
Isabelle LEBERT
Présentation
EXPÉRIENCE PROFESSIONNELLE
01/01/1991 Ingénieur de Recherches à
INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT
INRAE Clermont-Ferrand-Auvergne-Rhône-Alpes, Site de Theix, F-63122 Saint-Genès Champanelle
- 1991-2004 INRA UR370 Station de Recherches sur la Viandes.
Projet de recherche : Microbiologie prévisionnelle et génie des procédés
- 2004-2011: INRA UR454 Microbiologie.
Projet de recherche : Physiologie bactérienne en biofilm mixte
- 2011 - à nos jours : INRA UMR346 Epidémiologie des maladies animales et zoonotiques.
Projet de recherche : Systèmes d'information géographiques appliqués à l'épidémiologie animale
ÉDUCATION ET FORMATION
- 01/09/1986–08/12/1989 Diplôme d'ingénieur, Montpellier SupAgro, Montpellier (France)
Agronomie, Microbiologie alimentaire, Sécurité alimentaire
- 01/09/2000–01/02/2004 Doctorat en sciences des Aliments, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand (France)
Microbiologie alimentaire, microbiologie prévisionnelle, génie des procédés, thermodynamique appliquée, modélisation
- 01/11/2006 Habilitation à diriger des Recherches, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand (France)
Microbiologie alimentaire, microbiologie prévisionnelle, génie des procédés, thermodynamique appliquée, modélisation
Compétences organisationnelles/ managériales
Capacité à organiser, manager des projets, ou des taches scientifiques
Référente du management de la Qualité en recherche dans l'UMR EPIA
Référente Europe d'unité
Compétences liées à l’emploi
Compétences en systèmes d’information géographiques, bases de données, analyses spatiales, statistiques spatiales sur les méthodes d’agrégation, analyses lmulti-critères
Applications à l'épidémiologie animale et en particulier aux tiques et maladies à tiques :
Distribution de la tique Ixodes ricinus en France, risque tique, sciences participatives, exposition humaine aux piqûres de tiques, prévention des piqûres de tiques
PROJETS
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2020-2023 : Projet européen MOOD : MOnitoring Outbreak events for Disease surveillance in a data science context, coordonné par le Cirad (R. Lancelot)
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2019-2023 : Projet DAPPEM Développement d’une APPlication d’identification des Erythèmes Migrants (signe cutané de maladie de Lyme) à partir de photographies.Porteur du projet O. Lesens (CHU/LMGE). Collaborations : E. Mephu Nguifo (UCA, LIMOS), O. Lesens (CHU), UMR EPIA, partenaires socio-économiques et sanitaires : Mutualité Sociale Agricole (MSA), ONF (Office National des Forêts), CNPF (Centre Régional pour la Propriété Forestière). Responsable opérationnelle et suivi financier : I. Lebert
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2018-2021 : Projet CLIMATICK : Projection and adaptation of tick threat in agricultural and forest landscape under climate change.Porteur du projet : K. Chalvet-Monfray (UMR EPIA).Responsable opérationelle dans l’UMR EPIA : I. Lebert
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2018-2023 : Projet ERATIQ Evaluation du Risque d’exposition Aux piqûres de TIQues et aux agents de la maladie de Lyme dans les parcs urbains et péri-urbains de la région lyonnaise. Porteur du projet : M. René-Martellet.En collaboration avec Ville de Lyon, Métropole de Lyon, ARS, GREPS (Lyon 2)
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2018- : Projet FREQRANDO : Fréquentation humaine dans les sentiers et chemins français en France métropolitaine.Porteur du projet : I. Lebert, en collaboration avec Fédération Française de Randonnée Pédestre et S. Duméry
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2017-2019 : Projet TELETIQ Intérêt des données de TELEphonie mobile et des sciences participatives pour l’estimation et la compréhension du risque de transmission de maladies liées à l’environnement : Application aux maladies transmises par les TIQues. Porteur du projet G. Vourc’h, puis I. Lebert et S. Bord (2018-2019).Collaborations : S. Dernat, F. Johany (INRA, UMR Territoires), S. Bimonte (UR TSCF, IRSTEA), Orange Labs, JF Cosson (CITIQUE), C. Linard (Université de Namur).
