Jérémy LOBRY Directeur de recherche en écologie marineINRAE EABXCentre de Nouvelle Aquitaine - Bordeaux

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IdHAL :

jeremy-lobry

ORCID :

0000-0002-4567-3714

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083894810

Présentation

Publications

Article dans une revue (70)

Estuarine lateral ecotones shape taxonomic and functional structure of fish assemblages. The case of the Seine Estuary, France Matia Pavkovic,Alexandre Carpentier,Sylvain Duhamel,Laure Carassou,Jérémy Lobryet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2025, 313, pp.109066. ⟨10.1016/j.ecss.2024.109066⟩ Article dans une revue hal-04883978v1
Aquatic food webs in restored marshes: a stable‐isotope approach in the Gironde estuary ( SW France) Laure Carassou,Maud Vildier,Jérémy Lobry,Benoit Lebreton,Nicolas Savoyeet al. Restoration Ecology, 2025, ⟨10.1111/rec.70071⟩ Article dans une revue hal-05051328v1
Linking individual experiments and multiscale models to simulate physiological perturbations on aquatic food webs Pierre Bourdaud,Nathalie Niquil,Emma Araignous,Henrique Cabral,Alexandre Carpentieret al. Frontiers in Ecology and Evolution, 2024, 12, pp.1400936. ⟨10.3389/fevo.2024.1400936⟩ Article dans une revue hal-04727178v1
Modeling the impact of floating offshore wind turbines on marine food webs in the Gulf of Lion, France Mathieu Adgé,Jérémy Lobry,Anne Tessier,Serge Planes Frontiers in Marine Science, 2024, 11, ⟨10.3389/fmars.2024.1379331⟩ Article dans une revue hal-04638671v1
Fish distribution shifts due to climate change in the Northeast Atlantic: Using a hierarchical filtering approach on marine-estuarine opportunist species Anaïs Janc,Chloe Dambrine,Patrick Lambert,Géraldine Lassalle,Mario Lepageet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2024, 310, pp.109013. ⟨10.1016/j.ecss.2024.109013⟩ Article dans une revue hal-04763367v1
Cross-basin and cross-taxa patterns of marine community tropicalization and deborealization in warming European seas Guillem Chust,Ernesto Villarino,Matthew Mclean,Nova Mieszkowska,Lisandro Benedetti-Cecchiet al. Nature Communications, 2024, 15 (1), 2126 (13p.). ⟨10.1038/s41467-024-46526-y⟩ Article dans une revue hal-04573216v1
Assessing food limitation for marine juvenile fishes in coastal nurseries using a bioenergetic approach Marion Lefebvre Du Prey,Jérémy Lobry,Anik Brind'Amour,Hervé Le Bris,Bastien Sadoulet al. Ecological Modelling, 2023, 482, pp.110419. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2023.110419⟩ Article dans une revue hal-04195323v1
ESCROpath , a Bayesian mixing model to quantify diets and trophic flows in aquatic food webs Jérémy Lobry,Florence Mounier,Marine Ballutaud,Xavier Chevillot,Didier D. Gascuelet al. Methods in Ecology and Evolution, 2022, 13 (4), pp.894-907. ⟨10.1111/2041-210X.13808⟩ Article dans une revue hal-03738729v1
Contrasting impacts of climate change on connectivity and larval recruitment to estuarine nursery areas Henrique Cabral,Hilaire Drouineau,Ana Teles-Machado,Maud Pierre,Mario Lepageet al. Progress in Oceanography, 2021, 196, pp.102608. ⟨10.1016/j.pocean.2021.102608⟩ Article dans une revue hal-03241532v1
Dietary bioaccumulation of persistent organic pollutants in the common sole Solea solea in the context of global change. Part 2: Sensitivity of juvenile growth and contamination to toxicokinetic parameters uncertainty and environmental conditions variability in estuaries Florence Mounier,Véronique Loizeau,Laure Pecquerie,Hilaire Drouineau,Pierre Labadieet al. Ecological Modelling, 2020, 431, pp.109196. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2020.109196⟩ Article dans une revue hal-02926105v1
Major biomass fluctuations in lake food webs – An example in the peri-alpine Lake Annecy Marine Lemaire,Jean Guillard,Orlane Anneville,Jérémy Lobry Journal of Great Lakes Research, 2020, 46 (4), pp.798-812. ⟨10.1016/j.jglr.2020.04.007⟩ Article dans une revue hal-03325076v1
Dietary bioaccumulation of persistent organic pollutants in the common sole Solea solea in the context of global change. Part 1: Revisiting parameterisation and calibration of a DEB model to consider inter-individual variability in experimental and natural conditions Florence Mounier,Laure Pecquerie,Jérémy Lobry,Adriana E Sardi,Pierre Labadieet al. Ecological Modelling, 2020, 433, pp.109224. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2020.109224⟩ Article dans une revue hal-02926101v1
Interpretation of interannual variability in long-term aquatic ecological surveys Sophie Cauvy-Fraunié,Verena Trenkel,Martin Daufresne,Anthony Maire,Hervé Capraet al. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 2020, 77 (5), pp.894-903. ⟨10.1139/cjfas-2019-0146⟩ Article dans une revue hal-02493153v1
Assessing the ecological status of an estuarine ecosystem: linking biodiversity and food-web indicators Camille Le Guen,Samuele Tecchio,Jean-Claude Dauvin,Gwenola de Roton,Jérémy Lobryet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2019, 228, pp.106339. ⟨10.1016/j.ecss.2019.106339⟩ Article dans une revue hal-02346068v1
EStimating Contaminants tRansfers Over Complex food webs (ESCROC): An innovative Bayesian method for estimating POP's biomagnification in aquatic food webs Marine Ballutaud,Hilaire Drouineau,Laure Carassou,Gregory Munoz,Xavier Chevillotet al. Science of the Total Environment, 2019, 658, pp.638-659. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.12.0580048-9697⟩ Article dans une revue hal-02608305v1
