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Multi-proteins similarity-based sampling to select representative genomes from large databases
Rémi-Vinh Coudert
,
Jean-Philippe Charrier
,
Frédéric Jauffrit
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Céline Brochier-Armanet
Article dans une revue
hal-05241875v1
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14C dating of tsunami deposits in arid environments: How challenging can it be? The example of La Graciosa, Canary Islands
Raphaël Paris
,
Franck Lavigne
,
Christine Hatté
,
Juan Francisco Betancort
,
Jean-Pierre Flandrois
et al.
Article dans une revue
hal-05147980v1
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Description of a new genus of the Pectobacteriaceae family isolated from water in coastal brackish wetlands of the French Camargue region, Prodigiosinella gen. nov., including the new species Prodigiosinella aquatilis sp. nov
Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Jérôme Briolay
,
Sylvie Reverchon
,
Céline Brochier-Armanet
Article dans une revue
hal-04476288v1
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Diversité et diversification des Pectobacteriaceae, une famille de bactéries phytopathogènes d’importance mondiale
Céline Brochier
,
Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Sylvie Reverchon
,
Jérôme Briolay
Cahiers Scientifiques de la Fondation Pierre Vérots, 2024, 10, pp.19-29
Article dans une revue
hal-04695948v1
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The Inca child of the Quehuar volcano: Stable isotopes clue to geographic origin and seasonal diet, with putative seaweed consumption
Eve Poulallion
,
Violeta Galván
,
Verónica Seldes
,
María Fernanda Zigarán
,
Gabriela Recagno Browning
et al.
Article dans une revue
hal-04741268v1
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Geographic origin and social status of the Gallic warriors from Ribemont‐sur‐Ancre (France) studied through isotope systematics of bone remains
Thibault Clauzel
,
Pascale Richardin
,
Jannick Ricard
,
Gilles Prilaux
,
Jeremy E. Martin
et al.
Article dans une revue
hal-03828010v1
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δ2H and δ18O of river water from a high-altitude humid plain of the southern Alps: Implications for the interpretation of the isotopic compositions of bioapatite from humans living close to mountain areas
Christophe Lécuyer
,
François Atrops
,
François Fourel
,
Thibault Clauzel
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
hal-04616164v1
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Mitigation of the diagenesis risk in biological apatite δ18O interpretation
Christophe Lécuyer
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
hal-04616065v1
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A divide-and-conquer phylogenomic approach based on character supermatrices resolves early steps in the evolution of the Archaea
Monique Aouad
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Frédéric Jauffrit
,
Manolo Gouy
,
Simonetta Gribaldo
et al.
Article dans une revue
hal-03514913v1
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Hydrogen isotope measurements of bone and dental tissues from archaeological human and animal samples and their use as climatic and diet proxies
Thibault Clauzel
,
Pascale Richardin
,
Jannick Ricard
,
Yves Le Béchennec
,
Romain Amiot
et al.
Article dans une revue
hal-03833280v1
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Climate conditions and dietary practices during the Second Iron Age studied through the multi-isotope analysis of bones and teeth from individuals of Thézy-Glimont, Picardie, France
Thibault Clauzel
,
Pascale Richardin
,
Jannick Ricard
,
Yves Le Béchennec
,
Romain Amiot
et al.
Article dans une revue
hal-03620017v1
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A Comprehensive Evolutionary Scenario of Cell Division and Associated Processes in the Firmicutes
Pierre Garcia
,
Wandrille Duchemin
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Simonetta Gribaldo
,
Christophe Grangeasse
et al.
Article dans une revue
hal-03293358v1
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Climatic change and diet of the pre-Hispanic population of Gran Canaria (Canary Archipelago, Spain) during the Medieval Warm Period and Little Ice Age
Christophe Lécuyer
,
Jean Goedert
,
Johanne Klee
,
Thibault Clauzel
,
Pascale Richardin
et al.
Article dans une revue
hal-03293366v1
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The Gauls experienced the Roman Warm Period: Oxygen isotope study of the Gallic site of Thézy-Glimont, Picardie, France
Thibault Clauzel
,
Pascale Richardin
,
Jannick Ricard
,
Yves Le Béchennec
,
Romain Amiot
et al.
Article dans une revue
hal-02998511v1
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Metapopulation ecology links antibiotic resistance, consumption, and patient transfers in a network of hospital wards
Julie Teresa Shapiro
,
Gilles Leboucher
,
Anne-Florence Myard-Dury
,
Pascale Girardo
,
Anatole Luzzati
et al.
Article dans une revue
hal-03105766v1
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Dickeya poaceiphila sp. nov., a plant-pathogenic bacterium isolated from sugar cane (Saccharum officinarum)
Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat
,
Celine Brochier-Armanet
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Sylvie Reverchon
Article dans une revue
hal-03103453v1
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δ18O and δ13C of diagenetic land snail shells from the Pliocene (Zanclean) of Lanzarote, Canary Archipelago: Do they still record some climatic parameters?
