Isabelle LEBERT
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Presentation
**EXPÉRIENCE PROFESSIONNELLE**
01/01/1991 Ingénieur de Recherches à
INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT
INRAE Clermont-Ferrand-Auvergne-Rhône-Alpes, Site de Theix, F-63122 Saint-Genès Champanelle
- 1991-2004 INRA UR370 Station de Recherches sur la Viandes.
Projet de recherche : Microbiologie prévisionnelle et génie des procédés
- 2004-2011: INRA UR454 Microbiologie.
Projet de recherche : Physiologie bactérienne en biofilm mixte
- 2011 - à nos jours : INRA UMR346 Epidémiologie des maladies animales et zoonotiques.
Projet de recherche : Systèmes d'information géographiques appliqués à l'épidémiologie animale
**ÉDUCATION ET FORMATION**
- 01/09/1986–08/12/1989 Diplôme d'ingénieur, Montpellier SupAgro, Montpellier (France)
Agronomie, Microbiologie alimentaire, Sécurité alimentaire
- 01/09/2000–01/02/2004 Doctorat en sciences des Aliments, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand (France)
Microbiologie alimentaire, microbiologie prévisionnelle, génie des procédés, thermodynamique appliquée, modélisation
- 01/11/2006 Habilitation à diriger des Recherches, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand (France)
Microbiologie alimentaire, microbiologie prévisionnelle, génie des procédés, thermodynamique appliquée, modélisation
**Compétences organisationnelles/ managériales**
Capacité à organiser, manager des projets, ou des taches scientifiques
Référente du management de la Qualité en recherche dans l'UMR EPIA
Référente Europe d'unité
**Compétences liées à l’emploi**
Compétences en systèmes d’information géographiques, bases de données, analyses spatiales, statistiques spatiales sur les méthodes d’agrégation, analyses lmulti-critères
Applications à l'épidémiologie animale et en particulier aux tiques et maladies à tiques :
Distribution de la tique Ixodes ricinus en France, risque tique, sciences participatives, exposition humaine aux piqûres de tiques, prévention des piqûres de tiques
**PROJETS**
- 2020-2023 : Projet européen MOOD : MOnitoring Outbreak events for Disease surveillance in a data science context, coordonné par le Cirad (R. Lancelot)
- 2019-2023 : Projet DAPPEM Développement d’une APPlication d’identification des Erythèmes Migrants (signe cutané de maladie de Lyme) à partir de photographies.Porteur du projet O. Lesens (CHU/LMGE). Collaborations : E. Mephu Nguifo (UCA, LIMOS), O. Lesens (CHU), UMR EPIA, partenaires socio-économiques et sanitaires : Mutualité Sociale Agricole (MSA), ONF (Office National des Forêts), CNPF (Centre Régional pour la Propriété Forestière). Responsable opérationnelle et suivi financier : I. Lebert
- 2018-2021 : Projet CLIMATICK : Projection and adaptation of tick threat in agricultural and forest landscape under climate change.Porteur du projet : K. Chalvet-Monfray (UMR EPIA).Responsable opérationelle dans l’UMR EPIA : I. Lebert
- 2018-2023 : Projet ERATIQ Evaluation du Risque d’exposition Aux piqûres de TIQues et aux agents de la maladie de Lyme dans les parcs urbains et péri-urbains de la région lyonnaise. Porteur du projet : M. René-Martellet.En collaboration avec Ville de Lyon, Métropole de Lyon, ARS, GREPS (Lyon 2)
- 2018- : Projet FREQRANDO : Fréquentation humaine dans les sentiers et chemins français en France métropolitaine.Porteur du projet : I. Lebert, en collaboration avec Fédération Française de Randonnée Pédestre et S. Duméry
- 2017-2019 : Projet TELETIQ Intérêt des données de TELEphonie mobile et des sciences participatives pour l’estimation et la compréhension du risque de transmission de maladies liées à l’environnement : Application aux maladies transmises par les TIQues. Porteur du projet G. Vourc’h, puis I. Lebert et S. Bord (2018-2019).Collaborations : S. Dernat, F. Johany (INRA, UMR Territoires), S. Bimonte (UR TSCF, IRSTEA), Orange Labs, JF Cosson (CITIQUE), C. Linard (Université de Namur).