Temporal variations of perfluoroalkyl substances partitioning between surface water, suspended sediment, and biota in a macrotidal estuary Gabriel Munoz,Hélène Budzinski,Marc Babut,Jérémy Lobry,Jonathan Selleslaghet al. Chemosphere, 2019, 233, pp.319-326. ⟨10.1016/j.chemosphere.2019.05.281⟩ Article dans une revue hal-02145736v1
Global Changes Jeopardize the Trophic Carrying Capacity and Functioning of Estuarine Ecosystems Xavier Chevillot,Samuele Tecchio,Aurélie Chaalali,Géraldine Lassalle,Jonathan Selleslaghet al. Ecosystems, 2019, 22 (3), pp.473-495. ⟨10.1007/s10021-018-0282-9⟩ Article dans une revue hal-02154192v1
Change in fish functional diversity and assembly rules in the course of tidal marsh restoration A. Lechêne,Jérémy Lobry,Philippe Boët,Pascal Laffaille PLoS ONE, 2018, 13 (12), pp.e0209025. ⟨10.1371/journal.pone.0209025⟩ Article dans une revue hal-02074291v1
Influence of intertidal seascape on the functional structure of fish assemblages: Implications for habitat conservation in estuarine ecosystems Nils Teichert,Laure Carassou,Yohan Sahraoui,Jérémy Lobry,Mario Lepage Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 2018, 28 (4), pp.798-809. ⟨10.1002/aqc.2914⟩ Article dans une revue hal-02607511v1
Beyond classic ecological assessment: The use of functional indices to indicate fish assemblages sensitivity to human disturbance in estuaries Nils Teichert,Mario Lepage,Jérémy Lobry Science of the Total Environment, 2018, 639, pp.465-475. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.05.179⟩ Article dans une revue hal-02607510v1
A generic method to assess species exploratory potential under climate change F. Massiot Granier,Géraldine Lassalle,P.R. Almeida,Miran Aprahamian,M. Castonguayet al. Ecological Indicators, 2018, 90, pp.615-623. ⟨10.1016/j.ecolind.2018.03.047⟩ Article dans une revue hal-02607496v1
Environmental drivers of taxonomic, functional and phylogenetic diversity (alpha, beta and gamma components) in estuarine fish communities Nils Teichert,Mario Lepage,X. Chevillot,Jérémy Lobry Journal of Biogeography, 2018, 45 (2), pp.406-417. ⟨10.1111/jbi.13133⟩ Article dans une revue hal-02607012v1
Nekton communities of tidally restored marshes: A whole-estuary approach A. Lechêne,Philippe Boët,Pascal Laffaille,Jérémy Lobry Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2018, 207 (31), pp.368-382. ⟨10.1016/j.ecss.2017.08.038⟩ Article dans une revue hal-02606996v1
Fish communities in the Anthropocene: detecting drivers of changes in the deep peri-alpine Lake Geneva Orlane Anneville,C. Vogel,Jérémy Lobry,Jean Guillard Inland Waters, 2017, 7 (1), pp.65-76. ⟨10.1080/20442041.2017.1294350⟩ Article dans une revue hal-02606314v1
Toward a phenological mismatch in estuarine pelagic food web? X. Chevillot,Hilaire Drouineau,Patrick Lambert,Laure Carassou,Benoît Sautouret al. PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0173752. ⟨10.1371/journal.pone.0173752⟩ Article dans une revue hal-01541495v1
How does climate change make fish late for dinner? X. Chevillot,Hilaire Drouineau,Patrick Lambert,Laure Carassou,B. Sautouret al. Environmental Science Journal for Teens, 2017, octobre, pp.5 Article dans une revue hal-02607235v1
L'halieutique ou l'exploitation des ressources vivantes aquatiques : une science protéiforme Hilaire Drouineau,Jérémy Lobry,Nicolas Bez,M. Travers Trolet,Youen Vermardet al. Subaqua, 2017, 271, pp.28-29 Article dans une revue hal-02606150v1
Evidence for the Trophic Transfer of Perfluoroalkylated Substances in a Temperate Macrotidal Estuary Gabriel Munoz,Hélène Budzinski,Marc Babut,Hilaire Drouineau,Mathilde Lauzentet al. Environmental Science and Technology, 2017, 51 (15), pp.8450-8459. ⟨10.1021/acs.est.7b02399⟩ Article dans une revue hal-02067250v1
From species distributions to ecosystem structure and function: A methodological perspective Aurélie Chaalali,Grégory Beaugrand,Virginie Raybaud,Géraldine Lassalle,Blanche Saint-Béatet al. Ecological Modelling, 2016, 334, pp.78-90. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2016.04.022⟩ Article dans une revue hal-01318422v1
Evaluating ecosystem-level anthropogenic impacts in a stressed transitional environment: The case of the Seine estuary Samuele Tecchio,Aurélie Chaalali,Aurore Raoux,Armonie Tous Rius,Justine Lequesneet al. Ecological Indicators, 2016, 61 (2), pp.833-845. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.10.036⟩ Article dans une revue hal-01483254v1
Estuarine habitats structure zooplankton communities: Implications for the pelagic trophic pathways V. David,J. Selleslagh,A. Nowaczyk,S. Dubois,G. Bacheletet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2016, 179, pp.99-111. ⟨10.1016/j.ecss.2016.01.022⟩ Article dans une revue istex hal-02604791v1
Abrupt shifts in the Gironde fish community: an indicator of ecological changes in an estuarine ecosystem X. Chevillot,M. Pierre,A. Rigaud,Hilaire Drouineau,A. Chaalaliet al. Marine Ecology Progress Series, 2016, 549, pp.137-151. ⟨10.3354/meps11681⟩ Article dans une revue hal-01411213v1
The need for a protean fisheries science to address the degradation of exploited aquatic ecosystems Hilaire Drouineau,Jérémy Lobry,N. Bez,M. Travers Trolet,Y. Vermardet al. Aquatic Living Resources, 2016, 29 (2), 20 p. ⟨10.1051/alr/2016021⟩ Article dans une revue hal-01394122v1
Can analysis of Platichthys flesus otoliths provide relevant data on historical metal pollution in estuaries? Experimental and in situ approaches J. Selleslagh,A. Echard,Christophe Pécheyran,M. Baudrimont,Jérémy Lobryet al. Science of the Total Environment, 2016, 557-558, pp.20--30. ⟨10.1016/j.scitotenv.2016.03.014⟩ Article dans une revue istex hal-01495766v1