Christophe Lécuyer
,
Antonio Sanchez Marco
,
Alejandro Lomoschitz
,
Juan-Francisco Betancort
,
François Fourel
et al.
Article dans une revue
hal-02991811v1
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A Sample-to-Report Solution for Taxonomic Identification of Cultured Bacteria in the Clinical Setting Based on Nanopore Sequencing
Stefan Moritz Neuenschwander
,
Miguel Angel Terrazos Miani
,
Heiko Amlang
,
Carmen Perroulaz
,
Pascal Bittel
et al.
Article dans une revue
hal-03105483v1
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Isotopic systematics point to wild origin of mummified birds in Ancient Egypt
Marie Linglin
,
Romain Amiot
,
Pascale Richardin
,
Stéphanie Porcier
,
Ingrid Antheaume
et al.
Article dans une revue
hal-02991805v1
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Taxonomic assignment of uncultured prokaryotes with long range PCR targeting the spectinomycin operon
Jean-Pierre Flandrois
,
Céline Brochier-Armanet
,
Jérôme Briolay
,
Danis Abrouk
,
Guillaume P Schwob
et al.
Article dans une revue
hal-02327832v1
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The phytopathogenic nature of Dickeya aquatica 174/2 and the dynamic early evolution of Dickeya pathogenicity
Alexandre Duprey
,
Najwa Taïb
,
Simon Leonard
,
Tiffany Garin
,
Jean-Pierre Flandrois
et al.
Article dans une revue
hal-02099020v1
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Highly Reduced Genome of the New Species Mycobacterium uberis, the Causative Agent of Nodular Thelitis and Tuberculoid Scrotitis in Livestock and a Close Relative of the Leprosy Bacilli
Andrej Benjak
,
Charlotte Avanzi
,
Yvonne Benito
,
Franck Breysse
,
Christophe Chartier
et al.
Article dans une revue
hal-02332532v1
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Changing patterns of human migrations shaped the global population structure of Mycobacterium tuberculosis in France
Maxime Barbier
,
Oana Dumitrescu
,
Catherine Pichat
,
Gérard Carret
,
Anne-Sophie Ronnaux-Baron
et al.
Article dans une revue
hal-01908989v1
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Tsunami sedimentary deposits of Crete records climate during the ‘Minoan Warming Period’ (≈3350 yr BP)
Christophe Lécuyer
,
François Atrops
,
Romain Amiot
,
Delphine Angst
,
Valérie Daux
et al.
Article dans une revue
hal-01806805v1
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d18O-Derived incubation temperatures of oviraptorosaur eggs.
Romain Amiot
,
Xu Wang
,
Shuo Wang
,
Christophe Lécuyer
,
Jean-Michel Mazin
et al.
Article dans une revue
hal-01561556v1
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Strain-specific estimation of epidemic success provides insights into the transmission dynamics of tuberculosis
Jean-Philippe Rasigade
,
Maxime Barbier
,
Oana Dumitrescu
,
Catherine Pichat
,
Gérard Carret
et al.
Article dans une revue
hal-01911199v1
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|
Record of Nile seasonality in Nubian neonates.
Céline Martin
,
Bruno Maureille
,
Romain Amiot
,
Alexandra Touzeau
,
Aurélien Royer
et al.
Article dans une revue
hal-01495855v1
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Combined Genotypic, Phylogenetic, and Epidemiologic Analyses of Mycobacterium tuberculosis Genetic Diversity in the Rhône Alpes Region, France
Catherine Pichat
,
David Couvin
,
Gérard Carret
,
Isabelle Frédénucci
,
Véronique Jacomo
et al.
Article dans une revue
hal-01910925v1
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RiboDB database: a comprehensive resource for prokaryotic systematics
Frédéric Jauffrit
,
Simon Penel
,
Stéphane Delmotte
,
Carine Rey
,
Damien M de Vienne
et al.
Article dans une revue
hal-01800061v1
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Oxygen isotope fractionation between bird eggshell calcite and body water: application to fossil eggs from Lanzarote (Canary Islands)
Nicolas Lazzerini
,
Christophe Lécuyer
,
Romain Amiot
,
Delphine Angst
,
Eric Buffetaut
et al.
Article dans une revue
hal-02994717v1
|
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Nontuberculous Mycobacteria: An Underestimated Cause of Bioprosthetic Valve Infective Endocarditis
C. Bouchiat
,
J. Saison
,
S. Boisset
,
Jean-Pierre Flandrois
,
B. Issartel
et al.
