Jérôme Montfort

Publications

Article dans une revue (46)

Identification of sex-biased MiRNA markers informative of heat-past events Tosca van Gelderen,Jérôme Montfort,José Antonio Álvarez-Dios,Francesc Piferrer,Julien Bobeet al. BMC Genomics, 2025, 26 (1), pp.455. ⟨10.1186/s12864-025-11551-8⟩ Article dans une revue hal-05084188v1
Parent-of-origin regulation by maternal auts2 shapes neurodevelopment and behavior in fish Antoine Clement,Constance Merdrignac,Sergi Roig Puiggros,Dorine Sévère,Aurélien Brionneet al. Genome Biology, 2025, 26 (1), pp.125. ⟨10.1186/s13059-025-03600-y⟩ Article dans une revue hal-05079847v1
FEVER: an interactive web-based resource for evolutionary transcriptomics across fishes Jérôme Montfort,Francisca Hervas-Sotomayor,Aurélie Le Cam,Florent Murat Nucleic Acids Research, 2024, 52 (W1), pp.W65-W69. ⟨10.1093/nar/gkae264⟩ Article dans une revue hal-04537581v1
Evolutionarily conserved ovarian fluid proteins are responsible for extending egg viability in salmonid fish Aurélie Gueho,Daniel Żarski,Hélène Rime,Blandine Guével,Emmanuelle Comet al. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.9651. ⟨10.1038/s41598-024-60118-2⟩ Article dans une revue hal-04574286v1
Looking for a needle in a haystack: de novo phenotypic target identification reveals Hippo pathway-mediated miR-202 regulation of egg production Sarah JANATI IDRISSI,Mariana Roza de Abreu,Cervin Guyomar,Fernanda de Mello,Thuy Thao Vi Nguyenet al. Nucleic Acids Research, 2024, 52 (2), pp.738-754. ⟨10.1093/nar/gkad1154⟩ Article dans une revue hal-04501492v1
Genome structures resolve the early diversification of teleost fishes Elise Parey,Alexandra Louis,Jérôme Montfort,Olivier Bouchez,Céline Roqueset al. Science, 2023, 379 (6632), pp.572-575. ⟨10.1101/2022.04.07.487469⟩ Article dans une revue hal-03765882v1
Gene expression profiling of trout muscle during flesh quality recovery following spawning Yéléhi Diane Ahongo,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Jérôme Bugeon,Florence Lefèvreet al. BMC Genomics, 2022, 23 (1), pp.9. ⟨10.1186/s12864-021-08228-3⟩ Article dans une revue hal-03519475v1
auts2 Features and Expression Are Highly Conserved during Evolution despite Different Evolutionary Fates Following Whole Genome Duplication Constance Merdrignac,Antoine Clement,Jérôme Montfort,Florent Murat,Julien Bobe Cells, 2022, 11 (17), pp.2694. ⟨10.3390/cells11172694⟩ Article dans une revue hal-03777731v1
An atlas of fish genome evolution reveals delayed rediploidization following the teleost whole-genome duplication Elise Parey,Alexandra Louis,Jérôme Montfort,Yann Guiguen,Hugues Roest Crolliuset al. Genome Research, 2022, 32 (9), pp.1685 - 1697. ⟨10.1101/gr.276953.122⟩ Article dans une revue hal-03876769v1
An ancient truncated duplication of the anti‐Müllerian hormone receptor type 2 gene is a potential conserved master sex determinant in the Pangasiidae catfish family Ming Wen,Qiaowei Pan,Elodie Jouanno,Jérôme Montfort,Margot Zahmet al. Molecular Ecology Resources, 2022, 22 (6), pp.2411-2428. ⟨10.1111/1755-0998.13620⟩ Article dans une revue hal-03652234v1
FishmiRNA: An evolutionarily supported microRNA annotation and expression database for ray-finned fishes Thomas Desvignes,Philippe Bardou,Jérôme Montfort,Jason Sydes,Cervin Guyomaret al. Molecular Biology and Evolution, 2022, 39 (2), pp.msac004. ⟨10.1093/molbev/msac004⟩ Article dans une revue hal-03528022v1
Deciphering sex-specific miRNAs as heat-recorders in zebrafish Tosca A van Gelderen,Jérôme Montfort,José Antonio Álvarez-Dios,Violette Thermes,Francesc Piferreret al. Scientific Reports, 2022, 12, pp.18722. ⟨10.1038/s41598-022-21864-3⟩ Article dans une revue hal-03886962v1
Evolution after whole genome duplication: teleost microRNAs Thomas Desvignes,Jason Sydes,Jerôme Montfort,Julien Bobe,John Postlethwait Molecular Biology and Evolution, 2021, ⟨10.1093/molbev/msab105⟩ Article dans une revue hal-03205656v1
Circulating miRNA repertoire as a biomarker of metabolic and reproductive states in rainbow trout Emilie Cardona,Cervin Guyomar,Thomas Desvignes,Jérôme Montfort,Samia Guendouzet al. BMC Biology, 2021, 19 (1), pp.235. ⟨10.1186/s12915-021-01163-5⟩ Article dans une revue hal-03436712v1
The bowfin genome illuminates the developmental evolution of ray-finned fishes Andrew W Thompson,M Brent Hawkins,Elise Parey,Dustin J Wcisel,Tatsuya Otaet al. Nature Genetics, 2021, 53, pp.1373 - 1384. ⟨10.1038/s41588-021-00914-y⟩ Article dans une revue hal-03457561v1
Neurodevelopment vs. the immune system: Complementary contributions of maternally-inherited gene transcripts and proteins to successful embryonic development in fish Daniel Żarski,Aurelie Le Cam,Thomas Frohlich,Miwako Kösters,Christophe Kloppet al. Genomics, 2021, 113 (6), pp.3811-3826. ⟨10.1016/j.ygeno.2021.09.003⟩ Article dans une revue hal-03342588v2