- 2017-2018 : Projet LYMESNAP Incidence de l’érythème chronique migrant dans le territoire du Pays des Combrailles : étude participative en population générale par télédéclaration. Porteur du projet : Pr O. Lesens (CHU Clermont-Ferrand),
- 2015- : Projet CARTOTIQUE : Cartographie du risque de transmission de la maladie de Lyme par la tique Ixodes ricinus chez l’Homme en France. Porteur du projet : Magalie René-Martellet (VetAgroSup Marcy)
- 2013-2015: Projets avec A. Leblond (VetAgroSup Lyon) : Evaluation de la probabilité de complication de la piroplasmose lors de l’hospitalisation d’un cheval selon l’origine géographique et la saison par des méthodes d’agrégations.
- 2012-2016 : Projet ANR OSCAR Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage du Risque Acarologique.Porteur du projet : O. Plantard (BioEPAR, INRA).Gestionnaire de la base de données en lien avec les données géoréférencées, rédaction datapaper et partage des données (entrepôt dataverse) : I. Lebert
**WORK EXPERIENCE**
01/01/1991 Research Engineer
National Research Institute for Agriculture, Food and Environment
INRAE Clermont-Ferrand-Auvergne-Rhône-Alpes, Site de Theix, F-63122 Saint-Genès Champanelle
- 1991-2004 INRA UR370 Meat Research Department.
Research project: Predictive microbiology and combined modelling approach
- 2004-2011: INRA UR454 Microbiology Unit.
Research project: Bacterial physiology in Mixed Biofilm
- 2011 - up to now: INRA UMR346 Epidemiology of animal and zoonotic diseases.
Research project: Geographic Information Systems applied to Animal Epidemiology
**EDUCATION AND TRAINING**
- 01/09/1986–08/12/1989 Engineer degree, Montpellier SupAgro, F-Montpellier
Agronomy, Food microbiology, Food safety
- 01/09/2000–01/02/2004 Ph.D in Food sciences, Université Clermont Auvergne, F-Clermont-Ferrand
Food microbiology, predictive microbiology, process engineering, applied thermodynamic, modelling
- 01/11/2006 Habilitation à diriger des Recherches, Université Clermont Auvergne, F-Clermont-Ferrand
Food microbiology, predictive microbiology, process engineering, applied thermodynamic, modelling
**Organisational / managerial skills**
Ability to organize, to manage projects or scientific tasks
Quality management referre in research in my research unit
Europe referre in EPIA
**Job-related skills**
Skills in geographic information systems, databases, spatial analyses, spatial statistics on aggregation methods, multicriteria analysis.
Applications to animal epidemiology and particularly tick and tick-borne diseases:
Ixodes ricinus tick distribution in France, tick risk, citizen sciences, human exposure to Lyme disease, prevention of tick bites.
