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Jean-Philip Piquemal

CV de Jean-Philip Piquemal
15
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Affiliations actuelles
  • 413221
  • 454935
Identifiants chercheurs
  • IdHAL jean-philip-piquemal
  • ResearcherId : B-9901-2009
  • ORCID 0000-0001-6615-9426
  • Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=z0cOrb0AAAAJ&hl=fr
  • IdRef : 089289439
  • ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/B-9901-2009
Contact
Site web
  • https://piquemalresearch.com/
  • https://mastodon-pa.sorbonne-universite.fr/@piquemal

Présentation

**Jean-Philip Piquemal** Sorbonne Université (SU), Laboratoire de Chimie Théorique, UMR 7616 CNRS, Tour 12-13, 4 place Jussieu, 75252 Paris Cedex, France. Tel:(+33) 144272504 ; FAX: (+33)144274117 ; E-mail : jean-philip.piquemal (at) sorbonne-universite.fr ; Homepage: http://piquemalresearch.com; Twitter: [@jppiquem](https://twitter.com/jppiquem) (personal); [@piquemalgroup](https://twitter.com/PiquemalGroup) (research team) Mastodon: [@piquemal@mastodon-pa.sorbonne-universite.fr](https://mastodon-pa.sorbonne-universite.fr/@piquemal) LinkedIn: [@jppiquem](https://www.linkedin.com/in/jppiquem/) **Research Interests:** * Computational Quantum Chemistry; * Molecular Simulation; * Computational Drug Discovery; * Computer Science including High Performance Computing, Quantum Computing and Machine Learning. **Present Position** * Distinguished Professor (EXceptional class, PREX2) of Theoretical Chemistry, [Sorbonne Université](http://www.sorbonne-universite.fr/) (Paris, France); * Director of the [Laboratoire de Chimie Théorique, UMR 7616 Sorbonne Université & CNRS, Department of Chemistry;](http://www.lct.jussieu.fr) * Principal Investigator, [EMC2 (Extreme-scale Mathematically-based Computational Chemistry)](https://erc-emc2.eu/) ERC SyG project; * Research Adjunct Professor, [Department of Biomedical Engineering](https://www.bme.utexas.edu/), The University of Texas at Austin (USA); * Editor, [Results in Chemistry](https://www.journals.elsevier.com/results-in-chemistry) (Elsevier). **Updated Publication List and Bibliometrics :** See my [Google scholar profil](https://scholar.google.com/citations?user=z0cOrb0AAAAJ&hl=fr) or visit my webpage : [http://piquemalresearch.com/publications/](http://piquemalresearch.com/publications/ "Jean-Philip Piquemal publications") **Software development** My research team and I lead the development of the Tinker-HP molecular dynamics package ([https://tinker-hp.org](https://tinker-hp.org "Tinker-HP")) dedicated to new generation potentials (polarizable force fields and neural networks). **Professional Background** * 2023-present : Distinguished Professor (Exceptional class, PREX2), CNU section 31, SU. * 2020-present : Co-founder (2020) and CSO of [Qubit Pharmaceuticals](https://www.qubit-pharmaceuticals.com/) * 2019-present : Director [Laboratoire de Chimie Théorique (LCT)](http://www.lct.jussieu.fr), Department of Chemistry, SU & CNRS * 2019-present : Team leader: Extreme-scale Mathematically-based Computational Chemistry (EMC2), [LCT](http://www.lct.jussieu.fr), SU/CNRS. * 2019-present : PI of the [EMC2 ERC Synergy project](https://erc-emc2.eu/) (2019-2025) * 2015-present : Research Adjunct Professor, [Department of Biomedical Engineering](https://www.bme.utexas.edu/), The University of Texas at Austin (USA). * 2020-2023 : Member of the [PRACE](https://prace-ri.eu/) Steering Commitee (Partnership for Advanced Computing in Europe). * 2019-2023 : Distinguished Professor (Exceptional class, PREX1), CNU section 31, SU. * 2016-2021 : Junior Member of the [Institut Universitaire de France](https://www.iufrance.fr/) (research chair) * 2016-2019 : Full Professor (first class, PR1), CNU section 31, SU. * 2012-2019 : Team leader of the MC2 interdisciplinary project team at [ISCD](http://iscd.upmc.fr/) (Institute for Computations and data), SU. * 2012-2018 : Director of the Institut Parisien de Chimie Physique et Théorique ([IP2CT](http://www.ip2ct.upmc.fr/)), FR 2622, SU & CNRS * 2012-2018 : Team leader: research axis of LCT: «From quantum interpretative techniques to multiscale modeling». * 2011-2016 : Full Professor (second class, PR2), UPMC. * 2009-2011 : Associate Professor (Maître de Conférences - HDR), UPMC * 2006-2009 : Assistant Professor (Maître de Conférences), UPMC. * 2004-2006 : NIH Postdoctoral Visiting Fellow, [NIEHS](https://www.niehs.nih.gov), Research Triangle Park, NC, USA (group of Thomas Darden). **Education** * 2009 : Research Habilitation (HDR) in Theoretical Chemistry, UPMC. * 2004 : Ph.D. Thesis in Theoretical Chemistry, Laboratoire de Chimie Théorique, UPMC. \[[Academic Genealogy](https://academictree.org/chemistry/tree.php?pid=70959)\] * 2001 : Diplôme d'Etude Approfondie (DEA) in Computational and Theoretical Chemistry (DEA National CIT), UPMC. * 2000 : Master degree (Maîtrise) in Chemistry (major: Physical Chemistry), UPEC. Affiliations: SU= Sorbonne Université; UPMC= Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), now SU; NIEHS= National Institute of Environmental Health Sciences; UPEC = Université Paris-Est Créteil (Paris 12); CNRS= Centre National de la Recherche Scientifique **Teaching** Theoretical Chemistry (Quantum chemistry and Molecular Simulation), Physical Chemistry, Machine Learning, Computer Science and Programming. **Selected Honors & Awards** * 2022: [HPC Innovation Excellence Award](https://www.hpcwire.com/off-the-wire/hyperion-research-announces-winners-of-hpc-innovation-excellence-awards/) . * 2022: H2020 Innovative Training Networks (ITN), Co-PI of the [PHYMOL](http://www.phymol.eu/) project (Marie Skłodowska–Curie Actions Doctoral Network on Intermolecular Interactions). * 2022: Fellow of the [Royal Society of Chemistry](https://www.rsc.org/) (FSRC, UK) * 2022: Nominated as part of the [100 french innovators of the year](https://www.lepoint.fr/sciences-nature/les-meilleurs-inventeurs-francais-sont-09-06-2022-2478893_1924.php) by the french newspaper Le Point * 2022: [i-Nov](https://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/fr/le-concours-i-nov-49817) innovation award (BPI France/MESRI) * 2021: [EIC-Accelerator](https://eic.ec.europa.eu/eic-funding-opportunities/eic-accelerator_en) innovation program (European Research Council) * 2020: [i-Lab](https://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/fr/le-concours-i-lab-49808) innovation award (BPI France/MESRI) * 2018: [ERC Synergy](https://erc.europa.eu/funding/synergy-grants), Principal Investigator, project Extreme-scale Mathematically-based Computational Chemistry (EMC2 with E. Cancès, L. Grigori and Y. Maday) * 2018: [Atos Joseph Fourier Prize](https://fr.wikipedia.org/wiki/Prix_Atos_-_Joseph_Fourier) in Numerical Simulation (1st prize) * 2018: [France-Berkeley Fund](https://fbf.berkeley.edu/) Award * 2016: Nominated as a Junior Member of the [Institut Universitaire de France](https://en.wikipedia.org/wiki/Institut_Universitaire_de_France) (junior chair 2016-2021) * 2012: Emergence-UPMC fund Award * 2011: [Wiley-International Journal of Quantum Chemistry Young Investigator Award](https://sanibelsymposium.qtp.ufl.edu/awards-poster-sizes/winners/) * 2008: [France-Canada Research Fund](https://francecanadaculture.org/france-canada-research-fund/) Award * 2004: National Institute of Health (NIH) Postdoctoral Visiting Fellowship (2004-2006) * 2001: PhD scholarship from the Ministry of Higher Education, Research and Innovation (MESRI; 2001-2004) **Industry** * Co-founder (2020) and CSO of [Qubit Pharmaceuticals](https://qubit-pharmaceuticals.com/) **Editorial Activites** * Editor: [Results in Chemistry](https://www.journals.elsevier.com/results-in-chemistry) (Elsevier). * Associate Editor: [Living Journal of Computational Molecular Science](https://www.livecomsjournal.org/), LIveCoMS (Univ. of Colorado). * Editorial Board member: [International Journal of Quantum Chemistry](https://onlinelibrary.wiley.com/journal/1097461x) (Wiley); [Frontiers in Chemistry](https://www.frontiersin.org/journals/chemistry) (Frontiers); [Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences](https://link.springer.com/journal/12539) (Springer) **Scientific