Hubert Charles
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Documents
Identifiants chercheurs
- hubert-charles
- ResearcherId : B-9392-2011
- 0000-0002-0809-4705
- ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/B-9392-2011
Présentation
Etat Civil
==========
*Date et lieu de naissance* : 3 novembre 1969 à Paris XIème
*Situation familiale* : marié, 2 enfants
*Adresse personnelle* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Site personnel** : [La biodiversité derrière ma porte ](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) ou retrouvez-moi sur [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Adresse professionnelle* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Grades et Titres
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> **2018 :** Chevalier dans l’ordre des Palmes académiques (09/01/2018)
>
> **2012 :** Professeur des Universités. UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Biologie Cellulaire.
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> **2007** : Qualification aux fonctions de Professeur des Universités en sections CNU 65-Biologie Cellulaire (07165178138), 67-Biologie des Populations et écologie (07167178138) et 68-Biologie des organismes (07168178138).
>
> **2006** : Habilitation à Diriger des Recherches soutenue le 12 avril 2006 à l’INSA de Lyon. Analyse du transcriptome de *Buchnera aphidicola*, la bactérie symbiotique du puceron *Acyrthosiphon pisum*.
>
> **Depuis le** **1er octobre 1998 :** Maître de Conférences. Laboratoire de Biologie Fonctionnelle Insectes et Interactions (Directeur, Y. Rahbé), Titularisation le 01/09/99.
>
> **1998** : Stage Post-Doctoral d’avril à septembre. UMR CNRS 5558, Université Claude Bernard Lyon 1 (équipe de M. Gouy). *Sujet* : Méthodologie de reconstruction phylogénétique dans les symbioses intracellulaires (à fort taux de A+T et forte vitesse évolutive).
>
> **1997** : Stage Post-Doctoral d’octobre 97 à mars 98. Zoological Institute, Université de Tokyo, (équipe du Pr. H. Ishikawa). *Sujet* : Carte physique du génome de *Buchnera aphidicola*.
>
> **1997** : Thèse de Doctorat (Laboratoire de Biologie Appliquée INSA 406). Félicitations du Jury – Prix Malotau de Guerne 1997. Moniteur à l’Université Claude Bernard Lyon 1 (Biomathématiques).
>
> **1994** : DEA : «Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques». Mention Très Bien.
>
> **1993** : Professeur du Contingent en Biologie au Lycée militaire d’Autun.
>
> **1992** : INSA de Lyon, département de Biochimie. Diplôme d'ingénieur biochimiste.
>
> **1989** : Premier cycle INSA en section Sport-Etudes (Handball).
Civil status
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*Date and place of birth* : November 3, 1969 in Paris XIth
*Family status* : married, 2 children
*Personal address* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Personnal website** : [La biodiversité derrière ma porte](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) or find me at [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Professional address* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Degrees and titles
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**2018** : Knight in the order of the Academic Palms (09/01/2018)
**2012** : Professor UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Cellular Biology.
**2007** : Qualification as University Professor in CNU sections 65-Cellular Biology (07165178138), 67-Population Biology and Ecology (07167178138) and 68-Organism Biology (07168178138).
**2006** : Habilitation to supervise research defended on April 12, 2006 at INSA Lyon. Analysis of the transcriptome of *Buchnera aphidicola*, the symbiotic bacterium of the aphid *Acyrthosiphon pisum*.
**Since October 1, 1998**: Senior Lecturer. Laboratory of Functional Biology of Insects and Interactions (Director, Y. Rahbé), Tenure on 01/09/99.
**1998** : Post-Doctoral internship from April to September. UMR CNRS 5558, University Claude Bernard Lyon 1 (M. Gouy's team). Subject : Methodology of phylogenetic reconstruction in intracellular symbioses (with high A+T rate and high evolutionary speed).
**1997** : Post-Doctoral internship from October 97 to March 98. Zoological Institute, University of Tokyo, (team of Pr. H. Ishikawa). Subject : Physical map of the genome of *Buchnera aphidicola*.
**1997** : PhD thesis (Laboratory of Applied Biology INSA 406). Congratulations of the Jury - Malotau de Guerne Prize 1997. Instructor at the University Claude Bernard Lyon 1 (Biomathematics).
