Julien CUFI Research Engineer

Identifiants chercheurs

IdHAL :

julien-cufi

ORCID :

0000-0001-9149-5413

Présentation

Julien Cufi is an experienced architect and engineer of software systems, he has dual skills in software engineering and knowledge engineering. After working for private companies, he has joined the INRAE IATE laboratory to coordinate the development of decision support tools based on semantic web technologies. Currently he's also working as digital referrer for INRAE in order to implement FAIR principles in Information Systems.

Publications

Article dans une revue (8)

Une ontologie pour considérer les multiples dimensions des systèmes agroalimentaires dans une approche circulaire et plus durable Magalie Weber,Patrice Buche,Liliana Ibanescu,Stéphane Dervaux,Hervé Guilleminet al. NOV'AE - Numéros spéciaux, 2025, régulier 04 NOV'AE, ⟨10.20870/Revue-NOVAE.2025.9752⟩ Article dans une revue hal-05362938v1
PO2/TransformON, an ontology for data integration on food, feed, bioproducts and biowaste engineering Magalie Weber,Patrice Buche,Liliana Ibanescu,Stéphane Dervaux,Hervé Guilleminet al. npj Science of Food, 2023, 7, pp.47. ⟨10.1038/s41538-023-00221-2⟩ Article dans une revue hal-04197618v1
CO2 solubility and composition data of food products stored in data warehouse structured by an ontology Mélanie Munch,Patrice Buche,Luc Menut,Julien Cufi,Valérie Guillard Data in Brief, 2023, 47, pp.108950. ⟨10.1016/j.dib.2023.108950⟩ Article dans une revue (data paper) hal-03998593v1
Integrating collective know-how for multicriteria decision support in agrifood chains-application to cheesemaking Patrice Buche,Julien Couteaux,Julien Cufi,Sébastien Destercke,Alrick Oudot Frontiers in Artificial Intelligence, 2023, 6, pp.1145007. ⟨10.3389/frai.2023.1145007⟩ Article dans une revue hal-04086712v1
How to Manage Incompleteness of Nutritional Food Sources?: A solution using FoodOn as pivot ontology Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervaux,Juliette Dibie,Liliana Ibanescuet al. International Journal of Agricultural and Environmental Information Systems, 2021, 12 (4), pp.1-26. ⟨10.4018/IJAEIS.20211001.oa4⟩ Article dans une revue hal-03372310v1
Application des principes FAIR à l'aide à la sélection d'un emballage alimentaire : un exemple de démarche Open Science à l'Inra Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervaux,Juliette Dibie,Valérie Guillardet al. Cahier des Techniques de l'INRA, 2018, N° Spécial: Données de la recherche, 13 p Article dans une revue hal-04693770v1
Consumer perception data and scientific arguments about food packaging functionalities for fresh strawberries Bruno Yun,Patrice Buche,Pierre Bisquert,Sandrine Costa,Madalina Croitoruet al. Data in Brief, 2018, 20 (October), pp.1924-1927. ⟨10.1016/j.dib.2018.09.034⟩ Article dans une revue (data paper) hal-01889268v1
Harmonization and translation of crop modeling data to ensure interoperability Cheryl H. Porter,Chris Villalobos,Dean Holzworth,Roger Nelson,Jeffrey W. Whiteet al. Environmental Modelling and Software, 2014, 62, pp.495-508. ⟨10.1016/j.envsoft.2014.09.004⟩ Article dans une revue hal-02638259v1

Autre publication scientifique (3)

Guide simplifié - Gestion des données de vos recherches à l'usage des porteurs de projets Frédéric de Lamotte,Véronique Stoll,Hélène Chiapello,Julien Cufi 2025, ⟨10.17180/0ezn-aq96⟩ Autre publication scientifique hal-05094925v2
DOCAMEX, un outil web pédagogique qui propose une structuration de la connaissance inédite à base de cartes conceptuelles et d’arborescences de raisonnement technologique C Baudrit,Patrice Buche,Couteaux Julien,Julien Cufi,Christophe Fernandezet al. 2022 Autre publication scientifique hal-03739344v1
Démarche Open Science à l’INRA : application à l’aide à la sélection d’un emballage alimentaire Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervaux,Juliette Dibie-Barthelemy,Valérie V. Guillardet al. 2018 Autre publication scientifique hal-01924220v1

Poster de conférence (5)

