François Lallier François H. Lallier est Professeur de Biologie à la Faculté des Sciences de Sorbonne Université. Il exerce à la Station Biologique de Roscoff, en Bretagne, au sein du laboratoire Adaptation et Diversité en Milieu Marin.

Identifiants chercheurs

IdHAL :

francois-lallier

ORCID :

0000-0001-8979-8917

IdRef :

070133026

ResearcherID :

http://www.researcherid.com/rid/E-2201-2019

Présentation

François H. Lallier a obtenu son doctorat à l'université de Bordeaux en 1988, après avoir travaillé avec Jean-Paul Truchot à la station marine d'Arcachon sur la physiologie respiratoire comparative des crustacés marins. Après un séjour de deux ans dans le laboratoire de Patrick J. Walsh à la Rosenstiel School of Marine and Atmospheric Sciences de Miami, il a rejoint André Toulmond en tant que maître de conférences à l'Université Pierre et Marie Curie et s'est installé à la Station biologique de Roscoff. Il a ensuite orienté ses recherches vers l'adaptation des invertébrés marins aux cheminées hydrothermales des grands fonds, un environnement difficile où les annélides (par exemple Riftia ou Alvinella), les crustacés (par exemple Rimicaris) ou les mollusques (par exemple Bathymodiolus ou Alvinichoncha) dépendent de bactéries symbiotiques chimiotrophes pour se développer. Après avoir mené des études ciblées sur la façon dont ces animaux pouvaient s'adapter à des conditions de faible teneur en oxygène et de forte concentration en sulfure, il s'est progressivement tourné vers des approches plus globales, analysant les variations de l'expression génétique en relation avec la symbiose dans ces environnements extrêmes. Des études comparatives sur des espèces côtières (par exemple Arenicola ou les bivalves lucinidés)

Depuis 2001, il est professeur titulaire à l'Université Pierre et Marie Curie (UPMC, Paris 6, désormais Sorbonne Université), situé à la Station Biologique de Roscoff en Bretagne, où il a dirigé le laboratoire « Adaptation et diversité dans le milieu marin, une unité mixte de recherche avec le CNRS, jusqu'en 2018. Il a également dirigé un réseau national de recherche, ECCHIS, regroupant des scientifiques français spécialisés dans la « biologie des écosystèmes chimiosynthétiques des grands fonds », et a occupé le poste de chef de mission lors de sept campagnes océanographiques en haute mer.

Depuis 2019, il s'implique de plus en plus dans l'organisation et les projets prospectifs en sciences marines au sens large, tant au niveau national qu'européen, avec la coordination du réseau français des Universités marines, la création de l'Institut de l'Océan ou son implication au Comité éxécutif de l'European Marine Board.

Il compte à son actif plus de 80 publications (indice H = 34)

Publications

Article dans une revue (34)