Article dans une revue
hal-02044973v1
|
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|
Assessment of polycarbonate filter in a molecular analytical system for the microbiological quality monitoring of recycled waters onboard ISS
Anne-Laure Bechy-Loizeau
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Hafid Abaibou
Article dans une revue
hal-02332536v1
|
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|
leBIBIQBPP: a set of databases and a webtool for automatic phylogenetic analysis of prokaryotic sequences
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Perrière
,
Manolo Gouy
Article dans une revue
hal-02044751v1
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|
A Toolbox for Nonlinear Regression in R: The Package nistools
F. Baty
,
C. Ritz
,
Sandrine Charles
,
M. Brutsche
,
Jean-Pierre Flandrois
et al.
Journal of Statistical Software, 2015, 66, pp.1-21
Article dans une revue
hal-02044944v1
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Mycobacterium Species Related to M. leprae and M. lepromatosis from Cows with Bovine Nodular Thelitis
D. Pin
,
V. Guerin-Faublee
,
V. Garreau
,
F. Breysse
,
Oana Dumitrescu
et al.
Article dans une revue
hal-02045107v1
|
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|
Diet of ancient Egyptians inferred from stable isotope systematics
Alexandra Touzeau
,
Romain Amiot
,
Janne Blichert-Toft
,
Jean-Pierre Flandrois
,
François Fourel
et al.
Article dans une revue
istex
hal-02994728v1
|
|
|
MUBII-TB-DB: a database of mutations associated with antibiotic resistance in Mycobacterium tuberculosis.
Jean-Pierre Flandrois
,
Gérard Lina
,
Oana Dumitrescu
Article dans une revue
inserm-00982132v1
|
|
|
Enhanced tetrazolium violet reduction of Salmonella spp. by magnesium addition to the culture media
T. Junillon
,
L. Morand
,
Jean-Pierre Flandrois
Food Microbiology, 2014, 42, pp.132-135
Article dans une revue
hal-02046799v1
|
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|
Optimization of the reactional medium and a food impact study for a colorimetric in situ Salmonella spp. detection method
L. Morand
,
D. Michel
,
Jean-Pierre Flandrois
,
T. Junillon
,
D. Mosticon
et al.
International Journal of Food Microbiology, 2014, 181, pp.48-52
Article dans une revue
hal-02046798v1
|
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|
Mycobacterium bourgelatii sp. nov., a rapidly growing, non-chromogenic species isolated from the lymph nodes of cattle.
Véronique Guérin-Faublée
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Catherine Pichat
,
Maria Laura Boschiroli
,
Brigitte Lamy
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 12), pp.4669-74. ⟨10.1099/ijs.0.051979-0⟩
Article dans une revue
hal-01017330v1
|
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|
Egyptian mummies record increasing aridity in the Nile valley from 5500 to 1500yr before present
Alexandra Touzeau
,
Janne Blichert-Toft
,
Romain Amiot
,
François Fourel
,
François Martineau
et al.
Article dans une revue
istex
hal-02110386v1
|
|
|
Diminution of 2,3,5-triphenyltetrazolium chloride toxicity on Listeria monocytogenes growth by iron source addition to the culture medium
T. Junillon
,
Jp. Flandrois
Article dans une revue
hal-02281566v1
|
|
|
Candida albicans and non- Candida albicans fungemia in an institutional hospital during a decade
Jean-Pierre Flandrois
,
Laurence Parmeland
,
Mathieu Gazon
,
Claude Guérin
,
Laurent Argaud
et al.
Article dans une revue
hal-02334577v1
|
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|
Simplified detection of food-borne pathogens: An in situ high affinity capture and staining concept
T. Junillon
,
A. Vimont
,
D. Mosticone
,
B. Mallen
,
F. Baril
et al.
Article dans une revue
istex
hal-02296823v1
|
|
|
Species-driven interpretation guidelines in case of a single-sampling strategy for blood culture
D. Leyssene
,
S. Gardes
,
P. Vilquin
,
Jp. Flandrois
,
Gérard Carret
et al.
Article dans une revue
istex
hal-02297650v1
|
|
|
A pharmacologically based multiscale mathematical model of angiogenesis and its use in investigating the efficacy of a new cancer treatment strategy.
Frédérique Billy
,
Benjamin Ribba
,
Olivier Saut
,
Hélène Morre-Trouilhet
,
Thierry Colin
et al.
