Gonché DANESH

Publications

Article dans une revue (4)

COVFlow: phylodynamics analyses of viruses from selected SARS-CoV-2 genome sequences Gonché Danesh,Corentin Boennec,Laura Verdurme,Mathilde Roussel,Sabine Trombert-Paolantoniet al. Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e101. ⟨10.24072/pcjournal.333⟩ Article dans une revue hal-04246696v1
TiPS : Rapidly simulating trajectories and phylogenies from compartmental models Gonché Danesh,Emma Saulnier,Olivier Gascuel,Marc Choisy,Samuel Alizon Methods in Ecology and Evolution, 2022, 14 (2), pp.487-495. ⟨10.1111/2041-210X.14038⟩ Article dans une revue hal-03903561v1
Early phylodynamics analysis of the COVID-19 epidemic in France Gonché Danesh,Baptiste Elie,Yannis Michalakis,Mircea T Sofonea,Antonin Balet al. Peer Community Journal, 2021, 1, pp.e45. ⟨10.24072/pcjournal.40⟩ Article dans une revue hal-03001114v2
Quantifying transmission dynamics of acute hepatitis C virus infections in a heterogeneous population using sequence data Gonché Danesh,Victor Virlogeux,Christophe Ramière,Caroline Charre,Laurent Cotteet al. PLoS Pathogens, 2021, 17 (9), pp.e1009916. ⟨10.1371/journal.ppat.1009916⟩ Article dans une revue hal-03357552v1

Pré-publication, Document de travail (2)

TiPS: rapidly simulating trajectories and phylogenies from compartmental models Gonché Danesh,Emma Saulnier,Olivier Gascuel,Marc Choisy,Samuel Alizon 2022 Pré-publication, Document de travail hal-03872312v1
Rt2: computing and visualising COVID-19 epidemics temporal reproduction number Bastien Reyné,Gonché Danesh,Samuel Alizon,Mircea T Sofonea 2020 Pré-publication, Document de travail hal-03045490v1

Rapport (3)

Phylodynamique du COVID-19 en France Gonché Danesh,Baptiste Elie,Samuel Alizon [Rapport de recherche] 4, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020 Rapport (rapport de recherche) hal-02882688v1
Estimation du nombre de reproduction de l’épidémie de COVID-19 en France Gonché Danesh,Samuel Alizon [Rapport de recherche] 1, Centre national de la recherche scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020 Rapport (rapport de recherche) hal-02882680v1
Phylodynamique du COVID-19 en France : variations temporelles de la croissance épidémique Gonché Danesh,Baptiste Elie,Samuel Alizon [Rapport de recherche] 6, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020 Rapport (rapport de recherche) hal-02882698v1

Thèse (1)

Phylodynamique des virus évoluant rapidement : approches par calcul bayésien approché et par vraisemblance Gonché Danesh Sciences agricoles. Université Montpellier, 2021. Français. ⟨NNT : 2021MONTG016⟩ Thèse tel-03346462v2