**1994** : DEA : "Analysis and Modeling of Biological Systems". Mention Very Good.
**1993** : Professor of Biology at the Lycée militaire of Autun.
**1992** : INSA of Lyon, department of Biochemistry. Diploma of biochemical engineer.
**1989** : First cycle INSA in Sport-Etudes section (Handball).
Publications
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03514026v1
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Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
Communication dans un congrès
hal-03506807v1
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506796v1
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From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathwaysJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01208786v1
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SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01208785v1
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Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France
Communication dans un congrès
hal-03506701v1
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Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphidIPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02814211v1
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Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02808863v1
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Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic developmentSixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
hal-00748785v1
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Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid modelEMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01231279v1
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Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiquesJournée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02804281v1
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Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
Communication dans un congrès
hal-02823073v1
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Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p
Communication dans un congrès
hal-02755293v1
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Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesGenoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos
Communication dans un congrès
hal-02824684v1
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Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02818835v1
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Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02821530v1
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The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France
Communication dans un congrès
hal-00498411v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
Communication dans un congrès
hal-02814863v1
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Un vieux couple à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et sa bactérie symbiotiqueSéance commune Académie Agriculture et Académie des Sciences, Académie d'Agriculture de France (AAF). Paris, FRA., Dec 2009, Paris, France. 23 diapos
Communication dans un congrès
hal-02824438v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States
Communication dans un congrès
hal-02814342v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391280v1
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CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France
Communication dans un congrès
hal-00496032v1
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
Communication dans un congrès
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391499v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analysesRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France
Communication dans un congrès
hal-02815123v1
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Besoins en acides aminés des embryons de femelles parthénogénétiques du puceron du pois.Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Jun 2009, PARIS, France
Communication dans un congrès
hal-00511624v1
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TranscriptomiqueJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391255v1
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Les réseaux métaboliques et génétiquesJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391271v1
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France
Communication dans un congrès
hal-02824972v1
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France
Communication dans un congrès
hal-02821711v1
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391519v1
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Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391279v1
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391273v1
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Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentielsRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391259v1
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Conservation de la relation entre niveau d'expression des gènes et organisation du chromosome chez Buchnera aphidicola, symbiote primaire des pucerons : exemple d'un génome réduit mais non dégénéréXVème Colloque de Physiologie de l'Insecte, Jul 2007, Rennes, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00373311v1
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Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, "Is there any life left?"Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391505v1
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Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicolaTheoretical Approaches for the Genome Workshop, Nov 2006, France
Communication dans un congrès
hal-00506911v1
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Relationship between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391524v1
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Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genomeColloque INRA "Apports de la génomique à la physiologie et la pathologie de l'insecte", 2006, Montpellier (France), mars 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391267v1
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Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicolaWorkshop "Theoretical Approaches for the Genome", 2006, Annecy-le-Vieux (France), novembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Metabolic interactions between the bacterium Buchnera aphidicola and its obligate symbiotic partner, the pea aphid: nutritional studies combined with transcriptome analyses5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391262v1
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Buchnera aphidicola, endocytobiote du puceron : transcriptome d'un génome "dégénéré"Rencontres 2006 des Microbiologistes de l'INRA, 2006, Dourdan (France), juin 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Régulation génétique et métabolique chez Buchnera aphidicola (AgroBi 2006)Journée INRA-INRIA "Insertion des mathématiques dans les approches biologiques : du gène à l'organisme", 2006, Lyon (France), décembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Relationships between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid5th International of Symbiosis Society Congress, Aug 2006, Autriche
Communication dans un congrès
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Genomewide transcriptional changes associated with nutritional alterations affecting phenylalanine and tyrosine metabolism in Buchnera aphidicolaJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Global transcriptional responses of Buchnera aphidicola to aromatic amino acid limitation in the diet of its symbiotic partner, the phloem sap feeding insect Acyrthosiphon pisumSociety of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S226
Communication dans un congrès
hal-00391261v1
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Analyse transcriptomique de la réponse de Buchnera aphidicola à un stress métabolique subi par son hôte le puceron du pois, Acyrthosiphon pisumJournées Reseau Ecologie et Interactions Durables (REID), 2005, Lyon (France), janvier 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Of lice and plants: metabolite flows in the trophic pathway of phloem feeding insects as analysed through genomic and EST data from the aphid symbiosisSociety of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S233
Communication dans un congrès
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Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genomeIntegrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Buchnera aphidicola, bactérie endosymbiotique des pucerons : génomes et physiologie symbiotique4. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France
Communication dans un congrès
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Analyse du transcriptome de Buchnera, la bactérie symbiotique intracellulaire des pucerons : une approche méthodologique14. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France
Communication dans un congrès
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Les bactéries intracellulaires des insectes : Phylogénie et évolution moléculaireRencontre des Microbiologistes de l'INRA, Apr 1999, Dourdan, France
Communication dans un congrès
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Comparative and phylogenetic aspects of two insect endocytobioses : aphids and weevilsCOST meeting : Bacterial symbionts on survival of entomopathogenic nematodes, Apr 1998, Wellesbourne, United States
Communication dans un congrès
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Comparative and phylogenetic aspects of two insect endosymbioses : aphids and weevilsCost 819. Entomopathogenic nematodes. Taxonomy, phylogeny and gnotobiological studies of entomopathogenic nematode bacterium complexes, 1999
Chapitre d'ouvrage
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