Article dans une revue
istex
inria-00440447v1
|
|
|
A seven-gene multilocus genus-wide approach to the phylogeny of mycobacteria using supertrees
S. Mignard
,
Jean-Pierre Flandrois
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2008, 58(part 6), pp.1432-1441
Article dans une revue
hal-00428262v1
|
|
|
Identification of Mycobacterium using the EF-Tu encoding (tuf) gene and the tmRNA encoding (ssrA) gene
S. Mignard
,
J.-P. Flandrois
Article dans une revue
hal-02332574v1
|
|
|
16S rRNA sequencing in routine bacterial identification : A 30-month experiment
S. Mignard
,
Jean-Pierre Flandrois
Journal of Microbiological Methods, 2006, 67, pp.574-581
Article dans une revue
hal-00427881v1
|
|
|
<i>Mycobacterium bovis</i> Infection
S. Mignard
,
Jean-Pierre Flandrois
Journal of Medical Microbiology, 2006, 56, pp.1033-1041
Article dans une revue
hal-00428005v1
|
|
|
Use of PCR-Restriction Enzyme Pattern Analysis and Sequencing Database for <i>hsp65</i> Gene-Based Identification of <i>Nocardia</i> Species
V. Rodriguez-Nava
,
A. Couble
,
G. Devulder
,
Jean-Pierre Flandrois
,
P. Boiron
et al.
Article dans une revue
hal-00428029v1
|
|
|
Rapid identification of Enterobacteriaceae by sequencing DNA gyrase subunit B encoding gene
J. Delmas
,
F. Breysse
,
G. Devulder
,
Jean-Pierre Flandrois
,
M. Chomarat
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 2006, 55, pp.263-268
Article dans une revue
hal-00427939v1
|
|
|
De la prévalence aux valeurs prédictives: L`antibiogramme face à l`évolution de la résistance aux antibiotiques
B. Lamy
,
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Marie Laure Delignette-Muller
Annales de Biologie Clinique, 2005, 63, pp.493-502
Article dans une revue
hal-00427775v1
|
|
|
A multigene approach to phylogenetic analysis using the genus <i>Mycobacterium</i> as a model
G. Devulder
,
M. Perouse de Montclos
,
Jean-Pierre Flandrois
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2005, 55, pp.293-302
Article dans une revue
hal-00427738v1
|
|
|
[From prevalence to predictive values: considerations on the antimicrobial susceptibility testing dealing with change of susceptibility rates].
Jean-Pierre Flandrois
,
B Lamy
,
G. Carret
,
M Delignette-Muller
Annales de Biologie Clinique, 2005, 63 (5), pp.493-502
Article dans une revue
hal-02332581v1
|
|
|
How does susceptibility prevalence impact on the performance of disk diffusion susceptibility testing?
B. Lamy
,
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Marie Laure Delignette-Muller
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 2004, 49, pp.131-139
Article dans une revue
hal-00427611v1
|
|
|
A method to study the microscale 3-D spatial distribution of Bacteria in soil.
A. Dechesne
,
C. Pallud
,
D. Debouzie
,
Jean-Pierre Flandrois
,
J.P. Gaudet
et al.
Mycological Research, 2003, 107, pp.1221-1230
Article dans une revue
hal-00427331v1
|
|
|
A novel method for characterizing the microscale 3D spatial distribution of bacteria in soil
A. Dechesne
,
C. Pallud
,
D. Debouzie
,
J. P. Flandrois
,
T. M. Vogel
et al.
Article dans une revue
istex
hal-02573523v1
|
|
|
Quelques problèmes statistiques rencontrés dans l`estimation de la température minimale de croissance de Listeria monocytogenes
S. Charles-Bajard
,
Jean-Pierre Flandrois
,
R. Tomassone
Revue de Statistique Appliquée, 2003, LI, pp.59-71
Article dans une revue
hal-00427493v1
|
|
|
BIBI a bioinformatics bacterial identification tool
G. Devulder
,
G. Perrière
,
F. Baty
,
Jean-Pierre Flandrois
Journal of Clinical Microbiology, 2003, 41, pp.1785-1787
Article dans une revue
hal-00427401v1
|
|
|
Modelling the competitive growth of Listeria monocytogenes and Listeria innocua in enrichment broths
Marie Cornu
,
Martin Kalmokoff
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
istex
hal-02332587v1
|
|
|
What is the relevance of obtaining multiple blood samples for culture? A comprehensive model to optimize the strategy for diagnosing bacteremia
B. Lamy
,
Pascal Roy
,
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Marie Laure Delignette-Muller
Article dans une revue
hal-00427281v1
|
|
|
Modeling the Lag Time of Listeria monocytogenes from Viable Count Enumeration and Optical Density Data
F. Baty
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Marie Laure Delignette-Muller
Applied and Environmental Microbiology, 2002, 68, pp.5816-5825
Article dans une revue
hal-00427255v1
|
|
|
A mathematical model describing the thermal virus inactivation
C. Noel
,
Sandrine Charles
,
A. Francon
,
Jean-Pierre Flandrois
Vaccine, 2001, 19, pp.3575-3582
Article dans une revue
hal-00427188v1
|
|
|
Spatial Modeling of Nitrifier Microhabitats in Soil
G. Grundmann
,
A. Dechesne
,
F. Bartoli
,
Jean-Pierre Flandrois
,
J. Chassé
et al.