Comparative Population Genomics Unveils Congruent Secondary Suture Zone in Southwest Pacific Hydrothermal Vents Adrien Tran Lu Y,Stéphanie Ruault,Claire Daguin-Thiebaut,Anne-Sophie Le Port,Marion Ballenghienet al. Molecular Biology and Evolution, 2025, 42 (2), ⟨10.1093/molbev/msaf024⟩ Article dans une revue hal-05557471v1
Comparative population genomics unveils congruent secondary suture zone in Southwest Pacific Hydrothermal Vents Adrien Tran Lu Y,Stéphanie Ruault,Claire Daguin-Thiébaut,Anne-Sophie Le Port,Marion Ballenghienet al. Frontiers in Ecology and Evolution, 2024, 12 (42), pp.18969-18979. ⟨10.1101/2024.05.31.596862⟩ Article dans une revue hal-05013556v1
Chromosomal assembly of the flat oyster ( Ostrea edulis L.) genome as a new genetic resource for aquaculture Isabelle Boutet,Homère Alves Monteiro,Lyam Baudry,Takeshi Takeuchi,Eric Bonnivardet al. Evolutionary Applications, 2022, 15 (11), pp.1730-1748. ⟨10.1111/eva.13462⟩ Article dans une revue hal-03896508v1
“There and back again” - Ultrastructural changes in the gills of Bathymodiolus vent-mussels during symbiont loss: Back to a regular filter-feeding epidermis Bérénice Piquet,Sophie Le Panse,François Lallier,Sébastien Duperron,Ann C. Andersen Frontiers in Marine Science, 2022, 9, pp.968331. ⟨10.3389/fmars.2022.968331⟩ Article dans une revue mnhn-03858445v1
A community perspective on the concept of marine holobionts: current status, challenges, and future directions Simon M. Dittami,Enrique Arboleda,J.-C. Auguet,Arite Bigalke,Enora Briandet al. PeerJ, 2021, 9, pp.e10911. ⟨10.7717/peerj.10911⟩ Article dans une revue hal-03166872v2
Regionalized cell proliferation in the symbiont-bearing gill of the hydrothermal vent mussel Bathymodiolus azoricus Bérénice Piquet,François Lallier,Coralie André,Bruce Shillito,Ann Andersenet al. Symbiosis, 2020, 82, pp.225-233. ⟨10.1007/s13199-020-00720-w⟩ Article dans une revue hal-03020135v1
High rates of apoptosis visualized in the symbiont-bearing gills of deep-sea Bathymodiolus mussels Bérénice Piquet,Bruce Shillito,François H. Lallier,Sébastien Duperron,Ann Andersen PLoS ONE, 2019, 14 (2), pp.e0211499. ⟨10.1371/journal.pone.0211499⟩ Article dans une revue hal-02042415v1
Global host molecular perturbations upon in situ loss of bacterial endosymbionts in the deep-sea mussel Bathymodiolus azoricus assessed using proteomics and transcriptomics Camille Detree,Iman Haddad,Emmanuelle Demey-Thomas,Joelle Vinh,François Lallieret al. BMC Genomics, 2019, 20, pp.109. ⟨10.1186/s12864-019-5456-0⟩ Article dans une revue hal-02024891v1
Identification and gene expression of multiple peptidoglycan recognition proteins (PGRPs) in the deep-sea mussel Bathymodiolus azoricus, involvement in symbiosis? Camille Détrée,François H. Lallier,Arnaud Tanguy,Jean Mary Comparative Biochemistry and Physiology - Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2017, 207, pp.1-8. ⟨10.1016/j.cbpb.2017.02.002⟩ Article dans une revue hal-01469197v1
Multiple I-Type Lysozymes in the Hydrothermal Vent Mussel Bathymodiolus azoricus and Their Role in Symbiotic Plasticity Camille Detree,Apolline Chabenat,François H. Lallier,Nori Satoh,Eiichi Shoguchiet al. PLoS ONE, 2016, 11 (2), pp.e0148988. ⟨10.1371/journal.pone.0148988⟩ Article dans une revue hal-01278598v1
Can the hemoglobin characteristics of vesicomyid clam species influence their distribution in deep-sea sulfide-rich sediments? A case study in the Angola Basin C. Decker,N. Zorn,J. Le Bruchec,J.C. Caprais,N. Potieret al. Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography, 2016, 142, pp.219-232. ⟨10.1016/j.dsr2.2016.11.009⟩ Article dans une revue hal-01401524v1
Selective forces acting during multi‑domain protein evolution: the case of multi‑domain globins Joana Cristina Projecto‑garcia,Didier Jollivet,Jean Mary,François Lallier,Stephen W Shaefferet al. SpringerPlus, 2015, 4, pp.354. ⟨10.1186/s40064‑015‑1124‑2⟩ Article dans une revue hal-01177910v1
Relative abundances of methane- and sulfur-oxidizing symbionts in gills of the deep-sea hydrothermal vent mussel Bathymodiolus azoricus under pressure Kamil M. Szafranski,Bérénice Piquet,Bruce Shillito,François Lallier,Sébastien Duperron Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2015, 101, pp.7-13. ⟨10.1016/j.dsr.2015.03.003⟩ Article dans une revue hal-01133684v1
Comparative analysis of symbiont ratios and gene expression in natural populations of two Bathymodiolus mussel species H. Guezi,Isabelle Boutet,Ann C. Andersen,F. Lallier,Arnaud Tanguy Symbiosis, 2015, 63 (1), pp.19-29. ⟨10.1007/s13199-014-0284-0⟩ Article dans une revue hal-01109381v1
Management of ambiguities in magnetostratigraphic correlation F. Lallier,C. Antoine,J. Charreau,G. Caumon,J. Ruiu Earth and Planetary Science Letters, 2013, 371-372, pp.26-36. ⟨10.1016/j.epsl.2013.04.019⟩ Article dans une revue hal-01301477v1
Endosymbiotic bacteria in the bivalve Loripes lacteus: Localization, characterization and aspects of symbiont regulation Emmanuelle Pales Espinosa,Arnaud Tanguy,Sophie Le Panse,François Lallier,Bassem Allamet al. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2013, 448, pp.327-336. ⟨10.1016/j.jembe.2013.07.015⟩ Article dans une revue istex hal-01250919v1