Domestication modulates the expression of genes involved in neurogenesis in high‐quality eggs of Sander lucioperca Daniel Żarski,Aurélie Le Cam,Joanna Nynca,Christophe Klopp,Sławomir Ciesielskiet al. Molecular Reproduction and Development, 2020, 87 (9), pp.934-951. ⟨10.1002/mrd.23414⟩ Article dans une revue hal-02935418v1
MicroRNAs related to cholesterol metabolism affected by vegetable diet in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) from control and selected lines Tengfei Zhu,Geneviève Corraze,Elisabeth Plagnes-Juan,Jérôme Montfort,Julien Bobeet al. Aquaculture, 2019, 498, pp.132-142. ⟨10.1016/j.aquaculture.2018.08.058⟩ Article dans une revue hal-01870570v1
A novel evolutionary conserved mechanism of RNA stability regulates synexpression of primordial germ cell-specific genes prior to the sex-determination stage in medaka Amaury Herpin,Cornelia Schmidt,Susanne Kneitz,Clara Gobe,Martina Regensburgeret al. PLoS Biology, 2019, 17 (4), pp.1-29. ⟨10.1371/journal.pbio.3000185⟩ Article dans une revue hal-02093379v1
Domestication may affect the maternal mRNA profile in unfertilized eggs, potentially impacting the embryonic development of Eurasian perch (Perca fluviatilis) Taina Rocha de Almeida,Maud Alix,Aurélie Le Cam,Christophe Klopp,Jérôme Montfortet al. PLoS ONE, 2019, 14 (12), pp.1-25. ⟨10.1371/journal.pone.0226878⟩ Article dans une revue hal-02627554v1
Multi-tissue transcriptomic study reveals the main role of liver in the chicken adaptive response to a switch in dietary energy source through the transcriptional regulation of lipogenesis Colette Désert,Elisabeth Baéza,Meziane Aite,Morgane Boutin,Aurélie Le Camet al. BMC Genomics, 2018, 19 (1), pp.1-19. ⟨10.1186/s12864-018-4520-5⟩ Article dans une revue hal-01727161v1
MiR-202 controls female fecundity by regulating medaka oogenesis Stéphanie Gay,Jérôme Bugeon,Amine Bouchareb,Laure Henry,Clara Delahayeet al. PLoS Genetics, 2018, 14 (9), pp.1-26. ⟨10.1371/journal.pgen.1007593⟩ Article dans une revue hal-01871468v1
Evolution of gene expression after whole-genome duplication: New insights from the spotted gar genome Jérémy Pasquier,Ingo Braasch,Peter Batzel,Cédric Cabau,Jérôme Montfortet al. Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution, 2017, 328 (7), pp.709 - 721. ⟨10.1002/jez.b.22770⟩ Article dans une revue hal-01788671v1
Global gene expression in muscle from fasted/refed trout reveals up-regulation of genes promoting myofibre hypertrophy but not myofibre production Pierre-Yves Rescan,Aurélie Le Cam,Cécile Ralliere,Jérôme Montfort BMC Genomics, 2017, 18 (1), pp.1-12. ⟨10.1186/s12864-017-3837-9⟩ Article dans une revue hal-01535201v1
Gene expression profile during proliferation and differentiation of rainbow trout adipocyte precursor cells Marta Bou,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Cécile Ralliere,Véronique Lebretet al. BMC Genomics, 2017, 18, pp.1-20. ⟨10.1186/s12864-017-3728-0⟩ Article dans une revue hal-01607231v1
Transcriptomic profiling of egg quality in Sea bass (Dicentrarchus labrax) sheds light on genes involved in ubiquitination and translation Daniel Żarski,Thuy Thao Vi Nguyen,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Gilbert Duttoet al. Marine Biotechnology, 2017, 19 (1), pp.102-115. ⟨10.1007/s10126-017-9732-1⟩ Article dans une revue hal-01464069v1
Genome-wide identification of novel ovarian-predominant miRNAs: new insights from the medaka (Oryzias latipes) Amine Bouchareb,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Stéphanie Gay,Thuy Thao Vi Nguyenet al. Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.1-11. ⟨10.1038/srep40241⟩ Article dans une revue hal-01594581v1
Gene expression profiling of trout regenerating muscle reveals common transcriptional signatures with hyperplastic growth zones of the post-embryonic myotome Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Jean-Charles Gabillard,Pierre-Yves Rescan BMC Genomics, 2016, 17:810 (1), pp.1-12. ⟨10.1186/s12864-016-3160-x⟩ Article dans une revue hal-01385157v1
Molecular pathways associated with the nutritional programming of plant-based diet acceptance in rainbow trout following an early feeding exposure Mukundh N. Balasubramanian,Stéphane Panserat,Mathilde Dupont-Nivet,Edwige Quillet,Jérôme Montfortet al. BMC Genomics, 2016, 17 (1), pp.1-20. ⟨10.1186/s12864-016-2804-1⟩ Article dans une revue hal-01346912v1
A comparison between egg trancriptomes of cod and salmon reveals species-specific traits in eggs for each species Anna Wargelius,Tomasz Furmanek,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Lene Kleppeet al. Molecular Reproduction and Development, 2015, 82, pp.397-404. ⟨10.1002/mrd.22487⟩ Article dans une revue istex hal-01205122v1
Transcriptomic analysis of trout gill ionocytes in fresh water and sea water using laser capture microdissection combined with microarray analysis Isabelle Leguen,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Sandrine Peron,Alain Fautrel PLoS ONE, 2015, 10 (10), pp.1-22. ⟨10.1371/journal.pone.0139938⟩ Article dans une revue hal-01216200v1
