Frederic Geniet Maître de Conférences HC/CECoordonnateur axe ThéorieÉquipe SCPN - Axe ThéorieLaboratoire Charles CoulombUniversité de Montpellier

Identifiants chercheurs

IdHAL :

frederic-geniet

ORCID :

0000-0002-9133-9151

IdRef :

033777217

VIAF :

226402983

ISNI :

0000000363349288

Présentation

Je suis actuellement enseignant chercheur au L2C et au département de physique de l'université de Montpellier. Je suis théoricien, et à l'origine de ma carrière j'ai travaillé en physique des particules. Je me suis ensuite orienté vers la physique non linéaire (découverte de la supratransmission non-linéaire avec Jérôme Léon) et la physique statistique hors équilibre que j'applique en particulier à la physique du vivant (mécanismes de partition du génôme bactérien, mécanismes de la traduction...). Mes activités d'enseignements sont assez diverses, mais actuellement j'enseigne entre autre l'hydrodynamique et la matière active en master 1 et 2. J'ai également été responsable d'une licence professionnelle sur les métiers de la couleur et membre du jury de l'agrégation de Sciences Physiques.

Publications

Article dans une revue (18)

Signature of cooperativity in the stochastic fluctuations of small systems with application to the bacterial flagellar motor María-José Franco-Oñate,Andrea Parmeggiani,Jérôme Dorignac,Frédéric Geniet,Jean-Charles Walteret al. Scientific Reports, 2025, 15, pp.32109. ⟨10.1038/s41598-025-14570-3⟩ Article dans une revue hal-04252827v2
Exit times of totally asymmetric simple exclusion processes Jerome Dorignac,Fred Geniet,Estelle Pitard Physical Review E , 2024, 109 (3), pp.034116. ⟨10.1103/physreve.109.034116⟩ Article dans une revue hal-04543017v1
TASEP Exit Times Jérôme Dorignac,Fred Geniet,Estelle Pitard Physical Review E , 2023, 109 (3), pp.034116. ⟨10.1103/PhysRevE.109.034116⟩ Article dans une revue hal-04279672v1
Physical modeling of ribosomes along messenger RNA: estimating kinetic rates from ribosome profiling experiments with a ballistic model Carole Chevalier,Jerome Dorignac,Yahaya Ibrahim,Armelle Choquet,Alexandre Davidet al. PLoS Computational Biology, 2023, 19 (10), pp.e1011522. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011522⟩ Article dans une revue hal-03832368v1
Relaxation time asymmetry in stator dynamics of the bacterial flagellar motor Ruben Perez-Carrasco,Maria-José Franco-Oñate,Jean-Charles Walter,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. Science Advances , 2022, 8 (12), pp.eabl8112. ⟨10.1126/sciadv.abl8112⟩ Article dans une revue hal-03351194v1
Supercoiled DNA and non-equilibrium formation of protein complexes: A quantitative model of the nucleoprotein ParBS partition complex Jean-Charles Walter,Thibaut Lepage,Jerome Dorignac,Frédéric Geniet,Andrea Parmeggianiet al. PLoS Computational Biology, 2021, 17 (4), pp.e1008869. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008869⟩ Article dans une revue hal-03438826v1
Modelling the effect of ribosome mobility on the rate of protein synthesis Olivier Dauloudet,Izaak Neri,Jean-Charles Walter,Jérôme Dorignac,Frédéric Genietet al. European Physical Journal E: Soft matter and biological physics, 2021, 44, pp.19. ⟨10.1140/epje/s10189-021-00019-8⟩ Article dans une revue hal-02989969v1
Phase separation of polymer-bound particles induced by loop-mediated one dimensional effective long-range interactions Gabriel David,Jean-Charles Walter,Chase P. Broedersz,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. Physical Review Research, 2020, 2 (3), ⟨10.1103/PhysRevResearch.2.033377⟩ Article dans une revue hal-02950974v1
Modeling supercoiled DNA interacting with an anchored cluster of proteins: towards a quantitative estimation of chromosomal DNA supercoiling Jean-Charles Walter,Thibaut Lepage,Jérôme Dorignac,Frédéric Geniet,Andrea Parmeggianiet al. PLoS Computational Biology, 2020, 56 (6), pp.106153. ⟨10.48550/arXiv.2002.00111⟩ Article dans une revue hal-04851307v1
Physical modeling of a sliding clamp mechanism for the spreading of ParB at short genomic distance from bacterial centromere sites Jean-Charles Walter,Jerome Rech,Nils-Ole Walliser,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. iScience, 2020, 23 (12), pp.101861. ⟨10.1016/j.isci.2020.101861⟩ Article dans une revue hal-03052753v2
Looping and clustering model for the organization of protein-DNA complexes on the bacterial genome Jean-Charles Walter,Nils-Ole Walliser,Gabriel David,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. New Journal of Physics, 2018, 20, pp.035002. ⟨10.1088/1367-2630/aaad39⟩ Article dans une revue hal-01561696v1
A conserved mechanism drives partition complex assembly on bacterial chromosomes and plasmids Roxanne Debaugny,Aurore Sanchez,Jérôme Rech,Delphine Labourdette,Jerome Dorignacet al. Molecular Systems Biology, 2018, 14 (11), pp.e8516. ⟨10.15252/msb.20188516⟩ Article dans une revue hal-01926457v1
Surfing on protein waves: proteophoresis as a mechanism for bacterial genome partitioning Jean-Charles Walter,Jerome Dorignac,Vladimir Lorman,Jérôme Rech,Jean-Yves Bouetet al. Physical Review Letters, 2017, 119 (2), pp.028101. ⟨10.1103/PhysRevLett.119.028101⟩ Article dans une revue hal-01493262v1
Generation and dynamics of quadratic birefringent spatial gap solitons Petrutza Anghel-Vasilescu,Jérôme Dorignac,Frédéric Geniet,Jérôme Léon,Abdelmajid Taki Physical Review A : Atomic, molecular, and optical physics [1990-2015], 2011, 83 (4), pp.043836. ⟨10.1103/PhysRevA.83.043836⟩ Article dans une revue hal-00628026v1
Nonlinear supratransmission in multicomponent systems Petrutza Anghel-Vasilescu,Jerome Dorignac,Frédéric Geniet,Jerome Leon,Majid Taki Physical Review Letters, 2010, 105, pp.074101. ⟨10.1103/PhysRevLett.105.074101⟩ Article dans une revue hal-00510988v1
L'Option Sciences : un atout pour le dialogue entre disciplines Luc Andral,Abdallah Sabir,Fabienne Soulier,Christophe Chaubet,Maryse Noguèset al. Repères IREM, 2006, 65, pp.91-103 Article dans une revue hal-00818699v1
Nonlinear Supratransmission Jérôme Leon,Frédéric Geniet Journal of Physics: Condensed Matter, 2003, 15, pp.2933 Article dans une revue hal-00000362v1
Energy transmission in the forbidden bandgap of a nonlinear chain F. Geniet,J. Leon Physical Review Letters, 2002, 89 (13), pp.134102. ⟨10.1103/PhysRevLett.89.134102⟩ Article dans une revue hal-00178203v1