How the PO2/TransformON ontology enables knowledge integration for sustainable food production? Magalie Weber,Stéphane Dervaux,Liliana Ibanescu,Hervé Guillemin,Julien Cufiet al. GreenFoodTech 2025, Apr 2025, Saint-Malo, France Poster de conférence hal-05040608v1
Knowledge Engineering to enhance the data, knowledge and scientific expertise of agro-ressource transformation platforms: the PowderLib platform (F5.1) P. Buche,Adrien Réau,Alrick Oudot,Caroline Sablayrolles,C Baudritet al. GreenFoodTech 2025, Apr 2025, Saint-Malo, France. 2025 Poster de conférence hal-05030951v1
Projet ICAM (2024-26): Ingénierie des Connaissances et Analyse Multidimensionnelle de la Durabilité pour valoriser les données, les connaissances et l’expertise scientifique des plateformes de bioraffinerie Patrice Buche,Adrien Reau,Alrick Oudot,Caroline Sablayrolles,C Baudritet al. Séminaire chercheurs Institut Carnod 3BCAR 2024, Jan 2024, Montpellier, France Poster de conférence hal-04475584v1
D2KAB project taking off: Data to Knowledge in Agronomy and Biodiversity Sophie Aubin,Anne-Francoise Adam-Blondon,Michael Alaux,Mouhamadou Ba,Stéphan Bernardet al. 14th Research Data Alliance Plenary Conference (RDA P14), Best poster award, Oct 2019, Helsinki, Finland. , 2019, ⟨10.5281/zenodo.3520300⟩ Poster de conférence lirmm-02351000v1
Stics et exercices internationaux d'inter-comparaison de modeles de culture Simona Bassu,Nicolas Beaudoin,Nadine Brisson,Patrick Bertuzzi,Julie Constantinet al. 10. Colloque Modèle de culture STICS, Mar 2015, Rennes, France. , 103 p., 2015, Xe séminaire des utilisateurs et concepteurs du modèle STICS. Ier séminaire du réseau scientifique STICS Poster de conférence hal-01607426v1

Communication dans un congrès (11)

ConsomON, an ontology for structuring knowledge and modeling consumer food behavior Magalie Weber,Florian Duclos,Hervé Guillemin,Stéphane Dervaux,Julien Cufiet al. Joint Ontology Workshops (JOWO) - Episode XI: The Sicilian Summer under the Etna, co-located with the 15th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS 2025), IFOW- Integrated Food Ontology Workshop, Sep 2025, Catania, Italy Communication dans un congrès hal-05146634v2
How the PO2/TransformON and FermentON domain ontologies can help us achieve interoperability and reuse of data on (bio)processes. Magalie Weber,Liliana Ibanescu,Julien Cufi,Stéphane Dervaux BioIndustry 4.0 - Summer Webinar 2024, Aug 2024, Online, France Communication dans un congrès hal-04810088v1
Results of the Ontology Alignment Evaluation Initiative 2024 Mina Abd Nikooie Pour,Alsayed Algergawy,Eva Blomqvist,Patrice Buche,Jiaoyan Chenet al. 19. International Workshop on Ontology Matching (OM 2024 collocated with ISWC-2024), Nov 2024, Baltimore, United States. pp.1-34 Communication dans un congrès hal-04892635v1
DOCaMEx, a web-based educational and decision support tool that offers a new way of structuring knowledge based on concept maps and technological reasoning trees C Baudrit,Patrice Buche,Julien Couteaux,Julien Cufi,Christophe Fernandezet al. 14. International Congress on Engineering and Food (ICEF14), ICEF, Jun 2023, Nantes, France. pp.607 Communication dans un congrès hal-04669453v1
Results of the Ontology Alignment Evaluation Initiative 2023 Mina Abd Nikooie Pour,Alsayed Algergawy,Patrice Buche,Leyla Jael Castro,Jiaoyan Chenet al. 18. International Workshop on Ontology Matching (OM 2023), Nov 2023, Athènes, Greece. pp.97--139 Communication dans un congrès hal-04366893v1
DOCaMEx, un outil web pédagogique qui propose une structuration de la connaissance inédite à base de cartes conceptuelles et d’arborescences de raisonnement technologique C Baudrit,P. Buche,Couteaux Julien,Christophe Fernandez,Julien Cufiet al. APIA’22 Conférence Nationale sur les Applications Pratiques de l’Intelligence Artificielle, 2022, Saint-Etienne, France Communication dans un congrès hal-03739201v1
Alignement et enrichissement d’ontologies utilisées par deux systèmes d’informations gérant des données expérimentales sur les procédés de transformation : OpenSILEX-EnviBIS et PO2 BaGaTel Emilie Fernandez,Magalie Weber,Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervauxet al. Atelier IN-OVIVE, organisé dans le cadre de la conférence Ingénierie des connaissances IC-2022, PFIA., Jun 2022, Saint Etienne, France Communication dans un congrès hal-03768264v1
Managing Incompleteness and Validating the Content of Nutritional Food Sources using FoodOn as Pivot Ontology Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervaux,Liliana Ibanescu,Alrick Oudotet al. 12th International Conference on Biomedical Ontologies, Bolzano Summer of Knowledge 2021, Sep 2021, Bolzano, Italy. ⟨10.4018/ijaeis.20211001.oa4⟩ Communication dans un congrès hal-05091500v1
Food transformation process description using PO2 and FoodOn Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervaux,Juliette Dibie,Liliana Ibanescuet al. IFOW 2020 Integrated Food Ontology Workshop, Sep 2020, Online, Italy Communication dans un congrès hal-03013147v1
A Generic Software to Support Collective Decision in Food Chains and in Multi-Stakeholder Situations Rallou Thomopoulos,Julien Cufi,Maxime Le Breton FoodSim 2020 - 11th Biennial FOODSIM Conference, Sep 2020, Ghent, Belgium Communication dans un congrès hal-02484363v2
A new alignment method based on FoodOn as pivot ontology to integrate nutritional legacy data sources Patrice Buche,Julien Cufi,Stéphane Dervaux,Juliette Dibie,Liliana Ibanescuet al. IFOW 2020 - Integrated Food Ontology Workshop @ ICBO, Sep 2020, Online, Italy. pp.1-2 Communication dans un congrès hal-03013162v1