Article dans une revue
hal-02332596v1
|
|
|
Fitness and competitive growth advantage of new gentamicin-susceptible MRSA clones spreading in French hospitals
Jean-Pierre Flandrois
,
F. Laurent
Article dans une revue
hal-02332592v1
|
|
|
Characterization of Unexpected Growth of Escherichia coli O157:H7 by Modeling
M. Cornu
,
Marie Laure Delignette-Muller
,
Jean-Pierre Flandrois
Applied and Environmental Microbiology, 1999, 65, pp.5322-5327
Article dans une revue
hal-00428469v1
|
|
|
A model describing the relationship between regrowth lag time and mild temperature increase for Listeria monocytogenes
S. Breand
,
G. Fardel
,
Jean-Pierre Flandrois
,
L. Rosso
,
R. Tomassone
International Journal of Food Microbiology, 1999, 46, pp.251-261
Article dans une revue
hal-00428438v1
|
|
|
Model of the influence of time and mild temperature on Listeria monocytogenes nonlinear survival curves
S. Breand
,
G. Fardel
,
Jean-Pierre Flandrois
,
L. Rosso
,
R. Tomassone
International Journal of Food Microbiology, 1998, 40, pp.185-195
Article dans une revue
hal-00428479v1
|
|
|
Saccharomyces boulardii Fungemia in a Patient Receiving Ultra‐levure Therapy
Jean-Pierre Flandrois
,
I. Fredenucci
,
M. Chomarat
,
C. Boucaud
Article dans une revue
hal-02334575v1
|
|
|
Simple relationship between acid dissociation constant and minimal pH for microbial growth in laboratory medium
Jean-Pierre Flandrois
,
L. Rosso
,
E. Zuber
,
C. Pichat
Article dans une revue
istex
hal-02332604v1
|
|
|
A model describing the relationship between lag time and mild temperature increase duration
S. Breand
,
G. Fardel
,
Jean-Pierre Flandrois
,
L. Rosso
,
R. Tomassone
International Journal of Food Microbiology, 1997, 38, pp.157-167
Article dans une revue
hal-00434965v1
|
|
|
Homogeneous Two-Site Immunometric Assay Kinetics as a Theoretical Tool for Data Analysis
Emmanuel Zuber
,
Gérard Mathis
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
istex
hal-02332601v1
|
|
|
A Descriptive Model for the Kinetics of a Homogeneous Fluorometric Immunoassay
Emmanuel Zuber
,
Laurent Rosso
,
Bruno Darbouret
,
Françoise Socquet
,
Gérard Mathis
et al.
Article dans une revue
hal-02332602v1
|
|
|
Influence of atmospheric conditions during incubation on the susceptibilities of Streptococcus pneumoniae isolates to five beta- lactam antibiotics
M. Chomarat
,
L. Chollet
,
M. Peyret
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
hal-02332606v1
|
|
|
Reappraisal of the effect of temperature on the growth kinetics of Aeromonas salmonicida
V. Guérin-Faublée
,
Sandrine Charles
,
M. Chomarat
,
Jean-Pierre Flandrois
Letters in Applied Microbiology, 1997, 25, pp.363-366
Article dans une revue
hal-00434985v1
|
|
|
Evaluation of an expert system linked to a rapid antibiotic susceptibility testing system for the detection of β-lactam resistance phenotypes
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Vedel
,
M. Peyret
,
J.P. Gayral
,
Patrick Millot
Article dans une revue
istex
hal-02332610v1
|
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|
An economic approach to the MIC.
M. Delignette-Muller
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Catherine Chapuis
Zentralblatt fur Bakteriologie : international journal of medical microbiology, 1996, 284 (1), pp.67-74
Article dans une revue
hal-02332615v1
|
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|
Differential growth of Listeria monocytogenes at 4 and 8°C: Consequences for the Shelf Life of Chilled Products
L. Rosso
,
S. Bajard
,
Jean-Pierre Flandrois
,
C. Lahellec
,
J. Fournaud
et al.