Inhibition of zygotic DNA repair: transcriptome analysis of the offspring in trout [i](Oncorhynchus mykiss)[/i] C. Fernández-Díez,S. González-Rojo,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Julien Bobeet al. Reproduction [Cambridge], 2015, 149 (1), pp.101-111. ⟨10.1530/REP-14-0382⟩ Article dans une revue hal-01183015v1
The rainbow trout genome provides novel insights into evolution after whole-genome duplication in vertebrates. Camille Berthelot,Frédéric Brunet,Domitille Chalopin,Amélie Juanchich,Maria Bernardet al. Nature Communications, 2014, 5, pp.1-10. ⟨10.1038/ncomms4657⟩ Article dans une revue hal-01193812v1
Identification of differentially expressed miRNAs and their potential targets during fish ovarian development Amélie Juanchich,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Yann Guiguen,Julien Bobe Biology of Reproduction, 2013, 88 (5), pp.128, 1-11. ⟨10.1095/biolreprod.112.105361⟩ Article dans une revue hal-01205066v1
A unique in vivo experimental approach reveals metabolic adaptation of the probiotic Propionibacterium freudenreichii to the colon environment. Taous Saraoui,Sandrine Parayre,Grégory Guernec,Valentin Loux,Jérôme Montfortet al. BMC Genomics, 2013, 14 (1), pp.911. ⟨10.1186/1471-2164-14-911⟩ Article dans une revue inserm-00923652v1
Gene expression profiling of the hyperplastic growth zones of the late trout embryo myotome using laser capture microdissection and microarray analysis Pierre-Yves Rescan,Jérôme Montfort,Alain Fautrel,Cécile Ralliere,Véronique Lebret BMC Genomics, 2013, 14:173, pp.1-11. ⟨10.1186/1471-2164-14-173⟩ Article dans une revue hal-01205062v1
Transcriptomic profiling of the reproductive mode switch in the pea aphid in response to natural autumnal photoperiod. Gaël Le Trionnaire,Stéphanie Jaubert-Possamai,Joël Bonhomme,Jean-Pierre Gauthier,Grégory Guernecet al. Journal of Insect Physiology, 2012, 58 (12), pp.1517-1524. ⟨10.1016/j.jinsphys.2012.07.009⟩ Article dans une revue istex hal-00753429v1
Characterization of rainbow trout gonad, brain and gill deep cDNA repertoires using a Roche 454-Titanium sequencing approach Aurélie Le Cam,Julien Bobe,Olivier Bouchez,Cédric Cabeau,Olivier Kahet al. Gene, 2012, 500 (1), pp.32-39. ⟨10.1016/j.gene.2012.03.053⟩ Article dans une revue istex hal-01205069v1
Oocyte-somatic cells interactions, lessons from evolution. Cathy Charlier,Jérôme Montfort,Olivier Chabrol,Daphné Brisard,Thuy Thao Vi Nguyenet al. BMC Genomics, 2012, 13 (1), pp.560. ⟨10.1186/1471-2164-13-560⟩ Article dans une revue hal-00753310v1
Expression profiling of rainbow trout testis development identifies evolutionary conserved genes involved in spermatogenesis. Antoine Rolland,Jean-Jacques Lareyre,Anne-Sophie Goupil,Jérôme Montfort,Marie-José Ricordelet al. BMC Genomics, 2009, 10 (1), pp.546. ⟨10.1186/1471-2164-10-546⟩ Article dans une revue inserm-00663561v1
Dynamic gene expression in fish muscle during recovery growth induced by a fasting-refeeding schedule Pierre-Yves Rescan,Jérôme Montfort,Cécile Ralliere,Aurélie Le Cam,Diane D. Esquerreet al. BMC Genomics, 2007, 8 (438), pp.1-42. ⟨10.1186/1471-2164-8-438⟩ Article dans une revue hal-02668599v1
Effect of photoperiod manipulation on rainbow trout &lt;em&gt;(Oncorhynchus mykiss)&lt;/em&gt; egg quality: A genomic study Jérôme Montfort,Diane D. Esquerre,Karine Hugot,Alexis Fostier,Julien Bobe Aquaculture, 2007, 268 (1-4), pp.13-22. ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.04.027⟩ Article dans une revue istex hal-02664448v1
Androgen-induced masculinization in rainbow trout results in a marked dysregulation of early gonadal gene expression profiles Daniel Baron,Jérôme Montfort,Rémi Houlgatte,Alexis Fostier,Yann Guiguen BMC Genomics, 2007, 8 (357), pp.1-8. ⟨10.1186/1471-2164-8-357⟩ Article dans une revue hal-02661640v1
Identification of new participants in the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) oocyte maturation and ovulation processes using cDNA microarrays Julien Bobe,Jérôme Montfort,Thuy Thao Vi Nguyen,Alexis Fostier Reproductive Biology and Endocrinology, 2006, 4:39, pp.1-16. ⟨10.1186/1477-7827-4-39⟩ Article dans une revue hal-02658072v1
Transcriptional analysis of testis maturation using trout cDNA macroarrays David Mazurais,Jérôme Montfort,Christelle Delalande,Florence Le Gac General and Comparative Endocrinology, 2005, 142, pp.143-154. ⟨10.1016/j.ygcen.2005.02.018⟩ Article dans une revue istex hal-02675722v1
Gene expression profiling of colon cancer by DNA microarrays and correlation with histoclinical parameters F Bertucci,S Salas,S Eysteries,V Nasser,P Finettiet al. Oncogene, 2004, 23 (7), pp.1377-1391. ⟨10.1038/sj.onc.1207262⟩ Article dans une revue hal-01612151v1