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2017-2018 : Projet LYMESNAP Incidence de l’érythème chronique migrant dans le territoire du Pays des Combrailles : étude participative en population générale par télédéclaration. Porteur du projet : Pr O. Lesens (CHU Clermont-Ferrand),
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2015- : Projet CARTOTIQUE : Cartographie du risque de transmission de la maladie de Lyme par la tique Ixodes ricinus chez l’Homme en France. Porteur du projet : Magalie René-Martellet (VetAgroSup Marcy)
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2013-2015: Projets avec A. Leblond (VetAgroSup Lyon) : Evaluation de la probabilité de complication de la piroplasmose lors de l’hospitalisation d’un cheval selon l’origine géographique et la saison par des méthodes d’agrégations.
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2012-2016 : Projet ANR OSCAR Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage du Risque Acarologique.Porteur du projet : O. Plantard (BioEPAR, INRA).Gestionnaire de la base de données en lien avec les données géoréférencées, rédaction datapaper et partage des données (entrepôt dataverse) : I. Lebert
Publications
Publications
Tiques et risque tique dans une démarche One Health : Projet EPPAT19. Réunion annuelle du groupe « Tiques & Maladies à Tiques », Nov 2024, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-04784487
v1
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Tiques et surveillance des tiques : recherche et préventionJournées Portes Ouvertes du Centre INRAE Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes, INRAE, May 2024, Theix, France
Communication dans un congrès
hal-04987960
v1
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Peau&Tique, un outil pour la traçabilité et la surveillance de la forme précoce de la maladie de Lyme18. Réunion annuelle du groupe "Tiques et Maladies à Tiques" (TMT), Sep 2023, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
hal-04217701
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Risk assessment associated with ticks in urban and periurban green spaces in the region of Lyon, France: Results of ticks and rodents surveillance from 2019 to 202218. Réunion annuelle du groupe "Tiques et Maladies à Tiques" (TMT) du Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Sep 2023, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
hal-04217745
v1
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Tiques et maladies à tiquesAssemblée générale de la FDSEA 42, Oct 2023, Saint-Bonnet le Courreau, France
Communication dans un congrès
hal-04250056
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EMScan, une application mobile pour l’assistance au diagnostic des formes précoces de la maladie de Lyme23ème conférence francophone sur l’extraction et la gestion des connaissances (EGC), Université Lumière Lyon 2, Jan 2023, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04087748
v2
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La tique <i>Ixodes ricinus</i> et maladies transmises par les tiquesComité de coordination départemental de lutte contre les espèces à enjeu pour la santé humaine dont les ambroisies, Préfecture de Haute Loire, Mar 2023, Le Puy-en-Velay, France
Communication dans un congrès
hal-04074642
v1
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Evaluation du risque d’exposition aux tiques et aux agents de la maladie de Lyme dans les espaces verts de la région lyonnaise : résultats de la surveillance 2019-2023Colloque final de restitution du projet Biodiversa-Bioroddi, Nov 2023, Lyon (Sciences Po), France
Communication dans un congrès
hal-04440523
v1
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Projet Cartotique : Cartographie des conditions favorables à la tique <i>Ixodes ricinus</i> en France.Groupe de travail TBE, ANSES, 2022, En ligne, France
Communication dans un congrès
hal-03974853
v1
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EMScan: A Mobile Application for Early Lyme Disease DiagnosisEuropean Conference on Computer Vision ECCV-2022, Oct 2022, Tel-Aviv, Israël
Communication dans un congrès
hal-04087855
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Projet DAPPEM : Développement d'une APPlication d'identification des Erythèmes Migrants (signe cutané de maladie de Lyme) à partir de photographiesJournées Tiques et Maladies à Tiques, Mar 2022, Nancy, France
Communication dans un congrès
