,Romain Le Gendreet al. PLoS ONE, 2012, 8 (e44155), pp.7. ⟨10.1371/journal.pone.0044155⟩ Article dans une revue hal-00807556v1
Modelling the effects of macrofauna on sediment transport and bed elevation: application over a cross-shore mudflat profile and model validation Orvain Francis,Pierre Le Hir,Pierre-Guy Sauriau,Sébastien Lefebvre Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2012, 108 (1), pp.64-75. ⟨10.1016/j.ecss.2011.12.036⟩ Article dans une revue hal-01444601v1
Spatial and temporal interaction between sediment and microphytobentos in a temperate estuarine macro-intertidal bay. F. Orvain,Sébastien Lefebvre,J. Montepini,M. Sébire,A. Gangneryet al. Marine Ecology Progress Series, 2012, 458 (ISSN: 0171-8630), pp.53-68. ⟨10.3354/meps09698⟩ Article dans une revue hal-00806825v1
Biochemical characterization of Extracellular Polymeric Substances extracted from an intertidal mudflat using a cation exchange resin. Guillaume Pierre,Marianne Graber,Francis Orvain,Christine Dupuy,Thierry Maugard Biochemical Systematics and Ecology, 2010, 38, pp.917-923 Article dans une revue hal-00652078v1
Seasonal dynamics of trophic relationships between benthic suspension feeders within Crassostrea gigas culture areas. Sébastien Lefebvre,J.C. Marin-Leal,S. Dubois,F. Orvain,J.-L. Blinet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2009, 82, pp.415-425 Article dans une revue hal-00480678v1
Optimising extraction of extracellular polymeric substances (EPS) from benthic diatoms: comparison of the efficiency of six EPS extraction methods Eri Takahashi,Jérôme Ledauphin,Didier Goux,Francis Orvain Marine and Freshwater Research, 2009, 60 (12), pp.1201. ⟨10.1071/MF08258⟩ Article dans une revue hal-02472061v1
Stable isotope (δ13C and δ15N) and modelling as tools to estimate the trophic ecology of cultivated oysters in two contrasting environments J.C. Marin-Leal,S. Dubois,F. Orvain,A. Ourry,M.P. Batailléet al. Marine Biology, 2008, 153, pp.673-688 Article dans une revue hal-00481233v1
Spatio-temporal variations in intertidal mudflat erodability: Marennes-Oléron Bay, western France Francis Orvain,Pierre-Guy Sauriau,Pierre Le Hir,Gaël Guillou,Philippe Cannet al. Continental Shelf Research, 2007, 27 (8), pp.1153-1173. ⟨10.1016/j.csr.2006.05.013⟩ Article dans une revue hal-01855227v1
The influence of sediment cohesiveness on bioturbation effects due to &lt;I&gt;Hydrobia ulvae&lt;/I&gt; on the initial erosion of intertidal sediments: A study combining flume and model approaches Francis Orvain,Pierre-Guy Sauriau,Cédric Bacher,Michel Prineau Journal of Sea Research (JSR), 2006, 55 (1), pp.54-73. ⟨10.1016/j.seares.2005.10.002⟩ Article dans une revue hal-01855211v1
A model of sediment transport under the influence of surface bioturbation: generalisation to the facultative suspension-feeder Scrobicularia plana Francis Orvain Marine Ecology Progress Series, 2005, 286, pp.43-56. ⟨10.3354/meps286043⟩ Article dans une revue hal-05377981v1
Interacting effects of &lt;I&gt;Hydrobia ulvae&lt;/I&gt; bioturbation and microphytobenthos on the erodibility of mudflat sediments Francis Orvain,Pierre-Guy Sauriau,Angélique Sygut,Lucette Joassard,Pierre Le Hir Marine Ecology Progress Series, 2004, 278, pp.205 - 223. ⟨10.3354/meps278205⟩ Article dans une revue hal-01854893v1
A model of fluff layer erosion and subsequent bed erosion in the presence of the bioturbator, &lt;I&gt;Hydrobia ulvae&lt;/I&gt; Francis Orvain,Pierre Le Hir,Pierre-Guy Sauriau Journal of marine research, 2003, 61 (6), pp.821 - 849. ⟨10.1357/002224003322981165⟩ Article dans une revue hal-01854788v1
Carbohydrate production in relation to microphytobenthic biofilm development: an integrated approach in a tidal mesocosm Orvain Francis,Robert Galois,Christine Barnard,Aude Sylvestre,Gérard F. Blanchardet al. Microbial ecology, 2003, 45 (3), pp.237 - 251. ⟨10.1007/s00248-002-2027-7⟩ Article dans une revue istex hal-01854500v1
Environmental and behavioural factors affecting activity in the intertidal gastropod &lt;I&gt;Hydrobia ulvae&lt;/I&gt; Orvain Francis,Pierre-Guy Sauriau Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2002, 272 (2), pp.191 - 216. ⟨10.1016/S0022-0981(02)00130-2⟩ Article dans une revue hal-01854479v1
Influence de l’abondance du gastéropode &lt;I&gt;Hydrobia ulvae&lt;/I&gt; (Pennant) sur l’érodabilité d’un sédiment cohésif en baie de Marennes-Oléron : résultats d’expériences en canal hydraulique et mise en place d’un modèle mathématique simple Orvain Francis,Pierre-Guy Sauriau,Cédric Bacher,Michel Prineau,Thierry Benoit Journal de la Recherche Océanographique, 2001, 26 (3), pp.121-124 Article dans une revue hal-01856192v1
Dynamic behaviour of benthic microalgal biomass in intertidal mudflats Gérard F. Blanchard,Jean-Marc Guarini,Francis Orvain,Pierre-Guy Sauriau Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2001, 264 (1), pp.85 - 100. ⟨10.1016/s0022-0981(01)00312-4⟩ Article dans une revue istex hal-01854059v1