A new modeling approach to define marine ecosystems food-web status with uncertainty assessment Aurélie Chaalali,Blanche Saint-Béat,Géraldine Lassalle,François Le Loc’h,Samuele Tecchioet al. Progress in Oceanography, 2015, 135, pp.37-47. ⟨10.1016/j.pocean.2015.03.012⟩ Article dans une revue hal-01158158v1
Incorporating food-web parameter uncertainty into Ecopath-derived ecological network indicators Vanessa Guesnet,Géraldine Lassalle,Aurélie Chaalali,Kelly Kearney,Blanche Saint-Béatet al. Ecological Modelling, 2015, 313, pp.29-40. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2015.05.036⟩ Article dans une revue hal-01186765v1
Hydroacoustics as a relevant tool to monitor fish dynamics in large estuaries Valérie Samedy,M. Wach,Jérémy Lobry,Jonathan Selleslagh,Maud Pierreet al. Fisheries Research, 2015, 172, pp.225-233. ⟨10.1016/j.fishres.2015.07.025⟩ Article dans une revue istex hal-02560897v1
The mosaic of habitats of the Seine estuary: Insights from food-web modelling and network analysis Samuele Tecchio,Armonie Tous Rius,Jean-Claude Dauvin,Jérémy Lobry,Géraldine Lassalleet al. Ecological Modelling, 2015, 312, pp.91-101. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2015.05.026⟩ Article dans une revue hal-02154211v1
Les poissons de l’estuaire de la Gironde : 30 ans de changements, et maintenant ? Jérémy Lobry Adour Garonne, 2015, 131, pp.20-21 Article dans une revue hal-02602031v1
Feeding Habitats, Connectivity and Origin of Organic MatterSupporting Fish Populations in an Estuary with a ReducedIntertidal Area Assessed by Stable Isotope Analysis J. Selleslagh,H. Blanchet,G. Bachelet,Jérémy Lobry Estuaries and Coasts, 2015, 38, pp.1431-1447. ⟨10.1007/s12237-014-9911-5⟩ Article dans une revue hal-02601670v1
Reaction of an estuarine food web to disturbance: Lindeman's perspective N. Niquil,A. Baeta,J.C. Marques,A. Chaalali,Jérémy Lobryet al. Marine Ecology Progress Series, 2014, 512, pp.141--154. ⟨10.3354/meps10885⟩ Article dans une revue hal-02454840v1
Strength and time lag of relationships between human pressures and fish-based metrics used to assess ecological quality of estuarine systems Stéphanie Pasquaud,A. Courrat,V.F. Fonseca,R. Gamito,C.I. Gonçalveset al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2013, 134, pp.119-127 Article dans une revue hal-02599074v1
Ecosystem status and functioning: Searching for rules of thumb using an intersite comparison of food-web models of Northeast Atlantic continental shelves Géraldine Lassalle,Jérémy Lobry,François Le Loc’h,S. Mackinson,F. Sanchezet al. ICES Journal of Marine Science, 2013, 70 (1), pp.135--149. ⟨10.1093/icesjms/fss168⟩ Article dans une revue hal-02454848v1
A fish-based index of estuarine ecological quality incorporating information from both scientific fish survey and experts knowledge A. Tableau,Hilaire Drouineau,C. Delpech,M. Pierre,Jérémy Lobryet al. Ecological Indicators, 2013, 32, p. 147 - p. 156. ⟨10.1016/j.ecolind.2013.03.030⟩ Article dans une revue hal-00824755v1
Increase of marine juvenile fish abundances in the middle Gironde estuary related to warmer and more saline waters, due to global changes Stéphanie Pasquaud,Mélanie Béguer,M. H. Larsen,A. Chaalali,Henrique Cabralet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2012, 104-105, pp.46-53. ⟨10.1016/j.ecss.2012.03.021⟩ Article dans une revue istex hal-02597096v1
An ecosystem approach for the assessment of fisheries impacts on marine top predators: the Bay of Biscay case study Géraldine Lassalle,Didier D. Gascuel,François Le Loc’h,Jérémy Lobry,Gj. Pierceet al. ICES Journal of Marine Science, 2012, 69 (6), pp.925-938. ⟨10.1093/icesjms/fss049⟩ Article dans une revue hal-00840402v1
Trophic functioning of coastal ecosystems along an anthropogenic pressure gradient: A French case study with emphasis on a small and low impacted estuary J. Selleslagh,Jérémy Lobry,Rachid Amara,Jean-Michel Brylinski,Philippe Boët Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2012, Part of special issue Assessing Ecological Quality in Estuarine and Coastal Systems – Functional Perspective, 112, pp.73-85. ⟨10.1016/j.ecss.2011.08.004⟩ Article dans une revue istex hal-00760872v1
Seasonal succession of estuarine fish, shrimps, macrozoobenthos and plankton: physico-chemical and trophic influence. The ironde estuary as a case study J. Selleslagh,Jérémy Lobry,A.R. N'Zigou,G. Bachelet,H. Blanchetet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2012, 112, pp.243-254. ⟨10.1016/j.ecss.2012.07.030⟩ Article dans une revue istex hal-02597393v1
A Bayesian framework to objectively combine metrics when developing stressor specific multimetric indicator Hilaire Drouineau,Jérémy Lobry,C. Delpech,M. Bouchoucha,S. Mahévaset al. Ecological Indicators, 2012, 13 (1), p. 314 - p. 321. ⟨10.1016/j.ecolind.2011.06.029⟩ Article dans une revue hal-00654282v1
A future for marine fisheries in Europe (Manifesto of the Association Francaise d'Halieumetrie) Didier D. Gascuel,Nicolas Bez,André Forest,Patrice Guillotreau,Francis Laloeet al. Fisheries Research, 2011, 109 (1), pp.6. ⟨10.1016/j.fishres.2011.02.002⟩ Article dans une revue hal-00730149v1
Impact of global warming on European tidal estuaries: some evidence of northward migration of estuarine fish species D. Nicolas,A. Chaalali,Hilaire Drouineau,Jérémy Lobry,A. Uriarteet al. Regional Environmental Change, 2011, 11 (3), pp.639-649. ⟨10.1007/s10113-010-0196-3⟩ Article dans une revue istex hal-02596093v1