hal-03623091
v1
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Meteorological, climatic variables, and habitat heterogeneity predict the Ixodes ricinus nymph activity in FranceJournées Tiques et Maladies à Tiques, Mar 2022, Nancy, France
Communication dans un congrès
hal-03634322
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Enquête en région Rhône-Alpes-Auvergne sur les connaissances des pharmaciens sur l’écologie des tiques et la prévention de la maladie de LymeRéunion Tiques & Maladies à Tiques, Mar 2022, Nancy, France
Communication dans un congrès
hal-03632312
v1
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Tiques et maladies à tiques - Projet de recherche DAPPEM : identification des érythèmes migrantsAssemblée générale de la FDSEA 43, Jun 2022, Saint-Paulien, France
Communication dans un congrès
hal-03693207
v1
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Projet DAPPEM : Développement d’une APPlication de repérage des Erythèmes Migrants à partir de photographiesJournées Nationales des Centres de Références de Maladies Vectorielles à tiques, Apr 2022, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
hal-04086700
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Use of deep learning methods applied to the study of ticks and tick-borne diseasesJournées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Emmanuelle Becker (Université de Rennes); Thomas Derrien (CNRS); Claire Lemaitre (Inria), Jul 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03764950
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Utilisation de techniques d'intelligence artificielle dans le cadre de l'étude des tiques et de la maladie de LymeJournées INRAE systèmes d'information pour les données agro-environnementales, INRAE, Oct 2022, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
hal-04087679
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Seroprevalence of Q fever among blood donors and screening for Coxiella burnetii DNA in environmental dust in a French conurbation recently confronted to clustered human casesESCCAR International congress on Rickettsiae and 9th Meeting of the European Society for Chlamydia Research (ESCR), American Rickettsia Society; European Society for Chlamydia Research; European Society on intracellular bacteria (ESCCAR), Aug 2022, Lausanne, Switzerland
Communication dans un congrès
hal-03757385
v1
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Tiques et maladies à tiques Ecologie des tiques Maladies à tique Projet de recherche DAPPEM : identification des érythèmes migrantsAssemblée générale de la MSA Auvergne, Mutualité Sociale Agricole, Nov 2021, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
hal-03485332
v1
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Séroprévalence de la fièvre Q chez les donneurs de sang de l'agglomération niortaise, bassin d'élevage caprin récemment confronté à des cas humains groupésCongrès de la Société Française de Transfusion Sanguine, SFTS, Nov 2021, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-03511029
v1
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Projet transdisciplinaire EXPAIRCOX : études épidémiologiques et sociologiques dans une région régulièrement confrontée à la fièvre QWebinaire Pilotage de la santé des ruminants, Oct 2021, A distance, France
Communication dans un congrès
hal-04987912
v1
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Evaluation du risque d’exposition aux tiques dans les parcs publics et les espaces boisés en région LyonnaiseCongrès annuel conjoint des Sociétés Françaises de Mycologie Médicale et de Parasitologie, Equipes de Parasitologie et de Mycologie Médicale de Saint-Etienne et de Lyon; Ensemble de la communauté médicale et vétérinaire de la région Auvergne-Rhône-Alpes, Oct 2021, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04986819
v1
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Evaluation du risque associé aux tiques dans les parcs Lyonnais: résultats de la surveillance réalisée en 201916ème réunion annuelle du groupe de travail Tiques et Maladies à Tiques (TMT) du Réseau Ecologie des Interactions durables (REID), Mar 2021, En Distanciel, France
Communication dans un congrès
hal-04988501
v1
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Projet DAPPEM Développement d'une APPlication d'identification des Erythèmes Migrants (signe cutané de maladie de Lyme) à partir de photographiesRéunion organisée par le Centre de référence des Maladies vectorielles liées aux Tiques, Sep 2020, Clermont-Ferrand, France. pp.12 slides
