Jerome Bugeon
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An end-to-end pipeline based on open source deep learning tools for reliable analysis of complex 3D images of ovariesDevelopment (Cambridge, England), 2023, 150 (7), pp.dev201185. ⟨10.1242/dev.201185⟩
Article dans une revue
hal-04062159v1
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C-ECi: a CUBIC-ECi combined clearing method for three-dimensional follicular content analysis in the fish ovaryBiology of Reproduction, 2020, 103 (5), pp.1099-1109. ⟨10.1093/biolre/ioaa142⟩
Article dans une revue
hal-02935099v1
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Quantitative analysis of asynchronous oogenesis dynamics in fish: Application of a modern 3D analysis approach to an old problem12. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish (ISRPF), May 2023, Chersonissos, Greece
Communication dans un congrès
hal-04187726v1
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Mise en application d'algorithmes open-source de Deep-Learning pour l'analyse d'images 3D d'ovaires de Médaka11. Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes INRAE, Nov 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-04046034v1
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A comprehensive 3D approach to unravel follicular growth dynamics that governs fecundity in medaka fish (Oryzias latipes)14. International Congress on the Biology of Fish, Jun 2022, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-03764407v1
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Using 3D imaging to study ovarian development in Medaka12. Journées Scientifiques et Techniques du Rµi, Nov 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03892521v1
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Utilisation d’outils d’intelligence artificielle pour la segmentation d’images 3D d’ovaire de poisson17. Colloque de la Société Française de Microscopies, Jul 2021, Reims, France
Communication dans un congrès
hal-03299572v1
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Utilisation de l'imagerie en 3D pour caractériser l'organisation des tissus adipeux chez la truite arc-en-cielMettez un peu de piquant dans vos recherches, Jun 2023, Dijon, France
Poster de conférence
hal-04288888v1
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Monitoring the Oogenesis Dynamics in the Medaka Ovary Using a Quantitative 3D Image Analysis Approach12. European Zebrafish Meeting, Jul 2023, Krakow, Poland
Poster de conférence
hal-04187761v1
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Développement d'une nouvelle méthode pour l'analyse 3D de la dynamique ovarienne chez le poisson : Transparisation, microscopie, analyse d'image et modélisationSéminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, Nov 2019, Rennes, France. 85 p., 2019, Recueil des résumés
Poster de conférence
hal-02735123v1
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Utilisation de l’Eci pour la transparisation chez le poisson : exemples d’applications pour l’imagerie 3DPoster de conférence hal-02786189v1 |
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An end-to-end pipeline based on open source deep learning tools for reliable analysis of complex 3D images of Medaka ovaries2022
Pré-publication, Document de travail
hal-03759490v1
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C-Eci: A Cubic-Eci combined clearing method for 3D follicular content analysis In the ovary2020
Pré-publication, Document de travail
hal-02790859v1
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