Societies Memberships** * Société Chimique de France (SFC) * Royal Society of Chemistry (RSC) * American Chemical Society (ACS) * Biophysical Society * Association for Computing Machinery (ACM) * Sigma Xi
**Jean-Philip Piquemal** Sorbonne Université (SU), Laboratoire de Chimie Théorique, UMR 7616 CNRS, Tour 12-13, 4 place Jussieu, 75252 Paris Cedex, France. Tel:(+33) 144272504 ; FAX: (+33)144274117 ; E-mail : jean-philip.piquemal (at) sorbonne-universite.fr ; Homepage: http://piquemalresearch.com; Twitter: [@jppiquem](https://twitter.com/jppiquem) (personnel); [@piquemalgroup](https://twitter.com/PiquemalGroup) (équipe de recherche) Mastodon: [@piquemal@mastodon-pa.sorbonne-universite.fr](https://mastodon-pa.sorbonne-universite.fr/@piquemal) LinkedIn: [@jppiquem](https://www.linkedin.com/in/jppiquem/) **Recherche** * Chimie quantique; * Simulation moléculaire; * Sciences du médicament; * Informatique incluant High Performance Computing, Quantum Computing et Machine Learning. **Situation actuelle** * Professeur de classe exceptionnelle (PREX2) en Chimie Théorique, [Sorbonne Université](http://www.sorbonne-universite.fr/) (Paris, France); * Directeur du [Laboratoire de Chimie Théorique, UMR 7616 Sorbonne Université & CNRS, UFR de Chimie;](http://www.lct.jussieu.fr) * PI du projet [EMC2 (Extreme-scale Mathematically-based Computational Chemistry)](https://erc-emc2.eu/), ERC Synergy; * Research Adjunct Professor, [Department of Biomedical Engineering](https://www.bme.utexas.edu/), The University of Texas at Austin (USA); * Membre du comité scientifique de [PRACE](https://prace-ri.eu/) (Partnership for Advanced Computing in Europe). * Editeur, [Results in Chemistry](https://www.journals.elsevier.com/results-in-chemistry) (Elsevier). **Liste de publications mise à jour et Bibliométrie :** Visitez mon profil [Google scholar](https://scholar.google.com/citations?user=z0cOrb0AAAAJ&hl=fr) ou visitez ma page web : [http://piquemalresearch.com/publications/](http://piquemalresearch.com/publications/ "Jean-Philip Piquemal publications") **Développement logiciel** Développement du logiciel Tinker-HP: dynamique moléculaire ([https://tinker-hp.org](https://tinker-hp.org "Tinker-HP")). **Situation professionnelle** * 2023-présent : Professeur de classe exceptionnelle (PREX2), CNU section 31, SU. * 2020-présent : Membre du comité scientifique de [PRACE](https://prace-ri.eu/) (Partnership for Advanced Computing in Europe). * 2020-présent : Co-fondateur (2020) et directeur scientifique (CSO) de [Qubit Pharmaceuticals](https://www.qubit-pharmaceuticals.com/) * 2019-présent : Directeur du [Laboratoire de Chimie Théorique (LCT)](http://www.lct.jussieu.fr), UFR de Chimie, SU & CNRS * 2019-présent : chef d'équipe, Extreme-scale Mathematically-based Computational Chemistry (EMC2), [LCT](http://www.lct.jussieu.fr), SU/CNRS. * 2019-présent : PI du [projet ERC Synergy EMC2](https://erc-emc2.eu/) (2019-2025) * 2015-présent : Professeur adjoint de recherche, [Department of Biomedical Engineering](https://www.bme.utexas.edu/), The University of Texas at Austin (USA). * 2019-2023 : Professeur de classe exceptionnelle (PREX1), CNU section 31, SU. * 2016-2021 : Membre junior de l'[Institut Universitaire de France](https://www.iufrance.fr/) * 2016-2019 : Professeur (première classe, PR1), CNU section 31, SU. * 2012-2019 : chef d'équipe MC2, projet interdisciplinaire au sein de l'[ISCD](http://iscd.upmc.fr/) (Institute for Computations and data), SU. * 2012-2018 : Directeur de l'Institut Parisien de Chimie Physique et Théorique ([IP2CT](http://www.ip2ct.upmc.fr/)), FR 2622, SU & CNRS * 2012-2018 : chef d'équipe, axe de recherche du LCT: «From quantum interpretative techniques to multiscale modeling». * 2011-2016 : Professeur (seconde classe, PR2), UPMC. * 2009-2011 : Maître de Conférences - HDR, UPMC. * 2006-2009 : Maître de Conférences, UPMC. * 2004-2006 : chercheur postdoctoral (NIH Visiting Fellow) au [NIEHS](https://www.niehs.nih.gov), Research Triangle Park, NC, USA (groupe