Communication dans un congrès
hal-02931682
v1
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WIKISEMIO , une plateforme collaborative pour la définition de la sémiologie de cartesVisualization & HCI* for Crowd-Sourcing, Institut National de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture (IRSTEA). FRA., Jun 2019, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
hal-02790334
v1
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Projet CLIMATICK : Projection and adaptation of tick threat in agricultural and forest landscape under climate changeSéminaire annuel OPTMix, Institut National de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture (IRSTEA). FRA., Jan 2019, Nogent-sur-Vernisson, France. pp.22 slides
Communication dans un congrès
hal-02789712
v1
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Intérêt des données de téléphonie mobile et des sciences participatives pour l’estimation et la compréhension du risque de transmission de maladies liées à l’environnement : Application aux maladies transmises par les tiquesREID-ImmunInv2019, May 2019, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-02790331
v1
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Etude des risques associés aux tiques dans les parcs urbains et périurbains en région lyonnaiseREID-ImmunInv2019, Jun 2019, Montpellier, France. pp.16 slides
Communication dans un congrès
hal-02790332
v1
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Maladie de Lyme et autres infections : rôle des tiques, des bactéries et des animaux.Assemblée Générale de l‘Union Forestière en Montagne Bourbonnaise, Jan 2019, Saint-Clément (03), France. pp.46 slides
Communication dans un congrès
hal-02789673
v1
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Lymesnap - Télédéclaration de l’érythème chronique migrant dans le territoire du Pays des Combrailles - Etude de faisabilitéRéunion Tiques & Maladies à Tiques, Mar 2018, Laschamps - Saint Genès Champanelle, France. pp.26 slides
Communication dans un congrès
hal-02789889
v1
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Tiques et risques associés à une piqûre en région ARAPrésentation à la Direction de l’écologie urbaine, Feb 2018, Lyon, France. pp.17 slides
Communication dans un congrès
hal-02789664
v1
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Incidence de l’érythème chronique migrant dans le territoire du Pays des Combrailles. Etude participative en population générale par télédéclarationJournée régionale de veille sanitaire en Auvergne-Rhône-Alpes, Organisation territoriale des Agences Régionales de Santé (ARS)et de Santé publique FranceSanté., Dec 2017, Lyon, France. pp.17 slides
Communication dans un congrès
hal-02789729
v1
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Taking into account the spatial heterogeneity of agricultural landscapes to explain densities and movements of Ixodes ricinus and prevalence of its associated pathogens9. Tick and Tick-borne Pathogen Conference & 1st Asia Pacific Rickettsia Conference, Aug 2017, Cairns, Australia. 140 p
Communication dans un congrès
hal-02737044
v1
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Maladie de Lyme : informations générales épidémiologiquesIntervention à destination des professionnels de santé, Mar 2017, Clermont-Ferrand, France. pp.30 slides
Communication dans un congrès
hal-02791344
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Développement d’un outil de prédiction du risque d’exposition à la tique Ixodes ricinus et aux agents de la Borréliose de Lyme en France14. Rencontre des Microbiologistes du Pôle Clermontois, Apr 2017, Clermont-Ferrand, France. pp.13 slides, ⟨10.15454/1.520510083776725e12⟩
Communication dans un congrès
hal-02790684
v1
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Maladie de Lyme : informations générales épidémiologiquesRéunion d'information dans le cadre du projet LymeSnap, Mar 2017, Saint-Gervais-d’Auvergne, France. pp.30 slides
Communication dans un congrès
hal-02791406
v1
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Le projet Oscar : prendre en compte l'hétérogénéité spatiale du paysage pour comprendre les déterminants de la distribution du risque lié aux maladies à tiques13. Journées d'Animation Scientifique du Département de Santé Animale (JAS), May 2016, Poitiers, France