Communication dans un congrès (45)

Hippo mediated regulation of gonad function by miR-202 Sarah JANATI IDRISSI,Mariana Roza de Abreu,Cervin Guyomar,Sylwia Judycka,Thaovi Nguyenet al. Colloque différenciation et fonction des gonades, Mar 2025, Paris, France Communication dans un congrès hal-05084613v1
Evolution of Gene Content and Expression Following Various Whole Genome Duplication Events in Vertebrates Jérôme Monfort,Francisca Hervas-Sotomayor,Aurélie Le Cam,Florent Murat Congress of the European Society for Evolutionary Biology (ESEB) 2025, Aug 2025, Barcelone, Spain Communication dans un congrès hal-05233267v1
Unveiling the role of mir-187 in promoting adult ovarian follicle growth and female fecundity in medaka (Oryzias latipes) Stéphanie Gay,Marlène Davilma,Sully Heng,Fabrice Mahé,Manon Thomaset al. Différenciation et fonctions des gonades, Mar 2025, Paris, France Communication dans un congrès hal-05107315v1
The Role of Sperm Competition and Genome Duplication in Cell Type Diversity in Fish Gonads Francisca Hervas-Sotomayor,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Florent Murat The Congress of the European Society for Evolutionary Biology (ESEB) 2025, Aug 2025, Barcelone, Spain Communication dans un congrès hal-05233434v1
Hippo pathway-mediated regulation of micropyle formation by microRNA 202 (miR-202) in the fish oocyte Sarah JANATI IDRISSI,Mariana Roza de Abreu,Cervin Guyomar,Martin Pšenička,Fernanda de Melloet al. 12. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, May 2023, Chersonissos, Greece Communication dans un congrès hal-04210922v1
Integrating TGF-β signalling pathways and epigenetic modulations for controlling sex determination in medaka Amaury Herpin,Alexandra Depince,Florent Murat,Mateus Adolfi,Jérôme Montfortet al. 9. International Symposium on the Biology of Vertebrate Sex Determination, Apr 2023, Kona, Big Island, Hawaii, United States Communication dans un congrès hal-04089746v1
Difficulties to compare egg quality: insights from a transcriptomic analysis Taina Rocha de Almeida,Julien Bobe,Aurélie Le Cam,Christophe Klopp,Jérôme Montfortet al. 7. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2019, Rennes, France. pp.61-62 Communication dans un congrès hal-02282230v1
Transcriptomic profiling of eggs of pikeperch (Sander lucioperca) reveals novel egg-quality-associated transcripts D. Żarski,Aurélie Le Cam,J. Nynca,Christophe Klopp,S. Ciesielskiet al. Aquaculture Europe 2019, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2019, Berlin, Germany. 1672 p Communication dans un congrès hal-02317179v1
Circulating microRNA in plasma and ovarian fluid as potential non invasive biomarkers of nutrition and reproduction of female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Emilie Cardona,Jérôme Montfort,Hughes Parrinello,Laurent Journot,Julien Bobeet al. Aquaculture Europe 2019, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2019, Berlin, Germany Communication dans un congrès hal-02284505v1
Functional and proteomic characterisation of salmonid coelomic fluid Aurélie Guého,Hélène Rime,Emmanuelle Com,Régis Lavigne,Blandine Guevelet al. 7. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2019, Rennes, France. pp.59-59 Communication dans un congrès hal-03186872v1
Transcriptional rewiring, post-transcriptional regulation and neo-functionalization: how the master sex-determining gene of medaka was born Amaury Herpin,Cornelia Schmidt,Susanne Kneitz,Clara Gobe,Martina Regensburgeret al. Workshop: Paradigm shift in sex chromosome evolution, Leibniz Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries (IGB). DEU., Sep 2019, Berlin, Germany. 42 p., ⟨10.4126/FRL01-006417884⟩ Communication dans un congrès hal-02371345v1
A transcriptomic comparison suggests an influence of the domestication process on egg quality in Eurasian Perch (Perca fluviatilis) Taina Rocha de Almeida,M. Alix,B. Schaerlinger,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfortet al. 11. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA). Manaus, BRA., Jun 2018, Manaus, Brazil. 251 p Communication dans un congrès hal-01812820v1
Muscle growth and remodeling in trout: insights from transcriptomics Pierre-Yves Rescan,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Cécile Ralliere,Jean-Charles Gabillardet al. 5. International Symposium on Genomics in Aquaculture, Mar 2018, Albufeira, Portugal. 62 p Communication dans un congrès hal-02734647v1
Transcriptomic analysis of Eurasian perch (Perca fluviatilis) eggs assigned to distinct groups of quality Taina Rocha de Almeida,Bérénice Schaerlinger,Aurélie Le Cam,Maud Alix,Jérôme Montfortet al. 6. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, University of South Bohemia in České Budějovice. CZE., Sep 2017, Vodnany, Czech Republic. 156 p Communication dans un congrès hal-01579299v1