de Thomas Darden). **Formation** * 2009 : Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) en Chimie Théorique, UPMC. * 2004 : Thèse de doctorat en Chimie Théorique, Laboratoire de Chimie Théorique, UPMC. \[[Academic Genealogy](https://academictree.org/chemistry/tree.php?pid=70959)\] * 2001 : Diplôme d'Etude Approfondie (DEA) en Chimie Informatique et Théorique (DEA National CIT), UPMC. * 2000 : Maîtrise de Chimie (mention chimie physique), UPEC. Affiliations: SU= Sorbonne Université; UPMC= Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), now SU; NIEHS= National Institute of Environmental Health Sciences; UPEC = Université Paris-Est Créteil (Paris 12); CNRS= Centre National de la Recherche Scientifique **Enseignement** Chimie théorique (chimie quantique et simulation moléculaire), chimie physique, machine learning, informatique et programmation. **Prix, bourses de recherche et distinctions** * 2022: Prix: [HPC Innovation Excellence Award](https://www.hpcwire.com/off-the-wire/hyperion-research-announces-winners-of-hpc-innovation-excellence-awards/) . * 2022: H2020 Innovative Training Networks (ITN), Co-PI du projet [PHYMOL](http://www.phymol.eu/) (Marie Skłodowska–Curie Actions Doctoral Network sur les interactions intermoléculaires). * 2022: Fellow de la [Royal Society of Chemistry](https://www.rsc.org/) (FSRC, UK) * 2022: Nominé parmi les [100 meilleurs inventeurs francais de l'année](https://www.lepoint.fr/sciences-nature/les-meilleurs-inventeurs-francais-sont-09-06-2022-2478893_1924.php) par le journal Le Point * 2022: Prix d'innovation [i-Nov](https://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/fr/le-concours-i-nov-49817) (BPI France/MESRI) * 2021: Programme d'innovation [EIC-Accelerator](https://eic.ec.europa.eu/eic-funding-opportunities/eic-accelerator_en) (European Research Council) * 2020: Prix d'innovation [i-Lab](https://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/fr/le-concours-i-lab-49808) (BPI France/MESRI) * 2018: [ERC Synergy](https://erc.europa.eu/funding/synergy-grants), co-PI du projet Extreme-scale Mathematically-based Computational Chemistry (EMC2) avec E. Cancès, L. Grigori et Y. Maday * 2018: Prix [Atos Joseph Fourier](https://fr.wikipedia.org/wiki/Prix_Atos_-_Joseph_Fourier) en simulation numérique (1er prix) * 2018: Récipiendaire du [Fond France-Berkeley](https://fbf.berkeley.edu/) * 2016: Nominé en tant que membre junior de l'[Institut Universitaire de France](https://en.wikipedia.org/wiki/Institut_Universitaire_de_France) (chaire de recherche 2016-2021) * 2012: Récipiendaire du Fond Emergence-UPMC * 2011: Prix [Wiley-International Journal of Quantum Chemistry Young Investigator Award](https://sanibelsymposium.qtp.ufl.edu/awards-poster-sizes/winners/) * 2008: Récipiendaire du [Fond France-Canada pour la recherche](https://francecanadaculture.org/france-canada-research-fund/) * 2004: Bourse de recherche postdoctorale du National Institute of Health (NIH) - Visiting Fellowship (2004-2006) * 2001: Doctorat, financement du ministère de l'enseignement supérieur, de la recherche et de l'innovation (MESRI; 2001-2004) **Industrie** * Co-fondateur (2020) et directeur scientifique (CSO) de [Qubit Pharmaceuticals](https://qubit-pharmaceuticals.com/) **Activités Editoriales** * Editeur: [Results in Chemistry](https://www.journals.elsevier.com/results-in-chemistry) (Elsevier). * Editeur associé: [Living Journal of Computational Molecular Science](https://www.livecomsjournal.org/), LIveCoMS (Univ. of Colorado). * Membre de comités de lecture : [International Journal of Quantum Chemistry](https://onlinelibrary.wiley.com/journal/1097461x) (Wiley); [Frontiers in Chemistry](https://www.frontiersin.org/journals/chemistry) (Frontiers); [Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences](https://link.springer.com/journal/12539) (Springer) **Sociétés scientifiques (membre)** * Société Chimique de France (SFC) * Royal Society of Chemistry (RSC), FRSC (Fellow) * American Chemical Society (ACS) * Biophysical Society * Association for Computing Machinery (ACM) * Sigma Xi