Communication dans un congrès
hal-02800337
v1
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Les caractéristiques d'un paysage agricole influencent-elles la relation rongeur-tique ?Réunion annuel du groupe "Tiques et Maladies à Tiques" (TMT) du Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), Mar 2015, Montferrier sur Lez, France
Communication dans un congrès
hal-02417303
v1
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Incidence et diagnostic différentiel de l’Ehrlichiose canine dans le Sud de l’Europe : Résultats d’une enquête réalisée dans 78 clientèles vétérinairesRéunion du groupe de travail « Tiques et Maladies à Tiques » au sein du « Réseau Ecologie des Interactions durables », Mar 2015, Lyon, France. pp.16 slides
Communication dans un congrès
hal-02797915
v1
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A mapping tool to evaluate the impact of global change on tick-borne disease risk in European agricultural landscapes3e Conférence « Global Climate Smart Agriculture », Mar 2015, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-01169433
v1
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Vector role of <em>Rhipicephalus sanguineus</em>: implication in the transmission of canine tick-borne diseases (canine babesiosis, Rickettsial diseases)11. Merial symposium on parasitosis & arthopod-borne diseases, Oct 2014, Palerme, Italy. pp.33 slides
Communication dans un congrès
hal-02794375
v1
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Questionnaire based survey on distribution and clinical incidence of canine babesiosis in France12. International Symposium on Ectoparasites of Pets (ISEP), Apr 2013, Munich, Germany
Communication dans un congrès
hal-02809132
v1
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Detection of several vector-borne pathogens in dogs with clinical suspicion of canine monocytic ehrlichiosis in Southern Europe12. International Symposium on Ectoparasites of Pets (ISEP), Apr 2013, Munich, Germany
Communication dans un congrès
hal-02805858
v1
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Systèmes d’Information Géographique et analyses spatiales appliqués à l’épidémiologie animale : source d’infection des cas d'Encéphalopathie Spongiforme Bovine nés après l’interdiction des farines animales en 19905. Assemblée des utilisateurs, Centre régional auvergnat d'Information géographique (CRAIG). Clermont-Ferrand, FRA., Nov 2012, Clermont-Ferrand, France. pp.25 slides
Communication dans un congrès
hal-02806763
v1
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Répartition géographique de la babésiose canine en 2010. Résultats d’une enquête nationale auprès des vétérinaires praticiensCongrès des Sociétés Françaises de Parasitologie et de Mycologie Médicale, May 2012, Rennes, France. pp.14 slides
Communication dans un congrès
hal-02807316
v1
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Microbial risk assessment in coagulase negative staphylococci isolated from fermented foodstuffs using a dedicated diagnostic microarray21. International ICFMH " Evolving microbial Food quality and safety", Sep 2008, Aberdeen, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-01454045
v1
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Assessment of the effect of temperature, relative humidity and strain-to-strain variability Listeria spp. growth kinetics under refrigerated state.5th International Conference Predictive Modelling in Foods, 2007, Athène, Greece. pp.X
Communication dans un congrès
hal-00343937
v1
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Application of a complete heat-water model to predict microbial growth and inactivation during airflow treatments at the surface of meat products3. International Symposium on Applications of Modelling as an Innovative Technology in the Agri-Food Chain, May 2005, Louvain, Belgium
Communication dans un congrès
hal-02833272
v1
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Selection of cell wall antigens for the rapid detection of bacteria by immunological methods35. International Congress of Meat Science and Technology, Aug 1989, Copenhagen, Denmark
Communication dans un congrès
hal-02781060
v1
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Cartographie des habitats favorables à la tique Ixodes ricinus en France par analyse multicritère.Journées d’Animation Scientifique du Département Santé Animale, Oct 2022, Anglet, France.