Lower trophic levels and detrital biomass control the Bay of Biscay continental shelf food web: Implications for ecosystem management Géraldine Lassalle,Jérémy Lobry,François Le Loc’h,Paco Bustamante,Grégoire Certainet al. Progress in Oceanography, 2011, 91 (4), pp.561-575. ⟨10.1016/j.pocean.2011.09.002⟩ Article dans une revue hal-00683349v1
Gyroscopic magnetic levitation: an original design procedure based on the finite element method Z. de Grève,C. Versèle,Jérémy Lobry European Physical Journal: Applied Physics, 2010, 52 (2), ⟨10.1051/epjap/2010080⟩ Article dans une revue hal-00634371v1
Impact of warming on abundance and occurrence of flatfish populations in the Bay of Biscay (France) Marie Hermant,Jérémy Lobry,Sylvain Bonhommeau,Jean Charles Poulard,Olivier Le Pape Journal of Sea Research (JSR), 2010, 64 (1-2), pp.45-53. ⟨10.1016/j.seares.2009.07.001⟩ Article dans une revue istex hal-00494573v1
Development of a fish-based index to assess the ecological quality of transitional waters: The case of French estuaries C. Delpech,A. Courrat,Stéphanie Pasquaud,Jérémy Lobry,Olivier Le Papeet al. Marine Pollution Bulletin, 2010, 60 (6), p. 908 - p. 918. ⟨10.1016/j.marpolbul.2010.01.001⟩ Article dans une revue hal-00584047v1
Functional diversity in European estuaries: Relating the composition of fish assemblages to the abiotic environment D. Nicolas,Jérémy Lobry,Olivier Le Pape,Philippe Boët Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2010, 88 (3), p. 329 - p. 338. ⟨10.1016/j.ecss.2010.04.010⟩ Article dans une revue istex hal-00584043v1
Exploitation of trophic resources by fish under stressful estuarine conditions Stéphanie Pasquaud,V. David,Jérémy Lobry,Michel Girardin,B. Sautouret al. Marine Ecology Progress Series, 2010, 400, p. 207 - p. 219 Article dans une revue hal-00474342v1
Fish under influence: a macroecological analysis of relations between fish species richness and environmental gradients among European tidal estuaries D. Nicolas,Jérémy Lobry,Mario Lepage,B. Sautour,Olivier Le Papeet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2010, 86 (1), p. 137 - p. 147. ⟨10.1016/j.ecss.2009.11.006⟩ Article dans une revue hal-00474505v1
Regard critique sur la mise en place d'indicateurs d'évaluation de l'efficacité des aires marines protégées Stéphanie Pasquaud,Jérémy Lobry Sciences Eaux & Territoires, 2010, 3, p. 122 - p. 125. ⟨10.14758/SET-REVUE.2010.3.23⟩ Article dans une revue hal-00553052v1
Regard critique sur la mise en place d’indicateurs d’évaluation de l’efficacité des aires marines protégées Stephanie Pasquaud,Jérémy Lobry Sciences Eaux & Territoires, 2010, 3, pp.1-4 Article dans une revue hal-03975249v1
Anthropogenic disturbance on nursery function of estuarine areas for marine species A. Courrat,Jérémy Lobry,D. Nicolas,P. Laffargue,Rachid Amaraet al. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2009, 81 (2), pp.179-190. ⟨10.1016/j.ecss.2008.10.017⟩ Article dans une revue hal-00480403v1
Dealing with uncertainly in qualitative models with a semi-quantitative approach based on simulations: applications to the Gironde estuarine food web (France) S. Rochette,Jérémy Lobry,Mario Lepage,Philippe Boët Ecological Modelling, 2009, 220 (2), pp.122-132 Article dans une revue hal-02592907v1
Assessment of the ecological status of coastal areas and estuaries in France, using multiple fish-based indicators: a comparative analysis on the Vilaine estuary A. Brind'Amour,Jérémy Lobry Aquatic Living Resources, 2009, 22, p. 559 - p. 572. ⟨10.1051/alr/2009052⟩ Article dans une revue hal-00585653v1
From detritus to man: diversity and stability of an estuarine trophic network Jérémy Lobry,V. David,Stéphanie Pasquaud,Mario Lepage,B. Sautouret al. Marine Ecology Progress Series, 2008, 358, pp.13-25. ⟨10.3354/meps07294⟩ Article dans une revue hal-02590036v1
Facing the necessity of describing estuarine ecosystems: a review of food web ecology study techniques Stéphanie Pasquaud,Jérémy Lobry,Pierre Elie Hydrobiologia, 2007, 588, pp.159-172 Article dans une revue hal-02588755v1
From seasonal patterns to a reference situation in an estuarine environment: Example of the small fish and shrimp fauna of the Gironde estuary (SW France) Jérémy Lobry,Mario Lepage,Eric Rochard Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2006, 70 (1-2), pp.239-250 Article dans une revue hal-02588349v1
L'échantillonnage de la diversité piscicole en estuaires : stratégie et représentativité dans le contexte de la Directive cadre européenne sur l'eau Jérémy Lobry,Mario Lepage,Michel Girardin Ingénieries eau-agriculture-territoires, 2006, 45, p. 3 - p. 14 Article dans une revue hal-00601100v1
Structure of the Gironde estuarine fish assemblages: a comparison of European estuaries perspective Jérémy Lobry,L. Mourand,Eric Rochard,Pierre Elie Aquatic Living Resources, 2003, 16 (2), pp.47-58. ⟨10.1016/S0990-7440(03)00031-7⟩ Article dans une revue hal-02581413v1
Les cortèges ichtyologiques de l'estuaire de la Gironde. Réflexion sur l'établissement d'une situation de référence en vue d'identifier les perturbations Jérémy Lobry,Eric Rochard,Pierre Elie Journal de Recherche Océanographique., 2003, 28 (1 et 2), pp.76-80 Article dans une revue hal-02583638v1
La biodiversité spécifique des ressources démersales du plateau continental guinéen : utilisation d'indices classiques pour un diagnostic sur l'évolution de l'écosystème Jérémy Lobry,Didier D. Gascuel,F. Domain Aquatic Living Resources, 2003, 16 (2), pp.59-68. ⟨10.1016/S0990-7440(03)00010-X⟩ Article dans une revue hal-02581414v1