Publications

julia-contreras-garcia

NCIPLOT and the analysis of noncovalent interactions using the reduced density gradient

Rubén Laplaza , Francesca Peccati , Roberto A. Boto , Chaoyu Quan , Alessandra Carbone
WIREs Computational Molecular Science, 2021, 11 (2), ⟨10.1002/wcms.1497⟩
Article dans une revue hal-04028647v1
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NCIPLOT and the analysis of noncovalent interactions using the reduced density gradient

Rubén Laplaza , Francesca Peccati , Roberto A. Boto , Chaoyu Quan , Alessandra Carbone
WIREs Computational Molecular Science, 2021, 11 (2), pp.e1497. ⟨10.1002/wcms.1497⟩
Article dans une revue hal-02921299v1

NCIPLOT4: fast, robust and quantitative analysis of noncovalent interactions

Roberto A Boto , Francesca Peccati , Rubén Laplaza , Chaoyu Quan , Alessandra Carbone
Journal of Chemical Theory and Computation, 2020, ⟨10.1021/acs.jctc.0c00063⟩
Article dans une revue hal-02377999v1
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A New Way for Probing Bond Strength

J. Klein , H. Khartabil , J.C. Boisson , J. Contreras-Garcia , Jean-Philip Piquemal
Journal of Physical Chemistry A, 2020, 124 (9), pp.1850-1860. ⟨10.1021/acs.jpca.9b09845⟩
Article dans une revue hal-02377737v1
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The Independent Gradient Model: a new approach for probing strong and weak interactions in molecules from wave function calculations