Poster de conférence
hal-03837303
v1
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Activité d'Ixodes ricinus en lien avec la météorologie dans le cadre du changement climatiqueJournées d'Animation Scientifique du Département Santé Animale (JAS DSA), Oct 2018, Nantes, France. , 2018
Poster de conférence
hal-02788333
v1
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Feasibility of erythema migrans e-declaration by citizens in a rural area: a pilot study (Lymesnap study)European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Apr 2018, Madrid, Spain. 2018
Poster de conférence
hal-02789759
v1
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Evaluation de la télédéclaration pour estimer l’incidence de l’érythème migrant en Pays des Combrailles : étude PiloteJournées d'Animation Scientifique du Département Santé Animale (JAS DSA), Oct 2018, La Chapelle-sur-Erdre, France. INRA - SANTE ANIMALE, 110 p., 2018, Journées d'Animation Scientifique du Département Santé Animale (JAS DSA)
Poster de conférence
hal-02737232
v1
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Etude Lyme Snap. Télé-déclaration pour l’estimation de l’incidence de l’érythème migrant : Étude pilote19èmes Journées Nationales d’Infectiologie, Jun 2018, Nantes, France. 2018
Poster de conférence
hal-02788566
v1
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Développement d’un outil de prédiction des conditions favorables à la présence de la tique Ixodes ricinus, vecteur de la Borréliose de Lyme en FranceJournée scientifique ARC Santé, Sep 2015, Isle d'Abeau, France. 2015
Poster de conférence
hal-02800091
v1
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Several Anaplasma phagocytophilum epidemiological cycles in France revealed by sequencingConference GERI Genes, Ecosystems and Risk of Infection, Apr 2015, Heraklion, Greece. , 2015
Poster de conférence
hal-01169445
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Hygiène des procédés de traitement par l'aircongrès, 1999, 1999
Poster de conférence
hal-02835883
v1
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Microorganisms in traditional fermented meatsHandbook of fermented meat and poultry, 2.ed., John Wiley and Sons, pp.7, 2015, 978-1-118-52265-3; 978-1-118-52269-1
Chapitre d'ouvrage
hal-02801458
v1
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A global approach to predict Listeria innocua growth at the surface of foods as a function of the media and process characteristics.Larroche, C., Pandey, A., Dussap, C. G. Current Topics in Food Industry., 1, Asiatech, New Delhi, pp.296-317, 2004
Chapitre d'ouvrage
hal-05041308
v1
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Eating qualityEncyclopaedia of food sciences and nutrition., Academic Press, 2003, 0-12-227061-4
Chapitre d'ouvrage
hal-02826852
v1
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Prediction of bacterial growth in practiceNew development in meat refrigeration, ECCEAMST, 1996, 90-75319-13-4
Chapitre d'ouvrage
hal-02836536
v1
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Vers des cartes météo des tiques en France métropolitaine2022
Autre publication scientifique
hal-04987455
v1
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Ce qu’il faut retenir des tiques et de la prévention de la maladie de Lyme.2019, ⟨10.15454/c0gnl8⟩
Autre publication scientifique
hal-02998105
v1
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Cartographie des conditions favorables à la tique <i>Ixodes ricinus</i> en région Auvergne-Rhône-Alpes[Stage] INRAE. 2021, pp.49
Rapport
hal-03335313
v1
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Lyme borreliosis2024, pp.130-165
Chapitre de rapport
(rapport contrat/projet)
hal-04711142
v1
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Prédiction de la croissance de Listeria innocua par une approche phénoménologique : Modélisations complémentaires des propriétés du milieu, des transferts d'eau et des cinétiquesIngénierie des aliments. Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I, 2004. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse
tel-02831524
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Prédiction et simulation de la qualité et de la sécurité microbiologiques des aliments pendant un procédé. Méthodologies et modélisationsSciences du Vivant [q-bio]. ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE, 2006
HDR
tel-03078424
v1
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Les données sur les tiques : Quelles données ? Quelle utilisation ? Quel devenirÉcole thématique. En Ligne, France. 2023, 76 p
Cours
hal-03975408
v1
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