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François EHRENMANN
François Ehrenmann, Ingénieur d'études -
Administrateur systèmes d'information et bases de données
30%
Libre accès
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Documents
Affiliations actuelles
- 1002315
Identifiants chercheurs
- francois-ehrenmann
- 0000-0003-2727-0070
Présentation
#### Administrateur de Systèmes d'informations - Bases de données - Développement Web - Bio-informatique
**Activités principales**
- Administrateur / Gestionnaire de systèmes d'informations et bases de données
- Gestion, développement et maintenance des applications web / bases de données de l'unité et dans le cadre du réseau [EVOLTREE](http://www.evoltree.eu/) ([Quercus Portal](https://quercusportal.pierroton.inra.fr/), [Pinus Portal](https://pinusportal.pierroton.inra.fr/))
- Système d'Informations (SI) de bases interopérables couvrants différents champs (génétique, génomique, écologie). Interopérabilité avec les bases de données et le système d'information [GnpIS](https://urgi.versailles.inra.fr/gnpis/) (URGI Versailles)
- Plans de gestions de données (PGD) de projets et [d'unité](https://data.inrae.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.15454/XS1RPM)
- Référent Données Opérationnel (RDO) département ECODIV
- Co-animateur Qualité de l'UMR
- Administrateur du [dataverse d'unité BIOGECO](https://data.inrae.fr/dataverse/biogeco)
- Membre du [Pôle de Compétence Métier Informatique](https://www6.bordeaux-aquitaine.inrae.fr/biogeco/Poles-de-Competences-Metiers/INFORMATIQUE) de l'unité PCM INFO
- Co-pilote de processus SSI pilier Forêt RARe
**Participation aux infrastructures de recherche**
- Infrastructure de recherche nationale **RARe** (Ressources Agronomiques pour la Recherche) - Pilier Forêt
- Infrastructure nationale **IN-SYLVA** regroupant les dispositifs de recherche des Établissements travaillant sur la gestion forestière. Web : https://www6.inra.fr/in-sylva-france/
#### Information Systems Administrator - Databases - Web Development - Bioinformatics
**Main activities**
- Administrator / Manager of information systems and databases
- Management, development and maintenance of web applications / databases of the unit and in the framework of the EVOLTREE network ([Quercus Portal](https://quercusportal.pierroton.inra.fr/), [Pinus Portal](https://pinusportal.pierroton.inra.fr/))
- Information system (IS) of interoperable databases covering different fields (genetics, genomics, ecology). Interoperability with databases and the GnpIS information system (URGI Versailles)
- Data management plans (DMP) for projects and units
- Operational data referent of the ECODIV department
- UMR Quality co-animator
- Administrator of the [BIOGECO unit dataverse](https://data.inrae.fr/dataverse/biogeco)
- Member of the [Computer Science Expertise Hub of the unit](https://www6.bordeaux-aquitaine.inrae.fr/biogeco_eng/Skill-Units/COMPUTER-SCIENCE)
- Co-pilot of the SSI process of the Forêt RARe pillar
**Participation in research infrastructures**
- National research infrastructure **RARe** (Ressources Agronomiques pour la Recherche) - Forest pillar
- **IN-SYLVA** national infrastructure grouping together the research facilities of institutions working on forest management. Web : https://www6.inra.fr/in-sylva-france/
Publications
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Oak genome reveals facets of long lifespanNature Plants, 2018, 4 (7), pp.440-452. ⟨10.1038/s41477-018-0172-3⟩
Article dans une revue
hal-01820559v1
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Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies.Molecular Ecology Resources, 2015, 16 (1), pp.254-265. ⟨10.1111/1755-0998.12425⟩
Article dans une revue
hal-01579667v1
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The oak gene expression atlas: insights into Fagaceae genome evolution and the discovery of genes regulated during bud dormancy releaseBMC Genomics, 2015, 16 (1), pp.112. ⟨10.1186/s12864-015-1331-9⟩
Article dans une revue
hal-02285504v1
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Single-nucleotide polymorphism discovery and validation in high-density SNP array for genetic analysis in European white oaksMolecular Ecology Resources, 2015, 15 (6), pp.1446-1459. ⟨10.1111/1755-0998.12407⟩
Article dans une revue
hal-02635881v1
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An integrated information system dedicated to oak genomics and geneticsPAG XXVI Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States. pp.27 slides
Communication dans un congrès
hal-01839185v1
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Oak genome sequencing and evolutionGenomics and Forest Tree Genetics Conference, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., May 2016, Arcachon, France. 134 p
Communication dans un congrès
hal-02741698v1
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Annotation of the oak genome sequence and associated bioinformatic resourcesIUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., May 2016, Arcachon, France. 134 p
Communication dans un congrès
hal-02741128v1
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Development of high density linkage maps in European oak for multi-objective genetic applicationsIUFRO working group “Genetics of Quercus and Nothofagus”, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02805716v1
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Sequencing and analysis of the oak transcriptome using RNA-seq technologiesIUFRO working group “Genetics of Quercus and Nothofagus”, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02806071v1
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Development of genomic resources to study the structure, function and evolution of the oak genomeIUFRO working group "Genetics of Quercus and Nothofagus", Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01019850v1
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