Expression of miRNA and target genes was affected by genetic selection of rainbow trout and plant-based diet Tengfei Zhu,Geneviève Corraze,Elisabeth Plagnes- Juan,Jérôme Montfort,Julien Bobeet al. Aquaculture Europe 2017, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2017, Dubrovnik, Croatia Communication dans un congrès hal-01606808v1
What makes a good egg ? Molecular mechanisms defining egg developmental competence in teleost fish Julien Bobe,Aurélien Bouleau,Caroline Cheung,Ozlem Yilmaz,Thuy Thao Vi Nguyenet al. 1. Journées du GdR 3606 Repro, Université de Rennes 1 (UR1). Rennes, FRA., Apr 2015, Rennes, France. 105 p Communication dans un congrès hal-01897087v1
Identification of novel ovarian predominant MiRNAs in medaka Amine Bouchareb,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Stéphanie Gay,Thuy Thao Vi Nguyenet al. 9. European Zebrafish Meeting, Jun 2015, Oslo, Norway Communication dans un congrès hal-02742954v1
A comparison between egg transcriptomes of cod and salmon reveals species specific traits in eggs for each species Anna Wargelius,T. Furmanek,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,L. Kleppeet al. 10. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, Center of Marine Sciences (CCMAR). PRT., May 2014, Olhão, Portugal Communication dans un congrès hal-02744047v1
Transcriptomic analysis reveals molecular mechanisms mediating enhanced feed acceptance of plant-based diet in rainbow trout following early exposure at first feeding Mukundh Balasubramanian,Stéphane Panserat,Mathilde Dupont-Nivet,Edwige Quillet,Aurélie Le Camet al. Aquaculture Europe 2014, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2014, Saint Sébastien, Spain Communication dans un congrès hal-01193980v1
Identification of differentially expressed miRNAs and their potential targets during fish oogenesis Amélie A. Juanchich,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Yann Guiguen,Julien Bobe 4. International Workshop on The Biology of Fish Gametes, Sep 2013, Albufeira, Portugal. 261 p Communication dans un congrès hal-02745190v1
Sperm genome integrity and DNA repair in trout development: transcriptome analysis of the offspring C. Fernández-Díez,S. González Rojo,Julien Bobe,Jérôme Montfort,Aurélie Le Camet al. 4. International Workshop on The Biology of Fish Gametes, Sep 2013, Albufeira, Portugal. 261 p Communication dans un congrès hal-02746440v1
Apport de la microdissection laser à l’étude des mécanismes d’acclimatation des truites lors d’un transfert d’eau douce en eau de mer Isabelle Leguen,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Sandrine Peron,Alain Fautrel 26. Congrès de l'Association Française d'Histotechnologie, Association Française d'Histotechnologie (AFH). Amboise, FRA., Jun 2013, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02749183v1
Caractéristiques musculaires et texture de la chair de truite : intérêt de la comparaison de phénotypes extrêmes Florence Lefèvre,Gilles G. Paboeuf,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Laurent Labbéet al. 3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.87 Communication dans un congrès hal-01000611v1
Caractéristiques musculaires de truites triées sur la texture de leur chair Florence Lefèvre,Gilles G. Paboeuf,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Laurent Labbéet al. 14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage (IDELE). FRA., Nov 2012, Caen, France. pp.179-180 Communication dans un congrès hal-01000746v1
Gene expression profile during proliferation and differentiation in rainbow trout adipocyte precursor cells Marta Bou,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Cécile Ralliere,Jean-Charles Gabillardet al. AQUA 2012, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Sep 2012, Prague, Czech Republic Communication dans un congrès hal-02747949v1
Characterization of rainbow trout gonad, brain and gill deep cDNA repertoires using a Roche 454-Titanium sequencing approach Aurélie Le Cam,Julien Bobe,Olivier O. Bouchez,Cédric Cabeau,Olivier Kahet al. Animation de l'axe technologique génomique de Biogenouest, Plateforme Génomique Santé Biogenouest®. FRA., Apr 2011, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02747070v1
Etude de la fiabilité des listes de gènes différentiels obtenues à partir de données de comptage générées par séquençage 454 [Roche] en comparaison avec la technologie des microréseaux d'ADN [Agilent] Grégory Guernec,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,R. Reinhardt,Patrick Prunetet al. Rencontres Bio-informaticiens et Statisticiens de l’INRA, Mar 2011, Versailles, France Communication dans un congrès hal-02746434v1
FIBERFISH - Identification et caractérisation fonctionnelle de gènes régulateurs de l'hyperplasie musculaire, une composante essentielle de la croissance et de la texture du muscle chez les poissons Pierre-Yves Rescan,Cécile Ralliere,Jérôme Montfort,Véronique Lebret,Aurélie Le Camet al. 8. Journées AGENAE, Nov 2010, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-02753962v1