A New Barrier to Dispersal Trapped Old Genetic Clines That Escaped the Easter Microplate Tension Zone of the Pacific Vent Mussels Sophie Plouviez,Jean-Baptiste Faure,Dominique Le Guen,François Lallier,Nicolas Bierneet al. PLoS ONE, 2013, 8 (12), pp.e81555. ⟨10.1371/journal.pone.0081555⟩ Article dans une revue hal-01250916v1
Conjugating effects of symbionts and environmental factors on gene expression in deep-sea hydrothermal vent mussels. Isabelle Boutet,Raymond Ripp,Odile Lecompte,Carole Dossat,Erwan Correet al. BMC Genomics, 2011, 12 (1), pp.530. ⟨10.1186/1471-2164-12-530⟩ Article dans une revue inserm-00642454v1
Insights into metazoan evolution from Alvinella pompejana cDNAs. Nicolas Gagnière,Didier Jollivet,Isabelle Boutet,Yann Brélivet,Didier Bussoet al. BMC Genomics, 2010, 11 (1), pp.634. ⟨10.1186/1471-2164-11-634⟩ Article dans une revue inserm-00617220v1
Origin and Evolution of the Unique Tetra-Domain Hemoglobin from the Hydrothermal Vent Scale Worm Branchipolynoe J. Projecto-Garcia,N. Zorn,Didier Jollivet,S. W. Schaeffer,François Lallieret al. Molecular Biology and Evolution, 2010, 27 (1), pp.143-152. ⟨10.1093/molbev/msp218⟩ Article dans une revue hal-01250930v1
Determining gene flow and the influence of selection across the equatorial barrier of the East Pacific Rise in the tube-dwelling polychaete Alvinella pompejana Sophie Plouviez,Dominique Le Guen,Odile Lecompte,François Lallier,Didier Jollivet BMC Evolutionary Biology, 2010, 10, pp.220. ⟨10.1186/1471-2148-10-220⟩ Article dans une revue hal-01250939v1
Structural study of Carcinus maenas hemocyanin by native ESI-MS: Interaction with L-lactate and divalent cations Matthieu Bruneaux,Peran Terrier,Emmanuelle Leize,Jean Mary,François Lallieret al. Proteins - Structure, Function and Bioinformatics, 2009, 77 (3), pp.589-601. ⟨10.1002/prot.22471⟩ Article dans une revue hal-01250945v1
Comparative phylogeography among hydrothermal vent species along the East Pacific Rise reveals vicariant processes and population expansion in the South Sophie Plouviez,T. M. Shank,Jean-Baptiste Faure,Claire Daguin-Thiébaut,Frédérique Viardet al. Molecular Ecology, 2009, 18 (18), pp.3903-3917. ⟨10.1111/j.1365-294X.2009.04325.x⟩ Article dans une revue hal-01218864v1
Expression and localization of carbonic anhydrase and ATPases in the symbiotic tubeworm Riftia pachyptila Marie-Cécile de Cian,Ann Andersen,Xavier Bailly,François Lallier Journal of Experimental Biology, 2003, 206 (2), pp.399-409. ⟨10.1242/jeb.00074⟩ Article dans une revue hal-05579292v1
Isolated bacteriocyte cell suspensions from the hydrothermal-vent tubeworm Riftia pachyptila, a potent tool for cellular physiology in a chemoautotrophic symbiosis Mc de Cian,Ann C. Andersen,Jy Toullec,Isabelle C. Biegala,Jc Capraiset al. Marine Biology, 2003, 142, pp.141-151. ⟨10.1007/s00227-002-0931-5⟩ Article dans une revue istex hal-00727032v1
Isolated bacteriocyte cell suspensions from the hydrothermal-vent tubeworm Riftia pachyptila, a potent tool for cellular physiology in a chemoautotrophic symbiosis M.-C. de Cian,A. Andersen,J.-Y. Toullec,Isabelle C. Biegala,J.-C. Capraiset al. Marine Biology, 2003, 142 (1), pp.141 - 151. ⟨10.1007/s00227-002-0931-5⟩ Article dans une revue istex hal-01829176v1
Post-exercise lactate production and metabolism in three species of aquatic and terrestrial decapod crustaceans Raymond P. Henry,Charles E. Booth,François Lallier,Patrick J. Walsh Journal of Experimental Biology, 1994, 186 (1), pp.215-234. ⟨10.1242/jeb.186.1.215⟩ Article dans une revue hal-05579093v1
Modulation of the Oxygen-Carrying Function of Hemocyanin in Crustaceans J-P Truchot,François Lallier Physiology, 1992, 7 (2), pp.49-52. ⟨10.1152/physiologyonline.1992.7.2.49⟩ Article dans une revue hal-05579043v1
Metabolism of Isolated Hepatopancreas Cells from the Blue Crab ( Callinectes sapidus ) under Simulated Postexercise and Hypoxic Conditions François Lallier,Patrick J. Walsh Physiological Zoology, 1992, 65 (4), pp.712-723. ⟨10.1086/physzool.65.4.30158535⟩ Article dans une revue hal-05578876v1
Activities of Uricase, Xanthine Oxidase, and Xanthine Dehydrogenase in the Hepatopancreas of Aquatic and Terrestrial Crabs François Lallier,Patrick J. Walsh Journal of Crustacean Biology, 1991, 11 (4), pp.506-512. ⟨10.2307/1548519⟩ Article dans une revue hal-05578845v1
Urate Does not Accumulate in the Haemolymph of Exercised Blue Crabs, Calunectes Sapidus François Lallier,Patrick J. Walsh Journal of Experimental Biology, 1990, 154 (1), pp.581-585. ⟨10.1242/jeb.154.1.581⟩ Article dans une revue hal-05578749v1
Hemolymph oxygen transport during environmental hypoxia in the shore crab, Carcinus maenas François Lallier,J.P. Truchot Respiration Physiology, 1989, 77 (3), pp.323-336. ⟨10.1016/0034-5687(89)90120-5⟩ Article dans une revue istex hal-05578675v1
Modulation of Haemocyanin Oxygen-Affinity by L-Lactate and Urate in the Prawn Penaeus Japonicus François Lallier,J.P. Truchot Journal of Experimental Biology, 1989, 147 (1), pp.133-146. ⟨10.1242/jeb.147.1.133⟩ Article dans une revue hal-05578658v1
The effect of ambient oxygen and temperature on haemolymph l-lactate and urate concentrations in the shore crab Carcinus maenas François Lallier,F Boitel,J.P Truchot Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Physiology, 1987, 86 (2), pp.255-260. ⟨10.1016/0300-9629(87)90327-6⟩ Article dans une revue istex hal-05578645v1