Communication dans un congrès (24)

Energy restriction cancels the effect of temperature on the growth of common soles (Solea solea) in the Gironde estuary Tristan Halna Du Fretay,Jérémy Lobry,Hilaire Drouineau,Florence Mounier,Bastien Sadoul 9th International Symposium on DEB theory for metabolic organization, University of Crete, Jun 2025, Heraklion, Greece Communication dans un congrès hal-05120991v1
Fish distribution's shifts due to climate change in the Northeast Atlantic: using a hierarchical filtering approach on marine-estuarine opportunist species| Anaïs Janc,Chloé Dambrine,Patrick Lambert,Géraldine Lassalle,Henrique Cabralet al. FSBI ( Fisheries Society of the British Isles ) 2023 : Fish habitat ecology in a changing climate ·, Jul 2023, Colchester - Essex, United Kingdom Communication dans un congrès hal-04177495v1
Major biomass fluctuations in lake food webs – An example in the peri-alpine Lake Annecy Marine Lemaire,Jean Guillard,Orlane Anneville,Jérémy Lobry Joint Conference of the European Large Lakes Symposium (ELLS) / Conference of the International-Association-for-Great-Lakes-Research (IAGLR) - Big Lakes - Small World, 2019, Evian, France. pp.798-812 Communication dans un congrès hal-03151915v1
What drives the interannual variability in fish-population time series? S. Cauvy Fraunie,Hervé Capra,J.M. Olivier,Martin Daufresne,Jérémy Lobryet al. SEFS 10: Symposium of European Freshwater Sciences, Jul 2017, Olomouc, Czech Republic. pp.1 Communication dans un congrès hal-02609335v1
What drives the interannual variability in fish-population time series? S. Cauvy Fraunie,Verena Trenkel,Hervé Capra,J.M. Olivier,A. Maireet al. International Long Term Ecological Research Network & LTER-France (Zones Ateliers Network & Critical Zone Observatories) joint conference, Oct 2017, Nantes, France. pp.15 Communication dans un congrès hal-02606638v1
Habitat value of tidally restored marshes for fish and macrocrustaceans: feedback from two study cases in the Gironde estuary A. Lechêne,Philippe Boët,Pascal Laffaille,Jérémy Lobry Estuarine restoration: from theory to practice and back, ECSA symposium, Jul 2016, Anvers, Belgium. pp.30 Communication dans un congrès hal-02605029v1
La marinisation de l'estuaire de la Gironde Jérémy Lobry Ecosystèmes aquatiques : quelles évolutions dans un contexte de changement climatique ?, Jun 2015, Toulouse, France. pp.7-10 Communication dans un congrès hal-02602264v1
Approche multicritère de l’état de santé des écosystèmes estuariens : exemple de la Seine Nathalie Niquil,Samuele Tecchio,Camille Le Guen,Jean-Claude Dauvin,Géraldine Lasalleet al. Colloques biennal des zones ateliers, Oct 2015, Paris, France Communication dans un congrès hal-03547575v1
Climate-driven changes’ incidence on the food-web status of the Bay of Biscay: a focus on dominant fish species A. Chaalali,G. Beaugrand,M. Chifflet,V. Raybaud,Géraldine Lassalleet al. ISOBAY 14, XIV International Symposium on Oceanography of the Bay of Biscay, Jun 2014, Bordeaux, France. pp.17 Communication dans un congrès hal-02604895v1
Towards the evaluation of ecological consequences of hydromorphological evolutions of the Gironde estuary: A preliminary approach combining GIS and hydrodynamics modelling F. Fauvel,A. Just,V. Marieu,A. Sottolichio,Jérémy Lobry ECSA 50, Jun 2012, Venise, Italy. pp.14 Communication dans un congrès hal-02597280v1
Cause-effect relationships strength and time lag in response to human pressures of metrics used to assess ecological quality of estuarine systems based on fish assemblages Stéphanie Pasquaud,A. Courrat,Jérémy Lobry,Mario Lepage,C.I. Gonçalveset al. ELET Estuarine and Lagoon Ecosystem Trajectories, ECSA Symposium, Oct 2011, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-02596312v1
Structural vs functional approaches: A first comparison between WFD indicators and Ecological Network Analysis indices on French estuaries Jérémy Lobry,J. Selleslagh,H. Blanchet,N. Niquil ECSA 47 Symposium, Sep 2010, Figueira da Foz, Portugal. pp.22 Communication dans un congrès hal-02594568v1
Fish under influence? A large-scale functional analysis of relations between abiotic gradients and fish assemblages of European tidal estuaries D. Nicolas,Jérémy Lobry,Philippe Boët ECSA 47 symposium, Sep 2010, Figueira da Foz, Portugal. pp.1 Communication dans un congrès hal-02594060v1
Assessing contamination levels in transitional waters using fish-based core metrics: an original approach based on Bayesian framework Hilaire Drouineau,Jérémy Lobry,C. Delpech,M. Bouchoucha,Stéphanie Mahévaset al. ICES Annual Science Conference, Sep 2010, Nantes, France. pp.12 Communication dans un congrès hal-02594115v1
Trophic model of the Canche estuary, a small estuary of the eastern English Channel: a comparison with other French coastal systems J. Selleslagh,Jérémy Lobry,Rachid Amara,Jean-Michel Brylinski,Vincent Cornilleet al. ECSA Symposium 47: Integrative Tools and Methods in Assessing Ecological Quality in Estuarine and Coastal Systems Worldwide, Sep 2010, Figueira da fos, Portugal Communication dans un congrès hal-02594569v1
Assessing contamination levels in transitional waters using fish-based core metrics: an original approach based on Bayesian framework Hilaire Drouineau,Jérémy Lobry,C. Delpech,M. Bouchoucha,Stéphanie Mahévaset al. ECSA Symposium 47, Sep 2010, Figueira da Foz, Portugal. pp.11 Communication dans un congrès hal-02594116v1
Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : APR Liteau2 2005 Michel Girardin,Rachid Amara,Mario Lepage,Philippe Boët,Jérémy Lobryet al. Colloque Liteau. Science et gouvernance en appui au développement durable du littoral, Dec 2009, Montpellier, France. pp.9 Communication dans un congrès hal-02596103v1
Etat d'avancement des travaux sur l'indicateur poisson C. Delpech,Mario Lepage,Stéphanie Pasquaud,A. Courrat,D. Nicolaset al. Séminaire Aquaref « Les approches hydrobiologiques pour la DCE et le continuum eaux douces- eaux littorales », Jun 2008, Paris, France. pp.19 Communication dans un congrès hal-02594421v1
Indicateurs ichtyologiques pour le suivi de la fonctionnalité de nourricerie des masses d'eau de transition / xénobiotiques dans le cadre de la DCE A. Courrat,Jérémy Lobry,P. Laffargue,Mario Lepage,Michel Girardinet al. Impact des organismes pathogènes et des micropolluants sur l'état de santé des poissons, mollusques et crustacés des milieux naturels : de l'individu au peuplement, Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer (Ifremer); Centre d'Etudes du Machinisme Agricole, du génie Rural, des Eaux et Forêts (Cemagref); Office National de l'Eau et des Milieux Aquatiques (ONEMA), Mar 2008, Nantes, France. pp.20 Communication dans un congrès hal-02593126v1
Présentation de l'indicateur poisson dans les estuaires : Travail collaboratif réalisé dans le cadre de LITEAU II Mario Lepage,Rachid Amara,Philippe Boët,A. Courrat,C. Delpechet al. Séminaire de lancement du projet Liteau III BEEST « Vers une approche multicritère du Bon Etat / potentiel écologique des grands ESTuaires Seine, Loire et Gironde », Nov 2009, Paris, France. pp.24 Communication dans un congrès hal-02594418v1
Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : Définitions d'états de référence par type de MET Mario Lepage,A. Courrat,Jérémy Lobry,Olivier Le Pape,C. Delpechet al. Séminaire Aquaref « Les approches hydrobiologiques pour la DCE et le continuum eaux douces- eaux littorales », Jun 2008, Paris, France. pp.10 Communication dans un congrès hal-02594420v1
Toward a macroscopic analysis of European tidal estuaries fish assemblages patterns D. Nicolas,Jérémy Lobry,Mario Lepage,B. Sautour,Olivier Le Papeet al. ECSA 44 symposium, Sep 2008, Bahia Blanca, Argentina. pp.41 Communication dans un congrès hal-02594061v1
Detritus, fish and men...: The Gironde estuarine trophic structure Jérémy Lobry,Valérie David,Stéphanie Pasquaud,Benoit Sautour,Eric Rochard Changes in land uses: consequences on estuaries and coastal zones, ECSA, 38th symposium, Sep 2004, Rouen, France. pp.2 Communication dans un congrès hal-02583640v1
Approche de la dynamique des assemblages ichtyologiques dans l'estuaire de la Gironde Jérémy Lobry,Eric Rochard,Pierre Elie 2èmes rencontres de l'ichtyologie en France, Paris, 25-28 mars 2003, 2003, France. pp.1 Communication dans un congrès hal-02581310v1