Acclimation to seawater in rainbow trout: a QTL/eQTL approach Yvan Le Bras,Nicolas Dechamp,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Francine Krieget al. 9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany Communication dans un congrès hal-01193672v1
Oscile Cathy Charlier,Jérôme Montfort,Olivier Chabrol,François Moreews,M. Salhabet al. VIIIe Colloque Agenae / Genanimal, Nov 2010, Bordeaux, France Communication dans un congrès inria-00540830v1
Effect of confinement stress on the transcriptome of rainbow trout gill in freshwater Patrick Prunet,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Isabelle Leguen,Tom G. Pottinger 9. International Congress on the Biology of Fish, Jul 2010, Barcelone, Spain Communication dans un congrès hal-02755646v1
Etude physiologique des conséquences d'un transfert d'eau douce en eau de mer chez la truite arc-en-ciel Oncorhynchus mykiss au niveau du transcriptome branchial Yvan Le Bras,Jérôme Montfort,Claudiane Valotaire,Patrick Prunet 4. Rencontres de l'Ichtyologie en France, Mar 2009, Paris, France Communication dans un congrès hal-02757372v1
Effects of direct transfer to hyperosmotic environment on gill transcriptome in rainbow trout Yvan Le Bras,Jérôme Montfort,Patrick Prunet,Claudiane Valotaire Aquaculture Europe 09, Aug 2009, Trondheim, Norway Communication dans un congrès hal-02753055v1
Contribution of functional genomics to the understanding of gonadal sex differentiation in the rainbow trout Yann Guiguen,Sophie Mahé,Daniel Baron,R. Houlgatte,Aurélie Le Camet al. 6. International Symposium on Fish Endocrinology, Jun 2008, Calgary (Alberta), Canada Communication dans un congrès hal-02756022v1
Toxicogénomique des perturbateurs endocriniens de la reproduction chez la truite arc-en-ciel Gilles Monod,Daniel Baron,Julien Bobe,Alexis Fostier,Yann Guiguenet al. Colloque de restitution du Programme National d'Ecotoxicologie. PNETOX, Ministère de l'Ecologie, de l'Energie, du Développement durable et de l'Aménagement du Territoire. FRA., Oct 2008, Lille, France Communication dans un congrès hal-02756581v1
Transcriptional analysis of spermatogenesis regulation by sex steroids in trout Florence Le Gac,Jean-Jacques Lareyre,Jérôme Montfort,Diane D. Esquerre,Rémi Houlgatte 8. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, Jun 2007, Saint-Malo, France Communication dans un congrès hal-02758524v1
Dynamic gene expression in fish muscle during the compensatory growth induced by a food deprivation-refeeding sequence Pierre-Yves Rescan,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam 3. Work Group Meeting COST ACTION 925, Sep 2006, Antalya, Turkey Communication dans un congrès hal-02751038v1
Etude de la morphogénèse et de la différenciation du myotome embryonnaire de la truite par hybridation in situ d'un répertoire étendu de transcrits musculaires François Chauvigné,Cécile Ralliere,Chantal Cauty,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfortet al. 3. Carrefour Ouest-Genopole, Jan 2006, Brest, France. 27 p Communication dans un congrès hal-02821386v1
Analyse transcriptionnelle de la spermatogenèse et de ses régulations à l'aide de puces à ADN Florence Le Gac,Jérôme Montfort,David Mazurais,Jean-Jacques Lareyre,Rémi Houlgatte RIF 2006, Mar 2006, Paris, France Communication dans un congrès hal-02754263v1
Toxicogénomique des perturbateurs endocriniens de la reproduction chez la truite arc-en-ciel Gilles Monod,Daniel Baron,Julien Bobe,Alexis Fostier,Yann Guiguenet al. Colloque PNETOX, Nov 2005, Paris, France Communication dans un congrès hal-02763366v1
Gènes impliqués dans la sexualité et la reproduction des poissons Daniel Baron,Jérôme Montfort Assemblée générale de la SFI Société Française d'Ichtyologie, Jun 2004, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02826472v1
Estrogens in male reproductive cycle Florence Le Gac,Peter Fiegehen,Jérôme Montfort,Alexis Fostier 5. International Symposium on Fish Endocrinology, Sep 2004, Castellón, Spain Communication dans un congrès hal-02761952v1
Transcriptional analysis of spermatogenesis regulation using trout cDNA arrays Jérôme Montfort,David Mazurais,R. Houlgatte,Florence Le Gac 5. International Symposium on Fish Endocrinology, Sep 2004, Castellón, Spain Communication dans un congrès hal-02761223v1
The INRA AGENAE program and the Agenae trout EST collections: first results applied to fish physiology research Sandrine Aegerter,Daniel Baron,C. Carpentier,François Chauvigné,Christelle Dantecet al. Experimental Biology Annual Main Meeting, Mar 2004, Edinburgh, United Kingdom Communication dans un congrès hal-02761230v1
Régulation de la spermatogénèse chez la truite arc-en-ciel Jérôme Montfort,David Mazurais,Christelle Delalande,Florence Le Gac Journées Ouest chips, Oct 2003, Nantes, France Communication dans un congrès hal-02825811v1