Communication dans un congrès (5)

Signature of (anti)cooperativity in the stochastic fluctuations of small systems: application to the bacterial flagellar motor John Palmeri,Maria-José Franco-Oñate,Nils-Ole Walliser,Andrea Parmeggiani,Jérôme Dorignacet al. International Physics of Living Systems (IPOLS) 2023, Daniel Goldman, Georgia Tech, Aug 2023, Atlanta, United States Communication dans un congrès hal-04890444v1
Kinetics of stator recruitment and release in the bacterial flagellar motor Maria-José Franco-Oñate,Ruben Perez-Carrasco,Jean-Charles Walter,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. International Physics of Living Systems (IPOLS) 2022, CNRS, May 2022, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04901816v1
Phase separation of polymer-bound particles induced by loop-mediated 1D effective long-range interactions Gabriel David,Jean-Charles Walter,Chase Broedersz,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. Statistical Physics and Low Dimensional Systems, Martin Michael Müller, Oct 2020, Pont-à-Mousson, France Communication dans un congrès hal-04890693v1
Séparation de phase des à protéines liées l’ADN Gabriel David,Jean-Charles Walter,Chase Broedersz,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. GDR ADN Annual meeting, GDR ADN, Mar 2019, Lyon, France Communication dans un congrès hal-04894746v1
Effective long range interactions generated by polymer (DNA) fluctuations induce bound particle (protein) phase separation Gabriel David,Jean-Charles Walter,Chase Broedersz,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. APS March Meeting 2019, APS, Mar 2019, Boston (MA), United States Communication dans un congrès hal-04894725v1

Pré-publication, Document de travail (2)