Poster de conférence (4)

Importance des mugilidés sur les réseaux trophiques côtiers dans un contexte de carence en oméga-3 : du niveau sub-individuel à la dynamique trophique Pierre Bourdaud,Lucien Besnard,Alexandre Carpentier,Hilaire Drouineau,Luuk van Der Heijdenet al. 15e colloque de l’AFH "Les systèmes halieutiques face aux crises", Jun 2022, Brest, France. 2022 Poster de conférence hal-04193349v1
Structural vs functional approaches: A first comparison between water framework directive indicators and ENA indices on European estuaries Jérémy Lobry,V. Guesnet,Géraldine Lassalle,A. Chaalali,J. Selleslaghet al. Ecopath 30 years conference, Nov 2014, Barcelona, Portugal. 2014 Poster de conférence hal-02600797v1
Les petits pélagiques dans l'estuaire de la Gironde : 30 ans de suivi d'abondance face à 30 ans de changements globaux X. Chevillot,A. Rigaud,Hilaire Drouineau,A. Chaalali,Jérémy Lobryet al. Exploitation et conservation des écosystèmes aquatiques : une question d'échelle, Jun 2013, Bordeaux, France. pp.1, 2013 Poster de conférence hal-02600367v1
Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : Liteau2 2005-2008 Michel Girardin,Mario Lepage,Philippe Boët,Stéphanie Pasquaud,D. Nicolaset al. Colloque Liteau. Science et gouvernance en appui au développement durable du littoral, Dec 2009, Montpellier, France. pp.1, 2009 Poster de conférence hal-02593075v1