**PROJECTS**
2020-2023 : Projet européen MOOD : MOnitoring Outbreak events for Disease surveillance in a data science context, coordonninated by Cirad (R. Lancelot)
2019-2023 : Projet DAPPEM Développement d’une APPlication d’identification des Erythèmes Migrants (signe cutané de maladie de Lyme) à partir de photographies.Porteur du projet O. Lesens (CHU/LMGE). Collaborations : E. Mephu Nguifo (UCA, LIMOS), O. Lesens (CHU), UMR EPIA, partenaires socio-économiques et sanitaires : Mutualité Sociale Agricole (MSA), ONF (Office National des Forêts), CNPF (Centre Régional pour la Propriété Forestière). Responsable opérationnelle et suivi financier : I. Lebert
2018-2021 : Projet CLIMATICK : Projection and adaptation of tick threat in agricultural and forest landscape under climate change.Porteur du projet : K. Chalvet-Monfray (UMR EPIA).Responsable opérationelle dans l’UMR EPIA : I. Lebert
2018-2023 : Projet ERATIQ Evaluation du Risque d’exposition Aux piqûres de TIQues et aux agents de la maladie de Lyme dans les parcs urbains et péri-urbains de la région lyonnaise. Porteur du projet : M. René-Martellet.En collaboration avec Ville de Lyon, Métropole de Lyon, ARS, GREPS (Lyon 2)
2018- : Projet FREQRANDO : Fréquentation humaine dans les sentiers et chemins français en France métropolitaine.Porteur du projet : I. Lebert, en collaboration avec Fédération Française de Randonnée Pédestre et S. Duméry
2017-2019 : Projet TELETIQ Intérêt des données de TELEphonie mobile et des sciences participatives pour l’estimation et la compréhension du risque de transmission de maladies liées à l’environnement : Application aux maladies transmises par les TIQues. Porteur du projet G. Vourc’h, puis I. Lebert et S. Bord (2018-2019).Collaborations : S. Dernat, F. Johany (INRA, UMR Territoires), S. Bimonte (UR TSCF, IRSTEA), Orange Labs, JF Cosson (CITIQUE), C. Linard (Université de Namur).
2017-2018 : Projet LYMESNAP Incidence de l’érythème chronique migrant dans le territoire du Pays des Combrailles : étude participative en population générale par télédéclaration. Porteur du projet : Pr O. Lesens (CHU Clermont-Ferrand),
2015- : Projet CARTOTIQUE : Cartographie du risque de transmission de la maladie de Lyme par la tique Ixodes ricinus chez l’Homme en France. Porteur du projet : Magalie René-Martellet (VetAgroSup Marcy)
2013-2015: Projets avec A. Leblond (VetAgroSup Lyon) : Evaluation de la probabilité de complication de la piroplasmose lors de l’hospitalisation d’un cheval selon l’origine géographique et la saison par des méthodes d’agrégations.
2012-2016 : Projet ANR OSCAR Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage du Risque Acarologique.Porteur du projet : O. Plantard (BioEPAR, INRA).Gestionnaire de la base de données en lien avec les données géoréférencées, rédaction datapaper et partage des données (entrepôt dataverse) : I. Lebert
Publications
- 2
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
Microorganisms in traditional fermented meatsHandbook of fermented meat and poultry, 2.ed., John Wiley and Sons, pp.7, 2015, 978-1-118-52265-3; 978-1-118-52269-1
Book sections
hal-02801458v1
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Eating qualityEncyclopaedia of food sciences and nutrition., Academic Press, 2003, 0-12-227061-4
Book sections
hal-02826852v1
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Prediction of bacterial growth in practiceNew development in meat refrigeration, ECCEAMST, 1996, 90-75319-13-4
Book sections
hal-02836536v1
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Ce qu’il faut retenir des tiques et de la prévention de la maladie de Lyme.2019, ⟨10.15454/c0gnl8⟩
Other publications
hal-02998105v1
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Expert Opinion Elicitation for Assisting Deep Learning based Lyme Disease Classifier with Patient Data2022
Preprints, Working Papers, ...
hal-03765092v1
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Cartographie des conditions favorables à la tique Ixodes ricinus en région Auvergne-Rhône-Alpes[Stage] INRAE. 2021, pp.49
Reports
hal-03335313v1
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Lyme borreliosis2024, pp.130-165
Report chapter
hal-04711142v1
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Prédiction de la croissance de Listeria innocua par une approche phénoménologique : Modélisations complémentaires des propriétés du milieu, des transferts d'eau et des cinétiquesIngénierie des aliments. Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I, 2004. Français. ⟨NNT : ⟩
Theses
tel-02831524v1
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Prédiction et simulation de la qualité et de la sécurité microbiologiques des aliments pendant un procédé. Méthodologies et modélisationsSciences du Vivant [q-bio]. ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE, 2006
Habilitation à diriger des recherches
tel-03078424v1
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Les données sur les tiques : Quelles données ? Quelle utilisation ? Quel devenirÉcole thématique. En Ligne, France. 2023, 76 p
Lectures
hal-03975408v1
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