Poster de conférence (22)

Investigating the role of gene duplication in fish phenotypic evolution Jérôme Montfort,Yann Guiguen,Florent Murat The evolution of animal genomes / EMBO workshop, Sep 2023, Sevilla, Spain Poster de conférence hal-04320410v1
auts2 expression is highly conserved during evoluion despite different evolutionary fates following whole genome duplication Constance Merdrignac,Antoine Clement,Jérôme Montfort,Florent Murat,Julien Bobe International Congres on the Biology of Fish, Jun 2022, Montpellier, France Poster de conférence hal-03777897v1
Functional and proteomic characterisation of salmonid coelomic fluid Aurélie Guého,Hélène Rime,Emmanuelle Com,Régis Lavigne,Blandine Guevelet al. 7. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2019, Rennes, France. , pp.59-59, 2019 Poster de conférence hal-02282309v1
Caractérisation protéomique du liquide coelomique de salmonidés Aurélie Guého,Hélène Rime,Emmanuelle Com,R. Lavigne,B. Guévelet al. Séminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, Nov 2019, Rennes, France. 85 p., 2019, Recueil des résumés Poster de conférence hal-02735565v1
Functional and proteomic characterisation of salmonid coelomic fluid Aurélie Guého,Hélène Rime,Emmanuelle Com,Régis Lavigne,Blandine Guevelet al. Aquaculture Europe 2019, Oct 2019, Berlin, Germany. , 2019, Our future: growing from water Poster de conférence hal-02284509v1
Micro ARNs circulants dans le plasma et le fluide ovarien comme potentiels biomarqueurs non invasifs de la nutrition et de la reproduction de la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) Emilie Cardona,Jérôme Montfort,Hugues Parrinello,Laurent Journot,Julien Bobeet al. Séminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, Nov 2019, Rennes, France. 85 p., 2019, Recueil des résumés Poster de conférence hal-02735025v1
Identification and functional characterization of ovarian and maternally-inherited miRNAs in medaka Stéphanie Gay,Jérôme Montfort,Fabrice Legeai,Thuy Thao Vi Nguyen,Thomas Desvigneset al. 7. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2019, Rennes, France. , pp.153-153, 2019 Poster de conférence hal-02282325v1
MiR-202 regulates female fecundity by controlling early follicle development in medaka ovary Stéphanie Gay,Jérôme Bugeon,Amine Bouchareb,Laure Henry,Clara Delahayeet al. 11. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, Jun 2018, Manaus, Brazil. 251 p., 2018, New frontiers in reproductive diversity in a changing environment Poster de conférence hal-02437626v1
miR-202, un microARN clé pour le succès reproducteur des femelles chez le poisson médaka Stéphanie Gay,Jérôme Bugeon,Amine Bouchareb,Laure Henry,Jérôme Montfortet al. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés Poster de conférence hal-01771815v1
Novel maternal-effect genes shed new light on the molecular mechanisms controlling fish egg quality Caroline Cheung,Thuy Thao Vi Nguyen,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Julien Bobe 6. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2017, Vodnany, Czech Republic. University of South Bohemia in Ceske Budejovice ; Faculty of Fisheries and Protection of Waters, 1st, 156 p., 2017, 6. International Workshop on the Biology of Fish Gametes Poster de conférence hal-01579294v1
Transcriptomic analysis of Eurasian Perch (Perca fluviatilis) eggs assigned to various groups of qualities according to a statistically based analysis Taina Rocha de Almeida,Bérénice Schaerlinger,Aurélie Le Cam,Alix Maud,Jérôme Montfortet al. 7. Fish and Shellfish Larviculture Symposium, Sep 2017, Ghent, Belgium. 2017 Poster de conférence hal-02935650v1
Identification of novel ovarian predominant miRNAs in medaka (Oryzias latipes) Amine Bouchareb,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Stéphanie Gay,Thuy Thao Vi Nguyenet al. 49. Annual Meeting of the Society for the Study of Reproduction, Jul 2016, San Diego, California, United States. , 405 p., 2016, SSR 2016 Systems Biology of Reproduction Poster de conférence hal-02742929v1
Identification of novel ovarian predominant miRNAs in medaka (Oryzias latipes) Amine Bouchareb,Aurélie Le Cam,Jérôme Montfort,Stéphanie Gay,Thuy Thao Vi Nguyenet al. 10. Meeting SifrARN, Mar 2016, Toulouse, France. , 2016, SifrARN 2016 Poster de conférence hal-02742939v1
A unique in vivo experimental approach reveals metabolic adaptation of the probiotic [i]Propionibacterium freudenreichii[/i] to the colon environment Taous Saraoui,Sandrine Parayre-Breton,Grégory Guernec,Valentin Loux,Jérôme Montfortet al. 24. International ICFMH Conference, Food Micro 2014, Sep 2014, Nantes, France. , 2014, ICFMH Conference, Food Micro 2014 Poster de conférence hal-01209705v1
A unique in vivo experimental approach reveals metabolic adaptation of the probiotic [i]Propionibacterium freudenreichii[/i] to the colon environment. Gwénaël Jan,Taous Saraoui,Sandrine Parayre-Breton,Grégory Guernec,Valentin Louxet al. International Scientific Conference on Probiotics and Prebiotics – IPC2014, Jun 2014, Budapest, Hungary. PAMIDA International Ltd, 2014, IPC 2014 Poster de conférence hal-01209656v1
Nourrir les alevins de truite pendant une période courte avec un aliment végétal améliore son utilisation ultérieure Mukundh Balasubramanian,Françoise Médale,Sadasivam Kaushik,Edwige Quillet,Mathilde Dupont-Nivetet al. 4. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2014, Paris, France. ITAVI, 2014, JRFP 2014 Poster de conférence hal-01193852v1
A unique in vivo approach reveals metabolic adaptation of the probiotic Propionibacterium freudenreichii to the colon environment. Sandrine Parayre-Breton,Taous Saraoui,Grégory Guernec,Valentin Loux,Jérôme Montfortet al. Colloque Génomique Environnementale, Nov 2013, Rennes, France. , 2013 Poster de conférence hal-01209535v1
FIBERFISH - Identification chez la truite de séquences exprimées dans les aires de néomyogenèse au moyen de la capture laser et de microréseaux à forte densité, analyse fonctionnelle de quelques unes d'entre elles Pierre-Yves Rescan,Cécile Ralliere,Jérôme Montfort,Alain Fautrel,C. Rocancourtet al. 9. Journées AGENAE, Mar 2012, La Rochelle, France. 2012, Colloque génomique animale et microbienne Poster de conférence hal-02748827v1
Gene expression in bovine and mouse cumulus cells in relation with oocyte maturation Daphné Brisard,Franck Chesnel,Cathy Charlier,Jérôme Montfort,Joëlle Dupontet al. 4. COST Action FA0702 GEMINI General Conference - Maternal Interactions with Gametes and Embryos, Sep 2011, Gijon, Spain. , 2011 Poster de conférence hal-02745042v1
Transcriptome analysis of different cell types in trout gill Isabelle Leguen,Sandrine Peron,Jérôme Montfort,Aurélie Le Cam,Grégory Guernecet al. 9. International Congress on the Biology of Fish, Jul 2010, Barcelone, Spain. , 2010, 2010 Fish Biology Congress Abstracts Poster de conférence hal-02754655v1
Toxicogénomique des perturbateurs endocriniens de la reproduction chez la truite arc-en-ciel Daniel Baron,Julien Bobe,Peter Fiegehen,Alexis Fostier,Yann Guiguenet al. Colloque de restitution PNETOX "Apport de la recherche à la gestion des milieux", Mar 2004, Lyon, France. 2004 Poster de conférence hal-02829629v1
Données relatives à l'utilisation des micro et macro réseaux sur lames de verre et membranes de nylon David Mazurais,Jérôme Montfort,Christelle Delalande,M. Le Meur,J. Légeret al. Colloque Génomique des Animaux d'Elevage, May 2003, Seignosse-Le-Penon, France. 2003 Poster de conférence hal-02830288v1