Ouvrages (1)

Stratégie d'observation à long terme : guide pour le suivi de l'ichtyofaune dans l'estuaire de la Seine Jérémy Lobry,Mario Lepage,J. Dublon,A. Lechêne,E. Feunteunet al. GIP Seine aval, pp.19, 2013 Ouvrages hal-02605500v1

Chapitre d'ouvrage (6)

Trophic ecology of marine fish Laure Carassou,David Benhaïm,Marie Vagner,Jérémy Lobry Ecology of Marine Fish, Elsevier, pp.119-142, 2025, 978-0-323-99036-3. ⟨10.1016/B978-0-323-99036-3.00003-9⟩ Chapitre d'ouvrage hal-05228175v1
Chapter 4 -Fish growth: Patterns and modeling Jérémy Lobry,Benjamin Ciotti,Bastien Sadoul,Hilaire Drouineau,Carolina Minte-Veraet al. Elsevier. Ecology of Marine Fish, Elsevier, pp.65-90, 2025, 9780323990363. ⟨10.1016/B978-0-323-99036-3.00009-X⟩ Chapitre d'ouvrage hal-05265614v1
The role of fish in marine food webs Morgane Travers-Trolet,P. Daniel van Denderen,Clémentin Deniau,Didier D. Gascuel,Jérémy Lobryet al. Henrique Cabral; Mario LePage; Jeremy Lobry; Olivier Le Pape. Ecology of Marine Fish, Academic Press, Chapter 13, 257-266, 2025, 9780323990363. ⟨10.1016/B978-0-323-99036-3.00013-1⟩ Chapitre d'ouvrage hal-04937497v1
Chapter 21 - Perspectives on marine fish ecology research Henrique Cabral,Jérémy Lobry,Mario Lepage,Olivier Le Pape Academic Press. Ecology of Marine Fish, Elsevier, pp.413-415, 2025, 978-0-323-99036-3. ⟨10.1016/B978-0-323-99036-3.00001-5⟩ Chapitre d'ouvrage hal-05070861v1
Fish growth: Pattern and modelling Jérémy Lobry,Benjamin Ciotti,Bastien Sadoul,Hilaire Drouineau,Carolina Minte-Veraet al. Academic Press. Ecology of Marine Fish, Elsevier, 2024, 9780323990363 Chapitre d'ouvrage hal-05252354v1
Bordeaux, bientôt port de mer ? Jérémy Lobry Changement climatique, changement global : 55 résultats de recherche au service des territoires, Irstea, pp.94-95, 2015 Chapitre d'ouvrage hal-02602542v1

Autre publication scientifique (3)

Un avenir pour les pêches maritimes en Europe Didier D. Gascuel,N. Bez,Patrice Guillotreau,F. Laloe,Jérémy Lobryet al. 2011, 10 p Autre publication scientifique hal-00841899v1
Les communautés de poissons et l'organisation trophique de l'estuaire de la Gironde Jérémy Lobry,Eric Rochard,Pierre Elie Système fluvio-estuarien de la Gironde, 2005, pp.11-13 Autre publication scientifique hal-02587277v1
The Gironde estuary: a European reference for fish population? Jérémy Lobry,Eric Rochard River basin management: from experience to implementation, 2003, pp.63-77 Autre publication scientifique hal-02583637v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Is tropicalization of European estuarine fish communities a matter of latitude? Lobry Jérémy,Chloe Dambrine,Maud Pierre,Mario Lepage,Ernesto Villarinoet al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-05411363v1

Rapport (16)

Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde - Etude de la faune circulante 2020. Rapport pour EDF CNPE du Blayais Maud Pierre,Jérémy Lobry [Rapport de recherche] INRAE; SEANEO; EDF. 2021 Rapport (rapport de recherche) hal-03180792v1
Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde : suivi des captures 2015, étude de la faune circulante 2015 Jérémy Lobry,Gérard Castelnaud,M. Pierre [Rapport de recherche] irstea. 2016, pp.241 Rapport (rapport de recherche) hal-02607184v1
Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde : suivi des captures 2014, étude de la faune circulante 2014 Jérémy Lobry,Gérard Castelnaud [Rapport de recherche] irstea. 2015, pp.238 Rapport (rapport de recherche) hal-02604611v1
Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde : suivi des captures 2013, étude de la faune circulante 2013 Michel Girardin,Gérard Castelnaud,Jérémy Lobry [Rapport de recherche] irstea. 2014, pp.238 Rapport (rapport de recherche) hal-02602613v1
Réalisation de l'outil cartographique des habitats potentiels sur l'estuaire de la Gironde : rapport A. Just,Jérémy Lobry [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.67 Rapport (rapport de recherche) hal-02597057v1
Synthèse du projet BEEST Philippe Boët,G. Bocquené,Gabrielle Bouleau,H. Etchebert,V. Foussardet al. [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.100 Rapport (rapport de recherche) hal-02599542v1
Cartographier les fonctionnalités pour spatialiser le potentiel écologique : mise en place d'un outil SIG Habitats fonctionnels sur les estuaires de la Seine, de la Loire et de la Gironde : rapport N. Bacq,S. Moussard,Jérémy Lobry [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.26 Rapport (rapport de recherche) hal-02597454v1
Le bon potentiel des estuaires : conclusions et perspectives du projet BEEST Gabrielle Bouleau,V. Foussard,C. Leveque,Jérémy Lobry,S. Moussardet al. [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.20 Rapport (rapport de recherche) hal-02599578v1
Développement d'un indicateur poisson pour les estuaires français. Indice anatomo-morphologique et parasitaire pour l'évaluation de l'état de santé des poissons Mario Lepage,Philippe Boët,Pierre Elie,Rachid Amara,Olivier Le Papeet al. [Rapport de recherche] irstea. 2009, pp.263 Rapport (rapport de recherche) hal-02592732v1
Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : programme LITEAU2 2005 Mario Lepage,Rachid Amara,Philippe Boët,A. Courrat,C. Delpechet al. [Rapport de recherche] irstea. 2009, pp.75 Rapport (rapport de recherche) hal-02592841v1
L'estuaire de la Gironde : présentation du système et des données disponibles Stéphanie Pasquaud,Michel Girardin,Mario Lepage,Philippe Boët,Pierre Elieet al. [Rapport de recherche] irstea. 2008, pp.18 Rapport (rapport de recherche) hal-02593113v1
Indicateurs ichtyologiques pour l'état des masses d'eau de transition dans le cadre de la DCE : méthodologie A. Courrat,Jérémy Lobry,D. Nicolas,C. Delpech,Stephanie Pasquaudet al. [Rapport de recherche] irstea. 2008, pp.17 Rapport (rapport de recherche) hal-02593097v1
Contribution à la caractérisation de l'état écologique de masses d'eaux de transition de type &quot; estuaire &quot; à partir du cas de la Gironde : Structure des assemblages ichtyologiques dans les milieux de type estuarien Jérémy Lobry,Mario Lepage,Michel Girardin,Paul Gonthier irstea. 2004, pp.15 Rapport hal-02605603v1
Méthode de classification pour la typologie des eaux côtières et de transition sur les côtes françaises de l'Atlantique et de la Manche : Document réalisé pour le Groupe de Travail National &quot;DCE Eaux Littorales Mario Lepage,Michel Girardin,Jérémy Lobry,M. Joanny irstea. 2004, pp.30 Rapport hal-02605607v1
Structure des assemblages ichtyologiques dans les milieux de transition de type estuarien : contribution à la caractérisation de l'état écologique à partir du cas de la Gironde - Année 2004 : typologie, échantillonnage et suivi Mario Lepage,Jérémy Lobry,Michel Girardin,Paul Gonthier irstea. 2004, pp.93 Rapport hal-02584129v1
Contribution à la caractérisation de l'état écologique de masses d'eaux de transition de type &quot; estuaire &quot;à partir du cas de la Gironde Jérémy Lobry,Paul Gonthier,Pierre Elie,Eric Rochard irstea. 2003, pp.22 Rapport hal-02581715v1

Chapitre de rapport (1)

Les ressources exploitées par la pêche et la conchyliculture Nathalie Caill-Milly,Gilles Morandeau,Iker Castege,Florence Sanchez,Muriel Lissardyet al. Ce rapport est disponible dans : Prévoir pour Agir, 2. 2018, pp.200-223 Chapitre de rapport hal-02785823v1

Thèse (1)

Quel référentiel de fonctionnement pour les écosystèmes estuariens ? Le cas des cortèges de poissons fréquentant l'estuaire de la Gironde Jérémy Lobry Sciences de l'environnement. Doctorat Océanographie, Université de Bordeaux I, 2004. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-02584128v1

HDR (1)

Biodiversité et Fonctionnement écologique dans les écosystèmes estuariens : vers des indicateurs fonctionnels des changements globaux Jérémy Lobry Sciences de l'environnement. HDR Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés, Université de Bordeaux, 2016 HDR tel-02604940v1

Cours (1)

MOOC Biodiversité continentale : rivières et forêts Jérémy Lobry,Eric Rochard,T. Datry,Christian Chauvin,Marion Gosselin France. 2015 Cours hal-02601549v1