Corentin Lefebvre , Hassan Khartabil , Jean-Charles Boisson , Julia Contreras-García , Jean-Philip Piquemal
ChemPhysChem, 2018, 19 (6), pp.724-735. ⟨10.1002/cphc.201701325⟩
Article dans une revue hal-03377532v1
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Revealing strong interactions with the reduced density gradient: a benchmark for covalent, ionic and charge-shift bonds

Roberto A Boto , Jean-Philip Piquemal , Julia Contreras-García
Theoretical Chemistry Accounts: Theory, Computation, and Modeling, 2017, 136, pp.139
Article dans une revue hal-01636270v1
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Interpretation of the reduced density gradient

Roberto A. Boto , Julia Contreras-García , Julien Tierny , Jean-Philip Piquemal
Molecular Physics, 2015, pp.1-9. ⟨10.1080/00268976.2015.1123777⟩
Article dans une revue hal-01253888v1
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Characterizing Molecular Interactions in Chemical Systems

David Guenther , Roberto Alvarez-Boto , Julia Contreras-Garcia , Jean-Philip Piquemal , Julien Tierny
IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, 2014, 20 (12), pp.2476-2485. ⟨10.1109/TVCG.2014.2346403⟩
Article dans une revue hal-01146475v1

Revisiting H2O Nucleation around Au + and Hg 2+ : The Peculiar “Pseudo-Soft” Character of the Gold Cation

Robin Chaudret , Julia Contreras-García , Mickaël Delcey , Olivier Parisel , Weitao Yang
Journal of Chemical Theory and Computation, 2014, 10 (5), pp.1900-1909. ⟨10.1021/ct4006135⟩
Article dans une revue hal-02126798v1

Unraveling non-covalent interactions within flexible biomolecules: from electron density topology to gas phase spectroscopy

R. Chaudret , B. De Courcy , J. Contreras-García , Eric Gloaguen , A. Zehnacker-Rentien
Physical Chemistry Chemical Physics, 2014, 16, pp.9876-9891. ⟨10.1039/C3CP52774C⟩
Article dans une revue hal-01131254v1

Are Bond Critical Points Really Critical for Hydrogen Bonding?

Joseph Lane , Julia Contreras-García , Jean-Philip Piquemal , Benjamin Miller , Henrik Kjaergaard
Journal of Chemical Theory and Computation, 2013, 9 (8), pp.3263-3266. ⟨10.1021/ct400420r⟩
Article dans une revue hal-02126863v1

Ionic interactions: Comparative topological approach

Julia Contreras-García , Monica Calatayud , Jean-Philip Piquemal , J.M. Recio
Computational and Theoretical Chemistry, 2012, 998, pp.193-201. ⟨10.1016/j.comptc.2012.07.043⟩
Article dans une revue hal-02126866v1

Coupling Quantum Interpretative Techniques: Another Look at Chemical Mechanisms in Organic Reactions

Natacha Gillet , Robin Chaudret , Julia Contreras-García , Weitao Yang , Bernard Silvi
Journal of Chemical Theory and Computation, 2012, 8 (11), pp.3993-3997. ⟨10.1021/ct300234g⟩
Article dans une revue hal-02126838v1

NCIPLOT: A Program for Plotting Noncovalent Interaction Regions

Julia Contreras-García , Erin Johnson , Shahar Keinan , Robin Chaudret , Jean-Philip Piquemal
Journal of Chemical Theory and Computation, 2011, 7 (3), pp.625-632. ⟨10.1021/ct100641a⟩
Article dans une revue hal-02126834v1
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A complete NCI perspective: from new bonds to reactivity

Christophe Narth , Zeina Maroun , Roberto A. Boto , Robin Chaudret , Marie-Laure Bonnet
Esmail Alikhani, Remi Chauvin, Christine Lepetit, Bernard Silvi. Applications of Topological Methods in Molecular Chemistry, 22, Springer, pp.491-527, 2016, Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics ⟨10.1007/978-3-319-29022-5_18⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01224203v1