Article dans une revue
hal-02332607v1
|
|
|
The particular behaviour of Listeria monocytogenes under sub-optimal conditions
S. Bajard
,
L. Rosso
,
G. Fardel
,
J.P. Flandrois
Article dans une revue
istex
hal-04468907v1
|
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|
Application of a modified disc diffusion technique to antimicrobial susceptibility testing of Vibrio anguillarum and Aeromonas salmonicida clinical isolates
V. Guerin-Faublée
,
Marie Laure Delignette-Muller
,
M. Vigneulle
,
Jean-Pierre Flandrois
Veterinary Microbiology, 1996, 51, pp.137-149
Article dans une revue
hal-00435044v1
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Use of mathematics and statistics in nutrition modelling
G Ciuperca
,
R Tomassone
,
Jp Flandrois
Annales de zootechnie, 1996, 45 (Suppl1), pp.143-152
Article dans une revue
hal-00889615v1
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The particular behaviour of Listeria monocytogenes under sub-optimal conditions
S. Bajard
,
L. Rosso
,
G. Fardel
,
Jean-Pierre Flandrois
International Journal of Food Microbiology, 1996, 29, pp.201-211
Article dans une revue
hal-00435025v1
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Olecranon bursitis due toPrototheca wickerhamii, an algal opportunistic pathogen
M. Montclos
,
G. Chatte
,
M. Perrin-Fayolle
,
Jean-Pierre Flandrois
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 1995, 14 (6), pp.561-562. ⟨10.1007/bf02113444⟩
Article dans une revue
istex
hal-02332623v1
|
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Relationship between colonial surface and density on agar plate
L. Rosso
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Catherine Chapuis
Article dans une revue
hal-02332629v1
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Convenient Model To Describe the Combined Effects of Temperature and pH on Microbial Growth
L. Rosso
,
J.R. Lobry
,
S. Bajard
,
Jean-Pierre Flandrois
Applied and Environmental Microbiology, 1995, 61, pp.610-616
Article dans une revue
hal-00698190v1
|
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|
Accuracy of microbial growth predictions with square root and polynomial models
Jean-Pierre Flandrois
,
M. Delignette-Muller
Article dans une revue
istex
hal-02332618v1
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The effect of incubation temperature and sodium chloride concentration on the growth kinetics of Vibrio anguillarum and Vibrio anguillarum -related organisms
Véronique Guérin-Faublée
,
L. Rosso
,
Martine Vigneulle
,
J.-P. Flandrois
Article dans une revue
hal-02332625v1
|
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An accurate diffusion method for determining bacterial sensitivity to antibiotics
M. Delignette-Muller
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
istex
hal-02332634v1
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Mathematical model of the interactions between Micrococcus spp. and Pseudomonas aeruginosa on agar surface
J.-P. Flandrois
,
Catherine Chapuis
Article dans une revue
hal-02332635v1
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[Post-antibiotic effect of three aminoglycosides against Klebsiella pneumoniae].
M de Montclos
,
M. Guinet
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Catherine Chapuis
Pathologie Biologie, 1994, 42 (5), pp.419-24
Article dans une revue
hal-02332637v1
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Antimicrobial susceptibility testing of actinomyces pyogenes: Comparison of disk diffusion test and Api ATB Strep system with the Agar dilution method
Véronique Guérin-Faublée
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Yves Richard
Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology, 1993, 279 (3), pp.377-386. ⟨10.1016/S0934-8840(11)80370-1⟩
Article dans une revue
istex
hal-02332640v1
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|
An unexpected correlation between cardinal temperatures of microbial growth highlighted by a new model
L. Rosso
,
J.R. Lobry
,
Jean-Pierre Flandrois
Journal of Theoretical Biology, 1993, 162, pp.447-463
Article dans une revue
hal-00698186v1
|
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|
Mathematical model for comparison of time-killing curves.
F Guerillot
,
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
hal-02332638v1
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|
A statistical evaluation of the bactericidal effects of ceftibuten in combination with aminoglycosides and ciprofloxacin
F. Guérillot
,
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
istex
hal-02332639v1
|
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|
Actinomyces pyogenes: susceptibility of 103 clinical animal isolates to 22 antimicrobial agents
V Guérin-Faublée
,
Jp Flandrois
,
E Broye
,
F Tupin
,
Y Richard
Veterinary Research, 1993, 24 (3), pp.251-259
Article dans une revue
hal-00902121v1
|
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|
[Comparative study of two systems for the determination of the sensitivity of yeasts to antifungal agents].
M de Montclos
,
H. de Montclos
,
Jean-Pierre Flandrois
Pathologie Biologie, 1992, 40 (5), pp.495-9
Article dans une revue
hal-02332641v1
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|
Monod's bacterial growth model revisited
J.R. Lobry
,
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Carret
,
A. Pavé
Bulletin of Mathematical Biology, 1992, 54(1), pp.117-122
Article dans une revue
hal-00698414v1
|
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|
Maintenance requirements of <i>Escherichia coli</i> ATCC 25922 in the presence of sub-inhibitory concentrations of various antibiotics
J.R. Lobry
,
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 1992, 29, pp.121-127
Article dans une revue
hal-00698024v1
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|
Gram-positive infections in neutropenic patients: glycopeptide antibiotic choice
Monique Chomarat
,
Daniel Espinouse
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
istex
hal-02334574v1
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|
Biphasic kinetics of bacterial killing by quinolones
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Jean R Lobry
Article dans une revue
istex
hal-02332643v1
|
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|
Time-killing curves of Pseudomonas aeruginosa strains exposed to polymyxin B
M. Peyret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Fardel
Pathologie Biologie, 1991, 39, pp.446-450
Article dans une revue
hal-00698139v1
|
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|
[Time-killing curves of Pseudomonas aeruginosa strains exposed to polymyxin B].