Communication dans un congrès (2)

Mise en place d’un suivi de la colonisation à plusieurs échelles P. Claquin,F. Leroy,A.M. Rusig,I Musio,E Feuntenet al. Proceedings of the RECIF Conference on artificial reefs : from materials to ecosystem, ESITC, Jan 2015, Caen, France Communication dans un congrès hal-01708572v1
Le rôle de la macrofaune dans la dynamique sédimentaire des vasières intertidales : de l’observation à la modélisation en passant par l’expérimentation Pierre-Guy Sauriau,Francis Orvain Hydrodynamique et dynamique sédimentairelittorales. Séminaire de l'Institut océanographique (2ème partie), Barusseau, J.-P., Jan 2002, Paris (Institut océanographique), France. pp.38 Communication dans un congrès hal-04178464v1

Proceedings/Recueil des communications (1)

Primary production assessment on eco-engineering infrastructures: English Channel case study P Claquin,Baptiste Vivier,M Navon,A Rusig,I Mussioet al. Marineff International Conference 2022, May 2022, Caen, France. IOP Conference Series: Materials Science and Engineering, 1245 (1), pp.012011, 2022, ⟨10.1088/1757-899x/1245/1/012011⟩ Proceedings/Recueil des communications hal-03770402v1

Chapitre d'ouvrage (3)

Données sédimentologiques Olivier Maquaire,Sandric Lesourd,Bernadette Tessier,Stéphane Costa,Jean-Claude Dauvinet al. Olivier Maquaire; Stéphanie Detourbe. Dynamiques et évolution du littoral. Fascicule 3, Synthèse des connaissances du cap d'Antifer au cap de la Hague, Édition Cerema, pp.145-191, 2019, 978-2-37180-313-8 Chapitre d'ouvrage hal-02374111v1
Contexte général : données physiographiques Olivier Maquaire,Mathieu Fressard,Olivier Dugué,Sylvain Elineau,Jean-Claude Dauvinet al. CEREMA. Dynamiques et évolution du littoral. Fascicule 3, Synthèse des connaissances du cap d'Antifer au cap de la Hague, Édition Cerema, pp.16-59, 2019, 978-2-37180-313-8 Chapitre d'ouvrage hal-02373478v1
Dynamique spatiale de la remise en suspension du microphytobenthos dans un écosystème estuarien M. Ubertini,F. Orvain,Sébastien Lefebvre,A. Gangnery François .G. Schmitt. Le 26e Forum des jeunes océanographes, Union des Océanographes de France, pp.29-34, 2012, 978-2-9510625-5-9 Chapitre d'ouvrage hal-00800116v1

Rapport (2)

MELTING POTES. Modélisation de l'Évolution à Long Terme des INGénieurs d'écosystèmes marins en réPOnse au changement climatique et au Transport sédimentaire en Estuaire de Seine Amélie Lehuen,Francis Orvain Universite de Caen Normandie. 2024 Rapport hal-05488470v1
Projet Seine-Aval 6 PHARESEE « Productivité microphytobenthique des HAbitats intertidaux en lien avec la dynamique sédimentaire, biogéochimique et les ingénieurs d'écosystème de la faune benthique : implication pour des enjeux de modélisation et de REhabilitation des vasières de la SEine Estuarienne » Francis Orvain,Arnaud Huguet,Jérôme Morelle,Bénédicte Thouvenin,Edith Parlantiet al. [Rapport de recherche] GIP Seine-Aval. 2022 Rapport (rapport de recherche) hal-03793605v1