Chain decay and rates disorder in the totally asymmetric simple exclusion process Yahaya Ibrahim,Jérôme Dorignac,Fred Geniet,Carole Chevalier,Jean-Charles Walteret al. 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04878246v1
Modelling the Perception of Colour Patterns in Vertebrates with HMAX Julien Renoult,Bastien Guyl,Tamra Mendelson,Alice Percher,Jerome Dorignacet al. 2019 Pré-publication, Document de travail hal-02378522v1

Poster de conférence (8)

Physical Modeling of Translation with a Ballistic Model: Application to the Estimation of the Kinetic Parameters from Ribosome Sequencing Experiments Carole Chevalier,Jerome Dorignac,Yahaya Ibrahim,Armelle Choquet,Alexandre Davidet al. Annual Meeting of the International Physics of Living Systems (iPoLS) Network, May 2022, Montpellier, France Poster de conférence hal-03691814v1
Modelling Spatio-temporal Dynamic of Ribosome During Translation Carole Chevalier,Jean-Charles Walter,John Palmeri,Andrea Parmeggiani,Frederic Genietet al. 7ème Journées Scientifiques du LabEx NUMEV, Nov 2018, Montpellier, France Poster de conférence hal-01950298v1
Looping and Clustering: a statistical physics approach to protein-DNA complexes in bacteria Jean-Charles Walter,Nils-Ole Walliser,Gabriel David,Jerome Dorignac,Frederic Genietet al. EMBO | EMBL Symposium: Cellular Mechanisms Driven by Liquid Phase Separation, May 2018, Heidelberg, Germany Poster de conférence hal-01939915v1
Physical modeling of active bacterial DNA segregation Jean-Charles Walter,Jean-Yves Bouet,Jerome Dorignac,Frederic Geniet,V. Lormanet al. 6ème Journées Scientifiques du LabEx NUMEV, Nov 2017, Montpellier, France Poster de conférence hal-01950263v1
Physical modeling of active bacterial DNA segregation Jean-Charles Walter,Jean-Yves Bouet,Jerome Dorignac,Frederic Geniet,Vladimir Lormanet al. Défi Inphyniti Workshop (CNRS, MI), Nov 2016, Paris, France Poster de conférence hal-01950249v1
Physical modeling of active bacterial DNA segregation Jean-Charles Walter,Jean-Yves Bouet,Jerome Dorignac,Frederic Geniet,Vladimir Lormanet al. 5ème Journées Scientifiques du LabEx NUMEV, Oct 2016, Montpellier, France Poster de conférence hal-01950151v1
3d Architecture of a Bacterial DNA Segregation Apparatus Jean-Yves Bouet,Jerome Dorignac,Frederic Geniet,Vladimir Lorman,Marcelo Nollmannet al. 4ème Journée Scientifique du LabEx NUMEV, Jul 2015, Montpellier, France Poster de conférence hal-01950016v1
Architecture of a Bacterial DNA Segregation Apparatus : Experiments and Modeling Jean-Yves Bouet,Jerome Dorignac,Frederic Geniet,Vladimir Lorman,Marcelo Nollmannet al. 3ème Journée Scientifique du LabEx NUMEV, Jul 2014, Montpellier, France Poster de conférence hal-01948428v1

Autre publication scientifique (4)

Modelling DNA segregation and positioning in the bacterial genome Andrea Parmeggiani,John Palmeri,Jerome Dorignac,Frederic Geniet 2019, pp.25 Autre publication scientifique hal-02106248v1
Physico-mathematical modelling of intracellular molecular transport Andrea Parmeggiani,Jerome Dorignac,Frederic Geniet,John Palmeri,Norbert Kern 2019, pp.26 Autre publication scientifique hal-02106252v1
Modélisation de la ségrégation et du positionnementdu génome bactérien Andrea Parmeggiani,John Palmeri,Jerome Dorignac,Frederic Geniet 2018, pp.25 Autre publication scientifique hal-02106222v1
Modélisation physico-mathématique du transport moléculaire intracellulaire Andrea Parmeggiani,Norbert Kern,Jerome Dorignac,Frederic Geniet,John Palmeri 2018, pp.26 Autre publication scientifique hal-02106225v1

Brevet (1)

Color measurements of turbid liquids (European Patent) Frederic Geniet Denmark, Patent n° : EP18150259.2. L2C:16-460. 2018 Brevet hal-02090515v1

Cours (2)

Introduction au transfert radiatif Frédéric Geniet DEA. 2013, pp.59 Cours cel-00804553v1
Approche de la Couleur Frédéric Geniet Engineering school. Université Montpellier II, 2007, pp.70 Cours cel-00392484v1