Michel Peyret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
Ghislaine Fardel
Pathologie Biologie, 1991, 39 (5), pp.446-50
Article dans une revue
hal-02332645v1
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Susceptibility to Aminoglycosides of 63 Strains of Stomatococcus mucilaginosus Isolated from Sputum
Monique Chomarat
,
Marie-Gabrielle Vital
,
Jean-Pierre Flandrois
Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology, 1991, 276 (1), pp.63-67. ⟨10.1016/S0934-8840(11)80219-7⟩
Article dans une revue
istex
hal-02332646v1
|
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|
[Expert systems and antibiotic sensitivity test].
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Carret
Annales de Biologie Clinique, 1991, 49 (3), pp.166-71
Article dans une revue
hal-02334572v1
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Etude sur quatre ans des cas de yersiniose dans un service d'hépato-gastro-entérologie de la région lyonnaise
Jean-Pierre Flandrois
,
F. Bailly
,
M. Peyret
,
L. Descos
Article dans une revue
istex
hal-02334571v1
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|
[Influence of the culture medium (Isosensitest or Mueller-Hinton) on the results of antibiotics susceptibility testing and its interpretation].
Jean-Pierre Flandrois
,
M. Peyret
,
J Zindel
Pathologie Biologie, 1991, 39 (5), pp.455-60
Article dans une revue
hal-02334573v1
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|
A FORTRAN subroutine for the determination of parameter confidence limits in non-linear Models
J.R. Lobry
,
L. Rosso
,
Jean-Pierre Flandrois
Binary, 1991, 3, pp.86-93
Article dans une revue
hal-00698031v1
|
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|
Coagulase-negative staphylococci emerging during teicoplanin therapy and problems in the determination of their sensitivity
Monique Chomarat
,
Daniel Espinouse
,
Jean-Pierre Flandrois
Article dans une revue
istex
hal-02332642v1
|
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|
Comparison of estimates of Monod's growth model from the same data set
J.R. Lobry
,
Jean-Pierre Flandrois
Binary, 1991, 3, pp.20-23
Article dans une revue
hal-00698025v1
|
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Isolation ofSporosarcina ureae from a bronchial biopsy in a child with cystic fibrosis
Jean-Pierre Flandrois
,
M. Chomarat
,
M. Montclos
,
F. Breysse
European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 1990, 9 (4), pp.302-303. ⟨10.1007/bf01968068⟩
Article dans une revue
istex
hal-02332652v1
|
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[Mathematical study of the sensitivity curves of Escherichia coli exposed to polymyxins].
M. Peyret
,
G. Carret
,
C. Carré
,
G. Fardel
,
Jean-Pierre Flandrois
Pathologie Biologie, 1990, 38 (5), pp.441-5
Article dans une revue
hal-02332651v1
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Mathematical study of the sensitivity curves of Escherichia coli exposed to polymyxins
M. Peyret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Fardel
Pathologie Biologie, 1990, 38, pp.441-445
Article dans une revue
hal-00698138v1
|
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Preparation of a Latex Reagent for the Detection of Anti-Staphylococcus aureus Ribitol Teichoic Acid Antibodies
Michèle de Montclos
,
Jean-Pierre Flandrois
Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology, 1990, 274 (1), pp.50-60. ⟨10.1016/S0934-8840(11)80974-6⟩
Article dans une revue
istex
hal-02332653v1
|
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Mathematical modelling of growth of Escherichia coli at subinhibitory levels of chloramphenicol or tetracyclines
Jean-Pierre Flandrois
,
S. Comby
,
J.P. Flandrois
,
G. Carret
,
C. Pichat
Article dans une revue
istex
hal-02332654v1
|
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|
[Interpretative reading and quality control of an antibiotic sensitivity test using an expert system. Application to the API ATB system and Enterobacteriaceae].
M. Peyret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Carret
,
C. Pichat
Pathologie Biologie, 1989, 37 (5 Pt 2), pp.624-8
Article dans une revue
hal-02332658v1
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|
[Value of enzymuria during antibacterial therapy].
C Flandrois
,
Jean-Pierre Flandrois
,
D Coullioud
,
I Maire
Pathologie Biologie, 1989, 37 (5 Pt 2), pp.657-63
Article dans une revue
hal-02332656v1
|
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Bacterial Strain Characterization Using Mathematical Modelling of Growth
Marie-Joëlle Rochet
,
Jean-Pierre Flandrois
Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology, 1989, 271 (1), pp.2-10. ⟨10.1016/S0934-8840(89)80047-7⟩
Article dans une revue
istex
hal-02332655v1
|
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[Bacteriostatic and bactericidal antibiotics: differences in subinhibitory concentration effects on the growth of Escherichia coli].