Logiciel (6)

PO2 Engine, an application programming interface associated with the Process and Observation (PO2) software ecosystem Stéphane Dervaux,Hervé Guillemin,Julien Cufi,Patrice Buche,Magalie Weberet al. 2024, ⟨swh:1:dir:a39345ca80cab0c8026ff3591a601fc1f1320909⟩ Logiciel hal-04387669v1
Simple PO2 Query (SPO2Q), a querying tool to retrieve biomass transformation and characterization itineraries using the Process and Observation (PO2) Ontology Stéphane Dervaux,Julien Cufi,Hervé Guillemin,Magalie Weber,Liliana Ibanescuet al. 2024, ⟨swh:1:dir:360ce0db73073210c9e95ee9ee44cb50fc31d9bd⟩ Logiciel hal-04501660v1
PO2 Manager, an annotation tool to edit biomass transformation and characterization itineraries using the Process and Observation (PO2) Ontology Stéphane Dervaux,Hervé Guillemin,Julien Cufi,Patrice Buche,Magalie Weberet al. 2023, ⟨swh:1:dir:32f601791e1a504bbebfd2fae91df8d8fad45009⟩ Logiciel hal-04313202v1
MyChoice Rallou Thomopoulos,Julien Cufi,Maxime Le Breton,Thomas Bosch 2020, ⟨swh:1:rev:37c199e0afd770fa89448aa58b4153933ca2dd8c;origin=https://forgemia.inra.fr/mychoice/public.git;visit=swh:1:snp:1a4c601cd4e174d51f1659a0a3cd294d02b23601⟩ Logiciel hal-04330705v1
Capex, a multicriteria decision support tool for technological recommendations about biomass transformation process based on collective know-how Patrice Buche,Julien Cufi,Clément Sipieter,Alrick Oudot,Julie Cailleret al. 2020, ⟨swh:1:dir:6da535d0c2ae82f4f1fed1de20633b0edddc162d;origin=https://forgemia.inra.fr/capex/capex-backend-public.git;visit=swh:1:snp:683c16b77efbbdb1ad3d3b185ed8a49e7041b8ac;anchor=swh:1:rev:f2d31640d6487beabb78d7da7b65fe8b4396ed15⟩ Logiciel hal-04957075v1
Align tool, a new food source alignment method between two Food composition databases (FCDBs) using FoodOn and Langual as background knowledge. Alrick Oudot,Patrice Buche,Julien Cufi,Brett Choquet,Stéphane Dervaux 2020, ⟨swh:1:dir:195a71dc4326920bf797d07d3fea5dea8423ada8;origin=https://forge.inrae.fr/julien.cufi/meatylab.git;visit=swh:1:snp:68a47a0c79fbfd4db2e2e8efa3f8e5e14c9d46b1;anchor=swh:1:rev:c4f8014ce802e9416ba79b6997dae2401979ef8e⟩ Logiciel hal-05505080v1