Thèse (1)

Adaptation de la fonction de transport de l'oxygène par l'hémocyanine en milieu hypoxique: étude chez la crevette Penaeus japonicus et chez le crabe Carcinus maenas François Lallier Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Bordeaux, 1988. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-05578719v1

HDR (1)

Adaptations respiratoires des invertébrés inféodés aux sources hydrothermales profondes François Lallier Zoologie des invertébrés. Universite Pierre et Marie Curie, 2001 HDR tel-01169931v1

Ouvrages (1)

HOT96 news Francoise Gaill,Horst Felbeck,Daniel Desbruyeres,François Lallier,A. Toulmondet al. 5 (2), pp.22-24, 1996 Ouvrages hal-02908991v1

Chapitre d'ouvrage (2)

Enseigner l'océan François Lallier Sophie Panonacle. Quand on a que la mer.., Glénat, pp.125-141, 2025, Hommes et Océans, 978-2344070628 Chapitre d'ouvrage hal-05545836v1
THE BIOLOGY OF VESTIMENTIFERAN TUBEWORMS Monika Bright,François Lallier Gibson, RN and Atkinson, RJA and Gordon, JDM. OCEANOGRAPHY AND MARINE BIOLOGY: AN ANNUAL REVIEW, VOL 48, 48, CRC PRESS-TAYLOR & FRANCIS GROUP, pp.213-265, 2010, Oceanography and Marine Biology, 978-1-4398-2116-9 Chapitre d'ouvrage hal-01250932v1