S Comby
,
G. Carret
,
A. Pavé
,
Jean-Pierre Flandrois
,
C. Pichat
Pathologie Biologie, 1989, 37 (5), pp.335-40
Article dans une revue
hal-02332659v1
|
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|
[Demonstration of an inoculum effect on the estimation of the minimal inhibitory concentration of LY 146032].
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Carret
,
M. Peyret
,
Catherine Pichat
Pathologie Biologie, 1988, 36 (5), pp.377-80
Article dans une revue
hal-02332666v1
|
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|
[An expert system as an aid to the validation of results of the antibiogram. Feasibility study based on the example of Staphylococcus aureus].
S Comby
,
Jean-Pierre Flandrois
,
A. Pavé
Pathologie Biologie, 1988, 36 (5), pp.381-5
Article dans une revue
hal-02332664v1
|
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Mathematical modelling of bacterial growth at subinhibitory levels of aminoglycosides
Jean-Pierre Flandrois
,
S Comby
,
G. Carret
,
C. Pichat
Article dans une revue
istex
hal-02332662v1
|
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|
Early stages of in vitro killing curve of LY146032 and vancomycin for Staphylococcus aureus.
Jean-Pierre Flandrois
,
Ghislaine Fardel
,
G. Carret
Article dans une revue
hal-02332661v1
|
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Corynebacterium JK: surgical infections in non-immunosuppressed patients
Jean-Pierre Flandrois
,
A. Lepape
,
P.Y. Carry
,
M. Chomarat
,
J.P. Perdrix
et al.
Article dans une revue
istex
hal-02332688v1
|
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|
[Use of an expert system as a tool to carry out urinary cyto-bacteriologic tests].
S Comby
,
G. Carret
,
Jean-Pierre Flandrois
,
A. Pavé
,
M Perouse de Montclos
Annales de Biologie Clinique, 1988, 46 (8), pp.669-72
Article dans une revue
hal-02332663v1
|
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|
[A mathematical study of the mortality curve of Escherichia coli exposed to aminoglycosides].
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Carret
,
G. Fardel
Pathologie Biologie, 1988, 36 (5), pp.446-51
Article dans une revue
hal-02332694v1
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Study of staphylococcus aureus teichoic acid immunodominant site by help of synthetic haptens
Michèle Pérouse de Montclos
,
Paul Boullanger
,
Jean-Pierre Flandrois
Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology, 1988, 267 (3), pp.414-424. ⟨10.1016/S0176-6724(88)80058-0⟩
Article dans une revue
istex
hal-02332687v1
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|
[Effect of subinhibitory concentrations of antibiotics on the growth level of bacteria].
G. Carret
,
B Charpe
,
A Cheruy
,
Jean-Pierre Flandrois
,
A. Pavé
et al.
Pathologie Biologie, 1987, 35 (5), pp.483-93
Article dans une revue
hal-02332695v1
|
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Bacterial growth measurement using an automated system: Mathematical modelling and analysis of growth kinetics
Jean-Pierre Flandrois
,
A. Corman
,
G. Carret
,
A. Pavé
,
C. Couix
Article dans une revue
istex
hal-02332696v1
|
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[Evaluation of the Rapid-ATB system for testing the sensitivity of staphylococci to antibiotics. Comparison with the agar dilution reference method].
P Le Noc
,
G. Carret
,
C. Couix
,
Jean-Pierre Flandrois
,
J Gayral
et al.
Pathologie Biologie, 1986, 34 (5 Pt 2), pp.600-3
Article dans une revue
hal-02332697v1
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Gelatin and collagen binding to Staphylococcus aureus strains.
G. Carret
,
H. Emonard
,
G. Fardel
,
M. Druguet
,
D. Herbage
et al.
Ann Inst Pasteur Microbiol, 1985, 136A, pp.241-245
Article dans une revue
hal-00312957v1
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[Nonparametric approach to the determination of critical diameters. Comparison with conventional methods].
Jean-Pierre Flandrois
,
G. Carret
Pathologie Biologie, 1984, 32 (5 Pt 2), pp.488-91
Article dans une revue
hal-02332698v1
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Evolution de la résistance aux antibiotiques des agents infectieux en milieu hospitalier
J Fleurette
,
S Chassignol
,
A Moulin
,
A Biron
,
Jean-Pierre Flandrois
Bulletin de l'Institut national de la sante et de la recherche medicale, 1970, 25 (5), pp.963-92
Article dans une revue
hal-02328996v1
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