Chapitre d'ouvrage (1)

Toxicogénomique des perturbateurs endocriniens de la reproduction chez la truite arc-en-ciel Gilles Monod,Daniel Baron,Julien Bobe,Alexis Fostier,Yann Guiguenet al. Programme national d'écotoxicologie : point sur les recherches en cours 2001-2005, Documentation française, 2008, Environnement en Débat, 978-2-11-006669-5 Chapitre d'ouvrage hal-02824584v1

Pré-publication, Document de travail (6)

Identification of miR-187 as a modulator of early oogenesis and female fecundity in medaka Marlène Davilma,Stéphanie Gay,Manon Thomas,Sully Mak,Fabrice Mahéet al. 2026 Pré-publication, Document de travail hal-05458486v1
FEVER: An interactive web-based resource for evolutionary transcriptomics across fishes Jérôme Montfort,Francisca Hervas-Sotomayor,Aurélie Le Cam,Florent Murat 2024 Pré-publication, Document de travail hal-04536177v1
Autism-related gene intergenerationally regulates neurodevelopment and behavior in fish through non-genetic mechanisms Antoine Clement,Constance Merdrignac,Sergi Ruig Puiggros,Aurélien Brionne,Thuy Thao Vi Nguyenet al. 2024 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-04693265v1
Neurodevelopment vs. the immune system: complementary contributions of maternally-inherited gene transcripts and proteins to successful egg development in fish Daniel Zarski,Aurélie Le Cam,Thomas Frohlich,Miwako Kosters,Christophe Kloppet al. 2021 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03204116v1
MicroRNA-202 (miR-202) controls female fecundity by regulating medaka oogenesis Stéphanie Gay,Jérôme Bugeon,Amine Bouchareb,Laure Henry,Jérôme Montfortet al. 2018 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02790703v1
Evolution of gene expression after whole-genome duplication: new insights from the spotted gar genome Jérémy Pasquier,Ingo Braasch,Peter Batzel,Cédric Cabau,Jérôme Montfortet al. 2017 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02791027v1

Rapport (1)

Toxicogénomique des perturbateurs endocriniens de la reproduction chez la truite arc-en-ciel Gilles Monod,Daniel Baron,Julien Bobe,Alexis Fostier,Yann Guiguenet al. [Contrat] PNETOX II APR 2001, INRA. 2005 Rapport (rapport contrat/projet) hal-02833754v1

Logiciel (1)

New online bioinformatic tool (Fish and Chips) adapted to enable meta-analysis of fish genomic data Yann Echasseriau,Patrick Prunet,Daniel Baron,Rémi Houlgatte,Isabelle Leguenet al. 2013 Logiciel hal-02802005v1